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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-07-05 |
Single-Cell RNA Sequencing of Murine Liver Reveals an Aligned Circadian Clock and Cell-Population-Specific Circadian-Regulated Pathways
2026-Jul-03, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304261453628
PMID:42397025
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠肝脏中生物钟的同步性和细胞群体特异性昼夜节律调控通路 | 建立了生成小鼠肝脏细胞群体时间序列数据的实验方案和用于评估核心分子钟及个体细胞群体中振荡基因表达的方法学 | 未提及具体局限性 | 理解肝脏中个体细胞群体对生物钟功能的贡献以及昼夜节律与代谢通路的互作 | 小鼠肝脏细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝脏细胞时间序列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 662 | 2026-07-05 |
Yap mediates hippo signaling to balance proliferation and differentiation in the developing glandular stomach epithelium
2026-Jul-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117644
PMID:42397742
|
研究论文 | 通过小鼠遗传学、单细胞RNA测序和类器官实验,揭示Hippo信号通路中Yap蛋白调控胃腺上皮发育中增殖与分化的平衡机制 | 首次明确Yap通过调节细胞周期活性直接控制胃腺上皮增殖与分化的平衡,并揭示Mst1/2缺失通过Yap部分调控胃发育 | 具体分子机制细节(如Yap下游靶基因)未完全阐明,且研究主要基于小鼠模型,需在人类验证 | 探究Hippo信号通路在胃腺上皮发育中的作用机制 | 小鼠胚胎期胃腺上皮组织 | 发育生物学 | 消化系统发育相关疾病 | 小鼠遗传学, 单细胞RNA测序, 3D类器官培养 | NA | 单细胞基因表达数据, 组织学图像 | 小鼠胚胎胃组织样本(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 663 | 2026-07-05 |
Immunotherapy-based combination remodels the immunosuppressive microenvironment and enhances efficacy in advanced SMARCA4-deficient non-small cell lung cancer
2026-Jul-03, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218702
PMID:42398850
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研究论文 | 该研究评估了基于免疫治疗的联合方案在晚期SMARCA4缺陷非小细胞肺癌中的疗效,并通过多组学技术揭示了其重塑免疫抑制微环境的机制 | 首次在多中心回顾性队列中系统评估免疫治疗联合化疗与抗血管生成治疗在SMARCA4缺陷非小细胞肺癌中的疗效,并结合单细胞RNA和TCR测序以及CRISPR/Cas9敲除模型深入解析免疫微环境重塑机制 | 回顾性研究设计可能导致选择偏倚,且样本量有限(162例),需要前瞻性研究进一步验证 | 评估基于免疫治疗的联合方案在晚期SMARCA4缺陷非小细胞肺癌中的疗效并探究其免疫机制 | 162例来自四个中国癌症中心的晚期SMARCA4缺陷非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 下一代测序, 流式细胞术, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, CRISPR/Cas9敲除建模 | NA | RNA, TCR序列, 图像 | 162例患者及SMARCA4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 664 | 2026-07-05 |
PD-1 signalling restrains pathogenic T peripheral helper and effector CD4⁺ T cell functions in rheumatoid arthritis
2026-Jul-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.06.007
PMID:42399123
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研究论文 | 本研究探讨PD-1信号通路在类风湿性关节炎中抑制致病性外周辅助T细胞和效应CD4+ T细胞功能的作用 | 首次系统阐明PD-1激动剂通过抑制多种CD4+ T细胞亚群(包括Tph和Tfh细胞)及T-B细胞相互作用来减轻类风湿性关节炎病理反应的机制 | 未提及研究局限性 | 研究抑制性受体(PD-1、BTLA、TIGIT)在类风湿性关节炎滑膜CD4+ T细胞中的表达及功能,并确定受体激动如何调节T细胞效应功能和T-B细胞相互作用 | 类风湿性关节炎患者滑液、扁桃体和血液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑, ELISA, 三维类器官培养, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 从RA患者滑液、扁桃体和血液中分离的CD4+ T细胞,具体样本数未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于分析T细胞亚群的抑制性受体和配体表达 |
| 665 | 2026-07-05 |
Androgen Receptor-Induced Lactoferrin Accelerates Prostate Tumorigenesis Through Modulating Ferroptosis
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520109
PMID:41945871
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研究论文 | 揭示雄激素受体诱导的乳铁蛋白通过调节铁死亡促进前列腺肿瘤发生的机制 | 首次揭示乳铁蛋白在前列腺癌中的促癌作用,并建立AR-LF-铁死亡轴的新调控机制 | 未提及具体局限性 | 阐明乳铁蛋白在前列腺癌中的功能和潜在治疗策略 | 前列腺癌细胞的铁死亡调控机制 | 机器学习 | 前列腺癌 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | TRAMP小鼠模型和TCGA-PARD数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 666 | 2026-07-05 |
Inhibition of Focal Adhesion Restricts Chemoresistance in Pancreatic Cancer by Targeting SLC7A11 Mediated Ferroptosis
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75216
PMID:42003743
|
研究论文 | 通过单细胞测序和批量测序分析,发现粘着斑激酶抑制剂IN10018可通过靶向SLC7A11介导的铁死亡来限制胰腺癌的化疗耐药性 | 首次揭示粘着斑信号激活与胰腺癌化疗耐药性的关联,并证明FAK抑制剂可通过PI3K-Akt通路靶向SLC7A11介导的铁死亡来克服耐药性 | 未明确说明具体局限性 | 寻找限制胰腺导管腺癌化疗耐药性的候选靶点 | 经化疗治疗的胰腺癌样本和吉西他滨耐药样本 | 机器学习 | 胰腺癌 | scRNA-seq, bulk-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 667 | 2026-05-17 |
Corrigendum to 'Multiomic, Histologic, and scRNA-seq Profiling of Pleural Mesothelioma Reveals Negative Prognosis Associated With a Novel Uncommitted Molecular Phenotype' [Journal of Thoracic Oncology Volume 21 Issue 4 (2026) 103529]
2026-Jul, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103915
PMID:42138664
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 668 | 2026-07-05 |
Network Pharmacological Analysis of Lentinan in Regulating Intervertebral Disc Degeneration: Combined with Machine Learning-Based Screening and Molecular Dynamics Validation
2026-Jul, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261454407
PMID:42212606
|
研究论文 | 结合网络药理学、机器学习、分子对接和分子动力学模拟,系统探究香菇多糖与椎间盘退变之间的分子机制 | 首次整合网络药理分析与三种机器学习方法筛选核心靶点,并利用单细胞转录组虚拟敲除评估基因扰动对细胞状态和信号网络的重塑作用 | 全部基于公共数据库和计算模拟,缺乏体外或体内实验验证结果 | 阐明香菇多糖治疗椎间盘退变的分子机制 | 香菇多糖与椎间盘退变相关的潜在靶基因及信号通路 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 三个独立椎间盘退变数据集(含GSE176205) | NA | NA | NA | NA |
| 669 | 2026-07-05 |
Neutrophil-Mimetic MRI Enables Ultra-Early Detection of Vascular Inflammation After Stroke
2026-Jul, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71325
PMID:42260622
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研究论文 | 开发了靶向E选择素的铁氧化物微粒作为MRI探针,在卒中后超早期检测血管炎症,实现快速成像 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别E选择素作为早期内皮激活标志物,并设计中性粒细胞模拟磁共振探针实现卒中后数小时内炎症的超早期检测 | 未提供具体样本量或临床验证数据,研究基于小鼠模型,可能无法直接推广到人类 | 开发无创、实时的体内检测方法,用于识别可能受益于免疫调节治疗的脑卒中患者 | 小鼠脑缺血再灌注模型和脂多糖诱导神经炎症模型中的血管内皮细胞和中性粒细胞 | 机器学习、计算机视觉 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、磁共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、磁共振成像图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 670 | 2026-07-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts Promote Tumor Immunosuppression in Hepatocellular Carcinoma via the NNMT-ANGPTL4 Axis
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521418
PMID:41980209
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞通过NNMT-ANGPTL4轴促进肿瘤免疫抑制的机制 | 首次阐明CAF中NNMT通过结合EZH2调控ANGPTL4分泌,进而诱导PD-L1介导的免疫逃逸的代谢-表观遗传级联反应 | NA | 探究肝细胞癌中CAF的代谢调控机制,特别是NNMT在免疫抑制中的作用 | 肝细胞癌患者来源的CAF、单细胞RNA-seq数据、患者来源类器官、成纤维细胞特异性NNMT敲除小鼠 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、代谢组学分析、蛋白质印迹、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据 | 多个HCC患者样本、单细胞RNA-seq数据集GSE149614、患者来源类器官、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据来源于公共数据集GSE149614 |
| 671 | 2026-07-04 |
Myeloid Piezo1 Drives Cardiac Repair Through Orai1-Rac1-Dependent Efferocytosis
2026-Jul-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.328012
PMID:42227117
|
研究论文 | 研究揭示了髓系Piezo1通过Orai1-Rac1依赖的胞葬作用驱动心肌修复的机制 | 首次发现Piezo1-Orai1-Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬作用和溶酶体成熟,改善心肌梗死后的心脏功能 | 未在人类样本中验证该信号轴,且未探讨其他细胞类型(如成纤维细胞)的潜在作用 | 阐明髓系Piezo1在心肌梗死后心脏修复中的功能及分子机制 | 髓系Piezo1特异性敲除小鼠及骨髓来源的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、实时PCR、膜片钳、Western blot | 小鼠基因敲除模型(Piezo1ΔLysM) | 基因表达数据、钙成像数据、蛋白质数据 | 未明确样本量,涉及小鼠(n未具体说明)及体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞胞葬相关基因表达 |
| 672 | 2026-07-04 |
Hypoxia Induces Adaptive Lymphangiogenesis via Cd74 and Vegfr3 to Modulate Pulmonary Hypertension
2026-Jul-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.126.326822
PMID:42233213
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研究论文 | 研究发现缺氧通过Cd74和Vegfr3信号轴诱导适应性淋巴管生成,调节肺动脉高压,并揭示CD74-VEGFR3信号轴在淋巴内皮细胞中的新作用 | 首次发现淋巴管生成在肺动脉高压中起保护作用,并揭示CD74-VEGFR3信号轴在淋巴内皮细胞中的新功能 | 研究主要基于小鼠和大鼠模型,人类数据来自公开单细胞RNA测序数据集,可能需要更多验证 | 探究肺淋巴管在肺动脉高压病理和血管重塑中的作用 | 肺动脉高压患者和肺高压模型小鼠、大鼠的淋巴内皮细胞 | 计算机视觉 | 肺心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 基因编辑 | NA | 图像, 文本 | 小鼠和大鼠模型,以及人特发性肺动脉高压肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2026-07-04 |
Evolving strategies for lineage tracing: Genetic markers, synthetic barcodes, and natural variants
2026-Jul-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.05.001
PMID:42214336
|
综述 | 综述了谱系追踪从遗传标记、合成条形码到自然变异的方法演变及其与多组学和空间分析的整合 | 系统梳理了谱系追踪的三大方法支柱及其与多组学和空间分析整合的最新进展,并提供了实验设计的系统指南 | 未涉及具体技术细节或定量比较不同方法的性能,可能缺乏实际应用中的验证数据 | 综述谱系追踪策略的演变及其在细胞命运决定机制研究中的应用 | 谱系追踪方法及其在细胞命运分析中的实验设计 | 机器学习和计算生物学 | 不适用 | 单细胞测序、基因组编辑、合成条形码、自然变异分析 | 不适用 | 多组学数据、空间转录组学数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 674 | 2026-07-04 |
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2026-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056
PMID:41161490
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研究论文 | 提出scMapNet方法,通过视觉迁移学习与表格到图像转换,实现基于标记基因的scRNA-seq数据细胞类型注释 | 采用掩码自编码器(MAE)和视觉变换器(ViT)结合树图变换,充分利用细胞标记知识和未标记数据信息进行自监督学习 | 未提及具体限制,可能涉及对大型未标记数据的预训练依赖或标记基因选择的敏感性 | 开发一种能有效学习细胞标记知识和未标记数据信息的深度学习细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 掩码自编码器(MAE)和视觉变换器(ViT) | 表格数据(单细胞基因表达矩阵) | 多种数据集,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2026-07-04 |
The constitutive 20S proteasome is required for the maintenance and differentiation of spermatogonia in mice
2026-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.068
PMID:41167419
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研究论文 | 研究表明组成型20S蛋白酶体对小鼠精原细胞的维持和分化至关重要 | 首次揭示组成型PSMA7蛋白酶体在精原细胞维持和分化中的关键作用,并发现PSMA8的过表达可补偿PSMA7缺失的功能 | 未明确说明 | 探究组成型20S蛋白酶体在精子发生过程中的功能 | 小鼠精原细胞 | 机器学习 | 不适用 | 条件性基因敲除 | 不适用 | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠生殖细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 676 | 2026-07-04 |
Divergence between neural and retinal lineage specification during human brain development by signal transduction
2026-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.034
PMID:41135878
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研究论文 | 通过基因工程人胚胎干细胞衍生的脑类器官,研究S6K1缺失对人脑早期发育的影响,揭示其调控神经与视网膜谱系分化的信号机制 | 首次在人类脑类器官模型中证明S6K1信号缺失会驱动视网膜细胞而非皮层神经元形成,并区分了非细胞自主和细胞自主功能的作用 | 实验仅限于体外脑类器官模型,缺乏体内人体或动物模型验证;未探讨S6K1下游具体分子机制 | 探究S6K1在人类大脑发育中调控神经与视网膜谱系分化的作用 | S6K1基因敲除的人胚胎干细胞(hESCs)及其衍生的背侧前脑类器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、基因工程、脑类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据 | 早期(5周)和晚期(14周)阶段的背侧前脑类器官;共培养的S6K1敲除和野生型hESCs衍生的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 677 | 2026-07-04 |
SlGRF1 mediates gibberellin signaling to control cut-budding in tomato
2026-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70219
PMID:41834248
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示SlGRF1在番茄切割再生过程中介导赤霉素信号调控芽再生的分子机制 | 首次阐明SlGRF1作为关键调控因子,通过激活NAM1等茎尖分生组织调节基因表达,介导赤霉素信号对番茄切割再生的负调控作用 | 研究仅聚焦于番茄这一物种,未在其他植物中验证该机制的保守性;且未深入探讨SlGRF1与NAM1等下游靶基因的相互作用细节 | 探究番茄切割后芽再生(cut-budding)的分子调控机制,重点关注生长调控因子1(SlGRF1)及其与赤霉素信号的关系 | 番茄(Solanum lycopersicum) | NA | NA | 单细胞RNA测序、时间序列转录组分析、CRISPR/Cas9基因编辑、ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据、转录组测序数据、ChIP-seq数据 | 涉及grf1-cr突变体、野生型对照组及激素处理组,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2026-07-04 |
Dissecting and steering cell dynamics using spatially-informed RNA velocity with veloAgent
2026-Jul, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-026-00213-w
PMID:42092184
|
研究论文 | 提出了veloAgent框架,通过空间信息和生成式模型改进RNA速度推断,实现大规模空间转录组数据中细胞动态分析 | 首次将空间信息整合到RNA速度分析中,通过基于智能体的模拟实现亚线性内存扩展,并具备原位扰动模块以预测细胞命运调控干预效果 | 未提及具体局限性 | 开发可扩展且通用的空间转录组细胞动力学分析框架,支持细胞命运的模拟操控 | 单细胞转录组和空间转录组数据中的细胞状态转变动态 | 机器学习 | NA | RNA速度分析, 空间转录组学, 深度生成模型 | 深度生成模型, 智能体模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 679 | 2026-07-04 |
Prostaglandin I2 receptor activation promotes alveolar regeneration via the JUN/p53 pathway
2026-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamag116
PMID:42085259
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研究论文 | 研究前列腺素I2受体(IP)激活通过JUN/p53通路促进肺泡再生的机制 | 首次揭示IP受体通过PKA介导的MAP3K5抑制调控JNK/JUN轴,进而激活p53依赖性AT2向AT1细胞转分化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外类器官培养,人类IPF患者样本的验证仅限于原代AT2细胞,还需进一步体内验证 | 探究IP受体在调控AT2向AT1细胞转分化中的角色及分子机制 | 肺泡上皮细胞(AT2和AT1细胞)、小鼠肺损伤模型、患者特发性肺纤维化(IPF)组织 | 分子生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 小鼠模型(博来霉素和LPS诱导)、患者IPF原代AT2细胞 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3'用于scRNA-seq,10x Chromium Single Cell ATAC用于ATAC-seq |
| 680 | 2026-07-03 |
Targeting YAP1-Mediated Tubular Cell Senescence to Attenuate Maladaptive Repair and Fibrotic Transition After Acute Kidney Injury
2026-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503969RR
PMID:42381472
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研究论文 | 探讨YAP1介导的肾小管细胞衰老在急性肾损伤后修复及纤维化转变中的机制 | 首次揭示YAP1持续过表达通过驱动肾小管细胞衰老促进急性肾损伤向慢性肾病转变,并提出衰老细胞清除药物或维替泊芬可双重保护再生能力并抑制纤维化 | 未明确YAP1调控衰老的具体信号通路细节,且体内外模型可能不能完全模拟人类疾病的全部特征 | 阐明急性肾损伤后肾小管细胞衰老及上皮-间质转化在不良修复和纤维化中的分子机制,探索治疗靶点 | 小鼠肾组织(IRI及叶酸模型)、人肾小管上皮HK-2细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肾脏疾病(急性肾损伤及慢性肾病) | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人肾组织活检样本(GSE212273)及小鼠模型(未明确数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |