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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-06-19 |
Telomerase-related gene EHHADH drives lung cancer progression and shapes the immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102852
PMID:42269569
|
研究论文 | 本研究基于端粒酶相关基因构建肺癌预后风险模型,发现EHHADH驱动肺癌进展并塑造免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次从端粒酶相关基因角度构建肺癌预后模型,并发现EHHADH作为关键致癌驱动基因在免疫逃逸中的作用 | 未在更大规模临床队列中验证模型,EHHADH的分子机制仍需进一步深入探索 | 评估端粒酶相关基因在肺癌中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 | 肺癌患者样本及公开数据集中的端粒酶相关基因 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | 来自七个公开数据集的肺癌病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞-足细胞交互失调 | 整合阳离子牛血清白蛋白诱导的小鼠膜性肾病模型与单细胞RNA测序,绘制肾脏细胞图谱,发现巨噬细胞-足细胞轴失衡(Spp1-整合素信号增强和胶原IV稳态信号减弱)是肾小球损伤的关键驱动因素 | 主要基于小鼠模型,人体样本验证有限 | 阐明膜性肾病中细胞网络驱动损伤的机制 | 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾脏细胞 | 机器学习和生物信息学 | 膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 663 | 2026-06-18 |
From tarsal anatomy to tear-film homeostasis: A history-informed review of the meibomian gland in ocular surface biology
2026-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111052
PMID:42119841
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综述 | 回顾从解剖学到泪膜稳态的睑板腺研究历史,阐述其在眼表生物学中的核心作用及其功能障碍(MGD)的现代概念 | 提出“认识激活”作为分析术语,系统梳理睑板腺从解剖识别到因果疾病关联、量化测量和诊断框架整合的历史过程,并展望基于细胞状态、脂质相、免疫和计算表型的未来分类方向 | 未提及具体限制 | 综述睑板腺研究的历史演变,解释其从解剖结构到眼表疾病关键因素的转变,并为未来MGD分类提供历史视角 | 睑板腺及其功能障碍(MGD) | 眼科及眼表生物学 | 干眼症(蒸发过强型干眼)相关眼表疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型、人工智能图像分析、干细胞/再生研究 | NA | 文本(历史文献综述) | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 664 | 2026-06-18 |
Deep Structure-Enhanced Cell Clustering Model for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Aug, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261453098
PMID:42261796
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研究论文 | 提出一种名为scDSEC的深度结构增强细胞聚类模型,用于单细胞RNA测序数据 | 通过整合细胞内部特征和外部结构语义,并采用逐层增强策略来学习增强的细胞表示,以解决表示学习不充分的问题 | 文中未明确提及局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2026-06-15 |
Rescuing Prdx1-deficiency-mediated redox homeostasis disruption in bone marrow mesenchymal stem cells ameliorate radiation-induced bone loss
2026-Aug-16, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体内外实验,揭示Prdx1在骨髓间充质干细胞中通过抑制Akt/FoxO信号通路缓解辐射诱导骨丢失的机制,并构建E7-EV递送系统实现靶向基因治疗 | 首次阐明Prdx1在辐射诱导骨丢失中的动态表达模式及其通过Pten/Akt/FoxO通路调控氧化应激的分子机制,并开发了BMSCs特异性E7肽修饰细胞外囊泡递送系统用于Prdx1 mRNA靶向治疗 | 未在人体模型中验证,且E7-EV递送系统的长期安全性和有效性需要进一步评估 | 阐明Prdx1保护BMSCs免受辐射诱导骨丢失的作用机制,并开发新型基因治疗策略 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和辐射诱导骨丢失小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 放射性骨丢失 | 单细胞RNA测序, 高通量RNA测序, 分子动力学模拟 | NA | 测序数据 | 小鼠模型和原代BMSCs | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞转录组分析的10x Chromium平台 |
| 666 | 2026-06-15 |
Common subtypes of CAFs and their research progress in immune evasion of colorectal cancer
2026-Aug, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2026.157173
PMID:42263479
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综述 | 系统综述结直肠癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)的常见亚型及其在免疫逃逸中的研究进展 | 通过scRNA-seq和空间转录组学等前沿技术,细化了CAF亚型分类,并深入分析了不同亚型在结直肠癌免疫逃逸中的独特调控机制 | 未提及具体研究限制,但综述可能受限于当前领域研究的深度和广度,以及不同亚型功能验证的不足 | 为结直肠癌精准免疫治疗提供理论依据,并识别潜在治疗靶点 | 结直肠癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文本、基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞RNA测序, 10x Visium 空间转录组学 |
| 667 | 2026-06-13 |
Tepraloxydim metabolite exposure disrupts placental function revealed by single-cell sequencing and metabolomics
2026-Aug-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154073
PMID:42229169
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和代谢组学,系统探究除草剂tepraloxydim代谢物DMP对小鼠胎盘细胞组成、转录程序和代谢稳态的影响 | 首次系统揭示DMP通过代谢重编程和细胞命运改变破坏胎盘结构与功能的机制 | 未提及,摘要中无相关信息 | 探究DMP对胎盘发育的影响及其潜在机制 | 小鼠胎盘组织 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | 无特定模型 | 表达谱数据, 代谢物数据 | 小鼠模型,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 668 | 2026-06-13 |
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762
PMID:41775092
|
研究论文 | 提出通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络的方法 | 结合一阶和二阶邻近度捕获复杂拓扑结构,并通过对抗训练策略将目标向量正则化为基因表达数据的先验分布,以保持生物统计特性 | 未明确指出具体限制,但可能依赖于高质量的训练数据和网络拓扑假设 | 开发一种能够处理基因调控网络复杂拓扑和非同分布基因表达数据的新型推断方法 | 基因调控网络、基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 有向图自编码器、生成对抗网络 | 基因表达数据 | DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2026-06-13 |
GLUL drives metabolic reprogramming and confers docetaxel resistance in prostate cancer
2026-Aug, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118008
PMID:42044811
|
研究论文 | 该论文发现谷氨酸-氨连接酶(GLUL)驱动前列腺癌代谢重编程并导致多西他赛耐药 | 首次将GLUL确定为多西他赛耐药的关键代谢驱动因子,并揭示谷氨酰胺合成作为去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中可药用的脆弱点 | 未提及具体局限性 | 探索前列腺癌中多西他赛耐药的代谢决定因素及GLUL的作用机制 | 前列腺癌临床样本、细胞系及异种移植模型 | 机器学习和数字病理的交叉领域 | 前列腺癌 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 临床样本及独立队列验证 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 670 | 2026-06-13 |
Single-cell RNA sequencing unveils CD8+ T cell heterogeneity in the diffuse large B-cell lymphoma microenvironment: A systematic review
2026-Aug, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105381
PMID:42144172
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系统综述 | 通过单细胞RNA测序揭示弥漫大B细胞淋巴瘤微环境中CD8+ T细胞的异质性 | 首次系统性整合单细胞RNA测序研究,构建了弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的动态耗竭轨迹图谱,发现了Tpex亚群与预后的关联以及CXCR5+TCF7+ S1亚群对化疗敏感性的预测作用 | 未进行荟萃分析,仅基于定性系统综述; 需要未来多中心研究验证CD58和CD8-fit等新靶点 | 系统综述单细胞RNA测序研究以刻画弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的异质性及其临床意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 自然语言处理 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 18项合格研究,具体样本量未说明 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 671 | 2026-06-13 |
Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111461
PMID:42214511
|
研究论文 | 研究发现foxp3a缺失导致斑马鱼肠道-肝脏-性腺轴出现性别特异性免疫代谢重塑 | 首次证明foxp3a是哺乳动物FOXP3的功能性斑马鱼同源物,并揭示其在性别差异性黏膜免疫调控中的关键作用 | 未明确说明研究局限性 | 探究foxp3a在性别和器官间免疫代谢调控中的差异作用 | foxp3a缺失的斑马鱼模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、微生物组分析、多组学整合分析 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 用于肠道黏膜细胞的单细胞RNA测序 |
| 672 | 2026-06-11 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出了scMAG算法,一种通过多阶段深度融合与流形感知门控策略整合单细胞多组学数据的方法 | 创新性地提出了多阶段特征深度融合形式化方法,结合多核心流形保持与引导门控优化策略,实现了自适应对齐多组学潜在空间并优化数据分布 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞多组学数据的聚类精度和可视化效果,同时实现多组学潜在空间的自适应对齐并抑制生物噪声与测量误差 | 单细胞多组学数据集,包括scRNA-seq、scATAC-seq和ADT数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度融合网络 | 单细胞多组学数据 | 配对数据集(scRNA-seq与scATAC-seq和ADT) | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 673 | 2026-06-10 |
NPTX2 accelerates cell cycle progression, activates EMT, and regulates glycolytic metabolic pathways to promote clear cell renal cell carcinoma progression
2026-08, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117950
PMID:41956427
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、临床队列分析和功能实验,揭示NPTX2通过加速细胞周期、激活上皮间质转化和调节糖酵解代谢途径促进肾透明细胞癌进展的机制 | 首次阐明NPTX2通过协调细胞周期、上皮间质转化和糖酵解驱动的组蛋白乳酰化修饰(特别是H3K18la)促进肾透明细胞癌进展的多重调控机制,并发现其在肿瘤侵袭前沿与碳酸酐酶IX共定位 | 未说明 | 研究NPTX2在肾透明细胞癌中的功能及其通过细胞周期、上皮间质转化和糖酵解相关表观遗传修饰驱动癌症进展的分子机制 | 肾透明细胞癌细胞系(786-O和Caki-1)、临床组织样本、TCGA-KIRC队列数据 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序、慢病毒介导的基因敲低/过表达、组蛋白乳酰化检测 | NA | 单细胞转录组数据、临床基因表达数据 | TCGA-KIRC临床队列及本实验室收集的肾透明细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2026-06-10 |
The rule of three: structural diversity, differential expression and distinct regulatory output of three MALT paralogues in salmonid fish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111397
PMID:42134735
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研究论文 | 本研究探讨了虹鳟鱼中三个MALT旁系同源基因的结构多样性、差异表达及不同的调控输出 | 首次发现虹鳟鱼拥有三个MALT旁系同源基因,并揭示了它们在不同组织和细胞中的特异性表达模式,以及通过异源过表达系统展示出的功能差异 | 仅使用CHSE-214细胞作为异源系统进行过表达研究,缺乏在生理相关系统中的验证 | 探究虹鳟鱼中三个MALT旁系同源基因的功能差异及其在先天免疫信号调控中的作用 | 虹鳟鱼的MALT1、MALT2和MALT3三个旁系同源基因 | 分子生物学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2026-06-09 |
Hypoxia-driven TCF21/CCL11 axis in GCMSCs orchestrates macrophage polarization and lymphatic remodeling to promote gastric cancer lymph node metastasis
2026-Aug, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118056
PMID:42134670
|
研究论文 | 本研究揭示了低氧驱动的GCMSCs中TCF21/CCL11轴通过调控巨噬细胞极化和淋巴管重塑促进胃癌淋巴结转移的机制 | 首次发现GCMSCs分泌的CCL11通过非直接作用于肿瘤细胞,而是通过调控巨噬细胞M2极化和淋巴内皮细胞重塑来促进胃癌淋巴结转移,并阐明了低氧-TCF21-CCL11轴的核心调控机制 | NA | 阐明胃癌相关间充质干细胞(GCMSCs)介导的旁分泌因子在淋巴结转移中的作用及分子机制 | 胃癌相关间充质干细胞(GCMSCs)、巨噬细胞、淋巴内皮细胞(LECs)、胃癌细胞系 | machine learning | 胃癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞因子谱分析 | NA | 转录组数据、细胞因子数据、单细胞RNA测序数据 | 临床样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2026-06-07 |
Integrative multi-omics and experimental validation reveal UBE2C as a central hub gene and prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026-Aug-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116866
PMID:42155390
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研究论文 | 通过整合多组学数据和实验验证,揭示UBE2C在肝细胞癌中作为关键枢纽基因和预后生物标志物的作用 | 首次结合空间转录组学、单细胞转录组学和免疫微环境分析,全面阐明UBE2C在肝细胞癌免疫景观中的作用及其与免疫治疗反应的相关性 | 未提及具体局限性 | 探索UBE2C在肝细胞癌中的表达模式、功能作用及作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织、细胞系及皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 定量逆转录PCR, 免疫印迹 | Cox回归模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA, GEO, CPTAC数据库中的肝细胞癌样本(未具体说明数量) | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 677 | 2026-06-07 |
Immune dysregulation and cellular dysfunction mediate di-n-pentyl phthalate-induced hepatotoxicity: Insights from single-cell RNA sequencing
2026-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116114
PMID:42061636
|
research paper | 采用单细胞RNA测序技术研究邻苯二甲酸二正戊酯(DNPP)诱导小鼠肝毒性的机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示DNPP通过破坏免疫稳态和损伤细胞功能导致肝毒性的分子机制 | NA | 探究DNPP诱导肝毒性的潜在机制 | 小鼠肝脏组织 | NA | 肝毒性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、定量实时PCR | NA | RNA表达数据 | DNPP暴露小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 678 | 2026-06-05 |
Spatial multi-omics defines cancer-associated fibroblasts subtype gradients driving metabolic support and immune remodeling in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218585
PMID:42144098
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研究论文 | 整合空间转录组学和空间代谢组学数据,通过SpatialGlue多模态聚类和最优传输模型,定义胰腺导管腺癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型,揭示其代谢支持和免疫重塑功能 | 首次将空间多组学整合与最优传输建模结合,系统刻画CAF亚型的代谢异质性及其与肿瘤细胞的代谢通讯机制,并揭示亚型特异性临床预后关联 | 未明确提及研究局限性,但潜在局限包括空间分辨率限制、独立验证队列规模较小 | 阐明胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的代谢与空间异质性,及其在肿瘤微环境中的功能角色 | 胰腺导管腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚型及其与肿瘤细胞的代谢互作 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学, 多重免疫荧光, TCGA-PAAD反卷积 | SpatialGlue多模态聚类模型, 最优传输模型 | 空间基因表达数据, 空间代谢物数据, 多重免疫荧光图像, TCGA转录组数据 | 独立空间代谢组学队列和多重重免疫荧光染色队列的样本 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 679 | 2026-05-29 |
Single cell RNA sequencing revealed the mechanism underlying the increased osteogenic capacity of porcine BMSCs upon MSTN knockout
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150202
PMID:42106014
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MSTN基因敲除增强猪骨髓间充质干细胞成骨能力的机制 | 首次构建了早期培养猪BMSCs的单细胞转录组图谱,并在大型动物模型中阐明MSTN基因敲除增强BMSCs增殖和成骨潜能的机制 | 未提及明显局限性 | 研究MSTN基因敲除对猪骨髓间充质干细胞异质性和成骨能力的影响及机制 | 藏猪胫骨骨髓来源的骨髓间充质干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, SCENIC, CellChat | NA | 单细胞转录组数据 | 来自野生型和MSTN基因敲除藏猪的BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 680 | 2026-05-18 |
CEP-IP: An explainable framework for cell subpopulation identification in single-cell transcriptomics
2026-Aug-01, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109372
PMID:42070479
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研究论文 | 提出一种名为CEP-IP的可解释机器学习框架,用于在单细胞转录组学中识别具有强单调基因模块关系的细胞亚群 | 首次引入可解释机器学习框架CEP-IP,通过单细胞解释力分类和拐点分析识别具有成对单调基因模块关系的细胞亚群,解决了现有scRNA-seq框架缺乏可解释性的问题 | 未明确说明局限性,但可能受限于仅验证了前列腺癌、Allen中间颞叶和胶质母细胞瘤数据集,泛化性需进一步研究 | 开发一种可解释框架来识别单细胞转录组中具有强单调基因模块关系的细胞亚群 | 前列腺癌scRNA-seq数据集、Allen中间颞叶数据集、Neftel胶质母细胞瘤多形性数据集 | 机器学习 | 前列腺癌、胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 广义加性模型 | 单细胞转录组数据 | 三个独立scRNA-seq数据集,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |