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当前共找到 467 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-07-08
Urinary volatile organic compound metabolites and depressive symptoms among U.S. adults with cardiovascular-kidney-metabolic syndrome stages 0-3: NHANES-based associations and in silico multi-omics insights
2026-Jul-04, Neurotoxicology IF:3.4Q2
研究论文 基于NHANES数据库和美国心血管-肾脏-代谢综合征0-3期成人数据,分析尿液中挥发性有机化合物代谢物与抑郁症状的关联,并结合计算机多组学分析揭示潜在机制 首次在CKM综合征0-3期成人中系统评估16种VOC代谢物与抑郁症状的关联,并结合网络毒理学和单细胞RNA测序揭示PI3K/AKT相关神经免疫通路的潜在作用 NHANES为横断面研究,无法建立因果关系;VOC代谢物单次测量可能存在分类错误;未考虑CKM综合征不同亚组间的潜在差异 探究尿液挥发性有机化合物代谢物与美国CKM综合征0-3期成人抑郁症状的关联及潜在机制 美国NHANES 2011-2018数据库中CKM综合征0-3期成人 机器学习 心血管疾病 NHANES数据关联分析, 网络毒理学, 单细胞RNA测序, 分子对接 NA 文本 基于NHANES 2011-2018数据库的CKM综合征0-3期成人样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
242 2026-07-08
Pregnancy-induced tissue-resident memory-like T cells contribute to tumor control in breast cancer
2026-Jul-03, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文揭示了妊娠诱导的乳腺组织驻留记忆样T细胞对乳腺癌具有保护作用 首次发现妊娠诱导的T样细胞在乳腺组织中富集,并通过IL-15和TGFβ信号通路调控,且这些细胞具有效应功能并能控制肿瘤生长 未明确T样细胞在人体中的长期持久性及具体分子机制 探究妊娠降低乳腺癌风险的潜在免疫机制 经产与未产妇及小鼠的乳腺组织和T细胞 免疫学 乳腺癌 单细胞转录组学、谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 人乳腺组织样本、小鼠模型(具体数量未详述) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组分析
243 2026-07-08
scGenoByte: a GenoByte embedding transformer with biological priors for cell type annotation
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出scGenoByte框架,利用生物先验知识进行全基因建模以实现细胞类型注释 创新性地设计了GenoBytes生物一致单元,利用蛋白质-蛋白质相互作用网络和基因旁系同源网络实现全转录组高效建模,并通过整合蛋白质表示和通路活性预测任务增强细胞表征学习 未提及局限性 开发一种基于生物先验的全基因嵌入Transformer模型用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 机器学习 不适用 单细胞RNA测序 Transformer 基因表达数据 8个数据集 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
244 2026-07-08
scImmuneCo: a compendium of cell-type-specific functional modules for decoding immune responses from single-cell RNA-seq data
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了一个名为scImmuneCo的免疫细胞特异性共表达模块资源,用于从单细胞RNA-seq数据中解码免疫反应 通过修改的图框架从170万个细胞中构建了873个稳健模块,覆盖7种主要免疫细胞类型,提供了细胞类型特异性的功能推断网络,并能揭示传统通路工具无法捕捉的细胞特异性调控程序 未提供具体局限性信息 开发高分辨率、数据驱动的功能推断资源,以细胞分辨率解析免疫机制并识别疾病相关的转录程序 来自17种免疫学条件的170万个免疫细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图框架 基因表达数据 170万个细胞,来自17种免疫学条件 NA 单细胞RNA-seq NA NA
245 2026-07-08
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
研究论文 提出TranscriptFormer,一个跨1.53亿年进化史的生成式细胞图谱基础模型,在细胞类型分类和疾病状态识别上达先进水平 首次训练包含12个物种、1.12亿细胞的生成式基础模型,实现跨超过6.85亿年进化距离物种的零样本疾病状态识别,无需训练即可自然涌现发育轨迹和系统发育关系 未说明 开发通用单细胞分析框架,揭示跨物种细胞组织的普适原则 12个物种的细胞,涵盖1.53亿年进化史 机器学习 未指定 单细胞转录组测序 生成式基础模型(Transformer变体) 单细胞基因表达数据 1.12亿个细胞 未指定 单细胞RNA测序 未指定 未指定
246 2026-07-08
Patterning human kidney organoids with synthetic Wnt-secreting organizers
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
研究论文 通过合成Wnt分泌组织者实现人类肾脏类器官的模式化 首次通过引入工程化的Wnt分泌细胞组织者,在体外重建了肾脏发育中的信号几何结构,从而实现对肾脏类器官空间模式的控制 未提及具体限制 研究肾脏发育中组织信号几何结构的作用,并探索在体外重建该结构以控制组织模式化的可能性 人类肾脏类器官及工程化Wnt分泌细胞组织者 数字病理学 肾脏疾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
247 2026-07-08
The dual role of the microbiome in sepsis: A complex interplay between pathogenicity and protection
2026-Jul-02, Physics of life reviews IF:13.7Q1
综述 探讨微生物组在脓毒症中的双重作用,强调其既参与致病机制又具有保护潜力 提出超越传统抗感染治疗,以微生物组为中心的免疫-微生物稳态修复新范式 未明确讨论现有微生物组调控策略的具体临床转化障碍 总结微生物组在脓毒症发病和免疫调节中的双重作用,并展望基于微生物组调控的治疗策略 脓毒症患者中微生物组与宿主免疫系统的相互作用 机器学习 脓毒症 单细胞组学,空间转录组学,代谢组学 NA 综述文章,不涉及具体数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
248 2026-07-08
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Jul-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 通过人源化小鼠模型探索胶质母细胞瘤的免疫环境,建立患者来源异种移植模型以模拟复发性人类GBM 首次利用表达关键人细胞因子的免疫缺陷小鼠构建人源化GBM模型,成功重现人类复发性GBM的免疫细胞特征,并增强肿瘤异质性 仅评估了两个免疫缺陷小鼠品系,可能未涵盖所有相关细胞因子表达模型;人源化程度及长期稳定性未详细讨论 建立能真实反映人类GBM免疫环境的小鼠模型,以促进新型疗法(特别是免疫疗法)的研究 胶质母细胞瘤(GBM)患者来源的放疗抵抗性异种移植物,以及人源化小鼠中重建的人类免疫细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据、图像数据 两种免疫缺陷小鼠模型,接受CD34+造血干祖细胞移植后植入放疗抵抗性PDX肿瘤 NA 单细胞RNA测序 NA NA
249 2026-07-08
Glyoxalase 1 promotes glioma progression by modulating Sox2 transcriptional networks in glioma stem-like cells
2026-Jul-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 通过单细胞转录组学等手段发现乙二醛酶1通过调节Sox2转录网络促进胶质瘤干细胞样细胞驱动的肿瘤进展 首次发现Glo1是胶质瘤干细胞样细胞的关键调控因子,并揭示其作为治疗靶点的潜力 未明确指出局限性 研究乙二醛酶1在胶质瘤干细胞样细胞和胶质母细胞瘤中的作用及治疗潜力 胶质瘤干细胞样细胞和胶质母细胞瘤 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞转录组学,功能性基因组学 NA 单细胞转录组数据 患者来源异种移植模型和宫内电穿孔模型的胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
250 2026-07-08
Optics-free spatial genomics for mapping mammalian brain aging by IRISeq
2026-Jul, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 介绍一种无光学器件的空间基因组学平台IRISeq,用于绘制哺乳动物大脑衰老图谱 提出无光学器件、基于索引测序的空间交互映射平台IRISeq,实现可调尺寸和分辨率的组织分析,兼具高通量和低成本优势 未明确提及,可能包括分辨率受限或样本处理复杂性 开发无光学器件的空间转录组学平台,揭示大脑衰老中淋巴细胞依赖的区域特异性机制 成年和老年小鼠脑部冠状切片,包括野生型和两种淋巴细胞缺陷模型(Rag1和Prkdc突变体) 机器学习和空间转录组学 老年性疾病 索引测序(Indexed Sequencing)、单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据 超过70个小鼠脑部冠状切片,生成超过46万个空间转录组图谱,整合783,264个单细胞转录组 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 IRISeq 无光学器件的空间交互映射平台,分辨率为5-50微米
251 2026-07-08
Single-cell multi-omic atlas and morphogen screening informs midbrain and hindbrain organoid engineering
2026-Jul, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 通过单细胞多组学图谱和形态发生素筛选,指导中脑和后脑类器官的工程化构建 首次结合单细胞转录组与可及染色质测序,系统解析中脑和后脑类器官的细胞组成及调控机制,并通过高通量形态发生素筛选扩展类器官模型 研究主要依赖体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境及长期发育过程 阐明中脑和后脑类器官的细胞类型及基因调控网络,优化类器官工程化策略 中脑和后脑类器官的细胞亚群及神经分化过程 数字病理学, 机器学习 神经系统疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 转录因子扰动, 形态发生素筛选 基因调控网络, 转录因子扰动模型 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
252 2026-07-08
Laser interstitial thermal therapy enhances bidirectional blood-brain barrier permeability in glioblastoma
2026-Jul-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 激光间质热疗增强胶质母细胞瘤血脑屏障双向通透性的机制研究 首次揭示LITT通过下调细胞连接通路和上调胞吞作用实现血脑屏障双向通透性变化,并证明其能促进循环肿瘤DNA释放 未提及具体局限性 探究激光间质热疗对胶质母细胞瘤血脑屏障通透性的机制及时空特征 小鼠模型及人胶质母细胞瘤组织 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电镜、数字液滴PCR NA 基因表达数据、图像数据 小鼠模型(具体数量未提及)及人胶质母细胞瘤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
253 2026-07-08
Single-Cell Transcriptomics and Development of Gametocyte-Specific Molecular Markers for Avian Malaria Parasites
2026-Jul, Molecular ecology resources IF:5.5Q1
研究论文 基于单细胞转录组学开发禽疟原虫配子体特异性分子标记,用于区分和定量雄性和雌性配子体 首次开发出能区分禽疟原虫无性期、雄性和雌性配子体的分子标记,并利用单细胞RNA测序和直系同源引导的阶段映射方法,实现灵敏的配子体定量和性别鉴定 研究受限于禽类宿主有核红细胞和缺乏体外培养系统,可能影响标记的进一步验证和应用 开发分子标记以定量和区分禽疟原虫的雄性和雌性配子体,改善对传播动态的理解 广泛分布的禽疟原虫(Plasmodium relictum)的两种细胞色素b谱系(pSGS1和pDELURB4) 单细胞转录组学 禽疟疾 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 涉及两种寄生虫细胞色素b谱系的多个样本 NA 单细胞RNA-seq NA 采用单细胞RNA测序和直系同源引导的阶段映射方法
254 2026-07-08
Revolutionary Tools for Decoding the Complexity of Forest Trees: The Application of Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Woody Plants
2026 Jul-Aug, Physiologia plantarum IF:5.4Q1
综述 系统阐述了单细胞RNA测序和空间转录组学在木本植物研究中的发展历程、技术流程、整合方式及前沿应用 首次系统总结了scRNA-seq和ST在木本植物维管形成层分化、非生物胁迫响应及稀有细胞类型鉴定等方面的突破性应用 讨论了将这些技术应用于森林树木研究时面临的挑战,如组织解离困难、细胞标记物缺乏和数据分析复杂性 揭示单细胞和空间转录组学在解读木本植物复杂生物学中的潜力,为相关领域研究和应用提供新视角 木本植物(森林树木) 其他 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据、空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
255 2026-07-06
High-salt diet in macrophage-associated metabolic disorders: Mechanisms and therapeutic implications
2026-Jul-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
综述 综述高盐饮食通过调控巨噬细胞极化、代谢重编程和表观遗传印记促进慢性炎症和胰岛素抵抗的机制及其治疗意义 系统阐述了高盐饮食通过p38/MAPK、NF-κB和NLRP3信号通路驱动巨噬细胞向促炎性M1表型极化和糖酵解主导的代谢转变,并整合组蛋白修饰、DNA甲基化和非编码RNA等表观遗传机制形成持续代谢记忆的创新观点 当前研究主要基于动物模型和体外实验,缺乏大规模临床验证;未来需结合谱系追踪、单细胞测序和空间多组学技术进一步阐明HSD-巨噬细胞轴的精确机制 探讨高盐饮食在巨噬细胞相关代谢紊乱(如肥胖相关2型糖尿病)中的作用机制及其潜在治疗靶点 巨噬细胞及其在脂肪组织、肝脏、胰腺和肠道等代谢器官中的作用 NA 代谢性疾病 NA NA NA NA NA 单细胞测序 NA NA
256 2026-07-06
Single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal the dynamic transcript profiles of myocardial lymphangiogenesis post-myocardial infarction
2026-Jul-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学分析揭示心肌梗死后心肌淋巴管生成的动态转录谱 首次整合单细胞测序与空间转录组数据,系统性解析心肌梗死后心脏淋巴内皮细胞的异质性及其空间定位与生物学功能,并发现淋巴内皮细胞可能通过水通道蛋白1调节心肌水肿及通过Gal-9-CD44通路影响巨噬细胞浸润 仅基于小鼠模型,样本量有限,需进一步验证淋巴内皮细胞亚型在人体心脏中的存在及功能 探究心肌梗死后心脏淋巴内皮细胞的异质性及其在心肌水肿与炎症中的生物学功能 小鼠心脏组织中的淋巴内皮细胞 机器学习和生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 聚类分析、细胞轨迹分析、Cell-Chat分析 单细胞转录组数据、空间转录组数据 不同时间点(心肌梗死后)的小鼠心脏组织 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium
257 2026-07-06
PET imaging of atherosclerotic plaques using the stabilin-2-targeted tracer 18F-S2P in preclinical models
2026-Jul-04, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1
研究论文 本研究评估了靶向稳定素-2(STAB2)的18F标记示踪剂(18F-S2P)在临床前模型中进行PET成像以识别动脉粥样硬化斑块的可行性 首次开发并验证了一种新型STAB2靶向PET探针(18F-S2P),用于非侵入性成像动脉粥样硬化斑块中的炎症,该探针在斑块摄取上显著优于传统FDG和Pentixafor 未在标题和摘要中明确提及研究的局限性 评估使用STAB2靶向的18F标记示踪剂进行PET成像以识别动脉粥样硬化斑块的可行性 Ldlr-/-小鼠模型及人类动脉粥样硬化标本 计算机视觉 心血管疾病 PET成像,micro-PET/CT成像,单细胞RNA测序 NA 图像,基因表达数据 高脂饮食喂养的Ldlr-/-小鼠(3-12周)及正常饮食对照组,人类动脉粥样硬化标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
258 2026-07-06
Macrophage heterogeneity in breast cancer microenvironment and development of a prognostic model: exploring TFF1 as a novel therapeutic target
2026-Jul-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 探讨乳腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞异质性,并基于TFF1开发预后模型及新型治疗靶点 通过单细胞RNA测序鉴定巨噬细胞相关基因,结合机器学习算法构建预后模型,并首次将TFF1确定为乳腺癌潜在治疗靶点 数据来源仅限于公共数据库且样本量相对有限,预后模型的临床验证需进一步在更大规模队列中开展 揭示乳腺癌肿瘤微环境中的细胞异质性并识别新的治疗靶点,以实现个体化治疗 乳腺癌患者肿瘤微环境中的巨噬细胞及相关基因表达特征 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序,机器学习,ELISA,CCK-8,流式细胞术,Western blotting,免疫沉淀 XGBoost, LightGBM 基因表达数据,患者临床数据 基于TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
259 2026-07-06
Single-cell spatial landscape of aggrephagy activity stratifies hepatocellular carcinoma neutrophils and delivers a 5-gene diagnostic panel for patient stratification
2026-Jul-04, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学整合分析,揭示聚集体自噬活性在肝细胞癌中性粒细胞异质性中的作用,并开发了一个5基因诊断标志物组用于患者分层 首次在单细胞和空间水平上系统分析聚集体自噬活性对肝细胞癌中性粒细胞亚群异质性的影响,并构建了基于LIMK2的5基因诊断标志物组,具有AUC 0.83-0.91的稳健性能 未提供明确的局限性说明 探究聚集体自噬活性在肝细胞癌中性粒细胞异质性和肿瘤进展中的作用,并开发可用于患者分层的诊断标志物 肝细胞癌(LIHC)肿瘤组织中的中性粒细胞 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、NGS UCell评分、伪时间轨迹分析、细胞间通讯分析、代谢评分、机器学习特征选择 图像、文本 183,671个单细胞(含12,547个中性粒细胞)、空间转录组学数据、TCGA和GSE39791批量数据集 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
260 2026-07-06
Foxs1-mediated transformation of CD34+ fibroblast to myCAFs promotes tumor growth
2026-Jul-04, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 利用遗传谱系追踪、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,鉴定出Cd34Pi16成纤维细胞前体,并揭示了其向Acta2肌成纤维细胞的分化轨迹,由转录因子Foxs1驱动 首次通过实验验证了Cd34成纤维细胞向Acta2肌成纤维细胞的转化,并利用药物扰动数据库反向匹配筛选出抑制Foxs1上调的小分子候选药物,提出了靶向CAF谱系发育的抗肿瘤新策略 研究主要在黑色素瘤和胃癌中进行,其他肿瘤类型中的验证尚未涉及,且小分子候选药物的体内抗肿瘤效果需进一步验证 阐明癌症相关成纤维细胞的发育起源、分化轨迹及其治疗潜力 黑色素瘤和胃癌中的Cd34Pi16成纤维细胞前体及其分化产物 机器学习 黑色素瘤, 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 遗传谱系追踪 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium 单细胞测序平台和10x Visium 空间转录组平台
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