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当前共找到 688 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2026-08-15
hoodscanR: profiling single-cell neighborhoods in spatial transcriptomics data
2026-Aug-13, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了hoodscanR,一个用于空间转录组数据中单细胞邻域分析与可视化的Bioconductor包 提出细胞级邻域概率图谱,支持部分成员关系,超越了传统的硬分配方法 未提及具体局限性 精确识别和分析空间转录组数据中的细胞邻域 乳腺癌和肺癌数据集 生物信息学 乳腺癌、肺癌 空间转录组学 概率模型(邻域概率图谱) 空间转录组数据 多个数据集(具体数量未指定) NA 空间转录组学 NA NA
422 2026-08-15
GCAN: A data feature learning method for scRNA-seq data
2026-Aug-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出一种针对单细胞RNA测序数据的数据特征学习方法,通过自适应高变基因选择和混合图自编码器改善聚类性能 结合改进随机森林进行自适应HVG选择,融合图注意力网络和图卷积网络的混合图自编码器,并采用MMD正则化和Spearman相关性特征过滤进行生物学信息优化 未在摘要中明确说明局限性 自动识别噪声scRNA-seq数据中的生物学相关特征,建模多尺度细胞关系以实现稳健聚类,并提供可解释的表征用于机制洞察 多个单细胞RNA测序数据集中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 混合图自编码器(图注意力网络与图卷积网络) 基因表达数据 17个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
423 2026-08-14
Longitudinal zone- and cell type-specific pattern-triggered immune responses in Arabidopsis roots
2026-Aug-12, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 利用拟南芥根的单细胞转录组学和活细胞成像,揭示了植物来源的植物细胞因子在不同细胞类型和纵向发育区引发比微生物来源的模式更强的免疫反应,并阐明了其与生长-防御权衡及病原体入侵位点的关联 首次在单细胞分辨率下系统描绘了拟南芥根对不同免疫激发子的转录反应图谱,并揭示了植物细胞因子在特定细胞类型和纵向区域中引发的更强的免疫反应及其对受体激酶基因表达的抑制机制 摘要中未明确提及局限性 解析拟南芥根中不同细胞类型和纵向发育区对植物来源和微生物来源免疫激发子的转录反应及其调控机制 拟南芥根的不同细胞类型和纵向发育区 单细胞转录组学 不适用 单细胞转录组测序、活细胞成像 不适用 单细胞转录组数据、活细胞成像数据 拟南芥根样本(具体数量未提供) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
424 2026-08-14
One-carbon metabolism upregulated in lupus promotes the differentiation and effector functions of human B and T cells
2026-08-01, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过RT-qPCR和单细胞RNA测序分析,发现系统性红斑狼疮患者B细胞中一碳代谢网络上调,并抑制该网络可减少B和T细胞增殖及效应功能,提示其可能成为SLE治疗靶点。 首次在人类B和T细胞中揭示SGOC网络在SLE中的上调及其功能影响,特别是MTHFD2的表达增加,并验证了特定代谢抑制剂对细胞功能的作用。 研究主要基于体外实验,未进行体内验证;且样本量可能有限,未详细描述患者异质性。 探究SGOC网络在人类B和T细胞中及SLE中的表达和功能作用,评估其作为治疗靶点的潜力。 SLE患者和健康对照者的B细胞和T细胞,以及CD4 T细胞亚群。 免疫学 系统性红斑狼疮 RT-qPCR, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, ELISA NA 基因表达数据, 细胞功能数据 SLE患者和健康对照者的外周血样本,具体数量未给出 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
425 2026-08-14
Single-cell sequencing reveals NK cell dysregulation during chronic HIV infection and identifies transitional NK cell cytotoxicity related to HIV reservoir decay
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 通过单细胞测序揭示慢性HIV感染期间NK细胞失调,并识别与HIV储存库衰减相关的过渡性NK细胞毒性 首次在单细胞水平全面揭示HIV感染对NK细胞异质性的影响,并发现c5-过渡性NK亚群的细胞毒性评分与HIV-DNA下降相关,为NK细胞为基础的免疫治疗提供新见解 样本量较小,且未收集性别认同信息 探究HIV感染如何影响NK细胞的异质性及与HIV储存库衰减的关系 外周血NK细胞,来自5名健康对照和17名男性HIV感染者(治疗前后) 单细胞测序 HIV感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、O-link蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据、血浆炎症细胞因子数据、细胞相关HIV-DNA数据 5名健康对照和17名男性HIV感染者,共22名参与者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
426 2026-08-14
Myokines in exercise‑mediated bone homeostasis: Molecular signaling mechanisms and therapeutic implications for bone disorders (Review)
2026-Aug, International journal of molecular medicine IF:5.7Q1
综述 本综述总结了运动诱导的肌因子在骨骼稳态中的分子信号机制,并提出了肌肉-骨骼-免疫三角轴概念,探讨其在骨疾病治疗中的潜力。 首次系统整合了肌肉-骨骼-免疫三角轴的概念,并强调多组学、单细胞和空间转录组学、器官芯片及人工智能等创新方法在加速该领域发现中的作用。 未提及具体局限性。 综合阐述肌因子介导的肌肉-骨骼串扰机制,并评估其对骨疾病(如骨质疏松和肌少症)的治疗意义。 运动诱导的肌因子,骨骼细胞(成骨细胞、破骨细胞、骨细胞),以及骨骼微环境中的免疫细胞。 生物信息学 骨质疏松、肌少症、骨疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
427 2026-08-13
Single-cell multiomics identifies an ALDH9A1-carnitine signaling axis driving resistance of NSCLC to immunotherapy
2026-08-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过整合多种单细胞多组学技术,发现ALDH9A1-肉碱信号轴驱动非小细胞肺癌对免疫治疗耐药的新机制 首次揭示ALDH9A1在抗PD-1治疗耐药中的未识别作用,并阐明其通过肉碱生产、染色质重塑和IL-1β反馈环驱动免疫抑制的机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,且未提供长期临床随访数据 探究非小细胞肺癌对免疫治疗耐药的分子机制,并评估ALDH9A1作为治疗靶点的潜力 非小细胞肺癌肿瘤组织、免疫细胞(如MDSCs和CD8+ T细胞)、小鼠模型 数字病理学 肺癌 CODEX、代谢组学、CyTOF、ATAC-seq、单细胞空间转录组学 NA 图像、文本、基因表达数据 涉及人类肿瘤样本和小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 10x Genomics, Fluidigm, Illumina 单细胞空间转录组学, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 10x Visium, 10x Chromium, BD Rhapsody 单细胞空间转录组学使用10x Visium平台,CyTOF使用Fluidigm系统,ATAC-seq和单细胞测序使用Illumina测序仪
428 2026-08-13
Follicle-stimulating hormone promotes energy metabolism in bovine granulosa cells through the FOXO1-ISG15 pathway to maintain the development of multiple follicles
2026-Aug-12, Journal of animal science and biotechnology IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用猪纯化垂体卵泡刺激素(pFSH)建立多卵泡发育的哺乳动物模型,结合单细胞转录组学和功能分析,揭示了pFSH通过FOXO1-ISG15通路促进牛颗粒细胞能量代谢,从而维持多卵泡发育的分子机制。 首次揭示pFSH-FOXO1-ISG15调控轴在颗粒细胞代谢重编程和同步多卵泡发育中的核心作用,将FSH信号与干扰素相关通路及代谢调节联系起来。 未提及明显局限性,但可能涉及物种特异性或体外实验的局限性。 阐明猪纯化垂体FSH促进牛颗粒细胞能量代谢和多个卵泡同步发育的分子机制。 牛颗粒细胞(来自小腔卵泡) 转录组学 不适用 单细胞RNA测序、RNA测序、染色质免疫沉淀测序 不适用 基因表达数据 未明确样本数量,但涉及多个小腔卵泡的颗粒细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
429 2026-08-13
Development of an immune escape-related gene prognostic signature using integrated single-cell and bulk RNA sequencing for immune microenvironment profiling in thyroid cancer
2026-Aug-12, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
研究论文 本研究整合单细胞和批量RNA测序数据,开发甲状腺癌免疫逃逸相关基因预后特征,并分析肿瘤免疫微环境。 首次利用单细胞和批量RNA测序整合分析,构建免疫逃逸相关基因预后特征,并揭示免疫冷热表型及潜在治疗靶点。 研究依赖公共数据集,样本量有限,且预后特征的临床验证仍需进一步前瞻性研究。 探讨免疫逃逸在甲状腺癌中的预后作用及其对肿瘤免疫微环境的影响,并开发预后基因特征。 甲状腺癌患者样本数据,包括单细胞和批量RNA测序数据。 机器学习和数字病理学 甲状腺癌 RNA-seq和单细胞RNA测序 Cox回归和LASSO回归 基因表达数据和临床数据 具体样本量未在摘要中提及 NA 单细胞RNA测序和批量RNA测序 NA NA
430 2026-08-13
Metabolic mRNA insufficiency of single cells: Implications for drug targeting and resistance
2026-Aug-12, The FEBS journal
研究论文 利用单细胞转录组学构建代谢图谱,发现单个细胞mRNA不足但可通过酶稳定性解释生长,并识别出针对肝癌亚群的潜在药物靶点 引入基于酶的V约束模型,揭示单细胞mRNA不足并非生长障碍,而是酶稳定性决定细胞生长,从而识别亚群特异性代谢脆弱性 未详细探讨酶稳定性机制,也未在体内验证药物靶点的有效性 识别亚群特异性代谢网络的脆弱性,为药物靶向和耐药性提供新见解 四个增殖细胞群体(三种肝癌相关和一种对照),共5512个细胞 生物信息学 肝癌 单细胞转录组测序 通量平衡分析(FBA)模型 单细胞转录组数据 5512个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
431 2026-08-13
Disease-associated microglia adopt stage-specific phenotypes that regulate T cell fate and immunity in glioma
2026-Aug-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 该研究通过单细胞测序和空间转录组学,揭示了胶质瘤相关小胶质细胞的不同状态及其对T细胞命运和免疫调节的作用 首次在胶质瘤模型中识别出Cst7表达的病理性小胶质细胞,并揭示干扰素-γ和Toll样受体信号依次调控其阶段特异性表型,从而调节双向小胶质细胞-T细胞相互作用 研究基于小鼠GL261模型,需进一步在人类样本中验证 阐明胶质瘤中病理性小胶质细胞的表型转变机制及其对肿瘤免疫的调控作用 胶质瘤相关小胶质细胞、T细胞 机器学习和数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组和空间转录组数据 GL261小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学
432 2026-08-13
T cell-intrinsic AIM2 exacerbates lung inflammation in OVA-LPS- and HDM-induced asthma models
2026-08-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了T细胞内在的AIM2在OVA-LPS和HDM诱导的哮喘模型中加剧肺部炎症的作用 发现了AIM2在CD4 T细胞中而非Treg或髓系细胞中驱动哮喘发病的新机制,并揭示了髓系细胞在特定条件下的辅助作用 未明确提及,但可能包括对AIM2在人类哮喘中的机制验证不足,以及动物模型与人类疾病的差异 评估AIM2在哮喘发病中的相关性及其细胞特异性作用 AIM2基因及其在T细胞和髓系细胞中的表达调控 免疫学 哮喘 基因敲除、单细胞RNA测序、流式细胞术 基因缺陷小鼠模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 人类公开数据集及小鼠模型样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA 来自发表数据集,未提供具体平台配置
433 2026-08-13
Progranulin deficiency-induced lysosomal dysfunction drives maladaptive myeloid cell states through the MITF/TFE transcription factors
2026-Aug-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了progranulin缺失导致的小胶质细胞溶酶体功能障碍如何通过MITF/TFE转录因子驱动神经退行性疾病相关的髓系细胞状态改变 首次将溶酶体健康状态与髓系细胞的表观遗传、转录及功能状态联系起来,并发现GPNMB作为补偿机制可促进溶酶体酸化,其缺失会加剧神经毒性 摘要中未提及具体研究局限性 探究溶酶体功能障碍与髓系细胞状态之间的相互作用,特别是在神经退行性疾病背景下的机制 缺乏progranulin的老年小鼠(Grn小鼠)脑内的髓系细胞,特别是小胶质细胞 神经科学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序、表观遗传学分析(如ATAC-seq)、基因编辑(如CRISPR) NA 单细胞转录组数据、表观遗传数据 未明确说明,涉及老年Grn小鼠及对照组小鼠的脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
434 2026-08-13
CCR7+ activated dendritic cells are essential for spontaneous and immunotherapy-driven anti-tumor immunity
2026-Aug-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学识别出一种常规树突状细胞(cDCs)的活化状态,并利用小鼠模型证实该活化状态对自发性和免疫治疗驱动的抗肿瘤免疫至关重要。 首次通过CCR7表达条件性标记或消除活化树突状细胞(actDCs),并揭示了cDC1和cDC2来源的actDCs分别通过交叉提呈和交叉装扮支持CTL启动,且后者呈癌症类型依赖性。 摘要未提及明确的局限性。 探究活化的树突状细胞(actDCs)在抗肿瘤免疫中的功能作用。 小鼠模型中的常规树突状细胞(cDCs)及其活化状态(actDCs),包括cDC1和cDC2。 免疫学 肿瘤 单细胞转录组学 小鼠模型(条件性基因敲除或标记) 单细胞转录组数据 未提供具体样本量 未提供 单细胞RNA测序 未提供 未提供
435 2026-08-13
Truncating RELA variants drive autoinflammation and autoimmunity by impairing the negative feedback control of NF-κB
2026-Aug-11, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨截短型RELA变异如何通过损害NF-κB的负反馈控制导致自身炎症和自身免疫。 首次阐明RELA单倍剂量不足通过削弱IκBα和A20等抑制性调节因子的诱导,导致免疫稳态失衡和炎症反应放大,并利用单细胞转录组揭示细胞类型特异性后果。 未明确提及研究的局限性。 阐明截短型RELA变异导致自身炎症和自身免疫的分子机制。 六名来自五个不相关家系的携带新发杂合截短型RELA变异的患者及其来源细胞,以及突变RELA敲入模型。 免疫学 自身炎症性疾病,自身免疫性疾病 单细胞转录组学,基因敲入模型 NA 单细胞转录组数据,患者来源细胞数据 六名患者,五个家系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
436 2026-08-13
Targeting KIT prevents brain arteriovenous malformations driven by ALK1-deficient angiogenic endothelial cells
2026-Aug-11, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究通过内皮特异性诱导型Alk1敲除小鼠和单细胞RNA测序,揭示了KIT+血管生成内皮细胞在脑动静脉畸形(bAVM)发病中的关键作用,并证明药物抑制KIT可减轻血管畸形而不影响正常血管。 首次识别出KIT+血管生成内皮细胞群体是bAVM的主要驱动因素,并发现KIT受BMP9-ALK1-SMAD4信号直接抑制,提出KIT作为可药物干预的靶点。 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,未进行临床试验验证KIT抑制剂的长期安全性和有效性。 阐明ALK1缺失诱导脑动静脉畸形的细胞机制,并探索潜在的治疗靶点。 携带Alk1条件敲除的小鼠内皮细胞,以及人类散发性或HHT2型脑动静脉畸形样本。 计算病理学,单细胞基因组学 遗传性出血性毛细血管扩张症2型,脑动静脉畸形 单细胞RNA测序 小鼠基因敲除模型,KIT抑制剂 单细胞转录组数据 小鼠模型(数量未明确)和人类组织样本(数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
437 2026-08-13
Aberrant O-glycosylation Induces IL-34-Mediated Immune Remodeling and Promotes Pancreatic Cancer Progression
2026-Aug-11, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了Tn抗原通过诱导IL-34介导的免疫重塑促进胰腺癌进展的机制,为胰腺导管腺癌的靶向治疗提供了新见解 首次建立糖基化-免疫-细胞因子轴,证明截短的O-聚糖通过IL-34介导免疫抑制,并确定潜在治疗靶点 尚未在临床样本中验证靶向IL-34的治疗效果,且免疫重塑的长期影响未深入探讨 探究Tn抗原如何通过IL-34重塑肿瘤免疫微环境并促进胰腺癌进展,以改进靶向Tn的治疗策略 胰腺导管腺癌细胞系、患者来源类器官、小鼠PDAC模型及免疫细胞浸润 癌症生物学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明,涉及细胞系、类器官及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
438 2026-08-13
Decoding macrophage-driven tumor heterogeneity in renal cell carcinoma using spatial and single-cell transcriptomics
2026-Aug-11, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究利用批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组学综合分析肾细胞癌中巨噬细胞驱动的肿瘤异质性,鉴定出与预后相关的基因特征并验证其功能 结合多种转录组学方法揭示巨噬细胞在肾细胞癌中的异质性作用,并建立基于SLC11A1和IFI30基因的预测分类器 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内验证 阐明巨噬细胞在肾细胞癌中的功能及其与临床特征和分子景观的关联,为靶向治疗提供新途径 肾细胞癌肿瘤组织样本、肿瘤细胞系 数字病理学 肾细胞癌 RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 分类器 转录组数据、空间转录组数据、临床样本数据 未明确提及 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
439 2026-08-13
Targeting S100A8 mitigates pathogenic neutrophil-driven tissue injury in bacterial epididymo-orchitis
2026-Aug-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示细菌性附睾睾丸炎中致病性中性粒细胞亚群及其S100A8表达,并通过药物抑制S100A8/S100A9复合物减轻组织损伤 首次在睾丸炎模型中通过单细胞转录组学识别出主导的致病性中性粒细胞亚群(Cluster 0),并确定S100A8作为关键标志物和潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,未涉及人类样本验证 阐明细菌性附睾睾丸炎中中性粒细胞驱动的组织损伤机制,并评估S100A8作为治疗靶点的潜力 小鼠附睾睾丸炎模型中的睾丸中性粒细胞 单细胞转录组学 细菌性附睾睾丸炎 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 小鼠睾丸样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
440 2026-08-13
IL1R2⁺ Inflammatory Monocytes Contribute to Immune Dysregulation and Predict Mortality in COVID-19
2026-Aug-11, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 研究IL1R2⁺炎性单核细胞在COVID-19中的免疫失调作用及其对死亡风险的预测价值 首次揭示IL1R2⁺单核细胞作为COVID-19中高度炎症性单核细胞状态,并通过单细胞RNA测序和血清蛋白水平分析,支持其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 分析基于公开数据集,且样本量有限,未来需更大规模和前瞻性研究验证 探讨IL1R2在COVID-19中的细胞分布、临床意义及其与疾病严重程度和死亡率的关系 COVID-19患者的外周血单核细胞(PBMCs)和血清样本,以及健康对照 免疫学, 单细胞测序 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、血清蛋白检测 NA 基因表达数据、细胞通信数据、血清蛋白水平数据 公开数据集GSE149689和GSE198256中的COVID-19患者及健康对照;实验部分包括COVID-19患者和健康对照的血清样本(具体数量在摘要中未给出) NA NA NA NA
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