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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-05-12 |
Molecular mechanisms linking cadmium chloride exposure to ankylosing spondylitis: an integrative network-based study
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05394-7
PMID:42113191
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研究论文 | 采用网络毒理学框架,整合多机器学习和单细胞转录组分析,揭示氯化镉暴露与强直性脊柱炎之间的分子机制 | 首次通过网络毒理学结合多种机器学习算法(LASSO、SVM、随机森林和XGBoost)鉴定氯化镉暴露与强直性脊柱炎的核心共靶基因,并利用孟德尔随机化和单细胞RNA-seq虚拟敲除验证ETFA的因果作用 | 研究基于公开数据库和计算分析,缺乏大规模的队列验证和深入的体内实验验证 | 阐明氯化镉慢性暴露通过免疫调控异常参与强直性脊柱炎发病的分子机制 | 氯化镉暴露相关的毒理学靶点与强直性脊柱炎患者差异表达基因的交集基因 | 机器学习 | 强直性脊柱炎 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | GSE73754数据集(AS相关DEGs)、GSE194315数据集(单细胞RNA-seq) | NA | NA | NA | NA |
| 562 | 2026-07-25 |
Exploring peripheral immune mechanisms and potential therapeutic drugs for Alzheimer's disease
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05397-4
PMID:42089894
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 563 | 2026-07-25 |
Integrative single-cell transcriptomics and co-expression network analysis identify SIMALR as a prognostic immune-related lncRNA in breast cancer: in silico analysis and validation
2026-Jul, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05156-5
PMID:42103982
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 564 | 2026-07-25 |
tBid-Mediated Genetic Ablation of Connective Tissue Cells Reveals Their Key Regulatory Function During Limb Regeneration in Axolotls
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524339
PMID:42201602
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 565 | 2026-07-25 |
Ankyrin-B and ankyrin-G are required for synaptic integrity in the mouse outer retina
2026-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag239
PMID:42491609
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 566 | 2026-07-23 |
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026 Jul-Aug, Mycologia
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/00275514.2026.2631200
PMID:41871174
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研究论文 | 利用单细胞转录组学描述来自阿拉斯加湾的一种新海洋寄生虫罗兹菌及其分布特征 | 首次基于238个基因的系统发育分析确认一种新的罗兹菌分离株在罗兹菌门中的独特分类地位,并提出将其建立为新属 | 未明确提及局限性,但依赖于metaPR数据库的ASV分布数据可能受限于现有采样覆盖度 | 揭示海洋寄生虫罗兹菌门的多样性、分布和生态作用 | 从阿拉斯加湾分离的新罗兹菌分离株及硅藻宿主 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞转录组学, 系统发育分析 | 不适用 | 转录组数据, 宏条形码序列数据 | 1个分离株及多个环境样本(来自metaPR数据库) | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 567 | 2026-07-15 |
Microplastic Exposure Aggravates Cardiomyopathy Under Hemodynamic Stress Through the Gut-Heart Axis
2026-Jul-14, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 该研究揭示双酚F(BPF)通过肠道微生物代谢产生的N-乙酰腐胺(NAP)引起心肌肥厚和肠道屏障损伤的机制 | 首次发现肠道微生物在BPF诱导心脏毒性中的关键作用,并阐明了一条新的肠-心轴通路:色醇/Sat1-NAP通路 | NA | 研究BPF对心血管系统和肠道屏障的毒性作用及其机制 | BPF对小鼠和人类的心血管及肠道系统的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 代谢组学, 空间代谢组学 | NA | 测序数据, 代谢组数据 | 285份人类尿液样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2026-07-15 |
Multi-omics Mendelian randomization and experimental validation identify PRKAB1 as a regulator of phosphatidylcholine metabolism in IBD
2026-Jul-14, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05685-z
PMID:42443636
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研究论文 | 整合多组学孟德尔随机化与实验验证,揭示PRKAB1在炎症性肠病中调控磷脂酰胆碱代谢的作用 | 首次通过多组学定量性状位点分析与孟德尔随机化相结合,鉴定PRKAB1为IBD中磷脂酰胆碱代谢的关键调控因子,并通过敲低实验验证其功能 | 未在独立的队列中验证PRKAB1的因果关系,且药物预测缺乏体内实验验证 | 探索磷脂酰胆碱代谢相关基因与炎症性肠病的因果遗传关联 | 磷脂酰胆碱代谢相关基因(PRKAB1等)及78种脂质物种 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 孟德尔随机化、多组学QTL分析、单细胞RNA测序、基因敲低实验、分子对接 | NA | 多组学数据(DNA甲基化、基因表达、蛋白质丰度)、单细胞RNA测序数据 | FinnGen研究和IBD Genetics Consortium的数据集,包含78种脂质物种 | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序,Illumina NovaSeq用于批量测序 |
| 569 | 2026-07-15 |
Multi-omics machine learning-driven investigation of super-enhancers signatures and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2026-Jul-14, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01969-y
PMID:42443661
|
研究论文 | 通过多组学与机器学习结合的方法,探索肺腺癌中超级增强子特征及预后生物标志物 | 首次整合批量、单细胞和空间转录组学数据,结合10种聚类算法识别肺腺癌中超增强子相关分子亚型,并构建基于超增强子相关基因的风险评分预后模型 | 未提及具体限制 | 揭示肺腺癌中超级增强子的促肿瘤和肿瘤微环境调控特征,建立分子分型和预后模型 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本及体外细胞实验 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Lasso + StepCox算法 | 批量转录组, 单细胞转录组, 空间转录组数据 | 涉及肺腺癌患者样本(具体数量未提及) | 未提及 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 未提及 | 未提及 |
| 570 | 2026-07-15 |
Adenosine-A Regulator of Human Testicular Peritubular Cells
2026-Jul-14, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70304
PMID:42444403
|
研究论文 | 研究了腺苷对人睾丸周管细胞(HTPCs)的调控作用,发现腺苷通过受体介导的信号通路影响细胞功能 | 首次揭示腺苷通过ADORA2B受体上调IL33和StAR蛋白,并发现其诱导类固醇生成和炎症信号,拓展了对睾丸嘌呤信号系统的认知 | 结果基于体外细胞实验,可能无法完全反映体内实际情况;未明确腺苷在体内对男性生育功能的直接生理影响 | 探究腺苷对人睾丸周管细胞的调控机制及其生理功能 | 人睾丸周管细胞(HTPCs) | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、qPCR | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 睾丸组织样本来源的HTPCs细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 571 | 2026-07-15 |
African swine fever virus MGF_110-3L and MGF_110-4L signal TLR2-mediated lethal inflammation
2026-Jul-14, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag047
PMID:42446133
|
研究论文 | 揭示非洲猪瘟病毒MGF_110-3L和MGF_110-4L通过TLR2介导致命性炎症的机制 | 首次发现ASFV编码的MGF_110-3L和MGF_110-4L为分泌型毒力因子,通过结合TLR2并激活MyD88依赖性NF-κB信号通路诱导细胞因子风暴和免疫病理 | 未提及具体局限性,但可能包括体外模型与体内炎症过程的差异以及样本规模对结果普适性的影响 | 探究ASFV中导致系统性炎症的病毒因子及其分子机制 | 非洲猪瘟病毒MGF_110-3L和MGF_110-4L蛋白,及猪外周血单核细胞 | 分子生物学 | 非洲猪瘟 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 猪外周血单核细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 572 | 2026-07-15 |
High-Risk Rhabdomyosarcomas Feature a Convergent Cell State
2026-Jul-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4403
PMID:42446905
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研究论文 | 该论文通过单细胞转录组学等技术发现高危横纹肌肉瘤的癌细胞无论FOXO1融合状态如何,均会汇聚到一个共同的细胞状态,并表现出神经特征 | 首次发现高危横纹肌肉瘤存在超越传统分子和组织学边界的汇聚性细胞状态,并揭示该状态表现出神经特征 | 摘要中未提及局限性 | 研究高危横纹肌肉瘤的细胞状态特征及其与FOXO1融合状态的关系 | 高危横纹肌肉瘤的癌细胞 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞转录组测序、核转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学、扰动研究 | 未提及 | 单细胞转录组数据、核转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 未提及 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 未提及 | 未提及 |
| 573 | 2026-07-15 |
Hypoxia shapes both therapeutic response and resistance in metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.05.007
PMID:42242232
|
研究论文 | 研究低氧在转移性透明细胞肾细胞癌中如何同时塑造治疗反应和耐药性 | 鉴定出低氧响应的SPP1肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)作为治疗反应和耐药性的双重标志,揭示低氧在VEGFR-TKI/aPD-1治疗中的双面作用 | 主要基于小鼠模型,人类数据来自队列分析,需要进一步验证低氧机制在临床中的应用 | 探究VEGFR-TKI和aPD-1联合治疗下肿瘤微环境演变及低氧在ccRCC治疗反应与耐药中的作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的巨噬细胞和低氧状态 | 生物信息学, 癌症免疫学 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) | 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 包含转基因ccRCC小鼠模型以及人类治疗队列样本,具体数量未指定 | NA | 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 574 | 2026-07-15 |
Pathogenesis of diffuse large B cell lymphoma proteogenotypes
2026-Jul-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.05.008
PMID:42242231
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研究论文 | 通过整合蛋白质组、转录组和基因组数据,识别出弥漫性大B细胞淋巴瘤的七种蛋白质基因组型,揭示其病理生理特征 | 首次基于蛋白质组学数据对DLBCL进行分子分型,发现与预后不良相关的新亚型PG4,并揭示其独特的肿瘤微环境特征 | 未明确说明研究局限性,但蛋白质组学数据的覆盖深度和样本量可能限制某些罕见亚型的发现 | 解析弥漫性大B细胞淋巴瘤的临床和分子异质性,为诊断和治疗提供蛋白质基因组学框架 | 478例弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 蛋白质组学、转录组学、基因组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | 蛋白质组、转录组、基因组、单细胞、空间转录组数据 | 478例DLBCL肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 575 | 2026-07-15 |
Construction and multi-omics validation of a five-gene ferroptosis-based model for predicting prognosis and therapy response in pancreatic ductal adenocarcinoma with immune landscape analysis
2026-Jul-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05566-0
PMID:42440056
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研究论文 | 构建了一个基于铁死亡的5基因预后模型,并在胰腺导管腺癌中进行了多组学验证,结合免疫景观分析预测预后和治疗反应 | 首次结合铁死亡相关基因与多组学分析(包括单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫浸润分析)构建胰腺导管腺癌的预后模型,并验证了其与免疫逃逸和药物反应的关联 | 模型基于公开数据集,可能受样本异质性影响,且铁死亡相关基因的功能机制尚未完全阐明 | 建立基于铁死亡相关基因的预后模型,评估其在胰腺导管腺癌中的临床意义和治疗反应预测能力 | 胰腺导管腺癌患者样本及其转录组数据、单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Cox回归模型(单变量、LASSO、多变量) | 基因表达数据 | TCGA-PDAC队列、GTEx数据、GEO数据集(GSE62452、GSE78229、GSE183795、GSE212966)和空间转录组样本GSM8452850 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 576 | 2026-07-15 |
Tumor innervation drives cancer cell plasticity and immune evasion through the SLPI-GZMB axis
2026-Jul-13, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218731
PMID:42442600
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序,揭示肿瘤神经支配通过SLPI-GZMB轴驱动癌细胞可塑性和免疫逃逸的机制 | 首次发现神经来源的P物质通过TACR1受体诱导肿瘤细胞分泌SLPI,并明确SLPI通过抑制颗粒酶B介导的细胞凋亡和焦亡促进免疫逃逸,同时提出SP-TACR1-SLPI轴作为联合免疫治疗的靶点 | 主要基于小鼠模型和临床数据集分析,尚需在人类肿瘤中进一步验证;SLPI在神经支配肿瘤中的具体调控网络及下游信号通路的全貌尚未完全阐明 | 探究神经信号如何调控癌细胞可塑性和免疫抵抗的分子机制 | 小鼠神经内与非神经内肿瘤配对模型、人肿瘤样本(具有神经浸润)以及临床免疫治疗数据集 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、生物化学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)及人类肿瘤临床样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 577 | 2026-07-15 |
Restoring the CD226 in CD8+T cells overcomes TIGIT-refractory immunity in HER2+ breast cancer
2026-Jul-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09004-5
PMID:42443153
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研究论文 | 本研究揭示通过恢复CD8+T细胞中的CD226来克服HER2阳性乳腺癌中TIGIT介导的免疫耐受机制 | 首次发现TIGIT信号通路是HER2+乳腺癌免疫治疗耐受的关键轴,并证明恢复CD226共刺激受体可逆转这一耐受 | 未提及临床转化中的潜在副作用或长期治疗效果的评估 | 探究HER2+乳腺癌对免疫检查点阻断治疗耐受的机制并开发新的联合治疗策略 | HER2阳性乳腺癌患者和动物模型中的CD8+T细胞、肿瘤细胞及肿瘤微环境 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学、体外共培养实验、体内扰动实验、多重组织分析 | 动物模型(抗HER2非敏感小鼠模型)、患者队列(新辅助治疗非pCR队列) | 单细胞转录组数据、临床队列数据、组织切片数据 | 采用抗HER2非敏感小鼠模型和包含新辅助治疗非pCR患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2026-07-15 |
Dynamic single-cell transcriptomic analysis of peripheral blood mononuclear cells identifies novel biomarkers for autoimmune encephalitis
2026-Jul-13, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03737-7
PMID:42443389
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研究论文 | 对自身免疫性脑炎患者外周血单核细胞进行动态单细胞转录组分析,鉴定出NKT细胞及其亚群NKT-6减少可作为新型生物标志物 | 首次通过动态单细胞转录组分析揭示自然杀伤T细胞及其亚群NKT-6减少是自身免疫性脑炎的特异性标志物,并在多种神经精神疾病独立队列中验证其疾病特异性 | 未提及具体局限性 | 鉴定自身免疫性脑炎的新型生物标志物 | 自身免疫性脑炎患者外周血单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 自身免疫性脑炎急性期患者及六个月序贯治疗随访样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 579 | 2026-07-15 |
Ex utero 3D culture system illuminates post-implantation development and functions of the mouse yolk sac
2026-Jul-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10656-4
PMID:42443464
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研究论文 | 提出一种新型3D仿生培养平台,在体外精确重现小鼠卵黄囊的植入后发育过程,并揭示其代谢、凝血、血管发育和屏障形成等新功能 | 开发了一种操作简单、高可重复性的3D仿生培养平台,首次在体外成功模拟了卵黄囊的中胚层、血管和内胚层分化,并通过单细胞RNA测序确认其与体内模型的保真度,揭示了卵黄囊在糖代谢、脂代谢、蛋白质代谢、凝血、物质运输和屏障形成中的新功能 | 未明确提及局限性 | 阐明卵黄囊在植入后发育中的分子和细胞机制,优化全胚胎培养系统 | 小鼠卵黄囊及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D仿生培养平台 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 580 | 2026-07-15 |
High-resolution reconstruction of cell-type-specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2026-Jul-13, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03218-w
PMID:42443492
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研究论文 | 引入深度学习方法DeepDETAILS,从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 提出一种准监督的交叉模态解卷积框架DeepDETAILS,利用scATAC-seq参考库对批量数据集进行碱基对分辨率基因组信号映射,适用于多种组学数据 | 未明确说明 | 开发一种从批量测序样本中解析细胞类型特异性转录调控信号的方法 | 人类组织和细胞类型,包括39种组织和86种细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | scRNA-seq, scATAC-seq, PRO-cap, PRO-seq, ChIP-seq | 深度学习 | 基因组信号数据 | 39种人类组织、86种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |