单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 80 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-06-26
4-Nonylphenol mediated tumor progression and immune modulation through CDK2: Computational and experimental validation
2026-Aug, Journal of environmental sciences (China)
研究论文 通过整合网络毒理学、机器学习、分子对接模拟、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统研究了内分泌干扰物4-壬基酚的致癌机制 首次建立计算-实验联合框架,综合多种组学技术阐明4-壬基酚通过CDK2等靶点促进肿瘤进展及免疫抑制微环境的机制 研究主要基于计算模拟和体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型和临床样本的进一步确认 阐明4-壬基酚的致癌分子机制及其对肿瘤免疫微环境的影响 4-壬基酚及其相关致癌靶点,包括TNF、CDK2、PRKCA、ERBB2、CASP8、MAPK3等核心基因 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 网络毒理学, 分子对接模拟, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 机器学习模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 两种乳腺癌细胞系用于体外验证实验 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
42 2026-06-26
A Cross-Species Single-Cell Transcriptomic Atlas of Subcutaneous Adipose Tissue Reveals Conserved and Divergent Cellular Programs
2026-Aug, Animal genetics IF:1.8Q3
研究论文 构建牛、猪和人类皮下脂肪组织的跨物种单细胞转录组图谱,揭示保守和物种特异的细胞程序 首次跨物种系统比较皮下脂肪组织的单细胞转录组,识别了保守的细胞类型和物种特异的细胞类群及差异表达基因 NA 揭示不同哺乳动物(牛、猪、人)皮下脂肪组织在细胞组成和转录特征上的保守性与分歧 牛、猪和人的皮下脂肪组织 机器学习和转录组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 牛、猪和人的样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
43 2026-06-26
Spatiotemporal heterogeneity in non-small cell lung cancer: A paradigm shift from characterization to dynamic management (Review)
2026-Aug, Oncology letters IF:2.5Q3
综述 探讨非小细胞肺癌时空异质性及其在临床管理策略中从静态分类向动态监测与干预的范式转变 提出基于单细胞测序、空间转录组学和液体活检等技术的新型动态管理框架,整合多组学数据和智能算法,旨在将非小细胞肺癌转变为可控制的慢性病 技术层面(如数据整合与算法优化)、生物学层面(如异质性机制理解不充分)和临床转化层面(如策略验证与实施困难)存在持续挑战 分析非小细胞肺癌时空异质性对治疗失败和耐药的影响,并讨论从静态分类向动态监测和干预的临床管理范式转变 非小细胞肺癌的时空异质性及其临床管理策略 数字病理学 肺癌 单细胞测序、空间转录组学、液体活检 NA NA NA NA 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA
44 2026-06-23
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Aug, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 通过实验上调Lancl1表达促进视神经损伤后轴突再生 首次发现Lancl1作为新的轴突再生促进因子,在体内通过上调表达直接修复受损中枢神经系统轴突,且不依赖mTOR通路 未阐明Lancl1促进轴突再生的下游分子机制,且需进一步验证其在不同中枢神经系统损伤模型中的治疗潜力 探究Lancl1是否能在体内直接促进中枢神经系统损伤后轴突再生 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)及其轴突 计算机视觉 中枢神经系统损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能增益实验、AAV2介导的基因递送 NA 单细胞转录组数据 具体样本量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
45 2026-06-23
Cucurbitacin B targets PPAT to suppress de novo purine biosynthesis in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究揭示葫芦素B通过靶向PPAT抑制食管鳞状细胞癌中嘌呤从头合成通路,从而抑制肿瘤生长并增强放疗效果 首次发现PPAT是食管鳞癌发展的关键调控因子,并揭示天然化合物葫芦素B通过TRIM38介导的多聚泛素化降解PPAT,同时证明其放疗增敏作用 未提及具体局限性 阐明PPAT在食管鳞癌进展中的作用及PPAT靶向干预的潜在治疗价值 食管鳞状细胞癌细胞及小鼠模型 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、结构虚拟筛选、蛋白质印迹、泛素化分析 NA 基因表达数据、代谢数据 体内外实验涉及食管鳞癌细胞系及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
46 2026-06-23
Dihydrotanshinone I inhibits PHGDH to suppress serine synthesis and remodel TME in NSCLC
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究鉴定出二氢丹参酮I(DHT I)作为一种新型PHGDH抑制剂,通过抑制丝氨酸合成通路并重塑肿瘤微环境,增强非小细胞肺癌免疫治疗效果 首次从天然产物中筛选出靶向PHGDH的抑制剂DHT I,阐明其通过阻断PRMT1介导的PHGDH甲基化而抑制酶活性的新机制,并揭示DHT I调控组蛋白修饰和巨噬细胞极化的免疫微环境重塑作用 天然产物来源的PHGDH抑制剂尚未获批临床应用,其抗肿瘤药理机制的精确分子细节有待进一步阐明 从天然产物中鉴定PHGDH抑制剂并阐明其抗肿瘤药理机制 非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系及小鼠模型 计算机视觉 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序、分子对接模拟、细胞热位移分析、药物亲和反应靶标稳定性、微量热泳动、免疫共沉淀、蛋白质印迹、代谢组学分析、定量实时PCR、酶联免疫吸附试验 NA 基因表达数据、代谢组学数据、单细胞转录组数据 公共数据库中的人类非小细胞肺癌患者样本;小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
47 2026-06-23
Licochalcone B alleviates pulmonary vascular remodeling via inhibiting Furin/TGF-β1 in pulmonary hypertension
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 该研究揭示了Furin在肺动脉高压(PH)相关肺血管重塑中的关键作用,并发现甘草查尔酮B(LicoB)通过抑制Furin/TGF-β1信号轴缓解血管重塑 首次发现Furin在PH发病机制中的驱动作用并鉴定其新型抑制剂LicoB 仅基于动物模型和体外实验,缺乏临床患者数据验证 探究Furin在PH相关血管重塑中的作用并评估LicoB的治疗潜力 肺动脉高压动物模型(小鼠、大鼠)及肺动脉血管细胞 机器学 肺动脉高压 单细胞转录组学 NA 转录组数据 多种PH动物模型(小鼠和大鼠)及体外细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2026-06-23
Cepharanthine triggers immunogenic cell death in solid tumors by suppressing protein kinase C zeta-mediated poly(ADP-ribose) polymerase 1 expression and synergizes with immunotherapy
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了千金藤素在多种实体瘤中诱导免疫原性细胞死亡的能力,并阐明其通过抑制蛋白激酶Cζ介导的PARP1表达实现促免疫原性及与免疫治疗协同作用的机制 首次发现天然生物碱千金藤素通过靶向PKCζ/NF-κB/PARP1轴诱导免疫原性细胞死亡,并与PD-1阻断和OX40激动剂协同增强抗肿瘤疗效 主要为临床前研究,尚需进一步临床试验验证其安全性和有效性 探索千金藤素作为免疫原性细胞死亡诱导剂的潜力及其与免疫治疗的协同作用 多种实体瘤模型(乳腺癌、结直肠癌、食管癌、肝癌、肺癌) 机器学习 肺癌, 肝癌, 结直肠癌, 乳腺癌 流式细胞术, 蛋白免疫印迹, 免疫荧光, ATP定量, 细胞热移位实验, 表面等离子共振, 批量与单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 同源小鼠肿瘤模型及患者来源类器官系统 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-06-21
Unraveling the role of non-coding RNAs in Parkinson's disease: Molecular mechanisms and therapeutic insights
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
综述 该文章揭示了非编码RNA在帕金森病发病机制中的分子调控作用及其治疗潜力 系统整合了miRNA、lncRNA和circRNA三类非编码RNA在帕金森病中调控α-突触核蛋白稳态、线粒体功能、自噬及神经炎症的多层次机制,并引入单细胞测序和多组学数据揭示细胞特异性失调模式 仅基于现有文献综述,缺乏原始实验验证;未深入讨论非编码RNA作为治疗靶点的临床转化障碍(如递送系统、脱靶效应) 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制并探索治疗前景 帕金森病相关的非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA)及其调控网络 机器学习 神经退行性疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
50 2026-06-19
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals a baicalein-responsive 10-gene signature for non-small cell lung cancer
2026-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 整合单细胞和空间转录组学分析揭示了黄芩素应答的10基因签名用于非小细胞肺癌 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、批量转录组学、空间转录组学、机器学习和体外实验,系统鉴定非小细胞肺癌中黄芩素应答基因,并建立了高诊断准确性的10基因签名,通过分子对接和动力学模拟验证了黄芩素与关键靶蛋白的结合稳定性 研究主要基于公开数据和体外实验,缺乏体内动物模型和临床试验验证,且黄芩素的具体作用机制仍需进一步深入探究 识别非小细胞肺癌中黄芩素应答基因并建立诊断签名 非小细胞肺癌细胞系(PC-9和A549细胞)及肿瘤微环境中的不同细胞类型 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 机器学习模型(用于选择基因签名) 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确说明样本数量,但使用了公开数据集及体外实验中的PC-9和A549细胞系 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
51 2026-06-19
Telomerase-related gene EHHADH drives lung cancer progression and shapes the immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究基于端粒酶相关基因构建肺癌预后风险模型,发现EHHADH驱动肺癌进展并塑造免疫抑制性肿瘤微环境 首次从端粒酶相关基因角度构建肺癌预后模型,并发现EHHADH作为关键致癌驱动基因在免疫逃逸中的作用 未在更大规模临床队列中验证模型,EHHADH的分子机制仍需进一步深入探索 评估端粒酶相关基因在肺癌中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 肺癌患者样本及公开数据集中的端粒酶相关基因 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 Cox回归风险模型 基因表达数据 来自七个公开数据集的肺癌病例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
52 2026-06-18
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞-足细胞交互失调 整合阳离子牛血清白蛋白诱导的小鼠膜性肾病模型与单细胞RNA测序,绘制肾脏细胞图谱,发现巨噬细胞-足细胞轴失衡(Spp1-整合素信号增强和胶原IV稳态信号减弱)是肾小球损伤的关键驱动因素 主要基于小鼠模型,人体样本验证有限 阐明膜性肾病中细胞网络驱动损伤的机制 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾脏细胞 机器学习和生物信息学 膜性肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-06-18
From tarsal anatomy to tear-film homeostasis: A history-informed review of the meibomian gland in ocular surface biology
2026-Aug, Experimental eye research IF:3.0Q1
综述 回顾从解剖学到泪膜稳态的睑板腺研究历史,阐述其在眼表生物学中的核心作用及其功能障碍(MGD)的现代概念 提出“认识激活”作为分析术语,系统梳理睑板腺从解剖识别到因果疾病关联、量化测量和诊断框架整合的历史过程,并展望基于细胞状态、脂质相、免疫和计算表型的未来分类方向 未提及具体限制 综述睑板腺研究的历史演变,解释其从解剖结构到眼表疾病关键因素的转变,并为未来MGD分类提供历史视角 睑板腺及其功能障碍(MGD) 眼科及眼表生物学 干眼症(蒸发过强型干眼)相关眼表疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型、人工智能图像分析、干细胞/再生研究 NA 文本(历史文献综述) NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
54 2026-06-18
Deep Structure-Enhanced Cell Clustering Model for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Aug, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology IF:1.4Q2
研究论文 提出一种名为scDSEC的深度结构增强细胞聚类模型,用于单细胞RNA测序数据 通过整合细胞内部特征和外部结构语义,并采用逐层增强策略来学习增强的细胞表示,以解决表示学习不充分的问题 文中未明确提及局限性 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类性能 单细胞RNA测序数据中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度神经网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
55 2026-06-16
Ligand-based directed differentiation to produce granulosa-like cells expressing steroidogenic enzyme genes
2026-Aug, Stem cell research IF:0.8Q4
研究论文 报道一种基于配体的快速分化方案,将人类诱导多能干细胞分化为表达类固醇生成酶基因的颗粒样细胞 提出5天快速分化方案,通过配体诱导实现hiPSC向颗粒样细胞分化,并利用单细胞RNA测序鉴定细胞标志物和新基因 HSD17B1表达水平低,表明产生的是未成熟颗粒细胞表型 生成颗粒样细胞以模拟人类性腺发育和测试药物对卵巢的影响 人类诱导多能干细胞(hiPSCs) 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未具体说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
56 2026-06-15
Rescuing Prdx1-deficiency-mediated redox homeostasis disruption in bone marrow mesenchymal stem cells ameliorate radiation-induced bone loss
2026-Aug-16, Free radical biology & medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序和体内外实验,揭示Prdx1在骨髓间充质干细胞中通过抑制Akt/FoxO信号通路缓解辐射诱导骨丢失的机制,并构建E7-EV递送系统实现靶向基因治疗 首次阐明Prdx1在辐射诱导骨丢失中的动态表达模式及其通过Pten/Akt/FoxO通路调控氧化应激的分子机制,并开发了BMSCs特异性E7肽修饰细胞外囊泡递送系统用于Prdx1 mRNA靶向治疗 未在人体模型中验证,且E7-EV递送系统的长期安全性和有效性需要进一步评估 阐明Prdx1保护BMSCs免受辐射诱导骨丢失的作用机制,并开发新型基因治疗策略 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和辐射诱导骨丢失小鼠模型 机器学习和数字病理学 放射性骨丢失 单细胞RNA测序, 高通量RNA测序, 分子动力学模拟 NA 测序数据 小鼠模型和原代BMSCs 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞转录组分析的10x Chromium平台
57 2026-06-15
Common subtypes of CAFs and their research progress in immune evasion of colorectal cancer
2026-Aug, Cytokine IF:3.7Q2
综述 系统综述结直肠癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)的常见亚型及其在免疫逃逸中的研究进展 通过scRNA-seq和空间转录组学等前沿技术,细化了CAF亚型分类,并深入分析了不同亚型在结直肠癌免疫逃逸中的独特调控机制 未提及具体研究限制,但综述可能受限于当前领域研究的深度和广度,以及不同亚型功能验证的不足 为结直肠癌精准免疫治疗提供理论依据,并识别潜在治疗靶点 结直肠癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 文本、基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞RNA测序, 10x Visium 空间转录组学
58 2026-06-13
Tepraloxydim metabolite exposure disrupts placental function revealed by single-cell sequencing and metabolomics
2026-Aug-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和代谢组学,系统探究除草剂tepraloxydim代谢物DMP对小鼠胎盘细胞组成、转录程序和代谢稳态的影响 首次系统揭示DMP通过代谢重编程和细胞命运改变破坏胎盘结构与功能的机制 未提及,摘要中无相关信息 探究DMP对胎盘发育的影响及其潜在机制 小鼠胎盘组织 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序, 代谢组学 无特定模型 表达谱数据, 代谢物数据 小鼠模型,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
59 2026-06-13
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1
研究论文 提出通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络的方法 结合一阶和二阶邻近度捕获复杂拓扑结构,并通过对抗训练策略将目标向量正则化为基因表达数据的先验分布,以保持生物统计特性 未明确指出具体限制,但可能依赖于高质量的训练数据和网络拓扑假设 开发一种能够处理基因调控网络复杂拓扑和非同分布基因表达数据的新型推断方法 基因调控网络、基因表达数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 有向图自编码器、生成对抗网络 基因表达数据 DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
60 2026-06-13
GLUL drives metabolic reprogramming and confers docetaxel resistance in prostate cancer
2026-Aug, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 该论文发现谷氨酸-氨连接酶(GLUL)驱动前列腺癌代谢重编程并导致多西他赛耐药 首次将GLUL确定为多西他赛耐药的关键代谢驱动因子,并揭示谷氨酰胺合成作为去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中可药用的脆弱点 未提及具体局限性 探索前列腺癌中多西他赛耐药的代谢决定因素及GLUL的作用机制 前列腺癌临床样本、细胞系及异种移植模型 机器学习和数字病理的交叉领域 前列腺癌 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、代谢物数据 临床样本及独立队列验证 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台
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