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当前共找到 688 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-09-09
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity and Microenvironment of Temporal Bone Squamous Cell Carcinoma
2026-Aug, Clinical and experimental otorhinolaryngology IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术首次揭示了颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征 首次使用单细胞RNA测序技术全面刻画颞骨鳞状细胞癌的异质性和肿瘤微环境 样本量较小,缺乏大规模临床验证 阐明颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境 颞骨鳞状细胞癌肿瘤组织和癌旁正常组织 单细胞测序 颞骨鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 无 基因表达数据 6例患者的9个样本(5个肿瘤组织和4个癌旁正常组织),共113,344个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
82 2026-09-09
Human Papillomavirus (HPV)-Infected Epithelial Cells and FBLN1-Positive Fibroreticular Cells Govern the Immunogenic Tumor Microenvironment in HPV-Associated Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Aug, Clinical and experimental otorhinolaryngology IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学,比较HPV相关与非HPV相关的口咽鳞状细胞癌及正常扁桃体的肿瘤微环境,揭示FBLN1阳性纤维网状细胞在HPV相关肿瘤中的富集及其促进免疫原性微环境的作用 首次通过高分辨率空间转录组学分析,识别出FBLN1阳性纤维网状细胞亚群,并阐明其通过表达SLIT2促进免疫细胞募集,增强抗原呈递和上皮增殖,从而改善临床结果 研究样本量较小,且仅基于转录组学数据,缺乏功能验证实验来直接证明FBLN1阳性FRC在免疫调节中的因果作用 探究HPV相关口咽鳞状细胞癌中改善预后相关的细胞和分子因素,重点关注肿瘤微环境中的纤维网状细胞 口咽鳞状细胞癌患者样本及正常扁桃体组织 数字病理学 HPV相关口咽鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 2例非HPV相关OPSCC、5例HPV相关OPSCC、3例正常扁桃体 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
83 2026-09-09
Fibrosis as the Engine of Kidney Functional Decline: Donald W. Seldin Young Investigator Award Lecture
2026-08-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
综述 本文综述了肾小管间质纤维化作为慢性肾脏病功能衰退驱动力的机制,并讨论了单细胞和空间转录组学及肾脏类器官在抗纤维化药物研发中的应用 整合高分辨率转录组学与人类多能干细胞来源的肾脏类器官,强调其在功能验证和加速抗纤维化药物发现中的创新性 未提及具体局限性 总结肾脏纤维化重塑的机制见解,并探讨先进平台如何促进抗纤维化药物研发 肾小管间质纤维化、肌成纤维细胞、肾脏类器官 数字病理学 慢性肾脏病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
84 2026-09-07
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
2026-Aug-28, Research square
研究论文 对20种空间转录组细胞类型注释方法在四种技术及六种生物与技术场景下进行系统基准测试,评估其准确性、结构保留及生物学保真度 首次提供包含专家人工标注的多种空间转录组数据集的系统基准,涵盖参考依赖和参考自由方法,并引入结构感知指标评估全局细胞关系及下游富集分析一致性 基准数据集主要基于人工标注,可能受主观影响;方法性能因上下文而异,未完全覆盖所有可能的空间转录组平台及场景 系统评估空间转录组细胞类型注释方法的性能,为不同情境提供方法选择指南,并识别下一代方法的开发重点 20种前沿细胞类型注释方法及来自四种空间转录组技术的基准数据集,涵盖多种组织、实验条件、细胞数量和基因面板规模 生物信息学、机器学习、计算生物学 不适用 空间转录组学、单细胞RNA测序 多种,包括神经网络模型如scANVI, Seurat, TACCO(具体类型未提及) 空间基因表达数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,涉及多种组织、实验条件和细胞数量 不适用 空间转录组学 未明确具体平台,但涵盖四种技术 未提供具体平台配置信息
85 2026-09-07
Microenvironment-derived APP promotes osteosarcoma malignant phenotypes and induces macrophage M2 polarization via CD74
2026-Aug-28, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
研究论文 本研究探讨了微环境来源的APP通过CD74信号轴促进骨肉瘤恶性表型并诱导巨噬细胞M2极化的机制 首次揭示了APP-CD74信号轴在骨肉瘤中的促肿瘤作用及其对免疫微环境重塑的影响,并从单细胞水平解析了细胞来源 研究主要基于体外实验和异种移植模型,缺乏临床样本验证,且APP-CD74下游信号通路的具体分子机制未完全阐明 探明APP-CD74信号轴在骨肉瘤进展及免疫重塑中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 骨肉瘤细胞、巨噬细胞、内皮细胞以及骨肉瘤异种移植小鼠模型 数字病理学 骨肉瘤 bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、CellChat、ELISA、Western blot、免疫组化 异种移植模型、细胞共培养模型 转录组数据、单细胞表达数据、图像数据(免疫组化) 具体样本数量未在标题和摘要中提供 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-09-07
Spatially-resolved pharmaco-ecology of immunotherapy resistance in lung adenocarcinoma: Single-cell and spatial transcriptomics for mechanism-matched combination therapies
2026-Aug-27, Translational oncology IF:4.5Q1
综述 本文综述了肺腺癌免疫治疗耐药的空间药理学生态学,利用单细胞和空间转录组学探讨机制匹配的联合治疗策略 将肺腺癌免疫治疗耐药性与空间生态学概念相结合,提出从描述性免疫表型分型转向生态学诊断和精准免疫调节 存在采样偏差、平台异质性、区分关联与因果的挑战,以及需要FFPE兼容测试和前瞻性验证 探讨肺腺癌免疫治疗耐药机制,并利用单细胞和空间转录组学指导机制匹配的联合治疗 肺腺癌(LUAD)及非小细胞肺癌(NSCLC)中的恶性细胞、免疫细胞(如树突状细胞、T细胞、B细胞)、肿瘤微环境成分(如癌症相关成纤维细胞、细胞外基质、血管) 数字病理学 肺癌 空间转录组学、单细胞测序、FFPE兼容检测 NA 单细胞和空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
87 2026-09-07
TMEM176B orchestrates intratumoral hierarchy and immunosuppression in hepatocellular carcinoma: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Aug-26, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了肝细胞癌的肿瘤内异质性,并揭示了TMEM176B在肿瘤分化层级和免疫抑制中的关键作用。 首次利用单细胞转录组学描绘肝细胞癌的恶性层级结构,并识别TMEM176B作为连接肿瘤去分化与免疫重塑的关键分子。 体外实验验证功能,缺乏体内模型和临床多变量分析,需要进一步评估TMEM176B作为预后生物标志物的潜力。 探究肝细胞癌的细胞异质性和免疫微环境,揭示TMEM176B在肿瘤分级和免疫抑制中的作用及其预后价值。 五名肝细胞癌患者的肿瘤和相邻非肿瘤组织,以及LM3和Huh-7细胞系。 单细胞转录组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5名患者的配对肿瘤和相邻非肿瘤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-09-07
Protocol to identify genes required for cardiomyocyte development using Perturb-Seq
2026-Aug-25, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种使用Perturb-Seq技术识别心肌细胞发育所需基因的实验协议。 提出结合CRISPR筛选与单细胞RNA测序的协议,解决成本与异质性问题。 大规模实验成本高,分化异质性复杂。 识别心肌细胞发育所需基因。 心肌细胞发育过程中的基因。 机器学习和数字病理学 心血管疾病 Perturb-Seq,CRISPR,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'转录组
89 2026-09-07
Single-cell and bulk transcriptomic profiling of M2-like tumor-associated macrophages reveals a prognostic signature and an inflammation-metabolism crosstalk program in multiple myeloma
2026-Aug-24, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞和 bulk 转录组分析,识别多发性骨髓瘤特异性的 M2 样肿瘤相关巨噬细胞亚群,并构建预后签名和炎症-代谢交互程序 识别出骨髓瘤特有的 M2-TAM 亚群,并基于多机器学习算法构建共识预后模型,揭示了缺氧与炎症-代谢的交互作用 摘要未提及明确限制,可能受样本量和数据集来源限制 解析多发性骨髓瘤中 M2 样 TAM 的异质性,开发预后签名以改善风险分层 多发性骨髓瘤患者和正常骨髓中的巨噬细胞 机器学习和转录组学 多发性骨髓瘤 单细胞 RNA 测序与 bulk 转录组分析 机器学习算法(包括多种,如 Cox 相关模型等,具体未指定) 基因表达数据(单细胞和批量) 涉及多个数据集(GSE124310, GSE278230, GSE6477, GSE9782, GSE57317),具体样本数量未在摘要中明确 NA 单细胞 RNA 测序、批量转录组测序 NA NA
90 2026-09-07
COL1A1-Enhanced CD44/SLC7A11 Interaction and Cystine Uptake Result in CD34+ Foam-Like Macrophage Accumulation in Transplant Arteriosclerosis
2026-Aug-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,发现移植动脉硬化中CD34+泡沫样巨噬细胞的积累由COL1A1增强的CD44/SLC7A11相互作用及胱氨酸摄取驱动,并提供了潜在治疗靶点 首次鉴定出移植动脉硬化中一种新的促炎性泡沫样巨噬细胞表型,并揭示COL1A1通过增强CD44-SLC7A11复合物膜表达促进胱氨酸摄取,进而激活mTORC1-HIF-1α信号通路驱动脂质合成的新机制 研究主要基于人类标本和小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病的全部复杂性;且未对COL1A1-CD44-SLC7A11轴在临床干预中的长期效果进行验证 阐明移植动脉硬化中炎症性巨噬细胞亚群的起源和调控机制,以开发靶向治疗策略改善移植预后 人类慢性移植物血管病变标本和小鼠血管同种异体移植模型中的巨噬细胞亚群,特别是CD34+泡沫样巨噬细胞 数字病理学 移植动脉硬化 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、免疫荧光染色、邻近连接分析、免疫共沉淀、超高效液相色谱-高分辨率质谱 NA 转录组数据、图像数据、质谱数据 人类慢性移植物血管病变标本和小鼠血管同种异体移植模型(具体数量未提供) NA NA NA NA
91 2026-09-07
EVA1A responds to endoplasmic reticulum stress to regulate renal fibrosis by promoting TGF-β signaling pathway
2026-08, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本文揭示了EVA1A响应内质网应激通过促进TGF-β信号通路调节肾纤维化的机制 首次阐明EVA1A在肾纤维化中的作用,并揭示其通过CHOP响应ER应激,与BIP相互作用稳定并促进TGFBR2分泌至质膜,从而激活TGF-β信号通路的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床样本数量有限,且未深入探讨EVA1A在其他CKD类型或人类患者中的具体调控网络 阐明EVA1A在TGF-β信号调节和肾纤维化中的角色及其调控机制 慢性肾病患者、UUO和UIRI小鼠模型、肾上皮细胞以及Eva1a条件敲除小鼠 分子生物学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序、免疫组织化学、Western blot、共免疫沉淀、双分子荧光互补 条件敲除小鼠模型 基因表达数据及蛋白相互作用数据 人类肾纤维化组织和多种小鼠模型样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
92 2026-09-07
Decoding Brain Development and Function Through GABAergic Inhibitory Neurons
2026-08, The European journal of neuroscience
综述 本文综述了大脑皮层中间神经元在发育和功能中的关键作用,探讨了其分子和功能复杂性及其与神经发育疾病的关联 强调通过分子生物学、成像和单细胞转录组学揭示中间神经元发育的异质性,并探讨人类特有脑功能的潜在联系 未具体说明研究的局限性 旨在解析人类中间神经元的起源、功能多样性及其对神经发育疾病的理解 大脑皮层抑制性中间神经元 神经科学 神经发育障碍 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
93 2026-09-07
Single-Cell Profiling Identifies Skin-Resident Memory CD4+ T Cells as a Potential Correlate of Immunity During Staphylococcus aureus Skin Infection
2026-08, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,在小鼠皮肤感染模型中鉴定出皮肤驻留记忆CD4+ T细胞,并发现其在再次感染时提供保护性免疫 首次结合纵向单细胞RNA测序与流式细胞术,在金黄色葡萄球菌皮肤感染模型中全面表征皮肤驻留记忆CD4+ T细胞的转录程序、表型及功能,并证明其在保护性免疫中的关键作用,为疫苗策略提供新靶点 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;未深入探讨CD4 Trm细胞的具体效应机制 阐明金黄色葡萄球菌皮肤感染后皮肤内免疫记忆的细胞介质,评估CD4+ T细胞的组织驻留及其在保护性免疫中的作用 小鼠皮肤感染模型中的CD4+ T细胞,特别是皮肤驻留记忆T细胞(Trm) 单细胞测序, 免疫学 皮肤和软组织感染(金黄色葡萄球菌感染) 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 小鼠皮肤感染模型样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
94 2026-09-07
A Bacterial Microbiome Is Dispensable for the Induction of CD8 T Cell Exhaustion
2026-08, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究探讨了微生物组在慢性病毒感染中CD8 T细胞耗竭诱导中的作用,发现微生物组并非必需。 首次证明微生物组缺失不影响T细胞耗竭的发生及病毒控制,挑战了微生物组在免疫调节中的普遍必要性观点。 研究局限于特定的小鼠模型(LCMV感染),可能不足以推广到其他慢性感染或人类疾病。 评估微生物组对慢性病毒感染诱导CD8 T细胞耗竭和病毒控制的影响。 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠中的病毒特异性CD8 T细胞。 微生物组学、免疫学 慢性病毒感染 单细胞测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确,涉及无菌和特定病原体自由小鼠。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2026-09-05
Spatial mapping of RNA turnover kinetics in the mouse brain
2026-Aug-31, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 提出空间NT-seq方法,结合无转基因代谢RNA标记与空间转录组学平台上的原位化学重编码,共同映射新合成和预存的RNA,应用于小鼠大脑揭示RNA周转动力学的空间异质性 首次在完整组织中实现RNA周转动力学的空间映射,无需转基因,结合代谢标记和空间转录组学,揭示脑区特异的RNA合成与降解调控 标题和摘要中未明确提及局限性 开发一种空间分辨的方法来测量RNA周转动力学,并揭示小鼠大脑中RNA稳定性的调控架构 小鼠大脑组织,特别是齿状回区域以及电惊厥刺激后的脑区 空间转录组学 难治性抑郁症(作为治疗相关背景) 空间NT-seq(代谢RNA标记与空间转录组学结合) 计算建模 空间转录组数据 未明确说明样本量(涉及小鼠大脑组织) NA 空间转录组学 NA NA
96 2026-09-05
Didang Tang downregulates prostatic necroptosis and NETs formation in rats with chronic prostatitis: Evidence from multi-omics analysis and experimental validation
2026-Aug-28, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,探讨中药抵当汤对慢性前列腺炎大鼠模型中坏死性凋亡和中性粒细胞胞外陷阱形成的影响及其潜在机制。 首次提供实验证据,证明在CFA诱导的慢性前列腺炎样动物模型中,代表性坏死性凋亡通路标记物和NETs相关标记物上调,并揭示抵当汤通过抑制HMGB1释放和NETs形成来发挥保护作用。 仅基于动物模型,未涉及人体临床试验,且可能无法完全反映人类慢性前列腺炎的复杂性。 研究抵当汤对慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征的治疗效果,并阐明其改善前列腺组织损伤的潜在分子机制。 雄性Sprague-Dawley大鼠,经前列腺内注射弗氏完全佐剂诱导的慢性前列腺炎样模型。 数字病理学 前列腺炎 蛋白质组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 动物模型 蛋白质组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据, 组织学图像 未提供具体数量,涉及雄性SD大鼠模型。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
97 2026-09-05
SHMT2: a Metabolic and Immune Biomarker of Aggressive Lung Adenocarcinoma
2026-08-28, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本研究通过代谢组学、转录组学及单细胞RNA测序等多组学方法,探讨了SHMT2在肺腺癌中的表达、代谢重编程及其与免疫微环境和预后之间的关系 首次综合运用代谢组学、转录组学及单细胞测序数据,揭示SHMT2作为肺腺癌代谢和免疫生物标志物的潜力,并预测其对免疫检查点阻断治疗的响应性 需要进一步的药理学和体内验证来确认SHMT2作为治疗靶点的可行性 评估SHMT2在肺腺癌中的表达及其与肿瘤行为、免疫特征和免疫治疗响应性的关联 23对肺腺癌及癌旁正常组织样本,以及TCGA-LUAD队列的转录组和临床数据 肿瘤学 肺腺癌 代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序、RT-qPCR、蛋白质印迹、免疫组织化学、RNA干扰 NA 代谢组数据、转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 23对配对组织样本,以及TCGA-LUAD队列中的多个样本 NA 质谱分析、单细胞RNA测序 NA 内部萃取电喷雾电离质谱、单细胞RNA测序平台
98 2026-09-05
Preparation of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Bone Marrow Samples for Spatial Transcriptomics Using EDTA-Based Decalcification
2026-08-28, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 该文章介绍了一种利用EDTA脱钙处理福尔马林固定石蜡包埋骨髓样本以进行空间转录组分析的方法。 提出了一种包含EDTA脱钙步骤的10天方案,以保留RNA完整性并支持骨样本的空间转录组应用。 具体限制未在摘要中明确提及。 建立并优化骨髓样本的空间转录组分析协议,以保存组织形态并整合单细胞数据。 健康和病变的小鼠及人类骨髓组织样本。 空间转录组学、数字病理学 不适用 空间转录组学 不适用 图像、基因表达数据 健康和病变的小鼠及人类组织样本(具体数量未提供) 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
99 2026-09-05
Ascites reprograms innate lymphoid immune cells in ovarian cancer by promoting ILC2 enrichment and dysfunctional NK-cell states
2026-Aug-26, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析卵巢癌腹水中的NK/固有淋巴样细胞,揭示腹水通过促进ILC2富集和诱导NK细胞功能异常来重编程固有免疫,并提出TGF-β相关抑制作为免疫治疗靶点 首次在卵巢癌腹水中系统描绘NK/固有淋巴样细胞的异质性,发现腹水通过TGF-β信号促进PD-1+ ILC2积累并抑制NK细胞成熟,提出联合阻断TGF-β以恢复抗肿瘤免疫的新策略 未在体内模型中验证TGF-β抑制的疗效,也未涉及其他免疫细胞类型或治疗后的纵向分析 阐明卵巢癌腹水对固有淋巴样细胞的重编程机制,寻找恢复抗肿瘤免疫的潜在治疗靶点 卵巢癌患者的腹水样本及健康供体NK细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 轨迹分析 单细胞转录组数据 涉及卵巢癌腹水样本及健康供体NK细胞,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
100 2026-09-05
HABP4/VIM-mediated focal adhesion assembly regulates enteric neural crest cell migration via the FAK/SRC pathway
2026-Aug-20, Journal of pediatric surgery IF:2.4Q2
研究论文 本研究揭示了HABP4通过VIM介导黏着斑组装并激活FAK/SRC信号通路,从而调控肠神经嵴细胞迁移的机制,为先天性巨结肠的发病机制提供了新见解 首次阐明HABP4作为HSCR易感基因通过VIM相互作用调控黏着斑组装和FAK/SRC信号通路的具体分子机制,并发现可致病的HABP4 R379W变异 研究主要基于体外细胞模型和小鼠组织,缺乏体内功能验证实验;FAK激动剂仅部分挽救迁移缺陷,可能存在其他补偿机制 阐明HABP4调控肠神经嵴细胞迁移进而影响肠神经系统发育的分子机制,并评估HSCR患者中HABP4变异的致病性 小鼠肠道组织中的肠神经嵴细胞、人胚胎干细胞来源的神经嵴细胞以及HSCR患者中发现的HABP4变异 发育生物学、分子生物学 先天性巨结肠 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、蛋白质相互作用网络分析、转录组分析、AlphaFold结构建模、免疫共沉淀、Transwell迁移实验、药理学挽救实验 NA 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据、基因表达数据 小鼠肠道组织及人胚胎干细胞来源的神经嵴细胞;具体样本数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于小鼠肠道组织的单细胞RNA测序分析
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