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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-04-18
Single-cell RNA sequencing of the post-spinal cord injury dorsal root ganglia in cynomolgus monkeys: Elucidation of the cellular immune microenvironment of the central nervous system
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,首次全面描绘了食蟹猴脊髓损伤后背根神经节(DRG)的细胞免疫微环境图谱,并重点解析了巨噬细胞亚群在其中的作用 首次在食蟹猴脊髓损伤模型中,对背根神经节区域进行全面的单细胞转录组分析,揭示了巨噬细胞亚群的异质性及其在轴突再生调控中的潜在关键作用 研究基于单一物种(食蟹猴)的损伤模型,样本量有限,且为观察性研究,功能验证有待进一步实验 阐明脊髓损伤后背根神经节免疫微环境的细胞组成变化及其对轴突再生的影响 食蟹猴的背根神经节和脊髓组织细胞 单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 食蟹猴中胸段挫伤模型的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
62 2026-04-18
Modulation of mitochondrial dysfunction: Mechanisms and strategies for the use of natural products to treat stroke
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文综述了天然产物通过调控线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制与策略 系统总结了天然产物通过多靶点调控线粒体功能障碍(如生物合成、动力学平衡、自噬、抗凋亡、氧化应激调节和细胞间线粒体转运)在脑卒中治疗中的神经保护作用,并提出了整合单细胞测序和类器官模型等新技术以深入探索其机制的未来研究方向 天然产物的临床转化面临成分复杂性导致的标准化困难、跨区域临床数据不足以及缺乏长期安全性评估等挑战 探讨天然产物通过调控线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制与策略 天然产物(如虫草、羟基红花黄色素A、人参皂苷Rb3、绞股蓝皂苷XVII、银杏内酯K、灯盏花素和大黄酚)及其在脑卒中模型中的神经保护作用 NA 脑卒中 单细胞测序、类器官模型 NA NA NA NA NA NA NA
63 2026-04-18
Heterogeneity of the adult mammalian forebrain neurogenic ependyma: A comprehensive cellular map
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,全面绘制了成年小鼠前脑室管膜表面的细胞图谱,揭示了其细胞组成的异质性 首次在成年小鼠前脑室管膜表面识别出12种不同的细胞亚型,并详细分类了CD133+和CD133-细胞的具体组成,为解决关于成年神经干细胞存在的争议提供了新的细胞学视角 研究仅基于小鼠模型,未在人类或其他哺乳动物中进行验证,且功能验证和临床转化潜力尚需进一步探索 探究成年哺乳动物前脑室管膜表面的细胞异质性,并澄清关于成年神经干细胞存在的长期争议 成年小鼠前脑侧脑室侧壁的室管膜表面细胞 单细胞组学 神经系统疾病 单细胞RNA测序,免疫细胞化学分析 NA 单细胞转录组数据,免疫染色图像 未明确指定样本数量,但基于成年小鼠前脑侧脑室侧壁的全贴片样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-04-18
Integrating bulk and single-cell transcriptome profiling to uncover diagnostic biomarkers and regulatory mechanisms of oxidative stress in spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据,揭示了脊髓损伤中氧化应激的诊断生物标志物及其调控机制 整合bulk和单细胞转录组数据,系统分析氧化应激相关基因在脊髓损伤中的表达模式和调控网络,并识别潜在治疗药物 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅限于小鼠模型,人类样本的验证可能有限 探索脊髓损伤中氧化应激相关基因的表达、调控机制及诊断生物标志物,以改善诊断和治疗策略 人类血液样本和小鼠损伤脊髓组织 生物信息学 脊髓损伤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光, 定量PCR NA 转录组数据, 单细胞数据 来自GEO数据库的人类血液样本和小鼠脊髓组织数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
65 2026-04-17
Evaluation of the impact of glycolysis-related gene signatures on prognosis and therapeutic targeting in lung adenocarcinoma
2026-Jun, Cytotechnology IF:2.0Q4
研究论文 本研究通过生物信息学方法,评估了糖酵解相关基因特征对肺腺癌预后及治疗靶向的影响 结合多组学数据(TCGA、GEO数据库的bulk RNA-seq和scRNA-seq),利用机器学习框架筛选糖酵解相关预后标志物,并构建了具有强预测能力的预后特征,同时分析了其与肿瘤微环境免疫浸润、细胞间通讯及药物敏感性的关联 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;生物信息学分析结果需要进一步的体外或体内实验验证 探究糖酵解基因与肺腺癌进展的关联,并构建基于糖酵解相关预后标志物的风险特征以评估预后和指导治疗 肺腺癌患者(来自TCGA和GEO数据库的基因表达数据及单细胞RNA测序数据) 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序,基因表达谱分析,机器学习 机器学习计算框架(包含多种算法组合),Cox回归模型 基因表达数据(bulk RNA-seq和scRNA-seq) 一个来自TCGA的训练集和四个来自GEO的验证集(具体样本数未明确说明),以及来自GEO的scRNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
66 2026-04-14
Multi-layer molecular profiling defines an immune-active colorectal cancer subtype with therapeutic relevance
2026-Jun-16, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 本研究通过整合多组学数据定义了结直肠癌的免疫活性亚型,并开发了预后模型和联合治疗策略 建立了整合转录组、表观遗传和突变谱的多组学框架,识别出具有免疫活性的CS3亚型,该亚型在临床微卫星稳定肿瘤中可能被常规检测忽略 未明确说明样本的具体来源和验证队列的规模,临床转化仍需进一步验证 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
67 2026-04-14
Subtypes estimation in single-cell multi-omics data via S-multi-SNE
2026-Jun-07, Journal of theoretical biology IF:1.9Q3
研究论文 本文提出S-multi-SNE方法,用于单细胞多组学数据的细胞亚型估计和可视化 将多视图降维方法multi-SNE和S-multi-SNE应用于单细胞RNA测序数据,并展示其在跨个体、跨物种和跨测序技术数据中识别细胞亚型的有效性,同时整合scATAC-seq和scRNA-seq数据以改进细胞亚型识别 NA 开发用于单细胞多组学数据细胞亚型估计和可视化的多视图降维方法 单细胞RNA测序数据和单细胞多组学数据(包括scATAC-seq和scRNA-seq) 机器学习 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 S-multi-SNE,multi-SNE mRNA计数矩阵,多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 NA NA
68 2026-04-14
Identifying Potential Drug Targets in the Knee Osteoarthritis: Insights from the Druggable Genome
2026-Jun, Rejuvenation research IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过整合可药基因组和孟德尔随机化分析,识别了膝骨关节炎的潜在药物靶点 结合了可药基因组、孟德尔随机化、单细胞MR分析、蛋白质组学验证及遗传信息空间映射框架,从外周和中枢组织角度识别并验证了多个潜在治疗靶点 需要未来进一步实验验证所识别靶点在膝骨关节炎中的作用机制 寻找膝骨关节炎的潜在药物靶点 膝骨关节炎(KOA) 生物信息学 骨关节炎 孟德尔随机化分析、单细胞MR分析、蛋白质组学验证、空间转录组学 NA 基因表达数据、蛋白质定量性状位点数据、全基因组关联研究数据、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
69 2026-04-14
A proliferative subpopulation of coelomocytes in sea cucumber is identified and characterized by single-cell RNA-seq after evisceration
2026-Jun, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在海参中鉴定并表征了去内脏后体腔中一个增殖性亚群的体腔细胞 首次在海参中利用单细胞RNA测序技术,系统识别了体腔和水管系统中的体腔细胞亚群,并揭示了去内脏后一个增殖性亚群(簇10)的动态变化和分化能力 研究主要基于海参单一物种,且依赖于同源物种的细胞标记进行亚群分配,可能限制了结果的普适性 探究海参去内脏后体腔细胞的恢复机制,特别是增殖性亚群的鉴定和功能表征 海参(Apostichopus japonicus)的体腔细胞,包括体腔和水管系统中的细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及海参体腔和水管系统的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-04-14
Single-cell sequencing reveals metabolic reprogramming and immune regulation underlie the maintenance of teleost granulomas
2026-Jun, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组织转录组学、单细胞RNA测序、超微结构成像和荧光原位杂交技术,揭示了硬骨鱼肉芽肿中代谢重编程和免疫调控的维持机制 首次在脊椎动物模型中系统解析了肉芽肿的代谢和功能景观,发现了上皮样巨噬细胞(E-Macs)同时上调氧化磷酸化和糖酵解基因的代谢适应现象,并证实了该调控特征在斑马鱼中的进化保守性 研究主要基于硬骨鱼模型,在哺乳动物中的普适性仍需进一步验证;单细胞测序样本量相对有限 探究脊椎动物肉芽肿结构的生物能量学和维持调控机制 大口黑鲈(Micropterus salmoides)和诺卡氏菌(Nocardia seriolae)感染模型,以及斑马鱼比较分析 单细胞组学 慢性肉芽肿性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组织转录组学、超微结构成像、荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞转录组数据、组织转录组数据、图像数据 多组织(头肾、脾脏、肝脏、肾脏)样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
71 2026-04-14
SpNeigh: spatial neighborhood and differential expression analysis for high-resolution spatial transcriptomics
2026-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文介绍了SpNeigh,一个用于高分辨率空间转录组学空间邻域分析和差异表达建模的R包 SpNeigh通过边界检测、空间邻域提取、距离加权和基于梯度的统计测试,明确建模局部组织环境,如边界、邻域或梯度 NA 开发一个灵活且可解释的框架,用于解析复杂组织中的空间基因表达动态 小鼠大脑、人类乳腺癌和人类肝脏组织 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 基于样条的回归模型 空间基因表达数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD NA
72 2026-04-13
IGHG1+ malignant epithelial Cell-myCAF crosstalk via MIF-CD74/APP-CD74 drives early brain metastasis in NSCLC: Delineated via primary tumor-brain metastasis single-cell and spatial transcriptomics
2026-Jun-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,揭示了非小细胞肺癌早期脑转移的机制,并识别了CD74作为潜在治疗靶点 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了IGHG1+恶性上皮细胞与肌成纤维样癌症相关成纤维细胞通过MIF-CD74/APP-CD74轴相互作用,驱动非小细胞肺癌早期脑转移的新机制 研究为回顾性分析,样本量相对有限(53例患者),且体外和体内验证仍需进一步扩展 探究非小细胞肺癌早期脑转移的机制,开发预测模型并识别潜在治疗靶点 53例非小细胞肺癌患者的石蜡样本,包括正常肺组织、原发肿瘤(有/无脑转移)、脑转移灶和正常脑组织 数字病理学 肺癌 单核RNA测序, 空间转录组学, GeoMx DSP, CosMx SMI Augur, 伪时间分析, 空间通讯分析, ROC分析 转录组数据, 空间表达数据 53例非小细胞肺癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
73 2026-04-11
Multi-omics analysis reveals AR as a potential prognostic factor and immune-related therapeutic target in gastric cancer
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了雄激素受体(AR)在胃癌中的预后价值和作为免疫相关治疗靶点的潜力 首次系统分析了AR在多种癌症类型中的肿瘤免疫微环境作用及其对预后和免疫治疗反应的预测价值,特别是在胃癌中作为不良预后风险因素的新发现 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能影响结果的普适性 探究AR在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为预后标志物和免疫治疗靶点的潜力 多种癌症类型,重点关注胃癌 生物信息学 胃癌 多组学分析,单细胞测序 NA 基因组学,转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-04-11
ACOT8-mediated palmitate accumulation promotes M1 macrophage polarization in renal ischemia-reperfusion injury via activation of the cGAS-STING pathway
2026-Jun-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了ACOT8通过调控棕榈酸积累,激活cGAS-STING通路,从而促进巨噬细胞M1极化,加剧肾缺血再灌注损伤的分子机制 整合多组学数据与多层次实验验证,首次发现ACOT8在肾缺血再灌注损伤中通过调控脂质代谢(特别是棕榈酸)影响巨噬细胞极化的新机制,并利用肾脏特异性AAV9载体进行基因敲低验证其治疗潜力 研究主要在动物模型和细胞实验中进行,其临床转化效果和长期安全性有待进一步验证;ACOT8调控脂质代谢的具体上游信号通路尚未完全阐明 探究ACOT8在肾缺血再灌注损伤中的作用及分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 肾缺血再灌注损伤模型小鼠、肾小管上皮细胞、巨噬细胞 NA 急性肾损伤/肾缺血再灌注损伤 多组学数据分析(pQTL孟德尔随机化、转录组学)、机器学习算法(LASSO、SVM-RFE)、单细胞RNA测序、脂质组学、体内外实验验证 LASSO, SVM-RFE 转录组数据、单细胞RNA测序数据、脂质组学数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
75 2026-04-11
Neutrophil aconitate decarboxylase 1/itaconate axis suppresses extracellular traps via alkylating GSDMD and alleviates murine liver injury
2026-Jun-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文研究了中性粒细胞中ACOD1/itaconate轴通过烷基化GSDMD抑制NETs形成,从而减轻小鼠肝损伤的机制 首次揭示了ACOD1/itaconate轴通过烷基化GSDMD的Cys192残基来抑制NETs形成,为肝病治疗提供了新思路 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 探索ACOD1与NETs在肝损伤中的关系及其作用机制 小鼠中性粒细胞及肝损伤模型 单细胞组学 肝损伤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-03-28
Cell-type-specific genetic associations in Lewy body dementia identified using single-cell eQTL-based Mendelian randomization
2026-Jun, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用单细胞eQTL进行孟德尔随机化分析,识别了路易体痴呆中细胞类型特异的遗传关联 首次将单细胞转录组范围的孟德尔随机化与脑细胞类型特异性eQTL结合,揭示了ANKRD65在兴奋性神经元中表达与路易体痴呆风险的关联 研究主要基于遗传推断,需要进一步实验验证功能机制;样本分层可能影响统计效力 探索遗传变异通过细胞类型特异性机制影响路易体痴呆易感性的关联 路易体痴呆患者及对照人群的脑组织样本 生物信息学 神经退行性疾病 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 逆方差加权模型 遗传与转录组数据 基于APOE ε4携带状态分层的独立路易体痴呆队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
77 2026-03-20
CSPG4+ extracellular vesicles carry fibronectin and interleukin-11 and reflect radiographic severity in knee osteoarthritis
2026-Jun, Osteoarthritis and cartilage open
研究论文 本研究评估了血浆中CSPG4+细胞外囊泡作为膝骨关节炎严重程度的新型生物标志物,并揭示了其在关节组织中的定位及携带的致病性蛋白 首次将血浆CSPG4+细胞外囊泡频率与膝骨关节炎的影像学严重程度相关联,并发现其在滑液中富含纤维连接蛋白和白介素-11 研究未发现CSPG4+细胞外囊泡与症状性骨关节炎严重程度的相关性,且样本量相对有限 评估CSPG4+血浆细胞外囊泡作为膝骨关节炎严重程度的新型生物标志物 膝骨关节炎患者 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 测序数据、影像数据 204名骨关节炎患者(包括51名发现队列、92名验证队列和61名滑液样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2026-03-14
FOXN1 immunodeficiency detected by TREC-based newborn screening - A challenge of management?
2026-Jun, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本文通过TREC新生儿筛查发现FOXN1免疫缺陷,并详细描述了三位携带四种新FOXN1突变新生儿的临床病程,强调管理挑战 首次报道四种新的FOXN1突变,并利用高分辨率单细胞RNA测序结合流式细胞术进行综合免疫表征,揭示B细胞群体异常 样本量小(仅三位新生儿),基因型-表型相关性不完全,临床管理策略仍需验证 探讨非SCID FOXN1免疫缺陷的临床管理挑战,通过免疫表征理解疾病异质性 三位携带FOXN1突变的新生儿 数字病理学 免疫缺陷病 TREC新生儿筛查,流式细胞术免疫表型分析,高分辨率单细胞RNA测序 NA 基因测序数据,流式细胞数据,单细胞RNA测序数据 三位新生儿(P1、P2、P3) NA 单细胞RNA-seq NA NA
79 2026-03-13
Machine learning reveals sex-biased platelet-associated molecular signatures in systemic lupus erythematosus
2026-Jun, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本研究利用机器学习方法揭示了系统性红斑狼疮中性别偏倚的血小板相关分子特征 首次通过整合多个转录组数据集和机器学习算法,系统性识别了SLE中性别特异性的候选基因,特别是发现了血小板糖蛋白VI(GP6)在男性SLE患者中的差异表达及其与PTCRA的关联 研究基于公共数据库的转录组数据,可能受样本异质性和批次效应影响;未进行实验验证;样本量相对有限 探究系统性红斑狼疮中性别差异的分子基础,特别是血小板相关基因的表达模式 338名个体(175名正常对照和163名SLE患者)的转录组数据 机器学习 系统性红斑狼疮 转录组学分析、差异基因表达分析、机器学习算法、单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习算法(未指定具体模型) 转录组数据 338个样本(来自6个SLE研究) NA 单细胞RNA-seq, 转录组分析 NA NA
80 2026-03-10
ADAM12-programmed ECM-CAF remodeling activates PI3K-AKT and enforces an immune-excluded microenvironment to drive bladder cancer progression and therapy resistance
2026-Jun, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本文通过整合单细胞转录组、GWAS和TCGA等多组学数据,结合实验验证,揭示了ADAM12在膀胱癌中通过调控ECM-CAF重塑激活PI3K-AKT通路并促进免疫排斥微环境的机制 首次系统性地将ADAM12鉴定为连接基质重塑、PI3K-AKT信号通路和膀胱癌免疫抑制的核心驱动因子,并验证其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 研究主要基于膀胱癌模型,未在其他癌症类型中验证ADAM12的普适性,且体内外实验的样本规模相对有限 探究膀胱癌中肿瘤相关成纤维细胞介导的基质重塑的致病机制,并寻找潜在的治疗靶点 膀胱癌组织、细胞系(膀胱癌细胞)和动物模型(膀胱癌异种移植和肺转移模型) 数字病理学 膀胱癌 单细胞转录组测序、GWAS、TCGA和GEO数据反卷积、WGCNA、药物反应预测、多重免疫荧光、体外和体内验证实验 NA 转录组数据、基因组数据、图像数据(免疫荧光) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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