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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-07-28 |
FOSL2-driven SASP in endometrial stroma promotes the inflammation of endometriosis
2026-Jul-24, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-026-00447-w
PMID:42498708
|
研究论文 | 本研究探讨FOSL2驱动的子宫内膜基质细胞衰老相关分泌表型(SASP)在子宫内膜异位症炎症中的作用 | 首次发现转录因子FOSL2异常过表达诱导子宫内膜基质细胞衰老和SASP,并通过NF-κB信号通路促进M2巨噬细胞极化和招募,揭示了FOSL2作为子宫内膜异位症慢性盆腔炎症的新机制 | 未明确说明 | 探究子宫内膜异位症中促炎性SASP的机制及其潜在影响 | 子宫内膜基质细胞(ESCs)及子宫内膜异位症患者的在位内膜和异位病灶 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 未明确说明 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 382 | 2026-07-28 |
Immunological Reprogramming in Cardiomyopathies: From Cardiomyocyte Injury to Disease of the Cardiac Immune Ecosystem
2026-Jul-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15141308
PMID:42505415
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综述 | 提出心肌病中免疫重编程的统一框架,从心肌细胞损伤转向心脏免疫生态系统疾病的概念 | 整合心血管免疫学、单细胞和空间转录组学、免疫代谢及系统生物学,提出心肌病免疫重编程的统一框架,并引入免疫型概念以超越传统表型和遗传分类 | 未明确说明局限性 | 探讨心肌病中免疫重塑的动态作用并提出免疫生态系统分类新维度 | 心肌病中的免疫细胞、成纤维细胞、骨髓细胞等免疫生态系统组分 | 机器学习 | 心肌病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 383 | 2026-07-28 |
Human primary antibody response to vaccination follows a partially sequential class-switching program with a checkpoint at IGHG2
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102848
PMID:42242228
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研究论文 | 本研究通过分析新冠疫苗接种后志愿者的B细胞反应,揭示了抗体类别转换重组遵循部分顺序的程序并在IGHG2处存在检查点 | 首次通过高频采血和多种测序技术结合,揭示人类初级免疫应答中类别转换重组的有序性和IGHG2检查点的存在,挑战了传统单基因无菌转录的观点 | 样本量有限,仅针对新冠疫苗初免反应,且研究时间窗口限于接种后10周 | 阐明人类初级抗体应答中类别转换重组的动态机制 | 新冠疫苗初免的健康志愿者在接种后前三周内每隔一天采集的样本,包括B细胞受体库、单细胞转录组、免疫表型和IGHC无菌转录本 | 免疫学 | 传染病 | B细胞受体库测序, 单细胞转录组测序, 免疫表型分析, 无菌转录本分析 | NA | 测序数据, 转录组数据 | 新冠疫苗初免的健康志愿者,接种后前三周内高频采样 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2026-07-28 |
Differential T cell clonal dynamics underlie outcomes to frontline chemoimmunotherapy in advanced gastric cancer
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102910
PMID:42392078
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research paper | 研究晚期胃癌化疗免疫治疗中T细胞克隆动态变化与疗效的关系 | 首次通过单细胞RNA和TCR测序揭示化疗免疫治疗联合应用的T细胞克隆动态机制 | 样本量有限(33名患者),且为单中心试验 | 阐明化疗-免疫疗法协同作用的T细胞动态机制,解释晚期胃癌患者对chemoimmunotherapy的差异反应 | 来自33名晚期胃癌患者的66,813个T细胞(治疗前、化疗后和免疫治疗后) | machine learning | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 33名患者的66,813个T细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和TCR测序 |
| 385 | 2026-07-28 |
Microglia in Alzheimer's Disease: From Homeostatic Guardians to Multifaceted Drivers of Neuropathology
2026-Jul-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15141291
PMID:42505400
|
综述 | 综述了小胶质细胞在阿尔茨海默病中从稳态守护者到多面神经病理驱动者的转变 | 整合单细胞测序和代谢组学的最新进展,提出小胶质细胞可塑性、代谢重编程和细胞间通讯的综合框架 | 缺乏原始实验数据支持,依赖现有研究的总结 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的功能转变机制及治疗策略 | 小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 人工智能 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 386 | 2026-07-28 |
Robust and generalizable CNV detection for single-cell sequencing assays
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag636
PMID:42500822
|
研究论文 | 开发了一种名为RIDDLER的鲁棒且无监督的方法,用于从单细胞测序数据中检测拷贝数变异(CNVs),适用于多种单细胞模态 | 提出了一种基于异常值感知统计建模的鲁棒回归框架,能够跨多种单细胞模态(如sc-ATAC-seq和sc-甲基化)通用检测CNVs,并有效处理数据稀疏性 | 未明确讨论在极端数据稀疏或低测序深度下的性能,以及与其他模态(如sc-RNA-seq)的整合方法比较 | 建立一种可扩展、通用且准确的多模态单细胞CNV检测方法,以研究CNV动态与表观遗传改变之间的关系 | 单细胞ATAC-seq和单细胞甲基化数据中的拷贝数变异 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞ATAC-seq、单细胞甲基化测序 | 鲁棒回归模型 | 基因表达及表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 387 | 2026-07-28 |
Single-cell sequencing reveals an immunotherapy-relevant IFITM1-marked epithelial interferon state in nasopharyngeal carcinoma
2026-Jul-17, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102921
PMID:42468141
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示鼻咽癌中一种与免疫治疗相关的IFITM1标记的上皮干扰素状态 | 首次通过单细胞测序鉴定出鼻咽癌中IFITM1作为上皮干扰素状态(Epi7)的前导标志物,并连接了恶性细胞异质性与肿瘤免疫通讯及免疫治疗相关的微环境重塑 | 研究主要基于已有数据库和细胞系实验,缺少大规模临床队列验证以及体内动物模型的进一步确认 | 探究鼻咽癌恶性细胞异质性与免疫治疗反应相关的分子机制 | 鼻咽癌肿瘤组织、外部公开数据集(GSE53819等)、HK1细胞系 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 包括GSE53819、GSE12452、GSE64634、GSE102349及TCGA-HNSC等多个公开队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2026-07-28 |
Mediterranean Diet and Neurodegenerative Diseases: Recent Advances from the Gut-Immune-Brain Axis to Multi-Omics-Guided Precision Nutrition
2026-Jul-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15141287
PMID:42505396
|
综述 | 本文综合探讨了地中海饮食通过肠-免疫-脑轴对神经退行性疾病的神经保护作用,并整合多组学引导的精准营养策略 | 将疾病特异性机制框架与多组学引导的精准营养策略相结合,系统总结地中海饮食在阿尔茨海默病和帕金森病中的作用 | 当前证据多为观察性研究,需更多随机对照试验和标准化多组学数据分析框架 | 系统综述地中海饮食通过肠-免疫-脑轴对神经退行性疾病的影响,并探讨多组学技术在精准营养中的应用 | 阿尔茨海默病和帕金森病患者 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 微生物组分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 389 | 2026-07-28 |
Chemerin Promotes Obesity-Accelerated Orthodontic Tooth Movement by Activating IRE1α-Dependent ER Stress in PDL Fibroblasts
2026-Jul-16, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109708
PMID:42468352
|
研究论文 | 探讨肥胖相关趋化素上调通过激活IRE1α依赖的内质网应激促进牙周韧带成纤维细胞中正畸牙移动的作用及其机制 | 首次揭示趋化素通过IRE1α介导的内质网应激通路在肥胖加速正畸牙移动中的关键作用,并利用单细胞RNA测序鉴定牙周组织中趋化素的主要细胞来源 | 研究主要基于动物模型和体外实验,缺乏人体临床样本的直接验证,且机制探索集中于IRE1α通路,未涵盖其他可能的内质网应激分支 | 研究肥胖相关趋化素上调在正畸牙移动中的作用及其分子机制 | 肥胖小鼠和人类牙周韧带成纤维细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肥胖小鼠及体外培养的人牙周韧带成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2026-07-28 |
IFITM3 promotes an M2-like tumor-supportive microenvironment in acute myeloid leukemia
2026-Jul-08, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03310-w
PMID:42418060
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量基因表达分析,揭示了IFITM3通过诱导M2型巨噬细胞极化,促进急性髓系白血病肿瘤支持性微环境 | 首次阐明IFITM3通过PI3K/AKT信号通路驱动M2型巨噬细胞极化,从而塑造白血病免疫微环境的机制 | 未提及 | 阐明IFITM3在急性髓系白血病中调节免疫微环境的分子机制 | IFITM3高表达的急性髓系白血病细胞及相应的巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量基因表达分析、巨噬细胞极化实验 | NA | 基因表达数据 | IFITM3 AML细胞系及其敲低模型、IFITM3过表达HL-60细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 391 | 2026-07-28 |
Screening of cell-type-specific meta-programs for drug repurposing in Alzheimer's disease
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag411
PMID:42506875
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq数据的综合分析,识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的元程序,并筛选候选重定位药物 | 首次整合多个单细胞/核RNA-seq数据集,识别出51个跨样本的细胞类型特异性元程序,并利用这些元程序进行药物重定位筛选 | 未明确说明 | 识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的转录组元程序,并筛选潜在的药物重定位候选药物 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 机器学习和生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 67个高病理分级样本(Braak V/VI期),1208个阿尔茨海默病样本和725个正常样本的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 392 | 2026-07-28 |
Integrated Proteogenomics and Single-Cell Transcriptomics Prioritize Putative Protective Plasma Proteins for Hidradenitis Suppurativa
2026-Jul, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70332
PMID:42499219
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研究论文 | 整合蛋白质基因组学与单细胞转录组学,优先筛选出三种可能对化脓性汗腺炎具有保护作用的血浆蛋白 | 首次将蛋白质数量性状位点孟德尔随机化与单细胞转录组定位相结合,从遗传因果关系和细胞分辨率层面优先筛选HS保护性血浆蛋白 | 血浆蛋白检测阈值可能导致某些候选蛋白(如TNFRSF6B)在皮肤中无法检出,且需要进一步功能验证 | 鉴定遗传预测水平与HS风险因果关联的血浆蛋白,并在单细胞分辨率下定位其在皮肤中的表达 | 化脓性汗腺炎患者与健康对照 | 机器学习 | 化脓性汗腺炎 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | UK Biobank Pharma Proteomics Project的2923种血浆蛋白与FinnGen R12的HS汇总统计数据 | NA | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2026-07-27 |
Emerging applications of single cell and spatial transcriptomics under abiotic soil stress conditions
2026-Jul-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag375
PMID:42500918
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综述 | 探讨单细胞和空间转录组学在非生物土壤胁迫条件下应用于作物根系研究的新兴进展与挑战 | 本文针对实际土壤环境的复杂性,强调单细胞与空间转录组学在解析根系细胞特异性转录响应方面的优势,与传统批量转录组学相比,能捕捉到空间和时间上精细变化的胁迫信号 | 大多数研究仍基于简化条件(如凝胶、水培或人工化学处理),缺乏真正原位农业土壤系统的空间图谱,且未充分整合根系生长的时间动态及水分、机械应力、气体扩散、微生物群落和营养梯度等局部测量数据 | 理解作物根系在非生物土壤胁迫下的细胞级转录调控机制,推动方法从简化环境向真实土壤条件转化 | 作物根系及其在异质土壤环境中的细胞转录响应 | 机器学习 | 非适用 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非适用 | 转录组数据 | 非适用 | 非适用 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非适用 | 非适用 |
| 394 | 2026-07-27 |
Prdm15 deficiency perturbs hematopoietic stem and progenitor cell homeostasis
2026-Jul-25, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.07.009
PMID:42501896
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研究论文 | Prdm15缺失扰乱造血干细胞和祖细胞稳态 | 首次发现Prdm15缺陷导致造血干细胞累积,并阐明了其通过影响KMT2C和组蛋白修饰来调控造血稳态的分子机制 | 未涉及Prdm15在人类造血系统中的作用,且小鼠模型可能存在物种特异性差异 | 探究Prdm15在造血干细胞和祖细胞稳态维持中的调控作用及机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, CUT&Tag测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 小鼠造血干细胞和祖细胞样本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 395 | 2026-07-27 |
Single-cell analysis of the epigenome and 3D chromatin architecture in the human retina
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9162
PMID:42490430
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析研究人视网膜的表观基因组和3D染色质结构 | 首次在单细胞水平上整合了人视网膜的基因表达、染色质可及性、DNA甲基化和三维染色质结构,并利用深度学习解释非编码风险变异 | 未明确提及,可能受限于样本来源或技术验证的深度 | 解析人视网膜细胞类型的转录调控元件,并建立单细胞多组学图谱以研究眼部疾病 | 人视网膜、黄斑和视网膜色素上皮/脉络膜组织 | 机器学习 | 眼部疾病 | 单细胞多组学分析 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达、染色质可及性、DNA甲基化、3D染色质结构数据 | 人类视网膜样本中的23种视网膜细胞类型 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 396 | 2026-07-27 |
Mechanisms and therapeutic targets in distant metastasis of lung adenocarcinoma
2026-Jul-24, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02817-y
PMID:42493498
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研究论文 | 整合数字空间分析和多重免疫荧光技术,开发肺腺癌器官特异性转移风险预测模型并探索其分子机制 | 首次基于原发肿瘤空间转录组数据,应用随机森林模型高精度预测肺腺癌向脑、肝、肾上腺和骨的特异性转移,并揭示肿瘤、免疫及基质细胞中器官趋向性相关的关键基因表达特征 | 样本量较小(仅52例肺腺癌患者),可能影响模型的泛化能力 | 阐明肺腺癌远处转移的器官趋向性分子机制并识别治疗靶点 | 52例肺腺癌患者的原发肿瘤组织及对应转移灶 | 数字病理学 | 肺癌 | 数字空间分析(DSP)、多重免疫荧光(mIF) | 随机森林 | 空间转录组数据、临床数据 | 52例肺腺癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 397 | 2026-07-27 |
ELF3 links kidney function GWAS loci to maladaptive epithelial inflammation
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec6741
PMID:42497247
|
研究论文 | 该研究揭示了ELF3是肾功能GWAS位点的效应基因,通过放大损伤近端肾小管的上皮炎症重编程,推动慢性肾脏病进展 | 首次鉴定ELF3为肾功能GWAS位点的效应基因,并阐明其通过非经典NF-κB通路驱动上皮炎症重编程的机制 | 未提及具体限制,但可推断动物模型与人类疾病的差异及潜在脱靶效应 | 解析肾功能GWAS位点的效应基因及其在慢性肾脏病炎症重编程中的作用机制 | 小鼠模型和人类慢性肾脏病患者的损伤近端肾小管细胞 | 机器学习 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、免疫荧光图像 | 小鼠模型及人类慢性肾脏病组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 398 | 2026-07-27 |
Signaling mechanisms and dynamics governing the myocardial-epicardial fate switch during human cardiogenesis
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee5316
PMID:42497271
|
研究论文 | 开发基于人类多能干细胞的模型,结合单细胞RNA测序揭示心肌和心外膜命运决定的信号机制和动态过程 | 首次揭示视黄酸在心脏中胚层阶段作为关键命运开关,驱动人心肌和心外膜谱系分化的双向调控机制 | 基于体外模型,可能无法完全模拟体内发育的复杂微环境 | 阐明人类心脏发育中心肌和心外膜谱系分岔的信号机制和发育动态 | 人类多能干细胞来源的心脏发育模型中的心肌和心外膜细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列单细胞RNA测序 |
| 399 | 2026-07-27 |
The IRE1-XBP1s Axis Drives Inflammatory Osteolysis by Regulating a 5-HT Dependent Endogenous Anti-Autophagy Mechanism
2026-Jul-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76755
PMID:42490691
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研究论文 | IRE1-XBP1s轴通过调控5-HT依赖的内源性抗自噬机制驱动炎症性骨溶解 | 首次揭示IRE1-XBP1s轴在炎症性骨溶解中的关键作用及其通过5-HT依赖的抗自噬机制调控破骨细胞生成 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需更多临床验证 | 探讨IRE1-XBP1s轴在炎症性破骨细胞生成和骨溶解中的作用机制 | LPS诱导的骨溶解小鼠模型、炎症性骨病患者外周血单核细胞 | 机器学习和计算生物学 | 骨疾病(炎症性骨溶解) | 单细胞RNA测序、RNA测序、双荧光素酶报告实验、ChIP-PCR、非靶向代谢组学、HPLC-MS | NA | 基因表达和代谢物数据 | 小鼠样本和炎症性骨病患者外周血单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 400 | 2026-07-27 |
Multi-omics and artificial intelligence nominate PCLAF as a prognostic and druggable target for hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma
2026-Jul-22, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112753
PMID:42486346
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研究论文 | 通过多组学与人工智能分析,确定PCLAF作为乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的预后和可药物靶点 | 首次系统整合多组学数据(转录组、单细胞RNA测序、空间转录组)、人工智能药物筛选与实验验证,揭示PCLAF在肝癌免疫微环境中与增殖性但功能受限的循环T细胞的关联 | 尚需进一步在大规模临床队列和体内模型中验证PCLAF的预后和治疗价值 | 系统研究PCLAF在肝细胞癌中的临床意义、生物学功能及治疗潜力 | 肝细胞癌中PCLAF的分子特征及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 计算机视觉, 机器学习 | 肝癌 | 二代测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | GEO数据库中的GSE83148和GSE121248转录组数据集、TCGA-LIHC队列、单细胞RNA测序数据GSE202642、空间转录组数据GSE245908,以及临床标本和HCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |