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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-24 |
RAI1 safeguards fidelity and tempo of human neurodevelopmental gene expression
2026-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.11.731717
PMID:42327261
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研究论文 | 该研究通过构建RAI1基因杂合及纯合功能缺失的人胚胎干细胞系,结合纵向转录组分析和单细胞RNA测序,揭示了RAI1在人类神经发育基因表达调控中的关键作用 | 首次通过等基因人胚胎干细胞模型实验性地探索RAI1在人类神经发育中的角色,发现RAI1缺失会加速发育基因表达进程,并揭示其在抑制中胚层谱系程序和调控神经发育节奏中的新功能 | 研究主要基于体外胚胎干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内人脑发育的复杂微环境;未涉及RAI1的具体分子机制及下游靶基因的全基因组结合图谱分析 | 探究RAI1基因在人类神经发育基因表达调控中的功能及其在Smith-Magenis综合征发病机制中的作用 | 人胚胎干细胞系(包括RAI1杂合及纯合功能缺失的等基因细胞系)及其分化产生的神经祖细胞和兴奋性神经元 | 机器学习, 数字病理学 | Smith-Magenis综合征, 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 纵向转录组分析 | NA | 文本, 图像 | RAI1杂合及纯合功能缺失的人胚胎干细胞系及其分化后的神经祖细胞和兴奋性神经元,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-24 |
ITGAX is associated with poor prognosis and an immune-inflammatory microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jul-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16432-1
PMID:42387425
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析和体外实验探讨了ITGAX在透明细胞肾细胞癌中的表达、预后价值及其与免疫微环境和AKT/mTOR信号通路的关联 | 首次系统性地揭示了ITGAX在ccRCC中与不良预后、免疫炎症微环境及AKT/mTOR信号通路的关联,并通过单细胞RNA测序明确了其在髓系细胞中的定位 | 需要额外的临床、空间转录组和体内验证来进一步确认ITGAX作为ccRCC生物标志物的潜力 | 阐明ITGAX在透明细胞肾细胞癌中的表达特征、临床相关性、免疫调节功能及其潜在分子机制 | 透明细胞肾细胞癌细胞系(786-O和Caki-1)、正常肾上皮细胞系(HK-2)以及TCGA-KIRC数据库中的ccRCC患者样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 免疫印迹, 免疫组化, 计算算法分析 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | TCGA-KIRC数据集(具体样本量未在摘要中提及)和多个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-09-24 |
Structural-functional network decoupling in early stage amyotrophic lateral sclerosis reveals cell-type specific transcriptional signatures
2026-Jul-02, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04932-7
PMID:42393685
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研究论文 | 该研究通过多模态MRI分析早期散发性ALS患者的结构-功能网络耦合异常,并结合影像转录组学和单细胞RNA测序揭示其细胞类型特异性的转录特征 | 首次在早期散发性ALS中系统揭示结构-功能网络解耦与特定小胶质细胞失调(尤其是FMN1下调)之间的多尺度关联,并整合机器学习、影像转录组学和单细胞分析构建了从宏观神经影像到细胞病理的桥梁 | 样本量相对有限(73例患者和74例对照),仅针对早期散发性ALS,未涵盖其他ALS亚型或疾病阶段;影像转录组学相关性分析不能直接证明因果关系 | 研究早期散发性ALS中宏观结构-功能耦合异常及其潜在的转录组学特征 | 73例早期散发性ALS患者和74例年龄性别匹配的健康对照 | 数字病理学, 机器学习 | 肌萎缩侧索硬化症 | 扩散张量成像, 静息态功能磁共振成像, 单细胞RNA测序, 影像转录组学 | 梯度提升机 | 影像, 文本 | 73例早期散发性ALS患者和74例健康对照的多模态MRI数据,以及独立单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 扩散张量成像, 静息态功能磁共振成像 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-24 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 该研究建立了一种新型人源化小鼠胶质母细胞瘤模型,将患者来源异种移植瘤(PDX)移植到人源化免疫缺陷小鼠中,以研究肿瘤与人类免疫细胞的相互作用 | 首次将辐射耐受的PDX移植到表达关键人类细胞因子的人源化小鼠中,成功重建了多样化的人类免疫细胞浸润,且免疫细胞基因表达谱与人类复发性GBM相似,并揭示了肿瘤中高比例的神经祖细胞样细胞 | 样本量较小,仅使用了2种免疫缺陷小鼠模型,且未进行功能性免疫治疗验证实验 | 建立能够模拟人类肿瘤与免疫细胞相互作用的人源化GBM小鼠模型,用于研究肿瘤免疫微环境和评估新型免疫疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤PDX肿瘤及其浸润的人类免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 图像、文本 | 2种免疫缺陷小鼠模型,移植辐射耐受的PDX肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-24 |
NT-I7, a Long-Acting Interleukin 7, Increases Lymphocyte Counts and Induces CD8+ T-cell Clonotype Expansion in Patients with Newly Diagnosed High-Grade Gliomas
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2953
PMID:41880597
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研究论文 | 一项I期临床试验评估长效白介素7(NT-I7)在新诊断高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及对淋巴细胞的影响 | 首次在高级别胶质瘤患者中开展NT-I7的I期临床试验,发现其可显著增加淋巴细胞计数,并通过单细胞RNA测序揭示CD8+ T细胞选择性克隆扩增,且在MGMT启动子未甲基化的胶质母细胞瘤患者中观察到有前景的临床反应 | 样本量较小,为I期剂量探索性试验,缺乏对照组,疗效仍需更大规模随机试验验证 | 确定NT-I7在新诊断高级别胶质瘤患者中的最大耐受剂量、安全性及其对免疫细胞(尤其是淋巴细胞)的影响 | 新诊断高级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | I期临床试验患者(具体数量未在摘要中说明),其中部分患者接受单细胞RNA测序免疫分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-24 |
Taming autoimmunity: Alpha-1 antitrypsin overexpressing mesenchymal stromal cells promote regulatory T cell crosstalk to reverse diabetes
2026-Jul-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.032
PMID:41918165
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研究论文 | 该文章研究了过表达α-1抗胰蛋白酶(AAT)的间充质干细胞(MSC)如何通过促进调节性T细胞(Treg)与其他免疫细胞的相互作用来逆转糖尿病。 | 首次利用单细胞RNA测序、流式细胞术和功能分析,系统揭示了AAT-MSCs通过增强Treg扩增、诱导CD8 T细胞耗竭并提升胰岛细胞存活,从而调节免疫微环境、逆转新发糖尿病的细胞间通讯机制。 | 研究主要基于非肥胖糖尿病小鼠模型和体外实验,缺乏长期安全性和人体临床试验数据。 | 探索AAT-MSCs在1型糖尿病及其他自身免疫或炎症疾病中的免疫调节机制和临床应用潜力。 | 非肥胖糖尿病小鼠的胰腺淋巴结和胰岛,以及小鼠和人类的CD4、CD8 T细胞和胰岛细胞。 | 单细胞组学、免疫学、细胞治疗 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能分析、CellChat分析 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-24 |
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324694
PMID:42206364
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研究论文 | 该研究通过组织学、扫描电镜、单细胞测序和空间转录组学分析人类主动脉瓣组织,揭示了钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 | 首次结合单细胞和空间转录组学揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞在钙化位点附近的性别依赖性空间组织和基因表达差异,发现男性偏向性AP-1转录因子复合物表达和女性偏向性ECM重塑基因表达 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究驱动主动脉瓣组织性别依赖性纤维钙化的细胞机制,理解钙化性主动脉瓣疾病中性别差异的细胞表型 | 人类男性和女性主动脉瓣组织,包括健康患者和钙化性主动脉瓣疾病患者的瓣膜组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, RNA原位杂交, 组织学技术, 扫描电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-24 |
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-Jul, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2026.103476
PMID:42214760
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研究论文 | 该研究利用加速卵巢衰竭小鼠模型,通过空间转录组学技术探究急性木烟暴露对海马体的细胞特异性转录组响应 | 首次将加速卵巢衰竭模型与急性木烟暴露相结合,利用空间转录组学揭示围绝经期样激素状态下海马体对空气污染的细胞特异性转录响应,阐明了卵巢激素下降与空气污染暴露的交互作用机制 | 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(每组n=4),仅评估急性暴露(2天),未涉及长期暴露效应,且未进行蛋白质水平或功能验证 | 测试围绝经期样激素状态是否放大海马体对急性木烟暴露的响应,并定义细胞类型特异性的转录组框架 | 雌性C57BL/6小鼠,采用VCD诱导的中度加速卵巢衰竭模型 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 每组4个切片,共2组(过滤空气组和木烟暴露组) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台,结合自动化细胞类型注释 |
| 9 | 2026-09-24 |
IL-22 promotes genesis of small intestinal secretory cells that protect against cholera in mice
2026-Jul, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02375-7
PMID:42236988
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研究论文 | 通过对 infant mouse 小肠上皮和免疫细胞进行单细胞RNA测序,并结合IL-22Fc处理,研究IL-22在霍乱弧菌感染中促进肠道分泌细胞分化及黏膜防御的机制 | 首次揭示IL-22通过促进肠上皮细胞产生Reg3β及增加分泌系和杯状细胞丰度,分泌黏液至肠隐窝,从而抑制霍乱弧菌与上皮结合,保护小鼠免于腹泻和死亡 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;IL-22Fc的长期安全性及对肠道菌群的影响未充分探讨 | 探究小肠固有免疫防御机制及IL-22在抗霍乱弧菌感染中的作用 | infant mouse 小肠上皮细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-09-24 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描技术,研究胎儿发育期间手指关节的细胞组成、空间组织和结构,揭示PI16成纤维细胞在特定部位关节炎易感性中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描技术系统研究胎儿手指关节发育过程中的细胞组成和空间组织,发现PIP关节富含PI16通用成纤维细胞,并揭示其在血管周围区域和发育中的肌腱-韧带界面定位,提出间充质细胞化学计量学差异是驱动组织炎症易感性的普遍原则 | NA | 探究部位特异性炎症的细胞基础,阐明为何近端指间关节更易受炎症性关节炎影响而远端指间关节不受影响 | 人类胎儿手指关节(近端指间关节和远端指间关节) | 单细胞组学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序、成像、X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-09-24 |
PRECISE: A Prognostic Thyrocyte-Derived Gene Signature for Papillary Thyroid Carcinoma
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4488
PMID:42008746
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研究论文 | 该研究利用单细胞和单核RNA测序数据开发了甲状腺细胞来源的基因特征PRECISE,并在多个队列中验证其对甲状腺乳头状癌的预后价值 | 首次利用单细胞和单核RNA测序数据开发甲状腺细胞来源的基因特征PRECISE,包含41个在肿瘤细胞中下调的上皮基因,并在多个独立队列中验证其独立预后价值 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发有效的生物标志物并改进甲状腺乳头状癌的风险分层方法 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | 多变量Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | 发现队列109例(MDACC),验证队列65例(VUMC)和370例(TCGA),其中11例肿瘤和4例正常样本进行单核RNA测序 | NA | 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-24 |
OT-55 reshapes tolerogenic BH3-mimetic-induced apoptosis toward immunogenic cell death in acute myeloid leukemia, potentiating PD-1/Tim-3 blockade
2026-Jul-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09000-9
PMID:42386711
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研究论文 | 本研究探讨了羟基香豆素OT-55联合Bcl-xL抑制剂A-1331852将BH3模拟物诱导的耐受性凋亡转化为免疫原性细胞死亡,并增强PD-1/Tim-3阻断疗法在急性髓系白血病中的疗效 | 首次提出OT-55作为免疫原性佐剂可将BH3模拟物驱动的耐受性凋亡转化为免疫原性细胞死亡,并构建了九基因AML ICD评分系统,证明了联合PD-1/Tim-3阻断可实现局部和远端肿瘤控制且毒性较低 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性患者队列数据分析,缺乏前瞻性临床试验验证,OT-55在人体中的安全性和有效性尚需进一步评估 | 探索免疫原性佐剂OT-55能否将BH3模拟物触发的耐受性凋亡转化为免疫原性启动,从而增强检查点免疫治疗并克服AML中的免疫逃逸 | 急性髓系白血病(AML),包括三个AML患者队列(TARGET-AML、BEAT-AML、GSE37642)及小鼠C1498粒单核细胞白血病细胞模型 | 数字病理学, 机器学习 | 白血病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 转录组分析, CIBERSORTx免疫浸润分析 | Cox回归, CIBERSORTx | 转录组数据, 图像, 文本 | 三个AML患者队列(TARGET-AML、BEAT-AML、GSE37642)的转录组数据,AML和健康供体的骨髓scRNA-seq数据,以及小鼠C1498细胞模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-09-24 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics in the discovery of kidney disease potential biomarkers: a narrative review
2026-Jul-01, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05159-7
PMID:42387422
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)及其与空间转录组学(ST)整合技术在肾脏疾病潜在生物标志物发现中的最新应用与进展 | 系统总结了scRNA-seq与空间转录组学整合技术在肾脏疾病生物标志物发现中的应用,并提出了未来研究与临床应用的新视角和方向 | 作为叙述性综述,未进行系统性文献检索和定量分析,可能存在文献选择偏倚 | 总结单细胞RNA测序及空间转录组学在肾脏疾病潜在生物标志物发现中的最新应用与进展 | 肾脏疾病及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-09-24 |
Network-based integrative transcriptomic analysis reveals immune-regulatory and oncogenic signatures of EOMES and SPRYD3 in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16379-3
PMID:42387439
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研究论文 | 结合头颈鳞癌批量转录组数据与口腔鳞癌单细胞RNA测序数据,通过网络分析识别出EOMES和SPRYD3分别代表免疫调控和致癌增殖两种不同的转录程序 | 整合批量转录组与单细胞RNA测序数据揭示EOMES和SPRYD3在HNSCC中分别代表免疫调控和致癌增殖两种不同的转录程序,并利用CopyKAT鉴定非整倍体上皮细胞中SPRYD3的特异性富集 | 实验验证样本量有限,EOMES在OSCC组织中仅呈低表达趋势,尚未在更大队列中验证其预后价值 | 探讨头颈鳞癌中上皮增殖与免疫活性之间的关系,识别与肿瘤进展相关的基因程序及预后标志物 | 头颈鳞癌(HNSCC)患者及口腔鳞癌(OSCC)样本 | 数字病理学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,共表达网络分析,CopyKAT | NA | 转录组数据,图像 | GSE83519、TCGA-HNSC批量转录组队列及GSE172577单细胞RNA测序队列(具体样本数未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-24 |
From heterogeneity to mechanism: a systems-level analysis pinpoints the S100A8/A9 axis in colorectal cancer
2026-Jul-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04399-9
PMID:42387561
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研究论文 | 该研究通过整合bulk转录组学、单细胞RNA-seq图谱和机器学习优先级分析的多组学策略,解析S100蛋白家族在结直肠癌中的功能异质性,并识别出髓源性S100A8/A9轴作为促肿瘤炎症微环境的关键放大因子 | 通过多组学整合策略解决了S100家族在结直肠癌中广泛失调但预后价值有限的悖论,揭示了S100A8和S100A9的表达并非肿瘤内在性的,而是高度集中于肿瘤浸润髓系细胞,并实验验证了其作为炎症驱动因子的功能 | qRT-PCR验证队列仅30例患者,样本量较小;功能验证仅限于体外实验,缺乏体内动物模型验证;未深入探讨S100A8/A9轴的具体信号传导机制 | 解析S100蛋白家族在结直肠癌中的功能角色,克服其异质性带来的治疗靶点识别障碍,寻找潜在的预后标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织、肿瘤浸润髓系细胞、结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk转录组学、单细胞RNA-seq、qRT-PCR | 机器学习 | 文本、图像 | 30例患者队列(qRT-PCR验证),TCGA bulk转录组数据,Pan-GI细胞图谱大规模单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-09-23 |
Lineage-aware stochastic modeling reveals gene-expression dynamics in development and disease
2026-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734628
PMID:42395557
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研究论文 | 本文提出了LaVOUS,一个基于谱系感知的概率框架,用于在重建的谱系树上建模稀疏的单细胞基因表达计数,并在模拟和真实数据中验证其性能 | 将布朗运动与Ornstein-Uhlenbeck模型、负二项观测模型和可扩展变分推断相结合,实现了基于似然的基因表达遗传力检验、分支特异性表达变化检测和祖先表达重建,克服了传统方法将细胞视为独立快照的局限 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发一个谱系感知的概率框架来研究单细胞基因表达动态,以更准确地检测与谱系相关的表达变化 | 转移性肺癌、类别转换B细胞和发育中大脑的单细胞谱系数据 | 机器学习, 计算生物学 | 肺癌 | single-cell RNA-seq | 布朗运动模型, Ornstein-Uhlenbeck模型, 负二项模型, 变分推断 | 基因表达计数数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-09-23 |
VCAM-1-targeting peptide assemblies protect vascular endothelium and prolong cardiac xenograft survival
2026-Jul-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec5707
PMID:42418593
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定出VCAM-1内皮细胞亚群是猪到灵长类异种心脏移植急性排斥反应中易受损的主要内皮亚型,并开发了靶向VCAM-1的纳米颗粒(VTN)来保护该细胞群,从而延长异种移植心脏的存活时间 | 首次鉴定出VCAM-1内皮细胞亚群是异种心脏移植急性排斥反应中易受损的主要内皮亚型,并开发了整合VCAM-1结合肽、自组装肽纳米纤维涂层和局部免疫调节药物递送三种功能模块的靶向纳米颗粒(VTN),将异种移植心脏存活时间从6.7天延长至27.0天,延长近四倍 | 摘要中未提及该研究的局限性 | 解决异种心脏移植中长期移植物存活受内皮细胞功能障碍限制的问题,通过保护易受损的VCAM-1内皮细胞亚群来改善异种移植 outcomes | 猪到灵长类的异种心脏移植模型中的内皮细胞 | 单细胞组学、纳米医学 | 心血管疾病、器官移植排斥反应 | 单细胞RNA测序、一珠一化合物筛选、纳米颗粒递送 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-23 |
PanKbase Integrated Single-Cell Map: A Comprehensive Atlas of Human Pancreatic Islets
2026-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.02.729719
PMID:42327171
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研究论文 | 该研究通过整合公开的人类胰岛单细胞RNA测序数据,构建了一个全面的人类胰岛单细胞图谱,涵盖多种糖尿病表型 | 整合了来自多个来源和实验室的公开数据,系统性地考虑了年龄、性别、BMI、研究来源、治疗、胰岛分布资源和测序化学等变量,构建了大规模、高质量的胰岛单细胞图谱 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 构建全面整合的人类胰岛单细胞RNA测序图谱,以克服单个数据集规模有限和碎片化的问题,为研究1型糖尿病等糖尿病的病理生理学提供平台 | 人类胰岛组织,来自140名供体,包括无糖尿病对照组、自身抗体阳性无糖尿病、前驱糖尿病、1型糖尿病和2型糖尿病患者 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 191个高质量样本,来自140名供体,共448,935个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-09-23 |
Extreme conservation of cnidarian stinging cell identity despite 600 million years of evolution
2026-Jul-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.16.732747
PMID:42367904
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序和转录谱系重建,在珊瑚和海葵中揭示FoxL2基因控制刺细胞多样性演化的关键开关,决定穿刺细胞(nematocyte)或缠绕细胞(spirocyte)的分化。 | 首次发现单一基因FoxL2控制刺细胞多样性演化的关键开关,并发现缠绕细胞(spirocyte)是高度保守的'活化石'细胞,其保守性远超穿刺细胞。 | 仅研究了珊瑚和海葵两种刺胞动物,样本范围有限,且未进行功能实验验证FoxL2的具体调控机制。 | 理解细胞特化机制,重建刺胞动物刺细胞的演化历史。 | 珊瑚和海葵的刺细胞(cnidocytes)。 | 单细胞转录组学、演化生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录谱系重建 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-23 |
Multi-omics characterization of astrocyte subtypes reveals spatially coordinated astrocyte downregulation in depression
2026-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.02.735636
PMID:42427711
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研究论文 | 该研究结合空间转录组学与匹配的snRNA-seq和snATAC-seq数据集,对星形胶质细胞亚型进行空间定位,揭示其在重度抑郁症深皮层中的空间协调下调 | 首次在空间背景下解析星形胶质细胞亚型的分子异质性,整合空间转录组学、snRNA-seq和snATAC-seq多组学数据,发现MDD dlPFC深皮层中空间定位的星形胶质细胞功能障碍,并聚焦于PSAP-GPR37L1信号轴 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 在空间背景下解析星形胶质细胞亚型的分子特征及其对重度抑郁症病理的区域性贡献 | 重度抑郁症患者背外侧前额叶皮层(dlPFC)中的星形胶质细胞亚型及其与邻近细胞的相互作用 | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 重度抑郁症 | 空间转录组学, snRNA-seq, snATAC-seq | NA | 空间转录组数据, 单细胞核RNA测序数据, 单细胞核ATAC测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞核RNA-seq, 单细胞核ATAC-seq | NA | NA |