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当前共找到 80 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-15 |
Spatial omics of immunity: Mapping cellular landscapes in tissue microenvironments
2026-Aug, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2026.102790
PMID:42229080
|
综述 | 本文综述了用于解析肿瘤微环境中免疫细胞空间组织的多种空间组学技术 | 系统总结了高分辨率空间转录组学和蛋白质组学技术在组织免疫研究中的最新进展，包括计算工具创新及可视化数据解读方法 | 当前空间分子分析技术在分辨率和分析复杂性上存在技术限制，且跨平台数据缺乏标准化影响结果的可重复性和可比性 | 旨在通过空间分子图谱技术深入理解肿瘤微环境中的免疫细胞组织、功能及细胞间相互作用 | 肿瘤微环境中的免疫细胞及其空间组织、细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤微环境相关疾病（泛癌种） | 空间转录组学、空间蛋白质组学、多组学整合分析 | NA | RNA表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-07-13 |
Molecular Characterization and Immune Modulation of Schwann Cells in Vestibular Schwannoma
2026-08, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70179
PMID:42226390
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序全面探究前庭神经鞘瘤中雪旺细胞的分子特征及其在肿瘤微环境中的潜在免疫调控作用 | 识别了一个新型雪旺细胞亚群Schwann 4，该亚群显著表达MHC II类分子并富集PI3K信号、黏着斑和细胞黏附相关通路，揭示了其在肿瘤免疫调节中的潜在作用 | 候选药物如前庭神经鞘瘤的适用性需要专门验证 | 探究前庭神经鞘瘤中雪旺细胞的分子特征及其免疫调控功能 | 前庭神经鞘瘤中的雪旺细胞 | 机器学习 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-07-13 |
Early Developmental Neuronal Activity Impacts Oligodendrocyte Differentiation Through AMPA Receptors
2026-08, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70157
PMID:42334020
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研究论文 | 本研究探讨早期发育中谷氨酸能神经元活动如何通过AMPAR信号调控少突胶质细胞的分化和成熟 | 首次揭示在髓鞘形成前的早期大脑发育阶段，神经元活动减少反而促进少突胶质细胞分化，这与成熟大脑中的机制相反 | 未明确AMPAR信号在分化起始与成熟步骤中的具体分子机制，且研究仅限于小鼠模型 | 阐明早期脑发育中神经元活动对少突胶质细胞成熟的影响及其分子机制 | 小鼠嗅觉系统、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞前体细胞和少突胶质细胞 | 神经科学， 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序， 体内化学遗传学， 离体皮质切片培养 | NA | 基因表达数据 | NA（涉及小鼠模型，未明确具体数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 24 | 2026-07-10 |
The rituximab paradox in rheumatoid arthritis: Re-evaluating B-cell depletion depth and the synovial microenvironment
2026-Aug, Autoimmunity reviews
IF:9.2Q1
DOI:10.1016/j.autrev.2026.104089
PMID:42162633
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research paper | 重新评估类风湿关节炎中B细胞耗竭深度与滑膜微环境，解释利妥昔单抗临床悖论 | 提出类风湿关节炎治疗无需完全系统性B细胞清除，通过单细胞转录组学与纵向数据整合揭示“不完全耗竭”在维持组织免疫安全边际中的作用 | NA | 解释利妥昔单抗在类风湿关节炎中临床疗效与B细胞耗竭深度不一致的悖论，并提出未来治疗范式 | 类风湿关节炎患者及滑膜组织中的致病性B细胞-成纤维细胞相互作用 | machine learning, digital pathology | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、纵向临床数据 | 来自REDO试验的纵向数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-07-08 |
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Aug, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3679727
PMID:41945837
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研究论文 | 提出一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架，用于直接分解多维不规则张量数据（即 ragged tensor） | 首次引入二元加权张量模型描述ragged tensor的有效域，利用CP因子行与有效元素间的关联将全局目标解耦为独立、良态的子问题，并设计基于近邻交替最小化的闭式稳定更新算法，理论收敛有保障 | 未明确说明，需进一步阅读全文 | 发展能够处理多维不规则索引模式（ragged tensor）的张量分解方法 | 多光谱、高光谱图像以及空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 张量分解 | CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 | 图像、空间转录组数据 | 多个挑战性数据集（具体数量未详述） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-07-08 |
Fusobacterium nucleatum-Derived Outer Membrane Vesicles Disrupt Epithelial Barrier in Oral Lichen Planus via JNK/c-JUN Mediated Claudin-4 Downregulation
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109526
PMID:42048970
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研究论文 | 本研究揭示具核梭杆菌外膜囊泡通过JNK/c-JUN通路下调Claudin-4破坏口腔扁平苔藓上皮屏障 | 首次发现具核梭杆菌外膜囊泡通过激活JNK/c-JUN信号通路下调Claudin-4，揭示微生物驱动口腔扁平苔藓上皮屏障破坏的新机制 | 未开展体内动物模型验证实验，且主要基于体外细胞系研究，临床相关性需进一步验证 | 探究具核梭杆菌外膜囊泡在口腔扁平苔藓上皮屏障功能障碍中的作用机制 | 口腔扁平苔藓患者组织样本及HaCaT角质形成细胞 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RNA测序, qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 口腔扁平苔藓病变组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-07-08 |
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109577
PMID:42090950
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成，揭示其细胞异质性和独特亚群 | 首次在单细胞水平上比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组谱，发现了此前未表征的前体样亚群（簇9）共表达周细胞标志物和间充质基质细胞标志物，并识别出IGFBP3和IGFBP5在根尖乳头干细胞来源簇中特异性富集 | 基于培养细胞的转录相似性提出伪时间轨迹假设，而非验证性的谱系关系；需要后续使用NOTCH3+/PDGFRB+的前瞻性分离及体外体内功能验证来确认再生潜力 | 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成，检测其不同再生行为背后的亚群，并识别有助于未来分离和功能靶向的标志物 | 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞，培养至第2代 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 3名人类供体的根尖乳头和牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat包进行降维和聚类，统一流形逼近与投影可视化 |
| 28 | 2026-07-08 |
UPR-CEBPB-MIF Signaling Links to Macrophage Polarization and an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Aug, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-026-19598-x
PMID:41936685
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研究论文 | 该论文整合多组学数据，揭示了UPR-CEBPB-MIF信号轴与透明细胞肾细胞癌中巨噬细胞极化及免疫抑制性肿瘤微环境的关联 | 利用自编码器结合XGBoost鉴别UPR关键基因，并通过单细胞转录组分析映射UPR活性及免疫极化模式，首次阐明UPR-CEBPB-MIF信号轴在ccRCC免疫微环境中的作用 | 研究主要依赖公共数据库数据，需进一步实验验证信号轴的功能及临床转化潜力 | 解析UPR信号通路在ccRCC代谢重编程及免疫调控中的机制，并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤样本及细胞通信模式 | 机器学习 | 肾癌 | 多组学分析、单细胞转录组分析 | 自编码器、XGBoost、LASSO-Cox回归 | 基因表达数据、转录组数据 | 来自TCGA、GEO和ArrayExpress的多个队列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2026-07-08 |
Multi-Omics Integration Reveals the Genetic Mechanisms of Periodontitis and Predicts Therapeutic Drugs
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109678
PMID:42269280
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研究论文 | 该研究通过多组学整合分析揭示了牙周炎的遗传机制，并预测了潜在的治疗药物 | 首次整合GWAS、单细胞空间转录组学和单细胞RNA测序数据，利用人工智能驱动的药物筛选框架（DrugReflector）预测牙周炎的治疗化合物，并发现GNLY基因作为关键调控靶点 | 主要依赖公开数据集，药物预测结果需进一步的实验验证，且脑和肾脏组织的遗传富集机制仍需深入探索 | 系统解析牙周炎的遗传基础和关键调控因子，并预测潜在的治疗药物 | 牙周炎相关的遗传信号、免疫细胞亚群（单核细胞和自然杀伤细胞）及基因（如GNLY） | 数字病理学 | 牙周炎 | GWAS, 单细胞空间转录组学, 单细胞RNA-seq, Mendelian Randomization, 分子对接 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于Gene-Lifestyle Interactions in Dental Endpoints和FinnGen R11队列的GWAS摘要统计，以及单细胞空间转录组学和单细胞RNA测序数据，具体样本数量未明确 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序和空间转录组学平台，Illumina NovaSeq测序平台 |
| 30 | 2026-07-08 |
Mitochondrial Metabolic Biomarkers in Periodontitis: Discovery and Clinical Validation
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109682
PMID:42288013
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研究论文 | 通过综合生物信息学技术鉴定牙周炎中线粒体代谢相关生物标志物，并验证其诊断价值 | 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据及机器学习方法，鉴定并临床验证了与牙周炎相关的线粒体代谢生物标志物，并构建了高诊断效能的列线图 | 未明确提及，可能缺乏大规模前瞻性队列验证 | 识别牙周炎中线粒体代谢相关的关键生物标志物并评估其诊断潜力 | 牙周炎患者及大鼠模型 | 机器学习 | 牙周炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，反转录定量聚合酶链反应，免疫组织化学，Western blot分析 | 机器学习模型，列线图 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 临床样本（未明确数目）及大鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-07-05 |
Real-time transcriptomic profiling of hPSC-derived cartilage during development identifies a key role for the extracellular matrix in homeostasis and protection
2026-Aug-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205520
PMID:42396961
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研究论文 | 利用人类多能干细胞建立软骨发育模型，揭示细胞外基质在维持稳态和保护中的关键作用 | 通过实时转录组分析，首次精确确定人干细胞衍生软骨在发育过程中谱系限制的时间点 | 尚不明确 | 研究关节软骨细胞与生长板软骨细胞命运分化的机制及疾病中的异常变化 | 人类多能干细胞衍生的软骨组织 | 数字病理学 | 关节退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 尚不明确 | 转录组数据 | 尚不明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序平台 |
| 32 | 2026-07-03 |
The crosstalk between SPP1+ macrophages and follicular helper T cells promotes the immune disorder of Graves' disease
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110712
PMID:42128213
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示Graves病中SPP1+巨噬细胞与滤泡辅助性T细胞的相互作用促进免疫紊乱 | 首次在Graves病中通过单细胞和空间转录组学联合分析，发现SPP1+巨噬细胞与CXCL13+ Tfh细胞通过SPP1-CD44相互作用加重免疫微环境失调，并揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1和VEGF信号通路促进新生血管内皮细胞形成 | NA | 探究Graves病甲状腺组织中免疫细胞和空间基因表达模式的变化，以及SPP1+巨噬细胞在疾病免疫紊乱中的作用 | Graves病患者、缓解期患者和正常对照个体的甲状腺组织 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 单细胞转录组测序，空间转录组技术 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 对照个体、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-07-03 |
JAK-STAT3-MYC axis defines pathogenic stem cell-like memory CD4+ T cells in rheumatoid arthritis
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110733
PMID:42309459
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了类风湿关节炎患者CD4+ Tscm细胞中JAK-STAT3-MYC轴驱动致病性干细胞样记忆T细胞的作用 | 首次在类风湿关节炎Tscm细胞中鉴定出STAT3-MYC转录特征，并揭示其与治疗抵抗及疾病严重程度的相关性 | JAK抑制剂仅部分抑制STAT3活性，未完全阻断信号通路，MYC作为潜在治疗靶点需进一步验证 | 探究类风湿关节炎中CD4+ Tscm细胞的分子特征及其在慢性免疫激活中的致病机制 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的CD4+ Tscm细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的外周血Tscm细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于Tscm细胞转录组分析，同时结合蛋白质组学分析 |
| 34 | 2026-07-03 |
Multiomic Single-Cell Sequencing Identifies BCR::ABL1 as an Acquired Resistance Mechanism in FLT3+ AML
2026-Aug, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.70207
PMID:42046307
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研究论文 | 利用多组学单细胞测序识别FLT3阳性急性髓系白血病中BCR::ABL1作为获得性耐药机制 | 首次通过多组学单细胞DNA测序在单细胞分辨率下揭示BCR::ABL1获得作为FLT3-ITD AML患者对FLT3抑制剂耐药的克隆演化机制 | 基于单个病例的研究，结果可能需在更大样本中验证 | 阐明FLT3突变型AML中BCR::ABL1获得性耐药机制的克隆演化特征 | FLT3-ITD突变型急性髓系白血病患者 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 多组学单细胞DNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 1例FLT3-ITD AML患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-07-03 |
Cross-stage single-cell and spatial metabolome analyses reveal periderm specialization and tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza roots
2026-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71285
PMID:42169223
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研究论文 | 通过跨阶段单细胞和空间代谢组分析揭示丹参根周皮特化和丹参酮生物合成机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间代谢组学，构建丹参根从表皮到周皮的发育轨迹，鉴定与二萜生物合成相关的转录程序，并预测SmCYP76AK5参与丹参酮合成 | 未提及明确局限性 | 解析多年生根中周皮分化和次生代谢的细胞程序 | 丹参（Salvia miltiorrhiza）根在不同发育阶段的细胞类型组成和转录动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间代谢组数据 | 不同发育阶段的丹参根样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 36 | 2026-07-03 |
Chromatin and genomic instability in the cochlea contributing to age-related hearing loss: Insights from in vitro and in vivo models
2026-Aug, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2026.109691
PMID:42263393
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研究论文 | 通过体外和体内模型研究染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的贡献 | 结合多种体内外模型和单细胞RNA测序技术，首次揭示外毛细胞在衰老过程中染色质和基因组不稳定性的具体变化，并验证了ATRX基因的差异表达 | 具体限制未在标题和摘要中提及 | 探讨染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的作用机制 | 年龄相关性听力损失的小鼠模型（HEI-OC1细胞及Corti器、血管纹、螺旋神经节细胞）和转基因小鼠（tdTomato标记外毛细胞） | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-06-26 |
P2Y12 receptor in trigeminal ganglion contributes to CFA-induced mechanical allodynia in mice
2026-Aug-17, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 探究P2Y12受体在三叉神经节中对CFA诱导小鼠机械性异常疼痛的作用 | 首次揭示P2Y12受体在三叉神经节卫星胶质细胞和巨噬细胞上的表达上调在口面部炎性疼痛中通过神经免疫调节发挥关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，未涉及人类样本验证，且未深入探讨P2Y12受体信号通路的具体下游分子机制 | 研究P2Y12受体信号通路在口面部炎性疼痛中的作用，特别是三叉神经节作为外周作用位点的机制 | 三叉神经节中的P2Y12受体、卫星胶质细胞和巨噬细胞 | 神经科学 | 口面部炎性疼痛 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、药理学抑制 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-06-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals the neuronal transcriptional differentiation program associated with ferroptosis-related heterogeneity in human hepatoblastoma
2026-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示人类肝母细胞瘤中铁死亡相关异质性的神经元转录分化程序 | 首次在单细胞水平上揭示肝母细胞瘤中神经元分化与铁死亡程序的关联，并发现ACSL4与铁死亡抑制因子共调节，TGFB2与谷氨酸受体及转录因子共表达 | 未提及具体局限性 | 研究肝母细胞瘤中铁死亡转录程序在肿瘤异质性中的作用，特别是与神经元分化的关系 | 人类肝母细胞瘤肿瘤样本、正常肝脏样本及患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立队列（GSE131329和GSE104766）的批量转录组数据，及一个单细胞RNA测序数据（GSE180665） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-06-26 |
scDCL: A multi-view single-cell RNA sequencing clustering method based on dual contrastive learning
2026-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出基于双对比学习的多视图单细胞RNA测序聚类方法scDCL，用于更好地解析细胞异质性 | 首次将ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习协同集成，同时捕获细胞内在特征和全局结构特征，并通过双对比损失优化聚类效果 | 未提及具体数据集大小和计算资源需求，可能对大型数据集存在扩展性挑战 | 开发一种新的单细胞RNA测序聚类方法，解决数据高稀疏性、强非线性和极端维度带来的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ZINB掩码自编码器（ZINB-MAE）、图神经网络（GNN）、双对比学习 | 基因表达数据（单细胞RNA测序） | 未在标题和摘要中明确给出 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-06-26 |
Adipose tissue microvasculature is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Aug-01, AIDS (London, England)
DOI:10.1097/QAD.0000000000004491
PMID:41873969
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研究论文 | 研究了接受现代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的皮下脂肪组织微血管系统与胰岛素抵抗和脂质组改变之间的关联 | 首次在HIV感染者中揭示脂肪组织微血管重塑（毛细血管内皮减少及关键脂质转运受体表达下降）与胰岛素抵抗相关的脂质组特征的联系 | 样本量相对较小（n=127，其中单细胞RNA测序n=59），且为横断面观察性研究，无法确定因果关系 | 探究HIV感染者中皮下脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质谱 | 长期接受抗逆转录病毒治疗且病毒学抑制的HIV感染者 | 机器学习和生物信息学 | HIV相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序、未靶向血浆脂质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据和脂质组学数据 | 127名参与者（其中59名进行了单细胞RNA测序） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |