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当前共找到 956 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-30 |
PASSpedia: A Polyadenylation Site Database Across Different Species at Single-cell Resolution
2026-Jun-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf089
PMID:40986375
|
研究论文 | 基于深度学习升级管道SCAPTURE v2，从1330个单细胞RNA-seq数据集中分析七种物种的多聚腺苷酸化位点，构建跨物种单细胞分辨率数据库PASSpedia | 首次在单细胞分辨率下跨七个物种系统性地分析多聚腺苷酸化位点，并开发了SCAPTURE v2管道，利用长读长测序验证单细胞PAS分析准确性，揭示物种间PAS使用偏好差异 | 主要依赖3'标签单细胞RNA-seq数据，可能遗漏非多腺苷酸化转录本信息，跨物种偏好比较未考虑基因表达保守性之外的因素 | 构建跨物种单细胞分辨率的多聚腺苷酸化位点数据库，研究不同物种间的PAS使用偏好 | 七种物种（人类、小鼠等）的1330个已发表3'标签单细胞RNA-seq数据集 | 自然语言处理 | 不适用 | 单细胞RNA测序、长读长测序 | 深度学习（未明确指定具体模型） | 单细胞RNA测序数据 | 1330个单细胞RNA-seq数据集，覆盖七种物种 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 基于3'标签的单细胞RNA-seq数据集 |
| 162 | 2026-06-30 |
Identification of Centrosome Duplication-Related Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy Through Integrative Multi-Omics, Single-Cell Transcriptomics, and Experimental Validation
2026-06-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.047416
PMID:42261922
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研究论文 | 通过整合多组学、单细胞转录组学及实验验证，鉴定肥厚型心肌病中心体复制相关生物标志物 | 首次通过整合多组学和机器学习方法，系统鉴定与HCM相关的心体复制基因，并发现VPS8作为连接内体-溶酶体稳态与免疫重塑的关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 探究中心体复制相关基因在肥厚型心肌病发病机制中的潜在作用及生物标志物 | 肥厚型心肌病相关基因HBEGF和VPS8，重点关注VPS8在心肌细胞中的功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、多组学分析、机器学习和体外功能实验 | 多个机器学习模型（包括差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化） | 转录组数据和单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2026-06-30 |
Integrated multi-technology exploration of the mechanism by which Badushengji San regulates core targets in diabetic foot ulcer
2026-Jun-16, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-026-02469-1
PMID:42298176
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研究论文 | 本研究整合多组学技术探索拫毒生肌散调节糖尿病足溃疡核心靶点的机制 | 首次通过整合转录组、单细胞测序和多种机器学习算法，鉴定糖尿病足溃疡生物标志物并揭示拫毒生肌散的潜在调控机制 | 研究仅基于公共数据库分析和体外实验，缺乏体内机制验证 | 鉴定糖尿病足溃疡潜在生物标志物，并初步探索拫毒生肌散的治疗机制 | 糖尿病足溃疡及拫毒生肌散 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 三个公共数据集（GSE199939, GSE134431, GSE165816） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2026-06-30 |
Human vein-to-artery endothelial cell fate transition is driven by VEGF/ERK activation and PI3K inhibition
2026-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205490
PMID:42290237
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研究论文 | 开发了一种人类多能干细胞分化方案，模拟静脉到动脉的内皮细胞命运转变，并揭示VEGF激活与PI3K抑制是该过程的关键驱动信号 | 首次建立人类静脉到动脉内皮细胞转变的体外分化模型，利用单细胞RNA测序数据对比验证其与胚胎发育中血管生成源动脉内皮细胞的相似性，并明确VEGF/ERK激活和PI3K抑制为最小必需信号 | 未提及该方案的长期稳定性或体内功能验证，可能缺乏与体内复杂微环境的全面对比 | 模拟人类胚胎发育中静脉到动脉内皮细胞的转变过程，明确其关键信号通路 | 人类多能干细胞分化的内皮细胞（静脉和动脉表型）以及公共数据库中人类胚胎单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，分化方案建模 | NA | 转录组数据 | 人类多能干细胞分化模型（未明确样本数）及公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2026-06-30 |
Beyond suppression: the plasticity, dysfunction, and therapeutic reprogramming of regulatory T cells in inflammatory bowel disease
2026-Jun-08, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag067
PMID:42203202
|
综述 | 系统阐述炎症性肠病中调节性T细胞的生物学特征、功能缺陷及新兴治疗策略 | 提出以谱系缺陷性外Treg和耗竭性效应Treg的关键区分为核心的概念框架，并结合多组学洞察重新定义IBD中Treg功能衰竭 | 未对具体治疗策略的临床效果和安全性进行量化比较或荟萃分析 | 阐明IBD中Treg的可塑性、功能障碍及其治疗重编程机制 | 调节性T细胞 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 166 | 2026-06-30 |
Spatial Gene Set Enrichment Analysis with Applications to Spatially Resolved Transcriptomic Data
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729158
PMID:42282725
|
研究论文 | 提出了一种名为spaGSE的贝叶斯层次模型，用于空间通路富集分析，整合空间表达分析与基因集注释 | 通过贝叶斯层次模型引入spike-and-slab先验估计富集系数，并利用逻辑回归将基因空间变异与通路成员关系关联，从而在通路层面捕获空间依赖性 | 未提及具体限制，但可能依赖先验设定和对大规模数据集的扩展性 | 开发可检测空间组织通路并提高可解释性的空间通路富集分析方法 | 空间可变基因及生物学通路 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组测序 | 贝叶斯层次模型（含高斯混合框架、逻辑回归、spike-and-slab先验） | 空间分辨转录组数据 | 四个公共空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 167 | 2026-06-30 |
The HuBMAP Framework for Advancing Data FAIRness
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.728946
PMID:42282748
|
研究论文 | 介绍HuBMAP框架在推动数据FAIR原则实施中的实践与成效 | 发展了跨多种检测类型的社区认可元数据报告标准，并通过端到端元数据工作流实现数据FAIR化 | 未明确提及具体局限性，可能包括依赖社区采纳和标准化基础设施的挑战 | 旨在实现生物医学数据的可查找、可访问、可互操作和可重用（FAIR） | 来自40多个机构的10000多个数据集，涵盖50多种检测类型（如单细胞测序和空间组学） | 其他 | NA | 单细胞测序、空间组学 | NA | 元数据 | 10000多个数据集，来自40多个机构 | 10x Genomics, Illumina, BGI | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学、Illumina NovaSeq测序平台、BGI MGISEQ测序系统 |
| 168 | 2026-06-30 |
Scalable in vivo cardiac functional genomics with compressed AAV-Perturb-seq reveals a common mitochondrial response to perturbation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729445
PMID:42282780
|
研究论文 | 开发压缩AAV-Perturb-seq方法，在目标器官中进行高通量功能基因组学研究，并揭示线粒体转录组的普遍性应激反应 | 发展压缩AAV-Perturb-seq技术，允许每个细胞进行多次随机扰动并通过统计框架解卷积信号，实现在体内扩大的功能基因组规模 | 仅在小鼠心肌细胞中测试了585个基因敲除，可能需要进一步验证跨物种和扰动方式的普适性 | 建立可扩展的体内功能基因组学平台，以直接识别人类疾病的治疗靶点 | 小鼠心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序, 腺相关病毒介导 | 统计解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 585个基因敲除实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-06-30 |
BTK inhibition enhances immunovirotherapy in glioblastoma via tertiary lymphoid structure modulation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729275
PMID:42282778
|
研究论文 | BTK抑制通过调节三级淋巴结构增强胶质母细胞瘤的免疫病毒治疗效果 | 首次发现BTK抑制剂依鲁替尼能通过促进肿瘤浸润三级淋巴结构形成，增强溶瘤单纯疱疹病毒对胶质母细胞瘤的治疗效果 | NA | 探究BTK抑制增强溶瘤病毒疗法抗胶质母细胞瘤效果的机制 | 胶质母细胞瘤细胞、肿瘤浸润髓系细胞、T细胞和三级淋巴结构 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人GBM12异种移植模型和同源GSC005小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 170 | 2026-06-30 |
Modeling the role of urokinase-type plasminogen activator, uPA, and circulating cancer-associated fibroblasts (cCAFs) in breast cancer cell extravasation
2026-06-03, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10411-3
PMID:42234219
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研究论文 | 研究尿激酶型纤溶酶原激活剂（uPA）和循环肿瘤相关成纤维细胞（cCAFs）在乳腺癌细胞外渗过程中的作用 | 首次揭示CAFs通过上调乳腺癌细胞中PLAU/uPA表达促进肿瘤细胞从毛细血管后微静脉外渗至肺实质的机制 | 仅使用小鼠尾静脉模型和三阴性乳腺癌细胞系，未在患者样本中验证uPA/PLAU的临床相关性 | 阐明循环肿瘤相关成纤维细胞如何辅助乳腺癌细胞从血管外渗到肺实质 | 三阴性乳腺癌MDA-MB231细胞、CAF23成纤维细胞、HUVEC内皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据、体外结合实验数据 | 小鼠尾静脉注射模型（未明确样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 未在摘要中明确提及具体平台配置 |
| 171 | 2026-06-30 |
HyperNiche: Learning Heterophilic Cellular Niches with Hypergraph Neural Networks
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728986
PMID:42282514
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研究论文 | 提出HyperNiche，一个基于超图框架的方法，用于从空间转录组数据中建模高阶、异质性的细胞微环境 | 通过兼容性驱动的机制学习以锚点为中心的超边，同时捕获细胞间的同质性和异质性关系，并解耦节点角色为锚点和成员表示，整合空间几何到超边构建中 | 未明确说明 | 建模空间转录组数据中高阶、异质性的细胞微环境，以理解复杂的空间组织结构与肿瘤微环境 | 乳腺癌和肺癌组织微阵列中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肺癌 | 空间转录组学 | 超图神经网络 | 空间转录组数据 | 高多重Xenium空间转录组数据集，来自乳腺癌和肺癌组织微阵列 | NA | 空间转录组学 | Xenium | 高多重Xenium空间转录组学 |
| 172 | 2026-06-30 |
Multi-Scale Genetic and Transcriptomic Analyses Identify Druggable Targets for Epilepsy
2026-Jun, Current medical science
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11596-026-00194-9
PMID:42012806
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研究论文 | 通过整合GWAS、eQTL和单细胞转录组数据，识别癫痫的因果基因及可药物化靶点 | 首次结合大脑bulk和单细胞eQTL数据与GWAS进行孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，识别FGFR3驱动的FGF信号通路为癫痫的关键分子轴 | 研究基于脑组织表达数据，未涵盖其他组织或细胞类型的调控影响 | 利用多尺度遗传和转录组学分析，识别癫痫的可药物化靶点 | 癫痫因果基因（FGFR3、PM20D1、ZNF564、HAGH、CAPN15、CCDC117、DARS1-AS1）及候选化合物Ro-4396686 | 机器学习 | 癫痫 | GWAS, eQTL, scRNA-seq, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位 | NA | 遗传数据, 转录组数据 | 多组公共数据库样本（GWAS、eQTL）及独立RNA-seq队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2026-06-30 |
High-throughput generation of patient-derived cancer stem cells for precision medicine using a microwell-chip platform
2026-Jun, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-026-01957-1
PMID:42129300
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研究论文 | 利用微孔芯片平台从有限乳腺癌临床样本中高通量生成患者来源的肿瘤干细胞，用于精准医疗 | 开发了一种微孔细胞芯片培养平台，能够从少量临床样本（如穿刺活检）中快速、高通量生成均匀的微肿瘤球，并在8天内实现功能性肿瘤干细胞富集和个性化药物测试 | 未明确提及，但可能涉及样本大小限制或临床转化的进一步验证 | 实现从有限临床样本中高通量分离功能性肿瘤干细胞，以推动精准肿瘤学中基于肿瘤干细胞的药物评估 | 乳腺癌患者来源的肿瘤干细胞和微肿瘤球 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2026-06-30 |
Circulating B7H6 is associated with reduced NKp30 receptor expression and improved lung transplant recipient survival
2026-06-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag017
PMID:41738213
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研究论文 | 研究循环B7H6与NKp30受体表达降低及肺移植受者生存率改善的关联 | 首次发现囊性纤维化患者中NKp30受体特异性下调，并揭示可溶性B7H6在肺移植结果中的保护性作用 | 样本量较小，未明确NKp30下调的分子机制 | 探究自然杀伤细胞受体在肺移植受者预后中的作用 | 肺移植受者（囊性纤维化和慢性阻塞性肺疾病患者）及健康供者 | 自然语言处理 | 肺移植排斥、囊性纤维化 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 血浆、外周血单个核细胞 | 6名囊性纤维化受者、6名慢性阻塞性肺疾病受者、7名健康供者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 175 | 2026-06-30 |
Benchmarking plant single cell RNA-sequencing sample processing strategies
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00800-5
PMID:42106556
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研究论文 | 系统比较了植物单细胞RNA测序的样本处理策略，包括原生质体富集技术和scRNA-seq平台 | 首次全面评估了多种原生质体富集技术（传统流式、成像流式、磁珠分选）与不同scRNA-seq平台（10x Chromium、BD Rhapsody）在植物单细胞研究中的表现，并揭示了计算算法对双细胞识别的误判问题 | 研究仅以拟南芥根为模型，未涵盖其他植物组织或物种，且未评估其他scRNA-seq平台（如Smart-seq2） | 优化植物单细胞RNA测序的样本处理流程，提高数据质量 | 拟南芥根细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 拟南芥根样本，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 10x Chromium Single Cell 3', BD Rhapsody Single-Cell Analysis System |
| 176 | 2026-06-30 |
Design of Single-Atom Nanozymes for Precision Treatment of Erectile Dysfunction with Integrated Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524169
PMID:41980199
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和机器学习设计单原子纳米酶用于糖尿病勃起功能障碍的精准治疗 | 提出将单细胞RNA测序与机器学习相结合的数据驱动框架，用于设计具有特定酶模拟活性的单原子纳米酶，实现疾病特异性治疗 | 仅基于已发表研究构建纳米酶数据库，可能未涵盖所有潜在纳米酶类型，且Fe-DMOF的临床转化尚需进一步验证 | 开发一种集成单细胞RNA测序和机器学习的框架，设计用于精准治疗糖尿病勃起功能障碍的纳米酶 | 糖尿病勃起功能障碍患者的海绵体组织样本和细胞 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-06-30 |
Combinatorial and Inducible CRISPRa/i Enables Canalized hiPSC Forward Programming and Iterative Refinement via Single-Cell Genomics
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.31.729073
PMID:42282825
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研究论文 | 开发了一种名为CIRI的组合可诱导CRISPRa/i平台，实现人类iPSC的前向编程和单细胞基因组学迭代优化 | 首次在人类诱导多能干细胞中建立了可编程、可诱导的组合基因调控逻辑平台，实现了多模态调控和高效前向编程 | 未明确提及局限性 | 建立人类干细胞模型中的可编程合成生物学框架，实现高效的前向编程和优化 | 人类诱导多能干细胞及其衍生的心肌器官和骨骼肌细胞 | 机器学习和合成生物学 | NA | CRISPRa/i，单细胞RNA测序 | CRISPRa/i组合调控模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用组合双向导RNA的单细胞RNA测序筛选 |
| 178 | 2026-06-29 |
POLK and KCNK17 as novel candidate genes for type 2 diabetes via stress response and ion channel regulation
2026-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-026-02825-3
PMID:41793632
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别2型糖尿病β细胞功能障碍的新候选基因KCNK17和POLK | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法，从β细胞特异性角度鉴定出POLK和KCNK17作为2型糖尿病的候选致病基因，并揭示了离子转运与应激反应的不同细胞程序 | 未提及明显局限性，但可能受样本量较小（仅17例患者及17例对照）和外部验证仅依赖有限数据集（高糖处理的β细胞系和棕榈酸盐处理的人胰岛RNA-seq数据）的影响 | 识别2型糖尿病β细胞功能障碍的细胞类型特异性致病基因 | 17例2型糖尿病患者和17例健康对照的胰岛单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | 随机森林, XGBoost, SVM, L2正则化逻辑回归 | 单细胞基因表达数据, 全基因组关联研究汇总统计, 表达数量性状位点数据 | 17例2型糖尿病患者和17例健康对照的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-06-28 |
IL4Rα blockade inhibits proliferation of malignant lymphocytes and the immunosuppressive tumor microenvironment of mycosis fungoides
2026-Jun-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015022
PMID:42350047
|
研究论文 | 通过IL4Rα阻断抑制蕈样肉芽肿恶性淋巴细胞增殖及免疫抑制肿瘤微环境 | 首次在晚期MF患者皮肤外植体模型中结合单细胞转录组和机器学习分析，揭示IL4Rα阻断抑制恶性淋巴细胞增殖及多种免疫抑制通路的具体分子机制 | MF患者间广泛的遗传、转录和功能异质性表明需要抑制多个驱动通路并采用个性化治疗策略 | 分析晚期MF皮肤肿瘤微环境中IL4Rα阻断的分子机制 | 晚期MF患者的皮肤肿瘤组织 | 机器学习, 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤（蕈样肉芽肿） | CITE-seq, 单细胞转录组测序, 多色免疫荧光显微镜 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据 | 晚期MF患者样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-06-28 |
Sequential involvement of hypoxia and anti-PD-1 treatment in shaping tumor-regional CD39+CD8+ T cells highlights immunotherapy-resistant features in NSCLC
2026-Jun-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-014940
PMID:42350041
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧和抗PD-1治疗顺序影响非小细胞肺癌中CD39+CD8+ T细胞的区域分布，并与免疫治疗耐药相关 | 首次阐明缺氧和抗PD-1治疗先后塑造肿瘤区域CD39+CD8+ T细胞动态变化，并指出其缺失导致PD-1阻断后功能恢复受损 | 未说明具体样本量及临床验证范围，需进一步验证 | 探索CD39+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗中的分布、动态变化及其与耐药的关系 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者肿瘤微环境中的CD39+CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术, 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 功能性研究 | NA | 图像, 文本, 测序数据 | 独立NSCLC队列（具体数量未在摘要中给定） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |