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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-06-26 |
Piecing together the alveolar-capillary unit: arterial-venous capillary polarization
2026-Jul-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00101.2026
PMID:42227649
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综述 | 综述肺泡-毛细血管单元中动脉-静脉极化的研究进展 | 强调肺毛细血管内皮细胞中CAP1群体的异质性和修复亚群,揭示动脉-静脉极化及基因表达梯度 | 未提及具体局限性 | 总结肺毛细血管内皮细胞异质性,特别是动脉-静脉极化和修复性祖细胞 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观基因组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 722 | 2026-06-26 |
Identification of PSMA4 as a Therapeutic Target for Atherosclerosis: A Comprehensive Multiomics Mendelian Randomization Analysis
2026-Jul, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70039
PMID:42032825
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化整合分析,识别PSMA4作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次利用多组学孟德尔随机化框架,整合GWAS、eQTL、mQTL和sQTL数据,系统鉴定并验证PSMA4作为动脉粥样硬化的遗传因果治疗靶点,并通过单细胞RNA测序揭示其在斑块免疫细胞中的高表达 | 研究基于欧洲人群数据,种族多样性有限;MR和共定位分析虽支持因果关系,但无法完全排除残余混杂;药物预测仍需体外和体内实验验证 | 鉴定新的、受遗传支持的动脉粥样硬化治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者与对照人群的血液、组织样本及动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | GWAS, eQTL, mQTL, sQTL, scRNA-seq | NA | 基因表达、甲基化、剪接变异、单细胞转录组 | 三个独立队列的cis-eQTL数据及外部AS数据集,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 723 | 2026-06-26 |
Ythdf2 loss in microglia aggravates ischemic retinopathy by increasing microglia activation and microvascular anomalies
2026-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.024
PMID:41627954
|
研究论文 | 揭示小胶质细胞中Ythdf2缺失通过增加小胶质细胞活化和微血管异常加剧缺血性视网膜病变的机制 | 首次探索m6A阅读蛋白Ythdf2在视网膜小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的调控机制 | 未明确提及限制性 | 研究Ythdf2在小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的参与,并揭示其调控机制 | 小胶质细胞Ythdf2及视网膜微血管 | 机器学习 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 724 | 2026-06-26 |
Mouse, Pig, and Human Atherosclerotic Lesions Have Common and Distinct Mesenchymal Cell Populations
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323640
PMID:42165148
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序整合分析小鼠、猪和人类的动脉粥样硬化病变,发现共有和特有的间充质细胞群体 | 首次跨物种整合分析小鼠、猪和人类动脉粥样硬化斑块中的间充质细胞异质性,揭示了保守的间充质细胞连续体及多种物种特异性亚群(如DLX5和RERGL标记的平滑肌细胞亚群仅存在于人类颈动脉和冠状动脉斑块) | 未明确提及但隐含限制包括:不同物种间细胞状态的功能验证不足;仅分析了特定血管床和病变阶段,可能无法完全覆盖疾病全貌 | 比较小鼠和猪实验性动脉粥样硬化病变中复杂的间充质细胞群体与人类临床斑块的异同 | 来自人类颈动脉和冠状动脉、猪主动脉和冠状动脉、以及小鼠头臂动脉的动脉粥样硬化病变样本 | 数字病理学、单细胞组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了人类、猪和小鼠多个动脉样本的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 725 | 2026-06-26 |
Epigenetic Regulation of the Epstein-Barr Virus Latent-Lytic Switch
2026-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.71031
PMID:42345494
|
综述 | 综述爱泼斯坦-巴尔病毒潜伏-裂解转换的表观遗传调控机制 | 整合全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学和整合多组学分析的最新进展,揭示表观遗传抑制、转录控制、代谢适应和免疫微环境信号如何协同调控潜伏-裂解转换的分子逻辑 | 未提及具体限制 | 总结EBV潜伏-裂解转换的表观遗传调控新发现及其对治疗方法的启示 | 爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的潜伏-裂解转换过程 | 机器学习 | EBV相关恶性肿瘤 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学、整合多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多组学 | NA | NA |
| 726 | 2026-06-25 |
Cellular Heterogeneity During Arterial Aging
2026-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70597
PMID:42333936
|
综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术解析血管衰老过程中细胞异质性的研究成果,重点关注细胞衰老、细胞外基质重构、炎症老化和细胞通讯变化等关键表型程序 | 首次系统整合单细胞研究,揭示血管衰老中内皮功能障碍、平滑肌表型调节、成纤维细胞相关基质重构和免疫激活的跨物种和跨血管床的差异,并强调细胞间通讯网络的改变 | 当前单细胞研究中存在细胞状态注释不一致、功能验证不完整、空间和表观遗传分辨率有限等局限性 | 系统梳理单细胞RNA测序在血管衰老研究中的应用,阐述细胞异质性与衰老相关动脉变化的关系 | 动脉壁中的内皮细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2026-06-23 |
Intracellular microbial shifts during COVID-19 infection and longitudinal recovery revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Jul-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116344
PMID:42325555
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示COVID-19感染期间及长期康复过程中细胞内微生物群的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术,深入探究SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染和康复期间免疫细胞内微生物群落的动态变化,并揭示其与长期COVID病理生理学的潜在关联 | 未明确说明,推测可能包括样本量有限、微生物检测方法的灵敏度限制、以及缺乏功能验证实验 | 探究SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染和康复期间宿主-微生物动态变化,特别是免疫细胞中细胞内微生物群落的作用 | 57名个体的191,417个外周血单核细胞,包括健康对照、急性感染期、近期康复和长期康复者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 57名个体,包括9名健康对照、24名奥密克戎感染患者、16名近期康复者和8名长期康复者 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统,用于外周血单核细胞的单细胞RNA测序 |
| 728 | 2026-06-23 |
SOX4 is a transcriptional activator for CTHRC1 in lung fibroblast activation
2026-Jul-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150171
PMID:41997467
|
研究论文 | 研究发现SOX4是肺成纤维细胞激活中CTHRC1的转录激活因子 | 首次揭示SOX4直接结合CTHRC1启动子并激活其转录,确认SOX4-CTHRC1调控轴在肺成纤维细胞激活中的作用 | 未明确说明研究局限性 | 探究CTHRC1在肺成纤维细胞激活中的转录调控机制 | 肺纤维化中的成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公开数据集(GSE124685、GSE169500、GSE135893)及TGFβ1诱导的MRC5成纤维细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2026-06-23 |
Single-cell transcriptomic atlas of shrimp hepatopancreas reveals an endoplasmic reticulum stress-dependent immune response to Vibrio parahaemolyticus infection
2026-Jul, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111364
PMID:42000089
|
研究论文 | 通过对南美白对虾肝胰腺进行单细胞核测序,揭示了副溶血弧菌感染下内质网应激依赖的免疫应答机制 | 首次构建了甲壳类动物肝胰腺在细菌感染下的单细胞转录组图谱,并发现内质网应激是免疫应答的关键调控通路 | 研究仅使用snRNA-Seq分析,可能遗漏某些细胞类型的转录信息,且未进行功能验证实验 | 解析甲壳类动物在细菌感染时的免疫应答分子机制 | 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肝胰腺细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞核测序(snRNA-Seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 20000个以上高质量细胞(包含B、F、E、M和R五类细胞) | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2026-06-23 |
Decoupling lactylation-associated metabolic remodelling in Asthma: Integrated multi-omics and machine learning identify RCC2 as a potential therapeutic target
2026-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109371
PMID:42000636
|
研究论文 | 通过整合多组学和机器学习,揭示哮喘中乳酸化相关代谢重塑,并识别RCC2为潜在治疗靶点 | 首次构建可解释的乳酸代谢生物标志物诊断框架,整合批量转录组和单细胞RNA测序数据,系统描绘哮喘中乳酸/组蛋白乳酸化相关的代谢状态,并识别RCC2作为连接糖酵解与表观遗传重塑的候选调控枢纽 | 机制研究仅在体外细胞模型中验证,缺乏体内和临床队列的进一步验证 | 绘制哮喘气道细胞谱系中乳酸/组蛋白乳酸化相关的代谢状态,并开发可解释的乳酸代谢生物标志物诊断框架 | 哮喘患者的气道细胞,包括巨噬细胞和上皮细胞 | 机器学习和数字病理学 | 哮喘 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、siRNA敲降、乳酸定量、组蛋白乳酸化免疫荧光、非靶向液相色谱-质谱代谢组学 | 高斯混合模型引导的逻辑回归分类器 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 训练集GSE63142(未指定具体样本数),验证集GSE43696(未指定具体样本数),单细胞RNA测序数据集GSE193816(未指定具体样本数),尘螨刺激的16HBE细胞系 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 731 | 2026-06-23 |
Curcumin modulates the function of SPP1+ macrophages via NF-κB signaling to alleviate endometriosis
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116644
PMID:42001649
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建子宫内膜异位病灶单细胞图谱,发现SPP1+巨噬细胞是关键的致病细胞亚群,并阐明姜黄素通过调控NF-κB信号通路缓解疾病的分子机制 | 首次通过单细胞图谱鉴定SPP1+巨噬细胞为子宫内膜异位症的关键致病亚群,并揭示其通过NF-κB通路促炎重编程及介导旁分泌串扰的机制,同时提出姜黄素靶向该信号轴的新治疗机制 | NA | 探索子宫内膜异位症的关键致病细胞亚群及其分子机制,并评估姜黄素的治疗作用 | 子宫内膜异位病灶中的巨噬细胞、基质细胞、上皮细胞及动物模型中的异位病灶组织 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序、多组学分析、细胞通讯分析、功能验证、动物实验 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 732 | 2026-06-23 |
Comprehensive Multi-Omics Profiling of Tertiary Lymphoid Structures Reveals Immunogenetic Landscapes and Prognostic Subtypes in Lung Adenocarcinoma
2026-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70120
PMID:42070266
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研究论文 | 通过对三级淋巴结构的综合多组学分析,揭示了肺腺癌的免疫遗传学景观和预后亚型 | 首次通过整合多组学策略构建了与三级淋巴结构相关的预后模型,并利用孟德尔随机化鉴定具有遗传支持的TLS相关基因 | 未明确提及 | 构建三级淋巴结构相关的预后模型并阐明相关的免疫遗传机制 | 肺腺癌患者及细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 逆转录定量聚合酶链反应, 孟德尔随机化 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本总数 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2026-06-23 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq Revealed the Role of Programmed Cell Death-Related Genes in the Prognosis of Glioblastoma Patients
2026-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05687-w
PMID:42008052
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 734 | 2026-06-20 |
Malignant cell-secreted chemokines drive colorectal cancer progression through endothelial cell activation
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04188-2
PMID:41557142
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术,揭示恶性细胞分泌的趋化因子CXCL2通过激活内皮细胞上的ACKR1促进结直肠癌进展的机制 | 首次利用单细胞RNA测序、拷贝数变异推断和非负矩阵分解分析不同T分期的CRC肿瘤微环境动态变化,确定CXCL2-ACKR1轴在肿瘤侵袭中的关键作用,并提出阶段特异性干预策略 | 未在更大队列或体内模型中验证CXCL2-ACKR1相互作用的临床相关性,且仅以CXCL2为单一候选因子,可能忽略其他微环境组分的影响 | 阐明结直肠癌进展过程中肿瘤微环境细胞互作机制,识别促进肿瘤侵袭的关键趋化因子及其靶向策略 | 26例结直肠癌患者(根据T分期分层为T2、T3、T4a)的肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、拷贝数变异推断、非负矩阵分解 | NA | 单细胞基因表达数据 | 26例结直肠癌患者(T2、T3、T4a分期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2026-06-20 |
STING Drives Psoriatic Inflammation by Promoting Neutrophil Recruitment and Facilitating NETosis
2026-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70130
PMID:41775627
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研究论文 | 研究揭示STING信号通路通过促进中性粒细胞招募和NETosis加重银屑病炎症 | 首次阐明STING信号通路在中性粒细胞介导的银屑病炎症中不仅调控细胞招募,还直接驱动NETs产物的终末效应功能,并发现不同小鼠品系间STING通路活化的遗传异质性 | 未涉及STING通路在不同银屑病亚型中的差异及长期治疗安全性评价 | 探索STING信号通路在中性粒细胞介导银屑病炎症中的具体作用机制 | 银屑病患者病变组织和外周血中性粒细胞、IMQ诱导的银屑病小鼠模型(野生型、STING-/-、PADi4-/-)及HL-60细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床样本包含银屑病病变组织和外周血,小鼠模型涵盖不同品系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 736 | 2026-06-20 |
Gut Microbiota-Induced CTLA4 Expression on CD8 + T Cells Impairs Antitumor Immunity and Promotes Colorectal Cancer Progression
2026-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70128
PMID:41780914
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研究论文 | 揭示了肠道微生物群通过诱导CD8+ T细胞上CTLA4表达抑制抗肿瘤免疫并促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现肠道菌群失调通过上调CD8 T细胞CTLA4表达促进T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸,建立了菌群-CTLA4轴这一新的免疫抑制通路 | 未提及 | 研究肠道微生物群在结直肠癌中调控CTLA4表达及抗肿瘤免疫的作用机制 | 结直肠癌患者及小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 16S rRNA测序,单细胞转录组学,空间转录组学,粪便微生物移植 | NA | 测序数据,空间转录组数据 | 结直肠癌患者样本及小鼠模型样本 | Illumina | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | Illumina测序平台 | 16S rRNA基因测序及单细胞转录组学分析 |
| 737 | 2026-06-19 |
Transcriptome profiling of peripheral blood for inflammatory subtype classification and diagnostic model construction in asthma
2026-Jul, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2026.2633354
PMID:41732097
|
研究论文 | 通过外周血转录组测序进行哮喘炎症亚型分类并构建诊断模型 | 首次利用外周血转录组学数据,结合批量RNA测序和单细胞RNA测序,通过多级验证识别哮喘炎症亚型的关键生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的样本,可能无法完全代表不同人群的异质性,且验证仅通过体外细胞模型进行 | 利用外周血转录组学识别哮喘炎症亚型并筛选候选生物标志物 | 哮喘患者的外周血样本 | 机器学习 | 哮喘 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | LASSO, SVM-RFE | RNA测序数据 | GSE69683数据集(批量RNA测序)和GSE172495数据集(单细胞RNA测序) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 738 | 2026-06-19 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals peripheral immune dysregulation in adolescent major depressive disorder
2026-Jul, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106512
PMID:41740874
|
研究论文 | 通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序揭示青少年重度抑郁症的外周免疫失调 | 首次结合批量与单细胞RNA测序对青少年重度抑郁症进行多组学分析,揭示其独特的外周免疫基因下调模式,并发现现有单胺类抗抑郁药物对免疫失调的纠正作用有限 | 样本量较小(仅4例患者和4例对照进行单细胞测序),且未涉及药物治疗的长期跟踪 | 利用多组学方法表征青少年重度抑郁症的外周转录变化,探索免疫相关机制及潜在治疗靶点 | 青少年重度抑郁症患者的外周血样本 | 自然语言处理 | 青少年抑郁症 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、Connectivity Map分析 | NA | 基因表达数据 | 180例MDD患者和99名健康对照的批量RNA测序,其中4例患者和4名对照进行单细胞测序 | Illumina | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NovaSeq | NA |
| 739 | 2026-06-19 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomics analysis reveals cellular heterogeneity, immune microenvironment dynamics, and prognostic signatures in oral squamous cell carcinoma
2026-Jul, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100432
PMID:42140356
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组学分析,揭示了口腔鳞状细胞癌的细胞异质性、免疫微环境动态及预后标志物 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学与批量转录组数据,系统解析了OSCC的细胞异质性、免疫微环境动态及预后特征,并识别出六基因预后标志和免疫治疗响应生物标志 | 未提及明确局限,但样本量(如复发与非复发病例数)未详细说明,可能影响结论的普适性 | 阐明口腔鳞状细胞癌的分子和细胞复杂性,为精准治疗策略提供依据 | 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤样本,包括HPV阳性、HPV阴性、复发和非复发病例 | 计算机视觉 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、甲基化测序 | Kaplan-Meier生存分析、GSEA通路富集分析、降维和轨迹推断 | 基因表达数据 | 未明确提及总体样本量,但涉及HPV阳性、HPV阴性、复发和非复发病例等多个亚组 | 10x Genomics, Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3'试剂盒, 10x Visium 空间基因表达解决方案, Illumina NovaSeq 测序平台 |
| 740 | 2026-06-19 |
Single-nucleus multi-omics dissection of dysregulated trophoblast development and disrupted immune microenvironment in complete hydatidiform moles
2026-Jul, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3191-5
PMID:41772202
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研究论文 | 通过单核多组学分析揭示完全性葡萄胎中滋养层发育失调和免疫微环境紊乱的细胞与分子机制 | 首次整合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学构建完全性葡萄胎的细胞图谱,并鉴定出RASA1作为新的关键调控因子 | 样本量有限且仅关注完全性葡萄胎,未涉及部分性葡萄胎或其他妊娠相关疾病 | 阐明完全性葡萄胎中滋养层细胞发育异常和免疫微环境紊乱的分子机制 | 完全性葡萄胎与孕龄匹配对照组的胎盘组织样本 | 机器学学 | 妊娠滋养层疾病 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 机器学习 | NA | 单细胞转录组, 单细胞染色质可及性, 空间转录组数据 | 完全性葡萄胎和对照组胎盘组织样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium 空间基因表达, Illumina NovaSeq 测序平台 |