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当前共找到 403 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-24 |
Glioma microenvironment: Cellular crosstalk, immunosuppression, and novel therapeutic perspectives
2026-Sep-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004151
PMID:42299115
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综述 | 本文综述了胶质瘤肿瘤微环境中细胞间相互作用、免疫抑制机制及新型治疗前景，整合了单细胞和空间转录组学的最新进展 | 整合了单细胞和空间转录组学方法揭示的胶质瘤肿瘤微环境异质性结构和功能生态位的最新见解 | 未提及 | 阐明胶质瘤肿瘤微环境中的细胞和分子机制，探讨靶向肿瘤微环境以克服治疗耐药和改善患者预后的治疗机会 | 胶质瘤肿瘤微环境，包括胶质瘤细胞、髓系细胞、适应性免疫细胞、内皮细胞、神经元和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-24 |
Predictive control of human pancreatic cell fate using a digital model of in vitro differentiation
2026-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.27.721124
PMID:42094425
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研究论文 | 该研究开发了一个预测性数字模型，整合大规模单细胞多组学数据，解析人胰腺干细胞分化过程中的细胞命运调控逻辑，并验证了新的调控因子 | 整合了9个原始单细胞多组学数据集和52个公共单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集，覆盖4个细胞系和7种分化方案，构建了能够进行时间分辨推断和扰动细胞状态特异性基因调控网络的数字模型，并发现了新的外分泌驱动因子和内分泌规范调控因子 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 实现成熟干细胞衍生胰岛的可控生成，推动糖尿病的可扩展细胞治疗 | 人干细胞来源的胰岛分化过程，包括内胚层祖细胞、胰腺外分泌和内分泌谱系 | 单细胞多组学、计算生物学 | 糖尿病 | 单细胞多组学、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | 数字模型 | 单细胞多组学数据、基因表达数据、染色质可及性数据 | 400,603个细胞，来自9个原始单细胞多组学数据集、52个公共单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集，涵盖4个细胞系和7种分化方案 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-24 |
CFTR facilitates fluid secretion by ferret alveolar type 2 cells
2026-Sep, Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society
IF:5.4Q1
DOI:10.1016/j.jcf.2026.05.004
PMID:42140858
|
研究论文 | 该研究通过建立雪貂原代AT2细胞的类器官和气液界面培养模型，结合scRNA-seq、电生理学和药理学方法，证明CFTR主要促进AT2细胞的氯离子和液体分泌而非吸收 | 首次利用雪貂原代AT2细胞建立类器官和ALI培养模型，结合scRNA-seq验证细胞纯度，系统证明CFTR在远端肺中主要介导液体分泌而非吸收，并验证了VX-770对G551D突变的功能 rescue 效果 | 研究基于体外雪貂模型，尚未在体内验证；ASL高度的部分恢复提示VX-770疗效有限；CFTR在吸收条件下的贡献虽最小但仍不能完全排除 | 探究CFTR在肺泡2型细胞中的功能及其对肺泡液体平衡的调控作用，明确其促进分泌还是吸收 | 雪貂原代肺泡2型（AT2）细胞及其衍生的类器官和气液界面培养物 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | scRNA-seq, 电生理学（Ussing chamber）, 类器官培养, 气液界面培养 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 图像 | 雪貂原代AT2细胞衍生的类器官和ALI培养物（具体样本量未在摘要中说明） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-09-23 |
Spatial transcriptomics identifies a suppressive, T-cell-excluded tumor microenvironment in extramedullary myeloma
2026-09-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2026020500
PMID:42379250
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研究论文 | 该研究对髓外骨髓瘤肿瘤活检组织进行空间转录组学分析，以表征其肿瘤微环境的组织结构和细胞间相互作用网络 | 首次对髓外骨髓瘤进行空间转录组学分析，揭示了三种反复出现的肿瘤微环境生态位（免疫排斥型、免疫抑制型和免疫允许型），发现免疫排斥型生态位占据肿瘤主体，并构建了浆细胞与肿瘤微环境之间复杂的双向信号网络模型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征髓外骨髓瘤的肿瘤微环境组织结构和空间组织特征，以识别该高危骨髓瘤亚型中可临床干预的微环境生态位和信号网络 | 髓外骨髓瘤患者的肿瘤活检组织 | 空间转录组学 | 骨髓瘤 | 空间转录组学 | 细胞间相互作用建模 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-23 |
Mapping brain-wide monosynaptic inputs to single neurons with ROInet-seq
2026-Sep-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101512
PMID:42413505
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研究论文 | 该研究开发了ROInet-seq技术，通过条形码化ΔG-RV病毒和靶向测序，实现单神经元全脑单突触输入网络的高通量、低成本空间映射 | 首次将条形码化ΔG-RV与定量RNA测序结合实现单细胞分辨率网络追踪；开发ROInet-seq——一种可扩展、低成本的空间检测方法，结合常规荧光成像和靶向条形码测序，能够在全脑范围内映射单神经元网络 | 未明确提及 | 实现单神经元分辨率下的全脑单突触输入网络映射 | 哺乳动物大脑（体感皮层）中的单神经元 | 空间转录组学, 神经科学 | NA | 条形码化ΔG-RV病毒追踪, 定量RNA测序, 靶向条形码测序, 荧光成像 | NA | 图像, 测序数据 | 数百个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-23 |
Four-dimensional molecular mapping from a spatial snapshot reveals the dynamics of hair follicle organogenesis
2026-Sep-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.06.014
PMID:42385701
|
研究论文 | 该文章开发了3DEEP技术，通过组织透明化和去除基因组DNA，将空间转录组分析深度扩展至数百微米，从而从单次空间快照中重建器官发生的四维分子图谱。 | 开发了3DEEP方法，能够在保持组织完整性的同时进行深层空间转录组分析；通过分子推断发育年龄，将单次3D空间快照转化为4D（3D+时间）分子图谱，揭示了毛囊器官发生的动态过程。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 理解器官形成过程中三维空间和发育时间上的分子信息动态变化。 | 新生小鼠皮肤中的发育毛囊，以及Foxn1缺陷裸鼠（无毛模型）的毛囊。 | 空间转录组学 | NA | 3D DNase增强表达谱分析（3DEEP），组织透明化，空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 新生小鼠皮肤样本，捕获数百个发育中的毛囊 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-23 |
Blockade of Tumor TAK1 Induces DNA Damage and Immunogenic cGAS-STING Pathway Activation in Pancreatic Cancer
2026-Sep, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.017
PMID:42070691
|
研究论文 | 本文发现TAK1在胰腺导管腺癌中异常激活并与T细胞功能障碍相关，抑制TAK1可诱导DNA损伤和cGAS-STING通路激活，从而增强免疫检查点阻断疗效 | 首次揭示TAK1通过磷酸化EphA2（Ser897）进而磷酸化RAD51（Tyr315）维持基因组完整性，其抑制可诱导DNA损伤和cGAS-STING通路激活，将免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 | 未明确提及研究局限性，但机制主要基于小鼠模型和体外实验，人体临床试验验证尚需进一步开展 | 探究TAK1在PDAC免疫抑制微环境中的作用机制，并评估其作为治疗靶点联合免疫检查点阻断的潜力 | 人PDAC样本、基因工程小鼠模型（p48-Cre/Trp53f/f/LSL-KrasG12D）、肿瘤与T细胞共培养体系 | 肿瘤免疫学、分子生物学 | 胰腺癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、流式细胞术、蛋白质组学 | 基因工程小鼠模型、细胞共培养模型 | 图像、文本、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-23 |
Schlemm's Canal Development and Implications for Glaucoma Treatment
2026-Sep, Annual review of vision science
IF:5.0Q1
|
综述 | 本文综述了施莱姆管（SC）的发育过程、功能形态及其在房水引流和青光眼治疗中的意义 | 整合了单细胞测序等最新研究手段对施莱姆管发育、基因及青光眼机制的新认识 | 对施莱姆管发育和房水引流调控的机制仍部分未明 | 总结施莱姆管发育、功能形态及房水引流机制，并探讨新型青光眼治疗策略 | 施莱姆管、小梁网、房水、青光眼 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-23 |
A GPCR atlas across human microglial states in Alzheimer's disease: Insights from snRNA-seq and hiPSC models
2026-Sep, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115845
PMID:42173233
|
综述 | 该综述系统检索并重新分析了2020至2025年间基于人脑组织的snRNA-seq研究，刻画了阿尔茨海默病中五种关键小胶质细胞状态下GPCR的差异表达特征与潜在功能 | 首次系统性地跨数据集整合并重新分析snRNA-seq数据，全面刻画AD相关五种小胶质细胞状态下的GPCR表达图谱，并与hiPSC来源小胶质细胞的单细胞测序数据交叉比对，优选出保守的高关注度GPCR候选靶点 | 作为综述性研究，主要基于已有公开数据的再分析，缺乏实验验证；候选GPCR靶点的功能仍需后续功能实验和药物开发研究加以证实 | 系统梳理AD中小胶质细胞状态异质性相关的GPCR表达特征，整合死后人脑组织与hiPSC模型的转录组证据，为AD药物研发提供候选GPCR靶点 | 阿尔茨海默病患者脑组织中的小胶质细胞，以及人诱导多能干细胞（hiPSC）来源的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 文本、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-23 |
Coexistent alterations of BAFF and B-cell phenotypes in complicated CVID course
2026-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.04.029
PMID:42219089
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研究论文 | 该研究通过血浆蛋白检测、光谱流式细胞术和单细胞RNA测序，探索BAFF及其受体与B细胞亚群的共存变化如何影响复杂性CVID的病程 | 揭示了CVID中BAFF与B细胞亚群失调的共存现象，包括血浆BAFF:TACI比值升高、过渡型和活化初始B细胞增加、BAFF-R表达降低以及自身反应性VH4-34克隆性增加 | 致病机制尚未完全明确，需要进一步探索BAFF、其受体和B细胞亚群失调的汇聚机制 | 探索BAFF、其受体和B细胞亚群的共存变化如何塑造CVID | 伴有自身免疫性血细胞减少和淋巴组织增生的常见变异型免疫缺陷（CVID）患者 | 免疫学 | 常见变异型免疫缺陷 | 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, BCR测序, 血浆蛋白检测 | NA | 血浆蛋白数据, 流式细胞术数据, 单细胞RNA测序数据, BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-09-23 |
Integrated bioinformatics, single-cell analysis, and experimental validation identify quercetin as a potential therapeutic candidate for intervertebral disc degeneration
2026-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05619-9
PMID:42329412
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研究论文 | 该研究通过整合批量转录组分析、单细胞RNA测序、分子对接和体外实验，鉴定出ZEB2、COL6A2、CCND1、RAP1A和GATA3为椎间盘退变的关键枢纽基因，并发现槲皮素可能作为潜在治疗候选药物 | 首次整合生物信息学、单细胞分析、分子对接和体外实验验证，系统鉴定椎间盘退变的枢纽基因，并发现槲皮素可部分逆转枢纽基因异常表达、改善细胞存活 | 分子对接仅提供初步计算证据，缺乏槲皮素与枢纽蛋白结合的实验验证；体外实验仅使用LPS诱导的髓核细胞模型，缺乏动物模型和临床样本验证 | 鉴定椎间盘退变的关键基因和潜在治疗化合物，为椎间盘退变的进展机制和治疗提供新见解 | 椎间盘退变患者与对照的髓核组织样本及LPS诱导的髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、WGCNA、PPI网络分析、LASSO回归、分子对接 | LASSO回归 | 基因表达数据、图像 | GSE70362数据集中的椎间盘退变与对照髓核样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-09-23 |
Potential targets of baicalein in macrophages revealed by bulk and single cell RNA sequencing analysis
2026-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05628-8
PMID:42337165
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研究论文 | 该研究通过整合网络药理学、分子对接、巨噬细胞bulk RNA测序和脓毒症患者外周血单细胞RNA测序，揭示黄芩素在巨噬细胞中的潜在分子靶点及其在高炎症状态下的系统免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、分子对接、bulk RNA测序和单细胞RNA测序多种方法，系统鉴定黄芩素在巨噬细胞中的核心靶点（JAK2、SRC、TP53、MAPK3、AKT1、HSP90AA1、ESR1），并揭示其可能通过JAK2-STAT3和NF-κB通路发挥抗炎作用，同时发现黄芩素可能调控多种外周血免疫细胞群体的炎症表型 | 黄芩素对多种外周血免疫细胞群体的系统抗炎效应仅基于单细胞表达特征推断，尚需在人源细胞中进行实验验证 | 揭示黄芩素在巨噬细胞中的分子靶点及其在高炎症条件下对外周血免疫细胞的潜在系统免疫调节效应 | RAW264.7巨噬细胞、脓毒症患者外周血免疫细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接 | NA | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-09-23 |
Targeting NOX4 with Quercetagetin-PLGA nanomaterials: a novel therapeutic strategy for Alzheimer's disease
2026-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05599-w
PMID:42343047
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向α7-nAChR的负载Quercetagetin的PLGA纳米载体，用于抑制NOX4并发挥阿尔茨海默病神经保护作用 | 首次开发了α7-nAChR靶向的Quercetagetin-PLGA纳米平台，实现受体介导递送、NOX4抑制和神经保护，并降低游离药物的肝肾毒性 | 缺乏体内验证、非靶向对照、药物暴露归一化以及关键制剂参数（如包封率），脑靶向和转化潜力受限 | 解决阿尔茨海默病中NOX4驱动的氧化损伤及天然黄酮Quercetagetin生物利用度差的问题 | 阿尔茨海默病、Aβ诱导的HT-22神经元损伤模型、NOX4基因、Quercetagetin、PLGA纳米载体 | 机器学习、数字病理学、药物递送 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、LASSO回归、伪时间分析、双乳液法纳米粒制备、蛋白质印迹、流式细胞术 | LASSO回归 | 基因表达数据、图像、文本 | GSE97760数据集（具体样本量未提及），Aβ诱导的HT-22神经元损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-09-23 |
A multiperspective evaluation framework of spatial transcriptomics clustering methods
2026-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag075
PMID:42421749
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研究论文 | 该文章提出了一个名为MultimetricST的Python框架，用于多角度评估空间转录组学聚类方法，并在合成数据集和多种空间转录组技术数据集上对十一种深度学习方法进行了系统评估 | 提出了MultimetricST框架，整合了基于标签和无标签的评估指标，克服了传统评估方法在注释不完整或缺失时的局限性，能够联合评估转录组信息和空间信息的整合效果 | 未明确提及该框架的具体局限性 | 为空间转录组学聚类方法提供一个统一、灵活的多角度评估策略，支持方法的比较、稳健评估和方法选择 | 空间转录组学聚类方法及其识别的空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 2个合成数据集和13个来自7种空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-23 |
A multi-omics atlas reveals spatially resolved sphingolipid metabolic reprogramming after spinal cord injury
2026-Sep, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115840
PMID:42167519
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研究论文 | 该研究整合脂质组学、空间转录组学和单细胞RNA测序，构建了脊髓损伤后鞘脂代谢的多维时空图谱，揭示了小胶质细胞鞘脂代谢重编程在继发性损伤中的作用。 | 首次整合高通量脂质组学、空间转录组学和单细胞RNA测序，系统构建脊髓损伤后鞘脂代谢的多维时空图谱；发现以Hsd17b4和Spp1高表达为特征的新型小胶质细胞亚群（高鞘脂代谢亚型）；揭示鞘脂代谢活性持续升高阻碍小胶质细胞回归稳态并驱动其向慢性病理表型极化。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 系统解析脊髓损伤后以鞘脂代谢为中心的损伤微环境时空改变模式及其与神经免疫炎症相关的调控机制。 | 多种脊髓损伤模型（具体模型类型和数量未在摘要中说明） | 多组学、空间转录组学、单细胞组学 | 脊髓损伤 | 高通量脂质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光染色、拟时序轨迹分析 | NA | 脂质组数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 脂质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-09-23 |
Integrative transcriptomic and bioinformatic analyses predict candidate EMT-related genes in sepsis-associated acute lung injury
2026-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05522-3
PMID:42283835
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研究论文 | 通过整合转录组和生物信息学分析，预测脓毒症相关急性肺损伤中与EMT相关的候选基因并描述其免疫特征 | 结合人类转录组数据集与单细胞RNA测序数据库，应用ComBat算法去除批次效应，并采用多种机器学习算法（SVM、LASSO、随机森林）进行层次基因筛选，首次预测了脓毒症相关急性肺损伤中五个EMT相关候选基因（AURKA、MYB、CCNA2、CD24、TYMS）及MIF-(CD74+CXCR4)轴的作用 | 所有结果均基于生物信息学分析，仅为假设生成，未经实验验证 | 探索脓毒症相关急性肺损伤的潜在候选分子标志物，推断调控信号通路并描述其免疫特征 | 人类转录组数据集和单细胞RNA测序数据库中的脓毒症相关急性肺损伤样本 | 机器学习 | 脓毒症相关急性肺损伤 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | 支持向量机、LASSO、随机森林 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-09-23 |
Molecular mechanism by which perfluorooctane sulfonate regulates the initiation and progression of prostate cancer via the ENTPD5-adenine axis
2026-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05583-4
PMID:42319417
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研究论文 | 该研究通过整合网络毒理学、转录组差异分析、加权基因共表达网络分析、多算法机器学习、单细胞与空间转录组学、代谢组学及结构建模，揭示了PFOS通过ENTPD5-腺嘌呤轴调控前列腺癌发生发展的分子机制。 | 首次系统性地构建了PFOS-ENTPD5-腺嘌呤的机制轴，将环境污染物暴露与前列腺癌的嘌呤代谢重编程联系起来，并整合了网络毒理学、多算法机器学习、单细胞与空间转录组学、代谢组学及分子动力学模拟等多层次方法。 | 摘要未明确说明研究的局限性，缺乏体内功能验证实验及临床队列验证数据。 | 系统阐明PFOS相关前列腺癌发生的机制，重点识别可干预的分子靶点及代谢相关通路。 | PFOS暴露相关的前列腺癌发生发展过程及其分子靶点 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 转录组学，单细胞转录组学，空间转录组学，代谢组学，网络毒理学，分子对接，分子动力学模拟 | 多算法机器学习 | 图像，文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-23 |
Bisphenol A promotes esophageal carcinogenesis by activating the MMP1-PCOLCE regulatory axis and remodeling the tumor immune microenvironment
2026-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05625-x
PMID:42373973
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研究论文 | 该研究整合转录组差异表达分析、WGCNA、127种机器学习模型、单细胞RNA测序、分子对接与分子动力学模拟以及scTenifoldKnk虚拟基因敲除，系统揭示双酚A通过激活MMP1-PCOLCE调控轴并重塑肿瘤免疫微环境促进食管癌发生 | 首次提出BPA通过激活MMP1-PCOLCE调控轴并重塑肿瘤免疫微环境促进食管癌发生的新机制，并整合127种机器学习预测模型、SHAP可解释性分析与scTenifoldKnk虚拟基因敲除系统识别核心靶点 | 摘要中未明确说明研究局限性，缺乏体内实验验证与临床样本验证 | 系统识别BPA驱动食管癌发生的关键分子靶点并阐明其分子机制 | BPA驱动的食管癌发生过程及相关分子靶点、肿瘤微环境细胞亚群 | 机器学习 | 食管癌 | 转录组差异表达分析、WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、SHAP分析、scTenifoldKnk虚拟基因敲除 | 127种机器学习预测模型、SHAP、scTenifoldKnk | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-09-21 |
Single-Cell RNA Sequencing-Based Identification of Novel Podocyte Injury-Associated Genes From Isolated Glomeruli of Diabetic db/db Mice
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603735R
PMID:42762061
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研究论文 | 该研究通过对糖尿病db/db小鼠磁珠分离的肾小球进行单细胞RNA测序，结合体外棕榈酸诱导的人足细胞损伤模型，鉴定出与糖尿病足细胞损伤相关的新基因 | 采用磁珠分离肾小球策略克服全肾单细胞RNA测序中足细胞占比低的局限，生成高分辨率肾小球聚焦转录组数据集，并整合体内单细胞数据与体外脂毒性模型鉴定出OPCML、ADM、NELL2和DHRS3四个候选基因，首次发现OPCML、ADM和DHRS3是足细胞损伤的新型介导因子 | 研究主要基于db/db小鼠模型和体外培养的人足细胞，尚未在人类糖尿病肾病患者样本中验证，且候选基因的具体分子机制和信号通路仍需进一步阐明 | 克服全肾单细胞RNA测序中足细胞代表性不足的问题，鉴定糖尿病肾小球中足细胞损伤相关的新基因，为糖尿病肾病提供潜在治疗靶点 | 糖尿病db/db小鼠磁珠分离的肾小球以及体外培养的暴露于棕榈酸诱导脂毒性的人足细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、磁珠分离、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、图像 | 糖尿病db/db小鼠分离的肾小球样本以及体外培养的人足细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-21 |
Identification of immune cell mitochondrial dysfunction characteristics and clinical predictive biomarkers in sepsis via multi-cohort machine learning and single-cell RNA sequencing
2026-Sep-19, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02366-8
PMID:42762293
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研究论文 | 该研究整合五个GEO数据集和单细胞RNA测序数据，通过多种机器学习算法鉴定脓毒症免疫细胞线粒体功能障碍特征，构建12基因诊断模型和线粒体功能障碍评分，并进行蛋白水平和临床验证 | 首次通过多队列机器学习和单细胞RNA测序系统鉴定脓毒症中线粒体功能障碍相关免疫细胞特征，构建了12基因诊断模型和线粒体功能障碍评分（MAS），并在蛋白水平验证了关键基因的表达，揭示了线粒体功能障碍与免疫的交互作用在脓毒症发病机制中的核心地位 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，样本来源和人群特征可能存在异质性；单细胞数据仅来自一个数据集（GSE167363），验证队列有限；蛋白水平验证仅涉及部分枢纽基因，未覆盖全部12基因特征 | 阐明脓毒症中免疫细胞线粒体功能障碍的景观及其临床效用，构建诊断模型和预测评分以支持临床脓毒症管理 | 脓毒症患者样本，包括外周血单个核细胞（PBMC）和全血样本 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA, NMF聚类, Western blotting | 弹性网络（Elastic net）, 机器学习算法集成 | 基因表达数据, 图像, 文本 | 5个GEO数据集共1,256个样本（GSE65682, GSE95233, GSE54514, GSE26440, GSE26378），单细胞RNA测序数据包含59,731个细胞（GSE167363），PBMC样本用于Western blotting验证 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |