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当前共找到 688 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-24 |
Accurate prediction in reconstructed spatial transcriptomes does not ensure valid biological discovery
2026-Aug-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.19.733432
PMID:42395515
|
研究论文 | 本文提出了TIDEST框架，用于对重建的空间转录组进行统计上有效的推断，通过校准重建表达并调整潜在空间变异来控制差异表达分析中的假发现 | 首次指出重建空间转录组中预测准确性并不足以保证可靠的生物学发现，并提出了TIDEST框架，利用已测量基因校准重建表达并在差异表达分析前调整潜在空间变异 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 建立有效的统计推断方法，使重建的空间转录组能够产生可靠的生物学发现，避免将组织架构错误归因于生物学调控 | 小鼠和人类大脑、胶质母细胞瘤及乳腺癌的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤, 乳腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-24 |
An emergent disease-associated motor neuron state precedes cell death in ALS
2026-Aug-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.05.047
PMID:42335888
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研究论文 | 该研究通过纵向单核转录组、染色质可及性图谱和空间转录组学，在小鼠ALS模型中鉴定出一种与疾病相关的运动神经元状态，该状态在细胞死亡前出现 | 首次定义了“疾病相关运动神经元”（DMs）这一独特的细胞状态，揭示了从健康细胞向DMs转变的转录因子网络，并证明了该特征在人类ALS中的保守性及其与ALS遗传风险变异的关联 | 研究主要基于SOD1-G93A小鼠模型，其他ALS遗传亚型的适用性有待验证；人类数据主要来自单核RNA测序，缺乏纵向验证 | 定义肌萎缩侧索硬化症（ALS）中运动神经元变性的分子决定因素 | SOD1-G93A小鼠模型的脊髓运动神经元以及人类ALS脊髓组织 | 单细胞组学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-24 |
SPACE-seq integrates spatial transcriptomics and lineage tracing in native tissues
2026-Aug-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.05.017
PMID:42263684
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研究论文 | 本文提出SPACE-seq平台，将CRISPR谱系追踪与空间转录组学整合，在原生组织空间背景下同时解析细胞谱系、细胞状态和组织结构 | 首次将基于CRISPR的谱系记录与Slide-seq空间转录组学结合，实现在近细胞分辨率下原位同时解析谱系、细胞状态和组织结构，能够发现克隆相关细胞的瘤内转录多样化及肿瘤-基质互作 | 摘要中未明确说明该技术的局限性 | 开发一种整合CRISPR谱系追踪与空间转录组学的平台，以在原生空间背景下联合解析细胞谱系、细胞状态和组织结构 | 肿瘤组织中的克隆相关细胞及肿瘤-基质群体、肝脏发育过程中的肝母细胞 | 空间转录组学 | 癌症 | CRISPR谱系追踪、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、谱系条形码数据 | NA | Curio Bioscience | 空间转录组学 | Slide-seq | SPACE-seq（基于CRISPR条形码和Slide-seq的空间追踪），在近细胞分辨率下原位整合CRISPR谱系记录与空间转录组学 |
| 4 | 2026-09-24 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-cell Treatment Efficacy
2026-Aug-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0691
PMID:42112708
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析r/r DLBCL患者CAR T细胞输注产品，发现低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞疗效，并开发了一种体外制造策略 | 首次发现低强度I型干扰素信号作为CAR T细胞疗效的增强因子，且独立于共刺激信号；开发了一种体外制造过程中加入IFN-I、输注前去除IFN-I的新策略，避免体内毒性，兼容现有CAR结构和制造流程 | 样本量较小（仅8例患者），需要更大规模的临床验证；尚未进行体内临床试验验证该策略的安全性和有效性 | 揭示CAR T细胞治疗疗效的决定因素，并开发提高CD19靶向CAR T细胞治疗效果的新策略 | 8例接受axicabtagene ciloleucel治疗的复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的输注产品 | 单细胞转录组学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 文本 | 8例r/r DLBCL患者的输注产品 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-09-24 |
Single-cell analysis of HIV expression and integration sites reveals robust viral expression across diverse chromatin environments
2026-Aug-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00670-26
PMID:42379818
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序联合分析HIV感染的原代CD4 T细胞，探究HIV整合位点对病毒表达的影响 | 首次在同一细胞中同时测量HIV整合位点和病毒表达，利用scATAC-seq数据从1,530个细胞中恢复HIV整合位点信息并与scRNA-seq中的病毒RNA读数相关联，系统分析了15种不同染色质区室对HIV表达的影响 | 仅从117,610个感染细胞中的1,530个细胞恢复了整合位点信息，整合位点回收率较低，可能限制了分析的全面性 | 研究HIV前病毒整合位点的基因组特征对病毒表达和潜伏的影响，以及HIV整合对宿主基因表达的插入激活效应 | 117,610个HIV感染的原代CD4 T细胞，其中1,530个细胞成功恢复HIV整合位点信息 | 机器学习 | 艾滋病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观遗传数据 | 117,610个HIV感染的原代CD4 T细胞，其中1,530个细胞用于整合位点分析 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-09-24 |
Spatial transcriptomics maps early B-cell and T-cell activation in hidradenitis suppurativa
2026-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.01.041
PMID:41722764
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研究论文 | 该研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学分析，揭示了化脓性汗腺炎早期阶段即存在B细胞和T细胞激活，且这种免疫激活先于真皮隧道和三级淋巴结构形成 | 首次通过空间转录组学揭示化脓性汗腺炎早期阶段即存在强烈的真皮免疫激活，包括B细胞富集、17型T细胞通路激活和中性粒细胞浸润，且这些免疫激活发生在隧道或三级淋巴结构形成之前；发现早期病变中T细胞而非成纤维细胞是B细胞趋化因子CXCL13的主要产生者 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明化脓性汗腺炎中免疫激活的时间序列，确定免疫激活是先于还是跟随晚期结构形成 | 早期和晚期化脓性汗腺炎患者皮损组织，并与聚合性痤疮和银屑病进行比较 | 空间转录组学、单细胞转录组学 | 化脓性汗腺炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 156个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-24 |
Transcriptomic, Specific Marker, and Pathway Analysis of Smooth Muscle Cell Foam Cells Relative to Macrophage Foam Cells in Human Atherosclerosis
2026-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.27.728334
PMID:42282821
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人动脉粥样硬化中平滑肌细胞泡沫细胞与巨噬细胞泡沫细胞的转录组、特异性标志物及通路差异 | 首次系统比较了人动脉粥样硬化中平滑肌细胞泡沫细胞与巨噬细胞泡沫细胞的转录组特征，发现SMC泡沫细胞起源于纤维肌细胞（脂肌细胞），具有独特的标志物（SERPINE1/PAI-1和CFH）和生物学程序 | 样本来源于心脏移植受者的冠状动脉片段，仅涵盖早期至中期动脉粥样硬化阶段，未涉及晚期病变；SMC泡沫细胞的鉴定依赖于体外胆固醇加载标志物面板，可能存在一定偏差 | 确定平滑肌细胞泡沫细胞相对于巨噬细胞泡沫细胞的转录组、特异性标志物和生物学轨迹 | 心脏移植受者新鲜冠状动脉片段中的平滑肌细胞泡沫细胞和巨噬细胞泡沫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光显微镜 | NA | 图像, 文本 | 心脏移植受者的新鲜冠状动脉片段（具体数量未在摘要中说明），以及公开可用数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于新鲜冠状动脉段转录组分析，10x Xenium空间转录组学用于验证SMC泡沫细胞标志物 |
| 8 | 2026-09-23 |
Astatine 211-based conditioning with a humanized CD45 antibody for autologous hematopoietic stem cell gene therapy
2026-08-20, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2026033789
PMID:42224345
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研究论文 | 该研究使用人源化CD45抗体BC8标记α发射体砹-211（211At），在非人灵长类动物中评估CD45靶向放射免疫治疗（RIT）作为自体造血干细胞基因治疗前的清髓性预处理方案，并利用单细胞测序评估基因编辑效率 | 首次将α发射体211At标记的人源化CD45抗体用于非人灵长类动物自体造血干细胞基因治疗的预处理，替代传统全身照射清髓方案；开发了新的单细胞测序检测方法，能够精确评估多重基因编辑效率，发现传统批量分析低估了基因编辑细胞的频率 | 研究仅在非人灵长类动物中进行，尚未在人体临床试验中验证；样本量较小（共4只动物）；随访时间虽超过18个月，但长期安全性和有效性仍需进一步评估 | 评估基于211At的CD45靶向放射免疫治疗作为自体造血干细胞基因治疗前清髓性预处理方案的可行性和有效性，替代传统全身照射预处理 | 非人灵长类动物（猕猴） mobilized CD34+ 造血干细胞和祖细胞（HSPCs），经腺嘌呤碱基编辑器多重基因编辑（修饰HBG启动子重新激活胎儿血红蛋白并删除CD33） | 基因治疗 | 血液疾病 | 放射免疫治疗（RIT）、碱基编辑、单细胞测序 | NA | 序列数据 | 4只非人灵长类动物（2只接受300 μCi/kg，2只接受400 μCi/kg 211At） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-23 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving Metastasis and Immune Evasion
2026-08-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3134
PMID:42153907
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析上呼吸消化道鳞状细胞癌细胞及患者肿瘤，揭示ETS1作为主调控因子驱动混合上皮-间质转化程序，同时促进肿瘤转移和免疫逃逸。 | 首次发现ETS1作为混合上皮-间质转化程序的主调控因子，同时直接激活促转移基因和通过转录激活STAT1及CD274（PD-L1）塑造免疫冷肿瘤微环境，揭示了ETS1双重驱动肿瘤远端转移和免疫逃逸的新机制，并提名HSP90抑制剂（如alvespimycin）作为ETS1驱动肿瘤的靶向治疗策略。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 探究驱动肿瘤转移和免疫逃逸的转录瘤内异质性程序，以识别潜在的治疗和预防方法。 | 上呼吸消化道鳞状细胞癌细胞及患者肿瘤。 | 数字病理学 | 上呼吸消化道鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-23 |
Prenatal exposure to polystyrene nanoplastics impairs offspring fertility in mice by disrupting meiotic recombination and chromatin accessibility in oocytes
2026-08, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04371-6
PMID:42047698
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和多组学方法揭示了产前聚苯乙烯纳米塑料暴露通过破坏卵母细胞减数分裂重组和染色质可及性而损害后代生育能力的机制 | 首次发现产前纳米塑料暴露通过干扰组蛋白修饰（乙酰化降低、泛素化/SUMO化增加）和染色质可及性，破坏减数分裂轴组装和重组相关位点，并鉴定出停滞在偶线期的卵母细胞亚群发生凋亡和自噬，揭示了染色质重塑是纳米毒性的脆弱靶点 | 研究仅基于小鼠模型，未验证人类相关性；仅测试单一剂量（10 mg/kg/day）和单一粒径的PS-NPs；未评估多代效应；分子机制细节有待进一步验证 | 阐明产前PS-NPs暴露对雌性后代生育能力的跨代影响，并解析卵母细胞减数分裂缺陷背后的分子机制 | 产前暴露于聚苯乙烯纳米塑料的小鼠及其雌性后代卵母细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 生殖障碍 | 单细胞转录组测序, 单细胞ATAC测序, 功能细胞实验 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | NA |
| 11 | 2026-09-23 |
Cardiovascular toxicity of ethyl maltol exposure: a comprehensive investigation from virtual screening to experimental validation
2026-08, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04394-z
PMID:42047701
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、机器学习、分子对接与动力学模拟，以及体内外实验（含转录组和单细胞RNA测序），系统评估了乙基麦芽酚的心血管毒性，并确定HMOX1为核心靶点 | 首次揭示了乙基麦芽酚这一广泛使用的合成增味剂通过HMOX1驱动的炎症失调导致心血管毒性的风险，并建立了一个从虚拟筛选到实验验证的可转化范式用于食品添加剂和环境污染物安全性评估 | 未在摘要中明确说明 | 评估乙基麦芽酚的长期心血管安全性，并阐明其毒性作用的分子机制 | 乙基麦芽酚（一种广泛使用的合成增味剂）及其对心血管系统的影响 | 机器学习 | 心血管疾病 | 网络毒理学, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型, 分子对接模型, 分子动力学模拟 | 文本, 图像, 基因表达数据 | 小鼠（5、10、20 mg/kg乙基麦芽酚暴露）及人内皮细胞（10、20、40 μM乙基麦芽酚处理） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-23 |
Endothelial Continuum and Capillary Specialization in Pulmonary Vascular Development
2026-Aug, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.322483
PMID:42389786
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综述 | 本文综述了肺血管发育中内皮细胞的连续性及毛细血管特化，重点讨论了单细胞和空间转录组学揭示的内皮细胞动静脉转录谱及区域特异性身份 | 整合了单细胞和空间转录组学的最新进展，揭示了肺泡毛细血管内皮细胞类型1和2等新发现的异质性，并强调位置背景、血管口径和血流相关转录程序对内皮特化的影响 | 作为综述，缺乏原始实验数据，且新兴成像平台在连接分子身份与空间组织及动态细胞行为方面的应用仍处于探索阶段 | 总结肺血管形态发生、内皮命运特化及毛细血管多样化的当前理解，并探讨新兴成像平台如何帮助连接分子身份与空间组织及动态细胞行为 | 肺血管发育过程中的内皮细胞，特别是毛细血管床中的内皮细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-21 |
Programmed Clonal Expansion Associated with V(D)J Recombination Drives an ATM-Dependent Vulnerability Underlying Preferential Lymphocyte Depletion and Myeloid Bias Following DNA Damage
2026-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.05.743027
PMID:42760984
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研究论文 | 该研究系统表征了年轻成年小鼠在2 Gy电离辐射后48小时的急性造血反应，利用单细胞RNA测序揭示V(D)J重排相关的程序性克隆扩增导致淋巴细胞对DNA损伤的超敏性，并证明该过程依赖于ATM介导的DNA损伤应答 | 首次将DNA损伤后淋巴细胞的优先耗竭归因于V(D)J重排相关的程序性克隆扩增，并阐明这一发育阶段特异性脆弱性由ATM依赖性DNA损伤应答介导，为髓系偏向提供了机制解释 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；仅观察了2 Gy剂量和48小时时间点，缺乏剂量梯度和时间动态分析；ATM缺陷拯救实验的分子机制细节仍有待深入解析 | 阐明DNA损伤后淋巴生成优先受抑制及髓系偏向产生的机制 | 年轻成年小鼠的骨髓和胸腺造血系统 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻成年小鼠接受2 Gy电离辐射后48小时的骨髓和胸腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-09-21 |
Dynamic Landscape Analysis of cell fate decisions provides predictive models of neural development from single-cell data
2026-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003953
PMID:42647569
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研究论文 | 本文提出了动态景观分析（DLA）框架，整合动力系统理论，从单细胞数据中识别稳定细胞状态、映射转换路径并生成预测性细胞命运决策景观，应用于脊椎动物神经管发育并验证了其预测能力 | 首次将动力系统理论整合到单细胞数据分析中，生成预测性细胞命运决策景观，揭示了Shh引导的祖细胞特化具有初始 divergent 谱系通过多条不同路径汇聚到同一命运的意外拓扑结构，并能准确预测未见的动态信号条件下的细胞反应和命运分配 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 建立细胞命运决策的机制性理解，从单细胞数据中构建动态和预测模型，应用于发育生物学、干细胞治疗和再生医学 | 脊椎动物神经管发育过程以及人类胚胎类器官数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 动力系统理论模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-09-20 |
DeepPathway: predicting pathway expression from histopathology images
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag643
PMID:42647188
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研究论文 | 提出DeepPathway，一种基于对比学习的方法，从H&E组织病理图像预测通路表达水平 | 首次将预测目标从基因水平提升到通路水平，利用对比学习从H&E图像预测通路表达，并计算通路中各组成基因表达的汇总值作为输入 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 从廉价易得的H&E图像推断空间通路表达，以克服空间转录组技术成本高和数据获取困难的问题 | 多种癌症数据集、TCGA的H&E图像、脑肿瘤样本（哌莫硝唑缺氧染色作为金标准） | 数字病理学 | 肺癌，前列腺癌，脑肿瘤 | 空间转录组学，H&E染色 | 对比学习 | 图像，文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-09-20 |
st2traj: deconvolution-informed trajectory inference for multi-timepoint spatial transcriptomics
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag645
PMID:42658029
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研究论文 | 本文提出了st2traj，一种基于去卷积信息的轨迹推断框架，利用spot-state组成进行多时间点空间转录组轨迹推断 | 使用去卷积得到的spot-state组成而非归一化的spot级别表达进行多时间点空间轨迹推断，获得更平滑的轨迹场和更强的空间一致性 | 摘要中未明确说明 | 解决多时间点空间转录组中spot内细胞状态混合及切片间缺乏直接空间对应关系所导致的轨迹推断和生物学解释困难 | 人类心脏多时间点空间转录组数据、鸡心脏数据集（D7、D10和D14） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-09-20 |
Spatial Transcriptomics of Micropapillary, Plasmacytoid, and Sarcomatoid Urothelial Carcinoma Reveals Distinct Molecular Landscapes
2026-Aug-25, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2026.106160
PMID:42641761
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研究论文 | 利用空间转录组学技术对微乳头状、浆细胞样和肉瘤样尿路上皮癌进行分子分类和空间转录组分析，揭示其不同的分子景观 | 首次使用Bruker GeoMx数字空间分析仪对微乳头状、浆细胞样和肉瘤样尿路上皮癌进行空间转录组分析，揭示了这些亚型的共识分子分类和空间异质性 | 样本量较小（17个组织芯片核心，38个感兴趣区域），可能限制结果的普遍性 | 确定微乳头状、浆细胞样和肉瘤样膀胱尿路上皮癌的共识分子分类，并表征其空间转录组特征 | 17个福尔马林固定石蜡包埋的组织芯片核心，包括5个微乳头状、6个浆细胞样和6个肉瘤样尿路上皮癌样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 17个组织芯片核心（5个微乳头状，6个浆细胞样，6个肉瘤样），38个感兴趣区域 | Bruker | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | Bruker GeoMx数字空间分析仪，检测18,676个mRNA |
| 18 | 2026-09-20 |
Tumor-derived KLK5 activates TMEM158+ cancer-associated fibroblasts to induce CD8+ T cell exhaustion and confer immunotherapy resistance in lung cancer
2026-Aug-25, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101473
PMID:42759446
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研究论文 | 该研究通过单细胞和空间转录组学揭示了肺鳞癌中肿瘤来源的KLK5激活TMEM158⁺癌症相关成纤维细胞，进而诱导CD8⁺T细胞耗竭并导致免疫检查点阻断耐药 | 首次鉴定出TMEM158⁺癌症相关成纤维细胞亚群在肺鳞癌免疫检查点阻断非响应者中富集，并阐明了KLK5-TMEM158-SDCBP-MEK/ERK-ELK1-TNC/SPP1信号轴驱动免疫抑制微环境的机制 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 定义肺鳞癌中免疫检查点阻断耐药的微环境机制 | 接受新辅助抗PD-1治疗联合化疗的肺鳞癌患者手术标本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 多重免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-09-20 |
PD-1 regulates CD4+ T cell-mediated CD8+ T cell responses in the brain to balance viral control and neuroinflammation
2026-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76762-3
PMID:42744829
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研究论文 | 本文通过小鼠多瘤病毒感染模型，揭示PD-1在CD4+ T细胞中调控CD8+ T细胞应答，从而平衡脑内病毒控制与神经炎症的作用机制 | 发现PD-1缺失以脑自主方式发挥作用，且CD4+ T细胞而非CD8+ T细胞中PD-1的缺失可重现全局PD-1缺失的效果，阐明了CD4+ T细胞内在PD-1信号在平衡抗病毒防御与神经损伤中的关键作用 | 研究基于小鼠多瘤病毒模型，与人类JC多瘤病毒感染的PML可能存在种属差异，PD-1检查点免疫治疗结果可变的原因尚未完全阐明 | 探究PD-1在脑内多瘤病毒感染过程中如何调控T细胞应答，以及其在平衡病毒控制与神经炎症中的作用 | 小鼠多瘤病毒（MuPyV）感染的小鼠模型及脑浸润CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 进行性多灶性白质脑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-09-20 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Across Populations With Perianal Fistulizing Crohn's Disease Shows Proinflammatory CD4+ Macrophage Involvement in Disease Progression
2026-Aug-12, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101862
PMID:42586205
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，比较了伴有和不伴有肛瘘的直肠克罗恩病患者及健康对照者的直肠黏膜活检样本，揭示了促炎性CD4+巨噬细胞在肛瘘形成和疾病进展中的关键作用 | 首次在跨人群（非裔美国人和欧裔美国人）背景下，结合单细胞测序和空间转录组学技术，发现促炎性CD4+CD68+巨噬细胞在肛瘘型克罗恩病中形成大型聚集体并重塑固有层细胞网络，揭示了该细胞亚群在疾病严重程度和进展中的新机制 | 样本量相对有限（50例），未涉及其他种族人群，机制验证主要依赖体外类器官模型，缺乏体内功能实验验证 | 定义伴有和不伴有肛瘘的炎症性直肠克罗恩病在跨人群间的细胞和分子特征差异，以深入理解疾病严重程度和进展机制 | 50例个体的直肠黏膜活检样本，包括18例伴有肛瘘的直肠克罗恩病患者、25例不伴有肛瘘及其他肛周并发症的直肠克罗恩病患者、7例无黏膜疾病史的健康对照 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | 50例个体的直肠黏膜活检样本（共262k个细胞），包括18例肛瘘型克罗恩病、25例非肛瘘型克罗恩病和7例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |