本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-09-21 |
α-ketoglutarate accumulation orchestrates immunosuppressive metabolic remodeling to drive cetuximab resistance in metastatic colorectal cancer
2026-Jun-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09001-8
PMID:42380087
|
研究论文 | 本研究揭示了EGFR/GDH1/αKG/ALKBH5轴在转移性结直肠癌西妥昔单抗耐药中的关键调控作用,并提出了联合GDH1抑制剂R162的治疗策略 | 首次发现西妥昔单抗通过阻断EGFR对GDH1 Y451位点的磷酸化,稳定GDH1并增加αKG产生,进而通过ALKBH5介导的去m6A修饰重编程肿瘤代谢和免疫微环境,驱动KRAS信号激活和肝转移;提出血αKG可作为疗效监测标志物及GDH1抑制联合治疗新策略 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探寻EGFR的合成致死伴侣,克服转移性结直肠癌西妥昔单抗耐药 | 转移性结直肠癌(mCRC)细胞及临床样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-09-21 |
PCGF1-mediated bivalent promoter remodeling enables NK cell immune evasion in non-small cell lung cancer
2026-Jun-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09003-6
PMID:42380149
|
研究论文 | 该研究揭示了PCGF1通过介导二价启动子重塑抑制细胞因子-细胞因子受体相互作用通路,从而帮助非小细胞肺癌细胞逃避NK细胞免疫杀伤的机制 | 首次发现PCGF1通过驱动二价启动子平衡破坏,沉默免疫信号级联通路,使肿瘤细胞逃避NK细胞介导的免疫,确立了PCGF1作为非小细胞肺癌免疫治疗的表观遗传靶点 | 研究主要基于TCGA队列分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的大规模验证 | 探究PCGF1在非小细胞肺癌免疫逃逸中的作用及其表观遗传调控机制 | 非小细胞肺癌细胞和自然杀伤细胞 | 表观遗传学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 组蛋白修饰分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 基于TCGA队列分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-09-21 |
Single-cell-marker-based subtyping and multi-level analyses uncover the prognostic effects, dysregulations and therapeutic indicative potential of an eight-gene signature in lung adenocarcinoma
2026-Jun-30, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04403-2
PMID:42381064
|
研究论文 | 该研究基于单细胞标记基因对肺腺癌进行亚型划分,并通过多层面分析构建了一个八基因预后特征模型 | 利用单细胞转录组衍生的标记基因对TCGA-LUAD进行NMF聚类分型,发现C1和C2两个亚型在预后、衰老、干性和免疫治疗反应方面存在显著差异,并构建了具有预后、诊断和治疗指示潜力的八基因特征 | 未明确说明单细胞数据集的样本量大小,八基因特征的外部验证数据集数量有限,药物敏感性关联仅在细胞系中探索,缺乏临床药物试验验证 | 识别肺腺癌可靠的预后和治疗标志物,揭示单细胞水平下的分子异质性及其临床意义 | 肺腺癌(LUAD)患者样本、TCGA-LUAD数据集、LUAD细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质组学, 免疫组化 | LASSO-Cox回归, 非负矩阵分解(NMF)聚类 | 图像, 文本 | TCGA-LUAD数据集样本(具体数量未在摘要中说明),LUAD细胞系若干 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-09-21 |
Transcriptional analyses identify pericyte-centered signaling programs altered by sex and brain region in Alzheimer's Disease
2026-Jun-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10446-y
PMID:42260160
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和细胞间通讯分析,揭示了阿尔茨海默病中周细胞转录和信号传导变化在性别和脑区间的差异 | 首次系统描绘了AD中周细胞信号程序在性别和脑区(MTG和DLPFC)的特异性改变,发现女性AD中MTG特异上调的周细胞-内皮TGFβ信号、下调的雌激素通路及周细胞-星形胶质细胞相互作用,以及小胶质细胞-周细胞的缺氧和p53通路富集 | 研究基于转录组和通讯预测,缺乏功能验证实验;样本量有限,可能影响统计效力;空间转录组仅提供间接支持 | 探究阿尔茨海默病中周细胞在性别差异和脑区特异性方面的转录和信号传导变化 | 阿尔茨海默病患者和非AD供体的脑组织(中颞回和背外侧前额叶皮层) | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 105 | 2026-09-21 |
Loss of miR-29a/b1 Cluster Reprograms the Tumor Microenvironment and Contributes to Immunosuppression in Lung Cancer
2026-Jun-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1060
PMID:41739590
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序发现miR-29a/b1簇的缺失会重编程肺癌肿瘤微环境,并通过调控ATX等靶基因导致免疫抑制,从而影响免疫检查点抑制剂的疗效 | 首次揭示miR-29a/b1簇缺失通过调控Enpp2/ATX表达重编程肿瘤微环境,促进免疫抑制并导致抗PD-1耐药;重新表达miR-29可逆转耐药表型,增加CD8+ T细胞浸润并减少抑制性Ly6C+单核细胞 | 研究主要基于Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型,人类肺癌患者的验证仅依赖于公共RNA-seq数据的关联分析,缺乏直接的功能性验证实验;miR-29调控ATX的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究肺癌对抗PD-1免疫检查点抑制剂产生获得性或内在耐药的分子机制,特别是miR-29a/b1簇在肿瘤微环境重编程和免疫抑制中的作用 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型(具有抗PD-1获得性或内在耐药性)及公共肺腺癌患者RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-09-21 |
RENAL-CHIP: Rejection Evaluation via Non-Invasive Analysis of Circulating Podocytes With Herringbone-Chip Isolation Platform
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520426
PMID:41849694
|
研究论文 | 该研究开发了一种基于人字形微流控芯片的非侵入性方法,通过检测供体来源的循环足细胞(CPCs)来评估肾移植急性排斥反应 | 首次将供体来源的循环足细胞(CPCs)鉴定为急性排斥反应的血源性替代标志物,并开发了磁可逆人字形微流控芯片(Herringbone-Chip),结合EpCAM抗体功能化磁珠高效分离CPCs,实现了非侵入性、高精度的肾移植排斥反应检测 | 样本量较小(65名参与者),单细胞RNA-seq仅对10个分离的CPCs进行分析,需要更大规模的多中心验证研究来确认CPC计数的临床实用性 | 开发一种非侵入性、精确的肾移植急性排斥反应诊断方法,通过检测血液中供体来源的循环足细胞来替代传统的活检诊断 | 65名肾移植受者(包括活检确诊排斥反应的患者和稳定患者),以及性别不匹配移植受者的样本 | 数字病理学, 机器学习 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA-seq, 荧光原位杂交(FISH), 微流控芯片分离技术 | NA | 血液样本, 图像, 文本(基因表达数据) | 65名参与者,10个分离的CPCs用于单细胞RNA-seq,1 mL外周血样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台用于单细胞RNA测序分析 |
| 107 | 2026-09-21 |
scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524397
PMID:41869876
|
研究论文 | 该文章提出了 scResponse,一种基于秩的算法,通过单细胞数据量化单细胞对免疫治疗的响应,从而识别影响免疫治疗疗效的细胞状态 | 提出了一种高效的基于秩的算法 scResponse,能够在单细胞分辨率上评估免疫治疗疗效,捕捉不同细胞亚型和状态对疗效的细微影响,并发现了与响应状态相关的关键代谢通路,包括乙醛酸和二羧酸代谢的免疫治疗增敏作用以及视黄醇代谢的抑制作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种在单细胞分辨率上评估免疫治疗疗效的稳健方法,并揭示驱动不同治疗结果的细胞状态及机制 | 多种癌症的单细胞测序数据,包括血管细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞等 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 基于秩的算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-09-20 |
Spatial transcriptomics in cancer research: insights into tumorigenesis, diagnosis and therapeutics
2026-Jun-30, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03092-0
PMID:42380096
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在癌症研究中的应用,涵盖肿瘤发生、诊断和治疗,强调了其在理解肿瘤微环境和异质性方面的作用 | 系统总结了空间转录组学在肿瘤发生、诊断、治疗和预防中的突破性应用,突出其在揭示肿瘤微环境和免疫逃逸机制方面的独特优势 | 摘要未提及具体局限性 | 探讨空间转录组学在癌症研究中的应用,包括肿瘤发生、诊断和治疗 | 癌症组织及其微环境 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-09-20 |
Machine learning reveals X chromosome transcriptional signatures that classify systemic lupus erythematosus in females
2026-Jun-30, BMC rheumatology
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41927-026-00669-1
PMID:42381053
|
研究论文 | 利用机器学习分析228名女性供体的110万个外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据,发现X染色体基因表达特征能够以细胞类型特异的方式分类女性系统性红斑狼疮 | 首次利用机器学习在单细胞水平上证明X染色体基因表达特征能够以细胞类型特异性方式分类女性系统性红斑狼疮,并发现该特征富集于XCI逃逸基因,在CD8+ T细胞中具有稳定可重复的分类性能 | 仅分析了公共scRNA-seq数据集,IL2RG蛋白表达增加仅为适度水平,需要更大规模的前瞻性队列验证X染色体转录特征在SLE中的临床实用性 | 探究X染色体基因表达能否以细胞类型特异的方式对女性系统性红斑狼疮进行分类,并解析性染色体在自身免疫疾病中的贡献 | 228名女性供体的外周血单个核细胞,包括系统性红斑狼疮患者和健康对照,以及一个独立的儿童-成人SLE验证队列 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 集成分类器 | 单细胞转录组数据 | 228名女性供体的110万个细胞(发现队列),以及一个独立的儿童-成人SLE验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 110 | 2026-09-20 |
Exploring LTB-mediated T cell differentiation as a prognostic marker in triple-negative breast cancer
2026-Jun-30, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02332-6
PMID:42381077
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞数据分析,对三阴性乳腺癌的免疫浸润表型进行分类,并构建预后模型,探讨LTB介导的T细胞分化作为预后标志物的作用 | 首次通过无监督聚类识别三阴性乳腺癌的两种免疫浸润表型,并发现LTB主要在免疫浸润T细胞中表达,促进其向细胞毒性T细胞分化,增强免疫效应 | 未提及 | 探索三阴性乳腺癌中免疫浸润的表型分类及其关键调控机制,并评估LTB介导的T细胞分化作为预后标志物的潜力 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织及转录组和单细胞测序数据 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 转录组测序,单细胞测序 | 无监督聚类 | 转录组数据,单细胞数据 | 来自GEO和METABRIC数据库的转录组和单细胞数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-09-20 |
Integrated multi-omics analysis reveals folate metabolism-related genes as prognostic markers and therapeutic targets in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jun-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16397-1
PMID:42374231
|
研究论文 | 该研究通过整合转录组学和临床数据,构建并验证了一个叶酸代谢相关基因评分系统,用于透明细胞肾细胞癌患者的预后分层和免疫表型分析,并验证了NGF基因的功能作用 | 首次构建了基于叶酸代谢相关基因的评分系统用于透明细胞肾细胞癌的预后分层和免疫治疗反应预测,结合了单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了NGF的空间异质性表达,并通过体外实验验证了NGF促进肿瘤增殖、迁移和侵袭的功能 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 开发和验证叶酸代谢相关基因评分系统,对透明细胞肾细胞癌患者进行预后风险和免疫表型分层,并探索关键叶酸代谢相关基因在肿瘤进展中的功能作用 | 透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤样本 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 临床数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 转录组测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-09-20 |
ESR1 mutations and CDK4/6 inhibitor choice shape clonal selection and adaptive cell states during acquired resistance
2026-Jun-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01690-2
PMID:42365380
|
研究论文 | 该研究通过高复杂度DNA条形码追踪和多组学分析,揭示了ESR1突变状态和不同CDK4/6抑制剂(哌柏西利 vs 阿贝西利)如何影响ER+乳腺癌获得性耐药过程中的克隆选择和适应性细胞状态重塑 | 首次在同基因MCF7模型(WT ER vs Y537S突变ER)中结合高复杂度DNA条形码(ClonTracer)纵向采样与多组学分析,系统解析CDK4/6i获得性耐药中ESR1突变对克隆演化和细胞状态的独立影响,并揭示不同CDK4/6i(哌柏西利与阿贝西利)施加不同选择性压力导致 divergent 耐药状态,同时通过体内条形码追踪揭示转移与耐药亚克隆的部分重叠 | 研究主要基于MCF7同基因细胞模型和异种移植模型,可能无法完全反映临床肿瘤微环境和免疫系统的影响;临床样本量有限;未涉及其他CDK4/6i药物;分子机制层面的深入验证有待进一步研究 | 探究ESR1突变状态和不同CDK4/6抑制剂在ER+乳腺癌获得性耐药过程中对克隆动态、细胞状态和细胞可塑性的影响,以及不同CDK4/6i是否施加不同的选择压力和产生不同的耐药状态 | 同基因MCF7乳腺癌细胞模型(表达野生型ER或Y537S突变ER)、CDK4/6i耐药的临床肿瘤样本、乳腺异种移植小鼠模型(包括局部复发和远处转移灶) | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | 高复杂度DNA条形码追踪(ClonTracer文库), 单细胞RNA测序, 多组学分析, 纵向采样 | NA | 图像, 文本 | 同基因MCF7细胞模型(WT ER和Y537S突变ER)、CDK4/6i耐药临床肿瘤样本(配对活检)、乳腺异种移植小鼠模型(包括原发灶、局部复发和远处转移灶) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 113 | 2026-09-20 |
Mavacamten alleviates sepsis-induced acute respiratory distress syndrome by modulating the PI3K/AKT/autophagy axis: a spatial transcriptomic-guided investigation
2026-Jun-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08431-4
PMID:42374449
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术绘制脓毒症肺组织的分子图谱,并通过计算药物筛选鉴定出Mavacamten,验证其通过调控PI3K/AKT/自噬轴缓解脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征 | 首次将空间转录组学与计算药物筛选相结合来发现脓毒症诱导ARDS的治疗药物,揭示了Mavacamten通过抑制PI3K/AKT通路并恢复保护性自噬发挥治疗作用的新机制 | 研究仅在小鼠CLP模型中验证,尚未进行人体临床试验,Mavacamten在人类脓毒症ARDS患者中的疗效和安全性仍需进一步研究 | 利用空间转录组学绘制脓毒症肺组织的分子景观,以识别并验证新型治疗药物 | 小鼠肺组织、脂多糖刺激的小鼠肺泡上皮细胞、CLP脓毒症小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征 | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 小鼠肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-09-20 |
Identification and validation of SPP1 as a prognostic biomarker in interstitial lung disease subtypes by single-cell sequencing
2026-Jun-24, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03788-y
PMID:42337746
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定SPP1为间质性肺疾病亚型的预后生物标志物,并在血清样本中进行验证 | 首次通过单细胞测序在间质性肺疾病中鉴定SPP1,并在两个独立的间质性肺疾病队列中验证其作为预后生物标志物的价值 | 单细胞测序样本量较小(仅3例IPF患者和3例对照),血清验证队列规模有限,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 | 鉴定和验证间质性肺疾病亚型的预后生物标志物,用于风险分层和预后评估 | 特发性肺纤维化患者、特发性炎症性肌病相关间质性肺疾病患者及健康对照者的肺组织和血清样本 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据、临床数据 | 单细胞测序:3例IPF患者和3例对照的肺组织;血清验证:74例IPF患者、92例IIM-ILD患者和56例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-09-20 |
H3K18 lactylation promotes allergic airway inflammation in asthma via a CSF1/CSF1R/MAPK autocrine axis
2026-Jun-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03781-5
PMID:42337539
|
研究论文 | 该研究揭示了糖酵解驱动的组蛋白H3K18乳酸化通过CSF1/CSF1R/MAPK自分泌轴促进哮喘气道炎症的机制 | 首次发现H3K18乳酸化在CSF1R启动子区富集并直接增强其转录,建立了糖酵解-组蛋白乳酸化-CSF1R信号轴,将气道上皮细胞代谢重编程与持续性炎症基因激活联系起来 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探究气道上皮细胞代谢重编程驱动哮喘炎症的机制,特别是组蛋白乳酸化在其中的作用 | 哮喘患者的气道上皮细胞及临床标本 | 机器学习 | 哮喘 | scRNA-seq, ChIP-seq, RNA-seq, western blotting, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-09-19 |
Hypoxic CA9-high mesenchymal-like glioma stem cells promote ANXA1-FPR1-dependent macrophage polarization in recurrent glioblastoma
2026-Jun-29, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03905-0
PMID:42374432
|
研究论文 | 该研究整合公共转录组队列、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、配对临床标本及体内外功能实验,揭示缺氧诱导的CA9高表达间充质样胶质瘤干细胞通过ANXA1-FPR1轴促进复发性胶质母细胞瘤中免疫抑制性巨噬细胞极化 | 首次在单细胞分辨率下将CA9定位于复发性胶质母细胞瘤中缺氧相关MES样胶质瘤干细胞亚群,并揭示CA9-ANXA1-FPR1神经免疫串扰轴连接缺氧干性肿瘤状态与髓系重塑 | ANXA1被定位为贡献性旁分泌介质而非CA9驱动免疫抑制的唯一效应因子,其完整下游机制及治疗靶向价值仍需进一步验证 | 阐明CA9在复发性胶质母细胞瘤中的细胞状态特异性分布及其在胶质瘤干细胞-巨噬细胞串扰中的作用 | 复发性胶质母细胞瘤患者临床标本、胶质母细胞瘤细胞系及患者来源胶质瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、qRT-PCR、Western blotting、ELISA、启动子报告基因实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、图像 | 公共转录组队列及配对临床标本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-09-19 |
Single-cell profiling of gastric cancer ascites reveals an epithelial-immune dual phenotype signature predictive for anti-PD-1 immunotherapy responses
2026-06-29, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-05017-1
PMID:42374437
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组和TCR/BCR免疫组库分析胃癌恶性腹水与外周血的免疫景观,发现具有上皮-免疫双重表型的EIDPC细胞群,并构建IRS-EIDPC特征用于预测抗PD-1免疫治疗反应 | 首次鉴定出具有上皮-免疫双重表型的EIDPC细胞群,并基于其10个核心基因构建了能够准确预测抗PD-1治疗反应和预后的IRS-EIDPC特征(AUC达0.929) | 样本量较小(仅10例患者),需要更大规模的独立队列进一步验证EIDPC的生物学功能和IRS-EIDPC特征的临床适用性 | 揭示胃癌恶性腹水的免疫景观,鉴定预测抗PD-1免疫治疗反应的生物标志物 | 10例晚期胃癌患者的配对恶性腹水样本和外周血单个核细胞(PBMC)样本,以及独立胃癌临床队列 | 数字病理学, 机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组测序, TCR/BCR免疫组库分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 文本 | 10例晚期胃癌患者的配对恶性腹水和外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-09-19 |
Inferring genetic associations of programmed cell death genes with retinitis pigmentosa through multimodal Mendelian randomization
2026-Jun-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01547-9
PMID:42365225
|
研究论文 | 该研究通过整合多模态数据(GWAS、eQTL/pQTL、转录组数据),利用孟德尔随机化等方法推断程序性细胞死亡相关基因与视网膜色素变性的遗传关联 | 首次通过整合多模态框架(GWAS、eQTL/pQTL、bulk和单细胞RNA-seq)系统性地推断程序性细胞死亡相关基因与视网膜色素变性的遗传因果关系,并结合多种验证方法(SMR、贝叶斯共定位、MVMR、PheWAS)确保结果稳健性 | 研究主要基于公开数据库的汇总统计数据,缺乏实验验证;样本主要来自欧洲人群,可能存在人群特异性限制;未进行功能实验验证所识别的核心基因在RP发病中的具体机制 | 通过整合多模态框架识别程序性细胞死亡相关基因在视网膜色素变性发病中的遗传作用,并寻找新的治疗靶点 | 程序性细胞死亡相关基因、视网膜色素变性、视网膜转录组 | 机器学习, 数字病理学 | 视网膜色素变性 | GWAS, eQTL, pQTL, 孟德尔随机化, SMR, 贝叶斯共定位, MVMR, PheWAS, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | CIBERSORT | 文本, 图像 | 三个GWAS汇总统计数据集(ebi-a-GCST90018912、ebi-a-GCST90013904、ebi-a-GCST90013954),bulk转录组数据集GSE62020,单细胞转录组数据集GSE183206 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, GWAS, eQTL, pQTL | NA | NA |
| 119 | 2026-09-19 |
Identification of a long-term surviving human mesenchymal stromal cell subpopulation and implications for recessive dystrophic epidermolysis bullosa treatment
2026-Jun-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05101-6
PMID:42365332
|
研究论文 | 该研究通过体外预处理人骨髓间充质干细胞并注射到免疫缺陷小鼠体内,利用单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定了一个能长期存活的间充质干细胞亚群,并探讨其对隐性营养不良型大疱性表皮松解症治疗的启示 | 首次鉴定出注射后能存活长达54至61周的人骨髓间充质干细胞亚群,并发现该亚群独立于体外预处理条件而预先存在于注射群体中 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;样本来源限于健康供体,未涉及RDEB患者细胞;体外预处理策略未能显著改善干细胞存活率 | 优化人骨髓间充质干细胞的体外培养条件,以提高其在局部注射后的存活率,从而改善隐性营养不良型大疱性表皮松解症的治疗效果 | 健康人类供体来源的骨髓间充质干细胞及免疫缺陷小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 慢病毒转导, 体内生物发光成像 | NA | 图像, 文本 | 来自健康人类供体的骨髓间充质干细胞,注射到免疫缺陷小鼠中,具体样本数未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 120 | 2026-09-19 |
A single-cell transcriptomic atlas of the pigtail macaque placenta in late gestation
2026-Jun-26, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-13095-x
PMID:42363068
|
研究论文 | 该研究构建了妊娠晚期猪尾猕猴胎盘的多个母胎界面组织的单细胞转录组图谱 | 首次在妊娠晚期对猪尾猕猴胎盘的三个母胎界面组织(绒毛膜绒毛、绒毛膜羊膜和母体蜕膜)进行深度单细胞RNA测序,并系统比较其与人类胎盘的细胞组成相似性 | 仅涉及单一时间点(妊娠晚期),未涵盖妊娠早期和中期,且样本量有限 | 构建非人灵长类(猪尾猕猴)胎盘的妊娠晚期单细胞转录组图谱,以理解母胎界面细胞群体的组成,并为研究人类妊娠并发症提供参考 | 猪尾猕猴(Macaca nemestrina)妊娠晚期的胎盘组织,包括绒毛膜绒毛(胎盘盘)、绒毛膜羊膜和母体蜕膜 | 单细胞转录组学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | Seurat | 单细胞转录组数据 | 三种母胎界面组织(绒毛膜绒毛、绒毛膜羊膜、母体蜕膜),具体细胞数未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 未在摘要中提供详细配置信息 |