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当前共找到 814 篇文献,本页显示第 441 - 460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
441 2026-07-27
Context-aware sequence-to-function model of human gene regulation
2026-07-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种上下文感知的序列到功能模型Corgi,通过整合DNA序列和反式调控因子表达,预测染色质可及性、组蛋白修饰和基因表达覆盖度 Corgi模型能够外推到训练数据中未包含的细胞类型和条件,实现了跨序列和跨细胞类型的表观遗传轨道联合预测,并提出了仅利用RNA-seq数据插补表观遗传轨道的Corgi+版本 未明确说明,但可能受限于训练数据集的多样性和模型对未知细胞类型的泛化能力 开发一种能外推到未见细胞类型的上下文感知序列到功能模型,用于预测人类基因调控 人类基因调控中的染色质可及性、组蛋白修饰和基因表达覆盖度 机器学习 NA NA Corgi, Corgi+ DNA序列, 基因表达数据, 表观遗传数据 多种批量测序和单细胞测序数据集(未明确具体数量) Illumina 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
442 2026-07-27
Spatial and single-cell profiling identify NDRG1⁺ macrophages as key hallmark of angiogenic remodeling and platinum resistance in HGSOC
2026-Jul-13, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过空间转录组学和单细胞测序鉴定出NDRG1阳性巨噬细胞是高级别浆液性卵巢癌中血管生成重塑和铂类耐药的关键标志 首次整合空间转录组学与单细胞测序鉴定出NDRG1⁺Macro4巨噬细胞亚型,揭示其在缺氧驱动的血管生成龛形成及铂类耐药中的核心调控作用 摘要未提及明显局限性,但可能缺少体内功能验证或跨瘤种泛化性评估 阐明高级别浆液性卵巢癌中驱动疾病进展和治疗耐药的巨噬细胞程序 高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织中的巨噬细胞亚型及其微环境 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学, 单细胞测序, 多重免疫荧光, 伪时间重建 RSF(随机生存森林) 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 多重免疫荧光图像 多队列(具体样本量未在摘要中明确) NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
443 2026-07-27
Multi-omics analysis of arginine metabolism in ovarian cancer: A prognostic signature and GTF2F2-driven stromal remodeling
2026-Jul-13, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过多组学分析构建基于精氨酸代谢的预后标志物,并揭示GTF2F2在卵巢癌基质重塑中的驱动作用 首次利用十种机器学习算法构建精氨酸代谢相关的预后标志物,并识别GTF2F2为关键调控因子,揭示其在精氨酸代谢、基质激活和精氨酸剥夺敏感性中的转录调控机制 需要前瞻性验证来确认该标志物的临床应用价值 构建精氨酸代谢相关预后标志物以指导卵巢癌的预后和治疗策略,并鉴定可干预的调控因子 卵巢癌的肿瘤样本、单细胞转录组数据及批量RNA测序数据 机器学习 卵巢癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲降, qPCR, 免疫印迹, 流式细胞术, 双荧光素酶报告实验 随机生存森林, 随机森林 转录组数据, 单细胞转录组数据 单细胞RNA-seq和多个批量RNA测序数据集,具体样本量未详细说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
444 2026-07-27
Nasal immunity in respiratory viral infection, transmission, and protection
2026-Jul-13, Immunity IF:25.5Q1
综述 本文综述了鼻黏膜在呼吸道病毒感染、传播和保护中的免疫作用,重点讨论了单细胞RNA测序等技术揭示的细胞状态和应答机制 系统整合了鼻黏膜免疫在病毒感染中的最新进展,特别是COVID-19疫情期间的研究成果,并探讨了新型鼻内疫苗接种策略 未提及具体研究的局限性,可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 阐述鼻黏膜在呼吸道病毒感染中的免疫机制,并为开发鼻内疫苗提供新思路 小鼠和人类的鼻黏膜细胞及病毒感染后的免疫应答 数字病理学 呼吸道病毒感染 单细胞RNA测序 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序结合气液界面模型
445 2026-07-27
Exercise-primed Trpv4+ progenitors sense mechanical to regulate graded transition in enthesis regeneration
2026-Jul-13, Bone & joint research IF:4.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示Trpv4+祖细胞感受力学刺激调控肌腱-骨止点再生的机制 首次鉴定出Trpv4+祖细胞是力学敏感的关键群体,并阐明运动通过钙-钙调磷酸酶-NFATc1信号轴促进软骨分化的机制 研究主要基于小鼠模型,未能验证人类止点损伤中的机制;运动方案可能无法完全模拟临床术后康复场景 阐明肌腱-骨止点再生中力学转导的分子机制,以改善该损伤的临床治疗效果 小鼠肌腱-骨止点损伤模型中的Trpv4+祖细胞 机器学习 肌腱-骨止点损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个损伤时间点的止点组织样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
446 2026-07-27
Tumor heterogeneity: development, mechanisms, and therapeutic implications
2026-Jul-13, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
综述 综述了肿瘤异质性的起源、机制及治疗意义,强调其作为癌症驱动进展、转移和治疗耐药的核心特征 系统整合单细胞多组学、空间转录组学和液体活检等新技术对肿瘤异质性进行多维度解析,并提出靶向克隆协同网络、表观遗传可塑性和代谢重编程等创新治疗策略 未明确讨论当前技术在临床转化中的具体挑战和局限性 总结肿瘤异质性的研究进展,并探讨其对新型治疗范式和精准医学的启示 肿瘤异质性的细胞起源、分子机制、肿瘤微环境中的多维表现、转移异质性和治疗耐药 机器学习 癌症 单细胞多组学、空间转录组学、液体活检 NA 多组学数据 NA NA 单细胞多组学、空间转录组学 NA NA
447 2026-07-27
LRG1 Drives Pathological Angiogenesis by Disrupting Neutrophil Mitochondrial Homeostasis in Bladder Cancer
2026-Jul-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了LRG1通过破坏中性粒细胞线粒体稳态驱动膀胱癌病理性血管生成的作用机制 首次阐明LRG1通过结合中性粒细胞上的Annexin A2(ANXA2),阻碍Akt线粒体转位,触发mtROS依赖的中性粒细胞胞外陷阱释放,破坏血管稳定性,并证明阻断该轴可实现血管正常化,增敏化疗和免疫治疗 主要基于小鼠模型和临床标本,尚需进一步在人类临床试验中验证靶向LRG1-NETosis轴的转化潜力(根据摘要推断) 研究LRG1在膀胱癌微环境血管重塑中的作用及其机制 膀胱癌肿瘤微环境中的中性粒细胞和肿瘤血管 癌症生物学 膀胱癌 单细胞RNA测序-批处理转录组整合分析、下拉实验、质谱、共聚焦成像、中性粒细胞耗竭、DNase I处理 NA 单细胞基因表达数据、转录组数据、临床标本数据、成像数据 包含皮下和原位膀胱癌小鼠模型、临床标本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
448 2026-07-27
Mechanical stress promotes excessive NETs and exacerbates acute lung injury via Piezo1-mediated mitochondrial dysfunction
2026-Jul-11, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本文揭示了机械应力通过Piezo1介导的线粒体功能障碍促进过度NETs形成并加剧急性肺损伤的机制 首次阐明Piezo1作为机械感受器感知病理物理应变并驱动PMN过度激活,提出Piezo1是急性肺损伤的治疗新靶点 未明确提及研究的局限性 探究肺部生物力学微环境如何调节PMN过度激活及急性肺损伤的机制 急性肺损伤小鼠模型及体外细胞压缩系统中的多形核中性粒细胞 机器学习 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
449 2026-07-27
Integrative multi-omics identifies CYP1B1 as a candidate molecular link between toxicant exposure and ferroptosis-related epithelial stress in COPD
2026-Jul-11, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 通过整合多组学分析,确定CYP1B1作为COPD中烟草暴露与铁死亡相关上皮应激之间的候选分子连接 首次将CYP1B1与COPD中香烟烟雾诱导的铁死亡相关上皮应激联系起来,并整合了转录组、单细胞RNA测序、机器学习和实验验证 CYP1B1目前仅为探索性生物标志物,尚未确认为诊断工具或治疗靶点,需更大规模队列、吸烟调整分析、细胞类型特异性干扰及铁死亡拯救实验验证 识别与COPD相关的生物标志物和通路,重点关注CYP1B1与铁死亡相关上皮应激的潜在关联 公共转录组队列(GSE47460、GSE76925、GSE37768)、单细胞RNA-seq数据集(GSE196341、GSE135893)、香烟烟雾暴露小鼠模型、16HBE细胞 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 RNA-seq、单细胞RNA-seq、机器学习 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 公共队列共包含多个样本(具体数量未在摘要中提及) NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
450 2026-07-27
Identification of CTHRC1 as a Potential Prognostic Biomarker in Esophageal Squamous Cell Carcinoma by Bioinformatics Analysis
2026-Jul-11, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过生物信息学分析鉴定CTHRC1作为食管鳞状细胞癌的潜在预后生物标志物 首次通过多组学生物信息学框架系统评估CTHRC1在食管鳞状细胞癌中的预后价值,结合WGCNA、PPI和单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中的作用 缺乏前瞻性多中心验证和体内机制研究 评估CTHRC1在食管鳞状细胞癌中的预后相关性 食管鳞状细胞癌(ESCC) 数字病理学, 机器学习 食管癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 免疫荧光 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 三个基因组队列(TCGA-ESCA、GSE53624、GSE23400),一个单细胞RNA-seq数据集(GSE160269),四种ESCC细胞系(EC109、KYSE-150、KYSE-30、TE-1)和原代癌症相关成纤维细胞 Illumina RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq(推测) NA
451 2026-07-27
Single-cell Transcriptome Profiling Reveals Gene Regulatory Networks and Key Genes in the Root Epidermis and Cortical Cells Associated with Early Nodulation in Glycine Max
2026-Jul-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 利用单细胞转录组分析揭示大豆根表皮和皮层细胞中与早期结瘤相关的基因调控网络和关键基因 首次通过单细胞转录组分析揭示大豆根中早期感染和结节原基形成的精细调控机制,并鉴定和功能验证了由GmWRKY6.3/6.4转录因子和下游GmNod19靶标组成的乙烯激活回路,该回路通过促进感染线形成正向调控早期结瘤 研究仅关注接种后4天的时间点,可能未涵盖结瘤过程中的全部动态变化;需要进一步验证其他细胞类型和调控网络的贡献 阐明大豆根表皮感染和皮层结节原基形成的早期调控机制,识别关键基因和调控网络 大豆根组织,包括表皮细胞、皮层细胞及结节原基相关细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 21,500个细胞,分为12个主要细胞簇 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
452 2026-07-27
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Unveil Key Regulators Governing Cell Differentiation for Schistosoma japonicum Sexual Development
2026-Jul-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过单细胞和空间转录组学构建日本血吸虫性发育和产卵的动态细胞图谱,揭示关键调控因子 首次将单细胞转录组与空间转录组整合,解析组织解析的细胞龛,并定义多个组织特异性转录因子的时空表达谱,通过比较分析发现保守和物种特异的细胞可塑性 未提及具体局限性 阐明日本血吸虫性发育和产卵的细胞基础与调控程序 日本血吸虫的性成熟和产卵关键发育阶段 机器学习 血吸虫病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 涵盖性成熟和产卵关键发育阶段的日本血吸虫样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达
453 2026-07-27
In vivo engineering tumor cells to a universal "all-in-one" cancer vaccine with full antigen spectrum
2026-Jul-10, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 开发了一种通过编程肿瘤细胞为抗原呈递细胞,实现全抗原谱覆盖的通用“一体化”癌症疫苗 通过共递送CIITA、NLRC5、CD80和IL-2,将肿瘤细胞重编程为类似专业APC的表型,同时提供HLA-I和HLA-II抗原呈递、共刺激和T细胞增殖信号,直接激活CD4和CD8 T细胞,无需依赖传统APC 未提及临床试验或人体数据,仅在体外和小鼠模型中验证效果 开发一种通用癌症疫苗平台,覆盖全抗原谱并直接激活CD4和CD8 T细胞 肿瘤细胞(编程后转化为疫苗) 机器学习 癌症(未指定具体类型) 单细胞转录组测序 NA 文本 小鼠模型(预防性和治疗性模型) NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组分析用于确认细胞亚型相似性
454 2026-07-27
Spatial Autocorrelation Aware Resampling Improves Cell-Cell Interaction Inference in Spatial Transcriptomics Data
2026-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种考虑空间自相关的重采样方法SOAAR,用于提高空间转录组数据中细胞间相互作用推断的准确性 首次在空间转录组数据分析中引入空间自相关感知的重采样方法,通过保持基因水平空间自相关性来生成零分布,降低假阳性率 未来需将局部相关模式与下游生物通路变化关联,以推动生物标志物和治疗靶点发现 开发一种基于空间统计的空间基因-基因相关性统计检验方法,以更准确地识别细胞间相互作用 空间转录组数据中的细胞间相互作用(基于配体-受体共表达) 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学 空间自相关重采样统计方法 空间转录组数据 10名免疫治疗头颈鳞癌患者的10X Visium数据集,以及23名患者的单细胞空间CosMX SMI数据 10x Genomics, CosMX 空间转录组学 10x Visium, CosMX SMI 10x Visium用于FFPE样本,CosMX SMI用于单细胞空间分析
455 2026-07-27
Integrative bulk and single-cell analyses implicate ASL in MIF-associated myeloid programs in glioblastoma
2026-Jul-09, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 通过整合bulk和单细胞分析,发现ASL与胶质母细胞瘤中MIF相关的髓系程序有关 首次在单细胞分辨率下揭示ASL表达与精氨酸代谢活性在单核/巨噬细胞中富集,并与MIF信号通路相关,为GBM风险分层和免疫微环境研究提供新视角 文中未明确提及局限性,但可能包括验证数据集规模有限及单细胞数据来源仅来自五个样本 识别与胶质母细胞瘤预后相关的精氨酸代谢基因标志物,并揭示其细胞背景和免疫调控机制 TCGA、CGGA和GEO数据集中的GBM患者,以及五个GBM样本的单细胞RNA-seq数据 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA-seq、单细胞RNA-seq LASSO Cox回归 基因表达数据、单细胞转录组数据 TCGA GBM队列、CGGA和GEO验证数据集,单细胞数据来自5个GBM样本共38,263个高质量细胞 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
456 2026-07-27
Single-cell analysis reveals impaired Müller glia-mediated intercellular communication and photoreceptor pathology in USH1C retinal organoids
2026-Jul-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 通过单细胞分析揭示USH1C视网膜类器官中Müller胶质细胞介导的细胞间通讯受损和感光细胞病理 首次利用患者来源的诱导多能干细胞生成USH1C视网膜类器官,通过单细胞RNA测序揭示Müller胶质细胞信号传导异常在USH1C视网膜病变中的关键作用 未提及具体局限性 探究USH1C基因突变导致视网膜退行性病变的细胞和分子机制 两名USH1C患者的诱导多能干细胞来源的视网膜类器官 单细胞生物学 遗传性视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 两名USH1C患者的视网膜类器官样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
457 2026-07-27
Cross-layer multiomic and digital pathology analysis identifies a malignant keratinization state linked to immune exclusion in cervical squamous carcinoma
2026-Jul-09, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过跨层次多组学与数字病理分析,识别宫颈鳞状细胞癌中与免疫排斥相关的恶性角化状态 首次将单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq及全切片H&E分析整合,识别出与免疫排斥组织结构和肿瘤分级相关的基底鳞状应激角化(BSK)程序,并跨转录组和病理模态进行转化 研究未确立BSK为免疫治疗应答的因果驱动因子或验证性预测标志物,仅提供探索性临床病理支持 探究宫颈鳞状细胞癌中与免疫排斥相关的恶性上皮状态及其组织与形态学关联 宫颈鳞状细胞癌患者样本(包括初级肿瘤、局部新辅助免疫治疗队列等) 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq、全切片H&E分析、多重免疫荧光 NA 基因表达数据、图像 来自TCGA的250名患者的259张H&E切片,以及一个18名患者的局部新辅助免疫治疗队列 Illumina 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq Illumina NovaSeq NA
458 2026-07-27
Molecular characterization of cell dynamics during osteosarcoma progression
2026-Jul-09, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,系统描绘骨肉瘤进展过程中细胞组成和细胞动态的变化 首次大规模整合覆盖原发、复发和转移阶段的多中心单细胞及空间转录组数据,揭示骨肉瘤转移中的细胞动态重塑和分化轨迹 NA 研究骨肉瘤进展过程中细胞动态的分子特征和微环境重塑 骨肉瘤肿瘤组织中的成骨细胞、骨髓细胞、成纤维细胞、恶性细胞、T/NK细胞及肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 覆盖原发、复发和转移阶段的多中心样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
459 2026-07-27
Clinical significance of CD161+CD8+ T cells in the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma and their association with the 4-1BB signaling pathway
2026-Jul-09, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 探讨食管鳞状细胞癌微环境中CD161+CD8+ T细胞的临床意义及其与4-1BB信号通路的关联 首次在多中心队列中系统评估CD161+CD8+ T细胞在食管鳞癌中的预后预测价值及其与4-1BB信号通路的潜在相互作用,并开发基于CT的影像组学模型进行非侵入性预测 研究为回顾性分析,需前瞻性验证;CD161+CD8+ T细胞与巨噬细胞间的4-1BB/4-1BBL相互作用未在功能实验中得到直接证实 明确CD161+CD8+ T细胞在食管鳞癌中的临床意义与功能特征 食管鳞癌患者(接受手术或新辅助治疗) 数字病理学、机器学习 食管癌(食管鳞状细胞癌) 多重免疫荧光染色、单细胞RNA测序、CT影像组学 XGBoost 图像(病理组织切片、CT影像) 多中心队列(未明确具体人数) NA 单细胞RNA测序 NA NA
460 2026-07-27
Beyond gene expression: Single-cell transcriptomics at isoform resolution
2026-Jul-09, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1
综述 综述了从单细胞转录组到异构体分辨率的单细胞转录组学进展,包括短读和长读技术 总结单细胞异构体分辨转录组学在揭示细胞类型特异性转录本异构体使用和调控方面的创新实验与计算方法 未提及具体限制 回顾并讨论异构体分辨单细胞转录组学的发展、应用及对单细胞生物学的影响 单细胞转录组和RNA异构体 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序、短读长全转录本测序、长读长直接测序 NA RNA序列数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
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