单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1083 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-06-05 |
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 基于多组学分析，探讨MYB基因在三阴性乳腺癌中的潜在治疗靶点作用，重点关注PI3K/AKT信号通路 | 首次通过整合113种算法组合、多组学数据（转录组、单细胞RNA测序、空间转录组）和分子对接模拟，系统揭示MYB基因在TNBC与Non-TNBC预后差异中的关键角色，并发现桃红四物汤主要成分与MYB的强结合能力 | 研究主要基于公共数据库数据分析，缺乏独立临床队列验证；分子对接模拟结果需要后续实验验证；桃红四物汤成分与MYB结合的体内外功能验证尚未开展 | 探究PI3K/AKT信号通路中关键基因导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异的分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌和非三阴性乳腺癌的转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个转录组数据集，具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 942 | 2026-06-05 |
Fibroblasts as regulators of lung immunity, repair and fibrosis
2026-Jun, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-026-01268-4
PMID:41680464
|
综述 | 探讨成纤维细胞在肺部免疫、修复和纤维化中的调节作用，重点关注单细胞测序技术揭示的成纤维细胞异质性和功能多样性 | 整合免疫学、力学和代谢调节因子对成纤维细胞功能的影响，揭示慢性炎症、免疫功能障碍、组织生物力学改变和代谢应激如何破坏基质调节平衡导致进行性纤维化 | 未提供 | 研究成纤维细胞在纤维化间质性肺病中的调节机制及其在健康与疾病状态下的核心调控程序 | 成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 943 | 2026-06-05 |
Vascular basement membrane laminins modulate functional zonation of cerebral microvessels
2026-Jun, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251410040
PMID:41696806
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究血管基底膜层粘连蛋白对脑微血管功能区域化的调控作用 | 首次揭示层粘连蛋白α4和α5缺失对脑微血管内皮细胞动脉标记物表达及毛细血管后微静脉特性的调控效应，并发现层粘连蛋白α5的补偿性上调增强血管连接蛋白表达和收缩性 | NA | 探究基底膜层粘连蛋白是否影响脑血管的区域差异性，并揭示其分子机制 | 缺乏主要血管层粘连蛋白（层粘连蛋白α4和α5）的小鼠及其野生型同窝对照的脑血管 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 缺乏层粘连蛋白α4和α5的小鼠及其野生型同窝对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 944 | 2026-04-12 |
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Jun, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.008
PMID:41963136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 945 | 2026-06-05 |
Ustekinumab resistance in individuals with ulcerative colitis is associated with an alteration of a subset of proinflammatory mucosal regulatory T cells
2026-Jun-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izag059
PMID:41984825
|
研究论文 | 探讨乌司奴单抗治疗溃疡性结肠炎患者耐药性与黏膜调节性T细胞亚群改变的关系 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、多参数流式细胞术和空间转录组学等多模态方法，首次揭示了黏膜调节性T细胞表型和转录特征与乌司奴单抗治疗响应性的关联，并鉴定出OX40、GITR、GPR15和PIM2等关键分子作为潜在生物标志物 | 样本量较小，亚组分析中仅部分患者进行了多参数流式细胞术和空间转录组学检测，研究仅在单中心进行，需要更大规模多中心队列验证 | 阐明与乌司奴单抗治疗响应性相关的黏膜免疫变化，为治疗决策提供指导 | 接受乌司奴单抗治疗的溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，多参数流式细胞术，空间转录组学，免疫组化 | NA | 基因表达数据，图像 | 接受乌司奴单抗治疗的患者队列，包括响应者和非响应者，具体数量未明确提及 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'文库制备和测序，10x Visium空间转录组学分析 |
| 946 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals a differential response of human bronchial epithelial cell-types to cadmium chloride
2026-Jun, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04344-9
PMID:41807791
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人支气管上皮细胞类型对氯化镉的差异化反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术在高分辨率下解析人支气管上皮不同细胞类型对有毒化合物氯化镉的急性反应，发现了传统批量分析无法捕捉的细胞类型特异性转录特征 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞转录组学在分析复杂组织对有毒化合物急性反应中的附加价值 | 人支气管上皮细胞（纤毛细胞、分泌细胞、基底细胞） | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自3名独立供体的完全分化黏膜纤毛上皮，共18,255个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 947 | 2026-06-05 |
Epigenetically controlled endothelial promyelocytic leukemia drives liver inflammation and fibrosis
2026-Jun-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196730
PMID:41842990
|
研究论文 | 发现表观遗传调控的LSEC中PML/BRD4通过相分离驱动促炎信号，促进肝脏炎症和纤维化 | 首次鉴定表观遗传异常的LSEC通过PML/BRD4相分离激活超级增强子，放大促炎血管分泌信号，启动肝脏炎症与纤维化级联反应 | 未提及具体限制 | 阐明肝脏损伤初期触发免疫细胞募集的特定分子事件 | 肝脏窦内皮细胞及单核细胞来源的巨噬细胞 | NA | 肝脏纤维化 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠纤维化肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 948 | 2026-06-05 |
Endothelial origin of hematopoietic stem cells: Insights from new technologies and unresolved questions
2026-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103676
PMID:42102418
|
综述 | 利用新技术综述造血干细胞源自血源性内皮细胞的证据及未解决问题 | 通过整合单细胞转录组学、低输入表观基因组学和单细胞功能分析等高精度技术的最新研究，系统总结了HSC生成性HEC的富集标记、功能特性和发育轨迹，并阐述了从主动脉动脉内皮细胞到前造血干细胞的多个精细细胞阶段的连续特性 | 未提及具体局限性 | 总结和解决关于造血干细胞起源中血源性内皮细胞的性质、起源和命运的争议 | 造血干细胞生成性血源性内皮细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、低输入表观基因组学、单细胞功能分析 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 949 | 2026-06-03 |
MOTS-c, a mitochondrial-derived peptide, ameliorates lysosomal membrane permeability and improves survival of soft tissue transplantation
2026-Jun-02, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2677180
PMID:42153537
|
研究论文 | 本研究发现线粒体衍生肽MOTS-c通过抑制PLA2G4A磷酸化，减少溶酶体膜通透性，改善缺血皮瓣的存活 | 首次揭示MOTS-c通过MAPK1-MAPK3-NFKB信号级联调控PLA2G4A-LMP轴，促进自噬并减少内皮细胞焦亡，从而改善组织移植生存率 | 未明确MOTS-c在其他缺血组织模型中的效果以及长期治疗效果 | 研究MOTS-c在缺血皮瓣中的保护作用及其分子机制 | 缺血皮瓣模型和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 缺血性坏死 | RNA-seq, Western blotting, ELISA, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 950 | 2026-06-03 |
Ferroptosis promotes aortic stenosis through 5-lipoxygenase
2026-Jun-02, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag397
PMID:42227114
|
研究论文 | 铁死亡通过5-脂氧合酶促进主动脉瓣狭窄的机制研究 | 首次鉴定ALOX5-ACSL4轴为钙化性主动脉瓣疾病中铁死亡的关键介质，并验证其作为临床干预靶点的转化潜力 | 未说明具体局限性 | 探索铁死亡在钙化性主动脉瓣疾病中的通路机制并验证其临床转化相关性 | 人类主动脉瓣组织样本、手术患者的瓣膜间质细胞、小鼠模型（阿霉素诱导铁死亡模型和钢丝损伤模型） | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、图像数据 | 212个手术患者主动脉瓣、4874名SCAPIS参与者、273550名UK Biobank参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 951 | 2026-06-03 |
The role of cellular senescence in immune-metabolic features and prognosis of ovarian cancer: an integrated analysis based on single-cell sequencing and multi-omics data
2026-Jun-02, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-026-02343-3
PMID:42228240
|
研究论文 | 整合单细胞测序和多组学数据，分析细胞衰老在卵巢癌免疫代谢特征及预后中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多组学数据整合分析，系统揭示卵巢癌中衰老相关基因（SAGs）在肿瘤异质性、微环境免疫代谢及铂类药物反应中的作用，并构建了具有预后价值的八基因风险模型 | 基于公开数据库分析，缺乏额外的实验和临床验证 | 阐明衰老相关基因在卵巢癌异质性、预后及治疗相关特征中的角色 | 卵巢癌患者的肿瘤组织样本（包括TCGA和GEO数据集及单细胞测序数据） | 生物信息学， 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序， 多组学整合分析 | 共识聚类， 风险模型（八基因衰老相关风险模型） | 基因表达数据， 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据集中的卵巢癌患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 952 | 2026-06-03 |
Olfactory epithelium regeneration and homeostasis: cellular and molecular mechanisms and novel methodological advances
2026-Jun-02, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-026-00292-y
PMID:42228282
|
综述 | 综述了嗅上皮再生与稳态维持的细胞和分子机制，以及新兴技术进展 | 整合最新单细胞转录组学、空间转录组学和类器官模型的研究成果，揭示了先前未知的细胞状态、分化路径和细胞间通讯 | 未提及具体局限性信息 | 总结支持嗅上皮再生的分子和细胞机制，突出推进理解该过程的新兴技术 | 嗅上皮中的水平基底细胞和球状基底细胞 | 数字病理学 | 嗅觉功能障碍 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型 | NA | 转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 953 | 2026-06-03 |
OGFRL1 Deficiency Causes Chronic Recurrent Multifocal Osteomyelitis Via Pathologic Osteoclastogenesis, With Therapeutic Response to Tumor Necrosis Factor Inhibitor
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70057
PMID:41568604
|
研究论文 | 本研究验证了OGFRL1功能缺失变异在慢性复发性多灶性骨髓炎（CRMO）患者中的作用，并探讨其致病机制 | 首次发现OGFRL1缺陷是CRMO的新病因，揭示OGFRL1在抑制炎症反应中的先前未被认识的作用 | NA | 验证OGFRL1功能缺失变异在CRMO发病中的作用并研究其机制 | CRMO患者、Ogfrl1基因敲除小鼠 | 机器学习 | 慢性复发性多灶性骨髓炎 | 全外显子测序、Sanger测序、定量PCR、ELISA、流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、基因表达数据 | 1例CRMO患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 954 | 2026-06-03 |
CCL3+ Neutrophil Signature Predicts Response to Neoadjuvant Toripalimab plus Chemotherapy in Patients with Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A Phase II Trial
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4096
PMID:41817286
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和大量RNA测序，发现CCL3+中性粒细胞特征可作为预测下咽鳞状细胞癌患者对新辅助特瑞普利单抗联合化疗反应的生物标志物 | 首次提出Neu_CCL3基因特征作为预测下咽鳞状细胞癌新辅助免疫治疗反应的强独立生物标志物，其预测效能显著优于PD-L1 CPS评分 | 单中心、单臂II期试验设计；验证样本量有限（60例）；机制验证仅通过免疫组化和测序，缺乏更深入的实验验证 | 寻找可预测下咽鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的生物标志物 | 可切除局部晚期下咽鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 下咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序, 免疫组织化学 | 无 | 基因表达数据 | 70例患者（其中13例进行单细胞RNA测序，60例进行验证） | NA | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | NA |
| 955 | 2026-06-03 |
Podoplanin-defined tumour plasticity and CCR7-mediated lymphatic metastasis in triple-negative breast cancer
2026-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03402-4
PMID:41957138
|
研究论文 | 研究Podoplanin（PDPN）定义的三阴性乳腺癌肿瘤可塑性与CCR7介导的淋巴转移的关系 | 发现PDPN定义的肿瘤细胞间充质转变是CCR7驱动淋巴转移和肿瘤进展的必要条件，且缺氧可促进这一过程，揭示了肿瘤可塑性与CCR7在淋巴扩散中的协同作用 | NA | 探讨PDPN定义的肿瘤可塑性如何与CCR7相互作用促进三阴性乳腺癌淋巴转移 | 三阴性乳腺癌小鼠模型、细胞系及原发性肿瘤样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括METABRIC乳腺癌队列及scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 956 | 2026-06-03 |
Single-cell transcriptomic profiling of the splenic and peripheral immune landscape in rhesus macaques during CHIKV infection
2026-Jun, Journal of virus eradication
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.jve.2026.100624
PMID:41939511
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示猕猴感染基孔肯雅病毒后脾脏和外周血的免疫细胞动态变化 | 首次在非人灵长类模型中系统描绘CHIKV急性期脾脏和外周血单核细胞的单细胞转录组景观，揭示了中性粒细胞介导的炎症、T/B细胞先天-适应性转化特征以及Th1/Th17极化等关键免疫机制 | 仅分析了感染后第7天的急性期数据，缺乏时间动态变化和慢性期比较；未进行功能验证实验 | 阐明CHIKV急性感染的细胞免疫机制和致病机理 | 感染CHIKV的猕猴脾脏和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 基孔肯雅病毒感染 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 猕猴样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 957 | 2026-06-03 |
Orai1 Facilitates Angiogenesis After Myocardial Infarction Through Notch1 Signaling Pathway
2026-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.324231
PMID:41988713
|
研究论文 | 探究Orai1通过Notch1信号通路在心肌梗死后促进血管生成的作用机制 | 首次揭示Orai1依赖性钙内流在心肌梗死后血管生成中的新作用，并识别Orai1为心脏修复的潜在治疗靶点 | NA | 阐明Orai1在心肌梗死后血管生成中的分子机制 | 人脐静脉内皮细胞、小鼠心肌梗死模型、斑马鱼胚胎、ST段抬高型心肌梗死患者血清 | 心血管生物学 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、转录组学、免疫染色 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据 | 人脐静脉内皮细胞、小鼠心脏组织、斑马鱼胚胎 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析小鼠心肌梗死后心脏单细胞转录组 |
| 958 | 2026-06-03 |
Histology-informed spatial domain identification through multi-view graph convolutional networks
2026-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014281
PMID:42224211
|
研究论文 | 提出一种名为STESH的空间转录组学聚类方法，通过多视图图卷积网络整合基因表达、空间位置和组织学信息以识别空间结构域 | 首次将多视图图卷积网络与解码器及注意力机制相结合，同时整合组织学特征、表达数据和空间信息进行空间结构域识别 | 未提及具体局限性 | 开发高效整合组织学、基因表达和空间信息的空间结构域识别方法 | 多种组织类型和技术平台的空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | CNN, 图卷积网络, 多视图图卷积网络 | 基因表达数据, 空间位置数据, 组织学图像 | 多种组织类型样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 959 | 2026-06-03 |
Slfn4-mediated Stat3 signaling promotes suppressive bone marrow monocytes in a murine second-hit sepsis model
2026-Jun-01, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01515-3
PMID:42226106
|
research paper | 本研究通过小鼠二次感染败血症模型，发现Slfn4介导的Stat3信号通路促进骨髓单核细胞的免疫抑制功能 | 首次发现Slfn4标记骨髓中免疫抑制性M-MDSC样细胞亚群，并阐明Slfn4-Stat3轴在维持其抑制表型中的作用机制 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类样本中验证；具体分子机制仍需进一步深入解析 | 探讨败血症后期免疫抑制期骨髓免疫重塑的机制，特别是Slfn4对单核细胞免疫抑制功能的调控 | 小鼠骨髓中的单核细胞，特别是M-MDSC样细胞亚群 | 机器学习 | 败血症 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠二次感染败血症模型中的骨髓样本，具体数量未详述 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台用于单细胞RNA测序 |
| 960 | 2026-06-03 |
Dexmedetomidine may alleviate severe acute pancreatitis-associated lung injury by targeting the AIM2 inflammasome in endothelial cells
2026-Jun-01, BMC anesthesiology
IF:2.3Q2
DOI:10.1186/s12871-026-03917-6
PMID:42226110
|
研究论文 | 探讨右美托咪定通过靶向内皮细胞AIM2炎症小体缓解重症急性胰腺炎相关肺损伤的机制 | 首次发现右美托咪定通过靶向抑制AIM2炎症小体激活来缓解内皮细胞焦亡，从而改善重症急性胰腺炎相关肺损伤 | 该研究基于大鼠模型和细胞实验，其临床转化效果需进一步验证；AIM2敲低实验未显示右美托咪定的额外抑制作用，机制细节仍需深入 | 阐明右美托咪定在重症急性胰腺炎相关肺损伤中的保护作用及其分子机制 | 重症急性胰腺炎大鼠和脂多糖刺激的人脐静脉内皮细胞 | NA | 重症急性胰腺炎，肺损伤 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 大鼠模型（具体数目未在摘要中提及）和人脐静脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |