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当前共找到 814 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-08-20
Single-cell transcriptome reveals keratinocyte subclusters contributing to altered differentiation and inflammatory responses in atopic dermatitis
2026-Jul-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了特应性皮炎中角质细胞亚群对分化和炎症反应的异常贡献 首次在特应性皮炎中揭示角质细胞分化的逆转终末过渡,主要由DK7细胞驱动,并识别出LAD特异性调控因子(APOD、LYZ、SERPINB4)及TWEAK信号通路 未提及 阐明特应性皮炎中角质细胞亚群在分化障碍和炎症反应中的作用机制 42名特应性皮炎患者的皮损和非皮损皮肤组织,以及23名健康对照的皮肤组织 单细胞转录组学、空间转录组学 特应性皮炎 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 42名AD患者(皮损和非皮损样本)和23名健康对照,共65例样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
162 2026-08-20
A machine learning-guided epithelial plasticity score refines prognostication and immune-context stratification in muscle-invasive bladder cancer
2026-Jul-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 开发了一种基于机器学习的上皮可塑性评分(EPRS),用于改善肌层浸润性膀胱癌的预后预测和免疫微环境分层。 首次将上皮可塑性轴与机器学习模型结合,构建EPRS评分,并通过多队列验证和单细胞分析揭示其与恶性上皮状态及免疫逃逸微环境的关系。 未提及具体限制,但可能受限于回顾性数据、样本异质性及外部验证队列的可用性。 开发上皮可塑性相关风险评分(EPRS),评估其在MIBC中的预后价值、生物学意义和免疫相关性。 肌层浸润性膀胱癌(MIBC)患者样本,包括TCGA-MIBC队列(368例)及外部验证队列GSE32894和GSE13507。 机器学习 膀胱癌 RNA测序、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫去卷积 Ridge回归模型 基因组数据(RNA-seq)、单细胞转录组数据 368例TCGA-MIBC病例,以及外部验证队列GSE32894和GSE13507(具体数量未在摘要中说明) NA RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
163 2026-08-20
Transcriptomic analysis of tissue-resident memory T cells of the fallopian tube reveals a precursor immune surveillance network for ovarian cancer prevention
2026-Jul-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序,分析输卵管组织驻留记忆样T细胞的转录组,揭示其作为卵巢癌预防的前体免疫监视网络 首次对输卵管组织驻留记忆样T细胞进行全面转录组分析,发现其与肿瘤浸润细胞存在显著克隆重叠,并鉴定出一个新的SIK3高表达亚群,具有表观遗传可塑性和代谢适应特征 样本量有限,功能验证主要基于类器官共培养实验,需进一步体内验证 阐明输卵管组织驻留记忆样T细胞在卵巢癌发生中的免疫监视作用及其治疗潜力 患者来源的配对的非癌性输卵管、转移性肿瘤和周围血中的组织驻留记忆样T细胞 单细胞转录组学 高级别浆液性卵巢癌 单细胞RNA测序、配对T细胞受体测序 NA 单细胞转录组和T细胞受体序列数据 未提供具体样本数量,涉及配对的输卵管、转移性肿瘤和血样 NA 单细胞RNA测序 NA NA
164 2026-08-20
Single cell multiomics unravel the transcription networks controlling the different EMT tumor states
2026-Jul-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学方法描绘了皮肤鳞状细胞癌中不同上皮间质转化肿瘤状态的转录和染色质景观,并鉴定了调控各状态的关键转录因子 结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,首次系统描绘了不同EMT状态的转录和染色质景观,并通过CRISPR/Cas9敲除功能研究鉴定出状态特异性的转录因子,揭示了它们在转移中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的验证较为初步,EMT动态过程的时序机制仍需进一步探索 解析皮肤鳞状细胞癌中EMT不同状态的转录调控网络,鉴定状态特异性转录因子及其在转移中的作用 小鼠皮肤鳞状细胞癌模型,以及小鼠胰腺腺癌和人类癌症样本 单细胞多组学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、CRISPR/Cas9基因编辑 NA 基因组数据 小鼠皮肤鳞状细胞癌模型,以及小鼠胰腺腺癌和人类癌症样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序
165 2026-08-20
FcγR- and CD9-dependent synapse-engulfing microglia in the thalamus drive cognitive impairment following cortical brain damage in mice
2026-Jul-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究报道了小鼠皮层脑损伤后,丘脑中依赖FcγR和CD9的吞噬突触的小胶质细胞驱动认知障碍 首次揭示丘脑而非海马中的反应性小胶质细胞变化在慢性期损害识别记忆,并发现CD9阳性小胶质细胞通过IgG/FcγRIII信号通路介导突触吞噬,为脑损伤后认知障碍提供新机制 研究主要在雌性小鼠中进行,可能未涵盖性别差异;机制验证依赖抗体阻断和基因操作,可能未完全模拟人类病理 探究皮层脑损伤后丘脑区域特异性小胶质细胞重塑如何导致认知功能障碍 小鼠模型中的丘脑和皮层小胶质细胞、突触和认知行为 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
166 2026-08-20
Single-cell spatial transcriptomics reveals hepatocyte reprogramming in Fontan-associated liver disease
2026-Jul-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学技术,分析了Fontan相关肝病(FALD)患者的肝脏组织,揭示了肝细胞重编程及其在疾病进展中的作用 首次将单细胞空间转录组学应用于FALD研究,发现了具有细胞应激和冗余区域特征的肝细胞亚群,并识别出异位WNT2信号作为驱动肝细胞区域化破坏的关键因素 样本量较小,仅包含两名FALD患者(早期和晚期纤维化各一例)用于单细胞空间转录组学分析,可能限制结果的普遍性 探究FALD进展的病理生理机制,特别是肝细胞区域化改变和细胞应激在疾病发展中的作用 FALD患者的肝脏外植体组织样本 空间转录组学、数字病理学 Fontan相关肝病 单细胞空间转录组学(CosMx空间分子成像)、原位杂交、免疫荧光 无特定模型(使用CellChat进行细胞通讯分析) 空间基因表达数据、免疫荧光图像 两例用于单细胞空间转录组学(早期和晚期纤维化各一例),另外18例用于免疫荧光验证 NanoString 空间转录组学 CosMx空间分子成像 CosMx空间分子成像系统,使用6000个基因的原位杂交
167 2026-08-20
Pulmonary mRNA-LNP vaccines for rapid and durable protection against bacterial infection
2026-Jul-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究报道了一种肺部递送的mRNA-LNP疫苗,能快速激活先天免疫并诱导适应性免疫,为细菌性肺部感染提供即时和持久的保护 设计了一种可电离脂质用于局部高表达,实现双阶段免疫应答(早期抗原非依赖性清除和后期抗原特异性保护),范式性地整合先天和适应性免疫 研究仅在雌性小鼠中进行,未涉及人体临床试验,且主要针对铜绿假单胞菌,对其他病原体的效果需进一步验证 开发一种肺部mRNA-LNP疫苗,以弥补疫苗接种后的免疫空白期,并提供快速和持久的抗菌保护 雌性小鼠及铜绿假单胞菌(实验室和临床耐药菌株) 免疫学 细菌性肺部感染 mRNA疫苗、脂质纳米颗粒(LNP)、单细胞转录组学、免疫分析 NA 单细胞转录组数据、免疫谱数据 雌性小鼠(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
168 2026-08-20
Targeting Cystine Addiction Suppresses Breast Cancer Lung Metastasis
2026-Jul-07, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究利用体内和体外MYC驱动的乳腺癌肿瘤模型,结合稳定同位素标记代谢组学、质谱成像和单细胞RNA测序,发现肺转移癌细胞通过增加胱氨酸摄取和谷胱甘肽合成来适应新微环境,并证实靶向胱氨酸/半胱氨酸代谢可增强放疗效果,抑制肺转移。 首次揭示乳腺肿瘤肺转移细胞对胱氨酸/半胱氨酸的依赖性增强,这种代谢脆弱性是由于转硫途径下调导致细胞内半胱氨酸合成减少,并证明胱(c)氨酸酶与放疗联合能有效减少肺转移负担。 摘要中未提及研究的具体局限性。 探索MYC驱动的乳腺癌肺转移过程中的关键代谢变化,并评估靶向这些代谢依赖性作为治疗策略的潜力。 MYC驱动的乳腺肿瘤细胞及其肺转移灶。 癌症代谢组学 乳腺癌 稳定同位素标记代谢组学、质谱成像、单细胞RNA测序、放疗 NA 代谢组学数据、质谱成像数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量。 10x Genomics 单细胞RNA测序、稳定同位素标记代谢组学、质谱成像 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于转录组分析;质谱成像用于代谢物空间分布;稳定同位素标记代谢组学用于代谢通量分析。
169 2026-08-20
STRESS: spatial transcriptomics resolution enhancing method based on the state-space model
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于状态空间模型的空间转录组分辨率增强方法STRESS,以提升空间表达模式分析的连续性 无需依赖组织学图像或单细胞参考,仅利用基因表达谱和空间坐标即可实现空间表达细化,采用3D状态空间建模同时捕捉空间依赖性和转录关系 未提及具体局限性,可能包括依赖基因表达和空间坐标的精度、未使用组织图像信息可能影响某些场景下的效果 开发一种无需参考数据的空间转录组分辨率增强框架,提高下游空间域鉴定的准确性和稳定性 不同平台和组织类型的空间转录组数据集 深度学习 不适用 空间转录组学 状态空间模型 基因表达谱和空间坐标数据 多个数据集,具体数量未提及 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
170 2026-08-20
Influenza-induced tuft cell expansion is associated with changes in ILC2 populations in the distal lungs of mice
2026-Jul, Physiological reports IF:2.2Q3
研究论文 本文研究了流感感染后小鼠远端肺中异位簇细胞与ILC2群体的变化及其相互调节关系 首次揭示流感损伤后远端肺异位簇细胞与ILC2之间存在双向调节轴,并发现簇细胞缺失可改变ILC1和ILC3的扩增 结果仅基于小鼠模型,需进一步验证在人类中的适用性 探究流感损伤后远端肺异位簇细胞在塑造固有免疫反应中的功能 小鼠远端肺组织及免疫细胞群体(簇细胞、ILC1、ILC2、ILC3) 数字病理学 流感 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肺组织样本,具体数量未在摘要中给出 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3' 试剂盒
171 2026-08-19
Kinase Plasticity with Vandetanib Treatment Enhances Sensitivity to Tamoxifen in Estrogen Receptor Positive Breast Cancer
2026-Jul-28, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1
研究论文 研究表明凡德他尼治疗通过抑制MAPK信号通路,增强雌激素受体阳性乳腺癌对内分泌治疗的敏感性,并揭示适应性耐药机制及联合治疗潜力 首次发现凡德他尼可重编程激酶网络,上调PI3K和HER2活性作为共享耐药机制,并联合拉帕替尼进一步增强敏感性;利用手术室到实验室的短期离体实验结合单细胞RNA测序验证了临床相关变化 未来需评估敏感性特征是否能预测ER+乳腺肿瘤患者的反应,并进一步研究联合靶向HER2信号在凡德他尼治疗中的作用 探索凡德他尼在雌激素受体阳性乳腺癌中增强内分泌治疗敏感性的机制,并开发预测性生物标志物 ER+乳腺癌细胞系、患者来源类器官、异种移植模型及原代肿瘤细胞 癌症研究 乳腺癌 MIB/MS, 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 NA 基因表达数据, 蛋白质组学数据, 染色质结合数据 细胞系、患者来源类器官及原代肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
172 2026-08-19
Leveraging the genetics of human face shape boosts the discovery of orofacial cleft risk loci
2026-Jul-22, HGG advances
研究论文 本研究利用人脸形状的遗传信息,通过多效性-informed GWAS方法(cFDR-GWAS)提高了非综合征性口面裂风险位点的发现能力 创新性地应用cFDR-GWAS方法,整合正常面部形态和口面裂的遗传关联信号,发现了多个新的风险位点 样本量有限,且部分新位点未在独立队列中重复验证 通过多效性分析增强口面裂风险位点的发现能力,并揭示其与面部形态的共同遗传基础 欧洲人群的个体,包括正常面部形态和 nsCL/P 患者 遗传学 口面裂 GWAS(全基因组关联研究) cFDR(条件错误发现率)模型 基因组数据(GWAS 汇总统计) 正常面部形态 GWAS:n=4,680 和 n=3,566;nsCL/P GWAS:n=3,969;独立验证队列未具体说明 NA 微阵列(基因分型) NA NA
173 2026-08-18
Human single-cell atlas of proliferative diabetic retinopathy reveals a SOX15-overexpressing stromal population driving retinal fibrosis through the endothelin-1 -EDNRB axis
2026-Jul-22, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建人类增殖性糖尿病视网膜病变的单细胞图谱,揭示SOX15过表达的基质细胞群通过内皮素-1-EDNRB轴驱动视网膜纤维化的新机制 首次构建人类PDR视网膜的单细胞转录组图谱,并发现SOX15-EDN1-EDNRB轴是驱动视网膜纤维化的新机制,为抗纤维化治疗提供新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体内的长期效应和临床转化仍需进一步验证 阐明PDR中视网膜纤维化的关键细胞机制,寻找有效的抗纤维化治疗策略 人类PDR视网膜组织、非糖尿病对照视网膜、小鼠模型及体外培养的成纤维细胞 单细胞转录组学 增殖性糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序、免疫荧光、条件性基因敲除、siRNA敲低、药物拮抗剂 scRNA-seq分析、条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、图像数据 PDR器官捐献者和非糖尿病对照的视网膜组织,具体数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA-seq NA NA
174 2026-08-18
Dissecting human organ development using spatial technologies
2026-Jul-08, Developmental cell IF:10.7Q1
综述 综述空间技术如何通过分子谱分析揭示人类器官发育中的基因调控、细胞互作与组织结构,并探讨将空间谱分析与类器官结合的方法及未来方向 系统整合了空间多组学、类器官模型与机器学习,提出通过结合空间分析与可操控类器官系统来推进发育生物学的机制性和预测性研究 人类发育组织获取受限和伦理约束限制了实验验证及机制研究,类器官模型可能不能完全重现体内器官发育的复杂性 总结当前空间技术及其在人类器官发育研究中的应用,并突出类器官集成与未来整合策略以促进机制性和预测性发育生物学 人类胚胎和胎儿器官,以及干细胞衍生的类器官模型 空间转录组学 不适用 空间转录组学、空间表观基因组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间多组学 不适用 空间分子谱数据(转录、表观、蛋白质、代谢) 不适用 不适用 空间转录组学、空间表观基因组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间多组学 不适用 不适用
175 2026-08-18
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analyses Identify a B Cell- and Plasma Cell-Associated Prognostic Signature and a Candidate Tumor-Suppressive Role for FUT8 in Ovarian Cancer
2026-07-08, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别卵巢癌中B细胞和浆细胞相关的预后特征,并探索FUT8基因的潜在肿瘤抑制作用 首次将单细胞和批量转录组数据整合,构建B细胞和浆细胞相关的预后模型,并揭示FUT8在卵巢癌中的潜在肿瘤抑制功能 需要进一步的实验研究来验证和阐明涉及的精确分子机制 探讨卵巢癌中糖基化相关调节因子在肿瘤微环境中的功能,特别是FUT8在卵巢癌发展中的潜在作用 卵巢癌组织和正常卵巢组织的单细胞转录组数据,以及来自TCGA和GSE63885的批量转录组数据 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR、CCK-8实验、流式细胞术 预后模型 单细胞转录组数据和批量转录组数据 12个卵巢癌和正常卵巢组织样本(GSE184880),TCGA队列和GSE63885队列 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
176 2026-08-18
Multiomics Insights Into the Role of Spondin-1 in the Pathogenesis and Prognosis of Atrial Fibrillation
2026-Jul-07, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 通过整合多组学方法,本研究识别出Spondin-1在心房颤动发病机制和预后中的潜在作用 采用多层遗传筛选结合孟德尔随机化和共定位分析,首次将SPON1确定为AF的候选靶点,并通过单核RNA测序、空间转录组学及实验验证进行深入表征 研究主要基于遗传关联和生物信息学分析,实验验证仅针对成纤维细胞表型,临床关联分析局限于UK Biobank队列,可能受未测量混杂因素影响 利用整合多组学方法识别心房颤动的新型蛋白靶点 心房颤动患者及UK Biobank队列中的个体,包括血浆蛋白水平、心脏磁共振表型和成纤维细胞 多组学、遗传学、转录组学 心房颤动 孟德尔随机化、共定位分析、单核RNA测序、空间转录组学 NA 遗传数据、转录组数据、蛋白组数据、临床表型数据 UK Biobank队列39,372名个体 10x Genomics 单核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 用于单核RNA测序和空间转录组学分析
177 2026-08-18
Inflammatory and Structural Endotypes of Human Atherosclerotic Plaque Revealed by Integrated Transcriptomic Analysis
2026-07-02, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示人类动脉粥样硬化斑块中与不稳定和稳定表型相关的炎症性和结构性内型 首次将批量转录组与单细胞转录组数据整合,将炎症和结构信号映射到特定细胞区室和调控网络,提出动脉粥样硬化斑块的炎症性和结构性内型框架 未明确提及局限性,但研究依赖于公开数据集,可能受样本异质性和批次效应影响 识别与稳定和不稳定动脉粥样硬化斑块表型相关的协调转录程序,并映射到具体细胞类型和调控网络 人类颈动脉斑块和冠状动脉粥样硬化病变 生物信息学、转录组学 动脉粥样硬化 批量RNA测序、单细胞RNA测序 limma、clusterProfiler、Seurat模块评分、decoupleR、DoRothEA 转录组数据(bulk RNA-seq和scRNA-seq) 来自GSE120521的稳定和不稳定人类颈动脉斑块样本,以及来自GSE131778的人类冠状动脉粥样硬化病变样本(具体数量未在摘要中提供) NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
178 2026-08-18
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-07, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,识别出TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境,并与不良预后及免疫治疗反应相关 首次揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中的关键免疫抑制功能,并通过药理学抑制TREM1增强抗PD-1治疗效果 研究主要基于临床样本和临床前模型,需进一步验证TREM1靶向治疗在临床试验中的安全性和有效性 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群,并评估其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织中的中性粒细胞亚群及临床前模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫荧光染色 NA 图像,基因表达数据 包含肝细胞癌患者队列及临床前模型,具体样本数量未在摘要中提供 10x Genomics, Fluidigm 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 10x Chromium, CyTOF 10x Chromium用于单细胞RNA测序,流体igm CyTOF系统用于质谱流式细胞术分析
179 2026-08-18
IL15-mediated crosstalk between LSECs and CD8⁺ tissue-resident memory T cells drives alcohol-associated hepatitis
2026-Jul-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了酒精相关性肝炎中肝窦内皮细胞与CD8组织驻留记忆T细胞之间的IL15介导的相互作用,促进了T细胞活化及肝损伤 首次发现并验证了肝窦内皮细胞通过IL15信号通路放大AKT途径,促进CD8组织驻留记忆T细胞的持续存在和炎症活性,并提出了靶向IL15-LSEC-AKT轴的治疗策略 主要基于小鼠模型和体外实验,人类数据仅限于公共数据集的再分析和免疫组化验证,样本量有限,可能需要进一步临床试验确认 阐明酒精相关性肝炎中组织驻留记忆T细胞的功能及其与肝窦内皮细胞的相互作用机制 小鼠和人类的肝脏及血液免疫细胞,特别是CD8 T细胞亚群和肝窦内皮细胞 免疫学 酒精相关性肝炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化,体外共培养,流式细胞术 NA 基因表达数据,序列数据,图像数据 小鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
180 2026-08-18
EPHX2 Orchestrates Intestinal Epithelial Barrier Repair in Ulcerative Colitis: An Integrated Multi-Omics and Experimental Study
2026-07, Clinical and translational science
研究论文 本研究整合多组学数据与实验验证,发现EPHX2在溃疡性结肠炎中调控肠道上皮屏障修复的关键作用 结合GWAS-eQTL与单细胞转录组数据筛选出UC因果基因EPHX2,并通过结肠炎小鼠和体外炎症模型验证其功能,揭示其在黏膜愈合中的新机制 摘要未提及研究局限性 探究溃疡性结肠炎的遗传决定因素,特别是EPHX2在肠道上皮屏障修复中的作用 溃疡性结肠炎患者及结肠炎小鼠模型的肠道上皮细胞 基因组学 溃疡性结肠炎 GWAS-eQTL分析、单细胞转录组测序、基因集富集分析、功能实验 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、动物模型数据 摘要未提及具体样本量 NA 单细胞转录组测序 NA NA
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