单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 467 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 61 | 2026-07-25 |
Integrated Transcriptomic, In Silico, and In Vitro Characterization of lncRNA ENST00000615487.1 Reveals Epithelial-Specific Expression, Differential Subcellular Distribution Between Normal and Colorectal Cancer Cells, and Potential Regulatory Functions
2026-Jul-17, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna12040024
PMID:42496243
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| 62 | 2026-07-25 |
Role of Abca7-related microglial responses in linking type 2 diabetes mellitus to Alzheimer's disease progression: Evidence from single-cell transcriptomic analysis and experimental validation in animal and cell models
2026-Jul-16, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179152
PMID:42463036
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| 63 | 2026-07-25 |
Integrated single-cell and network analysis identifies SLAMF7 as a secretory mediator of the joint-lung axis in rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease targetable by Tanshinone IIA
2026-Jul-15, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158583
PMID:42492262
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| 64 | 2026-07-25 |
Tooth development, replacement and regeneration
2026-Jul-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205531
PMID:42496585
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| 65 | 2026-07-25 |
SRY-Box 9-Driven Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia Cell Lineage Plasticity Is a Potential Therapeutic Target That Mitigates Risk of Metaplastic Progression to Gastric Cancer
2026-Jul-14, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.06.024
PMID:42448241
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| 66 | 2026-07-25 |
Cross-layer multiomic and digital pathology analysis identifies a malignant keratinization state linked to immune exclusion in cervical squamous carcinoma
2026-Jul-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08567-3
PMID:42426811
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| 67 | 2026-06-23 |
PanKbase Integrated Single-Cell Map: A Comprehensive Atlas of Human Pancreatic Islets
2026-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.02.729719
PMID:42327171
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research paper | 构建了一个统一的人类胰腺胰岛单细胞图谱，整合来自多个来源的数据以研究1型糖尿病 | 整合了来自140名捐赠者、涵盖五种表型组的191个高质量测序数据，包括实验扰动样本（如SARS-CoV-2感染和促炎细胞因子暴露），并提供了公开访问的在线平台 | 未明确说明，但可能受限于公开数据的异质性和整合过程中对变量的控制 | 创建统一的单细胞RNA测序图谱以支持糖尿病病理生理学研究 | 人类分离胰腺胰岛组织及其单细胞数据 | machine learning | type 1 diabetes, type 2 diabetes | scRNA-seq | NA | 图像，文本 | 140名捐赠者中的191个高质量测序样本，包含448,935个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-07-25 |
Single-cell transcriptomics identifies CD36 as a negative regulator of osteogenic differentiation in murine osteoporosis
2026-Jul-07, Joint bone spine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jbspin.2026.106096
PMID:42413604
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| 69 | 2026-07-25 |
E2F1 Drives Endothelial Arterial Programming in Pulmonary Arterial Hypertension
2026-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.02.736230
PMID:42465492
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| 70 | 2026-07-25 |
Expression of Concern: Advances and challenges in single-cell RNA sequencing data analysis: a comprehensive review
2026-07-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag433
PMID:42490141
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| 71 | 2026-07-10 |
SpatialPEFT: a parameter-efficient fine-tuning framework for spatial transcriptomics foundation models
2026-Jul-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag503
PMID:42421217
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研究论文 | SpatialPEFT是一个统一的参数高效微调框架，可在单张16 GB消费级GPU上实现大规模空间转录组基础模型（高达14亿参数）的鲁棒适应 | 集成低秩适应（LoRA）、梯度检查点和空间感知适配器，峰值VRAM减少超过87%，同时显著提升下游空间注释准确性 | NA | 开发参数高效微调框架以适应性调整大规模空间转录组基础模型 | 空间转录组基础模型 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | 低秩适应（LoRA） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-07-10 |
Structural-information guided fusion for spatial domain identification from spatial transcriptomics
2026-Jul-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag508
PMID:42423290
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研究论文 | 提出了一种名为SGFST的框架，通过整合空间图和信号图，并利用双分支图卷积网络与注意力融合，从空间转录组数据中识别空间域 | 首次将空间图与信号图融合，并通过双分支图卷积网络和注意力机制捕捉互补的空间和功能信息，同时联合优化贝叶斯个性化排序损失、零膨胀负二项损失和距离结构信息约束，以保留局部邻域连续性和全局拓扑一致性 | 未明确提及，但可能依赖于高质量的空间转录组数据，且对大规模数据集的扩展性有待验证 | 从空间转录组数据中准确识别空间域，以理解组织结构和病理机制 | 空间转录组数据集中的空间域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络 (GCN) | 空间转录组数据 | 多个数据集（未具体说明数量） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 73 | 2026-07-25 |
Odon: an ultra-fast viewer for spatial proteomics
2026-Jul-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag514
PMID:42435412
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| 74 | 2026-04-30 |
Integration of Spatiotemporal Multi-Omics in Peach Fruit Unravels a Metabolic Niche and the Genetic Basis of Trichome-Mediated Stress Adaptation
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520438
PMID:42037236
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研究论文 | 整合空间转录组学与质谱成像技术构建桃果实早期发育的多维图谱，揭示代谢区室化与毛状体介导的抗逆遗传基础 | 首次构建蔷薇科水果的空间分辨多组学资源，并鉴定出Prupe.7G196500为整合茉莉酸信号促进毛状体发育与抗旱性的新型候选调控因子 | 对早期器官发生的系统层面理解仍有限，且研究仅针对单一物种及其变种 | 研究桃果实早期发育过程中基因表达与代谢的时空协调机制及其遗传基础 | 桃果实及其光滑变种油桃 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | NA | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 75 | 2026-04-30 |
Network medicine and single-cell mapping identify a collagen-rich, fibrosis-associated hub module in Duchenne muscular dystrophy
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05376-9
PMID:42053795
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研究论文 | 通过网络医学和单细胞映射识别杜氏肌营养不良症中胶原丰富、与纤维化相关的枢纽模块 | 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序，将杜氏肌营养不良症的纤维化信号特异性地映射到肌腱成纤维细胞，并鉴定了六个关键枢纽基因，同时筛选出候选药物卤夫酮 | 尚不清楚，摘要中未明确提及局限性 | 识别与杜氏肌营养不良症细胞外基质重塑相关的关键转录程序、枢纽基因网络、免疫微环境特征，并预测潜在治疗药物 | 杜氏肌营养不良症患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据，以及体外炎症诱导的成纤维细胞模型 | 生物信息学 | 杜氏肌营养不良症 | 加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、体外验证 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-05-12 |
Molecular mechanisms linking cadmium chloride exposure to ankylosing spondylitis: an integrative network-based study
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05394-7
PMID:42113191
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研究论文 | 采用网络毒理学框架，整合多机器学习和单细胞转录组分析，揭示氯化镉暴露与强直性脊柱炎之间的分子机制 | 首次通过网络毒理学结合多种机器学习算法（LASSO、SVM、随机森林和XGBoost）鉴定氯化镉暴露与强直性脊柱炎的核心共靶基因，并利用孟德尔随机化和单细胞RNA-seq虚拟敲除验证ETFA的因果作用 | 研究基于公开数据库和计算分析，缺乏大规模的队列验证和深入的体内实验验证 | 阐明氯化镉慢性暴露通过免疫调控异常参与强直性脊柱炎发病的分子机制 | 氯化镉暴露相关的毒理学靶点与强直性脊柱炎患者差异表达基因的交集基因 | 机器学习 | 强直性脊柱炎 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | GSE73754数据集（AS相关DEGs）、GSE194315数据集（单细胞RNA-seq） | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2026-07-25 |
Exploring peripheral immune mechanisms and potential therapeutic drugs for Alzheimer's disease
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05397-4
PMID:42089894
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| 78 | 2026-07-25 |
Integrative single-cell transcriptomics and co-expression network analysis identify SIMALR as a prognostic immune-related lncRNA in breast cancer: in silico analysis and validation
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05156-5
PMID:42103982
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| 79 | 2026-07-25 |
tBid-Mediated Genetic Ablation of Connective Tissue Cells Reveals Their Key Regulatory Function During Limb Regeneration in Axolotls
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524339
PMID:42201602
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| 80 | 2026-07-25 |
Ankyrin-B and ankyrin-G are required for synaptic integrity in the mouse outer retina
2026-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag239
PMID:42491609
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