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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-07-27 |
Publisher Correction: Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75454-2
PMID:42425996
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2026-07-27 |
UDP-glucuronate decarboxylase 1 promotes tumor immune evasion by accelerating KMT2D loss in hepatocellular carcinoma
2026-Jul-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013948
PMID:42419879
|
研究论文 | 该研究通过多组学整合框架,发现UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶1(UXS1)通过加速KMT2D降解促进肝癌免疫逃逸,揭示了UXS1-KMT2D-CEBPB-PD-L1信号轴的作用机制 | 首次发现UXS1作为免疫相关预后枢纽基因,通过非经典酶活机制促进肝癌恶性进展,并阐明其通过FBXW7介导的KMT2D泛素化降解及表观遗传重编程驱动免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型,尚需更多临床样本验证UXS1靶向治疗的可行性 | 揭示肝癌免疫逃逸的新驱动因子UXS1的分子机制,为改善免疫检查点阻断疗法提供潜在靶点 | 肝细胞癌(HCC)细胞、小鼠模型及人类HCC组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学整合、CRISPR敲除/过表达、免疫共沉淀联合质谱、泛素化检测、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 涉及多种体外细胞模型及小鼠模型,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于单细胞RNA测序,但具体平台未注明 |
| 463 | 2026-07-27 |
Molecular profiling of the single-cell proteome via gel electrophoresis and 3D single-molecule imaging
2026-07-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74840-0
PMID:42420286
|
研究论文 | 提出一种结合凝胶电泳与三维单分子荧光成像的超灵敏蛋白质组分析策略,用于单细胞蛋白质组分子分析 | 通过凝胶电泳与三维单分子成像结合,实现单细胞中蛋白质的定量检测,灵敏度达每个物种10个拷贝 | 未提及具体局限性,但可能受限于荧光标记效率和电泳分离的分辨率 | 开发高灵敏度单细胞蛋白质组分析技术,以全面量化单个细胞中的蛋白质丰度 | 单个人类细胞和心肌细胞分化过程中的细胞状态 | 数字病理学 | NA | 凝胶电泳、单分子荧光成像 | NA | 蛋白质组数据 | 单个哺乳动物细胞,涉及心肌细胞分化过程中的多个细胞状态 | NA | NA | 单细胞PAGE-PISA | 结合凝胶电泳与三维单分子荧光成像的蛋白质组分析系统 |
| 464 | 2026-07-27 |
An efficient method for tissue-specific protoplast isolation suitable for single-cell RNA sequencing and transient gene expression analysis in saffron (Crocus sativus L.)
2026-Jul-08, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-026-01187-1
PMID:42421006
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研究论文 | 建立了一种适用于藏红花(Crocus sativus L.)组织特异性原生质体分离的高效方法,可用于单细胞RNA测序和瞬时基因表达分析 | 首次详细报道了藏红花原生质体的分离、评估和应用方法,建立了高效的组织特异性原生质体分离技术 | 原生质体质量受发育阶段和采样位置影响,根原生质体活力相对较低(~61%) | 建立藏红花高效原生质体分离方法,以加速该物种分子生物学研究进展 | 藏红花(Crocus sativus L.)的顶端芽、花瓣、叶片和根组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 瞬时基因表达分析 | NA | 图像 | 四种组织:顶端芽、花瓣、叶片和根,样本量以单位鲜重计 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 465 | 2026-07-27 |
Gene expression profiling enables refined parcellation of cortical layers in the heterogeneous human cerebral cortex
2026-Jul-08, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01704-z
PMID:42421091
|
研究论文 | 提出基于基因表达定义的皮层分层方法(GD-Ls),利用空间转录组学和BayesSpace算法实现人类大脑皮层精细分区 | 相较于传统解剖学方法,GD-Ls能更精确解析皮层边界并捕获L1、L3、L6亚层结构及灰白质交界处的分子过渡区,且跨物种(猴、鼠)可推广 | NA | 开发基于空间转录组学的高分辨率皮层分区框架,克服传统解剖学主观性并提升分子解析度 | 人类大脑皮层、恒河猴皮层、小鼠皮层 | 数字病理学、空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | BayesSpace算法 | 基因表达数据 | 多个人类死后大脑样本(跨不同脑叶)、独立健康样本及病理改变组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 466 | 2026-07-27 |
Integrated PANoptosis Profiling Identifies Immunosuppressive Subtypes and a Prognostic Signature With Functional Validation of MLKL in Glioblastoma
2026-Jul-08, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70481
PMID:42421178
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研究论文 | 通过整合PANoptosis分析鉴定胶质母细胞瘤的免疫抑制亚型及预后标志,并验证MLKL的功能 | 首次揭示PANoptosis在胶质母细胞瘤异质性和免疫抑制微环境中的功能作用,并构建了基于PANoptosis相关基因的预后风险评分模型 | 未明确提及,推测可能包括样本量有限或需要进一步的功能验证 | 探讨PANoptosis在胶质母细胞瘤中的作用,并建立预后模型以指导患者分层和靶向治疗 | 胶质母细胞瘤患者样本及MLKL基因功能 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | K-means聚类, Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确,涉及独立队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 467 | 2026-07-27 |
A multi-omics approach to maize (Zea mays) tassel development
2026-Jul-08, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-026-09413-w
PMID:42414910
|
研究论文 | 综合多组学方法分析玉米雄穗发育过程中的转录组、小RNA和蛋白质组变化 | 首次在玉米雄穗四个发育阶段同时分析转录组、小RNA和蛋白质组,鉴定出126个核心miRNA和阶段特异性miRNA,并发现GSL4基因可影响雄穗分枝长度 | 未明确说明局限性 | 全面解析玉米雄穗发育(包括花药细胞类型特化)的调控程序 | 玉米(Zea mays)雄穗 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 小RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据、小RNA表达数据、蛋白质组数据 | 四个发育阶段(0.5-2.0厘米)的样本 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2026-07-27 |
Iron-catalyzed oxidative stress reveals an exposome-related ferroptosis-resistant karyomegalic niche in BRCA1-linked renal carcinogenesis
2026-Jul-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104293
PMID:42442115
|
研究论文 | 本研究整合Xenium单细胞空间转录组学等技术,探究铁驱动的肾癌发生过程中氧化应激适应的细胞机制,揭示BRCA1单倍体不足扩张了与铁死亡抵抗相关的核肿大近端小管细胞状态 | 首次通过空间转录组学与核形态计量学的整合分析,定义了铁驱动癌变中具有铁死亡抵抗特性的核肿大微环境,并建立核形态作为暴露组相关氧化应激适应的功能标志 | 未提及 | 探究慢性氧化应激下早期癌症起始过程中,适应应激的细胞的空间与形态特征 | Brca1(L63X/+)大鼠肾上皮细胞及人肾癌、乳腺癌组织 | 数字病理学 | 肾癌 | Xenium单细胞空间转录组学,定量核形态计量学,线粒体分析 | NA | 基因表达数据,图像数据 | Brca1(L63X/+)大鼠肾组织及人肿瘤数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | Xenium单细胞空间转录组学分析 |
| 469 | 2026-07-27 |
Virus infections and cancers: from mechanisms to therapeutics
2026-Jul-08, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00485-6
PMID:42417944
|
综述 | 本文全面梳理了病毒感染的致癌机制、肿瘤微环境重塑及防治策略 | 整合了病毒分类、致癌机制、肿瘤微环境重塑和转化策略,并强调了多组学、单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型和人工智能在病毒相关癌症研究中的推动作用 | 作为综述,可能缺乏原始数据支持,且主要基于已有文献总结,未提出新的实验验证 | 建立理解、预防和治疗病毒相关肿瘤的综合框架 | 主要致癌病毒(HPV、EBV、HBV、HCV、MCPyV、HTLV-1、KSHV、HIV)及新兴病毒(SARS-CoV-2) | 数字病理学 | 病毒相关癌症 | 多组学、单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 470 | 2026-07-27 |
Sirtuin 1 deficiency mediates chronic kidney disease-induced inflammaging cardiovascular calcification
2026-Jul-07, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00488-3
PMID:42410087
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研究论文 | 本研究整合群体分析、单细胞转录组学、遗传推断和功能实验,揭示SIRT1缺陷通过代谢-炎症耦合机制介导慢性肾病诱导的心血管钙化 | 首次发现SIRT1-NF-κB-NLRP3轴是慢性肾病加速主动脉瓣钙化的关键通路,并鉴定司美格鲁肽可恢复SIRT1/NLRP3平衡从而减轻钙化 | 未提及具体局限性 | 阐明慢性肾病诱导主动脉瓣钙化的分子机制并寻找治疗靶点 | 人主动脉瓣组织及瓣膜间质细胞、UK Biobank人群数据、小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、eQTL孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、群体数据 | UK Biobank大规模人群数据,人主动脉瓣样本(具体数量未提及),小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人主动脉瓣单细胞转录组分析 |
| 471 | 2026-07-27 |
CXCL13-CXCR5 signaling in CD8+ T cell recruitment and lymphoid immune organization in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jul-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04489-7
PMID:42412112
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研究论文 | 本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌中CXCL13-CXCR5信号通路对CD8+ T细胞招募和淋巴免疫组织的调控作用 | 揭示了CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中调控CD8 T细胞招募、分化及免疫组织结构的新机制,并发现CXCL13是免疫招募和生态位组织的关键调节因子 | 未明确说明局限性 | 研究CXCL13-CXCR5轴在高风险非转移性ccRCC中如何调控CD8 T细胞的招募、分化和免疫组织形成 | 高风险、非转移性透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤、血浆和匹配的邻近肾组织标本 | 自然语言处理 | 肾癌 | ELISA, 定量PCR, 迁移实验, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 同源小鼠模型 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | 人类肿瘤、血浆和匹配的邻近肾组织标本,以及同源小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 472 | 2026-07-27 |
TNF-α induces type I IFN signalling to suppress neurogenesis and recruit T cells
2026-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74104-x
PMID:42414275
|
研究论文 | 研究发现TNF-α通过诱导I型干扰素信号抑制海马神经发生并招募T细胞 | 首次揭示TNF-α通过先前未识别的I型干扰素自分泌/旁分泌环路驱动神经源性失调 | 论文标题和摘要未提及局限性 | 探究炎症导致成年海马神经发生损伤的机制 | 人海马祖细胞 | 神经科学、免疫学 | 神经退行性疾病、炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、功能性T细胞迁移实验 | NA | 基因表达数据 | 使用女性来源人体外神经发生模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2026-07-27 |
Anti-PD-1 plus anti-CTLA-4 blockade overcomes immune exclusion in NSCLC brain metastases by enhancing CD8+ T cell responses and promoting tertiary lymphoid structure formation
2026-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74782-7
PMID:42414284
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研究论文 | 通过整合临床结果分析、配对人类组织分析和同源小鼠模型,揭示抗PD-1联合抗CTLA-4阻断通过增强CD8+ T细胞应答和促进三级淋巴结构形成来克服非小细胞肺癌脑转移的免疫排斥 | 首次阐明联合免疫检查点阻断(抗PD-1和抗CTLA-4)在非小细胞肺癌脑转移中通过诱导三级淋巴结构形成和增强CD8+ T细胞功能来克服免疫排斥的机制 | 主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床研究验证 | 探索非小细胞肺癌脑转移对抗PD-1单药治疗耐药的原因及联合免疫检查点阻断的潜在机制 | 非小细胞肺癌脑转移患者的临床样本、配对原发肿瘤和脑转移组织、同源小鼠脑转移模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、组织样本、临床数据 | 包括配对人类标本和同源小鼠模型,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2026-07-27 |
High-resolution mri guided whole mouse brain neuronal cell type atlas using deep learning
2026-Jul-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10608-y
PMID:42414549
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研究论文 | 利用深度学习和高分辨率MRI对小鼠全脑神经元细胞类型进行图谱绘制 | 首次整合高分辨率弥散磁共振成像和三维光片显微镜数据,通过深度学习生成10微米各向同性分辨率的全脑神经元细胞类型图谱 | NA | 评估dMRI预测细胞类型的能力,并生成全脑神经元细胞类型图谱 | 成年小鼠大脑 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 弥散磁共振成像,三维光片显微镜,空间转录组学 | 深度学习模型 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2026-07-27 |
Longitudinal multiomics profiling of extracorporeal cross-circulation with pig liver xenografts in human decedents
2026-Jul-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-026-04511-6
PMID:42414621
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研究论文 | 通过纵向多组学分析,研究了使用基因编辑猪肝异种移植物进行体外交叉循环时的人-猪相互作用 | 首次在人体遗体上进行纵向蛋白质组学、脂质组学和代谢组学分析,结合空间转录组学和组织学,揭示体外肝交叉循环中人-猪异种移植物相互作用的细胞与分子机制 | NA | 研究体外肝交叉循环中宿主与异种移植物之间的相互作用 | 脑死亡人类遗体及其接受基因编辑猪肝异种移植物的血样和肝脏活检样本 | 数字病理学 | 肝衰竭 | 蛋白质组学、脂质组学、代谢组学、空间转录组学 | NA | 蛋白质组、脂质组、代谢组、空间转录组数据 | 64 个血样、25 个猪肝异种移植物活检样本、3 个天然人肝活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 476 | 2026-07-27 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reframe the Immunosuppressive Microenvironment of Neuroendocrine Neoplasms
2026-Jul-07, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18132176
PMID:42449718
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综述 | 整合单细胞和空间转录组学数据,重新定义神经内分泌肿瘤的免疫抑制微环境 | 首次跨神经内分泌肿瘤亚型整合单细胞和空间转录组数据,提出四层免疫抑制框架,并揭示除PD-1/PD-L1轴外的新型免疫逃避机制 | 依赖于已发表研究,可能受限于原始数据的质量和批次效应;跨亚型合成分析缺乏统一的数据处理流程 | 整合单细胞和空间转录组学数据,重新定义神经内分泌肿瘤的免疫抑制机制,并为生物标志物导向的治疗策略提供概念框架 | 神经内分泌肿瘤,涵盖胰腺、肺、胃肠、皮肤、垂体、肾上腺等亚型 | 机器学习和数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台,包括10x Chromium单细胞3'方案和Illumina NovaSeq测序系统 |
| 477 | 2026-07-27 |
A CAF-Associated Stromal Remodeling Signature Links Immune Exclusion to Exhaustion-Prone CD8+ T-Cell Dysfunction in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026-Jul-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27136092
PMID:42450357
|
研究论文 | 提出了一个与癌症相关成纤维细胞相关的间质重塑特征,该特征将高级别浆液性卵巢癌中的免疫排斥与耗竭倾向的CD8+ T细胞功能障碍联系起来 | 首次整合了收缩型/肌成纤维细胞、细胞外基质和线粒体代谢基因构建了CMMS特征,并阐明了其与免疫排斥和T细胞耗竭的关联 | 未明确说明 | 研究高级别浆液性卵巢癌中间质屏障对抗肿瘤免疫的抑制机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本及CD8+ T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq和单细胞RNA-seq | LASSO加权模型 | 基因表达数据和单细胞转录组数据 | TCGA-HGSOC队列、独立GEO队列、单细胞RNA-seq数据集以及抗PD-L1治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2026-07-27 |
The Interactions Between Circadian Rhythm, Gut Microbiota, and Anxiety: From Mechanisms to Intervention Strategies
2026-Jul-07, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu18132209
PMID:42451209
|
综述 | 该文章综述了昼夜节律、肠道微生物群与焦虑之间的相互作用机制及干预策略 | 系统整合昼夜节律-肠道微生物群-焦虑三方交互网络,提出基于时间营养学、微生物靶向治疗及光疗的精准干预新框架 | 未进行实验验证,主要基于现有文献总结,缺乏大规模临床随机对照试验证据 | 阐明昼夜节律紊乱通过肠道微生物群介导焦虑的机制并探索干预策略 | 昼夜节律、肠道微生物群、焦虑的相互作用网络 | 机器学习 | 焦虑症 | 单细胞与空间转录组学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 479 | 2026-07-27 |
Entosis remodels the immune microenvironment of osteosarcoma by regulating macrophage polarization: An integrated study based on multi-omics data and in vitro experiments
2026-Jul-06, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102898
PMID:42407378
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和体外实验,揭示内吞作用通过调控巨噬细胞极化重塑骨肉瘤免疫微环境 | 首次系统阐明内吞作用在骨肉瘤中通过调控巨噬细胞极化重塑免疫微环境的机制,并构建了基于六个基因的预后风险模型 | 未提及明显局限性 | 探究内吞作用在骨肉瘤中的临床意义及其对免疫微环境重塑的机制 | 骨肉瘤患者的肿瘤样本及巨噬细胞 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 多组学数据分析、scRNA-seq、体外实验 | 预后风险模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多组学数据来自TARGET-OS和GEO数据库,具体样本数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 480 | 2026-07-27 |
Targeting galactose metabolic reprogramming overcomes immunotherapy resistance in KRAS-mutant lung adenocarcinoma: Integrative multi-omics and machine learning approaches
2026-Jul-06, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102895
PMID:42407377
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研究论文 | 整合多组学和机器学习方法,研究半乳糖代谢重编程在KRAS突变肺腺癌中克服免疫治疗耐药性的作用 | 首次将半乳糖代谢重编程与KRAS突变肺腺癌的免疫治疗耐药性联系起来,并利用单细胞RNA测序和机器学习构建预后模型,识别KDM5A作为关键预测因子 | NA | 探索半乳糖代谢重编程在KRAS突变肺腺癌肿瘤微环境塑造和免疫治疗耐药性中的作用 | KRAS突变肺腺癌 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 机器学习, 流式细胞术 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 突变数据 | 来自GEO和TCGA公共队列的批量组织转录组数据及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |