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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-08-25 |
BNT162b2 mRNA Vaccination Activates Spike-Reactive Regulatory T Cells in Humans
2026-Aug-24, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxag045
PMID:42634894
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研究论文 | 本研究探讨BNT162b2 mRNA COVID-19疫苗在健康成年人中是否激活刺突蛋白反应性调节性T细胞 | 首次在人类中证明mRNA疫苗能够激活病毒抗原特异性调节性T细胞,并揭示其转录特征和功能 | 研究仅限于健康成年人,未评估疫苗对疾病结局的影响,且样本量较小 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种对刺突蛋白反应性调节性T细胞活化的影响 | 健康成年人的外周血单个核细胞(PBMC)中的刺突蛋白反应性CD4+ T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、T细胞受体(TCR)谱分析、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 样本量未明确说明,但来自健康成年人 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 202 | 2026-08-25 |
Reduced dosage of Kmt2d modifies Tbx1 haploinsufficiency toward phenotypes of 22q11.2DS
2026-Aug-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.206763
PMID:42635044
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研究论文 | 本研究探讨了Kmt2d基因剂量减少如何改变Tbx1单倍剂量不足,从而引发类似22q11.2DS的表型。 | 首次证明Kmt2d的剂量减少能修饰Tbx1单倍剂量不足,导致22q11.2DS和歌舞伎综合征共享的表型。 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本,且未深入探讨分子机制细节。 | 探究KMT2D基因剂量减少对Tbx1单倍剂量不足表型的影响及其在22q11.2DS和歌舞伎综合征中的作用。 | Tbx1杂合小鼠和Kmt2d条件性敲除小鼠。 | 发育生物学 | 22q11.2缺失综合征、歌舞伎综合征 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-08-25 |
Mutation-resolved single-cell transcriptomics reveals enhanced β-amyloid clearance in TET2-mutant human monocytes
2026-Aug-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.208804
PMID:42635046
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研究论文 | 利用突变分辨的单细胞转录组学揭示TET2突变单核细胞增强β-淀粉样蛋白清除的机制 | 首次在人类衰老个体中通过突变分辨的单细胞转录组学区分TET2突变和野生型单核细胞,揭示突变细胞富集吞噬和补体程序,且TET2沉默能增强β-淀粉样蛋白摄取 | 未提及明确局限性 | 阐明TET2驱动的克隆性造血降低阿尔茨海默病风险的人类机制 | 老年个体中的TET2突变和野生型单核细胞及巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2026-08-25 |
Ultrasound-responsive microencapsulated curcumin nanobubbles for treatment of mice rheumatoid arthritis and mechanistic insights based on single-cell Transcriptomics
2026-Aug-24, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2721648
PMID:42635113
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研究论文 | 本研究开发了超声响应性姜黄素纳米泡,并利用单细胞转录组学揭示其在类风湿关节炎小鼠模型中的治疗机制。 | 首次将超声响应性姜黄素纳米泡与单细胞转录组学结合,深入探讨其在类风湿关节炎治疗中的分子机制。 | 未提及具体局限性。 | 探究超声辅助姜黄素纳米泡对类风湿关节炎的治疗效果及其分子机制。 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞和胶原诱导的关节炎小鼠模型。 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2026-08-25 |
A single-cell transcriptome atlas reveals paradoxical monoallelic expression of RNA editing and heterozygous SNPs
2026-Aug-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag846
PMID:42635128
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研究论文 | 本研究利用果蝇单细胞转录组图谱,揭示了RNA编辑和杂合SNP的悖论性单等位基因表达现象 | 首次在单细胞水平发现94.0%的RNA编辑位点和92.8%的杂合SNP呈二元表达,挑战了传统认知,并对Smart-Seq技术在分子多样性分析中的适用性提出质疑 | 未深入探讨二元表达背后的生物或技术机制,仅保守地指出Smart-Seq可能不适用于分子多样性分析 | 探究单细胞水平RNA编辑和杂合SNP的表达模式及其对分子多样性的影响 | 果蝇(Drosophila melanogaster)的单细胞 | 转录组学 | 不适用 | Smart-Seq单细胞转录组测序 | 不适用 | 转录组测序数据 | 13,025个单细胞 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | Smart-Seq | Smart-Seq单细胞转录组测序 |
| 206 | 2026-08-25 |
Single-cell profiling reveals senescent bone marrow mesenchymal stem cell subpopulations driving pathological ossification in ankylosing spondylitis
2026-Aug-24, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keag429
PMID:42635554
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示强直性脊柱炎中衰老性骨髓间充质干细胞亚群驱动病理性骨化的机制 | 首次在单细胞水平上识别出与强直性脊柱炎结构损伤相关的衰老相关簇(SRC),该簇表现出细胞衰老和代谢亢进的双重表型,并定义了特定基因签名与氧化应激和异常分化轨迹相关 | 未在功能实验中验证JAK抑制剂对SRC表型的影响,且样本量有限(12例患者) | 表征强直性脊柱炎患者骨髓间充质干细胞的细胞异质性和分化状态,识别与结构损伤相关的亚群,并探索其分子特征和潜在治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者(按结构损伤严重程度分为SSD和NSD组)的骨髓间充质干细胞 | 单细胞测序 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、轨迹推断、代谢分析、通路富集、药物预测 | 单细胞转录组数据 | 12例强直性脊柱炎患者(9例重度结构损伤,3例无结构损伤)的骨髓间充质干细胞,共47,628个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2026-08-25 |
Uncoupling Type I Interferon Benefits From Inflammatory Toxicity: Transformer-Prioritized Precision Agonists for Potent and Safer Cancer Immunotherapy
2026-Aug-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77269
PMID:42635620
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度学习框架DLINP,从1.23亿个化合物中筛选出有机金属PNP钳形配合物Co68,其能解耦I型干扰素激活与炎症毒性,在胰腺导管腺癌模型中展现出优于标准STING激动剂的抗肿瘤效果,并通过单细胞和空间转录组学揭示了其重塑髓系细胞区室的机制 | 首次提出通过深度学习框架DLINP筛选能够解耦I型干扰素诱导与有害炎症信号的精准免疫调节剂,发现的Co68以非经典方式结合TLR4-MD2复合物,通过TLR4-TRIF-IFN-I轴触发干扰素信号同时通过TLR4-SYK-STAT1通路抑制NF-κB驱动的炎症,实现了免疫调节功能的解耦 | 摘要中未提及研究的局限性 | 开发能够解耦I型干扰素激活与炎症毒性的精准免疫调节剂,以克服紫杉醇化疗的免疫调节悖论,增强癌症免疫治疗效果 | 胰腺导管腺癌模型中的肿瘤微环境及免疫细胞(包括肿瘤相关巨噬细胞、NK细胞、CD8 T细胞) | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞转录组、空间转录组 | Transformer | 转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2026-08-25 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the FA9-VAP Module Regulating Fatty Acid Accumulation in Soybean Seeds
2026-Aug-23, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70750
PMID:42633702
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和空间转录组学,揭示FA9-VAP模块调控大豆种子脂肪酸积累的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学解析大豆种子中FA9基因调控脂质代谢的细胞类型特异性机制,并鉴定出FA9与VAP蛋白的相互作用 | 未提及 | 阐明FA9基因调控大豆种子脂肪酸积累的分子机制 | 野生型和FA9敲除的大豆种子 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫沉淀-质谱、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质互作数据 | 野生型和FA9敲除大豆种子(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 209 | 2026-08-25 |
The gut microbiome in chemotherapy-induced fatigue: Exploring clinical associations and modulation via fecal microbiota transplantation in female mice
2026-Aug-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117318
PMID:42633730
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研究论文 | 本研究探讨了化疗引起的疲劳与肠道微生物组之间的关联,并通过粪便微生物群移植在小鼠模型中评估了其对疲劳及炎症反应的影响 | 首次结合乳腺癌患者临床数据和化疗小鼠模型,综合评估粪便微生物群移植对化疗引起的疲劳、肠道和脑部基因表达及炎症标志物的影响 | 粪便微生物群移植仅对5-FU治疗的小鼠产生温和至中度益处,且对紫杉醇治疗无明显效果,表明其效果因化疗药物而异 | 研究化疗引起的疲劳与肠道微生物组的关联,并评估粪便微生物群移植在缓解化疗相关疲劳和炎症中的作用 | 乳腺癌患者(n=67)和接受化疗(5-氟尿嘧啶或紫杉醇)的小鼠模型 | 微生物组学,神经科学 | 乳腺癌,化疗引起的疲劳 | 16S rRNA测序,RT-qPCR,单细胞RNA测序,多重电化学发光分析 | NA | 微生物组数据,基因表达数据,临床数据,行为数据 | 67名乳腺癌患者,小鼠模型(具体数量未提供) | Illumina | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 | Illumina测序仪 | 16S rRNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台 |
| 210 | 2026-08-25 |
Epithelial-mesenchymal transition in carcinoma: navigating phenotypic states to target resistance and metastasis
2026-Aug-22, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-026-10368-5
PMID:42631751
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综述 | 探讨癌细胞内上皮-间质转化(EMT)的异质性表型状态及其对抗转移和耐药治疗策略的影响 | 强调EMT并非二元切换,而是细胞分布于连续的部分EMT状态中,并整合单细胞测序、空间组学和谱系追踪数据重塑对EMT的传统理解 | EMT定向干预的临床转化面临方法学挑战,包括因果动态未验证和治疗安全性未解决 | 分析EMT在肿瘤转移和耐药中的作用,并探讨针对癌细胞可塑性的治疗策略 | 癌细胞(特别是癌组织中的肿瘤细胞) | 癌症生物学 | 癌症 | 单细胞测序、空间组学、谱系追踪 | NA | 单细胞数据、空间组学数据、谱系追踪数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2026-08-25 |
Combining in vitro and in silico approaches to model neural tube patterning and isthmic organizer formation
2026-Aug-21, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00813-0
PMID:42629366
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研究论文 | 结合体外实验和计算建模方法,模拟神经管模式和峡部组织者的形成 | 将单细胞RNA测序数据与三维计算模型相结合,揭示瞬时形态发生素信号如何诱导不可逆的神经管模式,并准确捕捉峡部组织者的形成和维持 | 未提供具体限制信息 | 理解人类神经管在早期胚胎发育中的模式形成机制,特别是峡部组织者的形成 | 人类神经管模式形成过程中的细胞和分子机制,包括单细胞RNA测序数据 | 计算生物学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型(具体类型未提及,可能涉及微分方程或布尔网络) | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2026-08-25 |
Integrative multi-omics analysis identifies an enhancer-driven ELF3-CLDN4 regulatory axis that shapes an immunosuppressive microenvironment and predicts prognosis in high-grade serous ovarian cancer
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150360
PMID:42624178
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研究论文 | 整合多组学分析确定了一个增强子驱动的ELF3-CLDN4调控轴,该轴塑造了高级别浆液性卵巢癌的免疫抑制微环境并预测预后 | 首次整合H3K27ac ChIP-seq、Hi-C、单细胞RNA-seq和空间转录组学等多组学数据,重建了细胞类型特异性的增强子-基因调控网络,并确定了ELF3-CLDN4调控轴连接肿瘤可塑性与CD4+ T细胞免疫抑制 | 未提及具体局限性 | 识别高级别浆液性卵巢癌中连接肿瘤可塑性、CD4+ T细胞极化和预后的增强子相关调控回路 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织及非恶性卵巢组织 | 多组学分析 | 卵巢癌 | ChIP-seq, Hi-C, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | SCENIC, Louvain聚类, CellChat, 拟时间分析, GSVA, 生存模型 | 基因组、转录组、空间转录组、蛋白表达数据 | 90例原发性高级别浆液性卵巢癌和10例非恶性卵巢组织 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2026-08-25 |
The Hsd17b13P260S patient variant knock-in male mouse model provides translational insights into HSD17B13 biology
2026-Aug-14, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106429
PMID:42600259
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研究论文 | 本研究通过构建携带人HSD17B13 P260S患者变异的敲入小鼠模型,结合空间转录组学、组织学、MALDI成像及体外细胞表征,探究该变异对MASLD向MASH进展的保护机制 | 首次建立Hsd17b13P260S患者变异的敲入小鼠模型,并利用空间转录组学和MALDI成像揭示其保护表型,发现蛋白丰度降低、酶活性减少及门静脉周围区域化保留是潜在机制 | 仅使用雄性小鼠,未涉及雌性;研究局限于饮食诱导模型,未完全模拟人类疾病复杂性;机制未完全阐明 | 探究HSD17B13 P260S变异对MASLD向MASH进展的保护机制,验证小鼠模型的转化价值 | 携带Hsd17b13P260S变异的敲入小鼠及其野生型对照 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 空间转录组学、MALDI成像、组织学分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、图像数据 | 雄性Hsd17b13P260S小鼠和野生型小鼠(具体数量未提供) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 214 | 2026-08-25 |
Uncovering smooth structures in single-cell data with neighbor embeddings guided by predictability-computability-stability
2026-Aug-14, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2026.101621
PMID:42630787
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研究论文 | 本研究提出一种基于可预测性-可计算性-稳定性框架的邻域嵌入改进方法NESS,以增强单细胞数据中平滑生物结构的推断稳健性。 | 引入PCS框架来系统评估和改进邻域嵌入算法,提出名为NESS的可解释机器学习方法,利用算法稳定性提升单细胞数据低维表示的质量,减少t-SNE和UMAP等方法的失真问题。 | 摘要未明确提及局限性,可能包括对特定数据集或条件的依赖,以及计算复杂性等潜在限制。 | 解决单细胞数据中提取平滑低维结构的挑战,提高邻域嵌入的可靠性和可重复性,以支持稳健的数据驱动发现。 | 单细胞测序数据,包括多能干细胞分化、类器官发育和多种组织特异性谱系的研究数据。 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 邻域嵌入算法(如t-SNE、UMAP)及提出的NESS方法 | 单细胞数据 | 多个数据集,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq(推断) | NA | NA |
| 215 | 2026-08-25 |
T Cell-associated Co-expression Module Genes as Prognostic Biomarkers and Predictors of Immunotherapy Response in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-Aug-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和hdWGCNA分析,构建了一个由八个T细胞相关基因组成的预后模型,用于预测头颈鳞状细胞癌患者的生存和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序与hdWGCNA分析识别T细胞相关共表达模块基因,并构建八基因预后模型,该模型在预测预后和免疫治疗反应方面具有较高的判别能力 | 需要进一步的实验和临床验证,模型在不同人群中的通用性有待评估 | 开发T细胞相关预后模型,用于头颈鳞状细胞癌的预后评估和免疫治疗反应预测 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者及其肿瘤组织中的T细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA | Cox回归模型 | 单细胞基因表达数据,临床数据 | GSE181919(单细胞数据),TCGA(训练集),GSE41613和GSE117973(验证集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2026-08-25 |
Multi-Omics Integration and Proteomic Annotation Prioritize FAM174BAssociated Monocyte Remodeling in COPD and Lung Adenocarcinoma
2026-Aug-13, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
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研究论文 | 整合多组学数据、孟德尔随机化和蛋白质组学注释,优先筛选出FAM174B相关的单核细胞重塑作为慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的共享候选机制 | 首次将单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化相结合,以区分上游贡献因素和下游重塑事件,并优先识别出FAM174B作为COPD和LUAD的共享候选基因 | 孟德尔随机化分析为探索性,未进行正式多重检验校正和共定位分析;单细胞比较未考虑供体效应;蛋白质水平证据仅基于公共代表免疫组化图像 | 识别慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的共享细胞和分子程序,特别是与炎症重塑相关的恶性转化机制 | 慢性阻塞性肺疾病和肺腺癌患者的肺组织单细胞转录组数据、遗传变异的eQTL和GWAS汇总统计、肺腺癌组织蛋白质表达 | 多组学整合、机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病、肺腺癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、免疫组化 | NA | 单细胞基因表达数据、遗传变异汇总统计、免疫组化图像 | COPD数据集GSE196638和LUAD数据集GSE131907中包含的样本数未具体说明;eQTLGen和GWAS汇总统计数据未提供样本数 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2026-08-25 |
LAMP2 drives M2 macrophage polarization and promotes glioma progression through autophagy
2026-Aug-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05746-y
PMID:42627451
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,发现LAMP2在低级别胶质瘤中上调,并通过促进自噬介导的M2巨噬细胞极化来推动肿瘤进展 | 首次揭示LAMP2通过调控自噬溶酶体成熟和M2巨噬细胞极化,在胶质瘤进展中发挥关键作用,并提出了其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外细胞实验和体内小鼠模型,缺乏临床样本验证;且未深入探讨LAMP2调控自噬和巨噬细胞极化的具体分子机制 | 探究LAMP2在低级别胶质瘤进展中的作用及其机制,评估其作为预后标志物和治疗靶点的可能性 | 胶质瘤细胞和巨噬细胞(M2极化状态) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞实验数据 | NA(未提供具体样本数量) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2026-08-25 |
Single-cell Transcriptome-wide Mendelian Randomization and Colocalization Converge on Astrocytic TRIM66 as a Candidate Driver and Potential Therapeutic Target for Trigeminal Neuralgia
2026-Aug-10, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组全基因组的孟德尔随机化和共定位分析,发现星形胶质细胞中TRIM66基因表达与三叉神经痛风险相关,并可能作为潜在的治疗靶点 | 首次将单细胞cis-eQTL与孟德尔随机化及共定位分析相结合,在细胞类型水平上识别三叉神经痛的遗传驱动因素,提出了星形胶质细胞特异性调控TRIM66的新机制 | 功能验证尚未进行,且样本来源为神经病理学无异常的捐赠者,可能限制结果的普遍性 | 探究特定脑细胞类型的基因表达遗传调控对三叉神经痛易感性的影响,并提名可操作的 therapeutic 靶点 | 三叉神经痛患者及对照样本,包括183名无神经病理学捐赠者的单细胞数据,FinnGen数据库中2226例病例和435371例对照 | 机器学习 | 三叉神经痛 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、共定位分析 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | 183名捐赠者(单细胞数据),2226例病例和435371例对照(FinnGen数据) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2026-08-25 |
Development of a Prognostic Model Based on SCISSOR+ Osteoblastic Osteosarcoma Cell-Associated Genes
2026-Aug-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究旨在通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,开发一种基于SCISSOR+成骨性骨肉瘤细胞相关基因的预后模型,以改善骨肉瘤患者的预后预测。 | 利用SCISSOR算法识别SCISSOR+成骨性骨肉瘤细胞亚群,并基于其相关基因构建六基因风险评分模型,首次将单细胞异质性与预后模型结合。 | 基于单一数据集(GSE162454)进行回顾性分析,需进一步前瞻性验证。 | 建立骨肉瘤预后风险模型,评估其与免疫浸润和药物反应的关系。 | 骨肉瘤患者样本,包括批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据。 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, SCISSOR算法 | 风险评分模型(基于基因表达) | 基因表达数据(批量及单细胞) | 未明确样本数量,基于GSE162454数据集。 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-08-25 |
Integration of Single-Cell Transcriptomics and Network-Based Machine Learning Identifies Bone Marrow Mesenchymal Stem Cell-Associated Candidate Biomarkers and Exploratory Immune Correlates in Osteoarthritis
2026-Aug-05, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组和基于网络的机器学习,识别骨关节炎中骨髓间充质干细胞相关的候选生物标志物及免疫相关性 | 创新性地结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、XGBoost)进行跨组织整合分析,构建了基于Firth惩罚逻辑回归的四基因组合模型,并探索了免疫细胞和信号通路的相关性 | 免疫细胞和Hallmark通路相关性在Benjamini-Hochberg校正后不再显著,且需要进一步的临床和组织特异性验证 | 识别骨髓间充质干细胞相关的骨关节炎候选生物标志物,并评估其诊断潜力和免疫相关性 | 骨髓间充质干细胞、滑膜组织、骨关节炎患者 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR | LASSO、SVM-RFE、XGBoost、Firth惩罚逻辑回归 | 基因表达数据(单细胞和批量) | 包含GSE147287(单细胞)、GSE55457、GSE55235、GSE55584(训练队列)和GSE12021(验证队列)等多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |