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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-16 |
The Impact of Ageing on Skeletal Muscle: Roles of Mitochondrial Dysregulation, Systemic Communication, and Exercise
2026-08, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70212
PMID:42503896
|
综述 | 本文综述了衰老过程中线粒体功能失调、局部及全身细胞环境变化对骨骼肌再生能力下降和肌少症的影响，并探讨了运动干预及新兴技术在该领域的应用前景 | 整合了从细胞自主性代谢失调到局部及全身细胞环境老化的多层次机制，强调了运动对肌肉组织健康的重要作用，并指出人类肌肉图谱和空间转录组学等新兴技术将有助于发现新的生物标志物和治疗靶点 | 作为综述性文章，未提供原始实验数据，对具体分子机制和信号通路的阐述可能不够深入，且未对现有研究的异质性和争议进行系统性的荟萃分析 | 总结肌少症和衰老过程中肌肉修复效率低下的相关机制，从细胞自主性代谢失调到局部及全身细胞环境的老化变化，并探讨运动干预和新兴技术在防治肌少症中的潜力 | 衰老骨骼肌、肌少症、肌肉干细胞、细胞微环境 | NA | 肌少症 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-09-16 |
Multiomics Profiling Identifies Blood-Based Diagnostic Markers for Sepsis
2026-08, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70213
PMID:42530023
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研究论文 | 该研究通过整合大规模转录组分析与机器学习算法，识别出脓毒症的三基因诊断标志物（TLR5、HMGB2和C19orf59），并通过单细胞RNA测序、小鼠模型和临床血清验证其诊断与严重程度分层价值 | 发现了跨临床严重程度分层均保持稳定诊断效能的三基因标志物组合（TLR5、HMGB2和C19orf59），并通过单细胞RNA测序将其定位至髓系免疫细胞区室，同时利用严格时间匹配的假手术对照CLP小鼠模型和溶剂对照体外模型消除了手术或环境应激的混杂效应 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别和验证脓毒症的血液诊断标志物，用于早期诊断和风险分层 | 脓毒症患者、CLP小鼠模型、LPS刺激的体外细胞模型 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-09-16 |
Spatial dynamics of viral replication drive biphasic lymphoid activation and systemic alphavirus immune responses
2026-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014509
PMID:42585262
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研究论文 | 该研究揭示了委内瑞拉马脑炎病毒（VEEV）在淋巴结中的空间复制动态如何驱动双相淋巴激活和全身性α病毒免疫应答 | 结合靶向细胞清除和Visium HD空间转录组学病毒基因定量，首次揭示了VEEV感染引发的时空双相固有免疫应答：初期由淋巴结被膜下窦中树突状细胞和单核/巨噬细胞亚型的病毒复制驱动，后期（16小时感染后）则由非病毒复制的旁观者细胞（包括浆细胞样树突状细胞）主导细胞因子诱导 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他宿主中验证；VEEV突变体的淋巴趋向性可能无法完全代表野生型病毒；空间转录组学的分辨率可能限制了对单个细胞水平病毒复制动态的精确追踪 | 阐明淋巴组织中病毒-细胞相互作用和特定宿主信号通路如何启动全身性I型干扰素和促炎细胞因子应答，以及这些应答与病毒淋巴组织趋向性的关联 | 具有明确淋巴结趋向性的委内瑞拉马脑炎病毒（VEEV）突变体及感染的小鼠模型 | 空间转录组学、免疫学、病毒学 | α病毒感染、委内瑞拉马脑炎 | 空间转录组学、靶向细胞清除、病毒基因定量 | NA | 图像、文本（空间转录组数据） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | Visium HD空间转录组学用于病毒基因定量 |
| 44 | 2026-09-16 |
Single-cell immune atlas of mouse testes unveils metabolic reprogramming of FOLR2 + macrophages in orchestrating testicular immunity during aging
2026-Aug, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-026-02109-x
PMID:41618065
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了年轻和年老小鼠睾丸免疫细胞图谱，揭示了FOLR2+巨噬细胞在衰老过程中代谢重编程并调控睾丸免疫的机制 | 首次构建了小鼠睾丸衰老的全面免疫细胞图谱，发现了FOLR2+常驻巨噬细胞向促炎状态的表型转变，并揭示了线粒体代谢功能障碍（特别是IDH2抑制）是FOLR2+巨噬细胞激活的关键驱动因素，以及CCL8-CCR2/CCR5轴在招募单核细胞和CD8+ T细胞中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类睾丸衰老中验证相关发现；样本量相对有限（6622个免疫细胞） | 阐明睾丸衰老过程中免疫细胞的动态变化和功能，特别是FOLR2+巨噬细胞在维持睾丸免疫稳态中的作用 | 年轻和年老小鼠睾丸中的CD45+免疫细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 6622个免疫细胞（包括巨噬细胞、单核细胞和T细胞），来自年轻和年老小鼠睾丸 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-09-14 |
Multi-omics characterization of a GPRC5A+ epithelial subpopulation associated with malignant features in colorectal cancer
2026-08-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08886-5
PMID:42723078
|
研究论文 | 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学数据，鉴定并表征了结直肠癌中一个与恶性特征相关的GPRC5A+上皮细胞亚群 | 首次构建了结直肠癌分期分层的单细胞图谱，解析了11个恶性上皮亚群，并鉴定出GPRC5A+Epi为晚期富集且与EMT、缺氧和炎症程序相关的恶性上皮状态，同时揭示了GPRC5A受FOSL1调控及其与POSTN+成纤维细胞的潜在相互作用 | GPRC5A+Epi与POSTN+成纤维细胞之间的关系及曲美替尼相关发现属于假设生成性质，尚需功能性串扰验证、直接结合实验和治疗性验证 | 阐明结直肠癌中与恶性相关的上皮程序及其细胞背景，鉴定关键的恶性上皮亚群及其调控机制 | 结直肠癌样本中的上皮细胞亚群，特别是GPRC5A+上皮细胞亚群及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, CRISPR功能实验, EMT免疫印迹, 异种移植, SCENIC/JASPAR/ChIP-qPCR转录因子分析, 药物反应预测, 分子对接和分子动力学模拟 | NA | 图像, 文本 | 2,993例结直肠癌样本，包括批量RNA测序2,568例（两个OS/RFS队列）、单细胞RNA测序281,961个细胞/152个标本、空间转录组学6例、蛋白质组学267例 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-09-14 |
CCNA2 orchestrates the PI3K/AKT signaling axis to propel prostate cancer metastasis
2026-Aug-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2026-0511
PMID:42729059
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据及多种机器学习算法，系统评估了CCNA2在前列腺癌中的诊断和预后价值，并揭示其通过PI3K/AKT信号轴驱动肿瘤转移的机制 | 首次系统性地结合单细胞RNA测序、TCGA和GEO批量转录组数据以及多种机器学习算法，全面评估CCNA2在前列腺癌中的诊断和预后价值，并通过体外功能实验验证其通过PI3K/AKT信号通路促进前列腺癌转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列验证，机器学习诊断模型的临床转化仍需进一步多中心大样本研究证实 | 筛选与前列腺癌相关的关键机器学习生物标志物，系统评估CCNA2的诊断和预后价值，并阐明其在前列腺癌进展中的分子机制 | 前列腺癌患者转录组数据及前列腺癌细胞系 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq, 免疫荧光 | 机器学习集成算法, Cox比例风险模型, Kaplan-Meier生存分析 | 转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-09-14 |
Integrated transcriptome analysis and machine learning to construct a homeostatic model of acetylation for bladder cancer and validate the key gene CES1
2026-Aug-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2026-0435
PMID:42729074
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研究论文 | 该研究通过整合转录组分析和机器学习构建了膀胱癌乙酰化稳态模型，并验证了关键基因CES1的生物学功能 | 首次基于整合转录组分析和机器学习构建了膀胱癌乙酰化稳态模型，该模型由五个基因组成，能有效预测总生存期并作为独立预后因素，同时发现并验证了CES1作为关键基因通过调节细胞内辅酶A水平影响乙酰化稳态 | CES1与蛋白质乙酰化稳态的潜在关联需要进一步的机制验证 | 构建膀胱癌乙酰化稳态模型，用于生存分层和个性化治疗指导，并验证关键基因CES1 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | LASSO, Cox回归 | 转录组数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-09-14 |
Early immune dysregulation in Mtb/SIV co-infection resists cART treatment at the single-cell level
2026-Aug-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116944
PMID:42565131
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学分析接受cART治疗的Mtb/SIV共感染恒河猴的支气管肺泡灌洗细胞，揭示了早期SIV共感染潜伏性结核时出现的严重免疫失调 | 在单细胞水平上揭示了Mtb/SIV共感染早期免疫失调对cART治疗抵抗的机制，发现了持续T细胞偏移环境和髓系炎症，以及CD4 T细胞-巨噬细胞串扰扩大和免疫稳态丧失 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究Mtb/SIV共感染早期免疫失调的机制及其对cART治疗的反应，为HIV感染中结核再激活提供转录组学框架 | Mtb/SIV共感染的恒河猴（接受cART治疗）的支气管肺泡灌洗细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-09-14 |
GM-CSF regulates conserved ILC-like transcriptional states and myeloid cell signaling during ulceration in Crohn's disease
2026-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703526
PMID:41676475
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研究论文 | 该研究通过Xenium单细胞空间转录组学和斑马鱼模型，揭示了GM-CSF在克罗恩病溃疡区域中对髓系和淋巴样细胞互作的调控作用 | 首次利用Xenium单细胞空间转录组学解析克罗恩病中CSF的空间免疫生态位，发现GM-CSF特异性富集于溃疡区域，并通过跨物种单细胞分析揭示了保守的ILC基因模块和GM-CSF依赖的转录网络 | 未明确说明样本量大小，斑马鱼模型与人类克罗恩病的免疫复杂性存在差异，Xenium空间转录组学可能受限于基因panel覆盖度 | 揭示CSF（特别是GM-CSF）在克罗恩病中如何塑造空间免疫生态位及调控髓系-淋巴样细胞互作 | 克罗恩病患者回肠组织及斑马鱼肠道损伤模型 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | Xenium单细胞空间转录组学平台 |
| 50 | 2026-09-13 |
DPEP1 promotes pulmonary fibrosis by regulating arachidonic acid metabolism
2026-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2026-1666
PMID:42724184
|
研究论文 | 该研究通过公共转录组数据和小鼠模型揭示DPEP1通过调控花生四烯酸代谢和内皮炎症反应促进肺纤维化，并评估DPEP1抑制剂西司他丁钠的治疗潜力 | 首次确立DPEP1在特发性肺纤维化中的致病作用，揭示其通过花生四烯酸代谢和内皮炎症反应促进肺纤维化的新机制，并提出靶向DPEP1的治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究DPEP1在特发性肺纤维化发病机制中的作用及其涉及花生四烯酸代谢和内皮炎症反应的潜在机制 | 特发性肺纤维化患者血清和肺组织样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、ELISA、RT-qPCR、免疫组化、免疫荧光、Western blotting | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 转录组数据、图像、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-09-13 |
Midkine restrains T-cell mediated anti-tumor immunity by suppressing macrophage M1 polarization in lung adenocarcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1204
PMID:42724375
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和体外共培养模型，揭示了MDK通过抑制巨噬细胞M1极化从而抑制T细胞介导的抗肿瘤免疫，在肺腺癌免疫抑制微环境中发挥关键调控作用 | 首次系统阐明MDK在肺腺癌中通过同时抑制细胞毒性CD8+ T细胞扩增、TH1极化和巨噬细胞M1极化来发挥免疫抑制功能，并证明MDK中和抗体可有效逆转这些免疫抑制效应 | 研究主要基于体外共培养模型和单细胞测序数据分析，缺乏体内动物实验验证；样本量有限，未进行大规模临床队列验证MDK作为治疗靶点的临床转化潜力 | 探究MDK在肺腺癌中的免疫调节作用，并评估MDK中和抗体的治疗潜力 | 肺腺癌细胞系、非小细胞肺癌细胞系、人外周血单个核细胞（PBMCs） | digital pathology | lung cancer | single-cell sequencing, flow cytometry, LDH release assay, multiplex cytokine measurement | NA | 单细胞测序数据、流式细胞术数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系及人外周血单个核细胞（PBMCs），具体数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-09-13 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies decreased CEBPB and PAX8 expression associated with immune landscape differences between medullary and papillary thyroid carcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1098
PMID:42724389
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研究论文 | 通过对一例甲状腺髓样癌和一例甲状腺乳头状癌组织进行单细胞RNA测序，并结合RT-qPCR和免疫组化验证，揭示了MTC与PTC之间转录和免疫景观的差异 | 首次在单细胞分辨率上探索性地表征甲状腺髓样癌与甲状腺乳头状癌之间的转录和免疫差异，发现CEBPB和PAX8下调可能与MTC免疫监视受损相关 | 样本量极小，仅包含一例PTC和一例MTC组织，属于探索性初步研究，结果需要更大样本量验证 | 在单细胞分辨率上探索性地表征甲状腺乳头状癌和甲状腺髓样癌之间潜在的转录和免疫差异 | 一例甲状腺乳头状癌组织和一例甲状腺髓样癌组织，以及TPC-1和TT细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组化 | NA | 图像, 文本 | 2例组织样本（1例PTC和1例MTC），共19334个基因和0.11亿个UMI，来自MTC样本的10039个细胞和PTC样本的9295个细胞，分为22个聚类，注释为10种细胞谱系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-09-13 |
The role of KIAA1467 in breast cancer: insights from pan-cancer and single-cell sequencing analysis
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1233
PMID:42724418
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研究论文 | 该研究通过泛癌和单细胞测序分析，系统探索了KIAA1467在乳腺癌中的表达模式、预后价值、免疫调控功能、生物学效应及耐药相关性 | 首次系统揭示KIAA1467在乳腺癌中驱动免疫排斥型非炎症肿瘤微环境的作用，并结合泛癌分析、单细胞测序、多组学分析和体外实验全面阐明其作为免疫检查点联合治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床试验数据，KIAA1467的具体分子机制尚未完全阐明 | 系统探索KIAA1467在乳腺癌中的表达模式、预后价值、免疫调控功能、生物学效应及耐药相关性，为优化基于免疫检查点阻断的联合治疗提供新靶点 | 乳腺癌（BRCA）及多种其他肿瘤类型，乳腺癌临床标本，乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 多组学生物信息学分析 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | TCGA泛癌数据集及GSE176078单细胞RNA测序数据，乳腺癌临床标本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-09-13 |
RECQL correlates with immune infiltration and serves as a prognostic biomarker and therapeutic predictor in gastric cancer
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0411
PMID:42724473
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析和体外实验，探讨了RECQL在胃癌中的临床意义、生物学功能及其在肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 首次综合运用WGCNA、LASSO回归和空间转录组学分析，揭示了RECQL在胃癌中与免疫浸润（特别是M2巨噬细胞）的关联，并通过体外实验验证了RECQL敲低对胃癌细胞功能的影响 | 主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏体内动物实验和临床大样本验证；机制研究尚不深入 | 探索RECQL在胃癌中的临床意义、生物学功能及其在肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 胃癌组织及胃癌细胞系（HGC-27） | 数字病理学 | 胃癌 | WGCNA、差异表达分析、LASSO回归、功能富集分析、免疫浸润分析、空间转录组学分析、CCK-8、集落形成、划痕实验、TUNEL实验 | NA | 文本、图像 | 来自TCGA-STAD和GSE150290公共数据集的胃癌样本，以及HGC-27细胞系 | NA | 空间转录组学、批量RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-09-13 |
Identification of a novel signature for prognostic stratification and integrative analyses in lung adenocarcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0943
PMID:42724475
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研究论文 | 本研究利用高尔基体相关基因构建了一个包含5个基因的肺腺癌预后风险模型，并验证了其在预后分层和免疫治疗反应预测中的效用 | 首次基于高尔基体相关基因构建了包含5个基因（GNPNAT1、RGS20、CAV3、NTSR1和FURIN）的肺腺癌预后风险模型，并结合单细胞RNA测序揭示了这些基因在细胞中的分布模式 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 利用高尔基体相关基因构建一个更简洁实用的肺腺癌风险模型，用于预后分层和免疫治疗反应预测 | 肺腺癌（LUAD）患者 | 机器学习 | 肺癌 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, 单变量Cox回归, 多变量Cox回归 | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-09-13 |
scRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of macrophage copper metabolism and establish a risk signature in hepatocellular carcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0604
PMID:42724516
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，揭示肝细胞癌中巨噬细胞铜代谢特征，并构建了一个七基因风险预后模型 | 首次从巨噬细胞铜代谢角度出发，整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建肝细胞癌预后风险模型，并结合免疫微环境和药物敏感性分析进行多维度验证 | 模型在TCGA-LIHC中具有中等预后区分能力，但外部验证表现异质性较大，在不同数据集间性能不一致 | 探索巨噬细胞铜代谢相关的预后模型，并研究该风险模型与肿瘤免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | LASSO回归, 多因素Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA-LIHC队列及肝细胞癌单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-09-13 |
Epigallocatechin gallate is associated with PDGFRB downregulation and altered PI3K-AKT signaling in gastric cancer
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0722
PMID:42724533
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析与体外实验，鉴定表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）在胃癌中的候选靶基因，发现EGCG与PDGFRB下调及PI3K-AKT信号通路改变相关 | 将公共数据库筛选的EGCG相关差异基因与LASSO-Cox预后模型结合，首次提出PDGFRB作为EGCG在胃癌中的候选关联基因，并结合单细胞测序揭示其细胞定位 | 研究仅提供相关性证据与假设，缺乏深入的机制验证，未明确EGCG与PDGFRB之间的直接调控关系 | 识别胃癌中EGCG相关候选基因，并为进一步机制研究提供假设 | 胃癌差异表达基因、EGCG相关靶点、胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, Western blotting, MTT, Transwell迁移实验 | LASSO回归, Cox比例风险模型, ROC曲线 | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-09-13 |
Uncovering sodium overload-associated gene signatures in chronic obstructive pulmonary disease through integrated bioinformatics and machine learning
2026-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2026-0843
PMID:42724664
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研究论文 | 该研究整合了两个肺转录组队列，利用生物信息学和机器学习方法识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中钠超载相关的基因特征，并验证了一个三基因面板 | 首次系统性地将钠超载相关基因集与COPD的转录组架构相结合，并通过十二种机器学习算法基准测试筛选出紧凑的三基因面板（ALDH3A1、MUC5AC、PHEX） | 三基因面板的区分能力中等（AUC 0.686），PHEX在不同平台间存在方向异质性，样本量有限，需要在更大规模的前瞻性匹配队列中验证 | 识别COPD中钠超载相关的基因，并评估一个紧凑的上皮基因面板在多个验证平台中的表现 | COPD患者和对照组的肺组织转录组数据、单细胞RNA测序数据以及qPCR样本 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR | 十二种机器学习算法 | 转录组数据、图像（单细胞测序数据）、文本（基因表达数据） | 两个bulk肺转录组队列、一个独立外部队列、13例COPD和12例非COPD对照的qPCR样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR | NA | NA |
| 59 | 2026-09-13 |
STC1 is associated with tumor progression and suppressive niches in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1080
PMID:42724726
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研究论文 | 该研究通过公共数据库的单细胞RNA测序和临床数据分析，揭示了STC1在喉鳞状细胞癌中与肿瘤进展及免疫抑制微环境的相关性 | 首次将STC1定位到喉鳞状细胞癌的上皮细胞，并揭示STC1+上皮细胞通过TGF-β和BTLA通路与T细胞亚群进行配体-受体互作，阐明了STC1在免疫抑制微环境中的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证和前瞻性临床队列的证实 | 探究STC1在喉鳞状细胞癌发病机制中的未知作用及其与肿瘤进展和免疫微环境的关系 | 喉鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-09-13 |
Single-cell and machine learning identify a trihydroxybutyrylation-related prognostic signature in esophageal cancer
2026-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2026-0900
PMID:42724740
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习识别食管鳞状细胞癌中的恶性上皮亚型，并构建了与三羟基丁酰化相关的七基因预后模型 | 首次将单细胞RNA测序与Kbhb相关基因结合，识别出具有干性特征的Malignant2亚型，并构建了基于Kbhb相关基因的七基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证；qPCR验证的样本量有限 | 识别食管鳞状细胞癌中的恶性上皮亚型，并建立基于Kbhb相关基因的预后生物标志物 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，qPCR | Cox，LASSO，XGBoost，随机生存森林（RSF） | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | GSE188900单细胞RNA测序数据，GSE53625、TCGA-ESCC、GSE53624队列用于验证，qPCR验证样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |