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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-06-10 |
Inhibition of endothelial ALOX12 mitigates cerebral ischemia-reperfusion injury by suppressing 12-HETE
2026-07, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,发现内皮细胞ALOX12衍生的12-HETE在脑缺血再灌注损伤中加剧神经血管损伤,抑制ALOX12具有治疗潜力 | 首次明确内皮细胞是脑缺血再灌注后ALOX12诱导的主要细胞来源,并揭示12-HETE通过破坏紧密连接、激活小胶质细胞和加剧神经元氧化损伤的多细胞机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本量有限,且未深入探讨ALOX12抑制剂的长期疗效和安全性 | 探讨内皮ALOX12-12-HETE信号通路在脑缺血再灌注损伤中的作用,评估ALOX12抑制的潜在治疗价值 | 小鼠短暂性大脑中动脉阻塞模型、OGD/R细胞系统、AIS患者和健康对照者 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、OGD/R模型、AAV-BR1介导的基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据、临床血浆样本数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)、倾向评分匹配的AIS患者及健康对照(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 762 | 2026-06-10 |
Unraveling the spatial landscape of dystrophinopathies: a transcriptomic approach to Becker and Duchenne muscular dystrophies
2026-Jul, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70067
PMID:42067897
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示贝克型和杜氏肌营养不良症的空间组织景观 | 首次通过Visium空间转录组学对肌营养不良症患者骨骼肌活检样本进行空间分析,结合单核RNA测序数据解构细胞类型比例及空间定位,并识别与脂肪化区域及活性病理区相关的基因和细胞间通讯 | 样本量较小(患者8例、对照4例),且未对发现的基因和细胞互作进行体外或体内功能验证 | 探究肌营养不良症中肌肉脂肪化和纤维化的组织病理学变化及其分子机制 | 肌营养不良症患者(贝克型和杜氏型)及健康对照的骨骼肌活检样本 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症, 贝克型肌营养不良症 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 解卷积模型 | 转录组数据, 组织图像 | 8例患者(肌营养不良症)和4例健康对照 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x 单核RNA测序 | 10x Visium空间转录组学平台用于肌肉活检分析,单核RNA测序数据来自先前研究的10x平台 |
| 763 | 2026-06-09 |
Signal regulatory protein γ is associated with an exhaustion-prone immune microenvironment in metastatic melanoma
2026-Jul-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115069
PMID:42167713
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研究论文 | 通过数据库挖掘、单细胞转录组学和免疫组化验证,研究信号调节蛋白γ在转移性黑色素瘤中的表达及其与免疫微环境的关系 | 首次揭示SIRPG在转移性黑色素瘤中与耗竭倾向的免疫抑制微环境相关,并发现其与PD-1在蛋白水平上的共表达富集 | 基于公共数据库和有限样本的验证,需进一步大规模临床研究确认其作为生物标志物的潜力 | 探讨SIRPG在皮肤黑色素瘤中的表达、临床意义及其对免疫微环境重塑的潜在影响 | 皮肤黑色素瘤组织样本及正常皮肤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 基于公共数据库和免疫组化验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2026-06-09 |
Integrated intraocular-plasma proteomics reveals conserved biomarkers for diabetic retinopathy progression: a multi-fluid biopsy study
2026-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06708-3
PMID:41817688
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研究论文 | 通过整合眼内液和血浆蛋白质组学,鉴定可用于糖尿病视网膜病变进展监测的保守生物标志物 | 首次通过多液体活检(房水与血浆)联合分析,发现神经丝轻链作为可经血浆检测的跨阶段生物标志物,并验证其预测视网膜病变进展及血管并发症风险的能力 | 未提及明显的局限性 | 鉴定可追踪糖尿病视网膜病变全过程的保守生物标志物 | 糖尿病视网膜病变患者队列(中国广东DR多组学研究)、氧诱导视网膜病变小鼠模型、UK Biobank糖尿病患者队列 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 蛋白质组学(SomaScan v4.1)、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、临床随访数据 | 中国队列32例房水样本;UK Biobank糖尿病患者2495例 | NA | NA | SomaScan v4.1 | 高通量蛋白质组学SomaScan v4.1平台 |
| 765 | 2026-06-09 |
A NETs-centric multi-omics framework prioritizes PGLYRP1 and MMP9 as subtype-associated thromboinflammatory biomarker candidates and putative therapeutic hypotheses in ischemic stroke
2026-Jul, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107422
PMID:42066918
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研究论文 | 本研究构建了一个以中性粒细胞胞外陷阱(NETs)为中心的多组学框架,在缺血性卒中中识别出与亚型相关的血栓炎症生物标志物候选物PGLYRP1和MMP9,并提出了潜在的治疗假说 | 首次整合多队列外周血转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化、单细胞RNA测序以及计算扰动分析,建立了NETs导向的亚型特异性分层框架,并发现PGLYRP1在心源性栓塞性卒中中具有特异性富集信号和潜在的因果关联 | 未充分验证MMP9和PGLYRP1在更大独立队列中的临床转化价值,且孟德尔随机化分析中系统性细胞因子的中介作用不显著,提示局部血栓炎症环境的复杂性未完全解析 | 探索缺血性卒中中NETs相关的血栓炎症生物标志物,推动亚型特异性诊断和治疗假说的发展 | 缺血性卒中患者的外周血样本,涵盖多种亚型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子动力学模拟, 细胞热转移分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多队列分布,具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 766 | 2026-06-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing of Soybean Reveals Transcriptional Changes and Antiviral Functions of GmGSTU23 and GmGSTU24 in Response to Soybean Mosaic Virus
2026-Jul, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15164
PMID:39301882
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建大豆响应大豆花叶病毒感染的转录图谱,并发现GmGSTU23和GmGSTU24的抗病毒功能 | 首次在单细胞分辨率下解析大豆对SMV感染的转录网络变化,并鉴定出两个具有抗病毒功能的GSTU基因 | 未明确说明 | 揭示大豆在SMV感染下转录网络的变化机制,并鉴定参与抗病毒反应的GSTU基因 | 大豆(Glycine max)叶片原生质体及本氏烟瞬时表达系统 | 机器学习 | 植物病毒病(大豆花叶病毒) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 50,294个原生质体(来自SMV感染和模拟接种的大豆新叶) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2026-06-07 |
STCF: Multi-View Clustering for Spatial Transcriptomics Based on Cross-View Fusion
2026-Jul, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3665779
PMID:41701605
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研究论文 | 提出了一种基于交叉视图融合的空间转录组学多视图聚类框架STCF,通过融合高变基因和低变基因表达视图提升空间域识别精度 | 首次将高变基因和低变基因作为两个独立的表达视图,通过反向缩放余弦误差损失实现对齐与分离的平衡,采用即插即用的交叉视图融合策略增强鲁棒表示学习 | 未明确指出方法在非灵长类组织或大样本数据的泛化能力,可能依赖预设基因子集的划分方式 | 开发一种能够有效融合不同全局变异水平基因信息以提升空间域识别精度的聚类方法 | 空间转录组数据中的组织空间域(包括DLPFC、HBC、MBA三个基准数据集) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 交叉视图融合网络(含反向缩放余弦误差损失) | 空间转录组基因表达数据 | 三个基准数据集(DLPFC、HBC、MBA),具体样本量未说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 768 | 2026-06-07 |
Targeting BATF: A new strategy for cancer immunotherapy
2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189579
PMID:41866089
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综述 | 本文综述了BATF转录因子在抗肿瘤免疫治疗中作为新靶点的研究进展,重点介绍了BATF在CD8 T细胞发育和耗竭中的作用及其潜在应用 | 首次系统阐述了BATF在T细胞耗竭过程中的关键作用及其与PD-1的正反馈机制,提出靶向BATF可能成为增强T细胞抗肿瘤能力的新策略 | BATF作为治疗靶点研究中仍存在一些未解决的矛盾和挑战,其具体作用机制和临床应用还需进一步探索 | 总结BATF作为新靶点在抗肿瘤免疫治疗中的研究进展,为改善免疫治疗效果提供新思路 | BATF转录因子、CD8 T细胞 | machine learning | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2026-06-07 |
Mapping the immune landscape of PCa: From tumor microenvironment to therapeutics
2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189586
PMID:41956336
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综述文章 | 整合单细胞与空间转录组学数据,解码前列腺癌肿瘤微环境的免疫图谱,并提出免疫治疗新策略 | 首次提出并强调‘神经-免疫-微生物组’三角调控网络在前列腺癌免疫抑制中的作用,并系统解析TREM2+巨噬细胞介导的代谢共生驱动疾病进展的机制 | 现有数据主要基于公开数据集,缺乏前瞻性临床验证;神经-免疫-微生物组轴的具体分子机制仍需进一步实验证实 | 系统描绘前列腺癌肿瘤微环境的免疫景观,为精准肿瘤学中‘生态编辑’策略提供理论基础 | 前列腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞、神经细胞、微生物及代谢物 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 770 | 2026-06-07 |
Analysis of B cell dynamic changes and pivotal drivers based on single-cell transcriptome of peripheral blood in sepsis
2026-Jul, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2026.103009
PMID:42184475
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研究论文 | 基于外周血单细胞转录组分析脓毒症中B细胞的动态变化及关键驱动因子 | 首次整合多个GEO数据集进行单细胞B细胞轨迹分析,识别出六种具有强诊断潜力的枢纽基因(DDX17、SLC2A3、RPS4X、PCBP2、S100A9、PFDN5),并揭示脓毒症中B细胞组成及分化路径的显著变化 | NA | 探讨脓毒症中B细胞的动态分化机制及关键调控因子,并筛选用于诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 | 脓毒症患者的外周血B细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, LASSO | 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集,包含健康对照和脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-06-06 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序与实验验证,鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 整合单细胞RNA测序分析与体内外验证,首次发现COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2四个枢纽基因在IPAH中显著上调,并验证了其沉默可抑制PASMC增殖和迁移 | 未提及 | 鉴定特发性肺动脉高压中驱动肺动脉平滑肌细胞异常增殖和迁移的关键基因 | 特发性肺动脉高压患者及单侧气肿诱导的PAH大鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IPAH患者样本(具体数量未提及)及MCT诱导的PAH大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE169471数据集来自Gene Expression Omnibus |
| 772 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and in vivo investigation reveal the role of ANXA1 in intestinal barrier dysfunction during heat stroke by mediating neutrophil-monocyte interaction and regulating the TLR4/ERK/NF-κB pathway
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153873
PMID:42070539
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与体内实验,揭示ANXA1在中暑引起的肠屏障功能障碍中通过调控中性粒细胞-单核细胞相互作用及TLR4/ERK/NF-κB通路的作用 | 首次结合单细胞转录组学与体内实验阐明ANXA1-FPR2轴在中暑肠屏障功能障碍中的保护机制,发现中性粒细胞-单核细胞相互作用的关键角色 | 未提及研究局限性 | 探究ANXA1在中暑诱导的肠屏障功能障碍中的作用机制 | 中暑患者和炎症性肠病患者的结肠组织细胞,以及中暑小鼠模型 | 生物信息学 | 中暑 | 单细胞RNA测序, 组织染色, 流式细胞术, ELISA, 蛋白印迹, 免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白表达数据 | 中暑患者与健康对照的单细胞RNA测序数据,以及小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 773 | 2026-06-06 |
Dissecting Pirtobrutinib Resistance in Mantle Cell Lymphoma Through Single-Cell Multi-Omics
2026-Jul, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70304
PMID:41998849
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示套细胞淋巴瘤中Pirtobrutinib耐药的分子机制 | 首次通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和DNA-seq的多组学分析,揭示了PBN耐药的遗传和非遗传双重机制,并识别出黏连蛋白复合体核心成分RAD21和SMC3作为潜在治疗靶点 | 未明确说明 | 阐明Pirtobrutinib在套细胞淋巴瘤中产生耐药的分子动态机制 | 套细胞淋巴瘤患者的纵向样本 | 单细胞多组学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, DNA测序数据 | 套细胞淋巴瘤患者纵向样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell multi-omics analysis identifies fibroblast-like smooth muscle cells as a key driving phenotypic switching during aortic aneurysm progression
2026-Jul, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.05.006
PMID:42140576
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研究论文 | 整合单细胞多组学分析发现成纤维细胞样平滑肌细胞是驱动主动脉瘤进展中表型转换的关键细胞 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,系统鉴定出成纤维细胞样平滑肌细胞作为祖细胞样群体,并通过KAT5介导的代谢-表观遗传调控轴驱动主动脉瘤中平滑肌细胞表型转换 | 研究主要基于人主动脉组织样本的体外和动物模型验证,可能无法完全模拟体内复杂微环境,且样本量有限 | 探索主动脉瘤进展中平滑肌细胞的异质性和表型转换的调控机制 | 健康和主动脉瘤患者的人主动脉组织,以及人主动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 主动脉瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光染色, 动物模型, 体外实验 | 轨迹推断模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 人主动脉组织样本(健康与患病)及多种细胞亚群 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC测序 |
| 775 | 2026-06-06 |
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-Jul, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103189
PMID:42214504
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综述 | 本文综述了空间转录组学在解析年龄相关的神经退行性疾病组织微环境中的应用 | 强调空间转录组学作为连接分子发现与临床应用的桥梁技术,整合多组学与临床影像建立综合特征,用于早期疾病检测和患者分层 | 未明确讨论技术局限性,但提及衰老特异性挑战 | 探讨空间转录组学在揭示衰老相关病理机制和开发精准治疗干预中的应用 | 年龄相关的神经退行性病变和小胶质细胞微环境 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 776 | 2026-06-06 |
Benzene-induced myelosuppression confers a survival advantage to hematopoietic progenitors: Single-cell analysis of malignant transformation dynamics in a murine model
2026-07-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142337
PMID:42139775
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析苯诱导小鼠骨髓抑制向恶性转化的动态过程 | 首次通过单细胞分析揭示苯诱导骨髓抑制向白血病转化的关键时间窗及S100a8/S100a9相关转录程序作为早期分子特征 | 未在文献中明确提及 | 解析苯诱导骨髓抑制向快速恶性转化的演变机制 | Mll-Af9嵌合体小鼠模型及苯暴露后的造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mll-Af9嵌合体小鼠经慢性苯吸入暴露,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 777 | 2026-06-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Proteomics to Unravel Stem Cell Heterogeneity: Implications for Precision Regenerative Medicine
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11116-6
PMID:41951880
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 778 | 2026-06-06 |
Machine Learning-Based Identification of Molecular Signatures in PTOA Cell Subtypes via Single-Cell Transcriptomics in a Mouse Model
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11121-9
PMID:41979832
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 779 | 2026-06-06 |
Hypoplastic Left Heart Syndrome Cardiomyocytes Exhibit Intrinsic Stress Vulnerabilities and Augmented Stress Responses in vitro
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11127-3
PMID:42089915
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研究论文 | 该论文研究了左心发育不全综合征(HLHS)心肌细胞在体外表现出的内在应激脆弱性和增强的应激反应 | 首次通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示HLHS患者诱导多能干细胞来源的心肌细胞在转录水平上的内在脆弱性和对特定应激源的敏感性增强,为理解基因-环境相互作用在HLHS发病机制中的角色提供了新见解 | 研究仅基于体外模型(hiPSC-CMs),可能无法完全复制体内复杂的微环境;且样本量有限,可能限制结果的普遍性 | 识别HLHS患者与健康对照者心肌细胞之间的分子和功能差异,以揭示可能导致HLHS表型的潜在脆弱性 | 来自HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs) | 数字病理学 | 先天性心脏病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 780 | 2026-06-05 |
Sensory Nerves Regulate Odontoblast Differentiation via the SPP1/ITGA4 Axis During Tooth Root Development
2026-Jul, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70129
PMID:41796694
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研究论文 | 本研究以牙根发育为模型,探讨感觉神经如何通过SPP1/ITGA4轴调节成牙本质细胞分化 | 首次揭示感觉神经通过SPP1/ITGA4轴调控祖细胞命运,从而协调牙根发育的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;未涉及其他神经类型或信号通路的潜在作用 | 探究感觉神经在牙根发育过程中调节成牙本质细胞分化的作用及分子机制 | 小鼠牙乳头细胞、三叉神经节、牙根发育组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, Co-IP, PLA, siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第3.5天和第30天的小鼠三叉神经节和磨牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |