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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-13 |
Integrative analysis of single-cell sequencing identifies CD8+ TIM3+ CD101+ T cell-associated genes as prognostic biomarkers in breast cancer
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0674
PMID:42724782
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，表征乳腺癌中CD8+ TIM3+ CD101+ T细胞的免疫特征，并构建了预后风险模型 | 首次识别并表征了CD8+ CD101+ TIM3+ T细胞亚群，揭示了其与CD8+ CD101- TIM3+ T细胞状态之间的潜在转变关系，并基于该细胞相关基因构建了11基因预后模型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征乳腺癌中CD8+ TIM3+ CD101+ T细胞相关的免疫特征，并开发乳腺癌预后风险模型 | 乳腺癌患者样本中的CD8+ TIM3+ CD101+ T细胞及相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | LASSO Cox回归 | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-09-13 |
Pan-cancer characterization of HMGA1 reveals its oncogenic role in tumor microenvironment and stemness: functional validation in pancreatic cancer migration and invasion
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0937
PMID:42724846
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研究论文 | 本文系统分析了HMGA1在泛癌中的表达、预后、表观遗传激活及其与肿瘤微环境和干性的关系，并在胰腺癌中进行了功能验证 | 首次对HMGA1进行泛癌系统表征，结合单细胞RNA测序揭示其在胰腺癌恶性上皮细胞干性/可塑性及肿瘤微环境重塑中的作用，并通过功能实验验证其促进胰腺癌迁移和侵袭 | 研究基于关联性模型，缺乏深入的机制验证和临床验证，HMGA1尚不能用于治疗分层或免疫治疗反应预测 | 系统表征HMGA1在泛癌中的表达和预后模式、表观遗传激活及其与胰腺癌恶性细胞干性和肿瘤微环境重塑的关系 | 泛癌转录组数据及胰腺导管腺癌（PAAD）细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 甲基化分析, 免疫组化, qRT-PCR, Western blotting, 伤口愈合实验, Transwell迁移和侵袭实验 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-09-13 |
Microplastics and nanoplastics-related genes signature predicts prognosis in pancreatic ductal adenocarcinoma and functional validation of interleukin 1 alpha
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1405
PMID:42724844
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研究论文 | 基于微塑料和纳米塑料相关基因构建胰腺导管腺癌预后模型，并验证IL1A的生物学功能 | 首次基于微塑料和纳米塑料相关基因构建胰腺导管腺癌预后模型，结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，并实验验证IL1A功能 | 需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床适用性，体外实验需要体内实验证实 | 构建基于微塑料和纳米塑料相关基因的胰腺导管腺癌预后预测标志物，评估肿瘤免疫微环境 | 胰腺导管腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | TCGA、GEO和ICGC多队列数据，具体样本量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-09-13 |
Combined multi-omics profiling and machine learning analysis reveals that Bregs and RPS2 promote bone metastasis in nasopharyngeal carcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1388
PMID:42724854
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研究论文 | 结合单细胞测序、批量RNA测序和三种机器学习方法，揭示调节性B细胞（Bregs）及RPS2通过IL-10/PI3K/AKT/CXCR6轴促进鼻咽癌骨转移的机制 | 首次系统阐明Bregs在鼻咽癌骨转移微环境中的高浸润特征及其分子机制，发现RPS2通过上调Bregs分泌IL-10激活PI3K/AKT通路进而上调肿瘤细胞CXCR6表达，在骨内巨噬细胞分泌的CXCL16趋化下促进骨转移，并构建了基于Bregs和RPS2的预后模型 | 研究主要基于公共数据库的测序数据和体外及动物实验，临床队列验证规模有限，Bregs靶向治疗的临床转化可行性仍需进一步验证 | 探究Bregs在鼻咽癌骨转移中的浸润动态、功能影响及分子机制，识别可用于骨转移预后评估和治疗靶点的关键分子 | 鼻咽癌患者原发灶组织、骨转移灶、Bregs细胞、RPS2基因及鼻咽癌细胞系 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞测序, RNA-seq, LASSO回归分析, 随机森林算法, Boruta算法, 流式细胞术, CCK-8实验, 迁移实验, Transwell实验, 共培养体系, 生物发光成像, 数字X射线摄影, 微型计算机断层扫描 | LASSO回归, 随机森林, Boruta算法 | 单细胞测序数据, RNA测序数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-09-13 |
Selenium serves as an immunomodulator adjunct to enhance the efficacy of anti-PD-1 therapy in non-small cell lung cancer
2026-Aug-29, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag241
PMID:42728016
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研究论文 | 本研究探讨了硒作为免疫调节佐剂增强非小细胞肺癌抗PD-1治疗疗效的作用及机制 | 揭示了硒通过上调CD8+ T细胞PD-1和肿瘤细胞PD-L1表达，与抗PD-1治疗产生协同抗肿瘤效应，并发现CD8-Prf1亚群在联合治疗中扩增且与患者生存期延长相关 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型和单细胞RNA测序分析，临床验证仍需进一步开展前瞻性临床试验 | 探究硒在肿瘤免疫治疗中的作用机制，评估硒联合抗PD-1治疗的协同抗肿瘤效果 | Lewis肺癌细胞、荷瘤小鼠模型及接受抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-09-13 |
Loss of ABCA4 from photoreceptor discs is associated with glial transcriptomic changes in retinal organoids
2026-Aug-22, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxag045
PMID:42581602
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研究论文 | 该研究通过构建携带ABCA4基因无义突变的视网膜类器官模型，揭示了ABCA4蛋白缺失导致视网膜胶质细胞转录组变化，可能在光感受器退化前触发早期应激反应 | 首次利用携带ABCA4外显子24无义突变的人诱导多能干细胞来源的视网膜类器官，发现突变光感受器外段视盘缺乏ABCA4蛋白，但视杆和视锥细胞无明显转录改变，而Müller胶质细胞和星形胶质细胞出现显著转录组变化 | 研究未涉及ABCA4突变如何具体引发胶质细胞转录组改变的分子机制，且类器官模型可能无法完全模拟体内视网膜微环境 | 评估ABCA4基因无义突变对人视网膜类器官中mRNA和蛋白水平的影响，探究该突变在Stargardt病发病机制中的作用 | 携带ABCA4外显子24无义突变的人诱导多能干细胞来源的视网膜类器官 | 数字病理学 | Stargardt病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-09-13 |
Collapsed fibroblasts in aged human skin in vivo: A critical driver of dermal aging
2026-Aug-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.07.028
PMID:42586406
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研究论文 | 该研究利用三维多光子荧光显微镜结合二次谐波成像、单细胞RNA测序和多重空间原位转录组学，揭示衰老人类皮肤中成纤维细胞因细胞外基质退化而呈现塌陷形态，并伴有TGF-β/Smad和YAP/TAZ信号通路及ECM稳态基因表达受损，而恢复成纤维细胞铺展可完全逆转胶原稳态紊乱 | 首次在体内三维水平定量揭示衰老皮肤中成纤维细胞呈现塌陷形态，并证明该形态改变与TGF-β/Smad和YAP/TAZ信号通路受损及ECM稳态紊乱相关，且恢复细胞铺展可完全逆转胶原稳态异常，强调细胞外微环境在细胞衰老中的关键作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究衰老过程中细胞外基质改变对真皮成纤维细胞形态和功能的影响，以及细胞外微环境在细胞衰老中的作用 | 年轻和衰老的人类皮肤组织及原代人成纤维细胞培养模型 | 数字病理学 | 皮肤衰老 | 三维多光子荧光显微镜、二次谐波生成成像、单细胞RNA测序、多重空间原位转录组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2026-09-13 |
Integrative evidence-knowledge marker selection enhances LLM-based cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis
2026-Aug-11, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-026-00593-7
PMID:42717354
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研究论文 | 该文提出了CELLIA，一种基于大语言模型（LLM）的自动化细胞类型注释工作流，通过整合证据-知识标记选择策略提升单细胞RNA测序分析中的注释准确性 | 采用整合证据-知识的标记选择策略，将统计差异表达标准与经过整理的、组织特异性的标记资源相结合，以识别信息量大的标记基因，从而克服仅依赖基因表达或人工整理导致的标记选择偏差 | 摘要中未明确说明该研究的局限性 | 实现自动化且稳健的细胞类型注释，提高基于大语言模型的细胞类型注释可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型，涵盖102种细胞类型，并进一步在紧密相关的免疫细胞亚群和非免疫基质亚群（共25种细胞类型）中评估 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本、基因表达数据 | 102种细胞类型，并在免疫亚群和非免疫基质亚群中共25种细胞类型中进一步评估 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2026-09-13 |
Macrophage-fibroblast signaling networks identified by single-cell RNA sequencing in juvenile systemic sclerosis
2026-08-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.202801
PMID:42334871
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析青少年系统性硬化症皮肤，揭示成纤维细胞与巨噬细胞之间的信号网络改变 | 首次在青少年系统性硬化症中利用单细胞RNA测序识别成纤维细胞-巨噬细胞信号网络，揭示可能驱动纤维化的相互作用 | 样本量可能有限，需要进一步验证 | 探究青少年系统性硬化症中成纤维细胞与巨噬细胞的相互作用及其在纤维化中的作用 | 青少年系统性硬化症患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-09-13 |
Impaired adipogenesis and lipid storage capacity in subcutaneous adipose tissue of patients with PMOS
2026-08-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199981
PMID:42579798
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研究论文 | 通过对PMOS患者和健康对照者的皮下脂肪组织进行单核和单细胞RNA测序，发现PMOS患者脂肪生成受损和脂质储存能力下降。 | 首次在PMOS患者的皮下脂肪组织中鉴定出纤维化与胰岛素敏感脂肪细胞比例升高、间充质干细胞与前脂肪细胞比例升高，并发现SLIT2/ROBO信号通路可能通过抑制前脂肪细胞分化导致异位脂肪积累。 | 样本量较小，且需要进一步实验验证SLIT2/ROBO信号通路在PMOS代谢综合征发展中的具体机制。 | 探究PMOS患者皮下脂肪组织中与代谢综合征和中心性肥胖相关的改变。 | 15名有胰岛素抵抗迹象的绝经前PMOS女性患者和17名BMI匹配的健康对照女性的皮下脂肪组织活检样本。 | 单细胞组学 | 多囊卵巢综合征 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 32例皮下脂肪组织活检样本（15例PMOS患者，17例健康对照） | NA | single-nuclei RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-09-10 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Aug-01, Free radical biology & medicine
|
综述 | 本文综述了中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中对旁观者组织损伤的作用机制，并探讨了相关治疗策略。 | 从氧化还原生物学角度系统整合了中性粒细胞氧化系统在胃肠道黏膜微环境中的作用，并提出了选择性调节氧化还原的潜在治疗靶点。 | 主要依赖现有的实验和临床数据，缺乏直接的临床验证，且对具体机制的定量描述有限。 | 总结中性粒细胞活性氧在炎症性肠病中导致组织损伤的机制，并探讨选择性治疗的可能性。 | 中性粒细胞及其产生的活性氧在胃肠道黏膜中的作用，涉及细胞、分子和组织水平。 | 生物信息学与系统生物学 | 炎症性肠病 | 蛋白质组学，空间转录组学，活体显微镜检查，单细胞分析 | 不适用 | 文献综述性数据，包括分子和细胞生物学数据。 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 72 | 2026-09-09 |
IL-17-driven transcriptional programs in muscle fibroblasts are not required for pathogenesis in murine anti-histidyl-tRNA synthetase (Jo-1) myositis
2026-Aug-04, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag225
PMID:42554729
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究抗组氨酰tRNA合成酶（Jo-1）诱导的肌炎小鼠模型中肌肉成纤维细胞的动态变化，发现IL-17基因特征被激活，但IL-17-IκBζ信号轴对该模型的病理过程并非必需。 | 首次在Jo-1肌炎模型中利用单细胞RNA测序分析肌肉成纤维细胞的转录程序，并揭示IL-17驱动的Nfkbiz（编码IκBζ）激活，但否定了其在疾病发病机制中的必要性。 | 研究基于小鼠模型，可能不能完全反映人类IIM的复杂性；结果仅针对该特定模型，需在其他模型或患者中验证。 | 确定肌肉成纤维细胞在肌炎发病中的分子机制，评估IL-17信号通路在Jo-1诱导肌炎中的作用。 | 小鼠肌肉成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 特发性炎症性肌病（抗Jo-1肌炎） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提供，基于小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-09-09 |
CD151 identifies a cytotoxic CD4 T cell population enriched in people with HIV that later develop cancer
2026-Aug-04, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag208
PMID:42548058
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研究论文 | 研究CD151在HIV感染者中细胞毒性CD4 T细胞群中的表达及其与癌症发展的关联 | 首次报道CD151作为细胞毒性CD4 T细胞的标志物，在HIV感染者中该细胞群在癌症诊断前数年即出现异常扩增，提示其作为免疫重塑和癌症风险的潜在生物标志物 | 样本量较小，尤其单细胞测序仅涉及每组1名参与者，可能限制结果的普适性 | 探究HIV感染者中癌症发生前的免疫重塑特征，特别是CD151标记的细胞毒性CD4 T细胞的作用 | HIV感染者及非感染者的外周血单核细胞中的T细胞亚群，包括CD4+CD151+ T细胞 | 免疫学 | HIV感染相关癌症 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 成人队列（25-65岁），包括未感染者、无癌症HIV感染者及后续发展癌症的HIV感染者，每组样本数未明确提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-09-09 |
DFCE-KanT: predicting spatial gene expression from histology images via contrastive learning
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag502
PMID:42421216
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研究论文 | 提出DFCE-KanT，一种基于对比学习的框架，用于从H&E染色全切片图像预测空间基因表达，通过结合图像特征、基因特征和空间位置信息，并在五个公开数据集上验证其优越性能。 | 创新性地将Kolmogorov-Arnold网络（KAN）与Transformer多头注意力结合，组成KanT模块，自动学习最佳融合策略，并通过特征通道增强（FCE）注意力技术提升图像特征提取能力，增强了投影头的非线性能力，实现了图像与基因表达特征在共同嵌入空间中的更好兼容性。 | 未明确提及局限性 | 开发一种低成本方法，从常规H&E染色图像直接预测空间基因表达，以替代昂贵的空间转录组学实验。 | 五种公开数据集的H&E染色组织切片图像及其对应的空间转录组数据，包括HER2+、cSCC、Alex、HBC和Liver数据集 | 数字病理学、计算机视觉 | 乳腺癌、皮肤鳞状细胞癌、肝细胞癌等 | 空间转录组学 | 对比学习框架、DenseNet、KAN、Transformer | H&E染色图像和基因表达数据 | 涉及五个公开数据集（HER2+、cSCC、Alex、HBC和Liver） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2026-09-09 |
PRISM: Prior-enhanced Inference for Spatial Transcriptomic Cell Type Mapping
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag515
PMID:42490201
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研究论文 | 提出PRISM框架，通过结合生物先验、伪标签生成和多层空间转录组优化，实现细胞类型映射 | 引入跨域生物学先验来显式提取标记基因，结合先验增强的自训练策略生成伪标签，并在双方向生物学约束下优化模型，以处理域差距和平台特异性噪声 | 未在摘要中明确说明局限性 | 解决空间转录组数据中细胞类型注释的准确性和鲁棒性问题 | 空间转录组数据中细胞类型映射 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序，单细胞RNA测序 | 集成模型 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 十一个ST数据集，涵盖六个平台、两个物种和多种组织场景 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-09-09 |
SpatialFlux: an R package for distance gradient analysis in spatial transcriptomics
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag543
PMID:42494106
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研究论文 | 描述了一个名为SpatialFlux的R包，用于空间转录组学中的距离梯度分析，以克服低采样、组织形态多样性和高丢失率等挑战 | 提出了一个基于参考的距离梯度分析方法，能够在多个空间转录组组织切片和多个轴上，以无偏或有偏方式识别和可视化差异表达基因和通路 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发并描述SpatialFlux R包，以支持空间转录组数据的距离梯度分析，促进生物学发现 | 空间转录组数据，具体为多个组织切片中的基因表达和通路 | 生物信息学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据、图像（隐含） | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 77 | 2026-09-09 |
NicheDeSig: niche-aware deconvolution and adaptive signature analysis for spatial transcriptomics
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag578
PMID:42530368
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研究论文 | 提出NicheDeSig方法，用于空间转录组数据的巢穴感知去卷积，通过自适应签名提高细胞类型比例估计的准确性并支持功能分析 | 引入空间巢穴先验信息，使每种细胞类型采用动态适应的签名，从而在去卷积过程中考虑上下文依赖的细胞状态变化，支持巢穴相关分子程序的功能分析 | 摘要中未明确提及局限，但可能受限于模拟数据验证和特定组织类型代表性 | 研究空间转录组中准确去卷积细胞类型并分析空间微环境中细胞状态变异的算法开发 | 模拟基准数据集、模拟结肠数据集、人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌、胰腺导管腺癌样本A及结直肠肝转移样本 | 空间转录组学与计算生物学 | 乳腺癌、胰腺癌、结直肠癌肝转移 | 空间转录组学 | 自适应签名模型（基于概率或矩阵分解），不特指神经网络 | 空间转录组数据（spots序列和基因表达矩阵） | 包含模拟数据集及多种真实组织样本，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics, MGI, Illumina | 空间转录组学 | 10x Visium, MGI DNBSEQ, Illumina NovaSeq | 基于Spots技术的空间转录组平台 |
| 78 | 2026-09-09 |
Making multi-axis Gaussian graphical models scalable to millions of cells
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag523
PMID:42467839
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研究论文 | 提出一种多轴高斯图模型方法，能在数分钟内处理数百万细胞的数据集，用于学习基因和细胞的条件依赖网络 | 该方法是首个能够扩展至百万细胞规模的多轴方法，克服了现有方法只能处理数千细胞或基因的限制，并在神经发育的scRNA-seq数据上提供了比现有技术更聚焦的生物学解释 | 摘要未明确提及局限性，但可能受限于特定数据类型或计算资源 | 使多轴高斯图模型方法适用于现代大规模单细胞RNA测序数据集，以同时学习基因网络和细胞网络 | 神经元细胞发育的scRNA-seq数据集，以及基因和细胞之间的条件依赖关系 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 高斯图模型（GmGM） | 单细胞基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-09-09 |
SRLST: a unified multimodal representation learning framework for spatial transcriptomics analysis
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag524
PMID:42478747
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研究论文 | 提出SRLST，一种统一的多模态表示学习框架，用于空间转录组分析，通过整合转录组、空间和组织学信息来精确描绘组织结构 | 采用双图变分自编码器策略，联合建模空间邻近性和形态关系，并将基因表达嵌入融合到统一潜在空间，实现三种互补数据模态的整体协调 | 摘要中未提及明显局限性 | 解决空间转录组数据中空间域准确划分的挑战，通过整合转录组、空间和组织学信息来揭示组织结构 | 空间转录组数据中的组织结构、皮层组织、小面积不连续组织区室和肿瘤内异质性 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组 | 双图变分自编码器 | 空间转录组数据（包括转录组、空间和组织学图像信息） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2026-09-09 |
Deciphering spatial heterogeneity by multimodal spatial transcriptomics modelling with SpatialModal
2026-08-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag540
PMID:42482153
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研究论文 | 提出多模态图学习框架SpatialModal，用于整合空间转录组数据和组学图像，揭示组织空间异质性。 | 采用分层表征策略和双层级对比学习机制，实现多模态ST数据的有效整合与联合建模。 | 未提及 | 开发一种多模态空间转录组数据整合方法，以精确解析复杂组织的空间异质性。 | 人类和小鼠组织，包括大脑、乳腺癌、阿尔茨海默病和胚胎心脏。 | 机器学习, 生物信息学 | 乳腺癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组测序 | 图神经网络 | 基因表达, 组织学图像, 空间坐标 | 多个数据集，涵盖不同组织和物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |