本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-07-25 |
Single-cell transcriptomic insights into lipoprotein transport in yolk sac membrane endodermal epithelial cells of chicken embryos
2026-Aug, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106950
PMID:42102753
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 622 | 2026-07-25 |
Decoding immunotherapy resistance in multiple myeloma: genetic insights and approaches to counter resistance
2026-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3227-0
PMID:42101566
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 623 | 2026-07-25 |
Innovative technologies and future perspectives in tumor microbiomics
2026-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3202-x
PMID:42132991
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 624 | 2026-07-25 |
Comparison of Sertoli cells in duck testes pre- and post-sexual maturation
2026-Aug, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107021
PMID:42190478
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 625 | 2026-07-25 |
The neurotoxicity of Chlorantraniliprole to Helicoverpa armigera larvae
2026-Aug, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.107206
PMID:42493017
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 626 | 2026-07-25 |
An organotypic ectocervix mucosa model to study host-pathogen interaction of sexually transmitted infections
2026-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.103454
PMID:42494413
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 627 | 2026-07-25 |
Integrative machine learning and multi-omics identify a centromere gene signature and validate B3GALT4 as a tumor suppressor in osteosarcoma
2026-Aug, Journal of bone oncology
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jbo.2026.100787
PMID:42494653
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 628 | 2026-07-23 |
Clonal analysis for understanding fate biases in developing embryos
2026-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102475
PMID:42025228
|
综述 | 回顾了结合谱系追踪与单细胞转录组学在理解胚胎发育中命运偏差方面的前沿实验和计算方法 | 重点强调了新兴的空间和基于扰动的克隆生物学策略,这些策略有望揭示发育稳健性的机制 | 未明确提及,但作为综述,可能缺乏原创新发现 | 总结当前结合谱系追踪与单细胞转录组学在研究胚胎发育命运偏差方面的前沿方法 | 发育胚胎中的多能祖细胞及其克隆多样性 | 机器学习 | NA | 谱系追踪, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2026-07-18 |
Portulaca Oleracea polysaccharides attenuate zearalenone-induced macrophage activation and Leydig cell dysfunction in testis: A single-cell and multi-omics study
2026-Aug-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119481
PMID:42215139
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、睾丸和血清代谢组学以及肠道微生物组分析,鉴定了玉米赤霉烯酮的睾丸靶细胞类型,并探讨了马齿苋多糖的解毒作用和机制 | 首次整合单细胞转录组学、多组织代谢组学和肠道微生物组分析,阐明马齿苋多糖通过调节肠-血-睾丸轴缓解玉米赤霉烯酮诱导的生殖毒性 | NA | 研究玉米赤霉烯酮对雄性生殖的毒性机制及马齿苋多糖的保护作用 | 雄性昆明小鼠 | 机器学习 | 生殖毒性 | 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 微生物组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 微生物组测序 | NA | NA |
| 630 | 2026-07-15 |
Enhancing glioma immunotherapy by disrupting RBP-J-mediated NNMT signaling in tumor microenvironment
2026-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03844-3
PMID:42310095
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了转录因子RBP-J通过激活CAFs中的NNMT信号驱动胶质瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现RBP-J/NNMT/SAA3轴作为胶质瘤微环境中基质驱动的免疫逃逸关键通路,并证实靶向该通路可增强免疫治疗效果 | NA | 揭示胶质瘤免疫微环境中基质细胞介导的免疫逃逸机制 | 胶质瘤微环境中的癌相关成纤维细胞(CAFs)和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 631 | 2026-07-15 |
Decoding the complexity of intestinal immunity with spatial transcriptomics
2026-Aug, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2026.102806
PMID:42335605
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在解析肠道免疫复杂性中的应用,讨论了该技术的适用性、关键发现、互补技术、当前挑战及未来机遇 | 首次系统综述了空间转录组学在肠道免疫研究中的多方面应用,包括其与传统技术的对比和未来发展方向 | 当前空间转录组学技术仍面临分辨率、成本和数据分析挑战,且与肠道免疫微环境的深度整合有待进一步探索 | 评估空间转录组学在肠道免疫系统研究中的适用性,总结关键发现,并展望未来应用 | 肠道免疫系统及其与肠道微环境的相互作用 | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 632 | 2026-07-15 |
New learnings from the molecular pathology of the synovial tissue in rheumatoid arthritis: from pathogenesis to therapeutic targeting toward precision medicine
2026-Aug, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2026.102785
PMID:42167060
|
综述 | 本文综述了类风湿关节炎滑膜组织分子病理学的新发现,从发病机制到治疗靶向,推动精准医学发展 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术揭示滑膜组织异质性,识别新的致病细胞亚群和炎症互作网络,为治疗反应预测和新靶点开发提供创新见解 | 该领域仍处于早期阶段,滑膜多组学与临床数据的整合及人工智能应用尚需进一步发展 | 探讨滑膜组织分子病理学在类风湿关节炎精准医学中的作用,包括疾病分层、治疗预测和靶向治疗开发 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织及其细胞和分子特征 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 633 | 2026-07-15 |
Spatial omics of immunity: Mapping cellular landscapes in tissue microenvironments
2026-Aug, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2026.102790
PMID:42229080
|
综述 | 本文综述了用于解析肿瘤微环境中免疫细胞空间组织的多种空间组学技术 | 系统总结了高分辨率空间转录组学和蛋白质组学技术在组织免疫研究中的最新进展,包括计算工具创新及可视化数据解读方法 | 当前空间分子分析技术在分辨率和分析复杂性上存在技术限制,且跨平台数据缺乏标准化影响结果的可重复性和可比性 | 旨在通过空间分子图谱技术深入理解肿瘤微环境中的免疫细胞组织、功能及细胞间相互作用 | 肿瘤微环境中的免疫细胞及其空间组织、细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤微环境相关疾病(泛癌种) | 空间转录组学、空间蛋白质组学、多组学整合分析 | NA | RNA表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 634 | 2026-07-13 |
Molecular Characterization and Immune Modulation of Schwann Cells in Vestibular Schwannoma
2026-08, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70179
PMID:42226390
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序全面探究前庭神经鞘瘤中雪旺细胞的分子特征及其在肿瘤微环境中的潜在免疫调控作用 | 识别了一个新型雪旺细胞亚群Schwann 4,该亚群显著表达MHC II类分子并富集PI3K信号、黏着斑和细胞黏附相关通路,揭示了其在肿瘤免疫调节中的潜在作用 | 候选药物如前庭神经鞘瘤的适用性需要专门验证 | 探究前庭神经鞘瘤中雪旺细胞的分子特征及其免疫调控功能 | 前庭神经鞘瘤中的雪旺细胞 | 机器学习 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2026-07-13 |
Early Developmental Neuronal Activity Impacts Oligodendrocyte Differentiation Through AMPA Receptors
2026-08, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70157
PMID:42334020
|
研究论文 | 本研究探讨早期发育中谷氨酸能神经元活动如何通过AMPAR信号调控少突胶质细胞的分化和成熟 | 首次揭示在髓鞘形成前的早期大脑发育阶段,神经元活动减少反而促进少突胶质细胞分化,这与成熟大脑中的机制相反 | 未明确AMPAR信号在分化起始与成熟步骤中的具体分子机制,且研究仅限于小鼠模型 | 阐明早期脑发育中神经元活动对少突胶质细胞成熟的影响及其分子机制 | 小鼠嗅觉系统、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞前体细胞和少突胶质细胞 | 神经科学, 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 体内化学遗传学, 离体皮质切片培养 | NA | 基因表达数据 | NA(涉及小鼠模型,未明确具体数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 636 | 2026-07-10 |
The rituximab paradox in rheumatoid arthritis: Re-evaluating B-cell depletion depth and the synovial microenvironment
2026-Aug, Autoimmunity reviews
IF:9.2Q1
DOI:10.1016/j.autrev.2026.104089
PMID:42162633
|
research paper | 重新评估类风湿关节炎中B细胞耗竭深度与滑膜微环境,解释利妥昔单抗临床悖论 | 提出类风湿关节炎治疗无需完全系统性B细胞清除,通过单细胞转录组学与纵向数据整合揭示“不完全耗竭”在维持组织免疫安全边际中的作用 | NA | 解释利妥昔单抗在类风湿关节炎中临床疗效与B细胞耗竭深度不一致的悖论,并提出未来治疗范式 | 类风湿关节炎患者及滑膜组织中的致病性B细胞-成纤维细胞相互作用 | machine learning, digital pathology | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、纵向临床数据 | 来自REDO试验的纵向数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-07-08 |
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Aug, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3679727
PMID:41945837
|
研究论文 | 提出一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架,用于直接分解多维不规则张量数据(即 ragged tensor) | 首次引入二元加权张量模型描述ragged tensor的有效域,利用CP因子行与有效元素间的关联将全局目标解耦为独立、良态的子问题,并设计基于近邻交替最小化的闭式稳定更新算法,理论收敛有保障 | 未明确说明,需进一步阅读全文 | 发展能够处理多维不规则索引模式(ragged tensor)的张量分解方法 | 多光谱、高光谱图像以及空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 张量分解 | CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 | 图像、空间转录组数据 | 多个挑战性数据集(具体数量未详述) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 638 | 2026-07-08 |
Fusobacterium nucleatum-Derived Outer Membrane Vesicles Disrupt Epithelial Barrier in Oral Lichen Planus via JNK/c-JUN Mediated Claudin-4 Downregulation
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109526
PMID:42048970
|
研究论文 | 本研究揭示具核梭杆菌外膜囊泡通过JNK/c-JUN通路下调Claudin-4破坏口腔扁平苔藓上皮屏障 | 首次发现具核梭杆菌外膜囊泡通过激活JNK/c-JUN信号通路下调Claudin-4,揭示微生物驱动口腔扁平苔藓上皮屏障破坏的新机制 | 未开展体内动物模型验证实验,且主要基于体外细胞系研究,临床相关性需进一步验证 | 探究具核梭杆菌外膜囊泡在口腔扁平苔藓上皮屏障功能障碍中的作用机制 | 口腔扁平苔藓患者组织样本及HaCaT角质形成细胞 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RNA测序, qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 口腔扁平苔藓病变组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 639 | 2026-07-08 |
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109577
PMID:42090950
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成,揭示其细胞异质性和独特亚群 | 首次在单细胞水平上比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组谱,发现了此前未表征的前体样亚群(簇9)共表达周细胞标志物和间充质基质细胞标志物,并识别出IGFBP3和IGFBP5在根尖乳头干细胞来源簇中特异性富集 | 基于培养细胞的转录相似性提出伪时间轨迹假设,而非验证性的谱系关系;需要后续使用NOTCH3+/PDGFRB+的前瞻性分离及体外体内功能验证来确认再生潜力 | 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成,检测其不同再生行为背后的亚群,并识别有助于未来分离和功能靶向的标志物 | 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞,培养至第2代 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 3名人类供体的根尖乳头和牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat包进行降维和聚类,统一流形逼近与投影可视化 |
| 640 | 2026-07-08 |
UPR-CEBPB-MIF Signaling Links to Macrophage Polarization and an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Aug, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-026-19598-x
PMID:41936685
|
研究论文 | 该论文整合多组学数据,揭示了UPR-CEBPB-MIF信号轴与透明细胞肾细胞癌中巨噬细胞极化及免疫抑制性肿瘤微环境的关联 | 利用自编码器结合XGBoost鉴别UPR关键基因,并通过单细胞转录组分析映射UPR活性及免疫极化模式,首次阐明UPR-CEBPB-MIF信号轴在ccRCC免疫微环境中的作用 | 研究主要依赖公共数据库数据,需进一步实验验证信号轴的功能及临床转化潜力 | 解析UPR信号通路在ccRCC代谢重编程及免疫调控中的机制,并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤样本及细胞通信模式 | 机器学习 | 肾癌 | 多组学分析、单细胞转录组分析 | 自编码器、XGBoost、LASSO-Cox回归 | 基因表达数据、转录组数据 | 来自TCGA、GEO和ArrayExpress的多个队列样本 | NA | NA | NA | NA |