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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2026-09-20 |
VIDEO-Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: a tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2026-08-05, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag117
PMID:42114111
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研究论文 | 本文介绍了一个名为VIDEO的基于网页的分析工具，用于整合和可视化果蝇组织特异性差异表达基因的近端增强子中的转录因子结合基序、染色质可及性和转录因子结合数据 | 开发了VIDEO工具，能够交互式地探索和可视化转录因子结合基序与转录活性和染色质可及性在组织特异性背景下的交集，并允许同时可视化ATAC-seq确定的活性染色质和ChIP-seq的DNA结合数据 | 该工具目前仅针对果蝇（Drosophila）设计，可能无法直接应用于其他模式生物或人类研究 | 开发一个整合和可视化果蝇增强子组织中转录因子结合基序、染色质可及性和转录因子结合数据的工具，以促进基因调控研究 | 果蝇（Drosophila melanogaster）的组织特异性差异表达基因及其近端增强子 | 机器学习 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, scRNA-seq | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, bulk ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-09-20 |
ADAM8 mediates eosinophil and neutrophil infiltration and tissue remodeling in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.04.005
PMID:42031098
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA测序、单细胞RNA测序再分析和组织学分析，结合体外和体内实验，揭示了ADAM8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中介导嗜酸性粒细胞和中性粒细胞浸润及组织重塑的作用 | 首次系统阐明ADAM8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中作为炎症细胞浸润和组织重塑的关键介质，并证明靶向ADAM8可跨不同CRSwNP亚型发挥治疗作用 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 阐明ADAM8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用及其潜在机制 | 人类鼻组织、人鼻上皮细胞系（HNEpC）、原代人鼻上皮细胞（HNECs）、小鼠CRSwNP模型 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、组织学分析 | NA | 图像、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-09-19 |
Integrated pan-cancer analysis reveals a cancer-associated fibroblast oxidative stress response signature predicting immunotherapy response and prognosis
2026-Aug-31, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02424-w
PMID:42671485
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研究论文 | 该研究通过整合泛癌单细胞RNA测序数据，构建了癌症相关成纤维细胞氧化应激反应特征（FOSR.Sig），用于预测免疫治疗反应和预后 | 首次基于泛癌单细胞RNA测序数据揭示癌症相关成纤维细胞具有最高的氧化应激反应评分，并构建了成纤维细胞来源的氧化应激相关特征（FOSR.Sig）用于预测ICI反应和预后 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建基于癌症相关成纤维细胞氧化应激反应的特征，用于预测肿瘤免疫治疗反应和患者预后 | 泛癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞、免疫检查点抑制剂治疗患者 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序,RNA-seq | LASSO回归,机器学习框架 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-09-19 |
A Single-Cell Transcriptional Landscape of Emphysema: Heterogeneous Cellular Dynamics in Centrilobular, Panlobular, and Paraseptal Subtypes
2026-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27177807
PMID:42737703
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研究论文 | 该研究对三种肺气肿亚型（小叶中心型、全小叶型和间隔旁型）的肺组织进行单细胞RNA测序，绘制了转录景观图谱，揭示了各亚型特异性的细胞和分子机制 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三种肺气肿亚型（CLE、PLE、PSE）的转录景观，揭示了各亚型特异性的细胞组成和转录特征，发现了CLE以气道起源炎症为主、PSE呈现纤维化样重塑表型、PLE为先天免疫激活和基质失调的中间状态 | 每种亚型仅纳入3例患者，样本量较小，可能无法充分代表各亚型的异质性；未包含正常对照样本进行对比分析 | 揭示小叶中心型肺气肿（CLE）、全小叶型肺气肿（PLE）和间隔旁型肺气肿（PSE）三种亚型特异性的细胞和分子致病机制 | 9例肺气肿患者的肺组织（每种亚型3例） | 数字病理学 | 肺气肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 9例患者肺组织样本，共84,704个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-09-19 |
The landscape mapping of single-cell sequencing in the research progression and hotspots of liver cancer based on systematical analysis
2026-Aug-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050022
PMID:42629669
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研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2017年至2024年3月间单细胞测序在肝癌研究中的应用进展和热点 | 首次系统性地通过文献计量学方法绘制了单细胞测序在肝癌研究中的知识图谱，揭示了研究趋势和热点 | 仅基于Web of Science Core Collection数据库，可能遗漏其他数据库的相关研究 | 旨在绘制单细胞测序在肝癌领域的研究水平、研究热点和进展趋势 | 2017年至2024年3月间发表的379篇关于肝癌和单细胞测序的文章 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 379篇文章 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2026-09-19 |
Exploring and validating hub genes associated with atopic dermatitis through weighted gene co-expression network analysis and machine learning
2026-Aug-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050369
PMID:42629711
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研究论文 | 本研究通过整合差异表达分析和加权基因共表达网络分析，结合LASSO和支持向量机递归特征消除两种机器学习方法，筛选并验证了与特应性皮炎相关的6个核心基因，并分析了其与免疫细胞浸润及单细胞表达模式的关系 | 首次综合运用WGCNA与两种机器学习算法（LASSO和SVM-RFE）从多个AD数据集中筛选核心基因，并结合CIBERSORT免疫浸润分析和单细胞RNA测序揭示核心基因在AD中的细胞特异性表达模式，通过独立队列验证了核心基因的表达失调 | 摘要中未明确说明研究的局限性，但基于常规生物信息学研究的特征，可能包括样本量有限、缺乏实验功能验证、单细胞数据来源和样本量未详细说明等 | 识别特应性皮炎的新型生物标志物并探究其致病机制 | 特应性皮炎相关的基因表达数据集及患者样本 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析, 功能富集分析 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据, 文本 | 7个AD相关数据集（来自GEO数据库）加上一个独立验证队列，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-09-19 |
STADiffuser: high-fidelity simulation and full-view 3D modeling of spatial transcriptomics
2026-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76829-1
PMID:42749702
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研究论文 | 提出STADiffuser，一种基于扩散模型的深度生成模型，用于空间转录组数据的高保真模拟和全视图3D建模 | 采用两阶段架构（图注意力自编码器学习spot嵌入+潜在扩散模型结合空间去噪网络），支持多样本和3D坐标，可扩展至百万级spot，实现对超过2000万spot的狨猴小脑图谱全视图3D建模 | 未明确提及 | 解决空间转录组技术成本高、数据稀疏、分辨率有限以及缺乏灵活高保真模拟器的问题 | 空间转录组数据，包括狨猴小脑图谱 | 机器学习, 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 扩散模型, 自编码器, 图注意力机制 | 空间转录组数据, 图像 | 狨猴小脑图谱超过2000万个spot | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2026-09-19 |
Hypoxia enhances follicle survival and ameliorates markers of metabolic function in human ovarian cortical tissue culture
2026-Aug-18, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2026.105918
PMID:42753296
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人卵巢皮质组织体外培养引起的基因表达和组织形态变化，并探讨了缺氧条件对代谢和卵泡存活的影响 | 首次利用单细胞转录组学系统表征人卵巢皮质组织体外培养诱导的细胞类型特异性转录变化，并证明缺氧培养可部分恢复代谢特征、改善卵泡存活 | 样本量较小（单细胞转录组学n=3，缺氧验证n=12），仅评估6天培养，未涉及长期培养或体内移植验证 | 探究人卵巢皮质组织6天体外培养对基因表达和组织形态的影响，并优化培养条件以减少培养诱导的变化 | 接受性别肯定手术或择期剖宫产供者的卵巢皮质组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、图像 | 研究1中新鲜和培养样本n=3；研究2中来自12名供者的组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-09-19 |
scE2TM improves single-cell embedding interpretability and reveals cellular perturbation signatures
2026-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76825-5
PMID:42744811
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研究论文 | 提出了一种外部知识引导的嵌入式主题模型scETM，用于可解释的单细胞RNA测序分析，提升细胞嵌入的可解释性并揭示细胞扰动特征 | 引入外部知识引导的嵌入式主题模型，通过嵌入聚类正则化鼓励每个主题表示不同的基因群，从而捕获独特的生物信息，并模拟主题扰动 | 未明确提及 | 解决单细胞RNA测序中计算方法的性能与生物学可解释性之间的平衡问题 | 单细胞RNA测序数据，包括干扰素刺激的外周血单核细胞和黑色素瘤数据集 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 嵌入式主题模型 | 文本（基因表达计数数据） | 20个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-09-19 |
Decoding the sequence determinants of locus-specific DNA methylation across human tissues
2026-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76744-5
PMID:42744826
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研究论文 | 该论文提出了Melody深度学习框架，从10-kb基因组序列预测DNA甲基化，并开发了Melody-G整合单细胞RNA-seq基础模型嵌入来推断未见过细胞类型的甲基化状态 | 引入Melody深度学习框架，能够从10-kb基因组序列预测DNA甲基化，整合局部和长程序列信号，在全染色体、低甲基化区域和细胞类型特异性基准上优于现有方法，并开发Melody-G整合单细胞RNA-seq基础模型嵌入推断未见过细胞类型的甲基化状态 | 未明确提及 | 研究DNA甲基化的序列决定因素，预测位点特异性DNA甲基化，并连接基因组序列和细胞状态到DNA甲基化 | 人类组织中的DNA甲基化 | 机器学习 | NA | 深度学习，单细胞RNA-seq | 深度学习框架 | 基因组序列，甲基化数据，转录组数据 | 39个人类组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-09-19 |
Single-cell landscape of immunological responses in CTLA4 haploinsufficiency patient after abatacept therapy
2026-Aug-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/94fa8r
PMID:42752352
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研究论文 | 该研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序，分析了CTLA4单倍剂量不足患者在接受阿巴西普治疗前后的外周血单个核细胞免疫应答图谱 | 首次利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序联合分析CTLA4单倍剂量不足患者在接受阿巴西普治疗前后的免疫细胞图谱，揭示了阿巴西普治疗可调节T细胞和B细胞亚群比例、减轻适应性及先天性免疫激活，并导致多种免疫细胞线粒体基因表达下调，提示代谢重编程效应 | 研究仅基于一例患者，样本量极小，结论的普遍性有限 | 探究阿巴西普治疗CTLA4单倍剂量不足的免疫应答机制 | CTLA4单倍剂量不足患者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 免疫失调综合征 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | 1例患者治疗前后的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 32 | 2026-09-16 |
Plant Spatio-Temporal Integration Network (PSTN): a framework for dynamic single-cell and spatial transcriptomics in fungal-plant interactions
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag637
PMID:42633556
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研究论文 | 该研究开发了植物时空整合网络（PSTN），用于在真菌与植物互作的动态过程中联合学习阶段特异性的单细胞到空间映射，并在水稻稻瘟病菌感染数据上验证了其优于现有方法的性能 | PSTN通过表达重构和双向最大相似度时序正则化，联合学习阶段特异性的细胞到空间映射，首次实现了跨阶段的时序耦合单细胞与空间转录组整合，而非独立分析各阶段 | 基因置换对照实验表明方法性能依赖正确的跨模态基因对应关系；独立基准验证仅限于小鼠皮层数据的静态重构组件，在植物-病原体动态系统中的泛化能力仍需进一步验证 | 解决现有单细胞RNA测序与空间转录组整合方法独立分析各阶段、忽略时序连续性的问题，实现动态宿主-病原体系统中的时序耦合单细胞与空间整合 | 水稻（受稻瘟病菌Magnaporthe oryzae感染的宿主）的单细胞RNA测序与空间转录组数据，以及小鼠皮层数据作为独立基准验证 | 机器学习 | 植物病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | PSTN（Plant Spatio-Temporal Integration Network） | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 水稻scRNA-seq和ST匹配数据，覆盖0、12和24小时三个时间点；4000个高变基因用于评估 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 33 | 2026-09-16 |
Benzene metabolite-targeted gene ATF7IP2 drives glutamate metabolic reprogramming to promote acute myeloid leukemia initiation
2026-Aug-22, Toxicology letters
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.toxlet.2026.113185
PMID:42632605
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序数据，发现苯代谢物靶向基因ATF7IP2通过重编程谷氨酸代谢驱动造血干细胞向白血病前体干细胞转化，从而促进急性髓系白血病发生，并验证了靶向该轴的抑制剂TCMCB07的治疗效果 | 首次通过整合双样本孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序鉴定出ATF7IP2为苯相关急性髓系白血病的关键驱动基因，揭示其作为转录代谢枢纽通过重编程谷氨酸代谢驱动HSC向pre-LSC恶性分化，并开发靶向该轴的肽模拟抑制剂TCMCB07 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别苯相关急性髓系白血病的关键驱动因子并阐明其致病机制 | 苯暴露相关的急性髓系白血病患者样本、细胞模型、小鼠模型 | 机器学习、数字病理学 | 急性髓系白血病 | 孟德尔随机化、转录组学、单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-09-16 |
IL-1A promotes inflammation while safeguarding epithelial basal cell identity and barrier function
2026-Aug-20, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.08.003
PMID:42624292
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序结合空间表征和功能分析，揭示了人类食管上皮祖细胞的异质性，并阐明了IL-1A在嗜酸性食管炎中协调上皮炎症与再生反应的分子机制 | 利用NGFR和P73定义了跨越乳头区和乳头间区的人类基底祖细胞层，揭示了乳头区基底祖细胞中YAP信号的空间异质性，发现了IL-1A介导的上皮顶端到基底信号轴，并证明IL-1A信号结局由周围炎症环境决定 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征人类食管上皮祖细胞异质性，鉴定调控嗜酸性食管炎中上皮再生的分子机制 | 人类食管上皮祖细胞、原代人食管类器官、嗜酸性食管炎患者样本 | 单细胞组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序、空间表征、类器官培养、气液界面培养 | NA | 单细胞转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-09-16 |
Spatially distinct macrophage subsets drive myofibroblast heterogeneity and maladaptive fibrosis in lupus nephritis
2026-Aug-13, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.07.014
PMID:42595656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了狼疮肾炎中巨噬细胞与成纤维细胞之间的空间异质性相互作用网络，并在小鼠模型中验证了其功能后果 | 首次在狼疮肾炎中识别出两种空间分布不同的肌成纤维细胞亚群（Myofib1位于肾小管间质，Myofib2位于肾小球），并揭示了它们分别与不同巨噬细胞亚群的相互作用模式，阐明了Spp1/整合素、Sema4/PlexinB和NAMPT/INSR等关键配体-受体信号通路介导的纤维炎症回路 | 空间转录组学仅纳入6例患者活检样本，样本量较小；机制验证主要基于小鼠模型，与人类疾病的完全转化性仍需进一步验证 | 探究人类狼疮肾炎中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的图谱，并在小鼠模型中验证这些发现，以寻找预防慢性肾脏损伤的治疗靶点 | 156例人类狼疮肾炎活检样本、30例健康对照以及6例狼疮肾炎患者的空间转录组学活检样本，并辅以小鼠模型体外共培养研究 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、体外共培养实验 | NA | 图像、文本 | 156例人类狼疮肾炎活检样本、30例健康对照、6例空间转录组学活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞捕获平台用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 36 | 2026-09-16 |
A microphysiological system HHT-on-a-chip platform recapitulates patient vascular lesions
2026-Aug-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76448-w
PMID:42722664
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研究论文 | 该研究开发了一种基于全人源细胞的微生理系统芯片平台，通过诱导性shRNA调控原代内皮细胞中的Alk1表达，再现遗传性出血性毛细血管扩张症患者的血管病变 | 首次构建了HHT-on-a-chip微生理系统，利用诱导性shRNA在原代内皮细胞中调控内源性Alk1，仅需亚群Alk1缺陷内皮细胞即可触发血管畸形，并通过单细胞转录组学揭示了微血管修剪和退化以及PDGFB缺失参与病变机制 | 未明确提及 | 构建能忠实再现HHT患者血管病变的芯片模型，以更好地理解HHT疾病生物学并筛选潜在新药 | 遗传性出血性毛细血管扩张症（HHT）患者血管病变，原代内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | 微生理系统芯片模型 | 图像 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-09-16 |
Immune Circuit Rewiring by HDAC Inhibition Enables Response to Dual Checkpoint Blockade in Metastatic Breast Cancer
2026-Aug-11, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-26-1086
PMID:42578817
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研究论文 | 结合实验、临床数据与理论模型，研究HDAC抑制剂entinostat联合抗PD-1和抗CTLA-4治疗转移性乳腺癌的肿瘤微环境重塑机制 | 通过知识引导的单细胞RNA测序亚聚类和细胞回路分析，识别了39种细胞状态及其显著相互作用，并结合空间蛋白质组学和流式细胞术验证，揭示B细胞在治疗响应中的必要性以及ICAM1和IFNγ通路的关键作用 | 研究主要基于小鼠乳腺至肺转移模型，人体样本验证规模有限，数学模型的预测能力需进一步实验验证 | 阐明HDAC抑制剂联合双重免疫检查点阻断治疗转移性乳腺癌的响应机制，为开发免疫治疗组合策略提供框架 | 转移性乳腺癌患者活检和血液样本，以及小鼠乳腺至肺转移模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 流式细胞术 | 数学建模 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | NA |
| 38 | 2026-09-16 |
Th17 effector cytokines induce shared and distinct microglial and endothelial cell responses in a mouse model for post-streptococcal encephalitis
2026-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76232-w
PMID:42717209
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研究论文 | 本研究利用小鼠遗传学、单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了A组链球菌感染如何通过Th17效应细胞因子诱导小胶质细胞和脑内皮细胞的共享及特异性反应，从而导致血脑屏障功能障碍和神经炎症 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学联合分析，揭示了GAS感染后小胶质细胞IL-17A-IL17RA信号通路在血脑屏障功能障碍和神经炎症中的潜在介导作用，并发现GAS响应性小胶质细胞定位于浸润性CD4 T细胞附近 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；GM-CSF缺失仅部分减少小胶质细胞趋化因子表达且未恢复血脑屏障完整性；IL-17A中和仅部分挽救血脑屏障转录变化而非功能障碍 | 探究外周A组链球菌感染与脑功能障碍之间的机制联系，特别是Th17效应细胞因子如何介导小胶质细胞和脑内皮细胞的反应 | 小鼠模型中的小胶质细胞、脑内皮细胞（BECs）、CD4 T细胞以及受影响的链球菌感染患者血清 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 神经免疫学 | 链球菌感染后脑炎, 神经精神障碍, 神经炎症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 39 | 2026-09-16 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2026-Aug, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析年轻和老年脓毒症小鼠骨髓免疫细胞的变化，揭示老年脓毒症免疫功能障碍的机制 | 首次在老年脓毒症中构建骨髓免疫细胞的单细胞图谱，发现HSC扩增及Lgals9-Cd44介导的细胞间通讯受损是免疫衰竭的关键机制，并验证激活该轴可部分恢复髓系细胞迁移 | 样本量较小（每组2-3只小鼠），Lgals9-Cd44轴的治疗潜力仅在临床前模型中初步验证，临床可行性和安全性尚待证实 | 探究衰老导致脓毒症免疫功能障碍的骨髓细胞机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个骨髓样本（Y-Sham n=2, Y-CLP n=3, A-Sham n=2, A-CLP n=3） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 40 | 2026-09-16 |
Integrative transcriptomics and scpagwas analysis predicts immune-related markers of preeclampsia
2026-08, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104935
PMID:42442143
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和bulk转录组数据，结合scPagwas分析，鉴定子痫前期胎盘中与免疫相关的关键基因和巨噬细胞调控机制 | 首次将scPagwas算法应用于子痫前期研究，整合单细胞和bulk转录组数据，发现巨噬细胞与子痫前期遗传关联最强，并鉴定出ARL4C、SLC16A10和DAB2三个核心基因作为巨噬细胞极化的关键调控因子 | 单细胞RNA测序样本量较小（n=4），需要在更大规模队列中验证核心基因和候选药物的临床价值 | 利用整合转录组学和scPagwas分析鉴定子痫前期胎盘中与免疫相关的标志物 | 子痫前期患者胎盘组织 | 机器学习 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | LASSO、随机森林 | 基因表达数据 | 单细胞RNA测序4例（GSE173193），bulk转录组157例（GSE75010） | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |