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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-08-20 |
scKanFormer: A Transformer-KAN framework with biologically informed attention for cell type annotation in large-scale scRNA-seq data
2026-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014607
PMID:42599963
|
研究论文 | 提出了一种基于Transformer-KAN框架的监督方法scKanFormer，用于大规模单细胞RNA测序数据的细胞类型注释，结合生物信息注意力机制以提高准确性和可解释性。 | 采用Transformer框架避免降维，实现从注意力层到原始输入特征的追溯；集成生物信息、局部与全局注意力机制以及KAN网络，增强细胞特征识别和解释；结合CNN与Transformer以减轻批次效应。 | 文中未明确提及局限性。 | 解决scRNA-seq数据中细胞类型注释面临的批次效应和大规模数据处理问题，提高注释的准确性、鲁棒性和可解释性。 | 大规模多类别scRNA-seq数据中的细胞。 | 自然语言处理、机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer、KAN、CNN、注意力机制 | 基因表达数据 | 基准数据集（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2026-08-20 |
A single-cell transcriptomic atlas reveals the emergence of medusa-specific cell states in the scyphozoan Aurelia coerulea
2026-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003931
PMID:42599956
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研究论文 | 本研究提供了海月水母的单细胞转录组图谱，揭示了从水螅体到水母阶段转变过程中细胞类型多样性的增加和特定细胞状态的出现 | 首次构建了钵水母纲海月水母的单细胞转录组图谱，并揭示了神经和肌肉细胞谱系的进化保守性及基因复制在细胞复杂性增加中的作用 | 未提及 | 研究钵水母纲海月水母从水螅体到水母阶段转变过程中细胞类型组成的变化及其分子机制 | 海月水母（Aurelia coerulea）的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 海月水母的细胞（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-08-20 |
Alterations in chromatin organization promote totipotent-like features in a DPPA2/DUX-dependent manner
2026-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00853-6
PMID:42426342
|
研究论文 | 本文揭示了染色质组织结构改变通过依赖于DPPA2/DUX轴的方式促进小鼠胚胎干细胞向具有全能性特征的2细胞样细胞转化 | 首次证明CTCF和WAPL的耗竭通过破坏高级染色质组织结构来诱导2CLC重编程，而非CTCF的特异性功能，并鉴定ARID3A为调控因子，且发现该过程依赖于DPPA2/DUX轴和核仁完整性 | 人类ESC中WAPL或CTCF耗竭诱导的转录变化不类似于早期人类胚胎发生的转录程序，提示进化保守性有限 | 探究染色质高级组织结构破坏是否及如何促进小鼠胚胎干细胞向2细胞样细胞（全能性状态）的重编程 | 小鼠胚胎干细胞（ESC）和人类胚胎干细胞（hESC） | 表观遗传学、基因组学 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 小鼠ESC（CTCF/WAPL耗竭及对照）和人类ESC（WAPL或CTCF耗竭） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 ATAC-seq 试剂盒 |
| 324 | 2026-08-20 |
CDK8 remodels the tumor microenvironment and promotes resistance to KRASG12D inhibitors and daraxonrasib in PDAC
2026-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00854-5
PMID:42436354
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和CODEX空间蛋白组学分析，揭示了CDK8通过重塑肿瘤微环境促进PDAC对KRASG12D抑制剂和daraxonrasib的耐药性。 | 首次发现CDK8通过诱导CXCL2趋化因子分泌、抑制FAS表达及重塑肿瘤微环境导致PDAC对KRAS抑制剂的获得性耐药，并证明靶向CDK8可克服耐药，为联合治疗提供新策略。 | 研究基于小鼠模型和PDX样本，人类患者中的验证尚有限；未深入探究CDK8调控免疫逃逸的完整分子机制。 | 阐明PDAC中肿瘤微环境对KRAS抑制剂疗效持续性的贡献及耐药机制，寻找克服耐药的靶点。 | PDAC小鼠模型、PDX肿瘤样本及KRAS突变的肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CODEX空间蛋白组学 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、空间蛋白组数据 | NA | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 空间蛋白组学 | 10x Visium, 10x Chromium, CODEX | 10x Visium空间转录组, 10x Chromium单细胞RNA测序, CODEX空间蛋白组分析 |
| 325 | 2026-08-19 |
Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Deliver Progranulin to Alleviate Skin Wound Fibrosis
2026-Aug-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202602086R
PMID:42610473
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞通过细胞外囊泡递送颗粒蛋白前体（PGRN）调控成纤维细胞行为，从而减轻皮肤伤口纤维化的新机制 | 首次发现巨噬细胞PGRN通过细胞外囊泡靶向成纤维细胞DNAJC3，抑制SRF/α-SMA/CTGF纤维化信号通路，提出EV介导的细胞间通讯新途径，并展示巨噬细胞EV作为抗纤维化天然治疗剂的潜力 | 尚未在人体样本中验证该机制，且未深入探讨EV的异质性及其在复杂伤口微环境中的长期效应 | 阐明巨噬细胞源性PGRN通过细胞外囊泡调控成纤维细胞活化，减轻皮肤伤口纤维化的分子机制，并评估其治疗潜力 | 小鼠巨噬细胞、成纤维细胞及皮肤伤口模型 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞外囊泡分离与表征 | NA | 单细胞转录组数据、细胞共培养数据 | 小鼠伤口组织及细胞系样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于小鼠scRNA-seq |
| 326 | 2026-08-19 |
GPR132 antagonists alleviate atherosclerosis by suppressing M1 polarization and subsequent VSMCs proliferation and migration as revealed by transcriptomic profiling
2026-Aug-18, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02342-2
PMID:42608588
|
研究论文 | 通过转录组分析发现GPR132拮抗剂通过抑制M1极化及随后的血管平滑肌细胞增殖和迁移来减轻动脉粥样硬化 | 首次阐明GPR132在动脉粥样硬化相关巨噬细胞极化中的特定作用，揭示其通过p38/MAPK信号通路驱动M1极化，并提供药物拮抗治疗的证据 | 未明确说明 | 探讨GPR132在动脉粥样硬化中巨噬细胞极化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠、小鼠和人动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、GPR132过表达和敲除巨噬细胞、血管平滑肌细胞 | 转录组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、转录组分析、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2026-08-19 |
Integrative Multi-Omics Analysis Reveals Convergent Epigenome and Transcriptome Changes in Parkinson's Disease
2026-Aug-18, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70505
PMID:42610474
|
研究论文 | 对帕金森病的多组学数据进行整合分析，揭示多巴胺能神经元中趋同的表观基因组和转录组变化，并生成外周血单核细胞的批量ATAC-seq图谱以评估系统性表观遗传特征 | 首次通过整合单细胞转录组和表观基因组数据，识别出帕金森病中趋同的基因、通路和网络水平变化，并发现SMARCA4作为关键上游调控因子，同时提供外周血单核细胞的初步跨组织表观遗传证据 | 探索性分析，样本量较小，表观遗传特征需在更大队列中验证 | 识别帕金森病中使多巴胺能神经元易发生退行性变化的趋同转录和表观遗传改变，并评估这些改变是否扩展到外周血单核细胞 | 帕金森病患者和对照组的诱导多能干细胞来源的多巴胺能神经元，以及帕金森病患者的周围血单核细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量ATAC测序 | NA | 基因表达和染色质可及性数据 | 27例帕金森病和11例对照的单细胞RNA测序样本，10例帕金森病和2例对照的单细胞ATAC测序样本，10例帕金森病患者和4例对照的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量ATAC测序 | NA | NA |
| 328 | 2026-08-19 |
Φ-Space ST: A platform-agnostic method to identify cell states in spatial transcriptomics studies
2026-Aug-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101483
PMID:42285101
|
研究论文 | 介绍了一种平台无关的方法Φ-Space ST，用于在空间转录组学数据中识别连续细胞状态，并利用多个单细胞RNA测序参考实现细胞类型去卷积和空间生态位识别。 | Φ-Space ST是平台无关的，能够处理超细胞和亚细胞分辨率的数据，无需细胞分割即可注释细胞状态，并整合多个单细胞参考的注释结果，提供可解释的疾病细胞状态特征。 | 摘要中未提及研究的局限性。 | 开发一种稳健且可扩展的空间转录组学数据分析方法，以理解复杂组织和病理状态。 | 多种癌症组织样本，涉及CosMx、Visium、Xenium和Stereo-seq平台。 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序参考数据 | 四项案例研究，未明确样本数量。 | NA | 空间转录组学 | CosMx, Visium, Xenium, Stereo-seq | 包括CosMx、Visium、Xenium和Stereo-seq平台，但未提供具体配置。 |
| 329 | 2026-08-19 |
Integrative epidemiological analysis, plasma metabolomics, and single-cell RNA sequencing reveal the protective effects and mechanisms of dietary flavonoids against abdominal aortic aneurysm
2026-Aug-17, Food & function
IF:5.1Q1
DOI:10.1039/d6fo01948j
PMID:42507353
|
研究论文 | 通过整合流行病学分析、血浆代谢组学和单细胞RNA测序，揭示了膳食黄酮类化合物对腹主动脉瘤的保护作用及其机制 | 首次结合UK Biobank大规模队列、代谢组学和单细胞RNA测序，全面探讨黄酮类化合物（特别是原花青素）对腹主动脉瘤的保护作用，并识别出CLEC4E作为潜在靶点 | 研究基于观察性数据，可能受未测量混杂因素影响；机制探索需进一步实验验证 | 评估膳食黄酮类化合物摄入与腹主动脉瘤风险的关联，并探究其潜在机制 | 188101名基线无腹主动脉瘤的UK Biobank参与者，以及单细胞RNA测序的细胞样本 | 机器学习, 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | 代谢组学, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, 弹性网络回归 | 临床数据, 代谢组学数据, 单细胞转录组数据 | 188101名参与者的流行病学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 330 | 2026-08-19 |
Integrative bulk and single-cell transcriptomics identify a recurrence-prognostic risk model with exploratory associations with treatment-response phenotypes in colorectal cancer
2026-Aug-17, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-026-01435-8
PMID:42606648
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，构建了一个基于直肠癌的反应相关基因特征（RDRG）风险评分模型，用于结直肠癌复发分层，并探索其与治疗反应表型的关联 | 首次利用直肠癌（READ）衍生的反应相关基因签名进行复发分层，并在多个结直肠癌队列中进行探索性跨队列验证；结合单细胞RNA-seq分析揭示了恶性细胞的高风险特征及LEMD1的功能贡献 | 跨队列验证为探索性分析，时间依赖性AUC值中等；风险评分阈值因队列而异，而非固定；LEMD1的功能验证仅作为候选功能贡献者，而非确证的机制驱动因素 | 开发基于直肠癌的反应相关基因风险评分模型，用于结直肠癌复发分层，并探索其与治疗反应表型的关联 | 结直肠癌患者，包括TCGA-READ、TCGA-COAD、GSE190826和GSE17536队列 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | WGCNA, 逻辑回归, 单变量Cox回归, LASSO-Cox回归, 多变量Cox回归 | 转录组数据（bulk和单细胞） | 多个结直肠癌队列，具体样本数未在摘要中提及（包括TCGA-READ、TCGA-COAD、GSE190826和GSE17536） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2026-08-19 |
Preventing the inflammatory polarization of monocyte/macrophage provides an effective therapy for rheumatoid arthritis-associated vascular injury
2026-Aug-17, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117296
PMID:42607529
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研究论文 | 本研究旨在识别类风湿关节炎相关血管损伤中的关键免疫细胞，并探索通过防止单核细胞/巨噬细胞炎症极化来提供有效治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序结合临床数据，揭示单核细胞/巨噬细胞在类风湿关节炎相关血管损伤中的核心作用，并证明NF-κB抑制剂BAY 11-7085在减轻血管损伤方面优于现有药物 | 摘要未明确提及研究局限性 | 识别类风湿关节炎中脂质代谢紊乱与心血管疾病共存的常见致病免疫细胞，为靶向治疗提供依据 | 类风湿关节炎患者和健康个体的血液细胞、小鼠模型、大鼠模型（包括佐剂诱导关节炎和血管损伤模型） | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据、动物模型数据 | 未明确样本数量，但包括不同疾病严重程度的患者和健康个体，以及小鼠和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2026-08-19 |
Robust identification of cell-cell communication heterogeneity in single cells
2026-Aug-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101703
PMID:42607674
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯异质性的计算框架，并将其与细胞命运决定和细胞内反应联系起来 | 通过整合RNA剪接动力学和多层调控网络，实现了对细胞间通讯异质性及其与细胞命运关联的稳健识别 | 未提及 | 开发一种新方法，以揭示细胞类型内通讯行为的异质性，并连接细胞通讯与细胞命运决定及细胞内反应 | 单细胞和空间转录组数据，涉及角化细胞等生物样本 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 计算框架（具体模型类型未提及） | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 333 | 2026-08-19 |
Characterizing intra- and intertumor heterogeneity in ovarian high-grade serous carcinoma subtypes using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Aug-17, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281433.125
PMID:42608147
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术，表征了卵巢高级别浆液性癌亚型内部及肿瘤间的异质性 | 首次将分子亚型与空间转录组学结合，量化了HGSC在2D空间内的肿瘤内和肿瘤间异质性，并发现了亚型特异性空间抗共定位现象及Midkine信号差异，提出多切片分析的必要性 | 未明确说明局限性，但暗示每患者单一切片可能不足以全面表征空间转录组 | 探索HGSC中基于转录组的分子亚型与空间表达结构域之间的关联及其在患者间的变异性 | 卵巢高级别浆液性癌（HGSC）的组织样本 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间数据 | 未提供具体数目 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2026-08-19 |
Identifying phenotype-genotype-function coupling in 3D organoid imaging using Shape, Appearance and Motion Phenotype Observation Tool (SPOT)
2026-Aug-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75506-7
PMID:42608409
|
研究论文 | 开发了标准化形状-外观-运动（SAM）表型组和观察工具（SPOT），用于从3D类器官成像中识别表型-基因型-功能耦合 | 提出了一种无需先验知识的、基于2D投影视频全面描述3D形态动态表型的工具，并结合单细胞RNA测序揭示WNT信号通路改变与肠道类器官形态异常的关系 | 未在文中明确提及限制，但可能包括对2D投影视频的依赖和特定类器官模型的适用性 | 利用活细胞成像识别表型-基因型-功能耦合关系，推动生物医学发现 | 小鼠和人类类器官，包括模拟类器官数据库和超过160万实例 | 计算机视觉 | NA | 活细胞成像，单细胞RNA测序 | NA | 图像（2D投影视频），转录组数据 | 超过160万个小鼠和人类类器官实例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 335 | 2026-08-19 |
Canonical and non-canonical miRNA degradation shapes state transitions and stemness in breast cancer
2026-Aug-17, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00889-8
PMID:42608480
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研究论文 | 本研究结合CRISPRi介导的ZSWIM8敲低、miRNA测序和AGO2-eCLIP技术，绘制了乳腺癌亚型中的靶向miRNA降解（TDMD）图谱，并揭示了其调控细胞状态转变和干性的机制 | 首次在人类癌症中系统定义TDMD景观，并发现非经典TDMD机制（不依赖ZSWIM8和蛋白酶体），扩展了miRNA降解的机制谱 | 摘要中未提及明显的局限性 | 探究靶向miRNA降解在乳腺癌中的作用及其对细胞状态转变和干性的影响 | 乳腺癌细胞系及亚型，特别是三阴性乳腺癌中的恶性细胞亚群 | 基因组学 | 乳腺癌 | CRISPRi、miRNA-seq、AGO2-eCLIP、单细胞转录组学 | NA | 测序数据（miRNA-seq、eCLIP、单细胞转录组） | 未明确，涉及乳腺癌亚型及细胞系 | NA | miRNA-seq、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2026-08-19 |
CKLF1 Serves as a Pivotal Mediator of Blood-Brain Barrier Disruption and Neuroinflammation via PI3K/AKT/mTOR Signaling in Ischemic Stroke
2026-Aug-17, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-06119-w
PMID:42608489
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、调控网络分析和机器学习筛选，确定CKLF1为缺血性卒中的关键内皮调节因子，并验证其在血脑屏障破坏和神经炎症中的作用机制。 | 首次通过整合单细胞测序、调控网络分析和机器学习方法，鉴定CKLF1为缺血性卒中相关内皮调节因子，并阐明其通过PI3K/AKT/mTOR信号通路调控血脑屏障破坏和神经炎症的机制。 | 尚未明确CKLF1在缺血性卒中中的上游调控机制，以及其与其他信号通路的相互作用。 | 探究CKLF1在缺血性卒中中血脑屏障破坏和神经炎症中的作用及机制。 | 缺血性卒中相关内皮细胞、小胶质细胞和外周中性粒细胞。 | 机器学习和单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、调控网络分析、机器学习筛选 | 机器学习模型（具体未提及） | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量，使用tMCAO/R小鼠模型。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2026-08-19 |
Tumor-driven arginine depletion induces T-cell metabolism reprogramming to suppress atherosclerosis in colorectal cancer
2026-Aug-17, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-026-01899-2
PMID:42608528
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌对动脉粥样硬化的影响，发现肿瘤驱动的精氨酸耗竭通过重编程T细胞代谢来抑制动脉粥样硬化。 | 首次揭示肿瘤通过系统性精氨酸耗竭诱导斑块内T细胞向氧化磷酸化主导状态转变，从而改变动脉粥样硬化斑块的炎症微环境，并证明精氨酸补充可逆转此效应。 | 研究主要基于小鼠模型和临床数据，精氨酸代谢干预的长期效果及在人类中的适用性仍需进一步验证。 | 阐明结直肠癌对动脉粥样硬化发展的影响及其潜在机制，探索针对斑块的免疫代谢干预策略。 | 合并动脉粥样硬化和结直肠癌的患者，以及携带皮下MC38肿瘤的ApoE和Ldlr小鼠、自发性肠道腺瘤的APCApoE小鼠。 | 多组学整合分析 | 结直肠癌、动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、空间转录数据 | 临床患者数据及三种小鼠模型（具体数量未提及） | 10x Genomics, Illumina, 其他 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台专用于分析斑块组织，代谢组学和批量RNA测序用于全局分析 |
| 338 | 2026-08-19 |
The LncRNA-Tumor Immune Microenvironment Nexus: Integrative Insights for Cancer Immunotherapy
2026-Aug-17, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag084
PMID:42608821
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综述 | 该文章综合探讨了长链非编码RNA与肿瘤免疫微环境之间的相互作用，并强调了其在癌症免疫治疗中的潜在应用价值。 | 通过整合多组学分析、单细胞转录组学和计算建模，系统揭示了lncRNA在调控肿瘤免疫微环境中的复杂网络，并提出了将其作为生物标志物和治疗靶点的新策略。 | 由于是综述文章，未提供新的实验数据，且lncRNA靶向治疗的临床转化仍面临递送和特异性等挑战。 | 总结lncRNA在肿瘤免疫微环境中作用机制的最新发现，并探讨其作为免疫治疗靶点的转化前景。 | 长链非编码RNA（lncRNA）及其在肿瘤免疫微环境中的调控网络。 | 自然语言处理 | 癌症 | 高通量测序、单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2026-08-19 |
SPCC: Inferring Spatial Cell-Cell Interaction by Integrating Single-cell and Spatial Transcriptomics
2026-Aug-17, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag083
PMID:42608830
|
研究论文 | 开发了一种名为SPCC的深度学习计算框架，通过整合单细胞和空间转录组数据，推断细胞间的空间相互作用。 | 利用对抗性联合变分自编码器和随机森林模型，实现未配对单细胞和空间数据的对齐与映射，提高对测序噪声的鲁棒性，并成功识别出新的细胞间相互作用，如PECAM1-SOX4。 | 摘要中未提及局限性。 | 旨在通过整合单细胞和空间转录组数据，准确推断个体细胞分辨率的空间结构，并识别空间细胞间相互作用。 | 小鼠躯体感觉皮层、乳腺癌和黑色素瘤脑转移数据。 | 机器学习 | 乳腺癌、黑色素瘤 | 空间转录组测序、单细胞RNA测序 | 对抗性联合变分自编码器、随机森林 | 基因表达数据 | 三个数据集，具体样本数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 340 | 2026-08-19 |
ICOS-ImmunoPET Monitors T Cell Activation After Combination Immune Checkpoint Blockade in a Mouse Model of Melanoma Brain Metastasis
2026-Aug-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76803
PMID:42603288
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研究论文 | 本研究利用ICOS免疫PET成像技术监测黑色素瘤脑转移小鼠模型联合免疫检查点阻断治疗后的T细胞活化情况 | 首次将ICOS作为生物标志物用于免疫PET成像，实现对免疫检查点抑制剂治疗反应的早期、非侵入性、功能性评估，并通过对人脑转移样本的单细胞RNA测序数据重分析验证其临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人样本数据仅为转录组重分析，缺乏前瞻性临床试验验证；且文章未提及成像技术的具体分辨率和敏感性限制 | 开发并验证ICOS免疫PET成像技术，用于监测黑色素瘤脑转移中免疫检查点抑制剂治疗后的T细胞活化，以改善早期反应评估和患者分层 | 黑色素瘤脑转移小鼠模型及6例人类黑色素瘤脑转移标本 | 分子影像学 | 黑色素瘤脑转移 | 免疫PET成像、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 免疫PET影像数据、单细胞RNA测序数据 | 6例人类黑色素瘤脑转移标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |