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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2026-06-17 |
An invariant VLR-like receptor refines the T-like cell framework in lamprey
2026-Jun-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74420-2
PMID:42297841
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研究论文 | 通过单细胞转录组学在七鳃鳗中发现一种恒定VLR样受体,细化了T样细胞框架 | 首次发现并表征了一种种系编码、不进行重组的恒定VLR样受体,揭示了其与VLRC共表达且协调多样化VLR的新模式 | 未明确阐述研究局限性 | 研究七鳃鳗中VLR多样性的细胞组织方式以及单个淋巴细胞整合多种VLR的机制 | 七鳃鳗(雷氏七鳃鳗)的淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自多组织的淋巴细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 742 | 2026-06-17 |
Bisphenol A exacerbates diabetic foot ulcers through disruption of immune microenvironment and repair processes: a multi-omics analysis of environmental exposure mechanisms
2026-Jun-15, Drug and chemical toxicology
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/01480545.2026.2685282
PMID:42298305
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研究论文 | 通过多组学分析揭示双酚A通过破坏免疫微环境和修复过程加重糖尿病足溃疡的分子机制 | 首次系统分析环境污染物双酚A与糖尿病足溃疡的因果关系及其分子机制,并筛选出潜在拮抗剂药物 | 仅基于公共数据库的转录组数据,缺乏体外或体内实验验证 | 探索双酚A在糖尿病足溃疡中的分子机制并筛选拮抗剂 | 双酚A作用靶点和糖尿病足溃疡差异表达基因(来自GEO数据库) | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | NA | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 743 | 2026-06-17 |
Phylogenetic tree inference from single-cell RNA sequencing data with SCITE-RNA
2026-Jun-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04123-w
PMID:42298641
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的系统发育树推断方法SCITE-RNA | 引入最大似然随机扫描贪婪搜索算法,在细胞谱系树和突变树表示之间交替优化以逃逸局部最优 | 标题和摘要中未提供 | 开发适用于单细胞RNA测序数据的系统发育树推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的单核苷酸变异 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 最大似然随机扫描贪婪搜索 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟数据、癌症单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 744 | 2026-06-17 |
YAP/TAZ Drive Oral Leukoplakia Progression and Confer Ferroptosis Vulnerability
2026-Jun-15, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345261451778
PMID:42298963
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研究论文 | 本研究发现YAP/TAZ过度激活驱动口腔白斑进展,并揭示其介导的铁死亡脆弱性,为治疗提供新策略 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出口腔白斑特异性细胞群体,揭示YAP/TAZ激活的双重作用:维持恶性特性同时赋予铁死亡脆弱性,并提出利用临床可用药物组合诱导铁死亡来间接靶向YAP/TAZ | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限或机制验证需进一步临床转化研究 | 阐明YAP/TAZ在口腔白斑进展和恶性转化中的机制,并探索铁死亡诱导治疗的可能性 | 口腔白斑患者样本及转基因小鼠模型中的口腔白斑恶性细胞 | 机器学习 | 口腔白斑 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 口腔白斑患者样本(具体数量未提及)及转基因小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 745 | 2026-06-17 |
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2026-Jun-12, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205397
PMID:42281473
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研究论文 | 该研究利用高通量测序技术定义了小鼠前肢起始的发育和转录程序,鉴定出四个不同阶段,并发现一组受TBX5调控的候选早期转录靶基因 | 首次通过RNA-seq、scRNA-seq、ChIP-seq和Ribo-ITP等多种测序方法系统表征前肢起始的时序性转录程序,并鉴定出区别于其他细胞类型的前肢特征基因集,其中包含参与神经投射和细胞粘附的基因 | 未明确说明局限,但可能包括仅在小鼠胚胎中研究,以及未在功能上验证候选基因的调控机制 | 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制,特别是TBX5依赖性转录调控 | 小鼠胚胎中体壁侧板中胚层(体壁LPM)的前肢起始过程 | 数字病理学 | 不适用 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP | 不适用 | 转录组数据 | 小鼠胚胎,具体样本量未在摘要中说明 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 746 | 2026-06-17 |
Aberrant STAT signaling and T cell dysregulation define a targetable pediatric sepsis endotype
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202867
PMID:42262868
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研究论文 | 该研究通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术,在前瞻性队列中识别出儿科脓毒症的一种异常STAT信号和T细胞失调的内型 | 首次定义了由IL-6和IFN-γ驱动的儿科脓毒症T细胞功能障碍内型,并揭示JAK/STAT轴作为免疫调节治疗的潜在靶点 | 信息未明确提供 | 阐明儿科脓毒症中免疫异质性的机制并寻找可靶向治疗的内型 | 88名危重病患儿的免疫细胞和血浆样本 | 数字病理学 | 儿科脓毒症 | 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、磷酸流式细胞术 | 无监督聚类(对血浆细胞因子进行聚类) | 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 88名危重病患儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 747 | 2026-06-17 |
Single-cell spatial transcriptomics of formalin-fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202488
PMID:42262875
|
研究论文 | 利用成像型单细胞空间转录组学对福尔马林固定石蜡包埋活检组织进行分析,揭示了与结肠炎相关的细胞网络 | 首次将成像型单细胞空间转录组学应用于临床福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本,并识别出与维多珠单抗治疗反应相关的两种不同抗性原型 | 未提供 | 探究溃疡性结肠炎病理机制并识别治疗反应生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检组织 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像型单细胞空间转录组学 | 未提供 | 图像 | 包括溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | 自定义Xenium基因面板 |
| 748 | 2026-06-17 |
Single-cell and spatial transcriptomics unveil myeloid-lymphoid cross talk and the dermal immune niche underlying palmoplantar pustulosis
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.028
PMID:41740929
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示掌跖脓疱病中髓系-淋巴系交叉对话及其皮肤免疫微环境 | 首次通过单细胞转录组与空间转录组联合分析,系统描绘PPP进展过程中的免疫动态网络,并鉴定出CCL19+真皮上层淋巴样免疫微环境及CXCL1/6/8-ACKR1信号在诱导中性粒细胞募集中的关键作用 | 样本仅来自足部病变,未涉及手掌部位;功能验证和药物预测尚需进一步实验证实 | 探究掌跖脓疱病的免疫微环境及其发病机制 | 掌跖脓疱病患者的脓疱及非脓疱足部病灶样本 | 数字病理学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 来自PPP患者的脓疱及非脓疱足部病变组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA测序,10x Visium用于高分辨率空间转录组分析 |
| 749 | 2026-06-17 |
Spatially resolved ex vivo drug response profiling in SMARCB1-deficient sinonasal carcinoma
2026-Jun, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00437-1
PMID:42070010
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研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组学和离体患者来源组织切片培养,解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性、微环境组织及治疗脆弱性,并发现mTOR抑制剂Sapanisertib能诱导肿瘤坏死并消耗特定恶性细胞亚群 | 首次为SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌建立了综合性的离体药物反应图谱,结合单核RNA测序、空间转录组学和患者来源组织切片培养,揭示了肿瘤内异质性和微环境组织,并鉴定出对mTOR抑制剂Sapanisertib敏感的恶性细胞亚群 | 研究主要基于一个指标病例,虽然补充了12例回顾性队列,但样本量仍然较小,可能无法完全代表该罕见肿瘤的多样性 | 解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性和微环境组织,并评估其治疗脆弱性 | SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的肿瘤组织和细胞 | 数字病理学 | 鼻腔鼻窦癌 | snRNAseq, 空间转录组学, 离体组织切片培养 | NA | 单核RNA测序数据, 空间转录组学数据, 组织切片培养数据 | 1例指标病例和12例回顾性队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 750 | 2026-06-16 |
Single-cell transcriptomics and machine learning identify RNF144B and C5AR1 as immune-related molecular signatures and therapeutic targets in myocardial infarction
2026-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-026-01753-z
PMID:41984330
|
research paper | 结合单细胞转录组学与机器学习,鉴定了心肌梗死中RNF144B和C5AR1作为免疫相关分子标志物及治疗靶点 | 通过整合多个转录组数据集与机器学习方法,识别出13个关键基因特征,并利用单细胞数据揭示髓系细胞在心肌梗死发病中的突出作用,以及分子对接预测CCX168为潜在靶向药物 | 转录组数据整合可能受批次效应影响,且动物模型验证结果向临床转化仍需更多验证 | 识别心肌梗死的关键调控基因,阐明其作用机制,并促进诊断和治疗应用 | 心肌梗死患者及小鼠模型的转录组数据和单细胞数据 | machine learning | cardiovascular disease | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个转录组数据集及11种心脏细胞类型,小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 751 | 2026-06-15 |
Endothelial AGO1 deficiency reduces breast cancer burden in mice
2026-Jun-12, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-026-10048-6
PMID:42286210
|
研究论文 | 内皮细胞AGO1缺失通过减少血管生成并增强免疫细胞浸润来降低小鼠乳腺癌负担 | 首次揭示内皮细胞特异性AGO1在肿瘤微环境中调控血管生成和免疫稳态的具体功能 | 仅在小鼠同源乳腺癌模型中进行研究,尚未在人类样本中验证 | 阐明内皮细胞AGO1在肿瘤血管生成和免疫调控中的作用 | 内皮细胞特异性AGO1基因敲除小鼠及其野生型同窝对照 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 内皮细胞特异性AGO1敲除小鼠与野生型小鼠,使用E0771细胞诱导肿瘤模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 752 | 2026-06-15 |
Genomics of dendritic cell pyruvate metabolism reveals stage-associated circulating immune signatures in diabetic retinopathy
2026-Jun-10, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111116
PMID:42270003
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研究论文 | 通过整合基因组学分析,研究树突状细胞丙酮酸代谢与糖尿病视网膜病变阶段相关循环免疫特征的关系 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序代谢谱分析,揭示树突状细胞丙酮酸代谢在糖尿病视网膜病变中的阶段特异性免疫特征,并利用环境毒理基因组学推导候选环境暴露因素 | 结果基于观察性分析和假设生成,需功能性实验进一步验证 | 阐明循环丙酮酸在糖尿病视网膜病变进展中的细胞特异性基因组调控及其免疫特征 | 糖尿病视网膜病变患者和健康对照的外周血单核细胞 | 自然语言处理 | 糖尿病视网膜病变 | Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, qPCR | NA | 基因表达数据 | 两个样本孟德尔随机化分析及独立外周血队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 753 | 2026-06-15 |
Deciphering the potential molecular links between ochratoxin A and colorectal cancer: an integrated computational toxicological and single-cell transcriptomic study
2026-Jun-09, Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.toxicon.2026.109184
PMID:42263871
|
研究论文 | 通过整合计算毒理学与单细胞转录组学,揭示赭曲霉毒素A与结直肠癌之间的潜在分子联系 | 首次结合网络毒理学、多队列转录组分析、机器学习及单细胞RNA测序数据,系统解析OTA与CRC的关联,并通过单细胞扰动分析提出功能假设 | 基于计算预测,缺乏实验验证;依赖公共数据库,可能存在数据偏差 | 探索赭曲霉毒素A暴露与结直肠癌发病机制之间的潜在分子机制 | 赭曲霉毒素A预测靶点与结直肠癌相关基因的交叉 | 计算毒理学, 机器学学习, 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 网络毒理学, 转录组分析, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, CellChat, scTenifoldKnk | 机器学习(频率、SHAP重要性、PPI拓扑中心性) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 三个公共单细胞RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 754 | 2026-06-15 |
Unraveling the Molecular Mechanisms of Glioma Recurrence: A Study Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-06, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70306
PMID:41492853
|
研究论文 | 本研究结合单细胞与空间转录组学技术,揭示了胶质瘤复发的分子机制,并识别了关键驱动基因和潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统解析胶质瘤复发过程中成纤维细胞的动态变化及其微环境重塑作用,并发现AEBP1、ZNF708和TSHZ2三个预后相关基因与化疗敏感性关联 | 未提及具体局限性,但基于公开数据库的分析可能受限于样本量和批次效应,且缺乏功能验证实验 | 阐明胶质瘤复发的分子机制,识别关键驱动基因和细胞亚群,并探索潜在治疗靶点 | 胶质瘤原发与复发样本中的单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 随机生存森林, MISTy模型, PROGENy通路分析 | 基因表达数据 | TCGA胶质瘤mRNA数据及GEO单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 755 | 2026-06-15 |
Identification of rheumatoid arthritis manganese metabolism-related diagnostic biomarkers through bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Jun, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08081-3
PMID:41913032
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研究论文 | 通过批量与单细胞RNA测序分析,识别类风湿关节炎锰代谢相关诊断标志物 | 首次系统地将锰代谢失调与类风湿关节炎发病机制联系起来,并利用机器学习筛选出5个高准确性的诊断基因,通过单细胞分析揭示其在巨噬细胞和树突状细胞中的表达特征 | 未提及 | 探索锰代谢紊乱在类风湿关节炎中的作用机制,并识别可靠的诊断标志物 | 类风湿关节炎患者与健康对照的基因表达数据及单细胞数据 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | RNA-seq | LASSO, SVM, RF | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的多个队列 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 756 | 2026-06-15 |
TNF Pathway-Mediated Tolerogenic T-Cell Trajectory Driven by Allergen Immunotherapy
2026-Jun, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70367
PMID:42059108
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析,揭示过敏原免疫治疗通过TNF通路介导的耐受性T细胞轨迹 | 首次在单细胞水平上描述了过敏原免疫治疗过程中Tr17细胞作为促炎与调节性T细胞程序之间的中间状态,并揭示了TNF/TNFR2信号通路在耐受性信号传导中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究过敏原免疫治疗第一年内从3型免疫向调节状态的动态转变以及效应细胞功能障碍的机制 | 过敏原免疫治疗过程中的T细胞亚群(Treg、Tr17、Th17)及细胞内通讯网络 | 数字病理学 | 过敏性气道疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类血液样本及实验小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 757 | 2026-06-15 |
Distinct cellular and subcellular distributions of the alpha and beta isoforms of Heat Shock Protein 90 in the mouse cerebral cortex
2026-Jun, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2026.119412
PMID:42218969
|
研究论文 | 探究热休克蛋白90的α和β亚型在小鼠大脑皮层中的细胞及亚细胞分布差异 | 首次揭示HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层中具有不同的细胞类型和亚细胞分布模式 | 未明确阐述实验局限性 | 阐明HSP90同工型在大脑皮层中的独特功能角色 | 小鼠大脑皮层 | 机器学习 | NA | 免疫荧光染色, 荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 小鼠大脑皮层样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 758 | 2026-06-15 |
CLEC14A correlates with neutrophil infiltration in hepatocellular carcinoma and mediates neutrophil recruitment across liver endothelial cells
2026-Jun-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70077
PMID:42223241
|
研究论文 | 揭示CLEC14A与肝细胞癌中性粒细胞浸润的相关性,并介导中性粒细胞经肝内皮细胞的招募 | 首次发现血管生成受体CLEC14A在中性粒细胞招募中的新作用,并证明其不依赖已知配体MMRN2 | 主要基于体外和动物模型,缺乏临床干预验证;CLEC14A与免疫治疗疗效的直接关联尚未明确 | 阐明CLEC14A在肝细胞癌中性粒细胞跨内皮招募中的机制,为免疫治疗提供新靶点 | 肝细胞癌肿瘤血管、急性肝损伤血管、中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、siRNA敲低、抗体阻断、体外灌流实验、缺血再灌注模型 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织样本 | 公共数据集及手术切除肝细胞癌组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 759 | 2026-06-15 |
Multi-Omics Integration Reveals Incomplete Reactivation of Developmental Cell-Cycle Programs in Adult Human Infarcted Hearts
2026-Jun, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70337
PMID:42260994
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研究论文 | 整合多组学数据揭示成年人类梗死心脏中发育期细胞周期程序的不完全再激活 | 首次通过多组学整合分析(单核RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq和ATAC-seq)揭示成年心脏梗死区域心肌细胞虽能进入细胞周期,但无法完成分裂的关键分子机制,并鉴定出ANLN、KIF18A等五个发育期相关基因的不完全再激活是主要瓶颈 | 基于公共数据集的分析可能受限于样本异质性和批次效应;人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞模型可能与体内实际情况存在差异 | 探究成年人类心肌梗死后细胞周期活跃的心肌细胞为何无法完成分裂的分子机制 | 人类胎儿心脏和成年梗死心脏样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单核RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq、ATAC-seq | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据 | 多个公共数据集,具体样本数量未明确提及 | NA | 单核RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq、批量ATAC-seq | NA | NA |
| 760 | 2026-06-15 |
Interleukin-34-Induced Arg1+ Macrophages Play a Key Role in Breast Cancer Brain Metastasis
2026-Jun-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0639
PMID:42166785
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研究论文 | 本研究通过建立同基因免疫活性小鼠乳腺癌脑转移模型,发现白细胞介素-34诱导的Arg1+巨噬细胞在乳腺癌脑转移中发挥关键作用 | 首次揭示IL34通过诱导ARG1+巨噬细胞促进乳腺癌小脑转移的机制,并证实靶向IL34受体CSF1R的抗体可导致肿瘤缩小 | 基于小鼠模型,且IL34在人类样本中的表达仅依赖两个独立数据集,需进一步验证临床转化潜力 | 探究乳腺癌脑转移中IL34诱导的免疫微环境机制及其治疗靶点 | 小鼠乳腺癌脑转移模型、人类乳腺癌脑转移样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个独立人类脑转移样本数据集,小鼠模型未明确样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |