单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 814 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-07-27 |
Epstein-Barr Virus-Induced Upregulation of GPR183: A Potential Upstream Mechanism in IgG4-Related Ophthalmic Disease
2026-07-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.8.30
PMID:42423408
|
研究论文 | 本文发现EB病毒诱导GPR183上调可能是IgG4相关性眼病的上游发病机制 | 首次揭示GPR183是IgG4-RD中唯一在多个组织中共上调的基因，并发现EBV通过诱导GPR183表达促进异位生发中心形成 | 样本量较小，且未进行功能验证实验证明因果关系的直接证据 | 探索IgG4相关性眼病的上游触发机制和新的治疗靶点 | IgG4-ROD患者泪腺组织及对照样本 | 数字病理学 | IgG4相关性眼病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多重免疫荧光, 流式细胞术, qPCR | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 14例IgG4-ROD患者和13例对照（9例泪腺脱垂和4例慢性泪腺炎） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | bulk RNA-seq和公共单细胞RNA-seq数据集分析 |
| 522 | 2026-07-27 |
Identification of PRKCB, NLRC4, and TNFSF10 as Key Regulators of the Lipid Metabolism-Autophagy Network in Atherosclerosis
2026-Jul, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.70221
PMID:42389891
|
研究论文 | 本研究综合批量转录组和单细胞RNA测序数据，利用生物信息学方法筛选出动脉粥样硬化中脂质代谢-自噬网络的关键调节基因PRKCB、NLRC4和TNFSF10，并探讨其免疫微环境特征和潜在治疗价值 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA测序数据，通过WGCNA和LASSO回归筛选出三个与动脉粥样硬化脂质代谢和自噬相关的新调节基因，并利用分子对接技术发现槲皮素和阿替洛尔可与PRKCB活性位点稳定结合 | 研究仅基于小鼠模型和公开数据集，缺乏大规模临床样本验证；分子对接结果需要进一步实验验证；未深入探讨三个基因在脂质代谢和自噬之间的具体调控机制 | 探索动脉粥样硬化中脂质代谢和自噬网络的关键调节基因及其免疫微环境特征 | 动脉粥样硬化斑块组织、小鼠主动脉组织和血浆样本 | 生物信息学 | 动脉粥样硬化 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组化, 酶联免疫吸附测定 | WGCNA, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠主动脉组织（实验组和对照组） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2026-07-27 |
Single-bacterium RNA-seq protocol to uncover heterogeneous expression of coding and noncoding genes in Bacteroides thetaiotaomicron
2026-Jul-01, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104651
PMID:42391002
|
protocol | 描述了一种针对多形拟杆菌的单细菌RNA测序实验方案，用于揭示编码和非编码基因的异质性表达 | 首次为厌氧微生物Bacteroidota门下成员提供了专门的单细菌RNA-seq方案，包括转录组稳定化、FACS收集、优化裂解步骤以及结合MATQ-seq和Cas9去核糖体序列的流程 | 仅针对多形拟杆菌一个物种，可能需调整才能适用于其他Bacteroidota成员 | 开发并标准化可用于Bacteroidota门下细菌的单细胞转录组分析方法 | 多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron） | 单细胞转录组学 | NA | MATQ-seq, Cas9去核糖体序列, FACS, RNA-seq | NA | 单细菌转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-07-27 |
Integrated Proteomic and scRNA-Seq Analysis Reveals Pyroptosis-Related Subtypes in Lung Adenocarcinoma
2026-Jul, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70210
PMID:42402362
|
研究论文 | 整合蛋白质组和单细胞RNA测序数据，探究焦亡相关蛋白在肺腺癌肿瘤微环境中的潜在作用及其与免疫、预后和治疗反应的关系 | 首次通过整合蛋白质组和scRNA-seq数据，识别出肺腺癌中与焦亡相关的三种分子亚型（脂质代谢、信号转导和免疫激活），并构建了基于焦亡相关蛋白的预后评分模型 | 样本量相对较小（103例患者），且缺乏外部独立验证数据集 | 探究焦亡相关蛋白在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其与肿瘤免疫、预后和治疗反应的关联 | 肺腺癌患者 | 计算生物学 | 肺腺癌 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 103例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 525 | 2026-07-27 |
Exosome-Associated Gene Network and the Role of SPP1 in Herpes Stromal Keratitis and the Therapeutic Modulation by Ursolic Acid
2026-07-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.8.15
PMID:42405671
|
研究论文 | 本研究探索了单纯疱疹病毒性角膜炎中外泌体相关基因网络，鉴定了SPP1作为关键驱动基因，并评估了熊果酸的治疗潜力 | 首次构建了HSK中外泌体相关基因网络，发现SPP1在疾病进展中的核心作用，并揭示了熊果酸通过下调SPP1和抑制PI3K/Akt信号通路的治疗机制 | 该研究主要基于小鼠模型，未提及人类样本验证；机制探讨仅覆盖PI3K/Akt通路，未完全阐明其他可能的分子途径 | 阐明HSK中外泌体相关基因网络及SPP1的作用，并评估熊果酸的治疗效果和机制 | HSV-1感染小鼠的角膜组织及免疫细胞 | 数字病理学 | 单纯疱疹病毒性角膜炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 定量实时聚合酶链反应, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据, 流式数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2026-07-27 |
Spatial Transcriptomic Atlas Reveals That Forkhead Box O3-Mediated Mitochondrial Dynamics Imbalance Drives Premature Ovarian Insufficiency in Mice
2026-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70623
PMID:42435003
|
研究论文 | 通过构建空间转录组图谱揭示FoxO3介导的线粒体动力学失衡驱动小鼠卵巢早衰的机制 | 首次构建卵巢早衰小鼠模型的空间转录组图谱，结合空间分析与功能机制研究，阐明FoxO3通路异常激活通过破坏线粒体动态平衡导致颗粒细胞衰老和卵巢功能衰竭 | 仅使用小鼠模型（未涉及人类样本），且机制验证主要基于体外细胞实验和动物模型（可能需进一步临床验证） | 揭示卵巢早衰（POI）与生殖衰老的空间和分子特征，特别是颗粒细胞衰老过程中的线粒体动力学失衡机制 | 小鼠卵巢早衰模型（包括triptolide诱导的KGN细胞模型和10月龄自然衰老小鼠）的颗粒细胞 | 空间转录组学 | 卵巢早衰 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | POI小鼠模型（数量未明确）和10月龄自然衰老小鼠卵巢（每组至少3只，但未明确样本总数） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术用于构建小鼠卵巢空间图谱 |
| 527 | 2026-07-27 |
From Gut to Fat: Intestinal Epithelial Exosomes Target PDGFRα+ Progenitors to Promote Lipogenesis and Counteract Subcutaneous Adipose Tissue Atrophy in Aging
2026-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70625
PMID:42437849
|
研究论文 | 研究揭示小肠上皮外泌体通过miR-379-5p/Usp34/Wnt/β-catenin轴靶向PDGFRα+祖细胞促进脂肪生成，逆转衰老相关皮下脂肪组织萎缩 | 首次发现小肠上皮外泌体介导肠道与脂肪组织的通讯，通过调控PDGFRα+前脂肪细胞分化参与年龄相关的皮下脂肪重塑 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类中的机制保守性和治疗潜力 | 探讨年龄相关皮下脂肪组织萎缩的机制及潜在治疗策略 | 小鼠小肠上皮外泌体和皮下脂肪组织PDGFRα+祖细胞 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年和年轻小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 528 | 2026-07-27 |
The STAT3-CCND2 Axis Drives a Proliferative Metaplastic Precursor Population in Gastric Intestinal Metaplasia
2026-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71283
PMID:42454579
|
研究论文 | 本研究整合表观基因组-转录组分析及单细胞RNA测序，发现STAT3-CCND2轴驱动胃肠化生中增殖性化生前体细胞群体，为胃癌早期干预提供靶点 | 首次通过多组学整合分析揭示STAT3-CCND2轴在胃肠化生中的核心驱动作用，并利用患者来源胃类器官的单细胞测序鉴定出增殖性化生前体细胞亚群 | 未提及 | 阐明胃肠化生早期增殖和重编程的调控机制，寻找胃癌早期检测和化学预防靶点 | 人类胃肠化生组织及正常组织、患者来源胃类器官 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、双荧光素酶报告实验、qRT-PCR、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞转录组数据 | 人胃肠化生及正常组织样本、患者来源胃类器官（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于患者来源胃类器官的细胞异质性分析 |
| 529 | 2026-07-27 |
A Multi-Omics and Single-Cell Framework Identifies ITGA1 as a Candidate Predictive Biomarker of Neoadjuvant Chemotherapy Response in Epithelial Ovarian Cancer
2026 Jul-Aug, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70135
PMID:42457640
|
研究论文 | 整合单细胞与多组学数据识别ITGA1作为上皮性卵巢癌新辅助化疗反应预测生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序、批量转录组分析和机器学习模型来发现上皮性卵巢癌化疗反应生物标志物ITGA1 | 候选标志物转化为临床可应用预测因子的过程仍有限，研究主要在模型中进行验证 | 识别上皮性卵巢癌新辅助化疗反应的预测性生物标志物 | 上皮性卵巢癌患者及顺铂耐药卵巢癌细胞模型 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、机器学习建模 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2026-07-27 |
Sesamin Ameliorates High-Sugar, High-Fat Diet-Induced Hepatic Dysfunction via CYP1A2-Mediated Regulation of Lipid Metabolism and Oxidative Stress
2026-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71274
PMID:42466821
|
研究论文 | 采用多方法结合策略，发现芝麻素通过CYP1A2靶点改善高糖高脂饮食诱导的肝脏功能障碍 | 首次利用AlphaFold数据库跨物种蛋白质组筛选鉴定芝麻素直接靶点CYP1A2，结合单细胞RNA测序揭示肝细胞亚群重组 | NA | 阐明芝麻素改善高糖高脂饮食诱导肝脏功能障碍的分子机制 | 高糖高脂饮食喂养小鼠的肝细胞 | 计算机视觉 | 代谢性肝病 | 单细胞RNA测序, 分子动力学模拟, MM-PBSA分析, 细胞热转变分析, 药物亲和反应靶标稳定性分析, 蛋白质印迹, qPCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-07-27 |
Integrated Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify UBE2Q2 as a Candidate Molecule Target in Intervertebral Disc Degeneration
2026-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71292
PMID:42470154
|
研究论文 | 通过多组学整合分析与实验验证，识别UBE2Q2作为椎间盘退变的候选分子靶点 | 首次发现UBE2Q2作为椎间盘退变的潜在生物标志物和新分子靶点 | 未明确说明UBE2Q2的具体功能机制，仅提供基础研究支持 | 探究UBE2Q2在椎间盘退变中的作用及作为分子靶点的潜力 | 人类退变髓核组织和大鼠髓核细胞 | 机器学习 | 椎间盘退变 | NA | WGCNA | 基因表达数据 | GEO数据集(GSE70362和GSE23130)及单细胞RNA测序(GSE251686)样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2026-07-27 |
An Integrative Methylation-Metabolism Gene Signature Defines Prognosis and Immunosuppressive Microenvironment in Prostate Cancer
2026-Jul, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70360
PMID:42478154
|
研究论文 | 开发并验证了一个整合甲基化和氨基酸代谢的基因特征，用于前列腺癌预后评估和免疫抑制微环境分析 | 首次整合DNA甲基化与氨基酸代谢通路构建预后基因特征，揭示其与免疫抑制肿瘤微环境的关联 | 信息未明确说明 | 建立整合甲基化-代谢的预后基因特征并探索其与肿瘤微环境的关系 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组化，定量实时聚合酶链反应 | LASSO-Cox模型，列线图 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据，组织芯片图像 | 包含多个独立数据集和前列腺癌组织芯片，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2026-07-27 |
Single Cell RNA Sequencing Reveals THBS1+CD14+ Monocyte Modulates Inflammatory Activation via NRLP3-Inflammasome in Congenital Heart Block
2026-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71270
PMID:42482529
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示THBS1+CD14+单核细胞通过NLRP3炎症小体在先天性心脏传导阻滞中调节炎症激活 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统性描绘先天性心脏传导阻滞胎儿外周血免疫细胞图谱，发现THBS1+CD14+单核细胞亚群与NLRP3炎症小体介导的炎症反应相关 | 尚未说明 | 探究先天性心脏传导阻滞中外周循环免疫系统的变化及单核细胞的炎症机制 | 先天性心脏传导阻滞胎儿及地塞米松治疗后的单核细胞 | 单细胞转录组学 | 先天性心脏传导阻滞 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、实时定量PCR（qPCR）、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | CHB胎儿与对照胎儿样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2026-07-27 |
Psoriasis-Obesity-Related Gene COX7C Promotes Keratinocyte Proliferation and Positively Regulates Inflammatory Responses in Psoriasis
2026-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71277
PMID:42487278
|
研究论文 | 利用孟德尔随机化、单细胞RNA测序和机器学习方法，鉴定银屑病与肥胖共享关键基因COX7C，并验证其促进角质形成细胞增殖及正向调控炎症反应的作用 | 首次通过多组学整合分析揭示COX7C作为银屑病-肥胖共享诊断标志物，并验证其促进角质细胞增殖和正向调控炎症反应的生物学功能 | 未在临床样本中验证COX7C的蛋白表达水平，且动物模型缺失可能影响机制推论的直接性 | 探索银屑病与肥胖之间的生物学联系，鉴定共有的预测性生物标志物并阐明其功能 | 银屑病与肥胖患者的共享基因、皮肤细胞亚型、转录因子及脂质代谢通路 | 机器学习和单细胞组学 | 银屑病，肥胖症 | 孟德尔随机化，单细胞RNA测序(ScRNA-seq)，富集分析，机器学习（LASSO, SVM-RFE） | 逻辑回归，支持向量机 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 公共数据库多组数据（未明确样本量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-07-27 |
Immune Microenvironment Engineering for Functional Periodontal Regeneration: Mechanisms, Biomaterial Strategies, and Translational Perspectives
2026-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70289
PMID:42489855
|
综述 | 针对牙周免疫微环境失调导致的再生失败，总结了免疫工程策略在功能性牙周再生中的应用进展 | 提出了基于免疫微环境工程的综合框架，整合了巨噬细胞极化、中性粒细胞异质性、Th17/Treg平衡等关键调控网络，并引入单细胞与空间转录组学揭示NLRP3巨噬细胞与SAA1成纤维细胞等新功能亚群 | 未提及具体临床试验验证或量化比较不同免疫工程策略的疗效 | 综述免疫微环境机制及生物材料策略以推动功能性牙周再生的转化应用 | 牙周免疫微环境（巨噬细胞、中性粒细胞、Th17/Treg细胞）与牙周再生相关干细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本、图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 536 | 2026-07-26 |
The Single-Cell Atlas Revolution: Integrating Lineage, Space, and Evolution to Decode Animal Biology
2026-Jul-25, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/10445498261460199
PMID:42499312
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2026-07-26 |
Distinct systemic and gut IgA responses to bacteria of the human upper gastrointestinal tract
2026-Jul-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117721
PMID:42497062
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2026-07-26 |
IGF2BP1 regulates the malignant progression of intrahepatic cholangiocarcinoma by recognizing the m6A modification of FN1
2026-Jul-24, Arab journal of gastroenterology : the official publication of the Pan-Arab Association of Gastroenterology
IF:1.1Q4
DOI:10.1016/j.ajg.2026.07.005
PMID:42498553
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2026-07-26 |
Molecular mechanisms of heavy metal-induced cancer: Insights from animal models and human implications
2026-Jul-24, Toxicology and industrial health
IF:1.7Q4
DOI:10.1177/07482337261469287
PMID:42498637
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2026-07-26 |
PLIN2-PGAM5-regulated lipid droplet-mitochondria contacts drive microglial neuroinflammation after spinal cord injury via fatty acid metabolic reprogramming
2026-Jul-24, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-026-01815-5
PMID:42498720
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |