本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-08-16 |
Citrullination-associated transcriptional states identify a non-canonical invasive program in malignant epithelial cells and correlate with SPP1-CD44 immune microenvironment niches in thyroid cancer
2026-Aug-04, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102931
PMID:42556131
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组数据,揭示甲状腺癌中瓜氨酸化相关的恶性上皮细胞非经典侵袭程序及其与SPP1-CD44免疫微环境生态位的关联 | 首次描绘甲状腺癌中瓜氨酸化的细胞分布和功能状态,发现高瓜氨酸化恶性细胞具有非经典的“高侵袭/高凋亡”程序而不伴随EMT升高,并确定SPP1-CD44轴为功能性巨噬细胞-恶性细胞通讯枢纽 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明瓜氨酸化在甲状腺癌恶性进展和微环境重塑中的作用及其潜在治疗靶点 | 甲状腺癌中的恶性上皮细胞、髓系细胞(特别是常规树突状细胞和巨噬细胞)以及SPP1-CD44免疫微环境生态位 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、批量转录组测序、CopyKAT、基因敲低和过表达实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据、细胞实验数据 | 单细胞数据含92,519个细胞(GSE232237),空间转录组数据(GSE250521),TCGA-THCA批量数据,以及TPC-1和8505C细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2026-08-16 |
Protocol for high-resolution multiplexed sequencing of single-cell full-length transcriptome with CBTi-seq
2026-Aug-03, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104765
PMID:42545848
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CBTi-seq的高分辨率多重测序方案,用于单细胞全长转录组分析,详细描述了从样本获取到文库富集的完整实验流程。 | CBTi-seq通过组合条形码Tn5转座酶插入技术,实现了高可扩展性和全长转录组覆盖,解决了通量与全长覆盖之间的平衡难题。 | 摘要中未提及明显的局限性信息。 | 提供一种高效、可扩展的单细胞全长转录组测序方案,以支持单细胞和微区域组织的转录组分析。 | 单细胞和微区域组织样本。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | CBTi-seq(组合条形码Tn5转座酶插入测序) |
| 403 | 2026-08-16 |
Exploring Heteroplasmic Variants in mtDNA: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2026-Aug-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15151403
PMID:42587811
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术结合生物信息学流程,表征了线粒体DNA异质性,并探讨了突变水平与转录组变化的关系 | 首次利用单细胞转录组学在单细胞分辨率下揭示线粒体DNA异质性的分布特征,发现大多数细胞呈现近同质性,而非均匀混合 | 研究样本仅来自四株成纤维细胞系,且突变水平与转录组的关联具有高度样本特异性,可能受核背景和细胞环境的影响 | 利用单细胞RNA测序技术研究线粒体DNA异质性及其对细胞表型和转录组的影响 | 携带呼吸复合体I亚基基因异质性致病变异的患者来源的成纤维细胞系 | 单细胞转录组学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4株成纤维细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-08-16 |
Multi-Omics Identification of Vasculogenic Mimicry-Associated Molecular Subtypes in Hepatocellular Carcinoma for Prognostic Stratification and Therapeutic Response Prediction
2026-Aug-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18152482
PMID:42588699
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,建立了基于血管生成拟态相关的肝细胞癌分子亚型分类系统,并系统表征了其生物学特征,为预后分层和治疗决策提供框架。 | 创新性地基于血管生成拟态相关基因集和单细胞RNA测序数据,识别出六个预后相关VM基因,并构建了VM评分亚型分类系统,结合空间转录组学、CyTOF、代谢组学等多组学手段全面刻画了亚型特征。 | 伊维菌素的抗肿瘤活性仍需进一步的实验验证,且研究主要基于公共数据集和动物模型,临床验证尚不充分。 | 建立肝细胞癌中基于血管生成拟态的分子分型系统,评估其预后价值,并探索亚型特异的治疗反应预测。 | 肝细胞癌患者样本,包括bulk转录组、单细胞RNA测序、空间转录组、CyTOF、代谢组学、脂质组学、体细胞突变和拷贝数变异数据,以及原位肝癌小鼠模型。 | 多组学分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱流式细胞术、代谢组学、脂质组学、体细胞突变分析、拷贝数变异分析、LASSO-Cox回归 | Cox回归模型、LASSO | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、脂质组数据、基因组变异数据 | 多个独立HCC队列,具体样本量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 405 | 2026-08-16 |
Myofibroblastic CAF and Malignant Ductal Cell Crosstalk Drives Epithelial-Mesenchymal Transition and Progression in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma via THBS2-SDC/Integrin Axes
2026-Aug-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156951
PMID:42589604
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析,识别出胰腺导管腺癌中具有高上皮-间质转化活性的恶性导管亚群Ductal-T0,并揭示了肌成纤维细胞CAF通过THBS2-SDC/整合素轴促进该亚群EMT和肿瘤进展的机制 | 首次在PDAC中识别出具有最高EMT活性和myCAF样转录程序的Ductal-T0亚群,并通过多组学整合分析预测了myCAF分泌的THBS2与ITGA3/ITGB1/SDC1/SDC4受体轴的相互作用,结合空间转录组揭示了肿瘤边缘的共定位和免疫排斥机制 | 该研究主要基于计算预测和数据推断,缺乏实验验证;EMT相关免疫排斥模型为计算推断,需进一步功能实验证实 | 阐明PDAC中特定CAF亚型与恶性导管细胞之间的分子交互作用及其在EMT和肿瘤进展中的驱动机制 | 胰腺导管腺癌样本中的恶性导管细胞亚群和肌成纤维细胞CAF | 多组学与计算生物学 | 胰腺导管腺癌 | 多组学分析、空间转录组学 | 计算预测模型 | 多组学数据、空间转录组数据 | 未具体说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 406 | 2026-08-16 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2026-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
PMID:41125832
|
研究论文 | 构建了跨越三个解剖区域和11个年龄组的结肠细胞和空间图谱,并开发了计算框架cSplotch来研究衰老过程中的组织与细胞时空动态 | 开发了新的计算框架cSplotch,利用层次贝叶斯模型整合空间转录组和单核RNA测序数据,通过组织学特征共享信息,识别结肠衰老相关的细胞和分子梯度 | 未提及明显的局限性 | 揭示结肠衰老过程中组织结构和分子调控的时空动态变化 | 小鼠结肠组织,涵盖三个解剖区域和11个年龄组 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, 组织学图像 | 约1,500个小鼠肠道组织(空间转录组)和约400,000个单核RNA测序谱 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2026-08-16 |
Prognostic value and spatial transcriptomic landscape of histopathological growth patterns in synchronous colorectal liver metastases
2026-08, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2026.111951
PMID:42296573
|
research paper | 本研究验证了组织学生长模式(HGPs)在同步性结直肠癌肝转移中的预后价值,并通过空间转录组学揭示了其分子机制 | 首次将空间转录组学与HGPs结合,揭示了促结缔组织增生型和替代型肿瘤两种不同的分子适应策略,即血管生成受限与代谢共选 | 未提及具体限制 | 验证HGPs在同步性结直肠癌肝转移中的预后价值,并探索其空间转录组学基础 | 182例手术切除的同步性结直肠癌肝转移患者 | digital pathology | colorectal liver metastases | spatial transcriptomics, NMF | NA | clinicopathological data, spatial transcriptomics data | 182 patients | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 408 | 2026-08-16 |
Foxs1-mediated transformation of CD34+ fibroblast to myCAFs promotes tumor growth
2026-Aug, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00476-8
PMID:42401755
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪、单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出Cd34Pi16成纤维细胞祖细胞,并揭示其通过转录因子Foxs1向Acta2肌成纤维细胞分化的过程,提出靶向该分化过程的抗肿瘤策略 | 首次确定Acta2肌成纤维细胞的发育起源,实验验证了Cd34向Acta2的转化,并结合CMap/LINCS L1000数据库筛选出抑制Foxs1上调的小分子化合物,提出靶向CAF谱系发育的新型抗肿瘤策略 | 尚不清楚其他肿瘤类型中该分化机制是否普遍适用,且小分子候选物的体内疗效和安全性有待进一步验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞的发育起源和分化轨迹,并探索靶向其分化的抗肿瘤治疗策略 | 黑色素瘤和胃癌中的Cd34Pi16成纤维细胞祖细胞及其分化的Acta2肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤、胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、诱导型遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 不明确,涉及黑色素瘤和胃癌组织及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、10x Visium空间转录组FFPE方案 |
| 409 | 2026-08-16 |
Pericyte KATP channel hyperactivity redistributes cortical blood flow in a CADASIL mouse model
2026-Aug, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00844-0
PMID:42547848
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学与活体双光子及三光子成像,探究CADASIL小鼠模型中周细胞K通道活性增强如何导致皮层血流重新分布,并加剧深层脑区灌注不足 | 首次揭示周细胞K通道病理性过度活跃导致脑血流空间分配失衡的新机制,并利用空间转录组学与多光子成像结合的方法,深入解析微血管代谢障碍对深层灌注的影响 | 摘要中未明确提及研究局限,可能涉及样本量有限或动物模型与人类疾病的差异等 | 阐明CADASIL模型中毛细血管周细胞功能异常对脑血流空间分布及深层灌注的影响机制 | CADASIL小鼠模型(TgNotch3R169C)及对照小鼠的脑微血管系统,尤其是周细胞和毛细血管 | 数字病理学 | 小血管疾病 | 空间转录组学、双光子成像、三光子成像、电生理学、离体实验、计算机模拟 | NA | 基因表达数据、图像数据、电生理数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及CADASIL小鼠模型和对照小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 410 | 2026-08-16 |
RareCapsNet: An explainable capsule network enables robust discovery of rare cell populations from large-scale single-cell transcriptomics
2026-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013962
PMID:42574461
|
研究论文 | 开发了RareCapsNet,一种基于胶囊网络的罕见细胞识别技术,用于大规模单细胞RNA测序数据中稳健地发现罕见细胞群体 | 利用胶囊网络的低级胶囊解释性,通过标记基因以人类友好的方式识别罕见、低代表性或推定罕见的细胞群体,并支持跨批次知识迁移 | 未在摘要中明确提及,可能包括计算复杂性和对真实数据复杂性的依赖 | 通过胶囊网络改进大规模单细胞转录组数据中罕见细胞群体的识别和解释 | 罕见细胞群体及其转录组特征 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序数据分析 | 胶囊网络 | 单细胞转录组数据(模拟和真实数据) | 未明确,涉及大规模单细胞数据(数万细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2026-08-16 |
Integrating short-read and long-read single-cell transcriptomics of pig pituitary reveals mechanisms of high-altitude hypoxia adaptation
2026-Aug, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012267
PMID:42574456
|
研究论文 | 整合长读长和短读长单细胞转录组测序技术,构建猪垂体的单细胞图谱,揭示高海拔低氧适应机制 | 首次整合Oxford Nanopore长读长和Illumina短读长单细胞测序技术,生成猪垂体的全长度单细胞图谱,并鉴定出约28%的新转录本异构体,揭示了高海拔适应中的代谢重编程和细胞间通讯变化 | 未提供明确的局限性信息 | 通过单细胞转录组分析,揭示猪垂体在高海拔低氧环境下的适应机制 | 来自迪庆藏猪(高海拔3200米)和滇南小耳猪(低海拔500米)的垂体组织 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 长读长单细胞测序(Oxford Nanopore)和短读长单细胞测序(Illumina) | 无监督聚类和标记基因注释 | 单细胞转录组数据 | 27,339个单细胞,涵盖28,932个表达基因,来自两种猪品种 | Oxford Nanopore, Illumina | 单细胞RNA-seq | Oxford Nanopore, Illumina NovaSeq | Oxford Nanopore长读长单细胞测序和Illumina短读长单细胞测序 |
| 412 | 2026-08-16 |
Patient-derived resources for decoding and targeting brain metastases ecosystems
2026-Aug, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00472-y
PMID:42399405
|
观点评论 | 本文基于RISEbrain联盟的经验,综述了患者来源资源在解码和靶向脑转移生态系统中的应用,包括临床队列、生物库、功能性离体模型和多组学平台 | 强调快速尸检项目在捕获早期转移播种中的未充分利用潜力,并提出整合多种患者来源资源形成相互依赖的工具包以推进脑转移的早期检测、预防和精准治疗 | 文中未明确提及局限性,但可推断资源和平台的整合面临实质性后勤和技术障碍 | 探讨患者来源资源如何用于解码脑转移的生态系统,以推进早期检测、预防和精准治疗 | 脑转移患者来源的临床队列、生物库、功能性离体模型(如器官型培养和类器官)及多组学数据 | 数字病理学 | 脑转移 | 空间转录组学、蛋白质组学、液体活检、光子生物传感器 | 类器官模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、影像数据 | 未明确 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-08-16 |
Multi-omics uncovers the critical role of ceramide-mediated Acinetobacter growth suppression in pressure injury healing under aging and malnutrition
2026-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2026.101587
PMID:42598458
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了衰老和营养不良双重干预下,神经酰胺介导的醋杆菌生长抑制在压疮愈合中的关键作用 | 首次发现神经酰胺-花生四烯酸-自噬/WNT轴在衰老和营养不良条件下调节压疮愈合的新的分子机制,并证明神经酰胺补充可促进老年人伤口愈合 | 摘要未明确提及研究局限性 | 阐明衰老和营养不良对压疮愈合的影响及其分子机制 | 衰老和营养不良干预下的压疮伤口模型,包括皮肤微生物组、代谢组和转录组数据 | 数字病理学 | 压疮 | 16S rRNA测序、血清和皮肤代谢组学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 随机森林 | 微生物组、代谢组、转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 16S rRNA测序、代谢组学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2026-08-16 |
A multi-omics analysis of a succinylation-associated gene-expression signature in clear cell renal cell carcinoma: prognostic significance and the immune-metabolic microenvironment
2026-Aug, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-026-01785-5
PMID:42257998
|
研究论文 | 通过多组学分析,研究了透明细胞肾细胞癌中琥珀酰化相关基因表达特征的预后意义及免疫代谢微环境 | 首次构建了基于20基因组的琥珀酰化相关转录评分,并结合单细胞和空间转录组学分析其在肿瘤细胞中的定位,揭示了低评分肿瘤的免疫热表型特征 | 基于文献策划的20基因面板可能未完全覆盖所有琥珀酰化相关基因,且计算药物敏感性分析仅为探索性关联,需进一步验证 | 表征琥珀酰化相关转录特征及其在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤组织和正常组织样本 | 机器学习和数字病理 | 透明细胞肾细胞癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA-KIRC(约530例)、E-MTAB-1980(约101例)、CPTAC(约100例),以及其他验证队列 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 415 | 2026-08-16 |
Extracellular cyclophilin A promotes B-cell acute lymphoblastic leukemia progression via MC2R
2026-Aug, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00466-w
PMID:42271089
|
研究论文 | 研究表明细胞外亲环蛋白A通过结合MC2R受体激活下游信号通路,促进B细胞急性淋巴细胞白血病进展,并可作为潜在治疗靶点 | 首次揭示细胞外亲环蛋白A在B-ALL中的促癌机制,通过MC2R受体激活cAMP-PKA-CREB通路,调控CD44、FN1和MMP9表达,并验证了抗CypA抗体的治疗潜力 | 抗CypA抗体仅能适度降低白血病负担,且研究主要在异种移植小鼠模型中进行,临床效果需进一步验证 | 探究细胞外亲环蛋白A在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的作用机制,并评估其作为治疗靶点的可行性 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者样本、NALM6细胞系、小鼠异种移植模型和患者来源的异种移植模型 | 分子生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序 | 异种移植小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明患者样本数量,小鼠模型包括NALM6异种移植和患者来源异种移植 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2026-08-15 |
Integrated scRNA-Seq and ATAC-Seq Decipher the Xylem Development Atlas and Regulatory Landscape in Rubber Tree (Hevea brasiliensis)
2026-Aug-14, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70815
PMID:42596858
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和ATAC测序构建橡胶树木质部发育图谱及调控网络,揭示不同生长速率品种间的细胞异质性和转录调控差异 | 首次建立橡胶树分化中木质部的单细胞转录组图谱,并整合ATAC-seq揭示品种特异性的染色质可及性和转录因子结合基序,通过拟南芥突变体验证关键基因功能 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明橡胶树木质部分化过程中的细胞异质性和调控网络,为遗传改良提供资源和靶点 | 橡胶树两个品种(RK525和RY73397)的分化中木质部原生质体 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, ATAC-seq, WGCNA | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 | 两个橡胶树品种的木质部原生质体,具体细胞数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 417 | 2026-08-15 |
Clinical, genomic, and spatial transcriptomic features of pancreatic adenosquamous carcinoma support subtype-specific therapeutic strategies
2026-Aug-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2699
PMID:42599153
|
研究论文 | 本研究旨在表征胰腺腺鳞癌(ASQ)的临床结局、基因组景观和空间转录组结构,并与传统胰腺导管腺癌(PDAC)进行比较。 | 首次利用空间转录组学分析ASQ的肿瘤微环境,发现其免疫细胞共定位模式与PDAC不同,且鳞状区域富集EMT、炎症等通路,为亚型特异性治疗策略提供依据。 | 回顾性设计、单中心样本、空间转录组样本量小(n=11),可能影响结果的普遍性。 | 比较ASQ与PDAC的临床、分子和空间转录组特征,探索亚型特异性治疗策略。 | 胰腺腺鳞癌(ASQ)和胰腺导管腺癌(PDAC)患者的肿瘤样本。 | 数字病理学、空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学(Visium)、基因组分析(FoundationCore) | NA | 临床数据、基因组数据、空间转录组数据 | 178例ASQ患者(2013-2023)、244例ASQ和29,021例PDAC基因组数据、11例ASQ肿瘤样本(来自8例患者)和4例PDAC样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学分析 |
| 418 | 2026-08-15 |
Integrated population-based evidence, network toxicology, single-cell profiling, and in vitro studies elucidate mechanisms connecting PAHs to stroke
2026-Aug-13, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120654
PMID:42594829
|
研究论文 | 通过整合人群暴露分析、网络毒理学、转录组学、单细胞测序和体外实验,阐明多环芳烃暴露(以2-萘酚为代表)与卒中风险关联的潜在机制 | 首次结合多层次框架(人群流行病学、网络毒理学、单细胞测序和体外验证)来揭示多环芳烃代谢物2-NAP与卒中之间的细胞类型特异性机制,并确定LAMP2为关键靶点 | 研究主要依赖横断面数据,无法确证因果关系;PAH代谢物仅以2-NAP为代表,可能无法全面反映所有PAH暴露的影响;体外实验主要基于细胞模型,需进一步验证在体效果 | 探讨PAH暴露与卒中风险的关联,并揭示其分子机制和细胞类型特异性 | 人群样本、细胞系(内皮细胞、巨噬细胞、小胶质细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 网络毒理学、转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、体外实验 | 机器学习模型 | 人群数据、转录组数据、单细胞表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2026-08-15 |
ATP6AP2 dysregulation as a central hub in DMD pathogenesis: An integrated multi-omics and therapeutic study
2026-Aug-13, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117247
PMID:42594836
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了ATP6AP2在杜氏肌营养不良症发病机制中的核心作用,并验证了替莫唑胺的治疗潜力 | 首次通过单细胞RNA测序识别ATP6AP2为DMD中多种肌肉细胞类型的关键上调基因,并利用CMap分析发现替莫唑胺作为潜在治疗药物,通过体内外实验验证其通过调节ATP6AP2信号轴和抑制巨噬细胞介导的炎症反应来减轻肌营养不良病理 | 研究主要在mdx小鼠模型中进行,未在人类样本中验证;替莫唑胺的作用机制尚需进一步探索其临床适用性和长期安全性 | 阐明DMD中ATP6AP2失调的细胞驱动机制,并评估替莫唑胺作为新型免疫药理学治疗策略的潜力 | 杜氏肌营养不良症(DMD)小鼠模型(mdx和严重mdx小鼠)及相关的骨骼肌细胞类型,如内皮细胞、成纤维细胞和成肌细胞 | 多组学分析、单细胞转录组学、药物重定位 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、富集分析、连接图谱分析、转录组学、代谢组学、免疫荧光、Western blot | WGCNA、CMap | 单细胞转录组数据、转录组数据、代谢组数据、图像、蛋白表达数据 | 涉及mdx和严重mdx小鼠,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2026-08-15 |
Spatial transcriptomics reveals heterogeneity in rejection and recovery after heart transplantation
2026-Aug-13, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00855-x
PMID:42595796
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |