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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-08-12
Decabromodiphenyl Ethane Sensitizes Zebrafish to Alcoholic Liver Injury by Compromising NAD+-Mediated Multicellular Responses
2026-Aug-11, Environmental science & technology IF:10.8Q1
研究论文 本研究探讨了新型溴化阻燃剂十溴二苯乙烷(DBDPE)对斑马鱼酒精性肝损伤进展的影响,发现其通过抑制NAD+介导的多细胞反应增加肝损伤易感性并阻碍恢复 首次揭示DBDPE通过NAD+缺乏机制破坏胆管细胞紧密连接和肝细胞酒精代谢通路,从而加剧酒精性肝损伤,并发现烟酰胺核苷补充可逆转该效应 研究基于斑马鱼模型,未在哺乳动物或人类中验证,且未探讨DBDPE暴露的长期影响或剂量依赖性 探究DBDPE暴露对酒精性肝损伤进展的影响及其潜在分子机制 雄性斑马鱼 毒理学 酒精性肝病 单细胞转录组测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确样本数量(涉及斑马鱼肝脏组织) NA 单细胞RNA-seq NA NA
482 2026-08-12
Generation of Nasal Cell-Derived Human Alveolar Organoids and Organoid-Macrophage Assembloids for in Vitro Lung Modeling
2026-Aug-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究建立了从鼻细胞衍生类器官和单核细胞生成功能性肺泡类器官及肺泡巨噬细胞,并通过共培养形成类器官-巨噬细胞组装体,用于体外肺部建模 创新点在于利用易于获取和可扩展的鼻细胞衍生类器官生成肺泡类器官,并通过共培养构建类器官-巨噬细胞组装体,增强细胞成熟度,且揭示了SSEA-1+ club细胞作为主要肺泡祖细胞 摘要未提及明显局限性 旨在建立生理相关且广泛可及的体外肺模型,用于生物医学研究和转化医学 鼻细胞衍生类器官、外周血单核细胞来源的肺泡巨噬细胞、流感病毒(H5N1和H1N1) 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序 类器官、组装体 图像、测序数据 不适用 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'
483 2026-08-12
Spatial multi-omics landscape of colorectal cancer macro- and micrometastases
2026-Aug-10, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过空间多组学分析绘制结直肠癌宏观及微转移灶的空间演化图谱,揭示微转移灶的干性与静息状态及免疫抑制微环境,并鉴定与微小残留病相关的六基因特征。 首次整合点级和高分辨率空间转录组学、激光捕获显微切割后的多区域全基因组测序以及高多重蛋白成像技术,在单细胞和空间水平上全面解析结直肠癌肝、肺转移灶的演化过程,并识别出微转移灶特有的六基因特征,为临床监测和治疗提供新靶点。 研究样本量有限(19例患者),且主要基于组织样本,未来需在更大规模队列中验证六基因特征的临床适用性。 阐明结直肠癌转移(特别是微转移)的空间演化景观,并寻找可用于监测微小残留病和指导治疗的生物标志物。 结直肠癌患者的原发肿瘤及配对肝转移和肺转移病灶组织样本。 数字病理学 结直肠癌 空间转录组学、全基因组测序、蛋白质成像 NA 空间转录组数据、基因组测序数据、蛋白质成像数据 19例患者的49个肿瘤样本 10x Genomics, Illumina 空间转录组学, 全基因组测序 10x Visium, 10x Visium FFPE, Illumina NovaSeq 使用10x Visium和10x Visium FFPE进行空间转录组测序,以及Illumina NovaSeq平台进行全基因组测序
484 2026-08-12
PD-1 blockade unleashes local hepatitis B virus-related B cell response inhibiting hepatocellular carcinoma
2026-Aug-10, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过动态单细胞多组学分析,揭示PD-1阻断在肝细胞癌中通过增强肿瘤内三级淋巴结构中针对乙型肝炎病毒核心抗原的局部B细胞反应来抑制肿瘤的机制 首次发现PD-1阻断治疗肝细胞癌的机制涉及局部抗病毒B细胞免疫,特别是针对HBcAg的抗体反应和补体激活,而非仅依赖T细胞 摘要未提及明确的局限性 研究围手术期抗PD-1治疗对可切除复发性肝细胞癌的作用机制,并探索新的生物标志物 可切除复发性肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞和抗体 数字病理学 肝细胞癌 单细胞多组学、B细胞受体测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组和B细胞受体序列数据 涉及患者样本,具体数量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞多组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞多组学平台,结合空间转录组学
485 2026-08-12
GDF15 suppresses liver inflammation independently of weight loss through neuroendocrine glucocorticoid signaling
2026-Aug-10, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究利用热中性小鼠模型,发现GDF15通过GFRAL激活下丘脑-垂体-肾上腺轴,以不依赖体重减轻的方式抑制肝脏炎症和纤维化 首次揭示GDF15通过神经内分泌糖皮质激素信号通路独立于体重减轻发挥肝脏保护作用,并通过空间转录组学分析重塑肝脏免疫纤维化微环境 研究对象为小鼠模型,需在人类中验证;未完全阐明糖皮质激素信号下游的具体分子机制 阐明GDF15在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中的功能及其分子机制 GDF15及其受体GFRAL,涉及肝脏炎症、纤维化、免疫细胞及星状细胞 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 空间转录组学、RNA测序 NA 图像、文本 多个小鼠模型组(具体数量未提供) NA 空间转录组学, RNA-seq NA NA
486 2026-08-12
Alpha-ketoglutarate ameliorates diabetes-associated skeletal muscle fibrosis by restoring TET2-dependent epigenetic remodeling in CD90 positive fibro-adipogenic progenitors
2026-Aug-10, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究探讨α-酮戊二酸通过恢复CD90阳性纤维脂肪祖细胞中TET2依赖的表观遗传重塑,改善糖尿病相关骨骼肌纤维化的机制 首次揭示代谢物α-KG和L-2HG通过调控TET2依赖的DNA羟甲基化影响CD90+ FAP的不对称细胞分裂,从而驱动糖尿病骨骼肌纤维化的新机制 主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限 探究糖尿病骨骼肌纤维化中代谢-表观遗传机制,并评估α-KG补充的治疗潜力 CD90阳性纤维脂肪祖细胞(FAPs) 数字病理学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,LC-MS NA 单细胞RNA测序数据,组织样本 人类糖尿病骨骼肌活检标本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
487 2026-08-12
TNF Receptor 1 regulates colonic mesenchymal cell diversity and the epithelial stem cell niche
2026-Aug-10, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤坏死因子受体1在结肠间充质细胞多样性和上皮干细胞生态位中的作用,发现间充质TNFR1信号通过调控RSPO3维持干细胞生态位功能。 首次揭示了间充质TNFR1信号在维持结肠间充质细胞异质性和干细胞生态位中的关键作用,并鉴定了TNFR1依赖的TNF/干扰素响应间充质亚群,以及ITGA6信号在其中的调控机制。 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统,人类样本验证有限;未深入探讨TNFR1信号在疾病状态下的作用机制。 阐明间充质TNFR1信号如何调控结肠间充质细胞身份、干细胞生态位功能和上皮稳态。 结肠间充质细胞、肠道上皮干细胞、TNFR1缺陷小鼠模型和人类结肠肌成纤维细胞。 分子生物学 肠道疾病 免疫染色、western blot、bulk和单细胞RNA测序、类器官-间充质共培养、伤口愈合实验 小鼠模型(TNFR1-/-和Pdgfra-Cre;TNFR1fl/fl) 基因表达数据、图像数据 小鼠结肠组织样本和人类结肠肌成纤维细胞样本 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
488 2026-08-12
Hanchuan Zupa Granules attenuate host inflammatory and redox dysregulation in a pretreatment model of Pseudomonas aeruginosa-triggered acute lung injury
2026-Aug-10, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究评估了寒喘祖帕颗粒(HCZP)对铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型的预处理保护作用,并整合了公共单细胞转录组数据、LC-MS分析和分子对接,探索其抗炎和抗氧化机制及潜在可追溯成分 首次系统评估HCZP在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤模型中的预处理保护作用,并结合公共scRNA-seq数据、LC-MS和分子对接,优先确定了甘草苷和芹菜素作为潜在可追溯活性成分 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 评估HCZP预处理对铜绿假单胞菌触发的急性肺损伤宿主损伤反应的保护作用,并探索相关通路和可追溯成分 昆明小鼠和A549细胞 机器学习 急性肺损伤 LC-MS, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 分子对接 NA 基因表达数据, 图像, 质谱数据 昆明小鼠(数量未在摘要中明确)和A549细胞(细胞系) NA 单细胞RNA测序 NA 公共scRNA-seq数据(GSE276682)
489 2026-08-12
scRNA-Seq in Gastric Cancer Reveals Macrophage-Derived C1q as a Diagnostic Marker
2026-Aug-10, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究胃癌中巨噬细胞来源的C1q,并评估其作为诊断标志物的潜力 首次鉴定并功能验证了胃癌中的C1QA TAM亚群,发现C1q通过促进M2巨噬细胞极化加速胃癌细胞迁移,并展示其作为非侵入性早期诊断生物标志物的前景 未提及具体局限性,但研究样本量有限(3名患者用于单细胞测序,100例组织样本和240例血浆样本),且体外实验可能无法完全反映体内复杂环境 探究胃癌中肿瘤相关巨噬细胞异质性,特别是C1q的表达和功能,并评估其临床诊断价值 胃癌患者的肿瘤组织、相邻组织、血浆样本,以及THP-1来源的巨噬细胞和胃癌细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、免疫组化、ELISA、体外迁移实验 NA 单细胞转录组数据、组织图像、血浆蛋白浓度数据 3名未治疗患者的配对肿瘤和相邻组织用于单细胞测序;100例胃癌组织用于免疫组化;240例患者血浆用于ELISA NA 单细胞RNA测序 NA NA
490 2026-08-12
Calcified pituitary adenomas: First comprehensive characterization of a distinct clinical entity driven by GNAQ-mediated calcium-mitochondrial axis
2026-Aug-08, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究首次全面表征了钙化垂体腺瘤的分子特征,发现GNAQ通过钙-线粒体轴驱动肿瘤钙化 首次对钙化垂体腺瘤进行分子水平全面表征,识别出独特的GNAQ-IP3/Ca2+-线粒体凋亡-钙化轴,不同于经典成骨途径 未在摘要中提及具体局限性 揭示钙化垂体腺瘤的分子机制,特别是GNAQ在钙化中的作用 115名钙化垂体腺瘤患者,其中36例影像可见钙化,以及GH3垂体腺瘤细胞和小鼠异种移植模型 数字病理学 垂体腺瘤 单细胞RNA测序,转录组测序 NA 基因表达数据,临床数据,影像数据 115名患者(36例影像可见钙化),GH3细胞系,小鼠异种移植模型 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
491 2026-08-12
Single Cell-Type Spatial Proteomics Uncovers Regional Heterogeneity of Astrocytes
2026-08-07, Journal of proteome research IF:3.8Q1
研究论文 使用Microscoop Mint空间蛋白质组学平台直接分析小鼠脑组织中星形胶质细胞的蛋白质谱,揭示皮层和海马区的区域异质性 采用显微镜引导的空间蛋白质组学平台,实现福尔马林固定、OCT包埋脑组织中星形胶质细胞的亚细胞分辨率的蛋白质分析,无需单细胞分离 摘要中未提及明确局限性,可能包括样本量有限或需要进一步验证候选标记物 研究星形胶质细胞的区域异质性,通过空间蛋白质组学识别区域特异性蛋白标记物 小鼠脑组织中的星形胶质细胞 空间蛋白质组学 NA LC-MS/MS质谱法、空间蛋白质组学 NA 蛋白质组学数据、图像 小鼠脑组织样本(具体数量未提供) NA 空间蛋白质组学 Microscoop Mint 集成亚细胞区域特异性样本制备与LC-MS/MS质谱的显微镜引导平台
492 2026-08-12
Transposable elements and homotypic niches drive immune dynamics and resistance in melanoma epigenetic-based immunotherapy
2026-Aug-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学分析黑色素瘤患者在表观遗传免疫治疗期间的纵向活检样本,揭示了肿瘤可塑性、转座子激活和同型微环境在驱动免疫逃逸和治疗抵抗中的作用 首次在表观遗传免疫治疗临床试验中结合单细胞多组学和空间转录组学,识别出罕见的Wnt/β-Catenin黑色素细胞状态和去分化神经嵴样状态,并发现NFATC2作为耐药的关键调控因子,为治疗提供了新靶点 样本量有限,且主要基于单一临床试验队列,可能限制结果的普适性 阐明表观遗传重塑在黑色素瘤免疫治疗压力下如何驱动免疫逃逸和治疗抵抗的机制 接受表观遗传免疫治疗(DNA甲基转移酶1抑制剂联合抗CTLA-4)的黑色素瘤患者的纵向活检样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞多组学、空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 来自黑色素瘤患者的纵向活检样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞多组学、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞多组学(基因表达和染色质可及性)、10x Visium空间转录组学
493 2026-08-12
A topology-based framework for robust cancer-associated gene signature identification from scRNA-seq data
2026-Aug-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出一种基于拓扑学的框架,利用持续同调从单细胞RNA测序数据中识别稳健的癌症相关基因特征,超越传统基因选择方法 将持续同调引入基因特征识别,通过Vietoris-Rips过滤分析基因相关性拓扑结构,结合双阶段稳定性驱动分类策略,实现形状感知的生物学发现 摘要中未提及明确局限性 开发一种拓扑引导的框架,从scRNA-seq数据中提取结构不变且癌症相关的基因特征,提升生物标志物发现的准确性 乳腺癌和结直肠癌的单细胞RNA测序数据中的基因表达谱 机器学习 乳腺癌, 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 持续同调(拓扑数据分析) 基因表达数据 摘要中未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
494 2026-08-12
Integrative multi-omics and experimental validation reveal the oncogenic role of DDX52 in liver hepatocellular carcinoma
2026-Aug-06, Molecular and cellular probes IF:2.3Q4
研究论文 综合多组学分析与实验验证揭示了DDX52在肝肝细胞癌中的致癌作用 首次系统分析DDX52在泛癌中的表达、预后、遗传改变及免疫微环境特征,并在肝肝细胞癌中结合单细胞测序、分子对接和实验验证其功能与治疗潜力 部分分析依赖公开数据库,缺乏体内实验验证,分子对接结果需进一步生物学验证 阐明DDX52在肝肝细胞癌中的表达、预后价值、免疫关联及致癌机制,评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 DDX52基因及其在多种癌症,特别是肝肝细胞癌中的表达和相关细胞系HepG2和MHCC-97H 生物信息学、癌症基因组学 肝肝细胞癌 多组学分析(转录组、基因组)、单细胞测序、分子对接、细胞实验(siRNA沉默) NA 转录组数据、基因组数据、单细胞表达数据、药物敏感性数据 TCGA、GEO、HPA、SpatialTME数据库中的泛癌样本,及HepG2和MHCC-97H细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
495 2026-08-12
Dual Lineage Tracing Identifies Cellular Mechanisms Underlying Radiation-Associated Changes in Atherosclerotic Lesion Composition
2026-Aug-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究利用双谱系追踪小鼠模型,探究辐射诱导的动脉粥样硬化斑块组成变化背后的细胞机制,发现平滑肌细胞和内皮细胞的差异化响应。 首次在同一病灶中同时进行平滑肌细胞和内皮细胞的谱系追踪,避免传统单谱系追踪可能导致的错误归属。 未明确提及具体限制,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异,以及辐射条件的特定性。 阐明辐射如何通过影响平滑肌细胞和内皮细胞的表型可塑性来改变动脉粥样硬化斑块的组成和稳定性。 双谱系追踪的Apoe缺陷小鼠的血管组织和动脉粥样硬化病灶。 生物医学研究 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 双谱系追踪小鼠模型 单细胞转录组数据、免疫染色图像 使用了双谱系追踪的Apoe缺陷小鼠,具体数量未在标题和摘要中提及。 NA NA NA NA
496 2026-08-12
Sample Preparation for Imaging-Based Spatial Transcriptomics in Rigid Plant Tissues (Roots, Shoots)
2026-Aug-05, Bio-protocol IF:1.0Q3
研究论文 提出一种针对刚性植物组织(如水稻根)的基于成像的空间转录组学样本制备方案,确保组织处理、RNA完整性和空间结构保持,并包含样本附着测试。 优化了针对刚性植物组织的样本制备流程,包括组织固定、切片和附着测试,以确保高质量的空间转录组分析结果。 未提及具体局限性。 开发一种可靠且实用的样本制备方法,以支持刚性植物组织的空间转录组学研究。 刚性植物组织,特别是水稻根和茎。 空间转录组学 NA 成像-based空间转录组学 NA 图像 水稻根和茎样本,具体数量未提供。 NA 空间转录组学 商品化载玻片 未指定具体平台,但提及商业载玻片和探针杂交。
497 2026-08-12
Caveola and Its Resident Proteins, Caveolin-1 and -2, Play Critical Roles in the Pathogenesis of nAMD and PCV
2026-08-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和基因集富集分析,研究了新生血管性年龄相关性黄斑变性(nAMD)和息肉状脉络膜血管病变(PCV)中细胞和小分子机制,重点探讨了小窝蛋白Caveolin-1和-2在其中的作用 首次通过单细胞RNA测序在nAMD/PCV患者单核细胞中发现小窝(caveola)显著负富集,并通过体外过表达和敲低实验验证了Caveolin-1/2在炎症和血管功能中的调控作用,揭示了其作为潜在治疗靶点 样本量较小(患者10例,对照9例),且体外实验使用THP-1细胞和HUVEC,可能无法完全反映体内复杂微环境 探究nAMD和PCV的细胞和分子机制,特别是小窝及其驻留蛋白Caveolin-1和-2在疾病发病中的作用 nAMD/PCV患者和健康对照的外周血单核细胞(PBMC)中的单核细胞,以及THP-1单核细胞和人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 数字病理学 新生血管性年龄相关性黄斑变性、息肉状脉络膜血管病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因集富集分析(GSEA)、体外mRNA转染、qPCR、功能测定、细胞因子谱分析 NA 基因表达数据 nAMD/PCV患者10例,健康对照9例,共分析22,593个高质量单核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
498 2026-08-12
Senescent CD4+ T Cells Drive Diabetic Periodontitis via JAK-STAT-ROS-p38 MAPK
2026-08, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示了衰老CD4+ T细胞通过JAK-STAT-ROS-p38 MAPK信号通路驱动糖尿病牙周炎发病的免疫病理机制 首次阐明衰老CD4+ T细胞在糖尿病牙周炎中的致病作用,并揭示JAK-STAT-mtROS与TNF-α-p38 MAPK信号通路之间的交互作用,为靶向细胞衰老的治疗策略提供新视角 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类糖尿病牙周炎中的适用性需进一步验证,且具体分子机制细节仍需深入探索 探究糖尿病牙周炎中CD4+ T细胞的衰老状态及其致病机制,并阐明相关信号通路 糖尿病牙周炎小鼠模型的牙龈组织及CD4+ T细胞 免疫学、生物信息学 糖尿病牙周炎 单细胞RNA测序、过继转移实验、药理学抑制 NA 单细胞转录组数据、实验数据 基因表达综合数据库中的DPD小鼠牙龈组织单细胞RNA测序数据,以及实验用DPD小鼠模型(具体样本量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
499 2026-08-12
Beyond the Transcriptome: Leveraging Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing (CITE-seq) for Deeper Cellular Insights
2026-Aug, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1
综述 本文综述了CITE-seq技术,该技术通过寡核苷酸偶联抗体同时量化单细胞中的RNA和表面蛋白表达,以提供更深入的细胞功能见解 CITE-seq技术将转录组与蛋白组分析相结合,实现了单细胞水平的多模态检测,显著提升了细胞分类和功能解析的精度 存在技术与计算方面的持续挑战,包括数据处理复杂性和平台兼容性问题 阐述CITE-seq的方法学原理、计算框架及其在细胞生物学、肿瘤学和传染病研究中的应用,并展望未来方向 单细胞水平的转录组和表面蛋白表达数据 单细胞组学 肿瘤、传染病 CITE-seq NA 单细胞测序数据(RNA和蛋白质表达) NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
500 2026-08-12
Leveraging Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Gut Nutrition and Mucosal Immunology
2026-Aug, The Journal of nutrition IF:3.7Q2
评论 本文讨论了单细胞转录组学如何推动肠道营养生物学领域的发展,并探讨了空间转录组学和体内标记模型如何促进对营养干预调节的细胞间相互作用的研究。 强调了单细胞与空间转录组学联合应用在揭示肠上皮与免疫细胞间潜在通讯及营养代谢新假设方面的创新性。 未提供具体的实验数据或方法细节,且内容基于编辑视角,可能缺乏系统性实证支持。 探讨单细胞及空间转录组学在肠道营养和黏膜免疫学中的应用前景,以促进细胞间通讯研究。 肠道上皮细胞和免疫细胞。 生物信息学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA
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