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当前共找到 403 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-09-19
Closed-Loop Decoding and Intervention of Pain: A Novel BMI Strategy Integrating θ-Band Detection and Mechano-Electro-Biological Coupled Hydrogels
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种基于新型水凝胶电极的闭环脑机接口,用于神经病理性疼痛的诊断和干预 首次将θ波段检测与机械-电-生物耦合水凝胶结合的闭环脑机接口策略用于神经病理性疼痛管理 研究仅在大鼠模型中进行,尚未验证临床转化可行性 开发闭环脑机接口平台,实现神经病理性疼痛的客观诊断和有效治疗 神经病理性疼痛大鼠模型 脑机接口 神经病理性疼痛 电生理记录、空间转录组学 闭环脑机接口 电生理信号、转录组数据 未明确 NA 空间转录组学 NA NA
102 2026-09-19
Integrative multi-omics analysis identifies AIF1 as an immune-associated factor linked to monocyte-centered inflammatory networks in Alzheimer's disease
2026-Sep, Immunobiology IF:2.5Q3
研究论文 该研究通过整合多组学分析(孟德尔随机化、批量转录组学、单细胞RNA测序和外周血验证),系统识别了与阿尔茨海默病相关的血浆蛋白,并确定AIF1为与单核细胞为中心的炎症网络相关的免疫相关因子 首次通过整合孟德尔随机化、批量转录组学、单细胞RNA测序和外周血验证的多组学策略,系统性地识别AIF1作为阿尔茨海默病的共享候选基因;揭示了AIF1在单细胞水平上以单核细胞为主的细胞类型特异性表达模式,尽管批量转录组显示整体表达降低 摘要中未明确提及研究的具体局限性,如样本量大小、人群特异性、AIF1的功能机制尚未通过实验验证等 系统识别与阿尔茨海默病相关的血浆蛋白及其细胞背景,探究外周免疫参与阿尔茨海默病的分子机制 阿尔茨海默病患者与对照样本的血浆蛋白、转录组数据及外周血单核细胞 机器学习, 数字病理学 阿尔茨海默病 孟德尔随机化, 批量转录组学, 单细胞RNA测序, qPCR NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
103 2026-09-19
Berberine Modulates Mitophagy-Related Gene Expression and Suppresses Breast Cancer Cells: A Multi-Omics and Experimental Study
2026-Sep, Cell biochemistry and biophysics IF:1.8Q4
研究论文 本研究整合GEO数据库和单细胞测序数据,结合分子对接和体外实验,探究小檗碱通过调控线粒体自噬相关基因抑制乳腺癌的作用机制 首次整合GEO数据库、单细胞测序、分子对接和体外实验,系统揭示小檗碱通过靶向BECN1、BCL2、HIF1A、MYC、PINK1和FOXO3等关键基因调控线粒体自噬和线粒体质量控制从而抑制乳腺癌的新机制 CASP3仅在mRNA水平进行评估,因MCF-7细胞本身缺乏CASP3;研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物实验验证 探究小檗碱是否通过调控线粒体自噬相关基因发挥抗乳腺癌作用,并揭示乳腺癌中线粒体自噬的关键基因及潜在治疗靶点 乳腺癌细胞(MCF-7)及GEO数据库中的乳腺癌患者样本和单细胞测序数据 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序, 分子对接, 体外实验 NA 基因表达数据, 图像, 文本 NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
104 2026-09-19
The Portuguese man-of-war genome reveals the genetic basis of medusa loss and sea-air interface adaptation
2026-Sep, National science review IF:16.3Q1
研究论文 本研究通过染色体水平基因组组装和单细胞转录组学,揭示了僧帽水母(Portuguese man-of-war)失去自由游泳水母阶段及适应海气界面的遗传和细胞机制 首次获得两种漂浮水母的染色体水平基因组,发现神经和肌肉基因家族的广泛收缩,鉴定出Medusa基因作为水母发育的关键调控因子,并通过单细胞转录组学揭示了气囊充气的一氧化碳产生机制及触手中神经毒性、细胞毒性和溶血性代谢物与毒素的分布,发现了具有毒素结构域的扩张基因家族 摘要未明确提及研究的具体局限性 探究僧帽水母(漂浮水母)适应海气界面特殊生态位的分子基础,特别是其失去自由游泳水母阶段的遗传机制 两种漂浮水母(Physalia sp.及另一种具有远洋水母阶段的漂浮水母) 基因组学、进化生物学、单细胞转录组学 NA 染色体水平基因组组装、单细胞转录组测序、基因敲降 NA 基因组序列、单细胞转录组数据 两种漂浮水母的个体样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
105 2026-09-19
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了Halo,一种预训练的全细胞分割模型,通过整合细胞核形态与RNA转录本的空间分布,从仅有细胞核染色的空间转录组数据中重建全细胞边界 首次将转录本坐标转换为分子密度图与DAPI图像联合处理,基于Cellpose-SAM分割架构构建预训练模型,可在12种组织类型的多模态Xenium数据上预训练后直接应用于新数据集,无需额外训练或数据集特定拟合 摘要中未明确提及研究的局限性 解决空间转录组实验中仅有细胞核染色图像时难以可靠推断细胞边界的问题,实现可扩展且可重复的基于图像的空间转录组细胞分割 空间转录组数据中的细胞,涵盖12种组织类型 数字病理学 NA 空间转录组学 Cellpose-SAM 图像 12种组织类型的多模态Xenium数据 10x Genomics 空间转录组学 10x Xenium 10x Xenium多模态空间转录组数据,包含DAPI染色图像和转录本空间坐标信息
106 2026-09-19
Arginine Kinase 1 supports energy homeostasis in Drosophila flight muscle development
2026-Sep, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本文研究了Argk1在果蝇飞行肌发育中维持能量稳态的作用,发现其缺失导致ATP水平降低、肌节成熟缺陷和肌肉收缩丧失 首次揭示Argk1的一种亚型定位于发育中肌纤维的线粒体,并证明Argk1在非应激条件下对飞行肌发育不可或缺,通过维持局部ATP水平支持肌原纤维生成和肌肉生长 未明确Argk1各亚型的具体功能差异,未完全阐明Argk1如何协调线粒体能量供应与肌节成熟的分子机制 探究Argk1在果蝇飞行肌发育中的功能及其在能量稳态维持中的作用 果蝇(Drosophila)飞行肌及其相关成肌细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
107 2026-09-17
Inhibition of Jaw Bone Marrow Mesenchymal Stem Cell Cuproptosis Attenuates Bone Loss in Apical Periodontitis via Suppressing the FoxO Signalling Pathway
2026-Sep-16, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 本研究探讨了铜死亡在根尖周炎骨丧失中的作用,并发现抑制颌骨骨髓间充质干细胞铜死亡可通过FoxO信号通路减轻骨丧失 首次揭示铜死亡是根尖周炎牙槽骨丧失的新型驱动因素,并阐明铜死亡通过FoxO/β-catenin轴损害颌骨骨髓间充质细胞成骨功能的机制,提出TTM靶向铜死亡作为治疗策略 摘要中未明确提及研究局限性 研究铜死亡在根尖周炎骨丧失中的参与及其调控机制 根尖周炎患者根尖周组织标本、根尖周炎大鼠模型、颌骨骨髓间充质干细胞(JBMMSCs) 单细胞组学、骨生物学 根尖周炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LC-MS/MS蛋白质组学、micro-CT、H&E染色、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting NA 图像、文本、单细胞转录组数据 来自健康受试者或根尖周炎患者的根尖周标本;3个scRNA-seq数据集(GSE171213、GSE181688、GSE197680);根尖周炎大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
108 2026-09-17
Ruscogenin Targets TXNIP to Suppress PANoptosis and Inflammation in Periodontitis
2026-Sep-15, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究探索了PANoptosis在牙周炎中的作用,识别了关键PANoptosis相关基因TXNIP,并验证了Ruscogenin作为靶向TXNIP的小分子抑制剂可抑制PANoptosis和牙周炎症 首次揭示TXNIP作为牙周炎中PANoptosis的关键调控因子,并发现Ruscogenin可通过靶向TXNIP抑制PANoptosis和炎症,为牙周炎治疗提供了新的小分子药物候选 摘要中未明确提及研究局限性 探索PANoptosis在牙周炎中的作用,识别关键PANoptosis相关基因并评估潜在小分子抑制剂 牙周炎患者牙龈组织、临床样本、小鼠牙周炎模型及细胞实验 机器学习 牙周炎 单细胞RNA-seq,分子对接,分子动力学模拟,ssGSEA,WGCNA 多种机器学习方法 基因表达数据,图像,文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
109 2026-09-17
Machine learning and multi-omics clustering to map cellular rewiring and immune evasion in ccRCC
2026-Sep-15, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 该研究结合机器学习与多组学聚类,构建了ccRCC的共识机器学习驱动特征(CMLS),并利用空间转录组和单细胞RNA测序解析了肿瘤微环境中的细胞重编程和免疫逃逸机制 开发了一个整合框架,将宏观生存风险与微观肿瘤微环境结构相联系;使用101种机器学习组合生成24基因CMLS;结合空间转录组和14万细胞scRNA-seq图谱解码特征的细胞起源;发现CMLS在预测ICB获益方面优于肿瘤突变负荷 样本量相对有限(三个独立队列和17对临床组织),需要更大规模的前瞻性验证;RT-qPCR仅验证了5个核心基因 克服ccRCC中肿瘤微环境异质性对免疫检查点阻断疗效的限制,建立连接宏观生存风险与微观TME结构的整合框架,并开发能够预测ICB获益的患者分层工具 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者及其肿瘤微环境 机器学习, 数字病理学, 多组学 肾细胞癌 多组学聚类, 空间转录组, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 机器学习 SuperPC, 机器学习组合模型 图像, 文本, 基因表达数据 三个独立队列,140,000个细胞的scRNA-seq图谱,17对ccRCC临床组织 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组 NA NA
110 2026-09-16
Unveiling the Diagnostic Value and Potential Therapeutic Targets of Phenylalanine Metabolism in Pancreatic Cancer via Integrated Multi-Omics and Machine Learning
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 该研究整合代谢组学、孟德尔随机化和机器学习算法,揭示了苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的诊断价值和潜在治疗靶点 首次整合代谢组学、孟德尔随机化和机器学习算法研究苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的作用,利用113种机器学习算法组合筛选最优诊断模型,并结合SHAP值进行特征解释和单细胞RNA测序分析 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏大规模临床验证队列,诊断模型的临床转化应用仍需进一步验证 探索苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的功能,开发高精度诊断模型并识别潜在治疗靶点和药物 胰腺癌患者、55种血浆代谢物、胰腺癌细胞系 机器学习 胰腺癌 代谢组学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、RT-qPCR、分子对接、分子动力学模拟 机器学习(12种算法,113种组合)、SHAP 代谢组学数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像 55种血浆代谢物、8个差异表达基因、胰腺癌细胞系(具体数量未在摘要中说明) NA 代谢组学、单细胞RNA测序、转录组学 NA NA
111 2026-09-16
Identifying JAK2 and ANXA5 as Key Genes Linking Obstructive Sleep Apnea and Oxidative Stress via Machine Learning and Multilayer Transcriptomic Integration With Functional Validation
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合多层转录组学数据与机器学习方法,识别并验证了连接阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)与氧化应激(OS)的关键基因JAK2和ANXA5,并进行了功能验证 首次通过整合差异表达分析、WGCNA、PPI网络、多种机器学习算法(Lasso回归、随机森林、SVM-RFE)、单细胞RNA测序、伪时间轨迹推断、细胞间通讯分析、免疫浸润解卷积以及虚拟基因敲除实验,系统性地识别并验证了JAK2和ANXA5作为连接OSA与氧化应激的关键基因,揭示了单核细胞亚型重塑在OSA中的作用 摘要中未明确提及研究局限性,可能包括样本量有限、需要更大规模的临床队列验证、以及功能验证仅限于临床样本的RT-qPCR和Western blotting,缺乏深入的体内外功能机制研究 通过生物信息学方法识别并验证与阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)相关的氧化应激(OS)相关潜在基因 阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)相关的基因表达数据、人类单细胞RNA测序数据集以及临床样本 机器学习 阻塞性睡眠呼吸暂停 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、生物信息学分析 Lasso回归、随机森林、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、scTenifoldKnk 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、图像(Western blot)、文本(临床信息) 未明确说明具体样本数量,涉及公共基因表达数据集、人类单细胞RNA测序数据集以及临床样本 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
112 2026-09-16
Single-cell transcriptomics reveals that tenocyte-derived MIF contributes to tendon injury pathogenesis
2026-Sep-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示肌腱损伤中肌腱细胞来源的MIF在发病机制中的作用,并验证F127@4-IPP水凝胶的治疗潜力 首次通过单细胞转录组解析肌腱愈合过程中的细胞异质性,发现肌腱细胞与髓系细胞间MIF相关通讯在急性损伤期增强,并开发了光交联F127DA水凝胶递送4-IPP的干预策略 研究主要基于小鼠模型和生物信息学预测,MIF信号的具体分子机制及F127@4-IPP在人体中的有效性仍需进一步验证 探究肌腱损伤修复过程中的细胞异质性和分子机制,并评估靶向MIF信号的治疗干预效果 肌腱损伤修复过程中的细胞群体(间充质细胞和免疫细胞)及小鼠肌腱损伤模型 单细胞转录组学、数字病理学 肌腱损伤 单细胞RNA测序、CellChat细胞通讯分析、光交联水凝胶递送 NA 单细胞转录组数据、图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
113 2026-09-16
CoexpressDeconvolve enables reference-free single-cell-resolution deconvolution from spot-based spatial transcriptomics
2026-Sep-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 提出了一种名为CoexpressDeconvolve的无参比框架,用于从基于 spot 的空间转录组数据中恢复整数细胞计数和细胞类型特异性的转录组 结合了混合管家基因文库大小校准和空间基因共表达流形上的主题建模,无需外部单细胞参考,输出模仿标准Space Ranger输出的特征-条形码矩阵,可直接加载到标准单细胞下游分析流程中 摘要中未明确提及 解决基于 spot 的空间转录组数据中细胞类型信号模糊的问题,实现无参比的单细胞分辨率解卷积 人类乳腺癌和舌鳞状细胞癌 空间转录组学 乳腺癌, 舌鳞状细胞癌 空间转录组学 主题建模 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 基于 spot 的空间转录组技术
114 2026-09-16
SingleCellMQC: A comprehensive quality control workflow for single-cell multi-omics
2026-Sep-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 开发了一个开源R包SingleCellMQC,用于单细胞多组学数据的质量控制 提出了一个统一的多组学质量控制框架,涵盖样本、细胞、特征和批次四个层次,整合了经验阈值、组织特异性参考范围和数据驱动的异常值检测 未明确提及 为单细胞RNA测序、表面蛋白质组分析和免疫组库数据提供全面的质量控制 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、ADT和TCR/BCR数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 表面蛋白质组分析, 免疫组库测序 NA 文本 三个数据集:内部PBMC多组学数据集(28,498个细胞)、公共PBMC scRNA-seq数据集(137,214个细胞)和大型乳腺组织scRNA-seq数据集(超过100万个细胞) NA 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 NA NA
115 2026-09-16
Transcriptomic landscape of microglia in mouse models of social dysfunction and oxytocin-mediated recovery
2026-Sep-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 该研究使用单细胞和空间转录组学技术,揭示了产前丙戊酸暴露小鼠模型中下丘脑室旁核小胶质细胞的转录组异常,以及催产素神经元刺激对小胶质细胞的恢复作用 首次揭示了VPA暴露对PVH小胶质细胞的转录异常及空间分布改变,并发现催产素神经元刺激可逆转部分小胶质细胞基因下调,同时小胶质细胞药理操控可正常化催产素神经元基因表达,支持双向交互作用 研究基于小鼠模型,结果向人类神经发育障碍的转化仍需进一步验证;对小胶质细胞亚型的功能验证尚不充分 探究产前VPA暴露及催产素神经元刺激对PVH非神经元细胞(小胶质细胞)的影响及其在社交功能障碍中的角色 小鼠模型PVH中的小胶质细胞和催产素神经元 单细胞转录组学, 空间转录组学 神经发育障碍, 社交功能障碍 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 化学遗传学, 药理学操控 NA 基因表达数据, 图像 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
116 2026-09-16
TGF-β serves as a critical signaling determinant of liver progenitor cell activation and function
2026-Sep-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文通过空间转录组学和单细胞测序揭示了TGF-β在肝祖细胞静息状态维持和激活过程中的关键调控作用,并阐明了其在急性肝衰竭中的双重功能 首次阐明TGF-β在肝祖细胞中具有双重角色:既抑制LPC增殖(通过阻断G1到S期转变),又是HGF依赖的肝细胞基因程序诱导所必需的,揭示了TGF-β作为LPC激活和谱系特化的环境依赖性决定因子 摘要中未明确提及研究局限性 探究肝祖细胞在生理条件下如何维持静息状态以及在大量肝坏死相关急性肝衰竭后如何被激活的分子机制 肝祖细胞(LPCs)、急性肝衰竭患者样本、斑马鱼模型、小鼠损伤模型 空间转录组学、单细胞测序 急性肝衰竭 空间转录组学、单细胞测序、免疫染色 NA 图像、文本 NA NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
117 2026-09-16
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the spatiotemporal trajectory of the small peptide TAP4 in delaying postharvest fruit senescence
2026-Sep-14, Plant communications IF:9.4Q1
研究论文 该研究通过单细胞和空间转录组学揭示了小肽TAP4延缓采后果实衰老的时空轨迹 首次鉴定TAP4为Try自解肽中最具生物活性的肽,并利用单细胞转录组学揭示其通过激活转录因子HuWRKY21-1等重塑果皮细胞分化轨迹和免疫应答来延缓衰老 摘要中未明确提及研究的局限性 探究胰蛋白酶自解肽TAP4延缓采后果实衰老的分子机制 火龙果(Hylocereus undatus)果实及其果皮细胞 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 单细胞转录组测序、空间转录组测序、病毒诱导基因沉默、定量逆转录PCR NA 转录组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
118 2026-09-16
Tumor immune microenvironment remodeling predicts response to checkpoint inhibitor therapy
2026-Sep-14, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 该研究构建了跨十种癌症类型的纵向单细胞RNA测序图谱,揭示了肿瘤免疫微环境在免疫检查点抑制剂治疗中的重塑规律及其对疗效的预测价值 构建了大规模纵向单细胞RNA测序图谱,定义了77种免疫和基质细胞亚型及4种保守的TIME亚型,发现约40%的肿瘤在治疗过程中发生状态转变,且转变方向比基线状态更能预测疗效,并推导出59基因特征 摘要中未明确提及研究局限性 阐明免疫检查点抑制剂治疗中患者反应差异的机制,通过绘制肿瘤免疫微环境的重塑图谱来预测治疗反应 241名患者的441份样本,涵盖十种癌症类型 数字病理学 泛癌种 单细胞RNA测序 分层参考引导的深度表型分析框架 单细胞转录组数据 441份样本来自241名患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
119 2026-09-16
Elucidating the beneficial effects of gut microbiota-derived metabolites in treating hepatocellular carcinoma: an integrated network pharmacology, molecular docking, and single-cell sequencing analysis
2026-Sep-12, Bioresources and bioprocessing IF:4.3Q1
研究论文 本文通过整合网络药理学、分子对接和单细胞测序分析,阐明了肠道菌群衍生代谢物治疗肝细胞癌的有益效果及其潜在机制 首次整合网络药理学、分子对接和单细胞测序分析,系统揭示肠道菌群衍生代谢物通过多靶点、多通路抑制肝细胞癌的作用机制,并构建了微生物-代谢物-靶点-疾病网络 研究主要基于生物信息学分析和分子对接预测,缺乏体内外实验验证;单细胞数据来源于公共数据库,样本量和人群多样性有限 探究肠道菌群衍生代谢物治疗肝细胞癌的潜在作用机制和核心靶点 肠道菌群衍生代谢物、肝细胞癌相关靶点、肝细胞癌患者单细胞转录组数据 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接 NA 文本、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
120 2026-09-16
A pro-inflammatory metastasis-associated macrophage subset induces tumor-promoting mesothelial cell conversion in ovarian cancer via IL-1α secretion
2026-Sep-12, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析了卵巢癌腹水和大网膜转移灶来源的肿瘤相关巨噬细胞亚群,揭示了一个促炎性转移相关巨噬细胞亚群通过分泌IL-1α诱导间皮细胞向间充质转化,从而促进肿瘤转移 首次鉴定了大网膜转移灶中具有混合M1⁺/M2⁺表型的促炎性转移相关巨噬细胞亚群,并揭示其通过IL-1α与TGFβ协同激活自分泌TGFβ/TGFBR1反馈环路诱导间皮细胞MMT的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 表征卵巢癌转移过程中不同肿瘤相关巨噬细胞亚群的功能特化及其促进间皮细胞转化的机制 高级别卵巢癌患者来源的腹水巨噬细胞和大网膜转移灶巨噬细胞,以及原代间皮细胞 数字病理学, 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, 免疫组化分析 NA 文本, 图像 患者来源的腹水和大网膜转移灶巨噬细胞样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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