单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 80 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-13 |
Single-cell RNA sequencing unveils CD8+ T cell heterogeneity in the diffuse large B-cell lymphoma microenvironment: A systematic review
2026-Aug, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105381
PMID:42144172
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系统综述 | 通过单细胞RNA测序揭示弥漫大B细胞淋巴瘤微环境中CD8+ T细胞的异质性 | 首次系统性整合单细胞RNA测序研究，构建了弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的动态耗竭轨迹图谱，发现了Tpex亚群与预后的关联以及CXCR5+TCF7+ S1亚群对化疗敏感性的预测作用 | 未进行荟萃分析，仅基于定性系统综述; 需要未来多中心研究验证CD58和CD8-fit等新靶点 | 系统综述单细胞RNA测序研究以刻画弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的异质性及其临床意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 自然语言处理 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 18项合格研究，具体样本量未说明 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 62 | 2026-06-13 |
Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111461
PMID:42214511
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研究论文 | 研究发现foxp3a缺失导致斑马鱼肠道-肝脏-性腺轴出现性别特异性免疫代谢重塑 | 首次证明foxp3a是哺乳动物FOXP3的功能性斑马鱼同源物，并揭示其在性别差异性黏膜免疫调控中的关键作用 | 未明确说明研究局限性 | 探究foxp3a在性别和器官间免疫代谢调控中的差异作用 | foxp3a缺失的斑马鱼模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、微生物组分析、多组学整合分析 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 用于肠道黏膜细胞的单细胞RNA测序 |
| 63 | 2026-06-11 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出了scMAG算法，一种通过多阶段深度融合与流形感知门控策略整合单细胞多组学数据的方法 | 创新性地提出了多阶段特征深度融合形式化方法，结合多核心流形保持与引导门控优化策略，实现了自适应对齐多组学潜在空间并优化数据分布 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞多组学数据的聚类精度和可视化效果，同时实现多组学潜在空间的自适应对齐并抑制生物噪声与测量误差 | 单细胞多组学数据集，包括scRNA-seq、scATAC-seq和ADT数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度融合网络 | 单细胞多组学数据 | 配对数据集（scRNA-seq与scATAC-seq和ADT） | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-06-10 |
NPTX2 accelerates cell cycle progression, activates EMT, and regulates glycolytic metabolic pathways to promote clear cell renal cell carcinoma progression
2026-08, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117950
PMID:41956427
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、临床队列分析和功能实验，揭示NPTX2通过加速细胞周期、激活上皮间质转化和调节糖酵解代谢途径促进肾透明细胞癌进展的机制 | 首次阐明NPTX2通过协调细胞周期、上皮间质转化和糖酵解驱动的组蛋白乳酰化修饰（特别是H3K18la）促进肾透明细胞癌进展的多重调控机制，并发现其在肿瘤侵袭前沿与碳酸酐酶IX共定位 | 未说明 | 研究NPTX2在肾透明细胞癌中的功能及其通过细胞周期、上皮间质转化和糖酵解相关表观遗传修饰驱动癌症进展的分子机制 | 肾透明细胞癌细胞系（786-O和Caki-1）、临床组织样本、TCGA-KIRC队列数据 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序、慢病毒介导的基因敲低/过表达、组蛋白乳酰化检测 | NA | 单细胞转录组数据、临床基因表达数据 | TCGA-KIRC临床队列及本实验室收集的肾透明细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-06-10 |
The rule of three: structural diversity, differential expression and distinct regulatory output of three MALT paralogues in salmonid fish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111397
PMID:42134735
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研究论文 | 本研究探讨了虹鳟鱼中三个MALT旁系同源基因的结构多样性、差异表达及不同的调控输出 | 首次发现虹鳟鱼拥有三个MALT旁系同源基因，并揭示了它们在不同组织和细胞中的特异性表达模式，以及通过异源过表达系统展示出的功能差异 | 仅使用CHSE-214细胞作为异源系统进行过表达研究，缺乏在生理相关系统中的验证 | 探究虹鳟鱼中三个MALT旁系同源基因的功能差异及其在先天免疫信号调控中的作用 | 虹鳟鱼的MALT1、MALT2和MALT3三个旁系同源基因 | 分子生物学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-06-09 |
Hypoxia-driven TCF21/CCL11 axis in GCMSCs orchestrates macrophage polarization and lymphatic remodeling to promote gastric cancer lymph node metastasis
2026-Aug, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118056
PMID:42134670
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研究论文 | 本研究揭示了低氧驱动的GCMSCs中TCF21/CCL11轴通过调控巨噬细胞极化和淋巴管重塑促进胃癌淋巴结转移的机制 | 首次发现GCMSCs分泌的CCL11通过非直接作用于肿瘤细胞，而是通过调控巨噬细胞M2极化和淋巴内皮细胞重塑来促进胃癌淋巴结转移，并阐明了低氧-TCF21-CCL11轴的核心调控机制 | NA | 阐明胃癌相关间充质干细胞（GCMSCs）介导的旁分泌因子在淋巴结转移中的作用及分子机制 | 胃癌相关间充质干细胞（GCMSCs）、巨噬细胞、淋巴内皮细胞（LECs）、胃癌细胞系 | machine learning | 胃癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞因子谱分析 | NA | 转录组数据、细胞因子数据、单细胞RNA测序数据 | 临床样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-06-07 |
Integrative multi-omics and experimental validation reveal UBE2C as a central hub gene and prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026-Aug-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116866
PMID:42155390
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研究论文 | 通过整合多组学数据和实验验证，揭示UBE2C在肝细胞癌中作为关键枢纽基因和预后生物标志物的作用 | 首次结合空间转录组学、单细胞转录组学和免疫微环境分析，全面阐明UBE2C在肝细胞癌免疫景观中的作用及其与免疫治疗反应的相关性 | 未提及具体局限性 | 探索UBE2C在肝细胞癌中的表达模式、功能作用及作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织、细胞系及皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 定量逆转录PCR, 免疫印迹 | Cox回归模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA, GEO, CPTAC数据库中的肝细胞癌样本（未具体说明数量） | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-06-07 |
Immune dysregulation and cellular dysfunction mediate di-n-pentyl phthalate-induced hepatotoxicity: Insights from single-cell RNA sequencing
2026-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116114
PMID:42061636
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research paper | 采用单细胞RNA测序技术研究邻苯二甲酸二正戊酯（DNPP）诱导小鼠肝毒性的机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示DNPP通过破坏免疫稳态和损伤细胞功能导致肝毒性的分子机制 | NA | 探究DNPP诱导肝毒性的潜在机制 | 小鼠肝脏组织 | NA | 肝毒性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、定量实时PCR | NA | RNA表达数据 | DNPP暴露小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 69 | 2026-06-05 |
Spatial multi-omics defines cancer-associated fibroblasts subtype gradients driving metabolic support and immune remodeling in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218585
PMID:42144098
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研究论文 | 整合空间转录组学和空间代谢组学数据，通过SpatialGlue多模态聚类和最优传输模型，定义胰腺导管腺癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型，揭示其代谢支持和免疫重塑功能 | 首次将空间多组学整合与最优传输建模结合，系统刻画CAF亚型的代谢异质性及其与肿瘤细胞的代谢通讯机制，并揭示亚型特异性临床预后关联 | 未明确提及研究局限性，但潜在局限包括空间分辨率限制、独立验证队列规模较小 | 阐明胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的代谢与空间异质性，及其在肿瘤微环境中的功能角色 | 胰腺导管腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚型及其与肿瘤细胞的代谢互作 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学， 空间代谢组学， 多重免疫荧光， TCGA-PAAD反卷积 | SpatialGlue多模态聚类模型， 最优传输模型 | 空间基因表达数据， 空间代谢物数据， 多重免疫荧光图像， TCGA转录组数据 | 独立空间代谢组学队列和多重重免疫荧光染色队列的样本 | NA | 空间转录组学， 空间代谢组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-29 |
Single cell RNA sequencing revealed the mechanism underlying the increased osteogenic capacity of porcine BMSCs upon MSTN knockout
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150202
PMID:42106014
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MSTN基因敲除增强猪骨髓间充质干细胞成骨能力的机制 | 首次构建了早期培养猪BMSCs的单细胞转录组图谱，并在大型动物模型中阐明MSTN基因敲除增强BMSCs增殖和成骨潜能的机制 | 未提及明显局限性 | 研究MSTN基因敲除对猪骨髓间充质干细胞异质性和成骨能力的影响及机制 | 藏猪胫骨骨髓来源的骨髓间充质干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, SCENIC, CellChat | NA | 单细胞转录组数据 | 来自野生型和MSTN基因敲除藏猪的BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-05-18 |
CEP-IP: An explainable framework for cell subpopulation identification in single-cell transcriptomics
2026-Aug-01, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109372
PMID:42070479
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研究论文 | 提出一种名为CEP-IP的可解释机器学习框架，用于在单细胞转录组学中识别具有强单调基因模块关系的细胞亚群 | 首次引入可解释机器学习框架CEP-IP，通过单细胞解释力分类和拐点分析识别具有成对单调基因模块关系的细胞亚群，解决了现有scRNA-seq框架缺乏可解释性的问题 | 未明确说明局限性，但可能受限于仅验证了前列腺癌、Allen中间颞叶和胶质母细胞瘤数据集，泛化性需进一步研究 | 开发一种可解释框架来识别单细胞转录组中具有强单调基因模块关系的细胞亚群 | 前列腺癌scRNA-seq数据集、Allen中间颞叶数据集、Neftel胶质母细胞瘤多形性数据集 | 机器学习 | 前列腺癌、胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 广义加性模型 | 单细胞转录组数据 | 三个独立scRNA-seq数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-05-17 |
Fosb promotes ferroptosis in vascular smooth muscle cells via the NF-κB pathway to exacerbate abdominal aortic aneurysm progression
2026-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112544
PMID:42013987
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研究论文 | 本研究揭示了Fosb通过NF-κB通路促进血管平滑肌细胞铁死亡，从而加剧腹主动脉瘤进展的机制 | 首次发现Fosb作为平滑肌细胞表型转换的关键驱动因子，通过激活NF-κB通路触发铁死亡，促进AAA发展 | 仅通过细胞和动物模型验证，缺乏大规模临床样本验证；未探索Fosb在AAA中的其他潜在信号通路 | 阐明Fosb在腹主动脉瘤进展中通过平滑肌细胞表型转换和铁死亡调控的分子机制 | 腹主动脉瘤患者的单细胞RNA测序数据、T/G HA-VSMC人类血管平滑肌细胞、ApoE-/-小鼠AAA模型 | 机器学习 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、蛋白质印迹、ELISA、组织学染色 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞图像 | AAA患者scRNA-seq数据（具体样本量未明确）、T/G HA-VSMC细胞系、ApoE-/-小鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-05-17 |
RARG promotes gastric cancer progression by activating PMEPA1 transcription and Wnt/β-catenin signalling
2026-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112552
PMID:42025891
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研究论文 | 揭示RARG通过转录激活PMEPA1及增强Wnt/β-catenin信号通路促进胃癌进展的机制 | 首次发现RARG作为PMEPA1的转录调节因子，并通过双重机制（激活PMEPA1转录和直接结合β-catenin）促进胃癌进展 | 研究未提及具体局限性 | 探究RARG在胃癌中的功能及其调控机制 | 胃癌细胞及胃癌组织样本 | 机器学习 | 胃癌 | CUT&Tag测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹法, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 具体样本量未在标题和摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 74 | 2026-05-17 |
PHC2 promotes hepatocellular carcinoma progression and serves as a robust prognostic biomarker: A pancancer multiomics and clinical validation study
2026-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112555
PMID:42025893
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研究论文 | 通过泛癌多组学分析和临床验证，揭示PHC2在肝细胞癌中促进肿瘤进展并作为稳健的预后生物标志物 | 首次系统阐明PHC2在肝细胞癌中的表达模式、预后价值及致癌作用，并结合多组学数据、临床组织芯片和体内外实验进行验证 | 研究未明确PHC2与巨噬细胞浸润相关性背后的具体机制，且临床验证样本量有限 | 探究PHC2在肝细胞癌进展中的临床意义和生物学功能 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、组织芯片免疫组化 | NA | 多组学数据和图像 | 94例肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-05-17 |
Quercetin targets the TNF-a/TNF pathway to activate mitochondrial autophagy to improve nucleus pulposus cell function and delay disc degeneration
2026-Aug, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103468
PMID:41880862
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research paper | 研究槲皮素通过靶向TNF-α/TNF通路激活线粒体自噬以改善髓核细胞功能并延缓椎间盘退变 | 首次揭示了槲皮素通过干预TNF信号调控线粒体自噬平衡来逆转髓核细胞纤维化表型转化的完整机制链条，并构建了“成分-靶点-表型”的证据链 | 研究主要基于体外细胞模型和大鼠模型，缺乏大规模临床样本验证，且槲皮素的具体分子靶点相互作用网络需进一步细化 | 探究槲皮素通过干扰TNF信号调控线粒体自噬延缓椎间盘退变的分子机制 | 髓核细胞、巨噬细胞以及椎间盘退变大鼠模型 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序、转录组分析、分子对接、动物模型验证 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、病理图像 | 未明确提及具体样本量，涉及大鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-05-17 |
CLIC5B attenuates pro-inflammatory fibroblast migration through inhibition of the CLIC1/CLIC4-PIP5K1 axis
2026-Aug, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103493
PMID:41922125
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研究论文 | 本研究揭示了CLIC5B通过抑制CLIC1/CLIC4-PIP5K1轴来减弱促炎性成纤维细胞迁移的机制 | 首次发现CLIC5B在类风湿关节炎滑膜组织中显著下调，并阐明其作为负调控因子通过CLIC1/CLIC4-PIP5K1轴抑制成纤维细胞迁移的新机制 | NA | 探究CLIC5在类风湿关节炎滑膜及成纤维细胞功能中的作用及其调控机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和成纤维样滑膜细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个公共数据库的bulk和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-05-02 |
Nigrostriatal dopaminergic vulnerability in Parkinson's disease: Neuroprotective strategies
2026-Aug-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00380
PMID:40808403
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综述 | 综述帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的机制及神经保护策略 | 整合单核RNA测序和空间转录组学揭示的多巴胺能亚型特异性转录应激特征，并提出基于亚型选择性的精准靶向治疗策略 | 未详细讨论不同神经保护策略的临床试验结果或转化障碍 | 理解黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的分子和细胞机制，并评估新兴神经保护策略 | 帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元及其亚型（如AGTR1+/SOX6+和RIT2+群体） | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2026-04-23 |
Ion channel/Stat6-driven nano-immune programming of tissue-resident macrophages by amide-functionalized nanocellulose
2026-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.03.038
PMID:42004621
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，探讨了酰胺功能化纳米纤维素对组织驻留巨噬细胞的免疫重编程机制 | 揭示了酰胺功能化纳米纤维素通过激活电压门控离子通道和Stat6信号通路，促进M2巨噬细胞极化，而不引发适应性免疫反应 | 研究仅基于14天亚急性窗口和28天脾细胞分析，长期效应和具体分子机制需进一步验证 | 阐明纳米纤维素表面化学介导的免疫重编程机制 | 原始纤维素纳米晶体和酰胺功能化纤维素纳米晶体 | 纳米生物材料 | NA | scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, 药理学抑制, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-04-14 |
A multi-scale biocompatibility atlas of porous silicon nanoparticles: From whole embryo to single-cell resolution
2026-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究建立了一个多尺度评估流程，利用斑马鱼模型结合整体表型分析和单细胞RNA测序，系统评估了多孔硅纳米颗粒的生物相容性 | 首次将整体生物体表型分析与单细胞转录组测序相结合，构建了从胚胎到单细胞分辨率的多尺度生物相容性图谱 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型，其结果向更复杂哺乳动物系统的外推仍需进一步验证 | 评估多孔硅纳米颗粒的生物安全性和生物相容性，为其临床转化提供依据 | 多孔硅纳米颗粒 | 纳米医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-03-21 |
Chronic inflammation-responsive hydrogel restores myeloid-T cell crosstalk to reinvigorate antitumor immunity against metastatic colorectal cancer
2026-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.03.012
PMID:41858728
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研究论文 | 本文开发了一种慢性炎症响应性水凝胶（TRANS），通过调节骨髓细胞与T细胞间的相互作用，恢复抗肿瘤免疫，以治疗转移性结直肠癌 | 创新点在于设计了一种炎症条件触发的水凝胶，能同时抑制促肿瘤炎症并增强免疫监视，通过释放药物和激动剂优化骨髓细胞与T细胞的交互 | NA | 研究旨在通过重新平衡炎症-免疫动态，开发一种新型免疫疗法以对抗转移性结直肠癌 | 研究针对转移性结直肠癌模型，关注肿瘤微环境中的慢性炎症、骨髓细胞（如肿瘤相关巨噬细胞、cDC1）和T细胞 | 生物医学工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |