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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-08-20 |
Astragaloside IV Protects against PM2.5-Induced Spermatocyte Injury via the cGAS-STING/Nrf2/HMOX1 Axis
2026-Aug-18, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109328
PMID:42612738
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、转录组分析、分子对接、单细胞RNA测序和体外验证，揭示了黄芪甲苷IV通过抑制cGAS-STING信号通路和激活Nrf2/HMOX1轴来保护PM2.5诱导的精母细胞损伤 | 首次证实PM2.5诱导的精母细胞损伤涉及cGAS-STING天然免疫通路，并证明黄芪甲苷IV通过双重机制（抑制cGAS-STING和激活Nrf2/HMOX1）发挥保护作用，且通过表面等离子共振验证了其直接结合cGAS和STING蛋白 | 研究仅在体外GC-2精母细胞系中进行，缺乏体内动物模型验证；且未探讨PM2.5暴露的长期效应及其他潜在信号通路 | 探究黄芪甲苷IV对PM2.5诱导精母细胞损伤的保护机制，以及cGAS-STING通路在此过程中的作用 | GC-2精母细胞系，PM2.5暴露模型，以及GSE189187转录组数据 | 机器学习 | 男性生殖系统疾病 | RNA-seq、单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、表面等离子共振 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、分子对接结构数据 | 体外实验使用GC-2细胞系；转录组分析基于GSE189187数据集，包含多个样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2026-08-20 |
Inhibition of Salt-Inducible Kinases 2 and 3 reduces inflammatory signature in Psoriasis
2026-Aug-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.07.033
PMID:42612789
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞测序，评估了SIK2/SIK3抑制剂GLPG3970在银屑病中的作用机制，发现其通过抑制炎症通路和中性粒细胞募集来减轻病变 | 首次在银屑病中结合空间转录组学和单细胞测序，阐明SIK2/SIK3抑制的分子机制，并利用临床试验样本验证了药物反应 | 摘要中未提及研究的局限性，如样本量、实验条件控制或长期效果评估 | 探究SIK2/SIK3抑制剂GLPG3970在银屑病中发挥有益作用的分子机制 | 银屑病患者的皮肤活检样本、外周血单个核细胞、T细胞、成纤维细胞和角质形成细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学、单细胞测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体数量，包括银屑病皮肤活检样本（治疗与未治疗）及临床试验受试者样本 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2026-08-20 |
WISP1 Drives Intestinal Fibrosis in Crohn's Disease via Metabolic and Rho/ROCK/MRTF-mediated cytoskeletal Remodeling
2026-Aug-18, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.07.030
PMID:42612881
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研究论文 | 本研究探讨了WISP1在克罗恩病肠道纤维化中的作用机制，发现其通过代谢重编程和Rho/ROCK/MRTF介导的细胞骨架重塑驱动纤维化，并验证了WISP1中和抗体的抗纤维化效果 | 首次阐明WISP1通过将成纤维细胞代谢从脂肪酸氧化转向糖酵解、促进脂质积累和细胞外基质沉积来驱动克罗恩病纤维化，并证实WISP1中和抗体在体内具有治疗潜力 | 尚未在人类临床试验中验证WISP1中和抗体的效果，且空间转录组和脂质组学分析仅限于回肠组织，可能未能全面反映肠道纤维化的复杂性 | 阐明WISP1在克罗恩病肠道纤维化中调控成纤维细胞活化、代谢重编程和细胞外基质重塑的机制，评估其作为狭窄型克罗恩病治疗靶点的潜力 | 克罗恩病患者的纤维化、炎症和非纤维化回肠组织，以及原代人肠道成纤维细胞和鼠纤维化模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | bulk RNA测序、空间转录组学、脂质组学、代谢通量分析、蛋白质组学/分泌组学分析 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据、脂质组数据、蛋白质组数据、组织图像 | 匹配的克罗恩病患者纤维化、炎症和非纤维化回肠组织样本，以及体外培养的原代人肠道成纤维细胞和鼠纤维化模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台用于分析组织切片中基因表达的空间分布 |
| 304 | 2026-08-20 |
Dual-Targeting Biomimetic Nanozymes Loaded Microneedle Patch Promotes Scarless Wound Healing Through Anti-Inflammatory and Anti-Fibrotic Effects
2026-Aug-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77192
PMID:42606143
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研究论文 | 开发了一种双靶向仿生纳米酶负载微针贴片，通过抗炎和抗纤维化作用促进无疤痕伤口愈合 | 首次将成纤维细胞活化蛋白靶向肽（FTP）整合到双靶向仿生纳米酶系统中，并利用凋亡小体膜实现巨噬细胞靶向和M2极化，结合微针结构实现深层递送和高效利用 | 摘要未提及具体局限性 | 开发一种双靶向仿生纳米酶微针贴片，通过调节成纤维细胞-肌成纤维细胞转化和巨噬细胞极化，促进伤口愈合并抑制疤痕形成 | 小鼠和兔子的全阶段伤口模型 | 生物材料学 | 皮肤病/伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和兔子模型，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3' 测序 |
| 305 | 2026-08-20 |
Single-cell profiling reveals IFI44L as a central regulator of immune dysregulation in high HIV viral load
2026-Aug-17, Medical microbiology and immunology
IF:5.5Q1
DOI:10.1007/s00430-026-00884-0
PMID:42606736
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研究论文 | 通过单细胞测序分析，揭示了IFI44L在高病毒载量HIV感染中作为免疫失调中枢调节因子的作用 | 首次在单细胞水平上系统描绘了不同HIV病毒载量下的免疫细胞图谱，并发现IFI44L作为潜在的疾病枢纽基因，可作为新的生物标志物 | 样本量较小，且依赖公共数据集，缺乏功能验证实验 | 探究HIV不同病毒载量对免疫细胞异质性、功能和调控机制的影响 | 外周血单个核细胞（PBMC）中的免疫细胞亚群 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7例样本（3例高病毒载量HIV感染者、3例低病毒载量HIV感染者、1例健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 公共数据集GSE157829 |
| 306 | 2026-08-20 |
Prdx2 suppresses the erythroid differentiation by modulating the ROS-JNK1 signaling axis
2026-Aug-17, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168422
PMID:42607897
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，发现PRDX2通过调控ROS-JNK1信号轴抑制红细胞分化，促进红白血病进展 | 首次探索PRDX2在红白血病发病机制中的作用，并揭示其通过ROS-JNK1信号轴调控红细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人类患者样本中验证，且未探讨PRDX2在其他信号通路中的潜在作用 | 阐明PRDX2在红白血病红细胞分化阻滞中的作用及其分子机制，评估其作为治疗靶点的潜力 | F-MuLV诱导的红白血病小鼠模型及人红白血病细胞系K562和HEL | 数字病理学 | 红白血病 | 单细胞RNA测序，功能实验，免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据，细胞功能数据 | 未明确说明（小鼠骨髓样本和两个细胞系） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-08-20 |
A novel adrenomedullin receptor signaling-based prognostic model predicts immunosuppressive microenvironment and informs therapeutic stratification in hepatocellular carcinoma: A retrospective bioinformatics study
2026-Aug-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050066
PMID:42601689
|
研究论文 | 基于肾上腺髓质素受体信号相关基因构建并验证肝癌预后模型，并分析其与免疫微环境、药物敏感性和体细胞突变的关系 | 首次基于肾上腺髓质素受体信号相关基因构建多基因预后模型，并结合116种机器学习算法组合进行优化 | 药物敏感性预测结果仅为假设生成，需实验验证 | 开发并验证基于肾上腺髓质素受体信号相关基因的预后模型，阐明其与临床特征、免疫微环境、药物敏感性和体细胞突变的关系 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GSE14520队列，包括训练和验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2026-08-20 |
Identifying head and neck squamous cell carcinoma: HPV-associated signature by integrating bulk and single-cell sequencing data
2026-Aug-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050218
PMID:42601707
|
研究论文 | 通过整合 bulk 和单细胞测序数据，利用 Scissor 算法构建了预测头颈部鳞状细胞癌 HPV 状态的评分模型 | 首次结合 Scissor 算法与 bulk 和单细胞测序数据，构建了基于 43 个特异表达基因的 HPV 状态预测模型，其准确性优于大多数现有生物标志物 | 未明确提及局限性 | 构建一个能准确预测头颈部鳞状细胞癌患者 HPV 状态的模型 | 头颈部鳞状细胞癌患者的 bulk 和单细胞测序数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、bulk 测序 | Scissor 算法、基因集变异分析 | 测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括发现集和验证集 | NA | 单细胞 RNA 测序、bulk RNA 测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-08-20 |
Prognostic Modeling of Ovarian Cancer Based on Perioperative Anesthesia-Related Drug Target Genes: A Bioinformatics Approach
2026-Aug-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72629
PMID:42611564
|
研究论文 | 本研究基于围手术期麻醉相关药物靶基因开发卵巢癌预后模型，并整合多组学数据评估其临床意义 | 首次基于围手术期麻醉相关药物靶基因构建卵巢癌预后特征，并整合多组学数据及构建列线图以提升预后性能 | 未明确提及，但可能包括样本量有限及模型需进一步前瞻性验证 | 开发基于PARDTGs的卵巢癌预后模型，并探讨其在风险分层和免疫治疗反应预测中的价值 | 卵巢癌患者（基于TCGA-OV及三个外部验证队列） | 生物信息学 | 卵巢癌 | 多组学整合（bulk转录组、单细胞RNA测序、空间转录组） | Cox比例风险模型（stepAIC） | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | TCGA-OV及GSE26193、GSE30161、GSE63885（具体样本数未提供） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 310 | 2026-08-20 |
scOPE identifies which driver-associated expression programs transfer from bulk tumors to single cells
2026-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.24.740598
PMID:42539254
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研究论文 | 提出scOPE方法，学习源自肿瘤组织的驱动基因相关表达程序并将其迁移至单细胞转录组，并评估其迁移能力和适用条件 | 首次系统性评估驱动基因相关表达程序从实体瘤到单细胞数据的迁移选择性，并提出一种无金标准的置信度评分来指示迁移程序的可靠性 | 无法直接判定等位基因变异，仅恢复连续、突变相关的转录特征，且多数可评估的驱动基因模型未能达到预定的高AUROC阈值 | 开发从批量肿瘤转录组学习癌症特异、驱动基因相关的表达程序并迁移到单细胞数据的方法，以在缺乏变异信息时辅助读取细胞状态 | 来自七种恶性肿瘤的158个驱动基因-癌症配对模型，以及AML、胶质母细胞瘤、胰腺癌等数据 | 单细胞组学及计算生物学 | 急性髓系白血病、胶质母细胞瘤、胰腺癌等恶性肿瘤 | scRNA-seq、CNV推断、批量RNA-seq | 机器学习模型，涉及预测器和置信度评分方法 | 单细胞转录组数据、批量肿瘤转录组数据、患者突变注释 | 158个驱动基因-癌症配对模型，涉及12个可评估的AML驱动基因，包含多个患者样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2026-08-20 |
CCL4 as a Potential Immune-Metabolic Biomarker in Acute Myocardial Infarction via Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2026-Aug-11, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72480
PMID:42611748
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据及机器学习方法，识别与急性心肌梗死相关的钙调节蛋白基因，并探索其免疫代谢特征，提出CCL4作为潜在诊断生物标志物 | 首次结合批量与单细胞转录组数据及多种机器学习算法筛选出与AMI相关的六个关键钙调节蛋白基因，并特别指出CCL4在T和NK细胞中的表达显著降低，作为潜在诊断标志物 | 研究基于公开数据集和局部队列验证，样本量有限，且功能验证仅通过qPCR，缺乏蛋白水平和功能实验的深入验证 | 识别急性心肌梗死相关的钙调节蛋白基因，并探索其免疫代谢特征，以发现新的补充性生物标志物 | 急性心肌梗死样本中的钙调节蛋白相关基因及其在免疫细胞中的表达模式 | 机器学习 | 心血管疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR | 机器学习算法（具体未提及，但包括多种算法） | 转录组数据 | 未明确提及样本数量，但包括多个独立数据集和一个局部队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 312 | 2026-08-20 |
S100P as a Shared Biomarker in Inflammatory Bowel Disease, Colorectal Cancer, and Pancreatic Adenocarcinoma: An Integrated Transcriptomic Analysis
2026-Aug-11, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/71735
PMID:42611775
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研究论文 | 通过整合转录组分析，识别炎症性肠病、结直肠癌和胰腺导管腺癌共有的生物标志物S100P，并验证其与免疫相关特征 | 首次通过多疾病整合转录组分析，发现S100P作为三种疾病共有的生物标志物，并阐明了其与免疫细胞浸润和炎症通路的关系 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证仅限于体外细胞模型，缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 | 识别炎症性肠病、结直肠癌和胰腺导管腺癌共有的分子特征和生物标志物，探索其共享的生物学通路 | 炎症性肠病、结直肠癌和胰腺导管腺癌的基因表达数据集，以及脂多糖刺激的结肠上皮细胞 | 机器学习 | 炎症性肠病、结直肠癌、胰腺导管腺癌 | 转录组分析、加权基因共表达网络分析、差异表达分析、单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 共使用162个疾病相关基因，涉及多个公共数据集样本，具体数量未在标题和摘要中提供 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-08-20 |
Loom: Multi-Region Analysis of Spatial Transcriptomics with Local Neighborhoods and Global Trajectories
2026-Aug-08, ArXiv
PMID:42539149
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研究论文 | 介绍了Loom，一个空间转录组学可视化计算系统，用于分析伪时间轨迹、跨样本比较和局部微环境中的空间结构过程 | 结合新型字形和计算后端，支持局部微环境的详细伪时间探索、跨样本比较以及时空生物机制研究 | 摘要中未提及明确的局限性 | 支持空间转录组学数据的伪时间轨迹分析、样本间比较和局部微环境研究 | 空间转录组学数据，包括组织病理学和肿瘤学专家使用的案例 | 可视化计算 | 未指明 | 空间转录组学 | 未指明 | 空间转录组学数据 | 未指明 | 未指明 | 空间转录组学 | 未指明 | 未指明 |
| 314 | 2026-08-20 |
Endoplasmic Reticulum Stress-Related Immune Signature in Atrial Fibrillation: Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2026-Aug-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/71532
PMID:42611890
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研究论文 | 本研究描述了一个可重复的计算流程，通过整合批量转录组学、机器学习、免疫浸润分析和单细胞转录组学，识别心房颤动中内质网应激相关的基因特征。 | 创新性地整合了多种机器学习算法与单细胞转录组学，构建了内质网应激相关基因模型，并利用SHAP分析识别关键基因，将基因特征映射到单核细胞-巨噬细胞谱系，揭示了其在房颤免疫重塑中的潜在作用。 | 未明确提及局限性，但可能包括依赖公共数据集、样本量有限、模型泛化性需进一步验证。 | 识别心房颤动中内质网应激相关的基因特征，并阐明其与免疫细胞群体的关联。 | 心房颤动患者及对照的批量转录组和单细胞转录组数据。 | 生物信息学、机器学习 | 心房颤动 | 转录组测序，单细胞转录组，批量转录组 | 弹性网络（Enet）、机器学习模型 | 基因表达数据 | 使用多个公开数据集，包括训练集和验证集（GSE115574、GSE14975），具体样本数未在摘要中提及。 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-08-20 |
CD177+ neutrophils drive extracellular matrix remodelling and HGF-alpha release in ALPPS-induced liver regeneration
2026-Aug-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336300
PMID:41390175
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了ALPPS术后肝脏再生中CD177+中性粒细胞通过促进细胞外基质重塑和HGF-α释放驱动再生的免疫机制 | 首次在ALPPS患者和动物模型中阐明CD177+中性粒细胞通过CD177-PECAM1相互作用促进内皮迁移、通过MMP9介导ECM降解和HGF-α释放来驱动肝脏再生的具体机制，并验证了CD177+中性粒细胞输注的治疗潜力 | 研究主要基于观察性和功能验证实验，尚未在大型多中心临床试验中验证CD177+中性粒细胞输注的疗效和安全性 | 阐明ALPPS术后肝脏再生过程中免疫系统的变化及中性粒细胞介导的再生机制 | ALPPS患者残余肝组织、小鼠ALPPS模型中的中性粒细胞亚群及相关细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、组织学分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像数据 | 世界最大ALPPS临床队列及小鼠模型，具体样本数量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'转录组和10x Visium空间转录组平台 |
| 316 | 2026-08-20 |
Targeting cancer stem cells enhances multikinase inhibitor therapy in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2026-Aug-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336527
PMID:41448879
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研究论文 | 本研究旨在表征代谢功能障碍相关脂肪肝病相关肝细胞癌（MASLD-HCC）中的癌症干细胞（CSCs），并探讨其在肿瘤发生和治疗反应中的作用，提出了靶向CD133联合多激酶抑制剂的新型治疗策略。 | 首次在MASLD-HCC中系统表征CD133+ CSCs，揭示其通过CD133-MYH9/β-catenin轴促进肿瘤发生的机制，并开发了CD133靶向siRNA纳米颗粒增强多激酶抑制剂疗效的新策略。 | 摘要未提及具体限制，但可能包括样本量有限、临床转化尚需验证等。 | 阐明MASLD-HCC中癌症干细胞的特性及其对肿瘤发生和治疗反应的影响，并评估靶向CD133的治疗潜力。 | 人类MASLD-HCC肿瘤及邻近正常组织样本（29对），以及小鼠模型中的CD133+细胞。 | 癌症研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病相关肝细胞癌 | 表达谱分析、单细胞RNA测序、体内遗传谱系追踪、质谱分析、siRNA纳米颗粒递送 | 小鼠模型（肝细胞特异性CD133过表达模型） | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 29对人类肿瘤及邻近正常组织样本，以及多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | NA |
| 317 | 2026-08-20 |
A tolerogenic mRNA-LNP vaccine alleviates neuroinflammation and demyelination in experimental autoimmune encephalomyelitis
2026-Aug-05, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.08.017
PMID:42613282
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研究论文 | 开发了一种编码三种髓鞘抗原表位串联融合的mRNA-LNP疫苗，在实验性自身免疫性脑脊髓炎中减轻神经炎症和脱髓鞘 | 首次将mRNA-LNP疫苗用于多发性硬化的抗原特异性耐受诱导，并通过单细胞转录组学揭示其重塑微环境的机制 | 主要基于小鼠EAE模型，需要进一步验证在人类MS中的安全性和有效性 | 开发并评估一种抗原特异性mRNA-LNP疫苗对多发性硬化的治疗效果及其免疫机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型的脊髓组织 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3' |
| 318 | 2026-08-20 |
Single-cell analysis reveals a LAMB3-dependent immunosuppressive environment in gallbladder neck/cystic duct carcinoma
2026-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101860
PMID:42002036
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示了胆囊颈/胆囊管癌中LAMB3依赖的免疫抑制微环境，并与胆囊底/体癌的免疫活化微环境进行了对比 | 首次在单细胞水平上系统描绘了起源于胆囊颈/胆囊管的胆囊癌（GBCN/CD）与胆囊底/体癌（GBCF/B）之间的肿瘤微环境异质性，并鉴定LAMB3+肿瘤细胞作为GBCN/CD中的核心免疫调节因子，驱动巨噬细胞浸润和T细胞功能障碍，提出LAMB3可作为GBCN/CD的潜在治疗靶点 | 结论主要基于单细胞转录组和功能实验，尚需进一步的体内外验证及临床前瞻性研究来确认LAMB3靶向治疗的有效性和安全性 | 探讨胆囊癌不同发生部位（胆囊底/体 vs 颈/胆囊管）的肿瘤微环境差异及其分子机制，为部位特异性精准治疗策略提供依据 | 569,736个细胞，来源于38例胆囊底/体癌（GBCF/B）和17例胆囊颈/胆囊管癌（GBCN/CD）样本 | 单细胞转录组学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组测序、全外显子测序、单细胞T细胞受体测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 单细胞基因表达数据、外显子测序数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 55个胆囊癌样本（38例GBCF/B和17例GBCN/CD），包括569,736个细胞 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、空间转录组学、全外显子测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'转录组测序、10x Visium空间转录组、Illumina NovaSeq全外显子测序 |
| 319 | 2026-08-20 |
Recapitulation of bile acid metabolism in hepatobiliary organoids derived from hiPSC
2026-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101884
PMID:42092618
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研究论文 | 本研究开发了一种源于人类诱导多能干细胞（hiPSC）的胆酸肝胆类器官（BA-HBOs），这些类器官能够复现胆汁酸代谢的关键方面，为肝脏疾病研究和药物筛选提供了更接近生理和病理状态的平台。 | 该研究首次通过优化成熟方案（加入柴胡皂苷A）和转化生长因子-β处理，生成胆酸肝胆类器官，并利用单细胞RNA测序和代谢组学验证了其转录和代谢组特征，成功复现了胆汁酸代谢、肝细胞分区及纤维化相关功能异常。 | 摘要未明确提及相关限制。 | 生成能够复现人类肝脏胆汁酸代谢的hiPSC来源胆酸肝胆类器官，用于研究肝病机制和药物筛选。 | 人类诱导多能干细胞来源的胆酸肝胆类器官（BA-HBOs）及纤维化类器官（FiBA-HBOs）。 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，液相色谱-质谱联用代谢组学 | 类器官模型 | 基因表达数据，代谢组学数据 | 至少3个独立样本（n ≥ 3） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2026-08-20 |
SKIM: A fast sketching strategy integrated with model's dynamic-feedback for large-scale single-cell transcriptomic analysis
2026-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014638
PMID:42574452
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研究论文 | 提出了一种结合模型动态反馈的快速草图策略SKIM，用于大规模单细胞转录组分析，以提高数据缩减效率并保留关键生物信号。 | 首次将模型训练过程中的动态反馈（重建损失序列）用于草图选择，提供多尺度视图，并识别和移除异常细胞，优于现有几何距离方法。 | 未明确讨论对极端异质性数据或超高维特征的适应性，且依赖训练过程可能增加计算开销。 | 开发一种高效且准确的大规模单细胞转录组数据集草图方法，以平衡计算负担和生物信息保留。 | 单细胞RNA测序数据（scRNA-seq）中的细胞子集。 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器（基于训练损失动态反馈） | 单细胞转录组表达谱（数值矩阵） | 九个基准数据集，包含216,611个细胞（用于10%草图生成）。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |