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当前共找到 403 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-09-04
The pseudouridine epitranscriptomic landscape of advanced prostate cancer therapeutic resistance identifies TIMM17A as a key player
2026-Sep-02, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 该研究描绘了晚期前列腺癌治疗耐药中的伪尿苷表观转录组图谱,并确定TIMM17A为关键调控因子 首次系统描绘了晚期前列腺癌耐药中的伪尿苷(Ψ)表观转录组景观,并鉴定出TIMM17A作为新型治疗耐药介质 未明确提及,但可能包括体外和异种移植模型的局限性,以及公共数据集验证的依赖性 探索伪尿苷修饰在前列腺癌对雄激素受体信号抑制剂(ARSIs)耐药中的作用及机制 晚期前列腺癌细胞、异种移植肿瘤、单细胞RNA测序数据及公共数据集中的患者样本 数字病理学 前列腺癌 RNA测序、PA-Ψ测序 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA PA-Ψ-seq技术
262 2026-09-04
REG3α is a Predictive Biomarker of Complicated Disease from Preclinical through Established Crohn's Disease
2026-Sep-02, Clinical gastroenterology and hepatology : the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association IF:11.6Q1
研究论文 本研究评估了血清REG3α作为克罗恩病进展预测生物标志物的潜力,涵盖临床前至已确诊阶段。 首次表明血清REG3α在CD诊断前长达10年即可预测复杂病程,且独立于疾病活动性,并关联Paneth细胞亚群变化。 未明确提及局限性,但可推断需要更大样本验证及机制研究的深度限制。 评估血清REG3α与克罗恩病进展的关联及其作为非侵入性预后生物标志物的潜力。 克罗恩病患者及临床前个体,包括来自三个队列的血清和组织样本。 数字病理学 克罗恩病 RNA测序,单细胞RNA测序 NA 血清样本、组织活检(RNA测序数据) 394名患者(横断面队列),预诊断队列样本,配对回肠和结肠活检 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
263 2026-09-04
GTPase RAB31 supports ANXA1-driven macrophage education through clathrin-mediated endocytosis to suppress antitumor immunity
2026-Sep-02, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了小GTP酶RAB31通过网格蛋白介导的内吞作用支持ANXA1驱动的巨噬细胞教育,从而抑制抗肿瘤免疫的机制 首次阐明RAB31在肿瘤相关巨噬细胞极化中的关键作用及其通过CME依赖方式维持FPR2稳定性、调节抗肿瘤免疫的分子机制 摘要中未提及研究局限性 探究RAB31通过网格蛋白介导的内吞作用调节肿瘤相关巨噬细胞极化及其对抗肿瘤免疫的影响 肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞、小鼠肿瘤模型 免疫学, 肿瘤生物学 多种癌症(未特指) 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 质谱, 共免疫沉淀, 基因敲除小鼠 NA 基因表达数据、图像数据、流式细胞数据 多种人类癌症的公共scRNA-seq数据集及小鼠皮下肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
264 2026-09-04
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2026-Sep-02, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究整合高分辨率空间转录组学和谱系追踪技术,揭示了Kras;Trp53驱动的肺腺癌小鼠模型中肿瘤生长和转移的动态空间结构 创新地将空间转录组学与谱系追踪技术相结合,引入肿瘤系统地理学概念,从空间维度解析亚克隆扩张对微环境重塑及转移的影响 摘要中未提及明确的限制 阐明肿瘤扩张、可塑性和转移如何与微环境重塑共同演化,以及癌细胞状态和微环境结构的顺序变化如何协同促进肿瘤进展 Kras;Trp53驱动的肺腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞及其微环境 空间转录组学、谱系追踪 肺腺癌 空间转录组学、谱系追踪 NA 空间基因表达数据、谱系追踪数据 小鼠肿瘤样本(具体数量未在摘要中提及) NA 空间转录组学 NA NA
265 2026-09-04
Glutathione Primes Mitochondrial Autophagy to Guide Pulp-Dentine Complex Repair
2026-Sep-02, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 该研究利用多组学整合方法,揭示了谷胱甘肽通过PINK1/Parkin线粒体自噬轴引导牙髓-牙本质复合体修复的分子机制 首次通过多组学整合(单细胞转录组、蛋白质组和代谢组)系统阐明谷胱甘肽代谢在牙本质生成中的中心调控作用,并发现GCLC介导的GSH抗氧化系统通过PINK1/Parkin线粒体自噬轴调节牙髓细胞分化,提出新的代谢-氧化信号回路作为再生牙髓病学的潜在治疗靶点 摘要未明确提及研究局限性 阐明人牙髓干细胞成牙本质分化过程中调控牙髓-牙本质复合体修复的关键分子机制 人牙髓干细胞(hDPSCs)、龋坏和健康牙髓组织、小鼠磨牙损伤模型 数字病理学 牙髓损伤和龋病 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 NA 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物数据、图像数据 人类龋坏和健康牙髓组织,hDPSCs培养,小鼠磨牙损伤模型 NA 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 NA NA
266 2026-09-04
Spatial Mapping of the Precancer-to-Cancer Transition in Breast and Prostate
2026-Sep-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 利用光片显微镜和空间转录组学,绘制乳腺和前列腺癌前病变向浸润性癌转变的空间图谱,并识别关键基因和免疫细胞特征 开发了一种整合体积重建和空间转录组学的多模态连续切片工作流,并首次用于描绘两种激素驱动腺癌的癌前至癌症转变的过渡连接 未提及明显的局限性 研究乳腺和前列腺癌前病变向浸润性癌转变的基因表达特征和结构变化 乳腺和前列腺癌组织样本中的癌前病变和浸润性区域 数字病理学 乳腺癌, 前列腺癌 光片显微镜, 空间转录组学 NA 图像, 基因表达数据 51例病例,319个空间检测 NA 空间转录组学 NA NA
267 2026-09-04
Pulsed Electric Field Ablation Reprograms Tumor Immunity and Stimulates Germinal Center Formation in Tertiary Lymphoid Structures in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Sep-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 该治疗-切除临床研究评估了脉冲电场(PEF)消融在早期非小细胞肺癌(NSCLC)中调节抗肿瘤免疫的潜力,发现其可促进三级淋巴结构(TLS)中生发中心(GC)的形成 首次证明特异性PEF消融可诱导TLS中GC形成,上调CXCL13等细胞因子,并增强全身免疫,为增强免疫治疗反应提供新方法 该研究为探索性终点分析,样本量可能有限,且未报告长期临床结果或对免疫治疗反应的直接影响,具体局限性信息未见全文 评估专门PEF消融调节早期NSCLC抗肿瘤免疫的潜力,探索其诱导TLS及GC形成的能力 早期非小细胞肺癌患者的血液和肿瘤样本 数字病理学 肺癌 脉冲电场消融 NA 组织切片、细胞因子数据、单细胞RNA测序数据 治疗组与对照组患者,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
268 2026-09-04
Mast cell-derived IL-13 as a driver of Crohn disease-associated intestinal fibrosis
2026-Sep-01, Inflammatory bowel diseases IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过阻断IL-13或基因敲除,发现肥大细胞来源的IL-13驱动克罗恩病相关的肠道纤维化 首次确定肥大细胞是克罗恩病肠道纤维化中IL13的唯一来源,并证明IL-13而非IL-4是纤维化的关键驱动因子 研究主要基于SHIP缺陷小鼠模型,人类验证仅限于组织样本,未进行功能实验 识别驱动克罗恩病肠道纤维化的关键细胞因子及其细胞来源,以开发抗纤维化治疗 SHIP缺陷小鼠,克罗恩病患者的肠道组织样本 免疫学 克罗恩病 基因敲除,中和抗体,单细胞RNA测序,RNAscope 动物模型(SHIP基因缺陷小鼠) 基因表达数据,组织学图像 涉及SHIP小鼠和人类切除组织样本,具体数量未说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析
269 2026-09-04
Single-Cell Profiling Reveals Distinct Immune Hallmarks in Untreated Primary Colorectal and Liver Metastasis Cancers
2026-Sep, Chronic diseases and translational medicine
研究论文 本研究通过对未治疗的原发性结直肠癌和肝转移癌进行单细胞分析,揭示了独特的免疫特征。 发现了肝转移肿瘤微环境中的新特征,包括CXCL13+CD4 T细胞和调节性CD4 T细胞富集、耗竭型CD8+ T细胞增加、SPP1+肿瘤巨噬细胞增加、IGFBP7+癌症相关成纤维细胞的出现,以及亚油酸代谢通路的相对激活。 样本量较小(仅9例未治疗的结直肠癌肝转移患者),且未进行功能验证实验。 解码结直肠癌转移与原发部位的肿瘤微环境差异,为生物标志物和治疗策略提供新见解。 9未治疗的结直肠癌肝转移患者的36个样本(来自4个解剖位置)。 基因组学 结直肠癌 scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 9例患者、36个样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
270 2026-09-04
Clinical, Histopathological, and Molecular Characterization of Pediatric MN1::ZNF341-Associated Cancer
2026-Sep, Pediatric blood & cancer IF:2.4Q1
研究论文 本研究描述了四例伴有MN1::ZNF341融合的儿童恶性肿瘤,包括三例新生儿(其中一对同卵双胞胎)和一例青少年,通过详细的临床、组织病理学和分子特征分析,确认其与神经母细胞瘤和圆形细胞肉瘤等主要类似疾病不同,并表现出类固醇生成分化。 首次描述了四例新的MN1::ZNF341相关肿瘤,扩大了该疾病的临床病理谱,并通过单细胞RNA测序确认其独特的转录特征,区别于神经母细胞瘤。 样本数量有限,且未发现其他驱动事件,可能限制对肿瘤发生机制的全面理解。 揭示MN1::ZNF341相关儿童肿瘤的临床、组织病理学和分子特征,以区别于其他类似疾病,并进一步确认其作为一种独特的侵袭性儿童癌症。 四例患有MN1::ZNF341融合的儿童肿瘤患者,包括三例新生儿(含一对同卵双胞胎)和一例青少年。 数字病理学 儿童癌症 单细胞RNA测序,全基因组测序,靶向DNA测序 NA 基因表达数据,DNA序列数据,临床数据,病理图像 4例肿瘤样本(来自四名患者,其中一对为同卵双胞胎) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
271 2026-09-04
Beyond Morphology: Reframing Lymph-Node Metastasis Prediction Through Clonal Ecology-Decades-Long Genomic Instability and Polyclonal-to-Monoclonal Transitions as the Missing Dimension in Cancer
2026-Sep, Stem cells and development IF:2.5Q2
综述 本文通过克隆生态学视角重新审视结直肠癌淋巴结转移预测,整合计算病理学与进化肿瘤学,提出超越静态形态学特征的预测模型框架 提出将克隆生态学作为可测量的新维度,定义五大方法论支柱,并引入亚克隆转换板模型和AI多模态整合以实现进化感知的转移预测 文中未提供具体的实验验证数据或定量结果,主要基于文献综合和理论框架构建,缺乏临床前瞻性研究支持 旨在扩展基于形态学的转移预测模型,使其涵盖克隆进化、亚克隆动态和生态交互,以更准确预测淋巴结转移并识别治疗窗口 结直肠癌肿瘤及其进化过程中的克隆群体、亚克隆、肿瘤微环境和相关基因组/转录组数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、谱系追踪、空间转录组学、空间基因组学、液体活检、计算病理学 多实例学习、病理学基础模型 组织图像、单细胞转录组数据、空间转录组数据、基因组测序数据、纵向液体活检数据 未提供具体样本数量(文中提及一项KMT2A重排急性髓系白血病的纵向临床和实验研究作为支持性案例) NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、全基因组测序、谱系追踪 NA NA
272 2026-09-04
Phase I trial of autologous regulatory T cells for immune aplastic anemia
2026-Sep-01, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 一项针对免疫介导再生障碍性贫血患者的自体调节性T细胞I期临床试验,评估其安全性和疗效 首次在免疫再生障碍性贫血中测试自体扩增的调节性T细胞输注,并利用质谱流式和单细胞测序追踪体内持久性及相关标志物 该试验为I期,样本量小(6例),且未设置对照组,结果需进一步验证 评估自体调节性T细胞在难治/复发性免疫再生障碍性贫血患者中的安全性和初步疗效 对标准治疗抵抗或难治的免疫再生障碍性贫血患者 数字病理学 再生障碍性贫血 质谱流式、单细胞测序 NA 血液样本数据 6例患者 NA 单细胞测序 NA NA
273 2026-09-04
Spatial Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissue by spRandom-seq
2026-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 该研究介绍了一种基于随机引物的空间总RNA测序技术spRandom-seq,用于解析福尔马林固定石蜡包埋组织中的完整转录组,包括宿主、细菌和纳米级病毒RNA 采用随机引物设计,能同时捕获宿主、细菌和病毒的RNA,包括长链非编码RNA和可变剪接事件,兼容现有空间转录组平台且操作简便 未提及具体限制,如对RNA降解或组织类型的适用范围等可能存在的挑战 开发一种适用于FFPE组织的空间总RNA测序技术,以全面解析组织微环境中的转录景观,推动临床病理和感染诊断应用 小鼠大脑、嗅球,以及乳腺癌、肺炎克雷伯菌感染组织、乙型肝炎病毒阳性肝细胞癌的临床FFPE样本 空间转录组学 乳腺癌、感染性疾病、肝细胞癌 随机引物空间总RNA测序 NA 空间转录组数据,包括RNA序列和拷贝数变异数据 小鼠脑组织、嗅球及若干临床FFPE样本(具体数量未提供) NA 空间总RNA测序 spRandom-seq 基于随机引物和现有空间转录组平台
274 2026-09-04
A Functionally Constrained Immune Ecosystem in Microsatellite-stable Colorectal Cancer Resolved by Single-cell and Exome Profiling
2026 Sep-Oct, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
病例报告 通过单细胞和全外显子组测序分析一个微卫星稳定型结直肠癌病例,揭示T细胞丰富但免疫功能受限的微环境 首次在单细胞水平揭示MSS结直肠癌中T细胞丰度与免疫有效性脱节的现象 基于单一病例,缺乏多病例验证 探究MSS结直肠癌中T细胞浸润是否反映有效免疫或功能性免疫约束 一名77岁女性的错配修复完整、微卫星稳定型结直肠癌肿瘤、腺瘤及邻近正常组织 数字病理学 结直肠癌 全外显子组测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,外显子组测序数据 1例患者的肿瘤、腺瘤和邻近正常组织 NA 全外显子组测序,单细胞RNA测序 NA NA
275 2026-09-04
Multi-level Transcriptomic and Machine-learning Analyses Identify MZT1 as a Proliferation-associated Prognostic Marker in Lung Adenocarcinoma
2026 Sep-Oct, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 通过多层面转录组和机器学习分析,确定MZT1作为肺腺癌中与增殖相关的预后标志物 首次系统性地在肺腺癌中综合表征MZT1及其家族成员,结合多种转录组数据集、机器学习建模和单细胞测序,揭示了MZT1作为增殖相关标志物的潜在预后价值 未明确提及局限性 评估MZT1及相关家族成员在肺腺癌中的表达模式、预后关联及功能意义 肺腺癌患者样本及肿瘤组织,包括bulk转录组数据和单细胞RNA测序数据 机器学习 肺腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序 Cox比例风险模型、LASSO模型 转录组数据、单细胞数据、蛋白质表达数据 未明确提及具体样本数量 NA bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq NA NA
276 2026-09-04
Integrated Genomic and Proteomic Analysis Reveals T-B Lymphocyte Signatures in the MYCN Driven "Immune Desert" of Specific Neuroblastoma Subtypes
2026-Sep, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合基因组和蛋白质组分析,解析MYCN扩增驱动的高危神经母细胞瘤免疫抑制微环境,揭示特定亚型中T-B淋巴细胞特征 首次系统描绘MYCN驱动神经母细胞瘤的免疫沙漠表型,发现T细胞中REL和EOMES的失调网络及新型免疫抑制B细胞亚群B7,并整合单细胞、空间转录组和蛋白质组证据提出治疗靶点 EOMES/TRP轴和B7/MYC枢纽仅为生物信息学支持的假设,缺乏功能验证;空间转录组外部验证仅限于黑色素瘤 系统解析MYCN扩增如何塑造高危神经母细胞瘤的免疫抑制肿瘤微环境,阐明免疫逃逸的关键机制 高危神经母细胞瘤肿瘤微环境中的T淋巴细胞和B淋巴细胞 基因组学、转录组学、蛋白质组学、空间转录组学 神经母细胞瘤 bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、蛋白质组学、空间转录组学 无监督聚类、细胞通讯推断、转录调控网络重建 基因表达数据、单细胞表达数据、蛋白质表达数据、空间基因表达数据 bulk RNA-seq 721例,单细胞RNA-seq 9例,蛋白质组数据49例,空间转录组(含外部验证) 10x Genomics bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 10x Visium 10x Visium用于空间转录组分析
277 2026-09-04
Concerted changes in the pediatric single-cell intestinal ecosystem before and after anti-TNF blockade
2026-Sep-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,研究抗TNF治疗前后小儿克罗恩病肠道生态系统的一致变化 开发了无偏的分层聚类方法ARBOL,结合临床元数据解析治疗初治小儿克罗恩病患者的细胞状态向量,并发现抗TNF治疗推动肠道细胞生态系统向成人难治状态转变 样本量较小,且重复活检样本匹配有限,可能限制结果的普遍性 了解诊断时的细胞类型、亚群和状态预测疾病严重程度和治疗反应,以及抗TNF治疗对小儿肠道细胞生态系统的影响 小儿克罗恩病患者、非炎症性儿科对照(功能性胃肠疾病) 单细胞转录组学、计算生物学 克罗恩病(炎症性肠病) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、组织学、显微镜 分层聚类方法ARBOL 单细胞转录组数据、流式细胞数据、临床元数据、组织学图像 治疗初治小儿克罗恩病(14例)、匹配重复活检(8例)、非炎症性儿科对照(13例),共201,883个单细胞转录组 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
278 2026-09-04
Optimisation of Xenium automated in situ sequencing for PAXgene-fixed tissue samples
2026-Sep, Journal of histotechnology IF:0.6Q4
研究论文 本研究开发了一种优化的工作流程,将Xenium自动原位测序平台应用于PAXgene固定石蜡包埋(PFPE)组织,通过系统测试通透化条件,证实胃蛋白酶消化可增强RNA可及性,并实现了与FFPE和新鲜冷冻样本相当的转录检测效果 首次系统评估并优化了Xenium平台在PFPE组织上的应用,提出了新的Xenium组织优化(XTO)方案,并展示了通过调节通透化时间实现组织特异性的优化 研究中可能需要在转录检测率与组织完整性和形态学染色之间进行权衡,且优化条件可能需要根据组织类型进行额外调整 探索非标准保存格式(PAXgene固定)下空间转录组的应用,并提供一个将原位测序技术适应于PFPE组织的框架 多种小鼠和人类组织样本,包括PFPE、FFPE和新鲜冷冻格式 空间转录组学 不适用 原位测序 不适用 空间转录组数据 多种小鼠和人类组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium自动原位测序平台,结合Xenium组织优化(XTO)方案
279 2026-09-04
3D ex vivo platform for high-throughput immunotherapy screening in relapsed/refractory lymphoma patients
2026-Sep, HemaSphere IF:7.6Q1
研究论文 本文介绍了一种3D离体平台,用于对复发/难治性淋巴瘤患者进行高通量免疫治疗筛选 创新点在于开发了一种无支架、无基质的3D离体平台,能够生成患者来源的淋巴瘤球体,并保留原始肿瘤的细胞组成、T细胞激活和免疫逃逸特征,支持多重筛选和精准肿瘤学应用 文中未明确提及局限性 旨在建立一种忠实现保留患者样本免疫环境和活力的3D离体平台,用于相关的免疫治疗高通量药物测试,以指导复发/难治性B细胞淋巴瘤的治疗 研究对象为复发/难治性B细胞淋巴瘤患者,包括滤泡性淋巴瘤、转化型滤泡性淋巴瘤或弥漫性大B细胞淋巴瘤,样本来自外周血或淋巴结活检 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序、空间分析 3D球体模型 图像和单细胞转录组数据 未提供具体样本量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
280 2026-09-04
From Cluster to Claim: Calibrating Interpretation in Single-Cell Transcriptomics
2026-Sep, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
评论 本文倡导在单细胞转录组学研究中采用更为严谨的解读方法,并提出了一个三级逻辑框架(观察、推断、主张)来区分统计结果、生物学解释与机制性论断。 提出了一个清晰的三级逻辑框架(观察、推断、主张)来界定单细胞转录组研究中的证据与论断边界,并强调了在大型语言模型(LLM)日益介入领域时的校准必要性。 所提供的例子是说明性的,而非对该领域的系统性概述;因此,可能未完全覆盖所有潜在的解读风险。 倡导在单细胞转录组学研究中采用更严谨的解读方法,并强调证据强度与主张强度之间需进行校准。 单细胞转录组学研究中的常见推断误区(如计算集群等同于细胞类型、富集分析作为机制性证据)及分析逻辑框架。 生物信息学 NA 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA NA NA NA
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