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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-07-25 |
Single-cell transcriptomic analysis of endometrium pre-receptivity and receptivity stages in porcine
2026-Sep, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101219
PMID:42139939
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2026-07-15 |
A Porcine Model of Intervertebral Disc Injury Recapitulates Human Discogenic Pain Via Notochordal Cell Loss and Pain-Inducing Nucleus Pulposus Cell Emergence
2026-Sep, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.70200
PMID:42428568
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研究论文 | 通过猪模型研究椎间盘损伤引发的椎间盘源性疼痛,并验证其与人类病理的关联 | 首次在猪模型中结合MRI、生物行为测试和多组学分析全面量化椎间盘源性疼痛,并发现脊索细胞向髓核细胞分化与疼痛机制相关 | 猪模型中脊索细胞持续存在与人类不同,可能影响疼痛模型的直接转化性 | 建立猪椎间盘损伤模型的疼痛量化方法并验证其与人类椎间盘源性疼痛的相关性 | 猪的椎间盘和背根神经节组织 | NA | 椎间盘源性疼痛 | 单细胞转录组学、轨迹分析、细胞间通讯分析 | NA | 多组学数据(转录组、单细胞转录组)、MRI图像、行为测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2026-07-15 |
A systematic benchmark of bioinformatics methods for single-cell and spatial RNA-seq nanopore long reads data
2026-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag070
PMID:42441075
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研究论文 | 针对单细胞和空间长读RNA-seq数据,系统评估了十种生物信息学方法的性能 | 首次通过配对短读和纳米孔长读单细胞数据集,全面比较了条形码/UMI检测、解复用、基因表达谱分析和异构体检测等四个分析维度的工具性能 | 未提及长期稳定性评估或不同平台间通用性分析 | 评估和比较用于单细胞和空间长读转录组数据处理的生物信息学方法 | 十种现有最先进的生物信息学方法,包括条形码/UMI检测、解复用、基因表达分析和异构体检测工具 | 计算生物学 | 无特定疾病 | 纳米孔长读测序 | NA | RNA测序数据(包含短读和长读) | 实验和模拟数据集,包含不同协议、测序深度和化学试剂条件下的样本 | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Nanopore | 使用配对短读和纳米孔长读数据集,具体配置未详细说明 |
| 384 | 2026-07-13 |
Imbalanced neurogenesis and gliogenesis in the developing neocortex of mice lacking the proteoglycan Tsukushi
2026-Sep, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.05.009
PMID:42217743
|
研究论文 | 研究缺失蛋白聚糖Tsukushi的小鼠新皮层发育中神经发生与胶质发生的失衡 | 首次揭示了蛋白聚糖TSK在调控新皮层神经发生和胶质发生平衡中的作用,并发现其缺失会导致脑积水 | 未涉及TSK作用的具体分子机制及其在人类疾病中的相关性 | 探究蛋白聚糖Tsukushi在哺乳动物新皮层发育中调节神经发生与胶质发生的作用 | 新生小鼠新皮层组织 | 神经发育生物学 | 脑积水 | 单细胞转录组学, mRNA和蛋白质水平验证 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常小鼠和TSK基因敲除小鼠的新皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2026-07-10 |
Vesicular QSOX1-MMP2 from inflammatory cancer-associated fibroblasts degrades the extracellular matrix to drive colorectal cancer pulmonary dissemination
2026-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218645
PMID:42217558
|
研究论文 | 本研究揭示炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡携带QSOX1-MMP2复合物降解细胞外基质,驱动结直肠癌肺转移 | 首次发现炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡中QSOX1选择性富集,并能与MMP2结合促进其分泌和活性,从而重塑转移微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限,且QSOX1抑制剂Ebselen的安全性需进一步评估 | 阐明结直肠癌肺转移中基质细胞介导的转移定植机制,并探索靶向QSOX1的治疗策略 | 结直肠癌肺转移小鼠模型中的炎性癌相关成纤维细胞及其分泌的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 结直肠癌肺转移小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 386 | 2026-07-08 |
Identification of novel diagnostic biomarkers and host-directed drug screening for Mycobacterium avium infection: A multi-omics and artificial intelligence study
2026-Sep, SLAS discovery : advancing life sciences R & D
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.slasd.2026.100317
PMID:42276326
|
研究论文 | 结合多组学和人工智能识别鸟分枝杆菌感染的新型诊断标志物并进行宿主导向药物筛选 | 首次通过单细胞RNA测序与机器学习整合分析,揭示鸟分枝杆菌感染中髓系细胞重编程的MIF-APP轴机制,并基于113种机器学习算法筛选出高精度诊断模型及潜在免疫调节剂Wogonin | 依赖外周血样本,未验证组织或不同亚群中的免疫特征;临床验证样本量和动物模型数据有限 | 解析鸟分枝杆菌感染中的宿主免疫重塑机制,特别是髓系异质性,并识别精准诊断标志物与治疗靶点 | 鸟分枝杆菌感染患者的外周血样本 | 机器学习 | 鸟分枝杆菌感染 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | Stepglm+GBM | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2026-07-08 |
Polystyrene microplastics drive chondrotoxicity in osteoarthritis through inducing ER stress and apoptosis via NFKB1 activation
2026-Sep, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116166
PMID:42162659
|
研究论文 | 本研究结合网络毒理学和转录组学分析,发现聚苯乙烯微塑料通过激活NFKB1诱导内质网应激和细胞凋亡,从而加剧骨关节炎的软骨毒性 | 首次揭示聚苯乙烯微塑料通过NFKB1驱动内质网应激和凋亡通路促进骨关节炎进展的分子机制,并利用机器学习鉴定了六个潜在的早期诊断生物标志物 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序,缺乏体内动物模型验证,且NFKB1的上下游调控网络尚未完全阐明 | 阐明聚苯乙烯微塑料在骨关节炎发病机制中的作用及其分子通路 | 聚苯乙烯微塑料对软骨细胞的影响及骨关节炎相关分子机制 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、分子对接、动态模拟 | 机器学习模型、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本量,涉及网络毒理学分析和体外软骨细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2026-07-08 |
Integrated Multiomics Reveals Key Drivers and Immune Cell Phenotypes of Infrapopliteal Atherosclerosis and Calcification
2026-Sep, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2026.05.073
PMID:42176975
|
研究论文 | 整合多组学揭示膝下动脉粥样硬化和钙化的关键驱动因子及免疫细胞表型 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化等多组学方法,鉴定出HLA-B是膝下动脉粥样硬化的关键致病基因,并识别出因果相关的免疫细胞表型 | 未提及具体局限性 | 识别驱动膝下动脉粥样硬化和钙化的关键基因和免疫细胞表型,开发靶向治疗策略 | 膝下动脉粥样硬化和钙化患者样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ST, SMR, MR | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 389 | 2026-07-05 |
Single-cell RNA-seq reveals increased TNFRSF9+ senescent fibroblasts and enhanced crosstalk between TNFRSF9+ fibroblasts and neural cells in keloids
2026-Sep, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.108063
PMID:42150394
|
research paper | 利用单细胞RNA测序揭示瘢痕疙瘩中TNFRSF9+衰老成纤维细胞增多及其与神经细胞交互增强 | 首次鉴定出TNFRSF9+衰老成纤维细胞亚群,并发现其与神经细胞的强交互作用在瘢痕疙瘩形成中的关键角色 | 未说明具体局限性 | 探究瘢痕疙瘩成纤维细胞异质性及其在病理过程中的作用机制 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞及神经细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病(瘢痕疙瘩) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CellChat细胞间通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在标题和摘要中说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未在标题和摘要中提供具体平台配置 |
| 390 | 2026-07-04 |
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124503
PMID:42214611
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示昼夜节律紊乱通过TREM2+巨噬细胞介导的骨吸收加剧牙周炎的机制 | 首次发现TREM2+巨噬细胞亚群在昼夜节律紊乱条件下选择性扩增,并建立BMAL1-TREM2调控轴,揭示昼夜节律紊乱通过破坏该时间门控机制导致持续性TREM2过表达和骨吸收 | 研究主要基于小鼠模型,未在人体组织中验证该机制;CUT&Tag测序仅限于体外实验,体内直接证据不足 | 阐明昼夜节律紊乱如何感知并转化为局部炎症性骨丢失的分子机制 | CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织及巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag测序 | NA | 单细胞转录组数据 | CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 391 | 2026-07-04 |
METTL3 depletion mitigates hypoxic pulmonary arterial smooth muscle cell over-proliferation via YTHDF2-dependent regulation of FOXO1 mRNA N6-methyladenosine modification: a potential mechanism of hypoxic pulmonary hypertension
2026-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124466
PMID:42162687
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研究论文 | 本文探究了METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖的作用及其分子机制 | 首次发现METTL3-YTHDF2-FOXO1轴通过调控FOXO1 mRNA的m6A甲基化修饰驱动低氧性肺动脉平滑肌细胞增殖,为肺动脉高压治疗提供新靶点 | NA | 阐明METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖中的作用 | 人肺动脉高压组织、平滑肌特异性Mettl3敲除小鼠、低氧性肺动脉高压模型、人肺动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, MeRIP-qPCR, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2026-06-25 |
Single-cell profiling identifies an AIM2-dependent macrophage program amplifying T cell-mediated acute cardiac allograft rejection
2026-Sep-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116951
PMID:42235315
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术解析心脏移植排斥反应中巨噬细胞亚群特征,发现AIM2炎症小体通路在促进T细胞介导的急性排斥中起关键作用 | 首次在单细胞水平上鉴定心脏移植排斥中M1样巨噬细胞的AIM2依赖性程序,证明其通过增强共刺激活化和初始T细胞启动放大排斥反应,提出AIM2抑制剂作为心脏移植辅助疗法的潜在策略 | NA | 表征心脏移植急性排斥过程中巨噬细胞亚群特征及AIM2炎症小体在促炎巨噬细胞中的作用机制 | 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本中的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 393 | 2026-06-23 |
8-Chloroadenosine suppresses hepatocellular carcinoma progression via ADAR1/PPARγ axis-mediated lipid metabolism
2026-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101874
PMID:42327978
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研究论文 | 8-氯腺苷通过ADAR1/PPARγ轴调节脂质代谢抑制肝细胞癌进展 | 首次揭示ADAR1通过直接结合mRNA调控脂质代谢促进肝癌进展,并发现8-氯腺苷通过抑制ADAR1及后续PPARγ介导的脂质代谢过程抑制肝癌发生发展 | 现有关于肝癌脂质代谢分子调控网络的知识仍不完整 | 揭示ADAR1在肝癌进展中的作用及其通过脂质代谢调控的机制,并探索8-氯腺苷的治疗潜力 | 肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学方法,包括单细胞测序数据库、临床样本分析和细胞模型 | NA | 转录组数据 | 使用公开单细胞测序数据库中的样本,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基于公开单细胞测序数据库的数据分析 |
| 394 | 2026-06-13 |
LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations
2026-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112560
PMID:42066829
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研究论文 | 该研究揭示了LC3B通过Sp1-cyclin D1/p27轴促进膀胱癌细胞增殖的机制,并评估了其在多种癌症中的临床相关性 | 首次发现LC3B通过非经典自噬途径调控细胞周期,即通过增强Sp1介导的Cyclin D1转录并抑制p27表达,促进G1/S期转换,从而驱动膀胱癌细胞增殖 | LC3B的非脂化依赖性功能机制尚未完全阐明,且泛癌分析主要基于转录组数据,缺乏蛋白水平的验证 | 阐明LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能和分子机制,并评估其在多种人类癌症中的临床相关性 | 膀胱癌上皮细胞以及T24T和J82膀胱癌细胞系 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及膀胱癌T24T和J82细胞系,以及多种肿瘤类型的泛癌分析数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2026-06-13 |
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557
PMID:42069175
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研究论文 | 该研究利用整合组学和实验验证,发现BTN3A3通过与TOMM22相互作用维持线粒体稳态,促进肝癌干性和耐药性,并揭示了pan-BTN3单克隆抗体5E08的潜在治疗价值 | 首次揭示BTN3A3在肝癌中通过非免疫途径驱动线粒体重编程促进干性和耐药的新机制,并发现TOMM22是BTN3A3的新型相互作用蛋白 | 未明确说明研究局限性 | 探究线粒体功能与肝癌干性之间的分子机制,寻找新的治疗靶点 | BTN3A3、TOMM22、肝细胞癌(HCC)细胞系、CD90/EpCAM癌症干细胞、原位异种移植模型、患者来源类器官(PDOs) | 数字病理学 | 肝癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、质谱分析、免疫共沉淀、原位异种移植模型、患者来源类器官 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 涉及HCC细胞系、原位异种移植模型和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 396 | 2026-06-13 |
Targeting dysregulated glycolysis in type 2 diabetic osteoporosis: Identification of a diagnostic gene signature and therapeutic validation of calcifediol
2026-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124473
PMID:42184924
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研究论文 | 结合生物信息学与实验验证,鉴定2型糖尿病骨质疏松(T2DOP)中与糖酵解失调相关的诊断基因特征,并验证骨化二醇的治疗效果 | 首次综合运用差异表达分析、WGCNA、113种机器学习算法和scRNA-seq,系统鉴定T2DOP糖酵解相关核心生物标志物,并通过分子对接和体内实验验证骨化二醇的治疗潜力 | 骨化二醇的临床价值需在后续研究中进一步验证 | 探究2型糖尿病骨质疏松中糖酵解相关基因的机制,并筛选潜在治疗药物 | 2型糖尿病骨质疏松患者及T2D小鼠模型 | 机器学习 | 2型糖尿病骨质疏松 | 生物信息学分析、scRNA-seq、分子对接 | 机器学习模型(113种算法) | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 骨质疏松与2型糖尿病数据集的合并数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 397 | 2026-06-13 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts promote the glycolysis of myeloid-derived suppressor cells via TREM1/mTOR axis
2026-Sep-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116961
PMID:42242136
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示类风湿关节炎中成纤维样滑膜细胞通过TREM1/mTOR轴促进髓系抑制细胞糖酵解的机制 | 首次阐明TREM1信号在介导成纤维样滑膜细胞与髓系抑制细胞交互作用中的关键角色,并揭示其通过PI3K-AKT-mTOR-HIF-1α级联驱动糖酵解重编程的机制 | 未提供明显局限性信息 | 探究类风湿关节炎中髓系抑制细胞代谢重编程的驱动因素及调控机制 | 类风湿关节炎患者的髓系抑制细胞和成纤维样滑膜细胞(MH7a细胞) | 机器学习和数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组学、细胞外酸化率检测、葡萄糖摄取和乳酸生成检测 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢检测数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 398 | 2026-06-09 |
Wumei Wan restores the colonic mucus barrier by modulating TGF-β/Smad signaling to promote goblet cell differentiation in ulcerative colitis
2026-Sep-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121837
PMID:42140533
|
研究论文 | 该研究通过整合定量蛋白质组学、单细胞RNA测序和结肠类器官等技术,揭示了乌梅丸通过调节TGF-β/Smad信号通路促进杯状细胞分化、恢复溃疡性结肠炎结肠黏液屏障的作用机制 | 首次系统阐明了乌梅丸通过TGF-β/Smad信号轴调控肠道祖细胞向杯状细胞分化的分子机制,实现了从动物表型到细胞命运的跨尺度验证 | 研究未提及临床试验验证,且分子机制的深入探索(如具体靶点蛋白)可能仍需进一步实验支持 | 阐明乌梅丸改善溃疡性结肠炎的分子机制,重点关注杯状细胞命运调控和黏液屏障修复 | 溃疡性结肠炎小鼠模型、结肠类器官和细胞系 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 超高效液相色谱-高分辨质谱, 分子对接 | NA | 图像 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型,未提及具体样本数量 | Illumina | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2026-06-05 |
Genome-resolved metagenomics of the tumour microbiome: From strain diversity to functional cancer ecology
2026-Sep, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156543
PMID:42166940
|
综述 | 本文从基因组解析宏基因组学角度综述肿瘤微生物组的菌株多样性及功能生态在癌症中的作用 | 提出一个整合基因组解析、空间和功能视角的“肿瘤宏基因组框架”,将肿瘤微生物生态与癌症演化、免疫调节及转化干预联系起来 | 未提及具体局限性 | 综述肿瘤微生物组在菌株水平多样性、功能性生态及其在癌症进展和治疗中的影响 | 肿瘤相关微生物及其基因组、功能基因和代谢模块 | 机器学习和多组学分析 | 多癌种 | 宏基因组学、空间转录组学、单细胞测序、宏转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、空间数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞测序 | NA | NA |
| 400 | 2026-05-17 |
GRK5 in dorsolateral septal somatostatin neurons mediates chronic stress-induced depression via the AKT-mTORC1 pathway
2026-Sep-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110997
PMID:42061809
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序发现,慢性束缚应激导致小鼠背外侧隔核中表达生长抑素的GABA能神经元特异性下调GPCR激酶5,并通过AKT-mTORC1信号通路调控抑郁样行为 | 首次鉴定出背外侧隔核生长抑素神经元中的GRK5作为抑郁治疗的新靶点,并阐明了其通过AKT-mTORC1通路发挥作用的机制 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;且未探讨GRK5在其他脑区或神经元类型中的潜在作用 | 探究背外侧隔核生长抑素神经元中GRK5在慢性应激诱导抑郁中的作用及分子机制 | 小鼠背外侧隔核中的生长抑素阳性GABA能神经元 | machine learning | depression | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 慢性束缚应激模型小鼠和慢性社交挫败应激模型小鼠,具体数量未在摘要中说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |