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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-08-19 |
Reduced Occludin expression in aortic endothelial cells mediates endothelial barrier dysfunction in aortic dissection
2026-Aug-14, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168417
PMID:42600953
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研究论文 | 本研究探讨了紧密连接蛋白Occludin在主动脉夹层发病机制中的作用，发现其下调导致内皮屏障功能障碍，是AD的起始因素 | 首次通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除小鼠模型，证实内皮细胞中Occludin下调直接引发主动脉夹层，并提出靶向Occludin的治疗策略 | 研究主要基于动物模型和体外实验，缺乏临床样本验证；且BAPN诱导的AD模型与人类AD的病理过程存在差异 | 阐明Occludin在主动脉夹层早期内皮屏障功能障碍中的因果作用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类升主动脉组织、小鼠主动脉组织、人主动脉内皮细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫组化、荧光素酶报告基因、腺相关病毒介导的基因过表达 | 条件性基因敲除小鼠、AAV介导的过表达小鼠 | 基因表达数据、组织病理图像、影像数据、体外通透性数据 | 人类样本数量不详；小鼠模型包括内皮特异性Ocln敲除和过表达组；体外使用HAECs | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 342 | 2026-08-19 |
Epigenetic modulation of stromal cell states underpins pathological tissue niches in Crohn's disease
2026-Aug-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02617-0
PMID:42587037
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研究论文 | 使用单细胞空间转录组学、RNA测序和ATAC测序技术，绘制克罗恩病肠道中18种基质细胞状态及其微环境图谱，揭示炎症成纤维细胞状态的表观遗传调控机制 | 首次在克罗恩病全层肠道组织中结合单细胞空间转录组、RNA-seq和ATAC-seq，鉴定18种基质细胞状态，并发现炎症成纤维细胞状态可通过组蛋白去乙酰化酶抑制剂逆转 | 未明确说明样本来源及患者数量，且未进行体内功能验证 | 探究克罗恩病中基质细胞状态的起源、表型稳定性及其表观遗传调控机制 | 克罗恩病患者全层肠道组织中的基质细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞空间转录组学、RNA-seq、ATAC-seq | NA | 单细胞基因表达数据、染色质开放数据、空间转录数据 | 约2,500,000个细胞 | NA | 单细胞空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 343 | 2026-08-19 |
[Role and mechanism of methyltransferase-like 3 in promoting macrophage NLRP3 inflammatory responses in medication-related osteonecrosis of the jaw]
2026-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建唑来膦酸诱导的颌骨坏死样病变小鼠免疫图谱，探讨METTL3在巨噬细胞NLRP3炎症反应中的作用和机制 | 首次在单细胞水平揭示METTL3作为关键表观遗传调控因子促进巨噬细胞NLRP3炎症反应，参与药物相关性颌骨坏死发病，并通过虚拟敲降分析预测关键基因 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究METTL3在药物相关性颌骨坏死中调控巨噬细胞炎症反应的作用和机制 | 唑来膦酸诱导的颌骨坏死样病变小鼠及巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 药物相关性颌骨坏死 | 单细胞RNA测序、免疫组化、蛋白质印迹 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、蛋白质表达数据 | 未明确样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2026-08-19 |
Age-Associated B Cells Contribute to Inflammation Via Antibody-Independent Mechanisms in Takayasu Arteritis
2026-Aug-04, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70284
PMID:42549483
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研究论文 | 本研究探讨了年龄相关B细胞在Takayasu动脉炎中通过抗体非依赖机制促进炎症的作用 | 首次揭示TAK中ABC分化与抗体分泌细胞生成解偶联，且ABC通过促炎功能而非抗体介导炎症 | 未明确提及主要局限，但样本量较小（如组织学n=5，临床随访n=4） | 研究TAK中B细胞激活途径及其对发病机制的贡献 | Takayasu动脉炎患者及系统性红斑狼疮患者的B细胞 | 免疫学 | Takayasu动脉炎 | 组织学分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、体外实验 | NA | 基因表达数据、流式细胞术数据、组织学图像 | 组织学n=5，流式细胞术n=125，bulk RNA-seq n=12，体外实验n=5，功能实验n=6，体外药物实验n=15，临床随访n=4 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2026-08-19 |
Follicular Lymphoma Transformation is Characterized by Cytokine-associated Remodeling of Stromal and Macrophage Compartments
2026-Aug-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1104
PMID:42550967
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研究论文 | 通过多模态研究95份滤泡性淋巴瘤及转化型滤泡性淋巴瘤样本，揭示转化过程中细胞因子相关的基质和巨噬细胞区室重塑 | 首次通过单细胞和 bulk RNA 测序、空间转录组学和蛋白质组学的多模态整合分析，系统描绘滤泡性淋巴瘤转化过程中肿瘤微环境的细胞互作和空间分布变化 | 样本量有限，且未提供转化前后配对样本的动态追踪，可能限制了因果关系推断 | 解析滤泡性淋巴瘤向侵袭性大细胞淋巴瘤转化过程中肿瘤与微环境细胞群的相互作用 | 95份滤泡性淋巴瘤和转化型滤泡性淋巴瘤样本，包含肿瘤细胞及微环境中的成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞等 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 95份滤泡性淋巴瘤和转化型滤泡性淋巴瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 346 | 2026-08-19 |
Mesenchymal Stromal Cell-Mediated Intercellular Communication: Mapping the Interactome for Skeletal Muscle Homeostasis and Regeneration
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507444
PMID:42210793
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研究论文 | 该研究采用系统级方法构建骨骼肌中纤维脂肪生成祖细胞的相互作用组图谱，结合单细胞RNA测序和计算分析，揭示间充质基质细胞介导的细胞间通讯网络，并通过实验验证其生物学相关性。 | 首次构建了稳态和再生骨骼肌中全面的FAP相互作用组，整合独特的单细胞RNA测序图谱和先进计算分析，识别新的信号通路，并通过FAP耗竭实验验证关键相互作用。 | 摘要未提及具体局限性，可能包括计算预测需要更多实验验证、样本规模和模型系统的限制等。 | 阐明骨骼肌中MSC（FAP）介导的细胞间通讯网络，以理解其在肌肉稳态和再生中的作用，并为治疗靶点提供模型。 | 间充质基质细胞（特别是骨骼肌中的纤维脂肪生成祖细胞）及其与骨骼肌中其他细胞群体的相互作用。 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2026-08-19 |
Targeting Spatiotemporal Heterogeneity of oncomiRNAs: A New Frontier in Cancer Therapy
2026-08, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70639
PMID:42571955
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综述 | 本文综述了oncomiRNAs的时空异质性在癌症治疗中的重要作用，探讨了空间转录组学、单细胞分析和液体活检等新技术如何揭示其动态调控，并强调了整合这些发现以推进精准肿瘤学策略的必要性 | 强调了从传统bulk组织分析向时空异质性研究的转变，整合空间转录组学、单细胞分析和液体活检技术，并结合人工智能和多组学数据整合来提升患者分层和预测建模 | 未提及具体局限性，但可能缺乏系统性多区域和纵向研究设计的具体案例和数据支持 | 全面理解oncomiRNAs的时空调控机制，以推进下一代癌症诊断和治疗，实现miRNA引导的、分期适应的精准癌症诊疗 | oncomiRNAs（作为肿瘤促进或抑制因子的miRNA亚群）及其在肿瘤组织中的时空异质性表达 | 数字病理学 | 癌症（泛癌种） | 空间转录组学、单细胞分析、液体活检 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞数据、液体活检数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞分析、液体活检 | NA | NA |
| 348 | 2026-08-18 |
LCN2-Driven Fibroblast Ferroptosis-Associated Injury Promotes Keratinocyte Proliferation via Lipid Peroxidation Signaling in Psoriasis
2026-Aug-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601892R
PMID:42603091
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型，揭示了银屑病中LCN2驱动的成纤维细胞铁死亡相关损伤通过脂质过氧化信号促进角质形成细胞增殖的机制 | 首次整合单细胞测序、代谢组学和功能实验，阐明成纤维细胞铁死亡在银屑病发病中的新作用，并确定LCN2和4-HNE作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类银屑病样本中验证 | 阐明银屑病中成纤维细胞铁死亡相关改变及其对角质形成细胞增殖的影响，探索潜在的治疗靶点 | 银屑病样皮肤病变中的真皮成纤维细胞、角质形成细胞、炎症性成纤维细胞亚群(iFb1) | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS代谢组学、体外实验、动物模型 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据、图像数据 | 使用咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型及细胞培养样本，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 349 | 2026-08-18 |
Optimizing cell segmentation and downstream processing for plant probe-based spatial transcriptomics
2026-Aug-17, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag403
PMID:42605584
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研究论文 | 本研究提出了一种针对植物探针空间转录组学的细胞分割及下游处理工作流程，以提升转录本分配的准确性。 | 开发了结合荧光信号、napari插件和Baysor优化的定制化分割流程，适用于多种植物组织和平台。 | 未明确提及，但可能受限于特定样本类型和平台，且依赖荧光信号质量。 | 优化植物探针空间转录组学中的细胞分割，以提高转录本分配和下游分析质量。 | 植物组织，包括大豆结节、大豆种子、水稻根和小麦花序。 | 计算生物学 | 不适用 | 空间转录组学 | Baysor | 图像和转录本数据 | 四个植物组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 350 | 2026-08-18 |
Stage-Specific Gene Expression Profiles in Multiple Sclerosis Cortical Lesions Identified via Spatial Transcriptomics
2026-Aug-17, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261479076
PMID:42605943
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研究论文 | 通过空间转录组学分析多发性硬化症皮层灰质病变不同阶段的基因表达谱，发现早期活动性、慢性活动性和慢性非活动性病变具有独特的转录组特征 | 首次使用空间转录组学技术对人类多发性硬化症皮层灰质病变进行分期特异性基因表达分析，揭示了不同病变阶段的独特分子特征 | 样本量有限，早期活动性病变仅由一个病变代表，研究结果属于探索性 | 探究多发性硬化症灰质病变不同阶段的分子机制，识别潜在的生物标志物 | 多发性硬化症患者死后皮层组织中的灰质病变（早期活动性、慢性活动性、慢性非活动性） | 空间转录组学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 有限样本量（具体数量未提供，早期活动性病变仅一个） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 351 | 2026-08-18 |
Highly Sensitive Spatial Host-Microbiome Transcriptomics in FFPE Tissues via Iterative Hydrogel Expansion
2026-Aug-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77219
PMID:42605963
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Ex-spRandom的高灵敏空间转录组学平台，通过迭代水凝胶膨胀技术，克服了福尔马林固定石蜡包埋组织中空间分辨率与转录组灵敏度之间的权衡限制 | 创新点在于将随机引物原位cDNA合成化学与基于互穿聚合物网络的组织膨胀化学相结合，通过物理化学协同作用直接转化多样化的断裂RNA生物类型为稳定锚定的cDNA，同时提高空间信号限制和基因检测灵敏度 | 未明确提及 | 开发一种高灵敏的空间宿主-微生物组转录组学方法，用于存档FFPE组织，同时实现高空间分辨率和转录组灵敏度 | 胚胎眼和结肠组织，包括宿主和微生物RNA | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学、原位cDNA合成、组织膨胀 | 不适用 | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量，涉及胚胎眼和结肠组织 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 352 | 2026-08-18 |
Commensal Skin Microbiota Modulate Responses to Ultraviolet Radiation in Humans
2026-Aug-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag334
PMID:42606163
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研究论文 | 本研究探讨了皮肤共生微生物群对健康人类紫外线辐射诱导的炎症（晒伤反应）的影响 | 首次通过乙醇消毒与未消毒皮肤的对照实验，结合空间转录组学技术，揭示皮肤微生物群在紫外线反应中促进角质细胞凋亡和炎症浸润、抑制增殖的新机制 | 样本量较小（n=10），且仅涉及Fitzpatrick I-III型皮肤，结果可能不适用于其他肤色人群 | 探究皮肤微生物群对紫外线辐射诱导的炎症反应的影响及其潜在机制 | 10名健康志愿者的上背部皮肤（Fitzpatrick皮肤类型I-III） | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 10名健康志愿者 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学 |
| 353 | 2026-08-18 |
Multi-Omics Integration Identifies a CDH3-Associated Malignant Epithelial State and Immunosuppressive Niche to Predict Prognosis in Thymic Epithelial Tumors
2026-Aug-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77153
PMID:42603286
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研究论文 | 通过多组学整合分析，识别与CDH3相关的恶性上皮状态及免疫抑制微环境，以预测胸腺上皮肿瘤的预后 | 首次在多组学水平上整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、批量转录组学、功能实验、异种移植验证和计算病理学，全面刻画胸腺上皮肿瘤中的恶性上皮异质性，并确定了CDH3作为连接恶性上皮可塑性与免疫抑制微环境及不良临床行为的生物标志物和治疗靶点 | 摘要未提及明确的研究局限性 | 表征胸腺上皮肿瘤中的恶性上皮异质性及其微环境组织，并识别预后相关生物标志物和治疗靶点 | 胸腺上皮肿瘤（TETs），包括胸腺瘤和胸腺癌，涉及细胞系、患者来源的类器官和异种移植模型 | 计算病理学 | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、批量转录组学、功能实验、异种移植验证、计算病理学 | 深度学习模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫荧光图像、H&E幻灯片图像 | 涉及TCGA-THYM数据集及患者来源的胸腺癌类器官，具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2026-08-18 |
Integrative genomic and proteomic analyses identify candidate genetic loci and genetically supported proteins in age-related macular degeneration
2026-Aug-14, Eye and vision (London, England)
DOI:10.1186/s40662-026-00502-3
PMID:42601635
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研究论文 | 通过整合基因组和蛋白质组分析，识别年龄相关性黄斑变性的候选基因位点和遗传支持的蛋白质 | 首次通过多组学整合分析（包括GWAS、蛋白质组MR、共定位和SMR-HEIDI）识别出7个新AMD风险位点和23个遗传支持的蛋白质，并优先确定LAMC2和PLTP为一级风险基因 | 研究为探索性，需要实验验证提出的靶点和潜在机制；环磷酰胺的发现仅作为通路指示，因其毒性未作为直接治疗建议 | 识别AMD的候选基因位点和遗传支持的蛋白质，为一级预防提供转化基础 | 年龄相关性黄斑变性（AMD）的基因位点和血浆蛋白质 | 基因组学, 蛋白质组学 | 年龄相关性黄斑变性 | GWAS, 蛋白质组MR, 共定位, SMR-HEIDI, 单细胞RNA测序, 基因敲除 | 孟德尔随机化模型 | 基因组、蛋白质组、单细胞转录组、免疫表型数据 | 28,543例病例和1,072,092例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2026-08-18 |
Brain corticogenesis promotes SARS-CoV-2 neuro-glial tropism through lipid-dependent viral replication
2026-Aug-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.103020
PMID:42492515
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研究论文 | 本研究利用多组学方法建立不同发育阶段的大脑类器官模型，揭示脑皮层形成过程通过脂质依赖性病毒复制增强SARS-CoV-2的神经胶质趋向性 | 首次定量分析SARS-CoV-2在成熟大脑类器官中的长期病毒传播动力学，并揭示脂质代谢重塑在介导脑成熟与病毒易感性之间的机制联系 | 研究主要基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内大脑微环境的复杂性和免疫反应 | 探究大脑发育成熟过程与SARS-CoV-2神经侵袭性之间的关系，并揭示其潜在机制 | 培养60天（EB60）和120天（EB120）的大脑类器官，模拟未成熟和成熟发育阶段 | 病毒学、神经科学、多组学 | COVID-19相关神经系统病变 | 多组学（单细胞转录组学、RT-qPCR、免疫组化） | 类器官模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据、图像数据 | 两种发育阶段的大脑类器官（EB60和EB120） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组学使用未指定平台 |
| 356 | 2026-08-18 |
High and intermittent hydrostatic pressure promotes maturation of engineered cardiac tissues derived from human pluripotent stem cells
2026-Aug-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.103019
PMID:42492513
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研究论文 | 该研究开发了一种利用高且间歇性的静水压处理促进人多能干细胞来源工程心脏组织成熟的方法，并在大鼠心肌梗死模型中验证了其治疗效果 | 首次证明间歇性静水压（1小时/天，50 kPa，持续3天）可促进工程心脏组织的成熟，并发现内皮细胞在此过程中起关键作用 | 静水压处理的最佳参数（压力大小、时间、频率）尚未系统优化，且训练后的组织在临床转化中的长期安全性和有效性需进一步验证 | 利用静水压模拟心室负荷，促进人多能干细胞来源工程心脏组织的结构和功能成熟，以提高其在再生治疗中的应用潜力 | 人多能干细胞来源的心血管细胞、工程心脏组织、大鼠心肌梗死模型 | 组织工程与再生医学 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织学图像、功能测量数据 | 工程心脏组织样本及大鼠心肌梗死模型，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 357 | 2026-08-18 |
Single cell CRISPR screen identifies antagonism between Nsd1-H3K36me2 and Ezh2-H3K27me3 orchestrates pluripotency transition
2026-Aug-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.103016
PMID:42462715
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研究论文 | 利用单细胞CRISPR筛选揭示了Nsd1-H3K36me2与Ezh2-H3K27me3之间的拮抗作用，该作用调控小鼠胚胎干细胞的多能性转变 | 首次采用CROP-seq技术结合单细胞RNA测序，系统解析了表观遗传调控在多能性网络中的作用，并发现H3K36me2通过调控Dnmt1和Dnmt3a表达来影响DNA甲基化的新机制 | 未明确提及具体局限性 | 探究调控小鼠胚胎干细胞多能性网络的表观遗传机制 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 单细胞组学 | 不适用 | CROP-seq（CRISPR筛选耦合单细胞RNA-seq） | CRISPR/Cas9基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 不适用（未提供具体样本数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 358 | 2026-08-18 |
Brain injury reactivates a developmental program driving genesis and integration of transient LGE-class interneurons
2026-Aug-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.103015
PMID:42462713
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研究论文 | 本研究揭示脑损伤后纹状体星形胶质细胞产生的一类瞬时LGE类中间神经元，能够成熟并整合到皮层-纹状体-丘脑回路中 | 首次证明脑损伤后由星形胶质细胞产生的神经元属于特定的LGE-MEIS2/PAX6中间神经元类别，而非成体纹状体神经元类型，并发现哺乳动物端脑星形胶质细胞共同致力于这一瞬时神经元类别 | 研究主要基于小鼠模型，且对神经元的瞬时性和功能整合的长期影响尚未完全阐明 | 探究脑损伤反应性神经发生中星形胶质细胞产生神经元的身份和整合机制 | 小鼠纹状体星形胶质细胞及其产生的神经元，以及皮层和纹状体星形胶质细胞 | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台，具体配置未详细说明 |
| 359 | 2026-08-18 |
Quantitative RNA spatial profiling using single-molecule RNA FISH on plant tissue cryosections
2026-Aug-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101943
PMID:42252663
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研究论文 | 提出一种优化的单分子RNA荧光原位杂交方法（cryo-smFISH），用于植物组织冷冻切片的RNA定量空间分析 | 针对植物组织切片优化了smFISH方法，结合深度学习算法实现细胞核与细胞质中RNA丰度的精确分配，并与免疫荧光技术兼容，可用于验证scRNA-seq表达模式 | 未提及方法在厚组织或非模式植物中的适用性，也未详细讨论探针设计复杂度 | 开发并验证一种适用于植物组织冷冻切片的简单、稳健的smFISH方法，以实现单mRNA分子的可视化和定量 | 植物组织冷冻切片中的mRNA分子，包括低表达转录本和长链非编码RNA | 数字病理学 | NA | 单分子RNA荧光原位杂交（smFISH）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习算法 | 图像 | 植物组织切片样本 | NA | 单分子RNA荧光原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2026-08-18 |
Binary-SPA: a reference-free method for cell annotation in high-resolution spatial transcriptomics
2026-Aug-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag812
PMID:42605801
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研究论文 | 提出了一种无需参考数据的空间转录组细胞注释方法Binary-SPA，通过两阶段策略实现高分辨率细胞类型注释。 | Binary-SPA无需匹配的单细胞RNA测序参考数据，采用内部参考进行标签转移，提高了注释准确性和覆盖率，并在多种平台和组织类型中表现稳健。 | 未明确提及，但可能依赖于预定义的标记基因集，对标记基因选择敏感。 | 开发一种可靠且无需参考数据的空间转录组细胞注释方法，广泛适用于研究和临床样本。 | 高分辨率空间转录组数据，包括骨髓活检等复杂样本。 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | 分类器和标签转移方法 | 空间转录组数据，蛋白表达数据（用于验证） | 多种空间平台、组织类型和保存协议的样本，具体数量未说明 | NA | 空间转录组学 | NA | 多种空间平台，具体未指定 |