单细胞与空转测序相关文章

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序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
1	2026-05-16	Aucan targets CDK2 to suppress glioblastoma progression by inhibiting PI3K/AKT pathway-mediated proliferation and inducing apoptosis 2026-Jul, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2026.117893 PMID:41846012	研究论文	评估松萝酸二苯并呋喃类似物Aucan的抗胶质母细胞瘤活性及其通过靶向CDK2抑制PI3K/AKT通路介导的增殖并诱导凋亡的机制	首次整合网络药理学、孟德尔随机化和单细胞RNA测序识别出CDK2为Aucan的关键靶点，并验证其通过抑制PI3K/AKT通路发挥抗胶质母细胞瘤作用	未在更广泛的临床前模型中验证，且单细胞RNA测序分析可能受限于样本异质性	评估Aucan的抗胶质母细胞瘤活性并阐明其分子机制	胶质母细胞瘤细胞系（如U87、U251）和皮下及颅内异种移植小鼠模型	机器学习	胶质母细胞瘤	细胞增殖实验、Transwell迁移实验、凋亡检测、网络药理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序	NA	文本	体外细胞实验（具体样本量未详述）和体内小鼠模型（皮下及颅内移植瘤模型，数量未详述）	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium 单细胞3'测序平台
2	2026-05-16	Single-cell transcriptomic atlas of shrimp hepatopancreas reveals an endoplasmic reticulum stress-dependent immune response to Vibrio parahaemolyticus infection 2026-Jul, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2026.111364 PMID:42000089	研究论文	利用单细胞核测序构建南美白对虾肝胰腺细胞图谱，揭示其应对副溶血弧菌感染的内质网应激依赖性免疫反应	首次通过snRNA-Seq构建虾类肝胰腺的细胞图谱，发现内质网应激在甲壳动物抗菌免疫中的关键作用，为跨物种免疫调控的进化保守性提供了新证据	未涉及	探索甲壳动物先天免疫的细胞和分子机制，特别是肝胰腺应对细菌感染的反应	南美白对虾肝胰腺细胞	机器学习	感染性疾病	snRNA-Seq, Western blot, 免疫组化	NA	基因表达数据	超过20,000个高质量细胞	NA	单细胞核测序	NA	NA
3	2026-05-15	Integrative multi-omics analysis identifies coronin 1C as a potential mediator linking circadian rhythm disruption to neuroimmune dysregulation in ischemic stroke 2026-Jul-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116732 PMID:42068898	研究论文	该研究通过整合多组学分析，发现冠状蛋白1C（CORO1C）是连接昼夜节律紊乱与缺血性卒中后神经免疫失调的潜在中介因子	首次利用机器学习构建昼夜节律紊乱评分模型，并结合单细胞转录组学和虚拟基因敲除分析，揭示CORO1C在昼夜节律紊乱驱动的神经免疫失调中的核心调控作用	研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白水平和表观遗传学层面的验证；且动物模型及体外实验的临床转化意义需进一步评估	探讨昼夜节律紊乱是否通过免疫失衡促进缺血性卒中进展，并阐明其潜在的分子机制	人类缺血性卒中脑组织转录组数据、外周血单核细胞单细胞RNA测序数据、以及小鼠昼夜节律依赖的卒中模型	机器学习	缺血性卒中	RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲除, AAV介导的基因干预	机器学习模型（如CRD评分模型）, 虚拟基因敲除框架（scTenifoldKnk）	转录组数据, 单细胞转录组数据	人类缺血性卒中脑组织样本（具体数量未提供）及小鼠卒中模型样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
4	2026-05-15	Ebselen's role in overcoming cisplatin resistance in colorectal Cancer via SQSTM1 ubiquitination modulation 2026-Jul-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116705 PMID:42085841	研究论文	本研究通过体内外实验、单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示Ebselen通过调节SQSTM1泛素化逆转结直肠癌顺铂耐药的机制	首次阐明Ebselen通过抑制SQSTM1介导的RAD51蛋白酶体降解来逆转顺铂耐药，并结合单细胞和空间转录组学全面解析肿瘤微环境重塑	未提及	探究Ebselen逆转结直肠癌顺铂耐药的分子机制	HCT116/DDP顺铂耐药结直肠癌细胞、人源化PBMC皮下CDX小鼠模型	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫共沉淀，泛素化分析	NA	单细胞转录组数据，空间转录组数据	NA	10x Genomics	单细胞RNA测序，空间转录组学	10x Chromium, 10x Visium	10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
5	2026-05-12	The applications of single-cell and spatial transcriptomics in neuroscience and brain disorders 2026-Jul, Neuroscience and biobehavioral reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.neubiorev.2026.106721 PMID:42069165	综述	本文综述了单细胞和空间转录组学在神经科学和脑疾病中的应用进展	系统总结了空间转录组学平台的最新进展，并探讨了其在神经科学中的关键应用，包括脑细胞类型识别、结构-功能关系以及神经精神疾病的基因表达模式	未详细讨论空间转录组学在临床转化中的具体挑战，如成本和技术复杂性	总结空间转录组学平台及其在神经科学和脑疾病研究中的应用，并为未来研究提供基础	脑细胞类型、神经发育过程、阿尔茨海默病和抑郁症等精神及神经退行性疾病	数字病理学	神经退行性疾病, 精神疾病	空间转录组学	NA	基因表达数据	NA	NA	空间转录组学	NA	NA
6	2026-05-09	Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation 2026-Jul, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1 DOI:10.1016/j.fct.2026.116073 PMID:41895505	研究论文	本研究通过整合网络毒理学和实验验证，发现免疫基因MMP9是TCDD暴露相关动脉粥样硬化的关键介质	首次通过系统生物信息学分析与实验结合，揭示MMP9作为TCDD暴露诱导动脉粥样硬化的核心免疫基因及其调控通路	主要依赖公开数据库和计算机模拟，体外模型仅涉及HUVEC细胞，缺乏体内动物模型验证	探索TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制，为环境相关动脉粥样硬化的风险评估、早期诊断和靶向干预提供新见解和候选靶点	TCDD暴露相关动脉粥样硬化	网络毒理学	心血管疾病	网络毒理学, RT-qPCR, Western blot, 分子对接, 分子动力学模拟	机器学习, SHAP, WGCNA, 伪时间分析	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
7	2026-05-08	Macrophage polarization as a therapeutic target in lung diseases: From pathogenesis to precision intervention 2026-Jul-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116660 PMID:41999690	综述	系统阐述了巨噬细胞极化在多种肺部疾病发病机制中的核心作用，并探讨了从传统非特异调控向精准重编程转变的治疗策略，提出整合单细胞多组学、空间转录组学和人工智能的免疫稳态重建新框架	提出从非特异广谱调控向靶向精准重编程的范式转变，创新性地提出整合人工智能驱动预测模型和巨噬细胞外泌体生物标志物发现以实现实时无创监测极化动态与自适应治疗决策，以及从对抗性干预转向免疫稳态重建的策略框架	未提及具体局限性	综述巨噬细胞极化在肺部疾病中的作用机制及精准干预的治疗策略演进	肺巨噬细胞（包括组织驻留肺泡巨噬细胞和单核细胞来源的募集巨噬细胞）	机器学习	肺部疾病	NA	NA	文本	NA	NA	单细胞多组学，空间转录组学	NA	NA
8	2026-05-08	Cholangiocyte biology in primary sclerosing cholangitis and other cholangiopathies: pathogenesis, clinical insights, and experimental tools 2026-Jul-01, Physiological reviews IF:29.9Q1 DOI:10.1152/physrev.00022.2025 PMID:41973609	综述	本文综述了胆管细胞生物学，特别是在原发性硬化性胆管炎（PSC）及其他胆管病变中的发病机制、临床见解和实验工具	整合了胆管细胞异质性、可塑性及新型技术（如类器官培养、单细胞转录组学、表观基因组学和空间组学）对胆道病理生理学理解的变革性影响	PSC 治疗仍未解决，需要持续的多学科努力来开发靶向干预措施	探讨胆管细胞生物学及其在胆管病变（特别是PSC）发病机制中的作用，并提供现有研究工具和模型的概述	胆管细胞	数字病理学	胆管疾病	NA	NA	文本	NA	NA	单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，空间组学	NA	NA
9	2026-05-08	Alveolar macrophage subtypes express cholesterol and inflammation genes in cystic fibrosis 2026-Jul, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202503482 PMID:42061984	研究论文	通过单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞亚型，发现表达胆固醇和炎症相关基因的巨噬细胞亚型	首次在囊性纤维化患者中鉴定出12种肺泡巨噬细胞亚型，并发现CDKN1A和LDLR表达上调与胆固醇代谢和炎症相关	样本量较小，仅涉及囊性纤维化患者和健康对照者，可能无法完全代表人群多样性	研究囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞的细胞组成及其在肺部炎症中的作用	囊性纤维化患者和健康对照者的肺泡巨噬细胞和单核细胞	单细胞测序	囊性纤维化	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	囊性纤维化患者和健康对照者，具体数量未提及	NA	单细胞RNA测序	NA	支气管肺泡灌洗液样本进行单细胞RNA测序
10	2026-05-04	Molecular PET imaging of tumor-associated macrophages in precision oncology 2026-Jul-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2026.218526 PMID:42019605	综述	系统评述了用于肿瘤相关巨噬细胞定量成像的正电子发射断层扫描策略的演变，重点介绍了高亲和力分子探针的范式转变及其临床潜力	强调从间接代谢成像向高亲和力分子探针的范式转变，特别突出了纳米抗体和肽类示踪剂在肿瘤穿透性和快速清除方面优于全长抗体的优势	跨物种标志物不一致等转化障碍限制了临床应用	评估分子PET成像在肿瘤相关巨噬细胞量化中的进展及其在精准肿瘤学中的潜在应用	肿瘤相关巨噬细胞	计算机视觉	肿瘤	PET	NA	图像	NA	NA	NA	NA	NA
11	2026-05-04	GLT8D2-mediated PD-L1 N-glycosylation promotes tumor immune evasion in ovarian cancer peritoneal metastasis 2026-Jul-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2026.218478 PMID:41936856	研究论文	本研究探讨糖基转移酶GLT8D2通过PD-L1 N-糖基化促进卵巢癌腹膜转移和肿瘤免疫逃逸的作用机制	首次发现GLT8D2通过催化PD-L1在Asn192位点的N-糖基化修饰来增强PD-L1稳定性，从而促进卵巢癌腹膜转移和免疫逃逸，并揭示了HIF-1α作为其直接转录激活因子	尚需进一步验证GLT8D2在其他癌症类型中的功能和临床转化潜力	阐明GLT8D2在卵巢癌腹膜转移中调控免疫逃逸的分子机制	卵巢癌腹膜转移组织和肿瘤细胞	机器学习	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	临床样本和单细胞数据	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞3'测序
12	2026-05-04	Decoupling lactylation-associated metabolic remodelling in Asthma: Integrated multi-omics and machine learning identify RCC2 as a potential therapeutic target 2026-Jul, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109371 PMID:42000636	研究论文	通过整合多组学和机器学习，解析哮喘中乳酸化相关的代谢重塑，并识别RCC2作为潜在治疗靶点	首次结合批量转录组和单细胞RNA测序，构建可解释的乳酸代谢生物标志物诊断框架，并发现RCC2连接糖酵解与表观遗传重塑的调控作用	未提及具体局限性，但可能需要体内和临床队列进一步验证	绘制哮喘中乳酸/组蛋白乳酸化相关的代谢状态，并开发乳酸代谢生物标志物诊断框架	哮喘患者的气道细胞和16HBE细胞	机器学习	哮喘	RNA-seq, 单细胞RNA测序	高斯混合模型引导的逻辑回归分类器	转录组数据	批量转录组训练集GSE63142和验证集GSE43696，单细胞RNA测序数据集GSE193816	NA	NA	NA	NA
13	2026-05-04	Curcumin modulates the function of SPP1+ macrophages via NF-κB signaling to alleviate endometriosis 2026-Jul-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116644 PMID:42001649	研究论文	通过单细胞RNA测序和多组学分析，揭示SPP1+巨噬细胞通过NF-κB信号通路促进子宫内膜异位症发病，并阐明姜黄素通过靶向该通路缓解疾病的分子机制	首次鉴定SPP1+巨噬细胞为子宫内膜异位症的关键致病巨噬细胞亚群，并阐明姜黄素靶向NF-κB信号通路抑制炎症重编程的新机制	NA	探索子宫内膜异位症的细胞异质性及其核心致病机制，并评估姜黄素的治疗潜力	子宫内膜异位症病灶组织中的细胞，特别是SPP1+巨噬细胞	数字病理学	子宫内膜异位症	单细胞RNA测序，多组学分析，细胞间通讯分析，动物实验	NA	单细胞转录组数据，多组学数据	NA	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞3'测序
14	2026-05-04	DECTIN-2 regulates macrophage M1 polarization via the SYK/ROS/JNK axis to influence the progress of apical periodontitis 2026-Jul-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116694 PMID:42019388	研究论文	本研究揭示DECTIN-2通过SYK/ROS/JNK信号轴调控巨噬细胞M1极化，从而影响根尖周炎的进展	首次阐明DECTIN-2在根尖周炎中通过SYK/ROS/JNK轴调控巨噬细胞M1极化的分子机制	未提及具体局限性	探究DECTIN-2在巨噬细胞极化和根尖周炎中的功能及潜在机制	人类根尖周炎病变组织、Dectin-2敲除小鼠模型及体外培养的巨噬细胞	机器学习	根尖周炎	单细胞测序、转录组测序	NA	单细胞转录组数据、转录组测序数据	人类根尖周炎病变组织样本及Dectin-2敲除小鼠模型	NA	单细胞RNA测序、转录组测序	NA	NA
15	2026-05-04	From cells to niches: Rewiring cardiovascular disease through spatial immunity 2026-Jul-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116731 PMID:42044575	综述	提出从细胞中心转向微环境中心的心血管疾病空间免疫学新框架	提出从细胞中心模型转向微环境中心模型，将组织视为结构化免疫生态系统，并整合空间转录组学等多模态技术	目前从空间相关性推断因果关系的能力有限	整合空间免疫学进展，推动心血管疾病免疫机制的概念转变	心血管疾病中的免疫细胞、基质细胞及其空间微环境	计算生物学、免疫学	心血管疾病	空间转录组学、多重成像、单细胞多组学、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、成像数据	NA	NA	空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞多组学	NA	NA
16	2026-04-25	Erchen decoction and its active flavonoids hesperidin and quercetin alleviate high-fat diet-induced neuroinflammation by targeting HK2-mediated microglial glycolysis 2026-Jul-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jep.2026.121603 PMID:41921767	研究论文	本研究系统表征了二陈汤的活性植物化学物质，并阐明了其通过靶向HK2介导的小胶质细胞糖酵解缓解高脂饮食诱导的神经炎症的神经保护机制	首次揭示了二陈汤的活性成分橙皮苷和槲皮素通过直接结合并抑制己糖激酶2（HK2）、阻断HK2/HIF-1α轴、抑制小胶质细胞Warburg效应，从而缓解高脂饮食诱导的神经炎症的机制，将中医传统“化痰”理论与脑代谢稳态恢复相关联	NA	研究二陈汤的神经保护机制，特别是其对肥胖相关神经炎症的调控作用	二陈汤及其活性成分橙皮苷和槲皮素对高脂饮食小鼠神经炎症和小胶质细胞糖代谢的影响	机器学习	NA	UPLC-MS，单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟，酶活性检测	NA	代谢组学数据，单细胞RNA测序数据	雄性C57BL/6J小鼠（数量未在摘要中指定）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
17	2026-04-25	SLC28A1 inhibits clear cell renal cell carcinoma progression by affecting arachidonic acid metabolism: A novel nucleoside transporter-based targeted therapy strategy 2026-Jul-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2026.218481 PMID:41946263	研究论文	本研究探讨SLC28A1通过影响花生四烯酸代谢抑制肾透明细胞癌进展的机制，并提出基于核苷转运体的靶向治疗策略	首次发现SLC28A1作为关键核苷转运体通过调控PLA2G12A介导的MAPK信号通路影响花生四烯酸代谢促进铁死亡，并开发了靶向纳米递送系统增强药物疗效	未提及研究的具体局限性	评估核苷转运体在肾透明细胞癌中的预后作用，阐明关键转运体的抑癌机制，并开发靶向治疗策略	肾透明细胞癌（ccRCC）	机器学习	肾癌	NA	NA	转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据	TCGA数据库中的肾透明细胞癌样本（具体数量未提及）	NA	NA	NA	NA
18	2026-04-25	Targeting the NSUN5-circPPAP2A axis reverses immunosuppression and sensitizes renal cell carcinoma to anti-PD-1 therapy 2026-Jul-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2026.218466 PMID:41967697	研究论文	揭示NSUN5-circPPAP2A轴在肾透明细胞癌中通过调控HIF-2α信号和免疫抑制微环境导致治疗抵抗，并证明靶向该轴可增强抗PD-1疗效	首次发现circRNA的m5C修饰通过NSUN5/circPPAP2A/YBX1轴协同激活HIF-2α信号和诱导免疫抑制，区别于以往仅关注mRNA的研究	未在更大规模队列或不同种族人群中验证，且纳米颗粒递送系统的临床转化可行性尚需进一步评估	阐明肾透明细胞癌中circRNA的m5C修饰机制及其临床意义，探索克服HIF-2α靶向治疗和免疫治疗双重耐药的新策略	肾透明细胞癌患者临床样本、细胞系、小鼠模型	机器学习	肾癌	m5C-MeRIP-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RIP, RNA pull-down, ChIP-qPCR	NA	基因表达数据, 测序数据	临床样本（TCGA、ICGC队列及SYSU队列）	Illumina	单细胞RNA测序, 空间转录组学	Illumina NovaSeq	NA
19	2026-04-23	Construction of ammonia death-related lncRNA prognostic signature model and immunomodulatory effect in glioblastoma multiforme 2026-Jul-01, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2026.150266 PMID:41861940	研究论文	本研究构建了一个与氨死亡相关的lncRNA预后特征模型，并探讨了其在多形性胶质母细胞瘤中的免疫调节作用	首次将氨诱导的细胞死亡（一种不同于凋亡和铁死亡的新机制）相关的lncRNA与GBM预后及免疫微环境联系起来，构建了新型预后特征模型	研究主要基于生物信息学分析和体外细胞验证，缺乏体内实验和临床样本的直接功能验证	探索氨死亡相关lncRNA在GBM中的预后价值，并阐明其代谢-免疫调控机制	多形性胶质母细胞瘤（GBM）患者数据及GBM细胞系	生物信息学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、LASSO-Cox回归分析	LASSO-Cox回归模型	基因表达数据、单细胞转录组数据	TCGA-GBM数据集和独立CGGA队列，以及U-251、U-87 MG人GBM细胞系和正常人星形胶质细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
20	2026-04-11	Silencing Adamts2 attenuates fibroblast-mediated fibrosis and promotes axonal regeneration in an in vitro model 2026-Jul, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112450 PMID:41785981	研究论文	本研究通过单细胞测序分析小鼠脊髓损伤后成纤维细胞的变化，筛选出高表达基因Adamts2，并在体外模型中验证了沉默Adamts2可减弱成纤维细胞介导的纤维化并促进轴突再生	首次利用单细胞测序数据筛选脊髓损伤后成纤维细胞特异性高表达的Adamts2基因，并系统阐明其在调控纤维化和轴突再生中的双重作用机制	研究主要基于体外细胞模型，缺乏体内动物实验的验证	探索通过靶向Adamts2基因来抑制纤维化瘢痕形成、促进脊髓损伤后神经修复的治疗策略	小鼠脊髓成纤维细胞和运动神经元	单细胞组学	脊髓损伤	单细胞RNA测序，RNA干扰	体外TGFβ诱导的成纤维细胞模型，共培养模型	单细胞测序数据，基因表达数据	NA	NA	single-cell RNA-seq	NA	NA