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当前共找到 814 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-09-04 |
Immune hallmarks of recurrent immune checkpoint inhibitor-mediated inflammatory arthritis
2026-Jul-31, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1639
PMID:42536056
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研究论文 | 通过纵向分析免疫检查点抑制剂介导的炎症性关节炎患者的滑液样本，揭示其复发的免疫机制 | 首次对复发性免疫检查点抑制剂相关关节炎进行纵向单细胞分析，发现效应CD8+ T细胞和PD-1hiCXCL13hiCD4+ T细胞在第一和第二次复发事件中共享克隆扩增的特征 | 样本量较小（6例患者），且机制研究主要在转录水平，可能需进一步功能验证 | 阐明复发性免疫检查点抑制剂相关炎症性关节炎的细胞和分子机制，特别是免疫记忆反应的作用 | 免疫检查点抑制剂相关炎症性关节炎患者（首次和第二次发作）的滑液细胞 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组和单细胞免疫组库数据及流式细胞术数据 | 6例ICI-IA患者的12份滑液样本，以及6例非癌症骨关节炎患者的滑液样本作为阴性对照 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-09-04 |
Longitudinal analysis reveals myeloid cell contributions to murine neuroPASC pathogenesis
2026-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76156-5
PMID:42669720
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研究论文 | 对SARS-CoV-2感染小鼠进行纵向单细胞RNA测序分析，揭示髓系细胞在神经PASC发病机制中的贡献 | 首次通过纵向单细胞RNA测序分析，绘制了神经PASC期间大脑髓系免疫动态的高分辨率图谱，并揭示了微胶质细胞在维持慢性神经炎症中的核心作用 | 由于是基于小鼠模型的研究，结果可能不完全适用于人类神经PASC | 探究神经PASC中髓系细胞（特别是微胶质细胞）对神经炎症起始和持续的作用机制 | SARS-CoV-2感染小鼠的大脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 神经PASC（COVID-19后神经精神后遗症） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自0、6、30和100天感染后时间点的脑免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-09-04 |
Role and prognostic value of N6-methyladenosine RNA modification regulators in glycolytic reprogramming during sepsis
2026-Jul-30, Journal of intensive care
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s40560-026-00920-4
PMID:42675521
|
研究论文 | 本研究整合多个脓毒症转录组队列数据，分析m6A RNA修饰调节因子在脓毒症中的表达及其与糖酵解重编程和预后的关联。 | 首次系统阐明ALKBH5相关m6A修饰与脓毒症糖酵解重编程的关联，并构建了基于m6A相关基因的预后模型。 | 研究结果基于生物信息学分析，缺乏前瞻性实验验证，且预后模型的外部可重复性不完全，需在更大临床队列中验证。 | 探讨脓毒症中m6A调节因子表达特征及其与糖酵解重编程的关联，并评估其预后价值。 | 脓毒症患者转录组数据、ALKBH5敲除模型、MeRIP-seq数据及单细胞RNA测序数据。 | 机器学习和生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序、MeRIP-seq、单细胞RNA测序、基因敲除模型 | LASSO-Cox回归模型、CIBERSORT免疫浸润分析 | 转录组测序数据、MeRIP-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个GEO队列（GSE65682, GSE95233, GSE54514, GSE198316, GSE224650, GSE225143, GSE147363），具体样本数未在摘要中提供。 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、MeRIP-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-09-04 |
Single-cell profiling of natural killer/T-cell lymphoma reveals stratified immune features and potential therapeutic implications
2026-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76152-9
PMID:42660902
|
研究论文 | 通过对63个样本进行单细胞RNA测序并整合空间转录组、批量转录组、蛋白质组和代谢组数据，绘制了自然杀伤/T细胞淋巴瘤的分子图谱，揭示了四种分子亚型及其独特的免疫和代谢特征，为患者分层和治疗策略提供见解 | 首次在自然杀伤/T细胞淋巴瘤中整合单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组及代谢组等多组学数据，系统解析肿瘤间和肿瘤内异质性，并定义了与不同分子和免疫特征关联的四种功能元程序 | 基于标题和摘要，未明确提及研究的具体局限性 | 解析自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤细胞异质性及其与免疫微环境的相互作用，并探索不同分子亚型在治疗应答上的潜在意义 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者的肿瘤样本及肿瘤微环境中的免疫细胞等 | 单细胞组学 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 63个样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2026-09-04 |
Multi-omic analysis of androgen-deprived human testes reveals Sertoli cell regulation and niche reprogramming
2026-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76120-3
PMID:42660954
|
research paper | 该研究利用去雄激素的人睾丸组织，构建了整合单核RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组的多组学图谱，揭示了支持细胞的功能调控和微环境重编程机制 | 首次在人类去雄激素模型中构建多组学图谱，发现NRG2作为雄激素依赖的微环境因子促进精原细胞增殖，并发现去雄激素导致间质细胞异位表达WT1并重编程为支持细胞样状态 | 研究基于去雄激素组织，可能无法完全反映自然衰老或疾病状态下的变化，且涉及伦理和技术限制，样本数量有限 | 探究雄激素调控成人睾丸功能的分子机制，为雄激素相关性不育和生殖疾病的治疗提供资源 | 去雄激素处理的人成人睾丸组织，研究其中的支持细胞、间质细胞和精原细胞 | digital pathology | 不育 | 单核RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组 | NA | 基因表达数据、开放染色质数据、空间表达数据 | 未提供具体样本量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-09-04 |
Mechanistic study on comorbidities of kidney stones and sepsis using transcriptome sequencing combined with single-cell spatial transcriptome sequencing
2026-Jul-17, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049779
PMID:42469985
|
研究论文 | 本研究利用转录组测序和单细胞空间转录组测序技术探究肾结石与脓毒症共病的分子机制，并筛选关键基因 | 首次结合转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据，系统分析肾结石与脓毒症共病的分子调控网络，并鉴定出5个关键基因及其细胞类型特异性表达模式 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本量可能有限；分子对接和药物预测结果需要进一步体内外实验证实 | 探索肾结石与脓毒症共病的分子调控网络，筛选关键基因并阐明其在疾病进展中的作用 | 肾结石和脓毒症患者的转录组、单细胞RNA测序及空间转录组数据 | 转录组学 | 肾结石、脓毒症 | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 随机森林、LASSO回归 | 转录组数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | 未在标题和摘要中提供具体样本数量 | NA | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 数据来源于基因表达综合数据库，具体平台未说明 |
| 107 | 2026-09-04 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2026-Jul-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.05.007
PMID:42314682
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序定量描绘紧急髓系造血的分子图谱，揭示造血干细胞和祖细胞激活的保守模块 | 提出了可推广的细胞注释方法HemaScribe和精细化的造血分化定量模型HemaScape，并首次系统比较多种紧急髓系造血诱导剂，发现跨炎症挑战保守的髓系祖细胞激活模块，且该模块在人类中保守并可预测急性髓系白血病预后 | 摘要未提及局限性 | 探究不同紧急髓系造血诱导剂如何通过共享或独特的分子机制调控造血干细胞和祖细胞 | 小鼠造血干细胞和祖细胞（HSPCs），以及人类成人和儿童急性髓系白血病相关数据 | 单细胞转录组学、造血生物学 | 急性髓系白血病（成人和儿童） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | HemaScribe（细胞注释方法），HemaScape（造血分化定量模型） | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠HSPCs样本，以及人类急性髓系白血病样本的跨验证数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-09-04 |
Characteristics of Splenic CD8αβ+ γδT Cells in Plasmodium yoelii Infection
2026-Jul, Parasite immunology
IF:1.4Q3
DOI:10.1111/pim.70091
PMID:42390699
|
研究论文 | 本研究探讨了约氏疟原虫感染小鼠脾脏中CD8αβ+ γδT细胞的特征，发现其活化与功能增强，可能参与抗疟疾免疫应答。 | 首次详细表征了疟疾感染中CD8αβ γδT这一特定亚群的表型和功能特性，揭示了其向IFN-γ产生型极化并上调DNA复制修复相关基因。 | 研究基于小鼠模型，未探讨CD8αβ γδT细胞在人疟疾感染中的确切功能；样本量有限，且未进行功能验证实验。 | 明确CD8αβ γδT细胞在约氏疟原虫感染中的频率变化、表型特征和功能作用及潜在机制。 | 约氏疟原虫感染的C57BL/6小鼠脾脏中的CD45+淋巴细胞，特别是CD8αβ γδT细胞。 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞（免疫细胞） | 共使用若干只雌性C57BL/6小鼠（具体数量未在摘要中指定） | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 109 | 2026-09-04 |
Therapeutic effects of Icariside II on radiation cystitis: revealing the mechanistic role of the FN1/Itgαvβ6-PI3K/AKT signaling pathway using single-cell RNA sequencing
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000005212
PMID:42682324
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示放射性膀胱炎的细胞异质性，并阐明淫羊藿次苷II通过调节FN1/Itgαvβ6-PI3K/AKT信号通路发挥治疗作用的机制 | 首次通过单细胞RNA测序描绘放射性膀胱炎的膀胱细胞图谱，识别出16种细胞类型，并发现FN1-Itgαvβ6相互作用是纤维化进展的关键驱动因素，同时验证了淫羊藿次苷II作为潜在治疗药物的作用 | 该研究基于大鼠模型，其发现需要进一步在人类样本中验证；未提供充分的体内疗效数据，且对ICA II的长期安全性评估不足 | 阐明放射对膀胱不同细胞类型的影响，并探究淫羊藿次苷II在放射性膀胱炎治疗中的保护作用及潜在分子机制 | 放射性膀胱炎大鼠模型中的膀胱细胞，以及淫羊藿次苷II对细胞间相互作用的影响 | 单细胞测序 | 放射性膀胱炎 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 实验使用大鼠模型，具体样本数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-09-04 |
RUNX3+ basal-like malignant cells: architects of an immunosuppressive microenvironment in bladder cancer: a comprehensive bioinformatics analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000005103
PMID:42682391
|
研究论文 | 本研究通过对膀胱癌单细胞和空间转录组数据进行综合分析，揭示了RUNX3+基底样恶性细胞在免疫抑制微环境中的重要作用及其作为预后标志物的潜力 | 整合多个公开的单细胞RNA-seq数据集，并结合单核和空间转录组数据验证，首次识别出RUNX3调控的基底样恶性细胞亚群及其通过MIF-CD74信号通路与免疫细胞互作的机制 | 研究主要基于公开数据集和生信分析，缺乏实验验证的深度，且样本来源的异质性可能影响结果的普适性 | 利用单细胞和空间转录组学技术，深入解析膀胱癌的细胞异质性，识别可靠的预后生物标志物，并为个体化治疗策略提供依据 | 膀胱癌和正常样本中的恶性上皮细胞、免疫细胞（如CD8 T细胞、IL7R+初始T细胞、FCN1+单核细胞）及其微环境 | 生物信息学分析、单细胞转录组学、空间转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组测序、RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据（单细胞、单核、空间） | 62个膀胱癌和正常样本，超过530,000个细胞 | 10x Genomics, Illumina, NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Transcriptomics |
| 111 | 2026-09-04 |
Potential of RAD51C as a hub gene and therapeutic target in bladder cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000005112
PMID:42682403
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研究论文 | 通过生物信息学与实验分析，揭示RAD51C作为膀胱癌枢纽基因和治疗靶点的潜力 | 结合多算法机器学习与单细胞RNA测序，识别CREB-c-Jun转录因子靶向关键基因，并首次提名RAD51C作为膀胱癌治疗靶点 | 未提供明确的局限性说明 | 评估CREB-c-Jun转录因子靶向基因在膀胱癌预后及免疫治疗反应中的作用，并探索RAD51C作为治疗靶点的可行性 | 膀胱癌细胞系、肿瘤组织样本、基因表达及突变数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、机器学习 | 多算法机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-09-03 |
Single-cell analysis of the progeria arterial wall reveals progerin-induced progressive, cell type-specific dysfunction and somatic mutation accumulation
2026-Jul-31, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01719-6
PMID:42538566
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早衰症小鼠主动脉弓细胞，揭示progerin诱导的细胞类型特异性功能障碍和体细胞突变积累。 | 首次在单细胞水平揭示HGPS中血管平滑肌细胞特有的体细胞突变积累及细胞类型特异性分子动态变化。 | 未提及明确局限性。 | 阐明HGPS中渐进性血管变性的分子机制，并构建可搜索的scRNA-seq数据库。 | LmnaG609G/G609G小鼠主动脉弓细胞（包括血管平滑肌细胞和成纤维细胞）。 | 单细胞转录组学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序（Smart-seq2）、组织学、免疫染色、原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据、形态学图像 | 多年龄段的LmnaG609G/G609G小鼠主动脉弓细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | NA |
| 113 | 2026-09-03 |
Unify learns cellular evolution with universal multimodal embeddings
2026-07-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76230-y
PMID:42669747
|
研究论文 | 提出了一种名为Unify的迁移学习方法，通过整合RNA表达与蛋白质语言模型嵌入，学习通用多模态大基因，实现跨物种单细胞数据整合与细胞进化分析 | 创新性地结合蛋白质语言模型和通用语言模型嵌入，定义功能连贯的多模态大基因，超越了严格的基因同源性依赖，能够跨越巨大进化距离进行跨物种比较 | 摘要未明确提及局限性 | 开发一种能够跨物种整合单细胞RNA测序数据并重建细胞类型进化树的方法 | 跨物种的单细胞RNA测序数据，包括进化距离超过7亿年的物种 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据和蛋白质嵌入 | 涉及多个物种，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-09-03 |
LyP vs advanced-stage CTCLs: single-cell profiling reveals markers of self-limited vs aggressive disease behavior
2026-07-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017533
PMID:42085604
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析自限性淋巴瘤样丘疹病（LyP）与晚期皮肤T细胞淋巴瘤（aCTCL）的转录组差异，揭示与疾病自限行为相关的标志物。 | 首次通过单细胞测序比较LyP与多种致命性aCTCL亚型，发现LyP恶性克隆呈现高活化细胞毒性表型及独特的SPP1+巨噬细胞微环境，为理解CTCL谱系中自限与侵袭性行为提供新视角。 | 样本量有限，且研究基于转录组数据，缺乏功能验证实验；未涵盖所有CTCL亚型，结论的普适性需进一步验证。 | 探究LyP自限性消退与aCTCL侵袭性进展的分子机制，寻找潜在生物标志物和治疗靶点。 | 来自LyP（CD4+、CD8+、TCR-γδ+克隆表型）和aCTCL（CD4+蕈样肉芽肿、CD8+原发皮肤侵袭性嗜表皮性CD8+细胞毒性T细胞淋巴瘤、TCR-γδ+蕈样肉芽肿）患者的组织样本。 | 单细胞转录组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖LyP和aCTCL患者样本，具体数量未在摘要中说明。 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-09-03 |
Postnatal Iron Supplementation Fails to Fully Rescue Brain Metal and Transcriptional Defects Caused by Nutrition-Based Gestational Iron Deficiency
2026-Jul-18, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2026.101730
PMID:42471123
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研究论文 | 本研究探讨了产后铁补充对妊娠期铁缺乏引起的大脑金属稳态和转录缺陷的修复效果，发现补充不能完全逆转这些缺陷。 | 首次系统评估了产后不同时间点铁补充对妊娠期铁缺乏小鼠大脑金属稳态和长期基因表达的影响，并结合空间转录组学分析。 | 研究主要基于小鼠模型，且样本量有限，可能不完全反映人类情况；未涉及其他营养因素或长期行为学评估。 | 确定产后铁补充的时机如何影响妊娠期铁缺乏后的大脑金属稳态和长期基因表达。 | 妊娠期铁缺乏小鼠模型，包括三个组：营养铁正常对照组、出生时补铁组和出生后第7天补铁组，分析大脑皮层和海马组织。 | 神经科学 | 铁缺乏相关神经系统疾病 | 电感耦合等离子体质谱、空间转录组学 | 线性模型、细胞类型反卷积、基因集富集分析 | 金属浓度数据、转录组数据 | 每组7至19只小鼠，来自至少3窝；空间转录组学每组3只雄性小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-09-03 |
Macrophage signaling associates with fibrogenic program activation in periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2026-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199226
PMID:42024458
|
研究论文 | 本研究采用多组学方法整合空间转录组学、RNA-Seq和蛋白质组学，表征小儿原发性硬化性胆管炎的纤维化胆管周围区域及其细胞间通讯，发现巨噬细胞亚群与肝星状细胞活化相关 | 首次在小儿原发性硬化性胆管炎中应用多组学整合方法，结合空间转录组学、RNA-Seq和蛋白质组学，揭示巨噬细胞与肝星状细胞之间的潜在相互作用，并识别出17个巨噬细胞纤维化驱动基因和6个肝星状细胞效应基因 | 样本量有限，需要进一步功能验证以确证巨噬细胞亚群对肝星状细胞纤维化激活的因果关系 | 阐明小儿原发性硬化性胆管炎中胆管周围纤维化的细胞间通讯机制 | 小儿原发性硬化性胆管炎的肝脏组织样本，包括巨噬细胞亚群、胆管细胞、淋巴细胞和肝星状细胞 | 空间转录组学、多组学整合 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、RNA-Seq、蛋白质组学、免疫荧光、二次谐波成像 | NA | 空间转录组数据、RNA测序数据、蛋白质组数据、图像数据 | 涉及PSC患者和健康对照的肝脏组织和血浆样本，具体数量未在摘要中提供 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-09-03 |
Deciphering MFAP5+ Fibroblasts in Pancreatic Cancer Progression via Multi-Regional Single-Cell RNA Sequencing With Experimental Validation
2026-07, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70114
PMID:41995689
|
研究论文 | 通过多区域单细胞RNA测序和实验验证，揭示MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌进展中的作用机制 | 首次利用多区域单细胞RNA测序技术系统解析胰腺癌中MFAP5+成纤维细胞的生物学特性，并结合多色免疫荧光验证其与内皮细胞的促肿瘤相互作用 | 研究主要基于体外和组学数据，缺乏体内功能实验验证；样本量有限，需进一步扩大验证 | 阐明MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌微环境中的功能、空间分布及细胞间通讯机制 | 胰腺导管腺癌组织中的MFAP5+成纤维细胞、FABP4+内皮细胞及VWF+内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、伪时间分析、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 59,829个细胞，整合自有数据集（GSE285264）和公共数据集（GSE277782, GSE155698, GSE212966） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-09-02 |
RETROFIT: Reference-free deconvolution of cell-type mixtures in spatial transcriptomics
2026-Jul-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74928-7
PMID:42642366
|
研究论文 | 介绍了一种名为RETROFIT的无参考空间转录组数据解卷积方法，该方法直接基于测序数据进行贝叶斯推断，无需匹配单细胞参考或标记基因，并能有效恢复细胞类型特异性的空间组织。 | RETROFIT不需要单细胞参考或标记基因，直接从测序测量中操作，仅在事后注释阶段结合外部信息，并能在接近单细胞分辨率下工作，如Visium HD数据。 | 文中未明确提及局限性，但可能依赖于测序数据的质量以及事后注释的准确性。 | 开发一种无参考的空间转录组数据解卷积方法，以解析细胞类型混合信号，从而揭示细胞类型特异性的空间组织和转录程序。 | 空间转录组数据，包括模拟数据和多种真实数据集，以及Visium HD数据。 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据（空间转录组） | 模拟数据和多个真实数据集（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Visium HD |
| 119 | 2026-09-02 |
Spatial transcriptomics reveals distinct cell type dynamics following opioid dependence in female mice with the common human μ-opioid receptor variant Oprm1 A118G
2026-Jul-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75723-0
PMID:42637754
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示携带常见人类μ-阿片受体变体Oprm1 A118G的雌性小鼠在阿片依赖过程中不同细胞类型的动态变化 | 首次在空间转录组水平上揭示Oprm1 A118G基因型对阿片依赖中胶质细胞而非神经元转录状态的显著影响，并将基因风险与解剖学组织的胶质、神经元及网络功能变化联系起来 | 未提供明确的局限性信息 | 探究Oprm1 A118G变体如何影响阿片依赖的细胞和分子基础 | 携带Oprm1 A112G突变（对应人类A118G）的雌性小鼠，包括有和无吗啡依赖状态的个体 | 空间转录组学 | 阿片使用障碍 | 单核空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2026-09-02 |
Distinct cell type-specific mechanisms underlie cognitive dysfunction during persistent integrated stress response activation
2026-Jul-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537017123
PMID:42446983
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序，构建了小鼠大脑的综合应激反应图谱，揭示了细胞类型特异性机制在认知功能障碍中的作用 | 首次构建了持久性整合应激反应激活的大脑单细胞图谱，并发现不同神经元亚型依赖不同的ISR效应因子，特别是GABA能神经元中的ATF4缺失会加剧认知衰退 | 未提及 | 阐明持久性整合应激反应激活导致认知功能障碍的细胞类型特异性机制 | 小鼠大脑中的不同细胞类型，特别是GABA能神经元和谷氨酸能神经元 | 单细胞组学 | 认知功能障碍（与神经发育和神经退行性疾病相关） | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 小鼠大脑样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |