单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 814 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-07-09 |
PTBP1 knockdown reprograms glioma stem cells into neuronal-like cells and suppresses tumorigenesis via the DUSP5-ERK1/2 signaling pathway
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag068
PMID:41903206
|
研究论文 | 通过多组学分析和体内外实验揭示PTBP1通过DUSP5-ERK1/2通路调控胶质瘤干细胞分化为神经元样细胞并抑制肿瘤发生的机制，并开发A2-PLGA/venetoclax纳米治疗策略 | 首次发现PTBP1通过调控DUSP5-ERK1/2信号轴影响胶质瘤干细胞形态和分化，并利用已知临床药物venetoclax靶向PTBP1开发纳米治疗新策略 | 未提及 | 研究胶质瘤干细胞分化为神经元样细胞的机制并探索靶向治疗新策略 | 65例胶质瘤患者标本、小鼠模型、胶质瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 深度学习形态分类、组织透明化与3D成像、转录组分析、单细胞RNA-seq、慢病毒敲低、结构导向药物筛选 | NA | H&E染色图像、RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 65例患者标本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-07-08 |
Multi-Omics Framework Integrating Genetics, Microbiome, Metabolism, and Immunity for Deciphering Ulcerative Colitis Pathogenesis and Diagnostic Biomarker Discovery
2026-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601379R
PMID:42411190
|
研究论文 | 通过多组学框架整合遗传、微生物组、代谢和免疫因素，揭示溃疡性结肠炎发病机制并发现诊断生物标志物 | 首次将孟德尔随机化与单细胞及空间转录组学相结合，系统评估多组学因素与溃疡性结肠炎的因果关联，并发现Neutrophil_IFITM2细胞亚群及其潜在调控轴 | 孟德尔随机化分析基于GWAS汇总数据，可能存在未测量的混杂因素，且IFITM2敲低实验仅在体外巨噬细胞系中进行，缺乏体内验证 | 系统评估与溃疡性结肠炎易感性相关的多组学因素并识别可靠的诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者及健康对照的遗传数据、肠道微生物组、循环代谢物、免疫细胞表型及临床组织样本 | 机器学习, 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, qRT-PCR, siRNA敲低 | 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 多个转录组数据集、独立临床组织样本及THP-1来源的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 623 | 2026-07-08 |
Nav1.5 in the dorsal root ganglion plays a crucial role in mechanical hypersensitivity
2026-Jul-07, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf438
PMID:41810945
|
研究论文 | 本研究揭示Nav1.5在背根神经节中主要负责机械敏感性，并影响神经病理性疼痛和内脏痛模型中的机械超敏反应 | 首次发现传统认为的心脏钠通道Nav1.5在躯体感觉系统中作为机械敏感性的关键决定因子，并证实其在TrkB阳性A纤维神经元中的特异性表达和功能 | NA | 探究Nav1.5在初级感觉神经元中对机械敏感性和疼痛调控的作用 | 背根神经节中的TrkB阳性A纤维神经元 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 小鼠模型（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析背根神经节细胞 |
| 624 | 2026-07-08 |
Dissecting cellular heterogeneity across two ocular melanoma subtypes by single-cell RNA sequencing
2026-Jul-07, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000001119
PMID:42406542
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示两种眼部黑色素瘤亚型的细胞异质性 | 首次在单细胞水平上对葡萄膜黑色素瘤和结膜黑色素瘤两种眼部黑色素瘤亚型进行全面比较，揭示其肿瘤细胞和免疫微环境的差异 | NA | 探究两种眼部黑色素瘤亚型在单细胞水平的肿瘤细胞和微环境异质性 | 28个眼部黑色素瘤样本，包括14个葡萄膜黑色素瘤和14个结膜黑色素瘤样本 | NA | 眼部黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28个眼部黑色素瘤样本（14个葡萄膜黑色素瘤，14个结膜黑色素瘤） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 625 | 2026-07-08 |
Multi-layer network biology combined with single-cell evidence reveals core regulatory nodes in atherosclerotic plaques and potential drug-targeting directions
2026-Jul-07, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05672-4
PMID:42410224
|
研究论文 | 本研究整合多层网络生物学与单细胞证据，揭示动脉粥样硬化斑块中的核心调控节点及潜在药物靶向方向 | 首次将多层网络分析与单细胞RNA测序证据相结合，识别出七个核心枢纽基因（SMAD4、CASP8、PARP1、CRKL、CDK6、VDAC1、KHDRBS1），并发现槲皮素通过多靶点调控这些基因发挥内皮保护作用 | 研究基于公共数据集，未进行大规模临床样本验证，且体外实验仅使用oxLDL诱导模型，未在动物模型中验证 | 解析动脉粥样硬化斑块形成中的核心调控网络并识别潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者的斑块组织、单细胞转录组数据及oxLDL诱导的细胞模型 | 机器学习（如WGCNA、PPI网络分析）与计算机生物学的交叉应用 | 动脉粥样硬化 | NGS（公共数据集：GSE43292、GSE159677） | NA | 基因表达数据（bulk RNA-seq）、单细胞转录组数据（scRNA-seq） | 32名患者的配对斑块组织（包括晚期斑块和早期病变组织） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞平台用于scRNA-seq数据（GSE159677）的分析 |
| 626 | 2026-07-08 |
Angiocrine factors in tumor microenvironment: bidirectional crosstalk, mechanistic insights, and therapeutic strategies
2026-Jul-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08547-7
PMID:42410443
|
综述 | 综述肿瘤微环境中血管分泌因子的双向串扰、机制见解和治疗策略 | 系统总结了血管分泌因子在肿瘤进展中的关键功能域，包括Notch和Wnt信号通路及其串扰网络，并强调“一靶多效”治疗策略的潜力 | 血管分泌因子网络的复杂性和冗余性限制了抗血管治疗的效果，且“一靶多效”策略面临挑战 | 深入理解血管分泌因子的功能特征和调控机制，为癌症治疗寻找有效靶点 | 肿瘤微环境中的血管分泌因子及其与肿瘤细胞、内皮细胞的相互作用 | NA | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 627 | 2026-07-08 |
Integration of bulk RNA-seq and scRNA-seq reveals cell subsets and gene signatures associated with Glaesserella parasuis infection
2026-Jul-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-13146-3
PMID:42410501
|
研究论文 | 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示了与副猪嗜血杆菌感染相关的细胞亚群和基因特征 | 首次在单细胞分辨率下对副猪嗜血杆菌感染中的巨噬细胞异质性进行多组学解析，识别了与疾病严重程度相关的保护性和致病性细胞程序 | 未明确提及局限性，但研究基于猪肺泡巨噬细胞模型，可能无法完全反映体内复杂免疫环境 | 理解副猪嗜血杆菌感染中不同临床结果（从无症状携带到致死性疾病）的分子机制 | 猪肺泡巨噬细胞 | 机器学习和生物信息学 | 副猪嗜血杆菌感染 | 批量RNA-seq和单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据（bulk和单细胞） | 超过98,000个猪肺泡巨噬细胞，来自对照、轻度和严重感染组 | NA | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq | NA | NA |
| 628 | 2026-07-08 |
Single-cell and spatial omics in plants: from cellular atlases to regulatory mechanisms
2026-Jul-07, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag328
PMID:42411279
|
综述 | 综述单细胞与空间组学技术在植物研究中的应用，从细胞图谱构建到调控机制解析的进展与挑战 | 系统总结了植物单细胞研究的技术现状，并提出了未来在木本多年生植物和能源作物中的应用方向 | 未提及具体实验验证的局限性，主要基于文献综述，可能缺乏对某些新兴技术的深入讨论 | 概述植物中单细胞与空间组学技术的现状，讨论实验与分析挑战，并展望未来应用 | 植物（包括草本植物、木本多年生植物和能源作物） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间组学，染色质可及性分析，蛋白质组学，代谢组学 | 网络分析与基因调控网络重建框架 | 单细胞转录组数据，空间组学数据，多组学整合数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序微流控与文库制备平台 |
| 629 | 2026-07-08 |
Single-cell Transcriptomic Atlas of Ovarian Endometriosis Patient's Follicular Fluid: Unraveling Novel Insights into Abnormal Follicular Development
2026-Jul-07, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag083
PMID:42411754
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序对卵巢子宫内膜异位症患者的卵泡液进行转录组图谱分析，揭示异常卵泡发育的新见解 | 首次提供卵巢子宫内膜异位症卵泡液的单细胞转录组图谱，发现一种新型TCR+巨噬细胞亚型，并阐明了颗粒细胞发育异常、免疫失调及独特的细胞间相互作用 | 仅基于单个患者的数据，样本量有限（患侧2793个细胞，对照侧4699个细胞），需要更大规模研究验证 | 揭示卵巢子宫内膜异位症对卵泡发育的影响，寻找潜在诊断和治疗靶点 | 卵巢子宫内膜异位症患者的卵泡液中的细胞 | 单细胞组学 | 卵巢子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1位患者，患侧2793个细胞，对照侧4699个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 630 | 2026-07-08 |
Integrated multi-omics analysis reveals key molecular mechanisms underlying fibroproliferation and immune dysregulation in keloids
2026-Jul-07, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01968-z
PMID:42412240
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示瘢痕疙瘩中纤维增生和免疫失调的关键分子机制 | 首次整合单细胞RNA测序、hdWGCNA、孟德尔随机化、ATAC-seq和SCENIC分析等多种方法，系统鉴定瘢痕疙瘩相关的关键候选基因（CLEC2B、MGST3、SFRP2）和转录因子（CREB3L1、ZEB1） | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏独立验证队列；孟德尔随机化分析基于日本生物样本库，可能限制结果的普适性 | 阐明瘢痕疙瘩发病过程中细胞异质性和分子机制 | 八名瘢痕疙瘩患者的瘢痕组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 8名患者，共73,790个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-07-08 |
Single-cell and Spatial Transcriptomic Profiling Reveal that LAPTM5-mediated Ferroptosis in Macrophages Induces Fibroblast Dysfunction and Amplifies Periodontal Inflammation
2026-Jul-07, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02559-7
PMID:42412288
|
research paper | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示LAPTM5介导的巨噬细胞铁死亡导致成纤维细胞功能障碍并放大牙周炎症 | 首次系统鉴定铁死亡是牙周炎中主要的程序性细胞死亡通路，并发现LAPTM5驱动的巨噬细胞铁死亡通过半乳糖凝集素和OSM信号通路与成纤维细胞相互作用，导致成纤维细胞功能障碍和慢性炎症 | 主要基于公开数据集分析，缺乏大规模临床样本验证；功能实验仅限于体外模型，未在体内模型中验证 | 探究牙周炎中关键的程序性细胞死亡通路及其驱动因子，为恢复牙周免疫平衡提供新的治疗靶点 | 牙周炎组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 | machine learning | geriatric disease | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | gene expression data | 多个公开发表的单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 632 | 2026-07-08 |
Protocadherin-1 deficiency increases baseline and allergen-induced airway hyperresponsiveness in mice
2026-Jul-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag131
PMID:42412517
|
研究论文 | 研究发现原钙粘蛋白-1基因敲除小鼠在基线及过敏原刺激下气道高反应性增加，并伴有气道上皮屏障完整性下降和肺顺应性降低 | 首次构建Pcdh1基因敲除小鼠模型，并揭示其在上皮细胞分化、屏障完整性和气道重塑中的新功能 | 未完全阐明PCDH1缺失导致气道高反应性的分子机制，且仅在小鼠模型中验证 | 探究原钙粘蛋白-1在气道高反应性、炎症和重塑中的作用 | Pcdh1基因敲除小鼠及野生型对照小鼠 | 数字病理学 | 哮喘 | 基因敲除, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Pcdh1基因敲除小鼠及野生型同窝对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2026-07-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals A Tumor-Promoting Role of EGR1+CD4+ T Cells in Papillary Thyroid Cancer
2026-Jul-07, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag060
PMID:42412534
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序，揭示了乳头状甲状腺癌中EGR1+CD4+ T细胞促肿瘤作用的新发现 | 首次识别出EGR1+CD4+ T细胞作为此前未报道的CD4+ T细胞亚群，并发现其通过CD96/TIGIT阻断剂具有增强抗肿瘤免疫的潜力 | 研究仅在体外细胞系中进行，未涉及体内模型或临床样本验证，且EGR1+CD4+ T细胞的全面功能机制有待进一步探索 | 探究乳头状甲状腺癌中新型CD4+ T细胞亚群的功能及其在免疫治疗中的潜在靶点 | 乳头状甲状腺癌组织和细胞系中的T细胞亚群 | 自然语言处理 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提供样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析平台 |
| 634 | 2026-07-08 |
The evolutionary transition from alga to parasite in the sister lineage of apicomplexans
2026-Jul-06, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.05.042
PMID:42302773
|
research paper | 描述了在顶复门姐妹谱系中从藻类到寄生虫的进化转变，特别是新发现的寄生性chrompodellid物种Holdonia amygdala | 首次发现一种新的外寄生chrompodellid物种Holdonia amygdala，其具有不同于已知寄生方式的生态策略，并通过单细胞转录组学和系统基因组学分析揭示了其独立失去光合作用的进化路径 | 仅基于四个单细胞进行转录组分析，样本量较小，可能限制了进化推断的全面性 | 研究从自由生活藻类到专性寄生虫的进化转变过程 | 新发现的chrompodellid物种Holdonia amygdala及其与其他chrompodellids的进化关系 | machine learning | NA | 单细胞转录组学, 系统基因组学 | NA | 基因表达数据 | 四个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 用于单细胞转录组分析的平台未在标题和摘要中明确说明 |
| 635 | 2026-07-08 |
Super-resolution multimodal spatial transcriptomics reveals an ovoid stem cell niche structuring de novo shoot regeneration
2026-Jul-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.008
PMID:42141722
|
研究论文 | 利用超分辨率多模态空间转录组学揭示卵形干细胞龛在植物从头芽再生中的结构组织 | 首次通过超分辨率空间转录组学在单细胞尺度上揭示了植物再生过程中一种之前未被识别的卵形干细胞龛结构，并阐明了EPFL8b信号在其中的作用 | 未知（摘要未提及局限性） | 探究植物从头再生过程中干细胞龛形成的结构原理 | 番茄芽再生过程中的细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 约120万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | 超分辨率多模态空间转录组学 |
| 636 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies a MIF-driven keratinocyte-macrophage-Th2 axis as a key inflammatory circuit in atopic dermatitis
2026-Jul-06, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02316-4
PMID:42406119
|
研究论文 | 单细胞转录组分析揭示特应性皮炎中MIF驱动的角质形成细胞-巨噬细胞-Th2轴作为关键炎症回路 | 首次通过单细胞RNA测序揭示特应性皮炎中MIF信号轴在增殖角质形成细胞与M2极化巨噬细胞间相互作用及Th2驱动炎症中的关键作用 | NA | 阐明特应性皮炎发病中细胞异质性和细胞间通信网络的驱动机制 | 特应性皮炎患者皮损组织中的角质形成细胞、T细胞和巨噬细胞 | machine learning | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 特应性皮炎患者皮损组织样本及体外细胞模型（HaCaT、HEK、原代角质形成细胞和THP-1细胞）、MC903诱导的AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2026-07-08 |
Upregulation of macrophage UPP1 promotes lung adenocarcinoma metastasis through an mtROS-cGAS-NLRP3 inflammasome axis
2026-Jul-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03226-4
PMID:42409780
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞UPP1通过mtROS-cGAS-NLRP3炎症小体轴促进肺腺癌转移的机制 | 首次发现UPP1作为巨噬细胞富集的代谢调控因子，通过线粒体应激-cGAS-NLRP3通路驱动IL-1β介导的巨噬细胞-肿瘤细胞互作，促进肺腺癌转移 | 未明确UPP1在其他肿瘤类型中的作用及临床应用转化中的具体障碍 | 探究肿瘤相关巨噬细胞中代谢调控因子UPP1促进肺腺癌转移的分子机制 | 肺腺癌组织样本及巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个临床队列样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'单细胞RNA测序平台 |
| 638 | 2026-07-08 |
Multiscale systems modelling of communication networks in brain metastasis
2026-Jul-06, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01774-4
PMID:42409962
|
综述 | 通过整合空间转录组学/蛋白质组学、单细胞和多组学数据，将脑转移重新定义为一种多尺度通讯障碍，并讨论基于网络的模型和人工智能如何识别通讯枢纽、预测治疗反应以及指导联合治疗策略 | 首次将脑转移系统地概念化为跨分子、细胞、空间和系统尺度的通讯障碍，并强调整合空间与分子数据来识别可药物化的通讯枢纽 | 指出数据协调、空间分辨率限制、模型可解释性及临床部署约束等关键障碍 | 构建多尺度通讯模型以指导脑转移的精准治疗策略和临床试验设计 | 脑转移瘤微环境中的免疫、胶质、血管和全身性网络 | 计算系统建模 | 脑转移瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞组学, 多模态组学, 计算系统建模 | 网络模型, 多尺度模型, 人工智能模型 | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 单细胞数据, 多组学数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学, 单细胞组学, 空间蛋白质组学 | 不适用 | 不适用 |
| 639 | 2026-07-08 |
Granzyme K CD8⁺ T cells with tissue-resident features promote intestinal inflammation in patients with Crohn's disease
2026-Jul-06, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01763-7
PMID:42409960
|
研究论文 | 通过单细胞RNA和T细胞受体测序分析克罗恩病患者血液和肠道组织中的CD8+ T细胞，发现具有组织驻留特征的颗粒酶K+ CD8+ T细胞促进肠道炎症 | 首次揭示颗粒酶K+ CD8+ T细胞在克罗恩病肠道炎症中的促进作用，并证实其通过CXCR3-CXCL9/10轴与髓系细胞相互作用 | 样本量较小（15例患者），且未进行功能验证实验以外的机制深入研究 | 阐明CD8+ T细胞在克罗恩病发病机制中的作用，特别是颗粒酶不同亚群的炎症调节功能 | 克罗恩病患者的血液和肠道组织中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 15例患者（血液和肠道组织）及2例患者（空间转录组） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA和TCR测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 640 | 2026-07-08 |
A two-pronged strategy eliminates dissociation artifacts for high-fidelity neuroimmune single-cell transcriptomics
2026-Jul-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10609-x
PMID:42410134
|
研究论文 | 提出双重策略消除解离伪影，实现高保真神经免疫单细胞转录组学 | 结合优化实验方案和随机森林计算方法，分别实现约95%和60-64%的伪影消除，并首次绘制脑和颅骨骨髓的SAT伪影图谱 | 仅评估了大脑和颅骨骨髓中的解离伪影，可能不适用于其他组织；计算结果依赖于训练数据质量 | 消除单细胞RNA测序中的解离诱导应激伪影，提高神经免疫研究的准确性 | 小鼠大脑和颅骨骨髓中的神经免疫细胞 | 机器学习 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及脑和颅骨骨髓样本 | 未明确说明 | 单细胞RNA测序 | 未明确说明 | 未明确说明 |