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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-21 |
Single-cell and spatial transcriptomic analysis reveal distinct tumor microenvironment signatures in primary and recurrent hypopharyngeal squamous cell carcinoma
2026-Jul-13, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-00991-z
PMID:42443752
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了原发性和复发性下咽鳞状细胞癌肿瘤微环境的差异特征及复发相关分子机制 | 首次在复发性下咽鳞状细胞癌中鉴定出IGF2BP2作为m6A阅读蛋白选择性上调,通过稳定SMAD3 mRNA激活TGF-β信号通路促进恶性进展;同时揭示了FN1介导的基质激活和以CTLA4上调为标志的髓系免疫抑制重塑 | 样本量较小(原发6例,复发3例),需要更大规模的队列验证;功能验证实验的具体细节和范围未在摘要中充分说明 | 解析原发性和复发性下咽鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征及驱动复发的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 原发性下咽鳞状细胞癌样本(n=6)和复发性下咽鳞状细胞癌样本(n=3) | 数字病理学 | 下咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 原发灶6例,复发灶3例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-09-21 |
NK-like and networked CD8+ T cell immunity mediates exceptional HIV control
2026-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.02.735504
PMID:42465352
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研究论文 | 该研究通过整合功能性表位定位、单细胞转录组学和感染细胞清除实验,揭示了NK样KIR+CD8+ T细胞亚群与网络化HIV表位靶向共同介导了HIV的卓越控制 | 首次在卓越控制者中发现了NK样KIR+CD8+ T细胞亚群,该亚群选择性富集于HIV特异性CD8+ T细胞中,与高度细胞毒性亚群转录相似,并且功能性耗竭KIR+CD8+ T细胞会显著削弱对自体HIV感染CD4+ T细胞的清除能力,揭示了补体网络化表位靶向的先前未被认识的HIV免疫组分 | 摘要中未明确说明样本量及具体研究队列的详细特征,且卓越控制者属于罕见群体,样本获取可能存在局限 | 探究储库定义的卓越控制者中实现类似治愈性免疫的机制,为HIV免疫治疗治愈策略提供新框架 | HIV感染者中的卓越控制者(储库定义的卓越控制者),包括精英控制者谱系中无完整前病毒或前病毒局限于转录抑制基因组区域的罕见个体 | 免疫学、单细胞组学 | HIV感染 | 功能性表位定位、单细胞转录组学、感染细胞清除实验、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、功能性实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-09-21 |
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.021
PMID:41407191
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研究论文 | 本研究通过对小鼠背部皮肤四个相邻区域的细胞群体进行流式分选,定义了真皮乳头细胞、隆突干细胞、毛芽干细胞、表皮和毛囊上皮细胞及真皮成纤维细胞的转录组,揭示了毛囊干细胞及其微环境的分子特征和信号互作 | 首次对来自4个相邻小鼠背部皮肤区域的多个细胞群体进行流式分选并进行全转录组测序,通过56个全转录组测量的交叉比较,以空前的灵敏度分类了细胞类型特异性分子特征,并结合配体-受体映射和CellChat分析揭示了全面的细胞间通讯机制,同时更新了Hair-GEL数据库 | 研究仅基于小鼠模型,虽然与人类对应物进行了比较,但未进行直接的人类样本验证 | 深入探究毛囊干细胞及其指导性微环境的独特基因表达程序,并揭示细胞间的信号互作 | 小鼠背部皮肤中的真皮乳头细胞、隆突干细胞、毛芽干细胞、表皮和毛囊上皮细胞及真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 全转录组测序, 单细胞转录组学, 流式分选 | CellChat | 转录组数据 | 4个相邻小鼠背部皮肤区域,共56个全转录组测量样本 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-09-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate vascular cell orchestration of inflammatory changes after UV light exposure in skin
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.024
PMID:41419052
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研究论文 | 该研究通过单细胞和空间转录组学分析了小鼠皮肤暴露于UVB后表皮、真皮和脂肪组织的转录组变化,揭示了血管细胞在炎症反应中的协调作用 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析了UVB照射后皮肤不同层次和细胞类型的动态转录变化,并进行了跨物种比较,揭示了内皮细胞作为CXCL趋化因子和C3的关键靶点 | 研究主要基于小鼠模型,虽然进行了跨物种比较,但人类皮肤的验证有限;仅分析了UVB照射后12小时的时间点,未能全面捕捉动态变化过程 | 阐明急性紫外线辐射对皮肤的复杂影响,特别是血管细胞在炎症变化中的协调作用 | 小鼠皮肤组织(表皮、深层真皮和脂肪组织) | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 皮肤红斑狼疮, 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2026-09-21 |
Mapping clinical CAR-T cells: insights from scRNA-seq
2026-07, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2025.12.006
PMID:41545236
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序分析临床CAR-T细胞的研究,聚焦于T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性和细胞因子等方面 | 系统总结了scRNA-seq在临床CAR-T细胞研究中的应用,整合了T细胞激活、CD4+/CD8+比例、增殖、调节性T细胞和代谢等多维度发现及其与患者反应的相关性 | 作为综述,未提供原始实验数据,且scRNA-seq在CAR-T细胞研究中仍存在技术局限性 | 总结scRNA-seq在临床CAR-T细胞分析中的应用,为临床医生和研究人员提供关键见解 | 临床CAR-T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-09-21 |
Ablation of the renal tubular gluconeogenic enzyme PCK1 drives AKI-to-CKD transition by negatively regulating the TGF-β/Smad3 signaling pathway
2026-Jul-01, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06310-1
PMID:42380498
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研究论文 | 本研究揭示了肾脏近端小管糖异生限速酶PCK1在急性肾损伤向慢性肾脏病转变过程中发挥关键调控作用,其缺失通过激活TGF-β/Smad3信号通路驱动肾纤维化 | 首次发现PCK1是TGF-β/Smad3信号通路的内源性负调控因子和拮抗剂,阐明了PCK1缺失先于胶原沉积并作为纤维化发生的主要驱动因素,提出了PCK1靶向调节Smad3信号作为阻止AKI向CKD转变的治疗新策略 | 摘要中未明确提及研究局限性,体内实验主要在啮齿动物模型中进行,PCK1靶向治疗策略的临床转化效果尚需进一步验证 | 探究糖异生限速酶PCK1在急性肾损伤向慢性肾脏病转变中的作用及其分子机制 | 人类单细胞RNA测序数据集中的受损近端小管细胞、啮齿动物AKI-to-CKD模型、体外培养的肾小管上皮细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 肾脏疾病, 急性肾损伤, 慢性肾脏病, 肾纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 人类scRNA-seq数据集及啮齿动物模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-09-20 |
Single-cell analysis of ovarian immune cells reveals dynamic changes in NK and B-cell populations after ovarian stimulation
2026-07-10, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag153
PMID:42467591
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析小鼠卵巢免疫细胞,揭示促性腺激素刺激后NK细胞和B细胞群体的动态变化 | 首次在小鼠卵巢中系统表征高雌二醇状态下的免疫微环境,发现卵巢白细胞主要为组织驻留细胞,并揭示促性腺激素刺激后NK细胞频率翻倍而B1细胞减半的动态变化 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类卵巢中验证;单细胞RNA测序的细胞数量有限;未深入探讨NK细胞和B细胞变化的分子机制 | 探究高雌二醇和低雌二醇状态下卵巢免疫微环境的组成和动态变化 | 小鼠卵巢白细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-09-20 |
The emerging roles of noncoding RNAs in cancer
2026-Jul-07, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgag053
PMID:42664476
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综述 | 本文综述了非编码RNA(ncRNA)在癌症发生、发展及治疗耐药中的作用,并评估其作为诊断标志物、预后因子和治疗靶点的潜力 | 系统整合了四大类ncRNA(miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA)在癌症中的功能机制,并全面评述了基于ncRNA的治疗策略(如反义寡核苷酸、siRNA、CRISPR调控等)及高通量测序、单细胞转录组学和计算建模在其研究中的应用 | CRISPR介导的ncRNA调控仍处于研究阶段,受递送效率、脱靶活性和对ncRNA上下文依赖性理解不完整等因素限制;ncRNA的临床应用转化仍面临挑战 | 探讨不同类型ncRNA如何参与癌症起始、进展和治疗耐药,并评估其作为诊断标志物、预后因子和治疗靶点的潜力 | 非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA)及其在癌症中的作用 | 机器学习 | 肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年疾病 | 高通量测序、单细胞转录组学、计算建模 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2026-09-20 |
Single-cell profiling of paired nasal brushing and tissue samples reveals distinct cellular landscapes and immune phenotypes
2026-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.019
PMID:41759750
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,直接比较了同一解剖位点采集的配对鼻腔刷检(NB)和鼻组织(NT)样本的细胞组成和免疫细胞反应 | 首次在同一解剖位点配对采集NB和NT样本,系统比较了两种采样方法的细胞组成和免疫表型差异,揭示了NB样本在反映鼻组织免疫景观方面的局限性 | NB样本对深层黏膜层细胞的捕获能力有限,可能无法完全代表鼻组织的整体免疫状态 | 比较非侵入性鼻腔刷检样本与鼻组织样本的细胞组成和免疫细胞反应,评估NB样本能否准确反映鼻组织的免疫景观 | 同一解剖位点配对采集的鼻腔刷检样本和鼻组织样本 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 配对鼻腔刷检和鼻组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-09-20 |
From inflammation to malignancy: the dynamic evolution of cancer-associated fibroblasts in IBD-CRC
2026-07, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101310
PMID:42019096
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综述 | 本文综述了炎症性肠病相关结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的动态演化及其在恶性转化中的作用 | 提出'基质炎症记忆'概念,认为其通过表观遗传印记和PFKFB3介导的糖酵解代谢重编程编码,并强调基质与上皮和免疫区室的共演化驱动CAF亚群多样化 | 作为综述,缺乏原始实验数据验证所提出的概念框架,且'基质炎症记忆'等假设仍需进一步实验证实 | 探讨IBD-CRC中肠道成纤维细胞从炎症到恶性转化的动态演化及其作为肿瘤微环境驱动因素的作用 | 炎症性肠病相关结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞、肠道成纤维细胞、上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-09-19 |
ITPRIPL1: A tumor immune-associated biomarker with prognostic and therapeutic implications in gastrointestinal cancer
2026-07-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-64178-4
PMID:42728269
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研究论文 | 通过对胃癌、结肠癌、直肠癌和食管癌的多组学整合分析,揭示ITPRIPL1作为胃肠道肿瘤免疫相关生物标志物的预后与治疗意义 | 首次系统评估ITPRIPL1在多种胃肠道恶性肿瘤中的肿瘤类型特异性,发现其预后意义仅局限于胃腺癌,并揭示其与免疫微环境(特别是CD8⁺/CD4⁺ T细胞丰度及ZAP70表达)的动态关联 | 研究以探索性分析为主,外部免疫治疗队列和药敏数据的验证尚需前瞻性研究证实,机制层面的功能实验较为有限 | 阐明ITPRIPL1在胃肠道恶性肿瘤中的肿瘤类型特异性、临床相关性及其作为预后和治疗靶点的潜力 | 胃腺癌、结肠腺癌、直肠腺癌和食管癌患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 胃肠道肿瘤 | bulk转录组学, 免疫通路分析, 生存建模, 单细胞RNA测序, 免疫荧光验证, 治疗相关性分析 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-09-19 |
Spatial characterization of interface dermatitis in cutaneous lupus reveals novel chemokine axis-mediated recruitment of leukocytes that drive disease
2026-07-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-60937-5
PMID:42744872
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研究论文 | 通过空间转录组学和靶向蛋白质组学揭示皮肤型红斑狼疮界面皮炎的免疫发病机制,并发现新的趋化因子轴介导白细胞募集 | 首次在界面皮炎中鉴定出AIM2-Casp8-IL-18-CXCL6-CXCR1轴介导CD14+CD16+单核细胞募集,以及CCL8-CCR2和IFNG/IFNL1-CXCL9/CXCL11-CXCR3趋化因子轴,并发现羟氯喹和瑞帕辛可分别阻断不同单核细胞亚群的迁移 | 样本量较小(仅7例CLE患者和3例健康对照用于蛋白质组学,6例CLE和6例健康供体用于趋化实验),需要在更大队列中验证这些发现 | 研究皮肤型红斑狼疮中界面皮炎的免疫发病机制并寻找治疗靶点 | 皮肤型红斑狼疮患者(包括亚急性皮肤型红斑狼疮和盘状红斑狼疮)及健康对照者的皮肤组织和外周血单个核细胞 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 免疫学 | 皮肤型红斑狼疮 | 空间转录组学, 靶向蛋白质组学, 光谱流式细胞术, 趋化实验 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 空间转录组学和蛋白质组学:4例SCLE、4例DLE和3例健康边缘对照的存档组织;靶向蛋白质组学:7例CLE(4例SCLE、3例DLE)和3例健康对照的新鲜水疱活检组织及血清;趋化实验:6例CLE和6例健康献血者的外周血单个核细胞 | NA | 空间转录组学, 靶向蛋白质组学, 光谱流式细胞术 | NA | NA |
| 53 | 2026-09-19 |
Single-Cell Transcriptome Profiles of Foxl1-Lineage Cells Along the Intestinal Crypt-Villus Axis
2026-Jul-16, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101849
PMID:42463014
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序结合原位杂交、免疫荧光和报告小鼠模型,构建了沿肠道隐窝-绒毛轴的Foxl1谱系细胞图谱,揭示了四种空间上不同的亚上皮细胞群及其信号特征。 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘了沿肠道隐窝-绒毛轴的Foxl1谱系细胞异质性,鉴定出四种空间上不同的亚群(隐窝、绒毛基部、绒毛中部、绒毛顶端),并揭示了它们各自的信号程序、功能特化及其配对关系。 | 摘要中未明确提及研究局限性,可能包括样本量有限、仅基于小鼠模型、未进行功能验证实验等。 | 解析肠道隐窝-绒毛轴上Foxl1谱系细胞的异质性及其在维持肠道上皮稳态中的信号调控作用。 | 小鼠肠道隐窝-绒毛轴上的Foxl1谱系细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-09-19 |
Machine learning-based prognostic model and single-cell transcriptomic integration for identifying brain metastasis-associated malignant subpopulations and potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04370-8
PMID:42443906
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组数据与机器学习方法,构建了肺腺癌脑转移相关的预后模型,并鉴定出SEC61G和CFL1作为潜在的恶性亚群标志物及治疗靶点 | 首次结合单细胞转录组学(inferCNV和hdWGCNA)与101种机器学习组合方法构建了肺腺癌脑转移信息指导的12基因预后模型,并系统揭示了脑转移肿瘤微环境中MIF-CD74/CXCR4和MIF-CD74/CD44信号轴的关键调控作用 | 脑转移单细胞样本量有限,预后模型仍需更大规模的前瞻性队列验证,SEC61G和CFL1的具体分子机制尚未完全阐明 | 表征肺腺癌脑转移的肿瘤微环境,识别脑转移相关的恶性细胞亚群,构建预后模型并发现潜在治疗靶点 | 肺腺癌脑转移患者的单细胞转录组样本、肺腺癌生存队列数据、人脑转移组织、小鼠脑转移模型及PC9-BrM细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, qRT-PCR | 机器学习组合模型, CNN | 图像, 文本 | 脑转移单细胞转录组样本及多个肺腺癌生存队列,具体样本量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-09-19 |
IL-31 blockade elevates thymus and activation-regulated chemokine by lifting LAMP3+CD1c+ mature dendritic cells from calcitonin gene-related peptide-calcitonin receptor-like neuroimmune suppression in atopic dermatitis
2026-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.044
PMID:41831623
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研究论文 | 本研究通过血清蛋白质组学、小鼠模型、单细胞RNA测序及功能实验,揭示了IL-31受体阻断后TARC升高的神经免疫机制,即IL-31依赖的CGRP-CALCRL神经免疫刹车被解除,导致LAMP3+CD1c+成熟树突状细胞活化并释放TARC | 首次揭示了IL-31通过CGRP-CALCRL神经免疫轴抑制树突状细胞成熟和TARC产生的机制,阐明了nemolizumab治疗中TARC升高的原因,提出了神经免疫刹车的新概念 | 部分机制验证主要依赖小鼠MC903模型,人体数据以相关性分析为主,样本量有限,需要更大规模的临床研究验证 | 阐明IL-31受体A阻断后血清TARC升高的系统性变化及其神经免疫机制 | 特应性皮炎患者、MC903诱导的小鼠AD模型、人树突状细胞及人背根神经节 | 数字病理学, 机器学习 | 特应性皮炎 | 血清蛋白质组学(Olink), 单细胞RNA测序, 原位验证, 配体-受体推断分析 | NA | 图像, 文本 | 特应性皮炎患者样本(具体数量未提及)、MC903小鼠模型、人树突状细胞及人背根神经节样本 | Olink | 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 | Olink | NA |
| 56 | 2026-09-19 |
Heterogeneity and clinical relevance of group 2 innate lymphoid cells subsets in nasal polyps
2026-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.021
PMID:41956382
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了鼻息肉中2型固有淋巴样细胞(ILC2)的异质性及其与临床严重程度的关系 | 首次在鼻息肉中鉴定出四种具有不同激活状态的ILC2亚群(迁移型、过渡型、炎症型和耗竭样型),并揭示了这些亚群与临床严重程度的特异性关联 | 样本量较小(仅6例鼻息肉组织和4例外周血样本),需要更大规模的队列研究验证 | 探究鼻息肉中2型细胞因子的细胞来源、ILC2亚群的异质性以及ILC2亚群与临床严重程度的关系 | 鼻息肉组织和外周血样本中的ILC2细胞和CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例鼻息肉组织样本和4例外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-09-19 |
Establishing a single-cell RNA sequencing workflow using EUS-guided fine-needle aspiration for pancreatic ductal adenocarcinoma
2026 Jul-Aug, Endoscopic ultrasound
IF:4.4Q1
DOI:10.1097/eus.0000000000000214
PMID:42751418
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研究论文 | 本研究评估了使用超声内镜引导细针穿刺(EUS-FNA)获取的胰腺导管腺癌(PDAC)样本进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)的可行性,并与手术切除样本的质量指标和细胞组成进行了比较 | 首次系统评估EUS-FNA来源PDAC样本用于scRNA-seq的可行性,并比较其与手术切除样本在质量指标和细胞组成上的差异 | 样本量有限,需要在更大规模、最好是配对的前瞻性队列中进一步验证 | 评估EUS-FNA来源PDAC样本进行scRNA-seq分析的可行性,并比较其与手术切除样本的质量指标和细胞组成 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者的EUS-FNA样本和手术切除样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台 |
| 58 | 2026-09-16 |
Time-dependent effects of rapid-acting antidepressants in iPSC-derived neurons from treatment-resistant depression and healthy volunteers
2026-Jul-24, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03768-0
PMID:42498781
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研究论文 | 该研究利用来自难治性抑郁症患者和健康志愿者的iPSC衍生的皮层神经元,评估了多种快速起效抗抑郁药在6小时和24小时处理后的转录组效应 | 首次在iPSC衍生神经元模型中并行评估多种候选快速起效抗抑郁药,并结合单细胞RNA测序揭示了(2R,6R)-HNK的细胞类型特异性效应,且与氯胺酮治疗健康志愿者的脑脊液蛋白质组学结果进行了验证 | 摘要中未明确提及样本量有限、iPSC模型无法完全模拟体内复杂环境、仅评估了6小时和24小时两个时间点、以及脑脊液蛋白质组学验证仅针对氯胺酮 | 探究快速起效抗抑郁药在人类皮层神经元中的分子机制及其治疗效果的转化相关性 | 来自难治性抑郁症患者和健康志愿者的iPSC衍生成熟皮层样神经元 | 数字病理学 | 难治性抑郁症 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 蛋白质印迹, 免疫细胞化学, 脑脊液蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像 | 来自难治性抑郁症患者和健康志愿者的iPSC衍生神经元,具体数量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-09-16 |
GEM-GPT Enables Personalized Cell Type-Resolved Therapeutic Design for Systems Pharmacology
2026-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.739269
PMID:42539229
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研究论文 | 本文提出了GEM-GPT,一个基于转录组的分子生成框架,通过耦合单细胞RNA测序基础模型与分子GPT模型,设计能够逆转细胞类型特异性疾病状态的个性化治疗化合物 | 首次将单细胞RNA测序基础模型与分子GPT模型进行生物学启发的深度融合,实现细胞类型特异性化学-基因相互作用的建模,能够为不同细胞类型生成不同分子,并稳健泛化到未见过的细胞类型 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发面向系统药理学的生成式AI工具,实现个性化、细胞类型分辨的治疗分子设计,以克服传统一药一靶点范式的局限性 | 慢性及全身性疾病(以阿片类药物使用障碍为案例研究),涉及不同细胞类型的疾病状态 | 机器学习 | 阿片类药物使用障碍 | 单细胞RNA测序 | GPT、基础模型 | 文本、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-09-16 |
Neonatal hyperoxia promotes macrophage senescence and lung injury via a p38MAPK-dependent secretome
2026-Jul-17, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag141
PMID:42473130
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示了新生儿高氧通过糖酵解重编程诱导肺泡巨噬细胞衰老,并通过p38MAPK依赖性分泌组导致肺损伤的机制 | 首次阐明高氧通过增加糖酵解诱导肺泡巨噬细胞衰老,并证明衰老肺泡巨噬细胞的分泌组通过p38MAPK依赖性机制驱动肺损伤,提出抑制巨噬细胞糖酵解和p38MAPK通路作为预防肺损伤的新治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究高氧诱导肺泡巨噬细胞衰老的机制,以及衰老/高氧对肺泡巨噬细胞功能的影响和其分泌组在肺损伤中的作用 | 高氧暴露的新生小鼠及肺泡巨噬细胞 | 机器学习 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |