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当前共找到 403 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-20 |
B-Cell Remodeling and Regulatory Phenotypes During Acute COVID-19 Are Unaffected by Polyclonal Anti-SARS-CoV-2 Antibody XAV-19
2026-Sep, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70284
PMID:42745635
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研究论文 | 该研究通过对POLYCOR试验的免疫学子研究，利用光谱流式细胞术、体外功能实验和单细胞RNA测序，纵向分析了住院COVID-19患者B细胞区室的重塑及XAV-19抗体治疗的影响 | 首次系统揭示急性COVID-19期间调节性B细胞的动态变化，并证明糖基化人源化多克隆抗体XAV-19不影响B细胞稳态、表型、功能和基因表达 | 样本量有限，仅针对住院COVID-19患者，未探讨长期随访及不同疾病严重程度的影响 | 探究急性SARS-CoV-2感染期间B细胞尤其是调节性B细胞的动态变化，以及多克隆抗体XAV-19对B细胞免疫平衡的影响 | 住院COVID-19患者的B细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-09-20 |
Heterogeneous SPP1-expressing esophageal cancer cells license immunotherapy resistance by organizing an immunosuppressive niche
2026-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101331
PMID:42349108
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研究论文 | 该研究整合单细胞、空间和bulk转录组数据，发现表达SPP1的食管鳞癌细胞亚群通过塑造免疫抑制微环境驱动免疫治疗耐药 | 首次发现SPP1表达的恶性上皮亚群在免疫治疗无应答者中显著富集，揭示其通过mTORC1-STAT3通路上调PD-L1、通过SPP1-CD44信号诱导CD8+ T细胞耗竭、通过α5β1整合素-FAK-AKT-mTOR通路极化巨噬细胞，并提名微管和激酶抑制剂靶向SPP1+细胞 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别异质性肿瘤中驱动免疫治疗耐药的关键因素，并探索克服食管鳞癌免疫治疗耐药的策略 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者队列及肿瘤微环境中的恶性上皮细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, bulk转录组测序, RNA测序 | NA | 转录组数据, 图像 | 多个ESCC队列（摘要未提供具体样本量） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-09-20 |
Deep learning of pretreatment ascites cytopathology for platinum-resistance risk stratification in advanced epithelial ovarian cancer
2026-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101330
PMID:42365738
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研究论文 | 该研究提出了一个多尺度深度学习框架OVCAP，通过分析治疗前腹水细胞学全切片图像来评估晚期上皮性卵巢癌的铂类耐药风险 | 首次系统性地利用治疗前腹水细胞学全切片图像，结合多尺度深度学习框架进行铂类耐药风险分层，并通过注意力引导的细胞病理学回顾和单细胞RNA测序分析揭示了耐药相关的高危形态学模式和生物学特征 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 开发一种基于治疗前腹水细胞学的深度学习方法来预测晚期上皮性卵巢癌患者的铂类耐药风险，以便在治疗前进行早期风险分层 | 438例FIGO IIIB-IV期上皮性卵巢癌患者的治疗前腹水细胞学全切片图像 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 全切片图像分析, 单细胞RNA测序 | 多尺度深度学习框架 | 图像, 文本 | 438例FIGO IIIB-IV期上皮性卵巢癌患者，包含一个内部验证队列和两个独立外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-09-20 |
Regional signaling controls stem cell-mediated regeneration in an invertebrate chordate
2026-Sep, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3004000
PMID:42758752
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研究论文 | 本文通过比较海鞘Ciona robusta可再生的底部体片段与不可再生的上部片段，揭示了区域特异性信号如何调控干细胞介导的再生 | 利用海鞘独特的区域性再生差异模型，结合流式细胞术、单细胞RNA测序、移植和命运图谱技术，发现再生能力并非取决于干细胞数量，而是依赖于区域特异性信号微环境 | 研究对象为无脊椎动物海鞘，其再生机制与哺乳动物的差异尚需进一步验证，且未明确具体的信号通路分子机制 | 探究局部信号如何调控损伤后静息干细胞的激活及组织再生 | 海鞘（Ciona robusta）的底部可再生体片段和上部不可再生体片段 | 单细胞组学 | NA | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 移植实验, 命运图谱 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-09-19 |
S100A1 Promotes MDM2-Mediated KLF15 Ubiquitination to Regulate ID1-Driven Tubular Injury in Diabetic Kidney Disease
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603731R
PMID:42745573
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研究论文 | 该研究揭示S100A1通过促进MDM2介导的KLF15泛素化降解，解除KLF15对ID1的转录抑制，从而驱动糖尿病肾病肾小管损伤 | 首次发现S100A1-MDM2-KLF15-ID1调控轴在糖尿病肾病肾小管损伤中的作用，S100A1通过增强MDM2与KLF15互作诱导K48连接泛素化降解KLF15，进而上调ID1 | 摘要未提及研究局限性 | 探究S100A1在糖尿病肾病肾小管损伤中的作用及其分子调控机制 | 健康对照与糖尿病肾病患者肾脏样本、糖尿病肾病患者肾活检标本、高糖刺激的人近端肾小管上皮细胞HK-2、糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像,文本 | 健康对照和糖尿病肾病患者的肾脏单细胞RNA测序样本及肾活检标本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-09-19 |
Molecular heterogeneity in systemic sclerosis skin: insights from single-cell and spatial omics, and implications for disease stratification and cutaneous assessment
2026-Sep-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag258
PMID:42329219
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综述 | 本文综述了2021至2025年间应用单细胞和空间多组学技术研究系统性硬化症皮肤分子异质性的成果，并探讨其对疾病分层和皮肤评估的意义 | 系统整合了单细胞和空间多组学在系统性硬化症皮肤中的最新发现，提出皮肤纤维化并非均一过程，而是由不同细胞和空间程序驱动的异质性疾病模型，并讨论了分子异质性在临床表型、治疗反应异质性和患者亚组划分中的潜在应用 | 所述分子观察能否改善患者分层、治疗选择或皮肤结局评估，仍依赖于在更大规模且临床特征明确的队列中进行前瞻性验证 | 综合单细胞和空间多组学研究，探讨系统性硬化症皮肤分子异质性与临床表型的关系，及其对皮肤评估、治疗反应异质性和患者亚组划分的启示 | 系统性硬化症患者的皮肤组织及皮肤纤维化 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间多组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-09-19 |
Single-cell transcriptomics unveils metabolic and cellular dysregulation in striae gravidarum
2026-Sep-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag181
PMID:42141898
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研究论文 | 该研究通过单细胞和单核RNA测序技术，揭示了妊娠纹（SG）中成纤维细胞异质性、细胞间通讯异常及脂肪酸代谢重编程，并确定ACSBG1为潜在治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘妊娠纹的细胞图谱，发现sC7和sC5成纤维细胞亚群之间的异常通讯轴及从sC7到sC5的分化阻滞，揭示ACSBG1介导的脂肪酸代谢重编程在妊娠纹发病中的关键作用，并通过Triacsin C处理和Acsbg1基因沉默验证了靶向该通路的治疗潜力 | 样本量相对有限，仅纳入人类妊娠纹病灶及配对健康皮肤标本；动物模型仅验证了Acsbg1沉默的效果，尚未进行临床转化研究；未深入探讨其他细胞类型（如免疫细胞、角质形成细胞）在妊娠纹发病中的具体贡献 | 在单细胞水平上阐明妊娠纹的细胞景观和分子机制，重点关注成纤维细胞亚群动态、细胞间通讯和代谢重编程 | 人类妊娠纹病灶皮肤标本及配对的健康皮肤组织，以及小鼠背部皮肤模型 | 数字病理学 | 妊娠纹 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、单核RNA测序（snRNAseq）、定量聚合酶链反应（qPCR）、组织学染色（HE、EVG、天狼星红）、免疫荧光、孟德尔随机化分析 | NA | 图像、文本 | 人类妊娠纹病灶及配对的健康皮肤标本（具体数量未在摘要中说明），以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-08-20 |
Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics at single-molecule resolution
2026-Sep-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.08.021
PMID:42612630
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2026-09-19 |
AGTR1 signaling contributes to tumor immunity and therapy response in non-small cell lung cancer
2026-Sep-17, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2026.201253
PMID:42368624
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研究论文 | 该研究通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据分析，结合免疫组化验证，探讨了AGTR1信号在非小细胞肺癌肿瘤免疫和治疗反应中的作用，并评估了血管紧张素受体阻滞剂（ARB）对免疫检查点阻断治疗疗效的影响 | 首次系统性地揭示了AGTR1在非小细胞肺癌中主要表达于癌症相关成纤维细胞（CAFs），并与TGF-β相关的免疫抑制特征相关；发现ARB联合化疗-免疫治疗可显著改善非鳞状NSCLC患者的无进展生存期，尤其是在PD-L1≥1%的患者中 | 免疫组化验证样本量较小（n=14）；研究为回顾性分析，ARB使用的临床影响需要前瞻性随机对照试验进一步验证 | 探究AGTR1信号在非小细胞肺癌肿瘤微环境及免疫治疗反应中的作用，并评估ARB药物对免疫治疗疗效的影响 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者及其肿瘤组织样本、接受免疫检查点阻断治疗的患者队列 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 转录组数据, 图像 | 14例NSCLC标本用于IHC验证，另包含bulk RNA测序和scRNA-seq公共数据集及接受ICB治疗的患者队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-09-19 |
Whole-transcriptome-scale isoform-resolved spatial imaging of single cells in tissues
2026-Sep-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.06.027
PMID:42462710
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研究论文 | 该文章介绍了一种原位RNA扩增方法，并将其与MERFISH技术整合，实现了组织内单细胞的全转录组尺度、异构体分辨的空间成像 | 开发了一种原位RNA扩增方法并与MERFISH整合，首次实现了对短RNA序列的检测，能够进行全转录组尺度、异构体分辨的单细胞空间转录组分析 | NA | 实现组织内单细胞的全转录组尺度、异构体分辨的空间转录组分析，以系统理解细胞和组织的功能 | 小鼠大脑组织中的单细胞 | 空间转录组学 | NA | MERFISH、原位RNA扩增 | NA | 图像 | 小鼠大脑中约33,000个不同RNA，包括约23,000个基因和约10,000个异构体 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 原位RNA扩增方法与多重误差鲁棒荧光原位杂交（MERFISH）整合 |
| 71 | 2026-09-19 |
Machine learning-driven decoding of maternal immune signatures in repeated pregnancy loss
2026-Sep-17, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014806
PMID:42752397
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序结合机器学习和基础模型解码复发性流产中母体免疫特征，并识别出CXCR4和JUN为候选药物靶点 | 结合基因型来源分析、监督机器学习模型和基于Transformer的基础模型（scGPT），优先识别母体T细胞为携带最显著且可泛化RPL相关特征的细胞群体，并通过计算药物重定位和网络中心性分析鉴定可成药分子候选物 | 研究仅提名候选靶点，尚未进行功能验证实验，且未在摘要中明确说明样本量大小 | 解析复发性流产中母体免疫耐受破坏的机制，识别与T细胞失调相关的可成药分子靶点 | 复发性流产患者的蜕膜组织以及孕早期对照组的蜕膜组织 | 机器学习 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | 监督机器学习模型, Transformer基础模型（scGPT） | 文本（单细胞转录组数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-09-19 |
Balancing lipid synthesis and oxidation promotes B cell response to vaccination during immunosuppression
2026-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI205170
PMID:42752450
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研究论文 | 该研究通过高维免疫分析、单细胞转录组学和功能代谢实验，揭示了脂质代谢失衡是实体器官移植受者疫苗应答受损的核心机制，并发现靶向胆固醇合成可部分恢复B细胞功能 | 首次将脂质代谢失调确定为免疫抑制状态下疫苗应答受损的核心决定因素，发现CD11c+ B细胞通过CPT1A介导的脂肪酸氧化在霉酚酸存在下保留分化能力，并证明药理学抑制胆固醇合成可部分恢复浆母细胞分化 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性，如样本量有限、机制研究主要集中于体外实验、临床干预验证尚需进一步开展等 | 阐明免疫抑制治疗破坏人类B细胞疫苗应答的机制，并寻找可靶向的调控节点以改善免疫抑制患者的体液免疫 | 实体器官移植受者（SOTRs）及健康个体的B细胞 | 免疫学 | 移植免疫抑制相关免疫缺陷 | 高维免疫分析、单细胞转录组学、功能代谢实验 | NA | 单细胞转录组数据、功能代谢数据 | 实体器官移植受者及健康个体的B细胞样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-09-19 |
A Molecularly Anchored Spatial Transcriptomic Framework for Precise CA1-Subiculum Parcellation and Region-Resolved Analysis in Alzheimer's Disease
2026-Sep-17, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag094
PMID:42752570
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研究论文 | 该研究利用Stereo-seq空间转录组学和单核RNA测序数据，建立了分子锚定的CA1-下托分区框架，用于阿尔茨海默病海马区域的精确划分和区域分辨分析 | 首次提出分子锚定的空间转录组学框架来定义CA1与下托的区域身份，突破传统细胞构筑边界的模糊性；发现FN1和ETV1作为下托富集标志物，并在多数据集和多物种中验证；在保留CA1-下托界面生物学连续性的同时实现可重复的区域分子划分 | 样本量有限（12个供体）；FN1和ETV1作为下托标志物的特异性仍需更广泛验证；代谢功能改变的转录关联仅为探索性发现，缺乏功能验证 | 开发分子锚定的空间转录组学框架，实现CA1与下托界面的精确分子划分，并在阿尔茨海默病中进行区域分辨的转录分析 | 人类海马组织（CA1和下托区域），包括12个供体的Stereo-seq数据、10X Genomics空间转录组数据、小鼠原位杂交数据和小鼠空间转录组数据，以及阿尔茨海默病患者组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | Stereo-seq空间转录组学, 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位杂交 | NA | 空间转录组数据, 图像, 文本 | 12个人类供体的海马Stereo-seq数据集，以及额外的人类10X Genomics空间转录组、小鼠原位杂交和小鼠空间转录组数据 | 华大智造, 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | Stereo-seq, 10x Genomics空间转录组平台 | Stereo-seq高清晰度空间转录组学平台，10x Genomics空间转录组学平台 |
| 74 | 2026-09-19 |
A single-cell atlas of large B cell lymphomas reveals distinct malignant archetypes predictive of clinical outcomes
2026-Sep-17, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2026033056
PMID:42752800
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研究论文 | 该研究对63例大B细胞淋巴瘤（LBCL）肿瘤活检样本进行单细胞RNA测序、BCR测序和TCR测序，构建了LBCL的单细胞图谱，揭示了恶性B细胞的五种转录原型及其与临床预后的关联 | 首次在LBCL中鉴定出五种保守的恶性B细胞转录原型，这些原型可在同一肿瘤中共存但比例不同；发现以记忆B细胞特征和静息标志物为特点的原型4高丰度与标准免疫化疗后不良的无事件生存期相关，并通过bulk RNA-seq数据解卷积在独立队列中验证；提出了基于恶性细胞状态量化的患者分层新框架 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 理解大B细胞淋巴瘤异质性的细胞和分子基础，基于恶性细胞状态量化进行患者分层，为LBCL的精准治疗提供依据 | 63例大B细胞淋巴瘤（LBCL）肿瘤活检样本，其中大多数分类为弥漫性大B细胞淋巴瘤非特指型（DLBCL NOS） | 单细胞组学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, BCR测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 文本 | 63例LBCL肿瘤活检样本 | NA | single-cell RNA-seq, BCR-seq, TCR-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-09-19 |
Murine modeling of IDH-mutant 1p/19q-codeleted oligodendroglioma reveals genotype specific phenotypes
2026-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag228
PMID:42752889
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研究论文 | 该研究通过子宫内电穿孔技术构建了模拟人类IDH突变型1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤的小鼠模型，并对其遗传、组织和转录特征进行了表征 | 首次建立了能够重现人类IDH突变型1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤遗传、组织和转录特征的自发性基因工程小鼠模型 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 建立能够忠实重现人类IDH突变型1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤遗传和表型特征的小鼠模型 | 小鼠模型 | 数字病理学 | 少突胶质细胞瘤 | 子宫内电穿孔，RNA测序，单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 图像，文本 | NA | NA | bulk RNA-seq，single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-09-19 |
Mitochondria-Associated Transcription Precedes Oxidative Phosphorylation in Human Embryos
2026-Sep-17, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag117
PMID:42752920
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研究论文 | 该研究通过器官特异性转录组分析框架，对人类胚胎植入前发育过程中线粒体相关基因和线粒体转录基因的表达进行了系统分析 | 首次应用基于MitoCarta 3.0数据库的器官特异性转录组分析框架，揭示了线粒体相关转录在氧化磷酸化之前发生，并发现线粒体转录基因和核编码基因在不同发育阶段分别驱动聚类，线粒体基因表达谱可部分区分滋养外胚层与内细胞团 | 研究基于公共数据集的二次分析，样本量有限，仅使用了两个公开的人类单细胞RNA测序数据集，未进行实验验证 | 探究人类植入前胚胎发育过程中核编码线粒体相关基因和线粒体转录基因的转录活性及其在早期胚胎发育中的角色 | 人类植入前胚胎，包括从卵母细胞到囊胚阶段的单个细胞，以及从囊胚中分离的滋养外胚层和内细胞团细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个公开的人类单细胞RNA测序数据集，第一个涵盖从卵母细胞到囊胚阶段的单个细胞，第二个比较了囊胚中分离的滋养外胚层和内细胞团细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-09-19 |
Analysis of the expression of genes encoding the endothelin signaling pathway in fetal, healthy and diseased adult human heart using single-cell transcriptomics
2026-Sep-17, Canadian journal of physiology and pharmacology
IF:1.7Q4
DOI:10.1139/cjpp-2026-0097
PMID:42753274
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研究论文 | 该研究利用已发表的单细胞/单核RNA测序数据，绘制了健康胎儿、健康成人和患病成人心脏中内皮素信号通路主要基因（EDN1、EDN2、EDN3、EDNRA、EDNRB、ECE1和ECE2）的细胞表达图谱。 | 结合多个数据库，系统比较了内皮素信号通路基因在健康胎儿、健康成人和患病成人心脏中的细胞类型特异性表达模式，首次发现心肌缺血时ECE1在壁细胞（特别是周细胞）中显著上调，揭示了潜在的治疗靶点。 | 研究基于已发表的单细胞/单核RNA测序数据，可能存在批次效应和平台差异；样本来源和数量有限，可能影响结果的普遍性；未进行实验验证。 | 利用单细胞转录组学技术，分析内皮素信号通路相关基因在人类心脏不同发育阶段和疾病状态下的细胞表达特征，寻找潜在药物干预靶点。 | 健康胎儿、健康成人和患病成人的人类心脏组织 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于已发表的单细胞/单核RNA测序数据，具体样本数未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-09-19 |
Multimodal AI and single-cell transcriptomics integrate to construct a histopathological prognostic model for bladder cancer, revealing the RTN3-glycolysis axis in chemoresistance
2026-Sep-15, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00825-w
PMID:42745263
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学与多模态人工智能，构建膀胱癌组织病理学预后模型，并揭示RTN3-糖酵解轴在化疗耐药中的作用 | 首次将单细胞水平拷贝数变异异质性与常规H&E染色病理图像通过多模态AI相结合构建预后模型，并发现RTN3通过JAK2/STAT3通路调控糖酵解代谢重编程介导吉西他滨耐药 | 模型风险评分与转录组HCNV活性仅呈显著但中等程度相关，功能验证主要基于膀胱癌细胞系，缺乏大规模前瞻性临床队列验证 | 构建基于常规病理切片的膀胱癌预后预测模型，并阐明高拷贝数变异亚群驱动化疗耐药的分子机制 | 膀胱癌患者单细胞转录组数据及膀胱癌细胞系 | 数字病理 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, inferCNV, 多组学分析 | CNN, 深度学习 | 图像, 文本 | 6个公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-09-19 |
Cell-type-specific circadian and light-responsive transcriptional dynamics in adult Drosophila neurons
2026-Sep-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2619143123
PMID:42709819
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研究论文 | 该研究使用遗传多重标记策略和单核RNA测序技术，在光暗和恒定黑暗条件下对成年果蝇昼夜节律神经元进行12个时间点的转录组分析，揭示了昼夜节律神经元的细胞类型特异性转录动态 | 1) 使用遗传多重标记策略在单次实验中同时分析多个时间点的昼夜节律神经元转录组，减少时间点之间的混杂技术变异；2) 利用El-INTACT方法从冷冻头部纯化细胞核，实现了大规模单核RNA测序；3) 在光暗和恒定黑暗两种条件下检测了12个时间点，增强了基因表达的时间分析能力 | 之前的单细胞RNA测序研究结论需要验证和扩展，研究仅限于果蝇昼夜节律神经元，未涉及其他神经元类型或物种 | 验证和扩展之前单细胞RNA测序对昼夜节律神经元分子亚型的研究结论，全面揭示成年果蝇昼夜节律神经元的基因表达异质性以及内在时钟机制和光信号如何在不同昼夜节律神经元亚型中整合 | 成年果蝇中央脑中的昼夜节律神经元（约240个昼夜节律神经元，包含超过25种不同的神经元亚型） | 机器学习 | NA | 单核RNA测序 | NA | 文本 | 成年果蝇中央脑的昼夜节律神经元，在光暗和恒定黑暗条件下12个时间点进行采样 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-09-19 |
Resolving cell lineages and gene functions in the developing mouse gastrointestinal tract using in utero transduction
2026-Sep-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2614077123
PMID:42715084
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研究论文 | 本文介绍了一种子宫内慢病毒纳米注射策略，结合DNA条形码和单细胞转录组测序技术，解析了发育中小鼠胃肠道各细胞谱系的克隆关系及基因功能 | 开发了一种子宫内慢病毒纳米注射策略，能够早期高效地靶向发育中肠道所有主要细胞类型及肠道神经支配神经节的祖细胞，并结合DNA条形码和单细胞转录组测序技术，首次系统性地解析了肠道各谱系（上皮、神经、免疫和间充质细胞）的克隆关系，同时将该平台改造用于时间可控的细胞类型特异性基因操作 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证；子宫内注射技术的效率和可重复性可能受操作者技术影响；研究主要聚焦于发育早期阶段，对出生后及成年期的谱系关系涉及较少 | 解析器官发育过程中细胞谱系的起源和基因调控机制，建立一种广泛适用的体内框架来探究胃肠道和神经嵴发育过程中的基因功能 | 发育中小鼠胃肠道的各种细胞谱系，包括上皮细胞、神经细胞（肠神经系统）、免疫细胞和间充质细胞，以及肠道神经支配神经节 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序、DNA条形码、慢病毒纳米注射 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |