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当前共找到 1083 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2026-05-31 |
Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Uncover Distinct Fibroblast-Macrophage Crosstalk in Human Hip Synovium Between Patients With Femoroacetabular Impingement and Osteoarthritis
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70033
PMID:41524472
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示股骨髋臼撞击症与骨关节炎患者人类髋关节滑膜中独特的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 | 首次在髋关节滑膜中识别出EREG+衬里成纤维细胞与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞之间的FGF2-SDC4特异性相互作用，并发现EREG+CCL20+MMP3hi衬里成纤维细胞是髋关节骨关节炎特有的细胞类型 | 样本量较小（每种疾病6例），且未进行功能验证实验来确认FGF2-SDC4相互作用的因果关系 | 探究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎中滑膜细胞组成、转录组谱及细胞-细胞相互作用的改变 | 股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的髋关节滑膜组织 | 自然语言处理 | 骨关节炎, 股骨髋臼撞击症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 伪时间分析 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 12例（每组6例，性别匹配） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 982 | 2026-05-31 |
A systems biology framework uncovers multi-level genetic regulation of dizziness/vertigo through eQTL-GWAS integration and single-cell analysis
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2627258
PMID:41640369
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研究论文 | 通过整合eQTL-GWAS和单细胞分析，构建系统生物学框架揭示头晕/眩晕的多层次遗传调控机制 | 首次将GWAS与脑单细胞类型、免疫细胞等多种组织的eQTL数据整合，并结合听觉神经单细胞RNA测序来解析头晕/眩晕的因果基因和细胞类型特异性调控网络 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于样本来源的异质性和因果推断的统计效力 | 阐明头晕/眩晕的分子遗传机制并发现潜在治疗靶点 | 头晕/眩晕的遗传因果基因及其在单细胞类型中的表达调控 | 机器学习 | 神经系统疾病 | eQTL分析、GWAS、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、基因-基因相互作用网络、药物靶点筛选 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、文本数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于听觉神经单细胞转录组分析 |
| 983 | 2026-05-31 |
Integrating bulk and single-cell transcriptome profiling to uncover diagnostic biomarkers and regulatory mechanisms of oxidative stress in spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00693
PMID:41673791
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研究论文 | 整合批量转录组和单细胞转录组分析，揭示脊髓损伤中氧化应激的诊断标志物和调控机制 | 首次通过整合批量与单细胞转录组数据，系统识别脊髓损伤中与氧化应激相关的诊断标志物、动态表达模式及调控网络，并筛选潜在治疗药物 | 仅基于GEO数据库的人类血液样本和小鼠脊髓组织数据，缺乏独立临床队列验证；结果需进一步在人体组织中确认 | 探索氧化应激相关基因在脊髓损伤中的表达与调控机制，以改善诊断和治疗 | 人类血液样本（来自GEO数据库）和损伤小鼠脊髓组织 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 脊髓损伤 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 定量聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的人类血液样本和损伤小鼠脊髓组织（具体样本量未提及） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 984 | 2026-05-31 |
Single-Cell Analysis Reveals Peripheral Helper T Cells in Rheumatoid Arthritis-Related Interstitial Lung Disease
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70066
PMID:41629202
|
research paper | 通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎相关间质性肺病的细胞和转录组特征，发现外周辅助T细胞在疾病中的独特作用 | 首次揭示类风湿关节炎相关间质性肺病肺部存在外周辅助T细胞，并发现肺组织Tph细胞与滑膜Tph细胞在激活、细胞毒性和耗竭特征上存在器官特异性差异 | NA | 阐明类风湿关节炎相关间质性肺病的上皮细胞和免疫细胞的细胞及转录组景观 | 类风湿关节炎相关间质性肺病患者的肺组织上皮细胞和免疫细胞 | machine learning | 类风湿关节炎相关间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名对照者、3名非类风湿关节炎结缔组织病相关间质性肺病患者和5名类风湿关节炎相关间质性肺病患者的肺组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 荧光激活细胞分选后对上皮细胞和免疫细胞进行单细胞RNA测序 |
| 985 | 2026-05-31 |
SMAD7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension Via the TGF-β1-SMAD2/3 Pathway
2026-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002832
PMID:41886369
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组测序、蛋白质组学和孟德尔随机化方法，探讨SMAD7通过TGF-β1-SMAD2/3通路调控肺动脉高压中铁死亡的机制 | 首次揭示SMAD7作为铁死亡负调控因子参与肺动脉高压肺血管重塑，并整合多组学与孟德尔随机化方法提供多层次证据 | 仅提供初步证据，需进一步验证SMAD7在不同PAH模型中的普适性及长期治疗效果 | 阐明肺动脉高压中铁死亡的调控机制及SMAD7的作用 | 肺动脉内皮细胞、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、PAH大鼠模型和缺氧诱导的PAEC模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学、孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 单细胞转录组测序数据（具体数量和来源未提供）、大鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 986 | 2026-05-31 |
Innate lymphoid cells in rheumatoid arthritis as mediators of pathology and resolution
2026-Jun, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-026-01375-5
PMID:42115769
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研究论文 | 探讨先天淋巴样细胞在类风湿关节炎中作为病理和缓解中介的作用 | 首次系统综述ILC亚群在RA中的双重作用，包括ILC3促进炎症和ILC2促进修复，并探讨CAR-ILC2等新型细胞疗法 | 该领域仍处于临床前阶段，缺乏大规模临床验证 | 阐明先天淋巴样细胞在类风湿关节炎病理与缓解中的调控机制及治疗潜力 | 先天淋巴样细胞及其亚群（ILC2、ILC3、LTi细胞） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 高维免疫表型分析、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 987 | 2026-05-30 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-06, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70277
PMID:41853894
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示I型干扰素信号驱动镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系偏向性分化的机制 | 首次阐明I型干扰素异常激活是镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系分化的核心驱动因素，并发现G-CSF受体CSF3R上调导致单核细胞谱系偏向性生成 | 未涉及体内模型验证以及长期治疗对造血系统其他谱系的影响 | 探究镰状细胞贫血中中性粒细胞和单核细胞持续增高的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞转录组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 988 | 2026-05-30 |
SYT8 Drives Colorectal Cancer Progression and Immune Evasion via the SETD1A-H3K4me3 Axis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.006
PMID:41881308
|
研究论文 | 通过整合多组学数据，发现SYT8在结直肠癌中上调并通过SETD1A-H3K4me3轴驱动肿瘤进展和免疫逃逸 | 首次揭示SYT8通过与SETD1A互作形成正反馈回路，增强H3K4me3修饰并激活促肿瘤基因转录 | NA | 探究SYT8在结直肠癌进展和免疫逃逸中的作用及分子机制 | 结直肠癌肿瘤细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,免疫荧光,免疫共沉淀/质谱分析 | NA | 转录组数据,单细胞转录组数据 | TCGA、GEO数据库及自建结直肠癌队列的多组样本 | Illumina | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 989 | 2026-05-29 |
Machine learning identifies key cells and therapeutic targets during ferroptosis after spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00037
PMID:39104165
|
研究论文 | 利用机器学习识别脊髓损伤后铁死亡过程中的关键细胞及治疗靶点 | 首次通过机器学习算法（随机森林和LASSO）从转录组数据中筛选出Atf3和Piezo1作为脊髓损伤后铁死亡的关键基因，并结合单细胞RNA测序揭示其与巨噬细胞/小胶质细胞状态转变的密切关系，验证了低剂量环己酰亚胺的治疗效果 | 未提及明显局限性 | 探索脊髓损伤后铁死亡的细胞机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤后的巨噬细胞/小胶质细胞及其铁死亡相关基因表达 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | 随机森林, LASSO | 批量RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE47681、GSE5296批量RNA测序数据及GSE162610单细胞RNA测序数据；小鼠T8脊髓损伤模型 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 990 | 2026-05-29 |
RBAD: The first database dedicated alterations of blood RNA in individuals with Alzheimer's disease and their clinical relevance
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01165
PMID:40145964
|
研究论文 | 开发了首个专注于阿尔茨海默病患者血液RNA变化的数据库RBAD，并分析了其临床相关性 | 首次构建了基于1468例血样、涵盖多种RNA测序数据的阿尔茨海默病血液RNA数据库，并整合了超过11百万次比较与关联分析 | 未在摘要中明确说明局限性 | 探究阿尔茨海默病患者血液RNA变化及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者及小鼠模型的血液样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, microRNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 1468例血液样本（来自人类和小鼠研究） | NA | bulk RNA-seq, microRNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 991 | 2026-05-29 |
Single-cell RNA sequencing of the post-spinal cord injury dorsal root ganglia in cynomolgus monkeys: Elucidation of the cellular immune microenvironment of the central nervous system
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00974
PMID:40145972
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术对食蟹猴脊髓损伤后背根神经节的细胞免疫微环境进行全面分析 | 首次对食蟹猴脊髓损伤后背根神经节进行全面的转录组分析，涵盖几乎所有细胞类型，并揭示了巨噬细胞亚群在轴突再生中的调控作用 | 研究基于食蟹猴模型，可能不完全适用于人类；部分细胞亚群的功能仍需进一步实验验证 | 阐明脊髓损伤后背根神经节免疫细胞微环境的变化及其对轴突再生的影响机制 | 食蟹猴中胸段挫伤模型后的背根神经节和脊髓组织 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA-seq | 降维聚类分析、细胞轨迹分析、伪时间分析、配体-受体对分析 | 单细胞转录组数据 | 食蟹猴中胸段挫伤模型（具体样本数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 992 | 2026-05-29 |
Modulation of mitochondrial dysfunction: Mechanisms and strategies for the use of natural products to treat stroke
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00016
PMID:40618255
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综述 | 系统综述了天然产物通过调控线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制与策略 | 首次系统总结了天然产物通过多靶点调控线粒体生物合成、动力学平衡、自噬、凋亡、氧化应激及细胞间线粒体转运等机制发挥神经保护作用的证据，并提出结合单细胞测序和类器官模型等新技术的研究方向 | 成分复杂性导致标准化困难、跨区域临床数据不足、缺乏长期安全性评估，临床转化面临挑战 | 阐明天然产物通过靶向线粒体功能障碍治疗脑卒中的分子机制，为开发新型抗卒中药提供理论支持 | 线粒体功能障碍的动态调控过程（包括线粒体生物合成、融合/分裂、线粒体自噬、凋亡、氧化应激及细胞间线粒体转运）及天然产物（如虫草、羟基红花黄色素A、人参皂苷Rb3、绞股蓝皂苷XVII、银杏内酯K、灯盏花素、大黄酚） | 自然语言处理 | 脑卒中 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 993 | 2026-05-29 |
scIMGCN: an Automatic Single-Cell Type Annotation Method Based on Interpretable Graph Convolutional Network
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00738-y
PMID:40682757
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研究论文 | 提出一种基于可解释图卷积网络的单细胞类型自动注释方法scIMGCN | 通过网络增强技术提升图结构表示，使用改进的Transformer模块解决长程依赖问题，基于KAN的GCN变体增强特征表示和非线性，以及引入可解释性掩码机制提高模型透明度 | 未提供明显局限性说明 | 开发一种自动、高精度且可解释的单细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络、Transformer、KAN | 基因表达数据 | 十个真实数据集（未具体说明样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 994 | 2026-05-29 |
Clustering Single-Cell RNA-Seq Data with Low-Rank Matrix Factorization and Local Graph Regularization
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00762-y
PMID:40897868
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研究论文 | 提出一种结合低秩矩阵分解与局部图正则化的单细胞RNA测序数据聚类算法 | 采用三分解策略得到对齐核心矩阵，并通过局部流形正则化项在低维空间中表征细胞间距离，使用Schatten p-范数替代核范数以增强对噪声和异常值的鲁棒性，最后应用角度对齐策略获得相似矩阵 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和鲁棒性，以准确识别细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 低秩矩阵分解、局部图正则化 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 995 | 2026-05-29 |
Interpretable Multi-task Analysis of Single-Cell RNA-seq Data Through Topological Structure Preservation and Data Denoising
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00765-9
PMID:41023370
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研究论文 | 提出一个名为scIMTA的可解释多任务分析框架，用于单细胞RNA-seq数据的拓扑结构保持和数据降噪 | scIMTA实现了稀疏高噪声基因表达数据的协同多任务分析，通过生物学基础增强可解释性，并在保持数据完整性的同时稳健处理丢失事件 | 未提及具体局限 | 开发一个可解释的多任务分析框架，解决单细胞RNA-seq数据中的拓扑结构保持和丢失事件问题 | 乳腺癌单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 996 | 2026-05-29 |
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2026-Jun, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70154
PMID:41195968
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示mogamulizumab相关皮肤疹中的抗淋巴瘤免疫反应 | 首次对mogamulizumab相关皮疹进行全面的分子表征，发现残余恶性克隆呈现沉默免疫表型，并伴随潜在的抗肿瘤免疫反应 | 样本量较小（仅4例MAR患者），未明确说明机制验证实验 | 阐明mogamulizumab相关皮疹的分子特征及其与更好总生存期的关联机制 | mogamulizumab相关皮疹患者的皮肤活检组织 | 单细胞测序 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4例MAR患者，6例未治疗红皮病性CTCL患者，4例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 997 | 2026-05-29 |
Heterogeneity of the adult mammalian forebrain neurogenic ependyma: A comprehensive cellular map
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00789
PMID:40819302
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建成年小鼠前脑室管膜表面的完整细胞图谱，揭示其细胞异质性 | 首次通过全组织单细胞RNA测序系统鉴定成年小鼠前脑室管膜表面的12种不同细胞亚型，并精细刻画了CD133+与CD133-细胞的分子特征分类 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未探讨不同细胞亚型的功能差异及神经干细胞潜能的具体机制 | 阐明成年哺乳动物前脑室管膜细胞的组成异质性，为解决神经干细胞存在争议提供新视角 | 成年小鼠前脑侧脑室侧壁的室管膜表面细胞 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠的侧脑室侧壁整体组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 998 | 2026-05-29 |
Characterization of p16-positive stromal cells in age-related cardiac disorders
2026-Jun-01, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvag013
PMID:41705475
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析衰老心脏中p16阳性基质细胞的特征及其在心脏纤维化中的作用 | 首次利用p16-Tom小鼠模型在单细胞水平上表征p16阳性成纤维细胞在年龄相关心脏纤维化中的转录组特征，并证明选择性清除这些细胞可减轻纤维化 | 未提供 | 探究p16阳性基质细胞在年龄相关心脏疾病中的功能与机制 | 衰老p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 999 | 2026-05-29 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Jun, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高精子运动能力鹅的睾丸细胞异质性，发现内分泌-代谢支持及轴丝组装增强与精子运动能力相关 | 首次在鹅中利用单细胞转录组学解析精子运动能力差异的细胞基础，发现支持细胞和间质细胞的内分泌-代谢增强及圆形精子的轴丝组装程序上调 | 样本量较小（每组3只），且仅关注生理范围内的精子运动能力差异，未涉及极端低活力情况 | 探究鹅精子运动能力差异的睾丸细胞和分子基础 | 60只鹅中精子运动能力最高和最低的10%各6只，其中3只用于单细胞RNA测序 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 12只鹅用于表型比较，6只用于单细胞测序 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 1000 | 2026-05-29 |
stGNN: Spatially Informed Cell-Type Deconvolution Based on Deep Graph Learning and Statistical Modeling
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00728-0
PMID:40571903
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研究论文 | 提出基于深度图学习和统计建模的stGNN方法，用于空间转录组数据的细胞类型反卷积 | 创新性地结合图卷积网络与自编码器的双编码模块，以及自适应注意力机制，从低阶到高阶捕捉多尺度空间结构；采用负对数似然损失函数对齐ST与scRNA-seq参考数据的分布 | 依赖性于高质量scRNA-seq参考数据；未明确讨论计算效率或大规模数据扩展性 | 开发利用空间信息的细胞类型反卷积方法，提升空间转录组数据中细胞类型组成预测准确性 | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等多个平台的六套空间转录组数据集，以及小鼠脑组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图卷积网络、自编码器 | 空间转录组基因表达数据 | 六套来自多种平台的空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seqV2, Visium HD | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等不同分辨率的空间转录组平台 |