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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-08-16
Tissue-reactive zonation of mesenchymal-like phenotypes in human glioblastoma
2026-Aug-14, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过深度单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了人类胶质母细胞瘤中间充质样细胞状态的组织反应性区域分布特征 首次系统描述了胶质母细胞瘤中从肿瘤核心到正常皮层的间充质样细胞状态的空间组织,并发现间充质状态是恶性及非恶性细胞共有的可逆性组织反应状态 未提及 阐明胶质母细胞瘤中间充质样细胞状态的空间组织及其与微环境的关系 胶质母细胞瘤患者组织样本、类器官及非恶性星形胶质细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、荧光原位杂交、类器官培养 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 包含罕见胶质母细胞瘤病例及大型队列的标准切除样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 深单细胞RNA测序及888-plex EEL-FISH空间转录组学
382 2026-08-16
Myasthenia thymus reprograms class-switched B cells into BAFF-dependent survivors
2026-Aug-14, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、V(D)J重组分析和空间转录组学构建了最大的重症肌无力图谱,揭示了胸腺中类别转换B细胞重编程为依赖BAFF存活的机制,绕过了经典的耐受检查点。 首次通过最大规模的多组学数据揭示重症肌无力中耐受检查点交换机制,发现BAFF-BCMA轴作为潜在治疗靶点和疾病活动生物标志物。 未提及具体局限性,可能包括样本来源单一或验证不足。 探究重症肌无力中胸腺B细胞如何获得生存机制绕过耐受检查点,导致自身抗体持续产生,并寻找治疗靶点和生物标志物。 重症肌无力患者的胸腺B细胞和T滤泡辅助细胞。 数字病理学 重症肌无力 单细胞RNA测序、V(D)J重组分析、空间转录组学 NA 单细胞转录组、空间转录组、V(D)J序列 237,661个细胞 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
383 2026-08-16
Dynamic subpopulations and spatial interactions of hepatic stellate cells and cancer-associated fibroblasts in liver cancer
2026-Aug-14, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1
综述 本文综述了肝星状细胞和癌症相关成纤维细胞在肝癌中的动态亚群、空间相互作用及其在肿瘤微环境中的功能和治疗意义 系统总结了HSC和CAF亚群的异质性、状态转换及其驱动的信号,并利用空间转录组学和蛋白质组学揭示了它们在肝癌组织中的空间分布和细胞间相互作用,提出针对这些细胞克服免疫治疗耐药的潜在新策略 未提及具体局限性 总结HSC和CAF在肝癌中的异质性、功能、状态转换及空间相互作用,为克服免疫检查点抑制剂耐药和开发新的治疗靶点提供思路 肝星状细胞和癌症相关成纤维细胞及其在肝癌肿瘤微环境中的相互作用 数字病理学 肝癌 单细胞测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
384 2026-08-16
DLST drives lung adenocarcinoma progression by modulating cuproptosis-related copper homeostasis and apoptosis via an EP300-dependent mechanism
2026-Aug-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨DLST在肺腺癌进展中的作用,发现其通过EP300依赖机制调节铜死亡和凋亡,促进肿瘤生长 首次揭示DLST通过EP300-DLST-DLD轴调节铜死亡和凋亡,促进肺腺癌进展,为治疗提供新靶点 未提供具体实验样本量和临床样本验证,机制研究主要在细胞系和动物模型中进行 阐明DLST在肺腺癌中的作用及其分子机制,探索潜在治疗靶点 肺腺癌组织样本、LUAD细胞系、体内肿瘤模型 机器学习和生物信息学 肺腺癌 RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫共沉淀、蛋白质印迹、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞数据 TCGA和GEO数据集,具体样本数未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
385 2026-08-16
Application of dual-view oblique plane microscopy to small-molecule compound screening across 3D glioblastoma stem cell spheroids with single-cell resolution
2026-Aug-14, SLAS discovery : advancing life sciences R & D IF:2.7Q2
研究论文 本文展示了一种紧凑、低成本的轻片荧光显微镜平台——双视角倾斜平面显微镜(dOPM)在三维胶质母细胞瘤干细胞球体中进行小分子化合物筛选的能力,具有单细胞分辨率。 首次将dOPM应用于三维模型的高内涵筛选,提供单细胞级别的定量分析,且成本低、体积小,能够捕获多球体异质性,这是传统高内涵系统难以实现的。 dOPM平台仍处于开源发展阶段,可能需要进一步优化以提高稳定性和自动化程度,且其在高通量筛选中的表现仍需在更大规模化合物库中验证。 评估并验证dOPM在三维胶质母细胞瘤干细胞球体模型中进行高内涵小分子化合物筛选的可行性,以实现单细胞分辨率的药物反应分析。 表达FUCCI细胞周期报告基因的三维胶质母细胞瘤干细胞球体,以及96孔板格式中的多个球体。 计算机视觉 胶质母细胞瘤 荧光显微镜 NA 图像 96孔板中的多个三维胶质母细胞瘤干细胞球体 NA NA dOPM 双视角倾斜平面显微镜(dOPM)平台
386 2026-08-16
A sensitive method for profiling cell-type-specific secretomes of rare cells from complex tissues
2026-Aug-14, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文介绍了一种敏感的方法,用于从复杂组织中分析稀有细胞的细胞类型特异性分泌蛋白组,并通过小鼠模型成功应用于肝脏Kupffer巨噬细胞和气道微皱褶细胞。 该方法无需病毒载体即可从生理相关的低丰度细胞中分析分泌蛋白组,灵敏度高,能捕获scRNA-seq未检测到的细胞特异性蛋白,并已向社区开放小鼠模型。 摘要中未明确提及局限性。 开发一种敏感的方法,用于分析复杂组织中稀有细胞的细胞类型特异性分泌蛋白组,以促进细胞间通讯、分泌蛋白功能和生物标志物发现的研究。 稀有免疫细胞类型,包括肝脏中的Kupffer巨噬细胞和气道分化的微皱褶(M)细胞。 蛋白质组学 NA 分泌蛋白组分析(secretome profiling) 小鼠模型 蛋白质组学数据 NA NA NA NA NA
387 2026-08-16
A categorization of spatial transcriptomics methods for cell-cell communication analysis
2026-Aug-14, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1
综述 本文综述了33种用于细胞间通讯分析的空间转录组学方法,并将其分为三类,为研究者提供方法选择指南。 对空间转录组学细胞间通讯推断方法进行了系统分类,并提供了基于分析目标的方法选择指南。 未明确指出局限性,可能包括方法选择的主观性、综述范围的限制等。 为空间转录组学中的细胞间通讯推断方法提供结构化分类和选择指南。 33种空间转录组学细胞间通讯推断方法。 生物信息学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 33种方法 NA 空间转录组学 NA NA
388 2026-08-16
SpatialVista as a unified ecosystem for high-performance visualization and exploration of 3D spatial transcriptomics data
2026-Aug-14, Nature genetics IF:31.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
389 2026-08-16
Spatial analysis of head and neck cancer identifies two ecosystems with distinct modes of epithelial-to-mesenchymal transition
2026-Aug-14, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过空间转录组学分析头颈癌,识别出两种具有不同上皮-间质转化模式的空间生态系统 首次在头颈鳞状细胞癌中识别出两种不同空间结构的p-EMT模式(边缘型和核心型),分别由TGFβ和抑癌蛋白M诱导,且在不同肿瘤样本中保持一致,揭示肿瘤微环境中的不同相互作用汇聚于相似的p-EMT表型 样本量有限(n=26),且未进行功能验证实验来证实所提出的机制 探究头颈鳞状细胞癌中肿瘤空间结构及其与上皮-间质转化的关系 头颈鳞状细胞癌肿瘤组织(HPV阳性和HPV阴性) 空间转录组学 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 26例头颈鳞状细胞癌肿瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
390 2026-08-16
Integrative multi-omics analysis identifies SMIM24 as a favorable prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma
2026-Aug-13, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 综合多组学分析确定SMIM24为透明细胞肾细胞癌的有利预后生物标志物 基于去透明细胞分化(DCCD)肿瘤状态构建五基因预后特征,并鉴定SMIM24作为候选抑癌因子,通过抑制STAT3信号通路降低PD-L1表达 未明确提及 将DCCD相关生物学转化为预后框架,并探究其分子基础 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤样本及细胞系 数字病理学 肾细胞癌 RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组, 蛋白质组学 Cox回归 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 空间转录组数据 TCGA-KIRC训练队列,多个公共和机构验证队列,未明确样本数量 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组, 蛋白质组学 NA NA
391 2026-08-16
Single-cell analysis of Powassan virus-infected brains reveals age-dependent neuroinflammatory crosstalk and progressive Alzheimer's-like APP/Aβ accumulation
2026-Aug-12, mBio IF:5.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序分析波瓦桑病毒感染年轻和老年小鼠大脑的细胞反应,揭示了年龄依赖性神经炎症串扰和进行性阿尔茨海默样APP/Aβ积累 首次通过单细胞测序揭示波瓦桑病毒在不同年龄小鼠中引发不同的神经炎症反应和阿尔茨海默样病理变化,并发现病毒清除后APP/Aβ积累持续存在 该研究主要基于小鼠模型,需要进一步验证在人类患者中的相关性;且未深入探讨具体的分子机制 阐明波瓦桑病毒导致年龄依赖性致死和幸存者长期神经后遗症的机制 波瓦桑病毒感染的小鼠大脑组织细胞 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 年轻(10周龄)和老年(50周龄)C57BL/6小鼠,具体数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
392 2026-08-16
Paradoxical Th1 activation and CTLA-4 regulation is beneficial during latent cryptococcosis
2026-Aug-12, mBio IF:5.1Q1
研究论文 利用小鼠吸入感染模型和单细胞RNA测序,研究了潜伏性隐球菌病中CD4 T细胞的异质性反应,发现Th1样细胞和CTLA-4上调对控制感染有益。 首次通过单细胞RNA测序揭示了潜伏性隐球菌感染中CD4 T细胞反应的异质性和二分性,并证明CTLA-4上调通过抑制有害的Th2激活来支持Th1控制感染。 本研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类潜伏性隐球菌病的复杂性。 探究潜伏性隐球菌感染中CD4 T细胞反应的异质性及其调控机制。 小鼠肺部的CD4 T细胞。 单细胞转录组学 隐球菌病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型,具体样本数量未在标题和摘要中说明。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
393 2026-08-16
Gestational Hypoxia Disrupts Medial Ganglionic Eminence Progenitor Dynamics and Interneuron Development in Schizophrenia
2026-Aug-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过患者来源的MGE类器官和妊娠期缺氧小鼠模型,揭示了氧化还原失调如何破坏GABA能中间神经元发育,并验证了N-乙酰半胱氨酸的挽救效果 首次将精神分裂症患者来源的MGE类器官与妊娠期缺氧小鼠模型结合,通过单细胞转录组学揭示氧化还原失调直接损害GABA能回路组装,并证明母体NAC治疗具有转化潜力 受限于类器官和动物模型的固有局限性,可能无法完全复制人类精神分裂症的复杂病理生理,且NAC治疗的临床转化仍需进一步验证 阐明妊娠期缺氧通过氧化还原失调影响中间神经元发育的机制,并评估抗氧化治疗作为缓解神经发育风险的策略 首发精神分裂症患者来源的MGE类器官和妊娠期缺氧小鼠模型 神经科学,单细胞转录组学 精神分裂症 单细胞转录组学,类器官培养,小鼠模型 类器官模型,小鼠模型 单细胞转录组数据,行为学数据,突触超微结构数据 未明确提及患者样本数量,涉及MGE类器官和妊娠期缺氧小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
394 2026-08-16
Endothelial miR-15a/16-1 Regulation of SYNE1 Mediates Structural and Functional Recovery after Traumatic Brain Injury
2026-Aug-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 该研究揭示内皮细胞中miR-15a/16-1通过靶向SYNE1调控创伤性脑损伤后血脑屏障修复和神经功能恢复的机制 首次发现miR-15a/16-1-SYNE1轴在内皮细胞中介导创伤性脑损伤后的神经修复作用,并通过体内外实验及人类单细胞数据验证 摘要未提及研究局限性 阐明内皮细胞miR-15a/16-1在创伤性脑损伤后长期结构性和功能性恢复中的作用机制 小鼠内皮细胞及人类创伤性脑损伤组织 分子生物学 创伤性脑损伤 转录组测序, 单细胞RNA测序, 荧光素酶报告基因检测 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 小鼠模型及人类创伤性脑损伤组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 人类创伤性脑损伤组织的单细胞RNA测序
395 2026-08-16
A single-donor proof-of-concept single-cell analysis maps heterogeneous differentiation trajectories toward cartilage-like states in human urine-derived stem cells
2026-Aug-12, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能分化实验,绘制了人类尿液来源干细胞向软骨样状态分化的异质性轨迹图谱 首次在单细胞分辨率下结合伪时间轨迹分析和人类软骨参考图谱,揭示了尿液来源干细胞分化过程中存在一个与CDH1表达相关的候选瞬时转录状态及多条异质性分化轨迹 研究仅使用单一供体的细胞,结果具有假设生成性质,需要多供体验证;精细的伪时间排序对分析选择敏感,只能定性解释 表征尿液来源干细胞在软骨分化过程中的细胞异质性和转录动态,为未来多供体验证和转化应用提供单细胞框架 人类尿液来源干细胞及其在体外分化过程中的细胞异质性 单细胞转录组学 软骨再生 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、标记转移 轨迹推断模型 单细胞转录组数据 单一供体的尿液来源干细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
396 2026-08-16
Platelet heterogeneity in ageing and cancer: A single-cell atlas reveals transcriptional state-specific associations with metastasis
2026-Aug-11, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠血小板在衰老和癌症条件下的转录异质性,并揭示与转移相关的特定转录状态 首次大规模构建血小板单细胞转录组图谱,识别出四种保守的功能状态,并发现与衰老相关转移相关的Tpm2-high状态及PF4基因治疗的新关联 研究基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;未提供功能验证实验 阐明血小板在衰老和癌症中的功能异质性及其在转移中的作用 小鼠血小板 单细胞转录组学 癌症(转移) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 28,192个血小板,来自健康、衰老、转移和治疗小鼠 BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody平台
397 2026-08-16
A HEK293T-derived explainable CatBoost signature for estimating HCoV-OC43 viral burden from host transcriptomes
2026-Aug-10, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 该研究开发了一种基于单细胞RNA测序数据的CatBoost回归模型,用于预测HCoV-OC43病毒感染负荷,并识别核心宿主基因及其作用方向。 利用CatBoost的特征重要性指标和SHAP值,从单细胞转录组中识别出10个核心宿主基因,构建了可解释的紧凑模型,并在独立数据集上验证了其预测性能,展示了区分病毒感染与通用应激的能力。 HCoV-OC43作为模型仅能有限模拟广义β冠状病毒宿主程序,不能直接替代SARS-CoV-2,且模型在真实感染场景中的泛化性可能需要更多验证。 开发一种可解释的转录组特征,用于从宿主转录组中估计HCoV-OC43病毒负荷,并识别核心预测基因。 HEK293T细胞、MRC-5肺成纤维细胞和K562细胞。 机器学习 病毒感染(HCoV-OC43) 单细胞RNA测序、批量RNA测序 CatBoost回归模型 基因表达数据(单细胞和批量) 12,980个HEK293T细胞用于训练,2,598个细胞用于测试,5个时间点的MRC-5细胞批量数据,以及K562细胞应激数据集 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
398 2026-08-16
Sparse integrative dictionary learning resolves conserved drug-response states in multiple myeloma (MM)
2026-Aug-08, Cancer genetics IF:1.4Q4
研究论文 开发了PRISM-MM可解释稀疏集成字典学习框架,用于解析多发性骨髓瘤中多种药物处理共有的转录响应程序 首次将配对单细胞RNA测序作为校准层集成到稀疏字典学习框架中,以保留细胞状态级可解释性,并识别跨药物、跨研究的保守药物响应程序 摘要未提及明确的局限性 鉴定多发性骨髓瘤中不同药物处理间共有的转录适应程序,并生成关于治疗适应的机制性假设 多发性骨髓瘤细胞及其药物处理前后的转录组变化 机器学习 多发性骨髓瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序 稀疏集成字典学习 基因表达数据 多研究多发性骨髓瘤扰动数据集(具体样本数未在摘要中说明)以及外部配对单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
399 2026-08-16
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies a novel senescent fibroblast subtype associated with poor prognosis in acral melanoma
2026-Aug-06, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过整合单细胞和批量转录组分析,识别出肢端黑色素瘤中与不良预后相关的新型衰老成纤维细胞亚型 首次在肢端黑色素瘤中鉴定出衰老成纤维细胞亚型sCAF_CDKN2A,并揭示其通过MIF信号与Tregs相互作用形成免疫抑制网络,建立了基于转录因子的预后模型 主要依赖公共数据库数据,样本量有限,缺乏功能实验验证;mIHC验证仅限于蛋白水平,未进行单细胞水平验证 解析肢端黑色素瘤的肿瘤微环境异质性,并建立基于关键细胞亚群的预后模型 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织样本 数字病理学 肢端黑色素瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多重免疫组化 无监督聚类、CellChat、Scissor、Kaplan-Meier分析 基因表达数据、图像 未明确说明具体样本量,仅提及来自GEO和TCGA的数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
400 2026-08-16
Unveiling the power of TIIC: A prognostic tool for esophageal adenocarcinoma
2026-Aug-05, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,开发了一种基于肿瘤浸润免疫细胞的TIIC-Score预后工具,用于食管腺癌的风险分层和免疫治疗反应预测。 首次通过结合组织特异性指数计算和多种机器学习算法,构建了优化的TIIC-Score,并证明其预后价值优于22种已发表模型,同时结合孟德尔随机化揭示遗传关联。 研究主要依赖公开数据库,缺乏前瞻性临床验证;功能验证仅限于细胞系,未进行体内实验。 开发一种基于肿瘤浸润免疫细胞的预后工具,用于食管腺癌的风险分层和免疫治疗反应预测。 食管腺癌患者样本及食管癌细胞系,包括来自TCGA和GEO数据库的转录组数据。 数字病理学 食管腺癌 单细胞RNA测序、批量转录组测序、机器学习特征选择、孟德尔随机化 Cox比例风险模型、随机森林、支持向量机等 基因组数据(RNA-seq)、临床数据、细胞系数据 涉及多个队列,包括TCGA和GEO数据库样本,具体数量未提及,以及食管癌细胞系的功能实验。 未提及 单细胞RNA-seq 未提及 未提及
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