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当前共找到 814 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-08-14
Multi-omics profiling unveils biological and clinical insights into pulmonary sarcomatoid carcinoma
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过多组学分析揭示肺肉瘤样癌的生物学和临床见解 首次整合全外显子测序、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组及单细胞RNA测序数据,对肺肉瘤样癌进行全面的多组学特征描述,并发现铁死亡抑制特征及潜在治疗靶点 样本量较小,尤其是单细胞RNA测序仅来自3名患者,可能限制结果的普遍性 阐明肺肉瘤样癌的分子特征、免疫微环境及潜在治疗靶点 86名肺肉瘤样癌患者的肿瘤样本及3名接受新辅助化疗免疫治疗患者的单细胞样本 基因组学、蛋白质组学、单细胞测序 肺肉瘤样癌 全外显子测序、转录组测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 86名患者(多组学)和3名患者(单细胞RNA测序) NA 全外显子测序、转录组测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA NA
202 2026-08-13
Single-cell transcriptomic characterization of the tumor microenvironment in prostate cancer bone metastases
2026-Jul-31, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 利用单细胞RNA测序数据表征前列腺癌骨转移肿瘤微环境的细胞组成和分子特征。 首次对前列腺癌骨转移微环境进行详细的单细胞转录组表征,识别出多种细胞类型及其特异性基因特征和细胞间通讯网络。 仅使用公开数据库中的scRNA-seq数据,可能受样本来源和批次效应影响;缺乏功能验证实验。 全面表征前列腺癌骨转移微环境的细胞异质性和分子机制,以揭示疾病进展和治疗抵抗的驱动因素。 前列腺癌骨转移样本中的肿瘤微环境细胞,包括恶性上皮细胞、成纤维细胞、内皮细胞、成骨细胞、破骨细胞和免疫细胞。 单细胞转录组学 前列腺癌骨转移 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Seurat分析流程(包括聚类、拟时序等) 单细胞转录组数据 来自GEO数据库的前列腺癌骨转移样本(具体样本数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
203 2026-08-13
Protocol for automated optimization of feature selection and clustering parameters in single-cell RNA-seq using scAutoTune
2026-Jul-31, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一个使用scAutoTune工具对单细胞RNA测序数据进行特征选择和聚类参数自动优化的实验方案。 提出了一个自动优化单细胞RNA测序特征选择和聚类参数的协议,利用网格搜索和GAM平滑景观可视化,减少手动调参的繁琐和主观性。 未在摘要中提及具体局限性,可能包括对数据集的依赖性和计算资源需求。 提供一套详细的自动化参数优化流程,以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和可重复性。 单细胞RNA测序数据集,特别是公共数据集。 机器学习, 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 广义加性模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
204 2026-08-13
Deciphering lung cancer at high resolution: a narrative review of applications of single-cell and spatial transcriptomics sequencing
2026-Jul-31, Translational lung cancer research IF:4.0Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组测序在肺癌研究中的最新进展,探讨了这些技术如何提升对肿瘤生物学和治疗反应的理解。 该综述聚焦于单细胞和空间转录组测序在肺癌中的高分辨率应用,强调了转录可塑性、空间组织的肿瘤微环境生态位以及肿瘤-免疫-基质细胞动态相互作用的新视角。 许多提出的生物标志物和治疗靶点仍处于探索阶段,需要进一步的空间验证、功能实验和临床注释队列才能转化为常规精准医学。 总结单细胞RNA测序和空间转录组测序在肺癌中的应用,讨论这些技术如何改进对肿瘤生物学和治疗反应的理解。 肺癌患者肿瘤微环境中的细胞类型,包括免疫细胞、基质细胞、肿瘤细胞及其空间分布。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 NA NA
205 2026-08-13
An early invasive signature from the adenocarcinoma in situ-to-invasive adenocarcinoma single-cell trajectory stratifies stage I lung adenocarcinoma overall survival
2026-Jul-31, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
研究论文 通过单细胞伪时间轨迹分析识别早期侵袭性基因集(EIGS),并基于此构建风险评分,以改善I期肺腺癌的预后分层 基于单细胞RNA测序数据重建肺腺癌从原位癌到浸润癌的恶性上皮细胞伪时间轨迹,首次提出与侵袭相关的200基因EIGS,并结合Cox回归和岭惩罚构建预后风险评分,具有明确的生物学基础 需要进一步的前瞻性验证以确认其临床适用性 开发一种基于单细胞轨迹分析的基因集风险评分,用于I期肺腺癌患者的预后分类 I期肺腺癌患者,包括原位癌、微浸润癌和浸润癌样本 生物信息学, 单细胞分析 肺腺癌, 肺癌 单细胞RNA测序, 转录组分析 Cox比例风险模型, 岭回归 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 训练队列269例,外部验证队列70例(GSE37745)、92例(GSE50081)、254例(GSE72094) NA 单细胞RNA测序 NA NA
206 2026-08-13
Genetic association between immune cells and oral cancer: A Mendelian randomization study
2026-Jul-29, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 通过孟德尔随机化方法研究免疫细胞表型、细胞因子与口腔癌之间的因果关联 首次利用双向孟德尔随机化方法系统评估731种免疫细胞表型、41种细胞因子与口腔癌的因果关系,并结合单细胞RNA测序进行验证 该研究可能存在未测量的混杂因素,以及单细胞RNA测序验证的样本量和范围有限 探究免疫细胞、细胞因子与口腔癌之间的因果关系 口腔癌患者及相关免疫细胞表型和细胞因子 基因组学、生物信息学 口腔癌 全基因组关联分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、单细胞转录组数据 大规模GWAS数据(具体样本量未在摘要中指定),单细胞RNA测序验证数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
207 2026-08-13
Sustained AMPAR expression in CA3 neurons may mediate neuroprotection following FLASH-RT
2026-Jul-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析,探究FLASH-RT对正常大脑长期神经保护作用的早期机制,发现CA3和DG神经元中谷氨酸受体表达上调,并持续表达AMPAR。 首次揭示FLASH-RT通过早期钙内流和AMPAR持续表达介导神经保护的机制。 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本,且未直接评估认知功能。 阐明FLASH-RT在正常大脑中长期神经保护作用的早期分子机制。 C57BL/6J小鼠大脑的CA3和DG区域神经元及神经祖细胞。 空间转录组学 神经系统疾病 空间转录组学 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量,涉及小鼠大脑组织。 Nanostring 空间转录组学 Nanostring平台 未提供具体配置细节。
208 2026-08-13
Migraine immune cell gene targets and their relationship to psychiatric disorders
2026-Jul-25, The journal of headache and pain IF:7.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组-wide孟德尔随机化等方法,探索偏头痛与精神疾病共病的免疫遗传机制。 首次通过单细胞分辨率的转录组-wide孟德尔随机化,结合贝叶斯共定位和遗传相关性分析,识别出偏头痛与精神疾病共享的免疫细胞基因靶点。 未提供明确的局限性描述。 探究偏头痛与精神疾病共病的免疫遗传机制,识别共享的基因靶点。 偏头痛及其亚型(有先兆、无先兆)和五种精神疾病(焦虑、抑郁等)。 自然语言处理 偏头痛、精神疾病 孟德尔随机化、贝叶斯共定位、遗传相关性分析、GWAS、eQTL NA 基因表达数据、遗传变异数据 1,925名供者的28种免疫细胞亚型 NA NA NA NA
209 2026-08-13
Sex-dependent control of renal tubular homeostasis and stress tolerance by KDM6A
2026-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究比较了雌性和雄性小鼠肾小管上皮细胞中KDM6A缺失的影响,发现KDM6A对雌性肾脏稳态至关重要,而雄性因UTY补偿不受影响 首次揭示KDM6A和UTY作为X-Y基因对在肾脏中具有部分功能补偿作用,并发现性别依赖性调控肾小管稳态和应激耐受 未明确KDM6A酶活性与其支架功能在肾脏保护中的具体贡献,且研究仅限于小鼠模型 探究KDM6A在肾小管上皮细胞中对性别依赖性肾脏稳态和应激耐受的影响 雌性和雄性小鼠的肾小管上皮细胞 肾脏病理学 肾脏纤维化, 范可尼综合征 空间转录组学, 代谢组学, 基因敲除 NA 基因表达数据, 代谢物数据, 组织图像 小鼠模型,具体数量未提供 10x Genomics, NA 空间转录组学, 质谱 10x Visium 空间转录组学使用10x Visium平台
210 2026-08-13
Single-cell RNA sequencing reveals intrinsic and microbiota-associated sex differences in murine lung
2026-Jul-23, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示小鼠肺部免疫细胞中与性别相关的内在及微生物群相关差异 首次探索共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用,并识别出与微生物状态无关的内在性别差异 研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类肺部免疫的性别差异 阐明性别二态性在肺部免疫中的机制,以及微生物暴露对性别相关免疫差异的影响 雄性及雌性小鼠在无特定病原体或无菌条件下的肺部免疫细胞 单细胞转录组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 流式细胞术数据 未具体说明,涉及多组小鼠比较 NA 单细胞RNA测序 NA NA
211 2026-08-13
Single-cell transcriptomic unveils tumor-mediated reprogramming of neutrophils and their unique vulnerability that inhibits metastasis
2026-Jul-17, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组学揭示了肿瘤介导的中性粒细胞重编程过程,并发现了一种选择性靶向这些细胞以抑制转移的策略 首次在单细胞水平全面描绘了荷瘤小鼠不同组织中中性粒细胞的转录重编程,并利用IFITM蛋白增强的摄取机制,通过mTOR抑制剂Rapalink-1选择性清除重编程中性粒细胞,从而抑制肿瘤转移 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未详细探讨Rapalink-1对其他免疫细胞或正常组织的影响 理解肿瘤如何重编程中性粒细胞并探索选择性靶向这些细胞以抑制转移的方法 荷瘤和未荷瘤MMTV-PyMT小鼠的骨髓、血液、肿瘤微环境和肺转移巢中的中性粒细胞 单细胞转录组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 无 单细胞转录组数据 未具体说明样本数量,涉及多组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
212 2026-08-13
SRY-Box 9-Driven Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia Cell Lineage Plasticity Is a Potential Therapeutic Target That Mitigates Risk of Metaplastic Progression to Gastric Cancer
2026-Jul-14, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究探讨了SOX9转录因子在胃黏膜化生(SPEM)细胞可塑性中的作用及其对胃癌发生发展的影响 首次揭示SOX9是SPEM细胞谱系演化和化生进展的主调控因子,并发现DNA拓扑异构酶II-α阳性SPEM细胞亚群参与化生进展 研究主要基于小鼠模型和人类组织微阵列,SPEM类器官的使用有限,可能无法完全模拟人类胃黏膜微环境 阐明SOX9介导的SPEM细胞可塑性在胃黏膜化生发展和胃癌进展中的作用机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 小鼠胃主细胞、SPEM细胞、人类胃组织样本及SPEM类器官 分子生物学 胃癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、基因敲除小鼠模型 NA 基因表达数据、组织图像 两种基因敲除小鼠模型(GCS和GCKS)及人类组织微阵列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
213 2026-08-13
SBRT embedded in low-dose RT plus αPD-1 (immuno-EclipseRT, iERT) elicits CD8+ T cell immunity against bulky tumors via an IFN-I/NK/DC axis
2026-07-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究提出一种新型放疗技术EclipseRT,结合低剂量放疗和立体定向体部放疗,并联合免疫检查点抑制剂,通过IFN-I/NK/DC轴增强CD8+ T细胞抗肿瘤免疫,有效控制大体积肿瘤 创新性地将低剂量放疗与立体定向体部放疗结合在同一肿瘤内,并在联合免疫检查点抑制剂时,通过IFN-I/NK/DC轴协同激活CD8+ T细胞免疫,显著提高对大体积肿瘤的控制效果 摘要未提及具体局限性 探索一种新型放疗技术联合免疫检查点抑制剂治疗大体积肿瘤的策略,并揭示其免疫机制 大体积肿瘤模型,涉及NK细胞、CD8+ T细胞、树突状细胞等免疫细胞 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未在摘要中明确样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
214 2026-08-13
Single cell spatial transcriptomics track the evolutionary hierarchy and microenvironment remodeling during breast carcinoma invasion
2026-07-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和基因组学,追踪乳腺癌从导管原位癌到浸润性癌的进化层次和微环境重塑 首次构建了DCIS-IBC进展的统一空间分子图谱,识别了四个分子定义的基底膜破坏阶段(NMFT1-NMFT4),并揭示了侵袭主要由预先存在的DCIS亚克隆的克隆扩增驱动 未提及 阐明从导管原位癌到浸润性乳腺癌转变的机制,特别是克隆进化、转录重编程和肿瘤微环境重塑的作用 28例同步DCIS和IBC患者的单细胞、空间和基因组数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、基因组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据、基因组数据 28例患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
215 2026-08-13
A single-cell atlas of alternative wing development in two hemipteran species
2026-07-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析两种半翅目昆虫的翅芽,揭示翅多型现象的细胞基础 首次在单细胞分辨率下解析昆虫翅多型性的细胞决定因素,并鉴定出保守的细胞类型和关键调控基因 未提供 探究半翅目昆虫翅多型性的细胞机制 长翅和短翅命运的红蝽(Pyrrhocoris apterus)和褐飞虱(Nilaparvata lugens)的翅芽 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序、RNA干扰、流式细胞术 不适用 单细胞基因表达数据 两种昆虫的翅芽样本,具体数量未提供 未明确 单细胞RNA-seq 未明确 未明确
216 2026-08-13
Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in the mouse visual cortex
2026-Jul-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究整合小鼠视觉皮层的单细胞转录组与全脑投射组数据,建立了兴奋性神经元类型的综合分类系统 首次将单细胞转录组与长程轴突投射信息相结合,构建了跨模态分类器,揭示了转录组与投射目标之间的关联 仅涵盖小鼠视觉皮层,尚未扩展至全脑或跨物种验证 建立皮层兴奋性神经元的综合分类体系,并探讨转录组与投射组的关系 小鼠视觉皮层的兴奋性神经元 神经科学 NA Patch-seq,单细胞RNA测序,全神经元形态重建 多步分类器 转录组、形态学、电生理数据 1,528个兴奋性Patch-seq神经元和341个全神经元形态 NA 单细胞RNA测序 NA NA
217 2026-08-13
The perineurium integrates leptin with its sympathetic outflow to protect against obesity
2026-Jul, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序发现脂肪组织交感神经节和神经束周围形成屏障的神经束膜细胞同时表达瘦素受体和β-肾上腺素能受体,并揭示其在协调瘦素传入和交感传出信号以调节能量消耗和体重中的作用 首次揭示神经束膜细胞作为整合瘦素传入信号与交感传出信号的关键外周调节节点,并发现肥胖相关高瘦素血症通过诱导神经束膜细胞凋亡破坏屏障导致交感神经病变 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅限于遗传多态性关联,未提供直接的功能实验证据 阐明外周神经束膜细胞如何协调瘦素信号的传入和传出,以调节能量平衡,从而为肥胖治疗提供新靶点 小鼠交感神经节中的神经束膜细胞(特别是瘦素受体阳性细胞),以及人类遗传多态性数据 分子生物学 肥胖 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除, 遗传关联分析 NA 基因表达数据, 遗传变异数据 小鼠模型和大型欧洲人群遗传数据 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
218 2026-08-13
Assessing scale and predictive diversity in models for single-cell transcriptomics based on Geneformer
2026-Jul, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出了GFCAB框架,改进基于Geneformer的单细胞转录组学模型,以更好地捕捉排名结构并减少预测冗余 引入累积分配机制抑制重复基因预测,并采用基于相似性的正则化策略增强输出多样性,同时证明大规模预训练并非总是有益 未提及 开发更高效且具有生物学信息的单细胞转录组学模型,以改善疾病表征和精准生物学应用 单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Geneformer(Transformer) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
219 2026-08-13
Heterogeneous viral-host response at single-cell resolution and viral adaptive mutational atlas in birds and mammals upon H5 influenza virus infection
2026-Jul, National science review IF:16.3Q1
研究论文 该研究整合空间转录组和单细胞基因组学技术,描绘了H5高致病性禽流感病毒感染鸟类和哺乳动物肺部的单细胞转录组图谱,并鉴定了病毒适应性突变。 首次在单细胞分辨率下比较多种鸟类和哺乳动物对H5 HPAIV感染的宿主反应,并鉴定出影响病毒复制和聚合酶活性的突变。 未明确提及研究局限性。 阐明H5 HPAIV在不同宿主中肺部感染的细胞类型特异性反应和病毒适应性进化。 鸡、鸭、鸽子和小鼠、猪的肺部细胞。 单细胞转录组学、空间转录组学 禽流感 空间转录组学、单细胞基因组学 NA 基因表达数据、基因组变异数据 1499669个细胞 NA 空间转录组学、单细胞转录组学 NA NA
220 2026-08-12
Formononetin Antagonizes Osteosarcoma Metastasis by Targeting CD44: An Integrated Multi-Omics Study
2026-Jul-31, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了化疗耐药骨肉瘤细胞通过CD44介导内皮功能障碍促进转移的机制,并证实天然化合物芒柄花素(FMN)通过直接靶向CD44抑制肿瘤转移 首次揭示化疗耐药骨肉瘤细胞通过CD44介导内皮功能障碍促进转移的新机制,并鉴定FMN为直接靶向CD44的潜在抗转移药物 主要在细胞系和动物模型中验证,缺乏临床样本验证;FMN的长期安全性和药代动力学需要进一步研究 识别化疗耐药且易转移的骨肉瘤亚群,阐明其通过内皮功能障碍促进转移的机制,并探讨FMN作为潜在抑制剂的可行性 骨肉瘤患者样本(bulk RNA-seq, scRNA-seq, ST数据)及两种骨肉瘤细胞系(OS细胞系) 癌症生物学 骨肉瘤 RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟, CETSA, Transwell实验, 动物实验 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 图像, 实验数据 未明确患者样本数;细胞系两种;动物实验使用小鼠 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics NA NA
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