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当前共找到 814 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-08-03
Systems-Level Mapping of the Tumor Microenvironment Reveals Immune-Mediated Mechanisms and Potential Targets in Platinum-Resistant Ovarian Cancer
2026-Jul-22, Research square
研究论文 通过多模态系统生物学方法绘制卵巢癌肿瘤微环境图谱,揭示铂耐药相关的免疫介导机制和潜在靶点 整合多重免疫组化、 bulk 和单细胞 RNA 测序的多模态系统生物学方法,并使用 COMET 工具识别出两种独特的耐药程序 摘要中未明确提及局限性 研究卵巢癌微环境,识别驱动治疗耐药的细胞群体和标志物 良性(n=6-13)和癌症(n=7-20)卵巢组织样本 数字病理学 卵巢癌 多重免疫组化、bulk RNA-seq、单细胞 RNA-seq、CIBERSORTx、singleR、COMET、拟时序分析 NA 图像、基因表达数据 良性样本 6-13 例,癌症样本 7-20 例 NA 多重免疫组化、bulk RNA-seq、单细胞 RNA-seq NA NA
282 2026-08-03
Bacterial surface display enables lysis-independent joint host-pathogen single-cell profiling
2026-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍一种基于细菌表面展示的裂解非依赖性策略,实现对宿主和病原体单细胞特征的联合分析 利用细菌表面展示系统,将启动子活性和细菌身份编码为抗体可检测信号,无需病原体特异性裂解优化或预分选,即可与现有基于抗体的单细胞检测方法兼容 摘要未提及明确的局限性 开发一种可扩展的、联合宿主-病原体单细胞测量方法,以揭示宿主-病原体相互作用的异质性 受感染的巨噬细胞、多种细菌种类(包括李斯特菌和沙门氏菌) 单细胞测序 感染性疾病 表面展示、流式细胞术、液滴微流控单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 受感染的巨噬细胞样本 NA 单细胞RNA测序(液滴) NA NA
283 2026-08-03
Deep interpretable learning of sample representations for characterizing disease states in single-cell transcriptomics
2026-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍Phenoverse,一个可解释的深度学习框架,用于从单细胞转录组数据中学习样本级别的疾病状态表征,并在多个疾病数据集中验证其性能 通过细胞类型感知的残差编码、原型学习和基于Perceiver的聚合,实现样本级别的疾病状态表征学习,仅使用二元表型标签即可预测疾病状态并编码连续的疾病严重程度谱 未提及明显的局限性 开发一种可解释的疾病表型分析方法,将复杂的单细胞转录组数据转化为患者层面的生物学见解 单细胞转录组数据中的样本表征,用于疾病状态预测和严重程度评估 机器学习 COVID-19, 阿尔茨海默病, 系统性红斑狼疮 单细胞转录组测序 深度学习模型,包括残差编码、原型学习和Perceiver架构 单细胞转录组数据 超过500万个细胞 NA 单细胞转录组测序 NA NA
284 2026-08-03
Lineage-specific change in craniofacial gene regulatory networks of syngnathid fishes revealed by integrating multiomics across fishes
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过多组学比较研究,探讨海龙科鱼类颅面基因调控网络的谱系特异性变化 首次整合单细胞RNA测序、ATAC-seq和全基因组比对,揭示海龙科鱼类颅面进化的局部网络变化而非全局重连 未提供明确局限性信息 研究海龙科鱼类颅面形态多样性的基因调控网络进化机制 湾海龙、三刺鱼和斑马鱼的头神经嵴细胞 基因组学 NA 单细胞RNA测序、ATAC-seq、全基因组比对 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、基因组序列 三种鱼类(湾海龙、三刺鱼、斑马鱼)的头神经嵴细胞样本 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq NA NA
285 2026-08-03
Human Myometrial Cell Fate under Chronic Oxidative Stress for Leiomyomagenesis
2026-Jul-20, Research square
研究论文 本研究探讨慢性氧化应激对人子宫肌层细胞命运的影响及其在子宫肌瘤发生中的因果作用 首次利用MnSOD突变体构建持续氧化应激的人子宫肌层细胞模型,并结合空间转录组学和突变分析,从分子和基因组层面揭示氧化应激驱动子宫肌瘤起始的机制 研究主要基于细胞系和异种移植模型,可能不能完全代表体内复杂微环境;且未涉及患者来源样本的直接验证 验证慢性氧化应激诱导人子宫肌层细胞发生细胞重塑和基因组改变,从而促进子宫肌瘤发生的假说 人子宫肌层细胞系(Myo-hTERT)及原代子宫肌层细胞 数字病理学 子宫肌瘤 空间转录组学、突变分析、细胞培养、异种移植 NA 转录组数据、突变数据、细胞图像 涉及多种细胞系和原代细胞,异种移植研究持续至10个月,具体样本数未详述 NA 空间转录组学 NA NA
286 2026-08-03
scWeave: A deep learning model that bidirectionally translates between gene expression and chromatin structure at single-cell resolution
2026-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一个名为scWeave的深度学习模型,能够在单细胞分辨率下双向转换基因表达和三维染色质结构数据 首次实现在单细胞水平上双向转换基因表达和染色质结构,采用双自编码器架构提取独立的细胞级潜在表示,并通过专用翻译模块学习转换,优于现有方法 未提及明确局限性,但可能受限于共测定数据集的可用性和模型对特定细胞类型的泛化能力 建立基因表达与三维染色质结构之间的关系,实现从单一模态推断另一模态,以扩展昂贵共测定实验的应用 小鼠胚胎发育、小鼠皮层、小鼠嗅觉上皮和人类骨髓细胞 机器学习 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞Hi-C(scHi-C) 双自编码器(dual autoencoders) 基因表达数据和染色质构象数据 六个公开共测定数据集,包括小鼠和人类细胞,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序、单细胞Hi-C NA NA
287 2026-08-03
Targeting cellular senescence alleviates bone marrow aging
2026-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了通过PROTAC化合物753b清除衰老细胞以缓解骨髓衰老的机制 首次使用PROTAC化合物753b同时靶向BCL-xL和BCL-2清除衰老细胞,并证明其能逆转造血衰老的关键特征 摘要未提及研究的局限性 探究通过药理性清除衰老细胞来缓解骨髓衰老并恢复造血功能的策略 骨髓中的造血干细胞、衰老细胞及骨髓微环境(包括基质细胞和中性粒细胞祖细胞) 机器学习和数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠骨髓样本(具体数量未给出) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
288 2026-08-03
Single-cell multi-omic analyses resolve the cellular diversity of ALK/ROS1/MET/NTRK-fused gliomas in infants and older children
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞多组学分析,解析了婴儿和年长儿童中ALK/ROS1/MET/NTRK融合胶质瘤的细胞多样性 首次使用单细胞和单核RNA/ATAC-seq及空间转录组学,全面解析了融合阳性胶质瘤的细胞层次结构,发现了五种癌细胞状态,并揭示了FOS/JUN驱动的致癌程序和高的细胞可塑性 文章未明确提及局限性 解析婴儿型半球胶质瘤及其他RTK融合胶质瘤的细胞多样性和发育程序,为研究和治疗创新开辟新途径 24例融合阳性胶质瘤样本,涵盖婴儿至青少年 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 染色质开放性数据, 空间转录组数据 24例融合阳性胶质瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Chromium Single Cell ATAC, 10x Visium
289 2026-08-03
Enhanced BCMA Antigen Density Increases Trogocytosis and Attenuates CAR T cell Function
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了γ-分泌酶抑制剂提高BCMA抗原密度对CAR T细胞功能的影响,发现其增强细胞毒性但促进吞噬作用,导致CAR T细胞功能受损和耗竭 首次揭示了GSI驱动的BCMA抗原密度增加对CAR T细胞吞噬作用和功能的影响,通过多组学方法深入分析吞噬阳性CAR T细胞的表型和功能特征,并利用临床I期试验样本进行验证 研究主要基于体外共培养系统和临床样本,可能无法完全反映体内复杂环境;样本量有限,可能影响统计效力 探究γ-分泌酶抑制剂提高BCMA密度对CAR T细胞吞噬作用、功能和治疗结果的影响,以优化多发性骨髓瘤的CAR T细胞治疗策略 多发性骨髓瘤细胞系、CAR T细胞、来自两个临床I期试验的患者样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、蛋白质组学分析、流式细胞术、共聚焦显微镜、细胞毒性实验 CAR T细胞模型 图像、文本、测序数据 使用多种骨髓瘤细胞系和CAR T细胞,以及来自两个临床I期试验的患者样本,具体数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
290 2026-08-03
Reference Regulatory Element-Guided Gene Expression Analysis for Mechanistic Inference of Gene Regulatory Networks
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出REGA框架,利用参考调控元件目录从基因表达数据中推断转录因子-调控元件-基因程序,实现可扩展且可解释的基因调控网络分析 创新性地利用参考调控元件目录指导基因表达分析,无需额外多组学数据即可推断机制性基因调控网络,并在多个基准测试中优于现有方法 依赖参考调控元件目录的质量和覆盖度,可能限制在非模式生物或特定组织中的应用 弥合调控基因组学中深度与广度的差距,实现从大规模表达数据中进行机制性基因调控网络推断 基因表达数据,包括bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq及空间转录组数据 生物信息学、机器学习 神经精神疾病(如PsychENCODE相关) 基因表达分析、ChIP-seq、Hi-C、eQTL、snRNA-seq、空间转录组、Perturb-seq NA 基因表达数据(bulk、单细胞、空间) NA NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组 NA NA
291 2026-08-02
Integrative analysis of methylation-driven genes and macrophage subtypes defines prognostic biomarkers in clear-cell renal cell carcinoma
2026-Jul-31, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3
研究论文 整合分析甲基化驱动基因和巨噬细胞亚型,为透明细胞肾细胞癌定义预后生物标志物 首次整合单细胞RNA测序、批量转录组和甲基化数据,识别六种巨噬细胞亚型和三种DNA甲基化相关预后亚型,并发现一个三基因签名(HLA-DRA、HCST、RNASE2)在外部队列中表现出稳健的预后性能 基于公开数据集的分析,可能缺乏临床样本的多样性;qRT-PCR验证可能未涵盖所有患者亚群 研究DNA甲基化在调节巨噬细胞异质性中的作用,并确定ccRCC的预后生物标志物和治疗靶点 透明细胞肾细胞癌的巨噬细胞亚型和DNA甲基化相关基因 生物信息学 肾细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA-seq、甲基化测序、qRT-PCR、分子对接 NA 基因表达数据、甲基化数据 基于公开数据集和外部队列验证 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq, 甲基化测序 NA NA
292 2026-08-02
Single-cell and spatial transcriptomic insights into fibrotic mechanisms and therapeutic opportunities
2026-Jul-31, Drug discovery today IF:6.5Q1
综述 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示纤维化由多细胞生态位驱动,提出ECM相关间充质细胞连续体作为跨器官的纤维化机制框架,并评估了针对致病细胞状态的治疗策略 提出了ECM相关间充质细胞连续体概念,将基质祖细胞、周细胞、成纤维细胞和肌成纤维细胞跨器官联系起来,区分保守致病状态与组织特异性适应,并整合多模态数据用于患者分型和靶点优先排序 未提及具体局限性 利用单细胞和空间转录组学阐明纤维化机制,并探索针对致病细胞状态的治疗机会 纤维化相关的多细胞生态位、ECM相关间充质细胞连续体、上皮损伤、免疫-基质串扰及基质力学 数字病理学 纤维化疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
293 2026-08-02
Early versus delayed dupilumab differentially restores IL-13-induced airway barrier dysfunction
2026-Jul-31, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了早期与延迟使用度普利尤单抗对IL-13诱导的气道屏障功能障碍恢复的差异,并通过单细胞RNA测序揭示了相关机制 首次通过单细胞RNA测序结合RNA速率和基因集富集分析,揭示度普利尤单抗治疗时机对气道上皮细胞状态和屏障恢复的差异性影响 未提及具体局限性 阐明IL-4/IL-13阻断恢复气道屏障功能的机制,以及治疗时机对上皮细胞状态的影响 原代人支气管上皮细胞 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA测序 RNA速率分析, 基因集富集分析 基因表达数据 原代人支气管上皮细胞培养样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
294 2026-08-02
A transferable gut microbiota-bile acid pathway programs nanomedicine pharmacokinetics and therapeutic response
2026-Jul-31, Nature materials IF:37.2Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物群通过胆汁酸相关信号调节库普弗细胞吞噬状态,进而影响纳米药物的体内分布和抗肿瘤疗效 首次将肠道微生物群-胆汁酸-库普弗细胞通路与纳米药物的药代动力学和治疗反应联系起来,并展示了该通路可通过粪菌移植进行传递 摘要未提及局限性 探究肠道微生物群对纳米药物肝脏清除的调控机制及其对肿瘤蓄积和治疗效果的影响 小鼠模型(包括无菌小鼠)中的库普弗细胞、肠道微生物群、纳米药物制剂和肿瘤模型 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序、代谢组学分析、粪菌移植、微生物扰动 NA 单细胞转录组数据、代谢组数据、微生物组数据 摘要未明确样本量,涉及多种小鼠模型和多种纳米药物制剂 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
295 2026-08-02
From psoriatic plaque to synovium: decoding the skin-joint axis in psoriatic arthritis
2026-Jul-31, Nature reviews. Rheumatology
研究论文 本文综述了银屑病关节炎中皮肤与关节之间的功能联系,探讨了皮肤来源的免疫细胞如何迁移至滑膜并促进关节炎发展的机制 整合单细胞RNA测序、成像质谱流式细胞术和线粒体DNA谱系追踪数据,首次直接证明皮肤源性髓系前体细胞可填充早期银屑病关节炎患者的滑膜组织,并提出皮肤-关节轴的功能模型 未提供实验验证或具体数据集,主要基于现有证据的综述性分析 阐明银屑病关节炎从皮肤限制性疾病进展至肌肉骨骼疾病的机制,并为生物标志物发现、风险分层和疾病干预提供理论依据 银屑病关节炎患者中的皮肤斑块、滑膜组织、皮肤源性髓系前体细胞、T细胞 数字病理学 银屑病关节炎 单细胞RNA测序、成像质谱流式细胞术、线粒体DNA谱系追踪、T细胞受体分析 NA 基因表达数据、细胞影像数据、DNA序列数据 未明确说明,涉及早期银屑病关节炎患者 NA 单细胞RNA测序、成像质谱流式细胞术 NA NA
296 2026-08-02
Continual integration of single-cell multimodal data with MIRACLE
2026-Jul-31, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 介绍MIRACLE,一种基于持续学习的单细胞多模态数据整合框架,能够高效整合新数据并保持生物学保真度 提出动态架构适应和数据重放的持续学习框架,实现流式整合多模态单细胞数据,避免传统全量重整合的计算开销 未提及具体局限性,但可能面临数据重放内存占用和跨批次批次效应校正的挑战 开发高效的可扩展单细胞多模态数据整合工具,支持生物知识图谱的持续更新和探索 单细胞多模态数据集,包括跨模态、跨组织、跨疾病的数据 机器学习 呼吸系统感染性疾病(如COVID-19、甲型流感、肺结核) 单细胞多模态测序数据整合 持续学习框架(动态架构适应和数据重放) 单细胞多模态数据 评估涉及多个数据集,具体样本数未在摘要中说明 NA 单细胞多组学 NA NA
297 2026-08-02
LGMN regulates endothelial-to-mesenchymal transition via the p38 MAPK pathway to promote pulmonary fibrosis
2026-Jul-30, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨LGMN通过p38 MAPK通路调节内皮-间充质转化以促进肺纤维化的机制 首次揭示LGMN通过p38 MAPK途径调控EndMT在肺纤维化中的作用,并基于单细胞转录组数据识别内皮细胞为LGMN升高主要来源 摘要未提供具体局限性信息 探究LGMN是否通过调节EndMT过程影响肺纤维化 人类IPF及小鼠纤维化模型中的内皮细胞 分子生物学 肺纤维化 转录组分析、单细胞RNA测序、基因敲低和过表达实验 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
298 2026-08-02
Microbial single-cell sequencing technologies: Principles, applications, and spatial integration
2026-Jul-30, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 系统综述了微生物单细胞测序技术的原理、应用及空间整合,并探讨了微生物空间组学的新兴领域 首次系统整合微生物单细胞测序技术原理及其在空间组学中的前沿应用,强调先进成像技术与测序和荧光原位杂交的结合 仅基于综述内容,未提供实证数据或定量分析,可能无法全面涵盖所有最新技术进展 全面概述微生物单细胞测序技术的原理、应用及空间整合,以促进对微生物生态系统的理解 微生物单细胞测序技术及其在微生物生态系统中的应用 基因组学 NA 单细胞测序、空间组学、荧光原位杂交 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
299 2026-08-02
Protocol for the enrichment of endosteal and periosteal mesenchymal cells from murine bone for single-cell transcriptome analysis
2026-Jul-30, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 提出一种优化的鼠骨单细胞RNA测序工作流程,用于富集骨内膜和骨膜间充质细胞,并进行单细胞转录组分析 采用Liberase™消化、EDTA脱钙和连续去除造血及内皮细胞的方法,提高了单细胞分离的产量和活力,并提供了Seurat数据处理流程 未提及具体局限性 优化小鼠骨组织中骨内膜和骨膜间充质细胞的单细胞分离和转录组分析方法 小鼠骨组织中的骨内膜和骨膜间充质细胞 机器学习和数字病理学 NA 单细胞RNA测序 Seurat 单细胞转录组数据 小鼠骨组织样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
300 2026-08-02
IL-27 shapes NK cell heterogeneity and function in colorectal cancer
2026-Jul-29, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和功能实验,揭示了IL-27在结直肠癌中调节NK细胞异质性、成熟和功能的作用,并评估了其作为治疗靶点的潜力。 首次在结直肠癌中系统阐明IL-27通过维持未成熟NK细胞亚群和促进其浸润及活化来调节肿瘤免疫监视,并利用患者来源的类器官验证了其临床相关性。 研究主要基于小鼠模型,可能不完全反映人类CRC的复杂性;IL-27阻断的长期效应和潜在副作用未深入探讨;样本量和临床验证有限。 探讨IL-27在结直肠癌中对NK细胞分化和功能的调控机制,并评估其作为免疫治疗靶点的可能性。 结直肠癌肿瘤浸润的NK细胞亚群,包括未成熟和成熟亚型,以及肿瘤微环境中的免疫细胞。 癌症免疫学 结直肠癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、功能实验、体外共培养、患者来源类器官模型 小鼠肿瘤类器官移植模型(AKPS) 单细胞转录组数据、组织图像、流式细胞数据 小鼠模型及人类CRC单细胞数据集(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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