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当前共找到 956 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-05-29 |
Interpretable Multi-task Analysis of Single-Cell RNA-seq Data Through Topological Structure Preservation and Data Denoising
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00765-9
PMID:41023370
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研究论文 | 提出一个名为scIMTA的可解释多任务分析框架，用于单细胞RNA-seq数据的拓扑结构保持和数据降噪 | scIMTA实现了稀疏高噪声基因表达数据的协同多任务分析，通过生物学基础增强可解释性，并在保持数据完整性的同时稳健处理丢失事件 | 未提及具体局限 | 开发一个可解释的多任务分析框架，解决单细胞RNA-seq数据中的拓扑结构保持和丢失事件问题 | 乳腺癌单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 862 | 2026-05-29 |
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2026-Jun, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70154
PMID:41195968
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示mogamulizumab相关皮肤疹中的抗淋巴瘤免疫反应 | 首次对mogamulizumab相关皮疹进行全面的分子表征，发现残余恶性克隆呈现沉默免疫表型，并伴随潜在的抗肿瘤免疫反应 | 样本量较小（仅4例MAR患者），未明确说明机制验证实验 | 阐明mogamulizumab相关皮疹的分子特征及其与更好总生存期的关联机制 | mogamulizumab相关皮疹患者的皮肤活检组织 | 单细胞测序 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4例MAR患者，6例未治疗红皮病性CTCL患者，4例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 863 | 2026-05-29 |
Heterogeneity of the adult mammalian forebrain neurogenic ependyma: A comprehensive cellular map
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00789
PMID:40819302
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建成年小鼠前脑室管膜表面的完整细胞图谱，揭示其细胞异质性 | 首次通过全组织单细胞RNA测序系统鉴定成年小鼠前脑室管膜表面的12种不同细胞亚型，并精细刻画了CD133+与CD133-细胞的分子特征分类 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未探讨不同细胞亚型的功能差异及神经干细胞潜能的具体机制 | 阐明成年哺乳动物前脑室管膜细胞的组成异质性，为解决神经干细胞存在争议提供新视角 | 成年小鼠前脑侧脑室侧壁的室管膜表面细胞 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠的侧脑室侧壁整体组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 864 | 2026-05-29 |
Characterization of p16-positive stromal cells in age-related cardiac disorders
2026-Jun-01, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvag013
PMID:41705475
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析衰老心脏中p16阳性基质细胞的特征及其在心脏纤维化中的作用 | 首次利用p16-Tom小鼠模型在单细胞水平上表征p16阳性成纤维细胞在年龄相关心脏纤维化中的转录组特征，并证明选择性清除这些细胞可减轻纤维化 | 未提供 | 探究p16阳性基质细胞在年龄相关心脏疾病中的功能与机制 | 衰老p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 865 | 2026-05-29 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Jun, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高精子运动能力鹅的睾丸细胞异质性，发现内分泌-代谢支持及轴丝组装增强与精子运动能力相关 | 首次在鹅中利用单细胞转录组学解析精子运动能力差异的细胞基础，发现支持细胞和间质细胞的内分泌-代谢增强及圆形精子的轴丝组装程序上调 | 样本量较小（每组3只），且仅关注生理范围内的精子运动能力差异，未涉及极端低活力情况 | 探究鹅精子运动能力差异的睾丸细胞和分子基础 | 60只鹅中精子运动能力最高和最低的10%各6只，其中3只用于单细胞RNA测序 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 12只鹅用于表型比较，6只用于单细胞测序 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 866 | 2026-05-29 |
stGNN: Spatially Informed Cell-Type Deconvolution Based on Deep Graph Learning and Statistical Modeling
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00728-0
PMID:40571903
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研究论文 | 提出基于深度图学习和统计建模的stGNN方法，用于空间转录组数据的细胞类型反卷积 | 创新性地结合图卷积网络与自编码器的双编码模块，以及自适应注意力机制，从低阶到高阶捕捉多尺度空间结构；采用负对数似然损失函数对齐ST与scRNA-seq参考数据的分布 | 依赖性于高质量scRNA-seq参考数据；未明确讨论计算效率或大规模数据扩展性 | 开发利用空间信息的细胞类型反卷积方法，提升空间转录组数据中细胞类型组成预测准确性 | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等多个平台的六套空间转录组数据集，以及小鼠脑组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图卷积网络、自编码器 | 空间转录组基因表达数据 | 六套来自多种平台的空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seqV2, Visium HD | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等不同分辨率的空间转录组平台 |
| 867 | 2026-05-29 |
A Novel Dual-Level Momentum Distillation Method with Extreme Thresholding for Imputing Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00754-y
PMID:40841490
|
研究论文 | 提出了一种名为MoDET的新方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值，以提高数据质量和后续分析准确性 | 提出双重水平动量蒸馏与极端阈值机制相结合的方法，有效提升了细胞表征学习能力和对稀有细胞类型的识别精度 | 未提及跨平台或更大规模数据集验证，且对极端阈值机制的普适性未作深入讨论 | 解决单细胞RNA测序数据因缺失现象导致的稀疏性问题，提升下游聚类分析和稀有细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 双重水平动量蒸馏模型 | 基因表达矩阵 | 七个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 868 | 2026-05-29 |
Joint Low Rank Representation with Symmetric Orthogonal Decomposition for Clustering of scRNA-seq Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00767-7
PMID:41131369
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研究论文 | 提出一种结合低秩表示与对称正交分解的单细胞RNA测序数据聚类新方法LRRS | 引入新的正交对称分解策略，无需预设聚类数量，通过测量正交空间下的加权距离自适应表征局部特性 | 未在更大规模或更复杂的数据集上验证，且迭代优化方法可能增加计算复杂度 | 开发高效的单细胞RNA测序数据聚类方法以准确识别细胞类型，揭示复杂疾病分子机制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型组成 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示与对称正交分解模型 | 基因表达数据 | 11个基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 869 | 2026-05-28 |
Multiomics reveals CCL3-driving neuronal sensitization in chronic pruritus of unknown origin
2026-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.620
PMID:41320115
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研究论文 | 通过多组学分析揭示CCL3驱动不明原因慢性瘙痒中神经元敏化的机制 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定出CCL3作为不明原因慢性瘙痒的潜在诊断生物标志物，并阐明CCL3-CCR1轴在慢性瘙痒中的关键神经免疫通路 | CCL3在小鼠中不直接作为瘙痒原，其作用机制需进一步验证；研究中使用的慢性干皮瘙痒模型可能不能完全代表人类疾病 | 探究不明原因慢性瘙痒的潜在机制，寻找诊断生物标志物和治疗靶点 | 不明原因慢性瘙痒患者及健康对照者、小鼠模型 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 不明原因慢性瘙痒患者和健康对照者外周血单核细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 870 | 2026-05-28 |
Skin fibroblasts in health and disease: From extracellular matrix remodeling to immune regulation
2026-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.002
PMID:41493297
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综述 | 回顾了皮肤成纤维细胞在健康和疾病中的功能，重点关注其从细胞外基质重塑到免疫调节的转变 | 将成纤维细胞重新定义为动态的免疫调节细胞，并利用单细胞和空间转录组学揭示其异质性和疾病特异性表型 | 关于皮肤成纤维细胞的谱系特性、功能可塑性和表型驱动基因调控网络仍存在知识空白 | 综合当前对皮肤成纤维细胞异质性、可塑性及其在炎症性皮肤病中多样功能的理解 | 皮肤成纤维细胞在自身免疫性、过敏性、纤维化和肿瘤性皮肤病中的功能 | 数字病理学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞转录组学， 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium， 10x Visium | 用于单细胞和空间转录组学分析的平台 |
| 871 | 2026-05-25 |
Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study
2026-Jun, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-025-11351-y
PMID:40946247
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研究论文 | 采用多组学整合框架，结合网络药理学、机器学习、SHAP分析和单细胞RNA测序，系统研究肠道菌群代谢产物与基质金属蛋白酶-3（MMP3）在乳腺癌中的相互作用 | 首次整合网络药理学、机器学习与单细胞测序揭示肠道菌群代谢物-MMP3轴在乳腺癌中的作用，发现8种无毒菌群代谢物具有靶向MMP3的治疗潜力 | 结果基于计算分析和数据库验证，尚未进行体外和体内实验验证，缺乏临床样本的直接证据 | 探索肠道菌群代谢产物与乳腺癌相关靶点（尤其是MMP3）的相互作用机制 | 乳腺癌相关的肠道菌群代谢产物及其靶点MMP3 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 网络药理学, 分子对接, 孟德尔随机化 | 机器学习模型（SHAP分析） | 基因表达数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 872 | 2026-05-23 |
SIRT1-NCOR2 Corepressor Modulates Trophoblast-Macrophage Interactions in Preeclampsia
2026-Jun, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 研究SIRT1-NCOR2共抑制复合物在子痫前期中调节滋养层-巨噬细胞相互作用的机制 | 首次揭示SIRT1通过招募NCOR2调控RARRES2表达，影响滋养层与巨噬细胞相互作用，并验证孕酮补充可逆转子痫前期样症状 | 未标注具体局限性，但可能涉及小鼠模型的物种差异及临床样本量限制 | 探究子痫前期中低SIRT1水平如何上调RARRES2表达，影响巨噬细胞极化和疾病发病机制 | 系统性Sirt1杂合敲除小鼠、滋养层特异性Sirt1敲除（cKO）小鼠、子痫前期患者血浆 | 数字病理学 | 妊娠期高血压疾病（子痫前期） | 单细胞测序、共培养实验、荧光素酶报告基因、染色质免疫沉淀、质谱分析、免疫沉淀 | NA | 测序数据、细胞实验数据、动物模型数据、临床样本数据 | 包含小鼠模型（具体数量未提及）及子痫前期患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 873 | 2026-05-23 |
Endothelial prolyl hydroxylase 3 mitigates maladaptive inflammation to promote post-ischemic kidney repair
2026-Jun, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.017
PMID:41692346
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研究论文 | 研究内皮细胞脯氨酰羟化酶3在急性肾损伤后修复中的作用机制 | 首次揭示内皮PHD3作为关键氧感受器，通过抑制干扰素-γ驱动的内皮激活来保护肾脏免受适应不良性炎症，促进组织修复并限制AKI向CKD的转变 | 主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞分析，具体机制在人体内的验证尚需进一步研究 | 探究内皮氧感受（特别是PHD3）在急性肾损伤后肾脏修复中的作用 | 小鼠（条件性基因敲除品系）和人类肾脏样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、体外实验数据 | 两种独立人类数据集及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 874 | 2026-05-23 |
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Jun, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2642341
PMID:41789512
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SFRP2在IPF肺肌成纤维细胞中高表达，并揭示其通过抑制PINK1介导的线粒体自噬启动来增强肺肌成纤维细胞的纤维化活性 | 首次定义了一个新型的自分泌SFRP2-线粒体自噬调控轴，该轴持续激活肌成纤维细胞，并作为肺纤维化的潜在治疗靶点 | 目前文章未明确提及局限性，但可能包括模型仅限于小鼠、未在人体样本中验证治疗干预等 | 探究特发性肺纤维化中肌成纤维细胞持续激活的调控机制 | IPF患者肺组织、小鼠肺纤维化模型、原代小鼠肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体、中和抗体、自噬诱导剂 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及IPF患者肺组织样本和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'（推测） |
| 875 | 2026-05-23 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
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综述 | 本文综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA，并探讨了环境因素、诊断工具和治疗策略 | 整合了表观遗传学与遗传风险、环境触发因素及精准治疗策略的联系，并强调了单细胞表观基因组学和空间转录组学等新型诊断工具的应用潜力 | 临床前模型的预测价值有限，且表观遗传谱存在个体差异，限制了研究结果的转化 | 阐明表观遗传调控在银屑病病理生理中的核心作用，并探索其作为精准医学框架的桥梁价值 | 银屑病相关的表观遗传机制（DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA）及环境因素（紫外线、空气污染） | 自然语言处理 | 银屑病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 876 | 2026-05-23 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Identifies Prognostic Biomarkers in Breast Cancer Metastasis
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11228-7
PMID:40828203
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据，识别乳腺癌转移相关的预后生物标志物 | 首次结合批量微阵列与单细胞RNA测序数据，发现PRC1和POLR3H作为乳腺癌转移的新型预后标志物 | 未提供具体局限信息 | 识别乳腺癌转移的预后相关基因标志物 | 乳腺癌转移相关的差异表达基因及其在恶性上皮和EMT细胞中的表达 | 机器学习 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公共微阵列数据集（GSE14776、GSE103357、GSE32489）及一个单细胞RNA测序数据集（GSE180286） | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 877 | 2026-05-21 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2026-Jun, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙髓干细胞在血管生成、成牙本质和神经分化过程中的细胞异质性和分化序列 | 首次揭示牙髓干细胞在体内先进行血管生成分化，随后再进行神经分化的时间顺序，并利用单细胞RNA测序证实了细胞异质性和特异性基因表达模式 | 未明确说明限制，但可能包括体内模型的人为性和分化时间的个体差异 | 阐明牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经分化的机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人牙髓干细胞样本；免疫缺陷小鼠移植实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 878 | 2026-05-21 |
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04131-5
PMID:41396398
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平揭示口腔癌中炎症性肠病相关基因的表达异质性，并发现NFKBIA表达与趋化因子介导信号通路显著关联 | 研究样本量有限，未涉及功能性验证实验，缺乏健康对照组织比较 | 阐明炎症性肠病相关基因在口腔癌中的细胞和分子通路机制 | 口腔癌组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 口腔癌组织样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 879 | 2026-05-21 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals the impact of inflammatory microglia on prognosis and immunotherapy response in primary glioblastoma
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04135-1
PMID:41420790
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示炎症性小胶质细胞在原发性胶质母细胞瘤中对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次基于炎症性小胶质细胞相关基因对GBM患者进行分层，并揭示两种不同亚型在预后和免疫治疗反应上的显著差异 | NA | 阐明炎症性小胶质细胞在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的亚型特异性影响，并探索其预后和免疫治疗反应的预测价值 | 原发性胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的炎症性小胶质细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 三个独立数据集的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 880 | 2026-05-21 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular heterogeneity and prognostic subtypes in colorectal cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04153-z
PMID:41430524
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌的细胞异质性并识别预后亚型 | 整合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据，在单细胞水平揭示结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成，并基于标记基因对患者进行基因分型，识别出具有预后意义的分子亚型 | 需要进一步的功能验证以充分理解这些发现的临床意义 | 探索结直肠癌的细胞组成，整合单细胞与批量转录组数据以识别预后标志物并表征肿瘤异质性 | 结直肠癌肿瘤样本的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17例结直肠癌样本用于单细胞RNA-seq，566例结直肠癌样本用于批量RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |