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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-07-03 |
Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in the mouse visual cortex
2026-Jul-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10424-8
PMID:42386969
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学和投射组学,在小鼠视觉皮层中建立了兴奋性神经元类型的综合分类系统 | 首次将单细胞转录组数据与长程轴突投射特征直接关联,通过多步分类器整合跨模态数据,揭示转录组变异与形态电生理表型及投射靶点的对应关系 | 研究仅限于小鼠视觉皮层中的兴奋性神经元,未涉及抑制性神经元,且跨物种扩展性尚未验证 | 建立小鼠视觉皮层兴奋性神经元的综合分类系统,并探索转录组特征与投射靶点之间的预测关系 | 小鼠视觉皮层中的兴奋性神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, Patch-seq | 多步分类器 | 转录组数据, 形态学数据, 电生理数据 | 1,528个Patch-seq兴奋性神经元和341个全神经元形态数据 | NA | 单细胞RNA测序, Patch-seq | NA | NA |
| 342 | 2026-07-03 |
GPNMB-directed CAR T cell therapy against MiT/TFE-family fusion-driven solid tumors
2026-Jul-01, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-026-01194-3
PMID:42387022
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研究论文 | 开发针对GPNMB的CAR-T细胞疗法GCAR1,用于治疗MiT/TFE家族融合驱动的实体肿瘤,并在临床试验中展示初步疗效 | 首次鉴定GPNMB作为MiT/TFE家族融合驱动蛋白在ASPS和转位肾细胞癌中高度一致稳定表达,并开发相应的CAR-T细胞产品GCAR1,首次进行人体临床试验评估 | 临床试验为单臂开放标签,仅纳入一例受试者,样本量极小,且稳定期仅持续3个月,长期疗效和安全性需进一步验证 | 开发针对GPNMB的CAR-T细胞疗法,为MiT/TFE家族融合驱动实体肿瘤提供治疗新策略 | 肺泡状软组织肉瘤(ASPS)和转位肾细胞癌(tRCC)患者的肿瘤样本、细胞、类器官及异种移植模型 | 免疫治疗 | 肺泡状软组织肉瘤,肾细胞癌 | CAR-T细胞疗法,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 1例复发/难治性转移性ASPS患者(临床试验),以及患者匹配的细胞、类器官和异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 343 | 2026-07-03 |
Microglial tunneling nanotubes: an intercellular transfer facilitating mitochondrial dysfunction and neuroinflammation in experimental cerebral malaria
2026-Jul-01, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02370-7
PMID:42387204
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研究论文 | 探究微胶质细胞隧道纳米管在实验性脑疟中介导线粒体功能障碍和神经炎症的细胞间传递机制 | 首次揭示隧道纳米管在脑疟中介导微胶质细胞间线粒体和疟色素转移,并阐明其放大神经炎症的分子机制 | 主要基于体外和动物模型,缺乏临床样本验证;隧道纳米管抑制剂的长期效果和安全性未评估 | 阐明隧道纳米管在实验性脑疟微胶质细胞激活和神经炎症中的具体作用机制 | 实验性恶性疟疾模型小鼠的微胶质细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 实验性恶性疟疾模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 344 | 2026-07-03 |
An AI-Driven Multi-Omics Framework Identifies CASP8 as a Clinically Actionable Pyroptosis Biomarker in Bladder Cancer
2026 Jul-Aug, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70130
PMID:42387317
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研究论文 | 本研究开发了一个AI驱动的多组学框架,整合单细胞RNA测序、多队列转录组学和机器学习,鉴定出CASP8作为膀胱癌中临床可操作的焦亡生物标志物 | 创新性地将人工智能与多组学数据整合,从单细胞分辨率下分析染色体非整倍性和拷贝数变异,构建共识焦亡评分系统并通过机器学习筛选关键生物标志物,最终发现CASP8与基因组不稳定性及焦亡失调的临床关联 | 未在文中明确提及局限性 | 开发一种AI驱动的多组学发现框架,以克服将复杂基因组不稳定性与可解释生物学过程相关联的困难,加速膀胱癌生物标志物的临床转化 | 膀胱癌恶性细胞群体及其微环境中的焦亡活性与CASP8表达 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、多队列转录组学、机器学习基因组推断 | 机器学习模型(未具体说明类型) | 单细胞RNA测序数据、转录组学数据、基因组变异数据 | 多个队列的样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2026-07-03 |
A pan-cancer single-cell atlas uncovers the role of sex hormones and chromosomes in sex-divergent reprogramming of the tumor microenvironment
2026-Jul-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02995-w
PMID:42387342
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2026-07-02 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
|
研究论文 | 本研究结合遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型,探讨NOTCH4基因功能获得性变异如何影响系统性硬化症(SSc)患者的血管生成 | 首次在非裔美国人SSc患者中发现NOTCH4基因罕见变异与严重血管病变相关,并揭示其通过增强NOTCH4信号传导抑制血管生成和促进内皮-间质转化(EndoMT)的机制 | 未明确提及研究局限性,但可能包括样本规模有限、种族特异性变异推广性不足以及需要进一步临床试验验证治疗策略 | 探究非裔美国人SSc患者中严重血管表型的遗传病因,并评估NOTCH4通路作为治疗靶点的潜力 | 非裔美国人系统性硬化症患者及其血管病变相关NOTCH4基因功能获得性变异 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 基因检测 | 小鼠模型 | 基因测序数据, 细胞功能数据 | 非裔美国人SSc患者与对照组人群(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2026-07-02 |
NT-I7, a Long-Acting Interleukin 7, Increases Lymphocyte Counts and Induces CD8+ T-cell Clonotype Expansion in Patients with Newly Diagnosed High-Grade Gliomas
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2953
PMID:41880597
|
研究论文 | NT-I7(一种长效白细胞介素7)在新诊断高级别胶质瘤患者中增加淋巴细胞计数并诱导CD8+ T细胞克隆型扩增 | 首次在一期临床试验中评估NT-I7在高级别胶质瘤患者中的安全性和最大耐受剂量,并揭示其对CD8+ T细胞选择性克隆型扩增的作用 | 样本量较小,且仅在一部分患者进行了单细胞RNA测序分析 | 评估NT-I7在新诊断高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及其对免疫细胞的影响 | 新诊断高级别胶质瘤患者 | 临床试验 | 高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 一期临床试验纳入的患者(具体数量未在摘要中给出) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 348 | 2026-07-02 |
Multiomics Analysis Reveals Stromal Cell State Changes and INHBA-Associated Remodeling in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324799
PMID:42059080
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示钙化性主动脉瓣疾病中基质细胞状态变化及INHBA相关的重塑机制 | 首次整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统描绘了胎儿、健康成人和CAVD瓣膜中基质细胞(VIC和VDSC)的阶段性变化,并发现VDSC1亚群在CAVD中显著富集,同时鉴定出INHBA在VIC成骨重塑中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 阐明钙化性主动脉瓣疾病中细胞和分子机制,特别是基质细胞状态变化及INHBA的作用 | 人胎儿、健康成人和CAVD患者的主动脉瓣膜组织,以及体外培养的瓣膜间质细胞(VICs) | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | 包含胎儿、健康成人和CAVD瓣膜样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 349 | 2026-07-02 |
PRECISE: A Prognostic Thyrocyte-Derived Gene Signature for Papillary Thyroid Carcinoma
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4488
PMID:42008746
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序开发了一种甲状腺细胞来源的基因特征PRECISE,用于甲状腺乳头状癌的预后评估 | 首次结合单细胞和单核RNA测序数据,开发出甲状腺上皮细胞特异性基因签名,并验证其独立于TNM分期的预后价值 | 未提及具体局限性 | 开发甲状腺乳头状癌的预后生物标志物和风险分层方法 | 甲状腺乳头状癌患者 | 机器学习 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发现队列109例(含11个肿瘤和4个正常甲状腺样本的snRNA-seq),验证队列65例和370例 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 350 | 2026-07-02 |
Therapeutic effect of intranasal nicotinamide adenine dinucleotide in the restoration of olfactory dysfunction
2026-Jul-01, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01761-9
PMID:42380286
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研究论文 | 探索鼻内烟酰胺腺嘌呤二核苷酸给药在恢复嗅觉功能障碍中的治疗效果 | 首次证明鼻内NAD给药可促进嗅觉感觉神经元再生并恢复嗅觉功能,结合单细胞RNA-seq数据识别了六种神经元标志基因 | 研究仅基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化需进一步验证 | 评估鼻内NAD给药在恢复嗅觉功能障碍中的疗效 | 人嗅觉干细胞和锌诱导的嗅觉缺失小鼠模型 | 机器学习 | 嗅觉功能障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 原位杂交 | NA | 转录组数据 | 人嗅觉干细胞培养样本和小鼠模型样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 351 | 2026-07-02 |
Ablation of the renal tubular gluconeogenic enzyme PCK1 drives AKI-to-CKD transition by negatively regulating the TGF-β/Smad3 signaling pathway
2026-Jul-01, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06310-1
PMID:42380498
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研究论文 | 揭示肾小管糖异生关键酶PCK1通过负调控TGF-β/Smad3信号通路驱动急性肾损伤向慢性肾病转变的机制 | 首次阐明PCK1作为Smad3内源性负调控因子,其缺失释放对Smad3磷酸化和核转位的抑制,导致肾小管上皮特性丧失和纤维化进程 | NA | 探究PCK1在急性肾损伤向慢性肾病转变中的作用及其分子机制 | 急性肾损伤患者及肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 352 | 2026-07-02 |
A hypoxia-responsive migrasome-related lncRNA signature predicts prognosis and suggests the MSC-AS1/ITGA5 axis as a potential therapeutic target in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jul-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01956-3
PMID:42380675
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研究论文 | 构建了一个低氧响应的迁移体相关长链非编码RNA特征,用于预测头颈鳞状细胞癌预后,并发现MSC-AS1/ITGA5轴作为潜在治疗靶点 | 首次系统性地分析了迁移体相关lncRNA在HNSCC中的临床意义与调控机制,构建了一个10个MRL的预后模型,并揭示了低氧响应的MSC-AS1/ITGA5轴与迁移体相关分子特征的潜在关联 | 研究主要基于TCGA数据库的分析结果,MSC-AS1/ITGA5轴与迁移体相关分子特征的关联尚需直接实验验证 | 探索迁移体相关长链非编码RNA在头颈鳞状细胞癌中的预后意义及其调控机制 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA数据库中的HNSCC样本(具体数量未给出) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2026-07-01 |
Blood Transcriptome Analysis Reveals CTSB and ATP6V0D1 Expression in Circulating Monocytes as Potential Biomarkers of Sepsis
2026-Jul-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002693
PMID:40961380
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研究论文 | 通过全血转录组分析发现循环单核细胞中CTSB和ATP6V0D1的表达可作为脓毒症的潜在生物标志物 | 首次在循环单核细胞中发现CTSB和ATP6V0D1作为脓毒症的潜在生物标志物,并通过外部验证队列证实其与28天死亡率显著相关 | 样本量较小(20例脓毒症患者和12例健康个体),可能限制结果的普适性和统计效力 | 识别外周血单核细胞中的转录组变化作为脓毒症的潜在生物标志物 | 脓毒症患者和健康个体 | 机器学习 | 脓毒症 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序,免疫细胞荧光测定 | 加权基因共表达网络分析,蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 转录组数据 | 20例脓毒症患者和12例健康个体(内部队列);479例(外部验证队列) | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2026-06-30 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Jul, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
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研究论文 | 本文探讨了脂肪连蛋白-PEPITEM通路在早期未经治疗的类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态,以及PEPITEM给药在临床前模型中的治疗疗效 | 首次揭示了PEPITEM在免疫介导的炎性关节炎中通过调节滑膜微环境限制疾病进展的机制,并证明了PEPITEM治疗可显著降低关节炎严重程度和促炎介质表达 | 主要基于动物模型和早期患者样本,未涉及大规模临床试验验证;PEPITEM在更多免疫介导炎性疾病中的适用性尚需进一步探索 | 研究脂肪连蛋白-PEPITEM通路在免疫介导的炎性关节炎中的作用及PEPITEM的治疗潜力 | 早期类风湿关节炎和银屑病关节炎患者外周血单个核细胞,以及三种不同炎性关节炎动物模型(小鼠)的滑膜组织 | 机器学习 | 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 早期类风湿关节炎和银屑病关节炎患者外周血样本,以及三种小鼠炎性关节炎模型(具体数量未在摘要中明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台(用于小鼠滑膜组织的单细胞分析) |
| 355 | 2026-06-30 |
Distinct transcription factors control tissue adaptation and effector function in infant and adult memory T cells
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02535-1
PMID:42230957
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9技术揭示婴儿与成人记忆T细胞功能差异的分子机制 | 首次发现HELIOS和KLF6转录因子分别调控婴儿和成人记忆T细胞状态,并确定HELIOS为婴儿特异性转录程序的关键调节因子 | 未明确说明 | 探究人类记忆T细胞功能调控的年龄依赖性机制 | 婴儿(2-9个月)和成人(40-63岁)器官捐赠者的淋巴组织和粘膜组织中的T细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、ATAC测序、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 婴儿和成人器官捐赠者(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 356 | 2026-06-30 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描,研究人类手指关节在胎儿发育过程中的细胞组成、空间组织和结构,揭示近端指间关节易患炎症性关节炎而远端指间关节不受影响的细胞基础 | 首次在胚胎发育层面揭示了近端指间关节和远端指间关节在滑膜体积和成纤维细胞富集方面的差异,并发现PI16 '通用'成纤维细胞在炎症易感性中的关键作用 | NA | 探究炎症为何倾向于发生在特定部位(如手指近端指间关节)的细胞机制 | 人类胎儿手指关节 | NA | 关节炎 | 单细胞RNA测序、成像、X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2026-06-30 |
Functional and dysfunctional T regulatory cell states in human tissues in RA and other autoimmune arthritic diseases
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02540-4
PMID:42304100
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析类风湿关节炎及其他自身免疫性关节炎患者滑膜组织中的调节性T细胞,发现两种主要状态:功能性CD25+CXCR6+ T细胞和功能障碍性CD25+AREG+ T细胞 | 首次在滑膜组织中鉴定出两种不同的调节性T细胞状态,并阐明皮质醇和膜结合TNF分别驱动功能障碍和功能维持的分子机制,提示逆转T细胞功能障碍的治疗策略 | 未提及具体样本数量及多中心验证,也未探讨其他组织类型中的T细胞状态差异 | 探究类风湿关节炎及其他自身免疫性关节炎患者组织中调节性T细胞的功能和功能障碍状态及其调控机制 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的调节性T细胞 | 自然语言处理 | 类风湿关节炎, 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 类风湿关节炎患者滑膜组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2026-06-30 |
An inflammasome-driven differentiation program in intestinal stem cells protects against Salmonella infection
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02514-6
PMID:42120792
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研究论文 | 本研究揭示了肠道干细胞通过炎症小体介导的分化程序响应沙门氏菌感染并增强上皮防御能力的免疫机制 | 首次发现Lgr5干细胞具有直接感知细胞内沙门氏菌并通过ASC依赖的炎症小体信号启动向潘氏细胞分化的内在免疫机制,展示了干细胞可塑性作为先天免疫前沿策略 | 沙门氏菌特异性反应机制是否适用于其他肠道病原体尚不清楚 | 阐明肠道干细胞在抵御肠道病原体感染中的主动免疫调控作用 | 小鼠和人类的肠道Lgr5干细胞、沙门氏菌感染模型、克罗恩病患者组织样本 | 数字病理学 | 感染性疾病, 克罗恩病 | 单细胞转录组测序、荧光标记追踪、类器官培养、遗传扰动 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | 小鼠和人类肠道类器官样本,克罗恩病患者干细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于scRNA-seq分析 |
| 359 | 2026-06-26 |
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.013
PMID:41338334
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿之间独特的肿瘤微环境差异 | 首次通过空间转录组学比较滤泡性蕈样肉芽肿(FMF)与经典型蕈样肉芽肿(MF)在肿瘤微环境中的差异,发现FMF中肿瘤CD4 T细胞具有高炎症表型、更好的细胞饥饿适应能力和增强的抗原呈递 | 样本量有限,且仅分析了毛囊周围和真皮区域,未涉及其他潜在相关微环境区域 | 揭示滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿肿瘤微环境的差异及其临床侵袭性机制 | 蕈样肉芽肿患者皮肤组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 患者样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 360 | 2026-06-26 |
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.021
PMID:41407191
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研究论文 | 通过流式分选和全转录组测序,深入解析毛囊干细胞微环境中的分子特征及信号相互作用 | 利用56个全转录组测量进行跨比较,以前所未有的灵敏度分类细胞类型特异性分子特征,并与过去20年间15项研究联合分析,发现了许多之前未描述的毛乳头、隆突干细胞和毛胚干细胞基因 | 低检测灵敏度限制了基因表达的发现深度 | 深入理解毛囊干细胞及其指导性微环境的独特基因表达程序 | 小鼠背侧皮肤中的毛乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮和毛囊上皮细胞以及真皮成纤维细胞 | 机器学习 | NA | 全转录组测序,流式分选 | NA | 转录组数据 | 4个小鼠背侧皮肤区域的各细胞群体,共56个全转录组测量 | NA | 全转录组测序 | NA | NA |