单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202606-202606] [清除筛选条件]
当前共找到 1083 篇文献,本页显示第 821 - 840 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
821 2026-06-10
ST-LDAW: A Topic-Model and Damped Weighted Least-Squares Method for Integrative Deconvolution of Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Jun-09, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
822 2026-06-10
Loss of tumor-infiltrating lymphocytes and poor response to immunotherapy in IDH GOF mutant melanoma
2026-Jun-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究IDH功能获得性突变黑色素瘤中肿瘤浸润淋巴细胞缺失及对抗PD1免疫治疗反应不佳的机制 首次在人类黑色素瘤中描述IDH功能获得性突变与免疫微环境的关系,揭示了IDH突变通过影响DNA甲基化和免疫排斥导致免疫治疗耐受的新机制 具体局限性未在摘要中提及,可能需要进一步验证样本量及因果关系 探究IDH功能获得性突变对黑色素瘤免疫治疗反应的影响及其分子机制 IDH功能获得性突变黑色素瘤患者的肿瘤样本及临床数据 机器学习, 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化测序 NA 基因表达数据, 甲基化数据 未明确说明样本数量,涉及临床反应分析、单细胞RNA-seq、批量RNA-seq和DNA甲基化数据 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
823 2026-06-10
Dissecting the cellular architecture of breast cancer brain metastases reveals prognostically distinct immune landscapes
2026-Jun-08, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 对156例乳腺癌脑转移患者的免疫微环境进行多模态分析,揭示了两种与患者生存期延长相关的免疫景观 首次通过整合组织细胞术、批量及单核RNA测序、流式细胞术和空间转录组学等多模态方法,系统描绘乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性,并识别出两种与生存预后相关的免疫景观,且这些景观无法从配对的原发肿瘤中推导得出 未提及明确的局限性 探究乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性及其对免疫治疗的敏感性 156例乳腺癌脑转移患者的组织样本及患者衍生模型 数字病理学 乳腺癌 单核RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 NA 基因表达数据、空间转录数据 156例临床样本 10x Genomics, Illumina 单核RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学
824 2026-06-10
Endocytic evasion confers resistance to antibody-drug conjugates therapy in cancer
2026-Jun-08, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过整合配对空间转录组学、人源化小鼠模型和耐药细胞系统,揭示了癌细胞通过内吞逃逸对抗体-药物偶联物产生耐药性的新机制 首次发现AKR1C1蛋白通过结合NECTIN4并损害AP2M1依赖性网格蛋白介导的内吞作用,以及通过AKR1C1-WWP2轴促进细胞外囊泡介导的药物外排,从而降低细胞内药物积累,提出了一种靶点高表达但摄取缺陷的耐药状态 未提及具体局限性 阐明癌细胞对抗体-药物偶联物(ADC)产生原发性或获得性耐药的分子机制,并寻找克服耐药的治疗靶点 尿路上皮癌肿瘤样本、人源化小鼠模型、单细胞RNA测序数据、耐药细胞系 数字病理学 尿路上皮癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、人源化小鼠模型 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 配对治疗前后的肿瘤样本(具体数量未提及) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
825 2026-06-10
Exploring the gut-lung axis in post-liver transplant acute lung injury: A multi-omics approach
2026-Jun-08, Acta microbiologica et immunologica Hungarica IF:1.3Q4
研究论文 该混合转化研究整合转录组分析、免疫浸润分析、粪便菌群组成及预测功能分析,探究肝移植后急性肺损伤中肠-肺轴的机制 首次通过多组学方法揭示肝移植后急性肺损伤中肠道菌群失调与宿主免疫基因表达及肺部炎症的功能性肠-肺免疫轴联系 具体限制未在摘要中明确提及,可能包括样本量有限或因果关系需进一步验证 探究肝移植后急性肺损伤中肠道菌群失调与发病机制的功能联系 肝移植后急性肺损伤患者与非急性肺损伤患者的粪便样本、血清和支气管肺泡灌洗液 机器学习 肺部疾病 RNA-seq, 16S rRNA测序 LASSO, SVM-RFE, 随机森林 转录组数据(bulk和单细胞RNA-seq)、微生物组数据(16S rRNA)、临床样本 急性肺损伤与非急性肺损伤肝移植患者样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 16S rRNA测序 NA NA
826 2026-06-10
ILT2 identifies an unexploited pool of intratumoral CD8+ bystander T cells with TCR-independent cytotoxicity in renal cell carcinoma
2026-Jun-08, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 揭示肾细胞癌中CD8+ILT2+肿瘤浸润淋巴细胞具有TCR非依赖性细胞毒性,并识别HLA-G/ILT2轴作为免疫抑制通路的新治疗靶点 首次鉴定CD8+ILT2+ TILs为一种不同于CD8+PD1+ TILs的独特亚群,具有TCR非依赖性细胞毒性,并阐明其通过激活天然受体NKG2D发挥抗肿瘤活性 未明确提及具体局限性,但可能包括体内验证不足、样本量有限或临床转化挑战 探究CD8+ILT2+肿瘤浸润淋巴细胞在肾透明细胞癌中的特征、功能及作为免疫治疗靶点的潜力 肾透明细胞癌患者的CD8+ILT2+和CD8+PD1+肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理学 肾细胞癌 高维光谱流式细胞术、单细胞转录组学、TCR克隆型分析 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞转录组测序平台
827 2026-06-10
Targeting ATF4 overcomes dual resistance to chemo-immunotherapy in gastric cancer by disrupting the DNA damage response
2026-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过整合分析揭示ATF4通过上调HSPA9激活DNA损伤反应,导致胃癌对化疗免疫治疗的双重耐药性 首次发现转录因子ATF4作为调控胃癌化疗免疫双重耐药的关键因子,并阐明其通过HSPA9-DNA损伤反应轴连接内在化疗耐药与外源性免疫抑制的分子机制 未提及具体的局限性 阐明胃癌化疗免疫治疗双重耐药的分子机制,并鉴定关键调控因子和潜在治疗靶点 胃癌细胞系、患者来源类器官、患者来源异种移植模型及胃癌患者临床队列 机器学习 胃癌 单细胞RNA测序、批量转录组测序、染色质免疫共沉淀测序、RNA测序、多重免疫荧光 NA 基因表达数据、图像数据 多个胃癌队列的单细胞RNA测序和批量转录组数据集;胃癌细胞系、类器官和异种移植模型;临床胃癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
828 2026-06-10
Large language model consensus substantially improves the cell type annotation accuracy for scRNA-seq data
2026-Jun-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出mLLMCelltype框架,通过多个大型语言模型的迭代协商实现单细胞RNA测序数据的细胞类型注释,显著提升准确性和可靠性 利用多个LLM的集体智能进行结构化协商,克服单一模型偏见和参考数据依赖,提供透明推理链和共识置信度指标 未提及 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性,减少人工标注工作 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大型语言模型 单细胞基因表达数据 49个不同数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
829 2026-06-10
GPNMB-ECD drives acquired resistance to osimertinib in NSCLC via inducing tumor cell cytoskeletal reorganization
2026-Jun-08, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
研究论文 揭示GPNMB-ECD通过诱导肿瘤细胞骨架重排驱动非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药的机制 首次发现GPNMB-ECD作为肿瘤微环境中的关键因子,通过SDC4-F-actin-YAP信号轴促进奥希替尼耐药,并验证了抗GPNMB-ECD抗体作为克服耐药的精准治疗策略的可行性 具体局限性未在摘要中提及 探究GPNMB-ECD在非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药中的作用及其机制 非小细胞肺癌组织和细胞系,以及人源化患者来源异种移植模型(huPDX) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化、ELISA、免疫共沉淀、免疫荧光、透射电镜 NA 基因表达数据、图像 NSCLC患者组织样本和血浆样本,以及细胞系和裸鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
830 2026-06-10
Molecular classification of primary Sjögren's syndrome based on salivary gland omics
2026-Jun-08, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据,利用非负矩阵分解对原发性干燥综合征进行分子分型,识别出四种分子亚型并分析其临床特征和免疫微环境 首次利用整合单细胞和批量转录组数据,通过非负矩阵分解方法对原发性干燥综合征进行分子分型,发现四种亚型并鉴定亚型特异性基因特征集 研究样本量可能有限,且分型的临床验证和外推性需进一步评估 通过唾液腺组学数据解析原发性干燥综合征的疾病异质性,建立分子分型体系 原发性干燥综合征患者的小唾液腺组织样本 机器学习 干燥综合征 单细胞RNA测序、批量RNA测序、非负矩阵分解 非负矩阵分解 基因表达数据 未明确说明,涉及患者小唾液腺样本 未明确说明 单细胞RNA测序、批量RNA测序 未明确说明 NA
831 2026-06-10
Sleeve Gastrectomy Is Associated with Improved Systemic Redox Homeostasis in T2DM Through Ghrelin-GHSR Attenuation, POMC Neuronal Modulation, and CD4+ T Cell Metabolic Reprogramming
2026-Jun-08, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨袖状胃切除术通过抑制Ghrelin-GHSR轴、重塑下丘脑POMC神经元活性及重编程CD4+T细胞免疫代谢以改善2型糖尿病全身代谢稳态的机制 首次整合单细胞RNA测序与代谢组学揭示袖状胃切除术通过协调中枢食欲调控与外周免疫代谢重编程改善2型糖尿病的神经-免疫-代谢机制 未提及 研究袖状胃切除术改善2型糖尿病的分子机制,重点关注Ghrelin-GHSR信号轴的作用 饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 机器学习 2型糖尿病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 代谢组学 NA 基因表达数据, 代谢物数据 未提及 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
832 2026-06-10
Screening of Demethylation-related Biomarkers and Exploration of Regulatory Mechanisms in Esophageal Cancer Patients Based on Machine Learning and Mendelian Randomization
2026-Jun-08, Current cancer drug targets IF:2.3Q3
研究论文 基于机器学习和孟德尔随机化筛选食管癌患者去甲基化相关生物标志物并探索调控机制 整合加权基因共表达网络分析、机器学习算法与孟德尔随机化方法,系统筛选食管鳞状细胞癌中与去甲基化相关的预后基因并构建风险预测模型 未提及具体局限性,但可能需进一步实验验证基因功能及更大样本队列确认模型普适性 筛选食管鳞状细胞癌中去甲基化相关的预后生物标志物,并探索其调控机制及治疗意义 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织 机器学习 食管癌 单细胞RNA测序、qPCR 随机生存森林、LASSO-Cox回归模型 基因表达数据、单细胞转录组数据 未明确提及样本数量,但包含组织样本用于qPCR验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
833 2026-06-10
Establishment and multi-omics characterization of a PD-1-resistant murine esophageal squamous cell carcinoma cell line
2026-Jun-06, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 建立并多组学表征一种PD-1耐药的鼠食管鳞癌细胞系 首次建立一种新型鼠食管鳞癌细胞系mESCC-030,该细胞系来源于4-NQO诱导的原发性食管鳞癌肿瘤,经过连续体内选择获得,表现出对PD-1抗体治疗的明显耐药性,并提供了一个典型的免疫冷肿瘤模型 未提及具体的局限性 探索食管鳞癌免疫治疗耐药机制及开发联合治疗策略 4-NQO诱导的C57BL/6小鼠原发性食管鳞癌细胞系mESCC-030 机器学习 食管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来源于C57BL/6小鼠的细胞系,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
834 2026-06-10
From Multiomics Discovery to Clinical Validation: Identification of Novel Noninvasive Biomarkers for Liver Fibrosis
2026-Jun-05, Journal of proteome research IF:3.8Q1
研究论文 通过多组学和单细胞测序整合分析,鉴定并验证了THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化的新型非侵入性生物标志物 首次通过多组学发现与临床验证相结合的方法,系统鉴定了三个新型肝纤维化生物标志物,并开发了整合生物标志物与临床变量的多变量模型,显著提高了风险分层准确性 未提及具体局限性 鉴定用于肝纤维化早期诊断的非侵入性生物标志物 肝纤维化患者 机器学习的临床应用 肝纤维化 多组学、单细胞测序 多变量模型 多组学数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA测序、多组学 NA NA
835 2026-06-10
Obesity promotes aggressiveness of endometrial cancer via metabolic reprogramming and intercellular crosstalk in the tumor microenvironment
2026-Jun-05, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示了肥胖通过代谢重编程和细胞间通讯促进子宫内膜癌侵袭性的机制 首次在单细胞分辨率下阐明肥胖如何通过调控肿瘤微环境驱动子宫内膜癌的发生与进展,并发现SOX9LGR5上皮亚群具有癌症干细胞特征 未提及具体局限性 探究肥胖通过调控肿瘤微环境促进子宫内膜癌侵袭性的机制 遗传小鼠模型(pten条件敲除)、子宫内膜癌患者临床样本、10个子宫内膜肿瘤样本 自然语言处理 子宫内膜癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10个子宫内膜肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
836 2026-06-10
Chenodeoxycholic acid redirects the bile acid synthetic pathway to limit pro-inflammatory neutrophil infiltration and alleviate colitis
2026-Jun-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 揭示鹅去氧胆酸通过重编译胆汁酸合成途径限制促炎性中性粒细胞浸润并缓解结肠炎 首次阐明结肠炎对肝脏胆汁酸合成途径的影响,发现鹅去氧胆酸可通过替代途径减轻结肠炎,并揭示其通过维生素D受体抑制CXCL2的分子机制 研究主要基于动物模型和体外实验,临床样本量有限,且未完全阐明胆汁酸代谢与肠道菌群的相互作用细节 探究结肠炎对肝脏胆汁酸合成的影响及鹅去氧胆酸的治疗潜力 炎症性肠病(IBD)患者样本、小鼠结肠炎模型、单细胞RNA测序数据 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、临床样本 包含公开数据集、院内患者样本及动物模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Genomics平台 单细胞RNA测序用于分析结肠上皮细胞和免疫细胞
837 2026-06-10
HIV-1 infection converts CD4+ T cells to HLA class II-restricted CD8+ T cells
2026-Jun-03, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 研究发现HIV-1感染可将CD4+ T细胞转化为HLA II类限制性CD8+ T细胞,揭示了病毒驱动宿主细胞重编程的新机制 首次发现HIV-1通过Vpr蛋白上调TGF-β1,诱导CD4 T细胞直接转化为CD8 T细胞,并证明此类CD8 T细胞构成HIV-1潜伏库中先前被忽视的组分 未在文中明确说明 探究HIV-1感染后CD4 T细胞能否恢复CD4表达及其命运轨迹 HIV-1感染者的CD4和CD8 T细胞 机器学习 HIV-1感染 单细胞RNA测序、TCR测序 NA 测序数据 来自未经治疗和抗逆转录病毒治疗抑制的HIV-1感染者以及健康对照者的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
838 2026-06-10
Modulation of intestinal bile acids influences colonic mucosal responses
2026-Jun-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究肠道胆汁酸调节对结肠黏膜反应的影响 首次通过单细胞RNA测序结合靶向定植小鼠和人类活检样本,详细解析次级胆汁酸(尤其是DCA)对结肠上皮细胞类型和功能的影响 未提及 确定肠道上皮对胆汁酸调节的体内和原位反应 小鼠结肠上皮细胞及人类结肠组织活检样本 转录组学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、免疫染色 NA 基因表达数据、图像 定植小鼠(具体数量未明确)及人类活检样本(包括观察性队列和干预研究) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-Seq
839 2026-06-10
scMEDAL: interpretable single-cell transcriptomics analysis with batch effect visualization via deep mixed-effects autoencoder
2026-Jun-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出scMEDAL框架,通过深度混合效应自编码器可视化并建模单细胞转录组测序中的批次效应 首次设计随机效应贝叶斯自编码器(scMEDAL-RE),独立分离批次不变与批次特异性效应,并保留通常被标准校正方法丢弃的生物信息 未明确讨论计算复杂度或对超大规模的扩展性 开发一种可解释的批次效应建模方法,以保留与批次混杂的生物信号并提高疾病状态预测能力 来自自闭症、白血病和心血管疾病的单细胞转录组数据 机器学习 自闭症、白血病、心血管疾病 单细胞RNA测序 深度混合效应自编码器、贝叶斯自编码器 单细胞转录组表达数据 涉及多种疾病(自闭症、白血病、心血管疾病)及不同细胞类型的技术和生物效应 NA 单细胞RNA测序 NA NA
840 2026-06-10
Copper nanoregulator with organelle-level precision reprograms COMMD1-Mediated copper homeostasis for myocardial infarction repair
2026-Jun-02, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组学、临床样本和动物模型,发现心肌梗死中铜稳态的负调控因子COMMD1,并构建pH响应性铜纳米调节剂Qu@Cu-SS31,通过线粒体靶向释放铜离子,调节COMMD1-Cu-ROS轴,抑制细胞焦亡和凋亡,促进心肌修复 首次鉴定出COMMD1作为心肌梗死中铜稳态的负调控因子,并开发出具有细胞器级别精度的铜纳米调节剂,实现线粒体靶向和pH响应性铜释放,建立了新的铜稳态调控策略 NA 研究铜稳态失调在心肌梗死中的作用机制,并开发靶向线粒体的铜纳米调节剂以促进心肌修复 心肌梗死小鼠模型、临床样本、缺血性心肌细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠心肌梗死模型、临床样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部