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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-06-07 |
Analysis of B cell dynamic changes and pivotal drivers based on single-cell transcriptome of peripheral blood in sepsis
2026-Jul, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2026.103009
PMID:42184475
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研究论文 | 基于外周血单细胞转录组分析脓毒症中B细胞的动态变化及关键驱动因子 | 首次整合多个GEO数据集进行单细胞B细胞轨迹分析,识别出六种具有强诊断潜力的枢纽基因(DDX17、SLC2A3、RPS4X、PCBP2、S100A9、PFDN5),并揭示脓毒症中B细胞组成及分化路径的显著变化 | NA | 探讨脓毒症中B细胞的动态分化机制及关键调控因子,并筛选用于诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 | 脓毒症患者的外周血B细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, LASSO | 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集,包含健康对照和脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2026-06-06 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序与实验验证,鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 整合单细胞RNA测序分析与体内外验证,首次发现COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2四个枢纽基因在IPAH中显著上调,并验证了其沉默可抑制PASMC增殖和迁移 | 未提及 | 鉴定特发性肺动脉高压中驱动肺动脉平滑肌细胞异常增殖和迁移的关键基因 | 特发性肺动脉高压患者及单侧气肿诱导的PAH大鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IPAH患者样本(具体数量未提及)及MCT诱导的PAH大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE169471数据集来自Gene Expression Omnibus |
| 423 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and in vivo investigation reveal the role of ANXA1 in intestinal barrier dysfunction during heat stroke by mediating neutrophil-monocyte interaction and regulating the TLR4/ERK/NF-κB pathway
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153873
PMID:42070539
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与体内实验,揭示ANXA1在中暑引起的肠屏障功能障碍中通过调控中性粒细胞-单核细胞相互作用及TLR4/ERK/NF-κB通路的作用 | 首次结合单细胞转录组学与体内实验阐明ANXA1-FPR2轴在中暑肠屏障功能障碍中的保护机制,发现中性粒细胞-单核细胞相互作用的关键角色 | 未提及研究局限性 | 探究ANXA1在中暑诱导的肠屏障功能障碍中的作用机制 | 中暑患者和炎症性肠病患者的结肠组织细胞,以及中暑小鼠模型 | 生物信息学 | 中暑 | 单细胞RNA测序, 组织染色, 流式细胞术, ELISA, 蛋白印迹, 免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白表达数据 | 中暑患者与健康对照的单细胞RNA测序数据,以及小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2026-06-06 |
Dissecting Pirtobrutinib Resistance in Mantle Cell Lymphoma Through Single-Cell Multi-Omics
2026-Jul, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70304
PMID:41998849
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示套细胞淋巴瘤中Pirtobrutinib耐药的分子机制 | 首次通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和DNA-seq的多组学分析,揭示了PBN耐药的遗传和非遗传双重机制,并识别出黏连蛋白复合体核心成分RAD21和SMC3作为潜在治疗靶点 | 未明确说明 | 阐明Pirtobrutinib在套细胞淋巴瘤中产生耐药的分子动态机制 | 套细胞淋巴瘤患者的纵向样本 | 单细胞多组学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, DNA测序数据 | 套细胞淋巴瘤患者纵向样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell multi-omics analysis identifies fibroblast-like smooth muscle cells as a key driving phenotypic switching during aortic aneurysm progression
2026-Jul, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.05.006
PMID:42140576
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研究论文 | 整合单细胞多组学分析发现成纤维细胞样平滑肌细胞是驱动主动脉瘤进展中表型转换的关键细胞 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,系统鉴定出成纤维细胞样平滑肌细胞作为祖细胞样群体,并通过KAT5介导的代谢-表观遗传调控轴驱动主动脉瘤中平滑肌细胞表型转换 | 研究主要基于人主动脉组织样本的体外和动物模型验证,可能无法完全模拟体内复杂微环境,且样本量有限 | 探索主动脉瘤进展中平滑肌细胞的异质性和表型转换的调控机制 | 健康和主动脉瘤患者的人主动脉组织,以及人主动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 主动脉瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光染色, 动物模型, 体外实验 | 轨迹推断模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 人主动脉组织样本(健康与患病)及多种细胞亚群 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC测序 |
| 426 | 2026-06-06 |
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-Jul, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103189
PMID:42214504
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综述 | 本文综述了空间转录组学在解析年龄相关的神经退行性疾病组织微环境中的应用 | 强调空间转录组学作为连接分子发现与临床应用的桥梁技术,整合多组学与临床影像建立综合特征,用于早期疾病检测和患者分层 | 未明确讨论技术局限性,但提及衰老特异性挑战 | 探讨空间转录组学在揭示衰老相关病理机制和开发精准治疗干预中的应用 | 年龄相关的神经退行性病变和小胶质细胞微环境 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 427 | 2026-06-06 |
Benzene-induced myelosuppression confers a survival advantage to hematopoietic progenitors: Single-cell analysis of malignant transformation dynamics in a murine model
2026-07-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142337
PMID:42139775
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析苯诱导小鼠骨髓抑制向恶性转化的动态过程 | 首次通过单细胞分析揭示苯诱导骨髓抑制向白血病转化的关键时间窗及S100a8/S100a9相关转录程序作为早期分子特征 | 未在文献中明确提及 | 解析苯诱导骨髓抑制向快速恶性转化的演变机制 | Mll-Af9嵌合体小鼠模型及苯暴露后的造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mll-Af9嵌合体小鼠经慢性苯吸入暴露,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2026-06-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Proteomics to Unravel Stem Cell Heterogeneity: Implications for Precision Regenerative Medicine
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11116-6
PMID:41951880
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2026-06-06 |
Machine Learning-Based Identification of Molecular Signatures in PTOA Cell Subtypes via Single-Cell Transcriptomics in a Mouse Model
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11121-9
PMID:41979832
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2026-06-06 |
Hypoplastic Left Heart Syndrome Cardiomyocytes Exhibit Intrinsic Stress Vulnerabilities and Augmented Stress Responses in vitro
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11127-3
PMID:42089915
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研究论文 | 该论文研究了左心发育不全综合征(HLHS)心肌细胞在体外表现出的内在应激脆弱性和增强的应激反应 | 首次通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示HLHS患者诱导多能干细胞来源的心肌细胞在转录水平上的内在脆弱性和对特定应激源的敏感性增强,为理解基因-环境相互作用在HLHS发病机制中的角色提供了新见解 | 研究仅基于体外模型(hiPSC-CMs),可能无法完全复制体内复杂的微环境;且样本量有限,可能限制结果的普遍性 | 识别HLHS患者与健康对照者心肌细胞之间的分子和功能差异,以揭示可能导致HLHS表型的潜在脆弱性 | 来自HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs) | 数字病理学 | 先天性心脏病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 431 | 2026-06-06 |
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70726
PMID:42244441
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术,揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境并影响免疫治疗反应 | 首次确定TREM1+中性粒细胞亚群在肝细胞癌中作为关键免疫抑制细胞,通过CyTOF全面表征其功能表型,并证明靶向TREM1可增强抗PD-1抗体疗效 | 未在更大样本量或不同种族人群中验证,且TREM1抑制剂VJDT的具体作用机制需进一步阐明 | 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群并探索其免疫治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的中性粒细胞亚群,特别是TREM1+中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质组学数据 | 肝细胞癌患者队列(具体数量未在摘要中提及) | Fluidigm, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | 10x Chromium, CyTOF | 10x Chromium用于scRNA-seq, CyTOF用于质谱流式分析 |
| 432 | 2026-06-05 |
Sensory Nerves Regulate Odontoblast Differentiation via the SPP1/ITGA4 Axis During Tooth Root Development
2026-Jul, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70129
PMID:41796694
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研究论文 | 本研究以牙根发育为模型,探讨感觉神经如何通过SPP1/ITGA4轴调节成牙本质细胞分化 | 首次揭示感觉神经通过SPP1/ITGA4轴调控祖细胞命运,从而协调牙根发育的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;未涉及其他神经类型或信号通路的潜在作用 | 探究感觉神经在牙根发育过程中调节成牙本质细胞分化的作用及分子机制 | 小鼠牙乳头细胞、三叉神经节、牙根发育组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, Co-IP, PLA, siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第3.5天和第30天的小鼠三叉神经节和磨牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-06-05 |
Perspectives on human adipose tissue: from cellular mechanisms to clinical complications
2026-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06735-0
PMID:42029708
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综述 | 基于2025年Camillo Golgi奖讲座,回顾白色脂肪组织在代谢、内分泌和免疫功能中的可塑性,以及从代谢健康向肥胖相关疾病转变的细胞机制和临床意义 | 通过C年代测定和临床研究揭示脂肪细胞持续更新及脂质周转受损导致体重增加和胰岛素抵抗的机制,利用空间转录组学发现人类白色脂肪组织中至少三种主要脂肪细胞状态,并鉴定免疫调节性脂肪细胞在网膜脂肪组织中的富集 | 未明确提及具体限制 | 探讨人类脂肪组织从细胞机制到临床并发症的转化研究进展 | 人类白色脂肪组织,包括脂肪细胞更新、大小调控和细胞异质性 | 机器学习 | 心血管疾病, 代谢性疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | 未明确提及具体样本量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学用于人类白色脂肪组织分析 |
| 434 | 2026-06-05 |
Circulating Tumor Cells in Multiple Myeloma: From Peripheral Clues to Central Insights
2026-Jul, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70326
PMID:41974595
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综述 | 本文综述了循环肿瘤细胞(CTCs)在多发性骨髓瘤中的生物学意义、检测技术进展及其作为液体活检和预后生物标志物的临床应用价值 | 系统总结了CTCs从外周血检测到揭示骨髓微环境逃逸机制的研究进展,强调了其与骨髓微小残留病(BM-MRD)评估的互补作用,并介绍了单细胞测序技术(如MinimuMM-seq和SWIFT-seq)在追踪克隆异质性和进化动态中的创新应用 | CTCs检测面临标准化不足、灵敏度有限及临床整合困难的方法学挑战 | 探讨CTCs在多发性骨髓瘤中从生物学标志物向临床可操作工具转化的潜力,推动精准医学发展 | 多发性骨髓瘤患者及疾病谱各阶段(MGUS、冒烟型骨髓瘤、孤立性浆细胞瘤、症状性MM、浆细胞白血病)的循环肿瘤细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤 | 高灵敏度流式细胞术、下一代单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | MinimuMM-seq, SWIFT-seq | 单细胞测序技术用于CTCs基因组和转录组分析,包括MinimuMM-seq和SWIFT-seq等新型方法 |
| 435 | 2026-06-02 |
Alveolar macrophage subtypes express cholesterol and inflammation genes in cystic fibrosis
2026-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503482
PMID:42061984
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者与健康对照者的肺泡巨噬细胞亚型,发现表达胆固醇和炎症相关基因的巨噬细胞亚型 | 首次在囊性纤维化肺中通过单细胞RNA测序无偏聚类识别出12种肺泡巨噬细胞亚型,并发现CDKN1A和LDLR表达上调与胆固醇代谢及炎症相关的联系 | 巨噬细胞与其他免疫细胞在囊性纤维化中的相互作用机制尚不完全清楚 | 识别和比较囊性纤维化与健康人群气腔巨噬细胞和单核细胞的细胞组成 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺泡巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 囊性纤维化患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 通过支气管镜获取支气管肺泡灌洗液进行单细胞RNA测序 |
| 436 | 2026-05-30 |
Anemoside B4 alleviates pulmonary fibrosis by targeting the Keap1/Nrf2 axis to suppress NLRP3 inflammasome-mediated pyroptosis and epithelial-mesenchymal transition
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158223
PMID:42068876
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研究论文 | 该研究揭示了白头翁皂苷B4通过靶向Keap1/Nrf2轴抑制NLRP3炎症小体介导的细胞焦亡和上皮间质转化,从而减轻肺纤维化的作用机制 | 首次发现白头翁皂苷B4作为预防性而非治疗性药物对抗肺纤维化,并阐明了其通过直接结合Keap1激活Nrf2抗氧化途径、抑制NLRP3依赖性细胞焦亡及分泌组驱动的上皮间质转化的完整分子机制 | 未提及具体局限性 | 探究白头翁皂苷B4在肺纤维化中的保护作用及其分子机制,重点关注Keap1/Nrf2轴、NLRP3介导的细胞焦亡和上皮间质转化 | 野生型和Nlrp3基因敲除小鼠的博莱霉素诱导肺纤维化模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | NGS, scRNA-seq, Co-IP, CETSA | NA | 转录组数据 | 野生型和Nlrp3基因敲除小鼠(具体数量未提及) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2026-05-29 |
Immunoregulatory mechanisms underlying vitexin-mediated attenuation of concanavalin A-induced liver injury
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158231
PMID:42054738
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞技术,揭示了牡荆素通过调节T细胞功能缓解ConA诱导的肝损伤的免疫调控机制 | 首次采用质谱流式与单细胞RNA测序联合策略,系统描绘牡荆素对肝脏免疫景观的重编程作用,特别是对T细胞亚群的转录异质性和通讯网络的精细解析 | 信息来源未提供具体局限性,可能包括动物模型与人类AIH的差异、剂量依赖性效应的明确机制等 | 探究牡荆素在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制及治疗潜力 | ConA诱导的AIH小鼠模型中的肝脏免疫细胞,特别是T细胞亚群 | 数字化病理 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式细胞技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式细胞数据 | ConA诱导的AIH小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 采用质谱流式(CyTOF)与单细胞RNA测序(scRNA-seq)联合分析 |
| 438 | 2026-05-29 |
Single-cell profiling uncovers kaempferol-mediated immunoregulation in the protection against experimental autoimmune hepatitis
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158240
PMID:42066574
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示山奈酚在实验性自身免疫性肝炎中的免疫调节保护机制 | 首次利用单细胞RNA测序和CyTOF技术,在单细胞水平全面揭示山奈酚通过调控M2巨噬细胞扩增、上调Acod1和清除致病性CD8+记忆T细胞亚群缓解自身免疫性肝炎的免疫调节机制 | 基于小鼠模型,其结果向人类的转化需进一步验证;且未对山奈酚的剂量-效应关系及长期安全性进行探讨 | 探究山奈酚缓解实验性自身免疫性肝炎的治疗效果和免疫调节机制 | ConA诱导的实验性自身免疫性肝炎小鼠模型及其肝脏免疫微环境中的免疫细胞 | 免疫学,单细胞组学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序,CyTOF,抗体微阵列,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,免疫细胞蛋白标志物数据,细胞因子数据 | 涉及ConA诱导的小鼠模型,具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用单细胞RNA测序和CyTOF技术,但未提及具体平台产品型号 |
| 439 | 2026-05-29 |
Spatially resolved multi-omics reveals that paeoniflorin ameliorates IgA nephropathy via Oat, Aco1 and Fh-mediated metabolic reprogramming and tubuloimmune crosstalk
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158263
PMID:42096999
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研究论文 | 通过空间代谢组学和空间转录组学整合分析,揭示芍药苷通过Oat、Aco1和Fh介导的代谢重塑及肾小管-免疫交互改善IgA肾病的分子机制 | 首次采用空间多组学技术揭示芍药苷在IgA肾病中肾皮质区域特异的代谢重编程和转录调控机制,阐明了其通过干扰三羧酸循环及上调精氨酸和脯氨酸代谢发挥治疗作用 | 研究数据主要来源于大鼠模型,缺乏临床样本验证;空间多组学技术分辨率有限,可能遗漏部分细胞层面的异质性信息 | 阐明中药单体芍药苷治疗IgA肾病的空间分子机制 | IgA肾病大鼠模型及体外细胞实验 | 数字病理学 | IgA肾病 | 空间代谢组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 空间代谢数据、空间转录数据 | Wistar大鼠IgA肾病模型(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 440 | 2026-05-29 |
Aqueous extract of Solanum nigrum L. restrains colorectal cancer progression by blocking cancer-associated fibroblast-induced STAT3-Annexin A2 signaling
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158257
PMID:42097000
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现,龙葵水提物通过抑制STAT3-Annexin A2信号通路,阻断癌症相关成纤维细胞诱导的结直肠癌进展 | 首次整合单细胞RNA测序和TMT蛋白质组学,揭示龙葵活性成分(茄碱和茄边碱)通过直接靶向STAT3调控ANXA2转录,从而抑制结直肠癌转移的分子机制 | 未说明具体局限性 | 系统研究龙葵水提物的生物活性化学成分及其抗结直肠癌转移的分子机制 | 结直肠癌细胞及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | NGS, RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 皮下异种移植瘤模型、APCMin/+小鼠、实验性转移模型等多种小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 散装RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | NA |