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当前共找到 956 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-07-13
Early Immune Hypoactivation and Persistent Innate Reprogramming Characterize Chronic Chikungunya Disease
2026-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过纵向免疫分析揭示慢性基孔肯雅病患者的早期免疫低激活和持续先天免疫重编程 首次通过纵向单细胞RNA测序结合血浆细胞因子和流式细胞术,系统揭示了慢性基孔肯雅病从急性期到恢复期的免疫动态变化,特别是早期先天免疫低激活与后期持续先天免疫重编程之间的关联 未提及具体局限性 探索基孔肯雅病毒感染者从急性感染转为慢性疾病的免疫学机制 基孔肯雅病毒感染者,根据临床结局分层的患者 机器学习 基孔肯雅病 单细胞RNA测序, 多重血浆细胞因子分析, 流式细胞术, 细胞间通讯分析 NA 单细胞转录组数据, 血浆细胞因子数据, 流式细胞术数据 急性期和感染后六个月的基孔肯雅病毒感染者外周血单个核细胞样本 NA NA NA NA
62 2026-07-13
Ambiguity-Aware Multi-Stage Cell-Type Annotation for Spatial Transcriptomics
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种感知模糊、多阶段的空间转录组细胞类型注释框架,通过混合空间特征聚类和受限语言模型推理来提升注释可靠性 首次在空间转录组注释中显式处理生物学模糊性,通过局部重聚类保留未解析混合群而非强制标注 依赖特定空间平台数据参数设置,未在多种空间转录组平台验证泛化性 解决空间转录组细胞类型注释中的异质性表达和模糊标签分配问题 胆管癌组织中的空间转录组数据 数字病理学 胆管癌 空间转录组学 语言模型 空间转录组数据 10x Genomics Xenium平台采集的胆管癌空间转录组数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Xenium 10x Genomics Xenium空间转录组平台
63 2026-07-13
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals Microenvironment-Dependent Immune Signatures in a Lyme Arthritis model
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学揭示莱姆关节炎小鼠模型中关节组织的微环境依赖性免疫特征 首次在莱姆关节炎模型中应用空间转录组学技术,绘制关节组织炎症高峰期和消退期的空间基因表达图谱,发现不同关节区域的成纤维细胞和滑膜细胞呈现差异性的免疫表型 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本;抗生素治疗后仅观察了一个时间点(感染后4周),可能未完全捕捉炎症消退的完整动态过程 探索莱姆关节炎感染后关节组织的空间基因表达环境及其在病理发生中的作用 感染伯氏疏螺旋体的C3H小鼠的踝关节组织 空间转录组学 莱姆关节炎 空间转录组学 NA 基因表达数据 感染后2周(炎症高峰期)和感染后4周(抗生素治疗后炎症消退期)的C3H小鼠踝关节样本,以及媒介物处理的对照组 NA 空间转录组学 NA NA
64 2026-07-13
NanoCellAnnotator: Formalizing Expert Cell Type Annotation with Large Language Models
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种名为NanoCellAnnotator的生物约束框架,利用大型语言模型在空间转录组学中进行自动细胞类型注释 将空间结构发现、确定性生物学证据构建与轻量级语言模型推理解耦,并引入置信度估计和受限标签选择机制以避免产生生物学上不支持的预测和幻觉细胞类型 依赖PanglaoDB和CellMarker等数据库构建允许标签空间,可能无法覆盖所有细胞类型;轻量语言模型性能可能不及大型云端模型 开发一种生物约束且具有置信度感知的自动细胞类型注释方法,应用于空间转录组学数据 空间转录组学数据中的细胞簇及其标记基因 数字病理学 肝内胆管癌、乳腺癌 空间转录组学 大型语言模型(LLM) 空间转录组学数据 肝内胆管癌数据集和独立乳腺癌空间转录组学数据集 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组学平台
65 2026-07-13
Type I Interferon-Driven Monocyte Dysregulation and MAS-associated CD8+ T cells During Macrophage Activation Syndrome
2026-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 使用bulk和单细胞RNA测序研究儿童巨噬细胞活化综合征中单核细胞和CD8+ T细胞的转录变化 首次发现I型干扰素而非IFNγ驱动MAS单核细胞反应,并识别出一种与MAS相关的独特CD8+ T细胞群体 样本来自儿童,可能不适用于成人患者;未涉及功能验证实验 阐明巨噬细胞活化综合征中单核细胞的转录改变及其在病理机制中的作用 巨噬细胞活化综合征儿童患者的单核细胞 machine learning, digital pathology 巨噬细胞活化综合征, 系统性红斑狼疮, 新冠肺炎 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq cell-cell communication algorithms RNA sequencing data MAS儿童与健康对照 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
66 2026-07-13
Single-cell profiling reveals CCL5Hi GZMAHi effector memory CD8 T cell association to oligoarticular JIA
2026-Jun-03, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 通过单细胞分析揭示CCL5Hi GZMAHi效应记忆CD8 T细胞与少关节型幼年特发性关节炎(oligo JIA)的关联 首次在单细胞水平上揭示了oligo JIA患者滑液中活化的效应记忆CD8+ T细胞(CD8+TEM)的克隆扩增和细胞毒性特征,并发现这些细胞表达CCL5、GZMA和GNLY,且与葡萄膜炎相关的MAIT细胞克隆扩增和转录重编程 发现队列样本量较小,仅包含3例初治新发oligo JIA患者、4例葡萄膜炎发作患者和4例健康对照;验证队列样本量有限 表征oligo JIA及其关节外表现(葡萄膜炎)的免疫病理机制,鉴定致病细胞群和调控机制 少关节型幼年特发性关节炎(oligo JIA)患者及其葡萄膜炎并发症 单细胞基因组学 幼年特发性关节炎 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,质谱流式细胞术(CyTOF) NA 单细胞转录组和TCR测序数据,质谱流式细胞术数据 发现队列:14个样本(3例oligo JIA患者的PBMC和配对SF,4例葡萄膜炎患者的PBMC,4例健康对照的PBMC);验证队列:13例oligo JIA患者、8例葡萄膜炎患者和6例健康对照 NA 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,质谱流式细胞术 NA NA
67 2026-07-13
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-06-01, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 揭示HNF1A缺陷通过阻碍GLI3加工促使后肠向十二指肠而非胰腺命运分化,导致体内肠道伸长 首次阐明HNF1A与Hedgehog信号之间的自调节环路,解释其在后肠细胞命运决定中的作用 主要基于体外分化模型和转基因小鼠,缺乏人类疾病直接验证 探索Hedgehog信号控制后肠细胞谱系分离的分子机制 人类诱导多能干细胞分化模型和小鼠转基因模型 分子生物学、发育生物学 糖尿病、胰腺发育相关疾病 批量转录组学、单细胞转录组学、显微镜、生理学、遗传细胞追踪 NA 转录组数据、图像数据 人类诱导多能干细胞和转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
68 2026-07-13
A Dynamic Change of Microglial States Occurs During the Transition From Photoreceptor Degeneration to Regeneration in Zebrafish pde6c Mutants
2026-06, Glia IF:5.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了斑马鱼pde6c突变体中视网膜小胶质细胞从感光细胞退行到再生过程中的动态状态变化 首次描绘了斑马鱼视网膜小胶质细胞在慢性感光细胞退行和Müller胶质细胞介导的神经元再生过程中的转录组异质性和动态变化,并发现了退行反应簇表达神经保护和组织修复基因 未提及研究的方法学局限性或适用范围限制;可能仅限于斑马鱼模型,未在人类或其他哺乳动物中进行验证 理解小胶质细胞功能状态在神经元退行和再生过程中的调控机制 斑马鱼pde6c突变体视网膜中的小胶质细胞 数字病理学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 野生型同胞和pde6c突变体的视网膜样本,分别于5 dpf(感光细胞退行起始)和4 wpf(Müller胶质细胞介导的再生阶段)采集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
69 2026-07-10
IL-17-driven tumor cell-intrinsic inflammatory programming creates an immunotherapy-permissive microenvironment
2026-Jun-30, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程可创造免疫治疗允许的微环境,尤其在卵巢透明细胞癌中 首次阐明IL-17通过激活NF-κB依赖性炎症程序增强肿瘤免疫微环境对免疫检查点抑制剂的敏感性 主要基于小鼠模型和有限的人类样本,IL-17响应性肿瘤细胞炎症编程的临床转化潜力需进一步验证 探索IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程在卵巢透明细胞癌免疫治疗响应中的作用机制 卵巢透明细胞癌患者样本及同源小鼠模型 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 180例人类样本及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序平台
70 2026-07-10
Advancements in diagnosis and treatments of acute leukemia
2026-Jun-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
评论 总结急性白血病在微小残留病灶指导的精准分层、靶向治疗、细胞免疫治疗和异基因造血干细胞移植方面的里程碑式进展,并讨论未解决的临床瓶颈和未来方向 将MRD从预后指标升级为风险分层的核心决策因素,并系统总结LSC导向的MRD检测、单细胞测序等技术创新在提高监测灵敏度方面的作用 仍面临抗原逃逸、CAR-T细胞持久性、移植物抗宿主病和治疗可及性等挑战 总结急性白血病诊断和治疗的最新进展,提出未来改善治愈率和长期生存的方向 急性白血病患者,包括复发/难治性和老年患者 自然语言处理 急性白血病 单细胞测序, 数字PCR NA 文本 NA NA NA NA NA
71 2026-07-10
Diosgenin alleviates radiation nephropathy by suppressing renal mTORC1 signalling with concomitant effects on the gut and liver
2026-Jun-29, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 该研究通过整合单细胞转录组学、网络药理学和体内验证,揭示薯蓣皂苷通过抑制mTORC1信号通路减轻放射性肾病的机制,并伴随对肠道和肝脏的调节作用 首次利用单细胞转录组学解析放射性肾病中肾小管细胞和免疫细胞的mTORC1激活模式,并结合网络药理学和分子动力学模拟阐明薯蓣皂苷与mTOR的高亲和力结合,建立多组学框架揭示药物对肠道-肝脏轴的协同效应 未提及具体局限性,但可能包括小鼠模型与人类差异、辐射暴露方式的临床可比性以及长期疗效和安全性数据缺失 阐明薯蓣皂苷减轻放射性肾病的分子机制及其对肠道和肝脏的系统性影响 全身照射小鼠模型 数字病理学 放射性疾病(放射性肾病) 单细胞转录组学(scRNA-seq)、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、体内验证 mTORC1信号通路靶点分析 基因表达数据、蛋白质结构数据、组织病理学数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中明确给出 NA 单细胞RNA测序 NA NA
72 2026-07-10
Transcriptional heterogeneity predicts and enables clonal selection in ageing haematopoiesis
2026-Jun-25, Research square
研究论文 通过整合克隆谱系追踪和单细胞RNA测序,研究造血干细胞在衰老过程中的转录异质性如何预测并驱动克隆选择 开发了scCloneVar计算框架来量化克隆分辨率的转录异质性,发现转录变异性(而非平均状态)能预测衰老相关克隆选择,且DVG相关程序在人和小鼠中保守 未提及具体局限性 探究克隆内姐妹细胞间的转录变异性(而非转录状态)是否为预测衰老相关克隆选择的关键属性 小鼠造血干细胞(HSC)及其克隆 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) scCloneVar(计算框架) 单细胞转录组数据 涉及异时和同时间移植模型中的HSC克隆 NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-07-10
Comparative Transcriptional Profiling of Key Macrophage and Fibroblast Subpopulations in Rheumatoid Arthritis-Associated Lung Disease
2026-Jun-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 利用Flex单细胞RNA测序比较类风湿关节炎相关肺病中关键巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱 首次使用探针基础的Flex单细胞RNA测序对固定肺组织标本进行转录组分析,比较RA-ILD与RA肺结节中巨噬细胞和成纤维细胞的基因表达差异,并揭示与IPF的转录重叠 标题和摘要未明确提及研究局限性,样本量较小(对照组4例,RA-ILD组9例,RA结节组3例) 通过转录组分析评估不同类风湿肺病中细胞特异性基因表达和通路激活,比较RA-ILD与RA肺结节及IPF的差异 固定肺组织标本中的巨噬细胞和成纤维细胞亚群 数字病理学 类风湿关节炎、间质性肺病、肺结节、特发性肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4名无疾病对照、9名RA-ILD患者、3名RA结节患者的肺标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium Flex 探针基础的Flex单细胞RNA测序(scRNA-seq)处理固定肺组织标本
74 2026-07-10
Pathway-centric visualization of cell-cell communication in single-cell transcriptomics data
2026-06-20, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 开发了scVizComm,一个用于交互式可视化单细胞转录组数据中细胞间通信的Web门户 提供了一个非编程的交互式可视化平台,并能够整合分子通路信息以优先分析细胞间通信中的下游受体信号 依赖于预计算的结果,可能无法实时分析新数据集 实现单细胞转录组数据中细胞间通信的途径中心化可视化 人类肾脏和心脏单核转录组数据,以及小鼠前脑数据 数字病理学 纤维化相关疾病 单核RNA测序 NA 基因表达数据 人类肾脏和心脏组织样本,以及小鼠前脑样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单核RNA测序数据
75 2026-07-10
Adiposity-Associated Monocyte Costimulatory Programming in Rheumatoid Arthritis Identified by Single-Cell Transcriptomics
2026-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过单细胞转录组学识别类风湿关节炎中与肥胖相关的单核细胞共刺激编程 首次在单细胞水平揭示肥胖通过增强单核细胞共刺激信号通路促进类风湿关节炎适应性免疫激活的机制 未提及具体局限性 探究肥胖如何增强类风湿关节炎中单核细胞的共刺激编程,从而促进适应性免疫激活 来自31名捐赠者(16名类风湿关节炎患者和15名非RA对照)的纯化循环单核细胞 单细胞转录组学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 31名捐赠者(16名RA患者和15名对照),约135,599个单核细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Flex平台 10x Genomics Flex平台用于纯化循环单核细胞的单细胞RNA测序
76 2026-07-10
JMJD3-driven epigenetic reprogramming of p16INK4a-positive cells promotes tendon regeneration
2026-06-11, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 研究表明损伤诱导的p16阳性细胞通过JMJD3驱动的表观遗传重编程促进肌腱再生 首次揭示p16阳性细胞在肌腱再生中的有益作用及其依赖JMJD3的表观遗传机制,挑战了p16仅为衰老标志的传统认知 主要基于小鼠模型,缺乏人体组织验证;具体信号通路上下游调控细节未完全阐明 阐明p16阳性细胞在肌腱再生中的细胞身份和功能贡献 小鼠跟腱损伤模型中的p16阳性细胞 数字病理学 肌腱损伤 单细胞RNA测序, 原位免疫染色, 组蛋白去甲基化酶活性分析 NA 基因表达数据, 组织图像 小鼠跟腱损伤模型(具体样本量未明确提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
77 2026-07-10
circVDJ-seq for T cell clonotype detection in single-cell and spatial multi-omics
2026-06-10, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 介绍circVDJ-seq技术,用于从3'导向的单细胞和空间多组学工作流程中简化且高效地检测T细胞克隆型 circVDJ-seq提供了一种简化且经济高效的T细胞受体分析方法,可从单细胞RNA测序、ATAC+RNA多组学和空间转录组学等3'导向工作流中获取VDJ信息,无需特殊测序设备 NA 开发并验证一种可兼容多种3'导向单细胞和空间组学技术的T细胞克隆型检测方法 新鲜切除的神经母细胞瘤组织和受肺炎或COVID-19影响的死后淋巴结组织中的T细胞 machine learning 肿瘤学, 传染病学 circVDJ-seq NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 新鲜切除的神经母细胞瘤组织样本和死后淋巴结样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学 10x Chromium NA
78 2026-07-10
Inflammatory genital strain of Chlamydia trachomatis elicits a Th17 immune response
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 该研究比较了沙眼衣原体炎症株D血清型与非炎症株L2血清型在小鼠生殖道感染中诱导的免疫反应差异,发现D血清型选择性驱动Th17细胞极化,引发炎症性CD4+ T细胞反应 首次通过单细胞RNA测序揭示D血清型感染后子宫CD4+ T细胞的Th17偏向性转录特征,包括Bhlhe40和Il1r1上调,表明Th17细胞在沙眼衣原体免疫病理学中的关键作用 研究仅使用小鼠模型,人类免疫反应的复杂性可能未完全体现;未深入探讨Th17细胞如何具体导致组织损伤的分子机制 阐明沙眼衣原体不同血清型感染后CD4+ T细胞反应差异及其与免疫病理学的关系 沙眼衣原体D血清型和L2血清型感染的小鼠模型 机器学习 生殖道感染 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 小鼠子宫组织中的CD4+ T细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
79 2026-07-10
scRNA-seq and genomics analyses reveal key mechanisms of inverted papilloma-associated sinonasal squamous cell carcinoma malignant transformation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 整合单细胞RNA测序、空间蛋白质组学与全外显子测序揭示内翻性乳头状瘤相关鼻窦鳞状细胞癌恶性转化的关键机制 首次通过多模态数据整合发现CXCL14-IDO免疫抑制新机制,明确呼吸道上皮基底细胞为起源细胞并解析肿瘤-基质界面的免疫重编程 未提及 阐明内翻性乳头状瘤恶性转化为鼻窦鳞状细胞癌的分子与免疫驱动机制 内翻性乳头状瘤与IP相关鼻窦鳞状细胞癌患者的组织样本 数字病理学 鼻窦鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 全外显子测序 未涉及 基因表达数据, 蛋白质空间分布数据 内翻性乳头状瘤与IP相关鼻窦鳞状细胞癌队列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
80 2026-07-10
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and immune microenvironment in lymphatic metastasis of head and neck squamous cell carcinoma
2026-06, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 通过单细胞转录组学分析揭示了头颈部鳞状细胞癌淋巴转移中的异质性和免疫微环境 首次对头颈部鳞状细胞癌的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织进行单细胞RNA测序比较分析,识别出与肿瘤发生和转移相关的特定细胞亚群,并构建了基于INHBA、SFRP2、SPP1和IFI27表达的预后模型 样本量较小(7个转移组织和5个非转移组织),可能限制了发现的普适性和统计效力 探究头颈部鳞状细胞癌淋巴转移过程中的细胞异质性和免疫微环境特征 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 7个淋巴结转移组织样本和5个非转移组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
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