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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-06-15 |
G-CSF enhances neutrophil function with potential involvement of INHBA during Aspergillus fumigatus infection
2026-Jun, International journal of medical microbiology : IJMM
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ijmm.2026.151722
PMID:42173078
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研究论文 | 研究G-CSF激活的中性粒细胞在烟曲霉感染中的功能增强作用,并探索INHBA的可能参与 | 首次揭示G-CSF通过下调INHBA增强中性粒细胞抗真菌功能,并提出离体G-CSF激活的中性粒细胞过继转移作为一种新的免疫治疗策略 | 未完全阐明INHBA调控中性粒细胞功能障碍的分子机制,且研究仅限于小鼠模型 | 探究G-CSF激活中性粒细胞对侵袭性烟曲霉感染的治疗潜力及INHBA的调控作用 | 烟曲霉感染小鼠模型及中性粒细胞 | 数字病理学 | 侵袭性曲霉病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 免疫抑制小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 762 | 2026-06-14 |
GREM1/FGFR1-activated myofibroblasts induce immunosuppression and accelerate metastasis in high-grade serous ovarian cancer
2026-Jun-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2529786123
PMID:42268885
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研究论文 | 本文整合多种测序数据与功能实验,揭示了GREM1/FGFR1激活的肌成纤维细胞通过诱导免疫抑制促进高级别浆液性卵巢癌转移的机制 | 首次发现GREM1阳性肌成纤维细胞通过FGFR1-MAPKs-NFκB-TDO2-犬尿氨酸轴驱动免疫抑制和肿瘤转移,并证明GREM1敲低可增强抗PD-1疗法疗效 | 研究主要基于公共数据集和体外/体内模型,尚需更多临床样本验证GREM1 myCAFs作为治疗靶点的可行性 | 阐明癌症相关成纤维细胞与调节性T细胞在高级别浆液性卵巢癌中驱动免疫抑制的机制 | 高级别浆液性卵巢癌转移灶中的GREM1阳性肌成纤维细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 图像 | 使用公共数据集的批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据 | Illumina, 10x Genomics | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组FFPE |
| 763 | 2026-06-14 |
MICA/MICB-Mediated NKG2D Immune Escape in Cervical Cancer: Single-Cell Transcriptomic Mapping of Radionuclide Therapy Targets for Precision Radioimmunotherapy
2026-Jun-13, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785261458459
PMID:42287067
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与实验验证,系统描绘了宫颈癌中MICA/MICB介导的NKG2D免疫逃逸景观,并探讨其对精准放射性核素治疗靶点选择的转化意义 | 首次从单细胞转录组层面解析宫颈癌中NKG2D配体(MICA/MICB)下调与SUSD1上调协同抑制NKG2D介导的抗肿瘤免疫,并建立基于scRNA-seq的精准放射性核素治疗(RNT)分层策略,包括患者分层、放射标记抗MICA/MICB纳米抗体治疗诊断成像及联合放射免疫治疗方案 | 未明确提及,但从文中可推测样本量有限(仅两个scRNA-seq数据集及三种细胞系),且缺乏体内动物模型验证及临床试验数据支持 | 阐明宫颈癌中NKG2D配体失调的机制基础及其对放射性核素治疗靶向性的影响,为精准RNT靶点选择和患者分层提供依据 | 宫颈癌细胞系(HeLa、SiHa)及正常宫颈上皮细胞HCerEpiC,以及两个公共scRNA-seq数据集 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、实时定量PCR、酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据集(GSM1551311和GSM1551411);三种细胞系(HeLa、SiHa、HCerEpiC),每种细胞系5个独立生物重复 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 764 | 2026-06-14 |
Time-series single-cell transcriptomics reveals pervasive daily rhythmicity and nocturnal spermatogenesis in the zebrafish testis
2026-Jun-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee7124
PMID:42284396
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研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序构建成年斑马鱼睾丸时间图谱,揭示昼夜节律调控精子发生的细胞机制 | 首次证明脊椎动物睾丸具有普遍的细胞昼夜节律,发现夜间精子发生的偏好性,并鉴定出新的细胞类型标志物和睾丸亚型 | 仅使用斑马鱼模型,缺乏哺乳动物验证;未完全解析昼夜节律调控的具体分子机制 | 研究斑马鱼睾丸细胞的昼夜节律动态及其在精子发生中的作用 | 成年斑马鱼睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 时间序列单细胞RNA-seq样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 765 | 2026-06-14 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing Identified Novel Nr4a1+ Ear2+ Anti-Inflammatory Macrophage Phenotype under Myeloid-TLR4 Dependent Regulation in Anti-Glomerular Basement Membrane (GBM) Crescentic Glomerulonephritis (cGN)"
2026-Jun-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76055
PMID:42284512
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 766 | 2026-06-14 |
SPP1+ macrophages facilitate the differentiation and maturation of regulatory T cells in tumour-draining lymph nodes of colorectal cancer
2026-Jun-12, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337038
PMID:42285754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌肿瘤引流淋巴结中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴促进调节性T细胞分化和成熟的免疫抑制机制 | 首次阐明肿瘤浸润淋巴结中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44-NF-κB1轴驱动CD137+调节性T细胞成熟,并验证LNP-siSPP1联合抗CD44单抗可协同抑制淋巴结转移 | 未说明 | 绘制结直肠癌肿瘤引流淋巴结的免疫微环境图谱,识别可靶向的免疫调节轴 | 来自7例结直肠癌患者的23对四联样本(原发肿瘤、癌旁正常组织、无肿瘤淋巴结和肿瘤浸润淋巴结) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达定量数据 | 7例患者的23例四联样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 767 | 2026-06-14 |
Corrigendum to "Single-cell RNA-seq reveals functionally distinct biomaterial degradation-related macrophage populations" [Biomaterials Oct:277 (2021) 121116]
2026-Jun-12, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 768 | 2026-06-14 |
Longitudinal profiling reveals immune dynamics and distinct plasma cell signatures during B-cell depletion in IgG4-related disease
2026-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.05.024
PMID:42285873
|
研究论文 | 纵向分析揭示IgG4相关疾病中B细胞耗竭期间的免疫动态及独特的浆细胞特征 | 首次发现一种疾病特异性表达神经肽NMU且IGHV1-69高度偏斜的IgG4+浆细胞亚群,并揭示CD4+Tfh和双阴性T细胞在疾病复发和缓解中的动态变化 | 未提及明显局限性 | 通过纵向多组学分析,明确B细胞耗竭治疗期间IgG4相关疾病的免疫动态,识别致病细胞亚群和与复发相关的生物标志物 | 接受利妥昔单抗治疗的IgG4相关疾病患者 | 机器学习和计算生物学(主要涉及单细胞组学数据分析) | IgG4相关疾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq)、B细胞受体测序、血清蛋白质组学 | NA | 外周血样本、颌下腺和淋巴结组织样本 | 119份外周血样本(来自接受利妥昔单抗治疗的患者,覆盖活动期、缓解期和复发期) | NA | 单细胞转录组学、B细胞受体测序、血清蛋白质组学 | NA | NA |
| 769 | 2026-06-14 |
Inflammation reprograms fibro-adipogenic progenitors to sustain immunopathogenic niches in myositis
2026-Jun-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08966-w
PMID:42285969
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研究论文 | 本研究揭示了炎症通过重编程纤维-脂肪祖细胞来维持肌炎中免疫致病微环境的新机制 | 首次发现组织驻留基质细胞(纤维-脂肪祖细胞)在特发性炎症性肌病中通过感知组织环境并形成炎性微环境,驱动促炎和促纤维化表型,其作用此前未被认识 | 研究主要基于转录组学分析,功能验证依赖体外实验,体内成像和因果关系的直接证据可能不足 | 探究特发性炎症性肌病中疾病活动持续存在的机制,寻找新的治疗靶点 | 特发性炎症性肌病患者(24例)和非疾病对照(6例)的骨骼肌组织 | 数字病理学 | 肌炎 | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 24例IIM患者和6例非疾病对照的骨骼肌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞核3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 770 | 2026-06-14 |
Developing WNT-derived bone anabolic peptides for skeletal aging and fracture by reconstructing thumb and index domains of WNT7B
2026-Jun-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01695-7
PMID:42286253
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研究论文 | 通过重建WNT7B的拇指和索引结构域,开发出WNT来源的骨合成肽,用于治疗骨骼老化和骨折 | 利用AlphaFold增强的序列预测和计算机对接筛选,首次识别WNT7B的重组结构域作为骨合成肽,并通过非经典Ca-NFAT通路独立于致癌的经典Wnt/β-catenin信号发挥作用 | 未提及具体局限性 | 开发WNT来源的骨合成肽以治疗骨骼老化和促进骨折愈合 | WNT7B肽对老龄小鼠和猪骨质疏松模型的治疗效果,以及其促进间充质干细胞功能和骨再生的机制 | 机器学习 | 骨骼老化,骨质疏松 | AlphaFold序列预测,计算机对接筛选,单细胞测序,转基因谱系追踪,生化分析 | AlphaFold | 序列数据,单细胞测序数据,图像(用于骨再生评估) | 老龄小鼠和猪骨质疏松模型,临界尺寸骨缺损模型,涉及多种组织样本和细胞(间充质干细胞) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 771 | 2026-06-14 |
Brillouin microscopy for contact- and label-free quantification of tissue stiffness in lung fibrosis
2026-Jun-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag114
PMID:42286788
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研究论文 | 利用布里渊显微镜对肺纤维化组织硬度进行无标记、无接触的定量评估 | 首次证明布里渊显微镜可对肺纤维化组织进行定量空间硬度测量,并整合到常规研究流程中 | 该研究为概念验证性研究,且仅限于冷冻切片的离体测量,未涉及活体组织检测 | 评估布里渊显微镜在肺纤维化组织硬度定量表征中的可行性,为机械生物学研究提供新工具 | 小鼠肺组织冷冻切片(含纤维化及对照组)和人类纤维化肺组织切片 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 布里渊显微镜 | NA | 图像 | 未在标题和摘要中明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、布里渊显微镜 | NA | 自制布里渊显微镜系统,已用水凝胶刚度标准进行校准 |
| 772 | 2026-06-14 |
Unraveling the HGF/MET axis in Mallory-Denk body pathogenesis associated with liver fibrosis through single-cell transcriptomics
2026-Jun-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02722-4
PMID:42270593
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示Mallory-Denk小体(MDB)发病机制中HGF/MET轴的作用及其与肝纤维化的关系 | 首次通过单核RNA测序(snRNA-seq)识别出与MDB相关的肝细胞亚群(MAHs)及肝星状细胞亚群(aHSCs),并揭示HGF/MET/Ubd轴在MDB形成和肝纤维化中的正反馈调控机制 | 主要基于动物模型和体外类器官实验,人类样本验证规模有限 | 探究肝内细胞间交互驱动MDB发病机制及肝纤维化进展的分子途径 | 小鼠肝纤维化模型、MDB类器官培养样本、含MDB的人肝活检组织 | 数字病理学 | 肝纤维化、肝细胞癌 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(含Ubd基因敲除鼠)及人类肝活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序(snRNA-seq) |
| 773 | 2026-06-14 |
ScRNA-seq Data Reveal Gene Upregulation and Downregulation in Oxygen-Induced Retinopathy
2026-Jun-11, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.951911
PMID:42272073
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析氧气诱导的视网膜病变中的基因上调和下调 | 首次利用单细胞RNA测序数据全面解析氧气诱导视网膜病变中的关键基因表达变化,并鉴定了多个潜在靶基因如Hnrnpu、Vamp2等 | 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;数据来源单一(GSE150703),可能缺乏普适性 | 探索早产儿视网膜病变中氧气诱导视网膜病变的靶基因 | 小鼠视网膜组织细胞 | 数字病理学 | 早产儿视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 来自GSE150703数据集的视网膜组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 774 | 2026-06-14 |
Causal effect estimation from trans-regulatory single-cell CRISPR screens
2026-Jun-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101251
PMID:42269591
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评论 | 介绍从反式调控单细胞CRISPR筛选实验中估计因果效应的关键概念和原则 | 系统解析了在单细胞CRISPR研究中将统计关联解释为因果效应所需的核心假设,并通过实例展示假设违背如何导致偏差 | 未提出新的统计方法或验证框架,仅对现有方法进行因果假设层面的综述性分析 | 阐明在反式调控单细胞CRISPR研究中实现因果效应估计的统计原则与假设条件 | 单细胞CRISPR筛选实验中的基因扰动与表达数据的因果关联 | 机器学习 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2026-06-14 |
A Systemic Immune State Axis Distinguishes Psoriatic Arthritis from Psoriasis
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115121
PMID:42278644
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研究论文 | 通过分析多项公开数据集,定义了区分银屑病关节炎与银屑病的系统性免疫状态轴 | 首次定义了一个与银屑病关节炎相关的系统性免疫状态坐标(CRS),该坐标独立于皮肤炎症反应轴(DIR),并在多种数据层面验证其区分能力 | 研究依赖公开数据集,可能受限于样本异质性和数据整合的批次效应;主要关注未治疗患者,治疗影响未充分探讨 | 揭示区分银屑病与银屑病关节炎的系统性免疫状态特征 | 银屑病患者、银屑病关节炎患者及健康对照者 | 机器学习 | 银屑病、银屑病关节炎 | 全血甲基化测序、单细胞RNA测序、RNA测序、甲基化测序 | NA | 甲基化数据、单细胞转录组数据、转录组数据 | 跨四个核心公开数据集,涉及全血甲基化、PBMC单细胞RNA测序(受试者层面汇总)、皮肤RNA测序和纯化CD4 T细胞甲基化,外加两个外部皮肤队列 | NA | 单细胞RNA测序、全血甲基化测序、RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2026-06-14 |
Integrated Transcriptomic Analysis Suggests a C1Q-Related Macrophage-Fibroblast Signaling Axis in Keloids
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115140
PMID:42278663
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研究论文 | 通过整合转录组分析,揭示瘢痕疙瘩中C1Q相关的巨噬细胞-成纤维细胞信号轴 | 首次提出C1Q相关的巨噬细胞-成纤维细胞通讯模型,并通过体外实验初步验证C1Q对瘢痕疙瘩成纤维细胞的激活作用 | 研究主要基于公共数据集和初步体外实验,缺乏体内实验验证和更深入的机制研究 | 阐明巨噬细胞功能状态如何调控瘢痕疙瘩中成纤维细胞的病理性激活 | 瘢痕疙瘩组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 组织免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像 | 多个公共数据集及组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-06-14 |
Integrating Single-Cell Profiling with Generative AI for De Novo Design of MMP9 Protein Binders in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2026-Jun-05, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31111969
PMID:42280270
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和生成式AI设计针对弥漫大B细胞淋巴瘤中MMP9的蛋白结合剂 | 首次整合单细胞RNA测序与生成式AI管道(RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold),用于设计靶向MMP9 PEX结构域的蛋白结合剂 | 研究仅验证了部分设计蛋白的结合能力,且蛋白结合剂的体内功能及疗效尚未评估 | 探索MMP9在弥漫大B细胞淋巴瘤ABC亚型中的细胞来源,并设计靶向MMP9的蛋白结合剂 | MMP9蛋白及其PEX结构域,弥漫大B细胞淋巴瘤ABC亚型中的特异性巨噬细胞 | 机器学习 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,生成式AI(RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold),ELISA | RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold | 单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 778 | 2026-06-14 |
Integrative Transcriptomics and Machine Learning Identify Macrophage-Associated Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy
2026-Jun-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115102
PMID:42278626
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研究论文 | 通过整合转录组学和机器学习,在单细胞水平上分析巨噬细胞相关基因在肥厚型心肌病中的表达,识别出三个核心基因并构建诊断模型 | 首次利用单细胞RNA测序结合机器学习方法系统鉴定肥厚型心肌病中巨噬细胞相关的生物标志物并建立诊断模型 | 基于公开数据集,结果需进一步在独立队列中验证;样本量有限,可能影响模型泛化性 | 探究肥厚型心肌病的分子机制,识别巨噬细胞相关的生物标志物并构建诊断模型 | 肥厚型心肌病患者的心肌组织细胞,包括巨噬细胞在内的免疫细胞亚群 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,LASSO回归 | LASSO回归模型,机器学习 | 基因表达数据 | 多个公开数据集(GSE181764、GSE161921、GSE249925),具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 779 | 2026-06-14 |
SpatioCell: deep integration of histology and spatial transcriptomics for profiling the cellular microenvironment at single-cell level
2026-Jun-03, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.06.006
PMID:42285802
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研究论文 | 提出了SpatioCell算法,通过整合组织学与空间转录组学数据,以单细胞分辨率自动提取细胞类型和表达信息 | 创新性地通过动态规划结合形态与转录组信息,实现确定性单细胞空间重构,纠正去卷积错误并揭示被忽视的微环境特征 | NA | 开发一种计算算法,将空间转录组数据提升至单细胞分辨率,以深入理解细胞空间组织 | 三阴性乳腺癌组织样本中的空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 动态规划 | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 780 | 2026-06-14 |
Beyond Molecular Classification in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer: Toward Subtype-Guided Precision Oncology
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115040
PMID:42278564
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综述 | 本文综述了转移性三阴性乳腺癌的分子分类及其在精准肿瘤学中的应用 | 系统整合了mTNBC的基因组、转录组、表观遗传、免疫、基质及生物力学维度的肿瘤异质性,并介绍了新兴工具如单细胞RNA测序、空间转录组学和循环肿瘤DNA分析在患者分层中的潜力 | 临床实施需要更高的方法学标准化、经过验证的预测性生物标志物、可及的诊断平台以及能够捕捉治疗压力下亚型演变的动态监测策略 | 探索mTNBC的分子分类和亚型导向的精准治疗策略 | 转移性三阴性乳腺癌及其分子亚型(BL1、BL2、M、MSL、IM、LAR) | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 循环肿瘤DNA分析, 长链非编码RNA分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 免疫组化数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学技术 |