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当前共找到 956 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2026-06-06 |
3D chromatin architecture-related genes orchestrate LUAD evolution and therapy resistance: insights from integrative machine learning and spatial single-cell mapping
2026-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01914-z
PMID:42240917
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研究论文 | 整合机器学习和空间单细胞测序揭示3D染色质结构相关基因在肺腺癌进展和治疗耐药中的调控作用 | 首次系统鉴定并验证5个3D染色质结构相关基因（SMC3、RAD21、FOXM1、MYBL2和MTA3）在肺腺癌术后复发、索拉非尼治疗反应及肿瘤进展中的关键调控作用，并利用空间转录组学和虚拟单基因扰动分析揭示其在肿瘤增殖细胞中的功能机制 | 研究主要基于公开数据集和生物信息学分析，缺乏临床样本的独立大规模验证，且未深入探讨这些基因在染色质三维结构中的具体调控机制 | 探索3D染色质结构相关基因在肺腺癌术后复发、索拉非尼治疗反应、肿瘤进展及肿瘤微环境调控中的作用 | 肺腺癌（LUAD）患者肿瘤组织及周边正常组织 | 机器学习 | 肺腺癌（lung cancer） | 转录组测序（RNA-seq）、空间转录组测序、单细胞测序、集成机器学习 | 集成机器学习模型 | 基因表达数据（转录组）、单细胞数据、空间转录组数据 | TCGA-LUAD队列及7个GEO数据集（GSE31210、GSE30219、GSE33072、GSE27389、GSE115002、GSE83836、GSE31428），含独立验证队列 | NA | 单细胞转录组测序（single-cell RNA-seq）、空间转录组测序（spatial transcriptomics） | 10x Chromium、10x Visium（推断，基于单细胞和空间测序常用平台） | NA |
| 742 | 2026-06-06 |
Culture-specific transcriptional drifts limit the fidelity of organoid infection models
2026-Jun-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014321
PMID:42241455
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研究论文 | 通过时间序列转录组分析揭示培养诱导的转录漂移影响了患者源回肠类器官在分枝杆菌感染模型中的保真度 | 首次使用人类肠道类器官模拟副结核分枝杆菌感染并表征上皮转录组反应，发现培养相关转录漂移是基因表达变化的主要驱动因素，并通过空间转录组学揭示感染可选择性抵消培养诱导的基因表达变化 | 培养诱导的转录漂移和福斯克林处理均对类器官感染模型产生显著干扰，可能掩盖病原体特异性响应 | 探究培养诱导的人工产物对肠道类器官感染模型的影响 | 患者源回肠类器官 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 患者源回肠类器官，包含MAP感染、FSK处理和未处理对照组的48小时时间序列样本 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 743 | 2026-06-06 |
DEHP-induced male reproductive toxicity: Evidence from population studies, animal experiments, and multi-omics profiling
2026-Jun-04, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120320
PMID:42241798
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研究论文 | 通过人群研究、动物实验和多组学分析评估DEHP暴露与男性生殖毒性的关联 | 采用多层次整合策略，结合NHANES人群数据、大鼠实验、转录组机器学习和单细胞RNA-seq网络推断，系统揭示DEHP生殖毒性机制并预测候选化合物 | 熊果酸的验证仅基于计算模拟，缺乏实验验证 | 探究DEHP暴露与男性睾酮缺乏的关联及分子机制 | 成年男性（NHANES 2013-2016）和雄性SD大鼠 | 机器学习 | 男性生殖毒性 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | 逻辑回归, 集成机器学习 | 文本, 基因表达数据 | NHANES 2013-2016成年男性（具体数量未提及）；Sprague-Dawley大鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 744 | 2026-06-06 |
Widespread transcriptional memory shapes heritable states and functional heterogeneity in cancer and stem cells
2026-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101621
PMID:42242211
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研究论文 | 通过谱系解析的单细胞转录组学揭示癌症和干细胞中广泛的转录记忆塑造可遗传状态和功能异质性 | 首次利用谱系追踪的单细胞转录组学区分可遗传细胞状态与瞬时波动，将转录记忆定义为可遗传异质性的新基础，并揭示聚类状态和潜在状态两类可遗传状态 | 转录记忆的跨细胞类型保守性仅部分观察到，且其维持机制尚未完全阐明，对潜在状态基因的功能优势解释有限 | 解析非遗传异质性的机制，特别是通过可遗传状态促进癌症进化和发育轨迹的分子基础 | 癌症细胞和干细胞中的可遗传细胞状态及其转录记忆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 谱系解析的单细胞转录组学 |
| 745 | 2026-06-06 |
Agility training enhances motor temporal precision by reweighting spinal phase-locked commissural inhibition
2026-Jun-04, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.05.013
PMID:42242212
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研究论文 | 本研究揭示了敏捷训练通过增强脊髓相位锁定交叉抑制来重塑慢速运动神经元活动，从而提升运动时间精确性的机制 | 首次发现敏捷训练通过增强交叉抑制而非均匀增强兴奋来选择性压缩慢速运动神经元活动，并阐明其分子基础为甘氨酸受体表达上调 | 未说明 | 探究敏捷训练改善运动时间精确性的神经回路和分子机制 | 成年斑马鱼的脊髓运动回路 | 计算神经科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 746 | 2026-06-06 |
CD157+ vascular endothelial stem cells represent a conserved subpopulation with an angiogenic gene expression profile
2026-Jun-04, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102931
PMID:42242216
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研究论文 | 鉴定表达CD157抗原的血管内皮干细胞是一个保守的亚群，具有与血管生成相关的基因表达谱，并在血管再生中发挥作用 | 首次系统揭示了小鼠和人类CD157阳性内皮细胞的保守转录谱，发现NFAT通路在血管网络形成中的作用，并识别出人类内皮细胞中类似小鼠CD157阳性细胞的亚群及其定位 | 未充分探讨CD157内皮细胞的临床应用潜力，以及其在疾病模型中的功能验证 | 阐明CD157阳性血管内皮干细胞的分子特征及其在血管再生中的保守机制 | 小鼠和人类组织中的CD157阳性血管内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类多个组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 747 | 2026-06-06 |
Human primary antibody response to vaccination follows a partially sequential class-switching program with a checkpoint at IGHG2
2026-Jun-04, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102848
PMID:42242228
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研究论文 | 研究人类首次对疫苗接种反应中抗体类别转换的部分有序程序，并在IGHG2处发现检查点 | 首次在人体初次免疫反应中，通过单细胞和批量测序结合，揭示类别转换遵循部分有序程序，并在IGHG2处存在检查点，挑战了单基因无菌转录的普遍观点 | 该研究仅关注SARS-CoV-2疫苗接种后的前三周反应，可能无法完全代表长期或不同抗原刺激下的类别转换动力学 | 阐明人类初次免疫应答中抗体类别转换的动力学和机制 | COVID-19未感染的健康志愿者在SARS-CoV-2疫苗接种后前21天的外周血B细胞 | 自然语言处理 | COVID-19 | B细胞受体库测序, 单细胞转录组测序, 免疫表型分析, IGHC无菌转录分析 | NA | 文本, 图像 | COVID-19未感染的健康志愿者，每两天采样一次，持续三周 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell B Cell Receptor和转录组测序平台 |
| 748 | 2026-06-06 |
High Uric Acid Promotes Stem Leydig Cell Senescence by CCDC90B Mediates Mitochondrial Quality Control Imbalance
2026-Jun-04, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70237
PMID:42242294
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研究论文 | 揭示高尿酸通过CCDC90B介导线粒体质量控制失衡促进干细胞莱迪希细胞衰老 | 首次在单细胞RNA测序水平揭示高尿酸条件下干细胞莱迪希细胞衰老现象，并发现CCDC90B作为关键调控靶点，AAV介导的基因治疗为低睾酮水平提供新思路 | 未提及具体限制 | 探究高尿酸影响干细胞莱迪希细胞功能的分子机制 | 干细胞莱迪希细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 749 | 2026-06-06 |
Luminal-basal stratification of the native human pancreatic duct is differentially represented in pancreatic cancers
2026-Jun-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337970
PMID:42242908
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示人类胰腺导管细胞群在正常组织和胰腺癌中的管腔-基底分层差异 | 首次生成人类胰腺导管细胞在正常组织和肿瘤中的空间分辨图谱，发现角蛋白5+细胞群包含ΔNp63+基底细胞和ΔNp63-管腔B细胞，并揭示MUC4和MUC16在管腔B细胞中的新表达 | 未明确提及，但可能包括样本量有限或空间转录组学平台间的技术差异 | 生成人类胰腺导管细胞群在正常组织和肿瘤中的空间分辨图谱，并评估其与胰腺导管腺癌和腺鳞癌的相关性 | 人类胰腺导管细胞群，包括角蛋白5+细胞、ΔNp63+基底细胞、ΔNp63-管腔B细胞，以及胰腺导管腺癌和腺鳞癌标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | 无 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、多重免疫荧光图像 | 使用多个空间转录组学平台获取新数据集，并与公共单细胞RNA测序数据集整合，具体样本数未提及 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 多个空间转录组学平台，包括10x Visium，并结合公共单细胞RNA测序数据集（如10x Chromium） |
| 750 | 2026-06-06 |
Identifying fate-determining transcription factors with single-cell omics
2026-Jun-04, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2026.05.005
PMID:42242982
|
综述 | 系统综述了利用单细胞组学数据识别细胞命运决定转录因子的计算方法，从三个视角组织这些方法 | 首次从细胞状态定义与转变、离散与连续过程、独立与组合作用三个维度系统分类关键转录因子识别方法 | 未提供具体方法的性能比较基准或标准评估数据集 | 综述单细胞组学中识别细胞命运决定转录因子的计算方法并指导工具选择 | 细胞命运决定转录因子（关键转录因子） | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 751 | 2026-06-06 |
Mitochondrial-impaired ductal epithelium fuels TLS formation in Sjögren's disease
2026-Jun-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.05.014
PMID:42243007
|
研究论文 | 发现线粒体功能受损的导管上皮细胞在干燥综合征中促进三级淋巴结构形成 | 首次揭示干燥综合征中纹状导管上皮细胞线粒体功能障碍是三级淋巴结构形成的关键触发因素，并识别出SD-C1亚型作为潜在治疗靶点 | 研究未明确线粒体功能障碍直接导致三级淋巴结构形成的具体分子机制，且动物模型验证主要基于NOD/ShiLtj小鼠，结果外推至人类可能有限 | 探究干燥综合征进展中三级淋巴结构形成的初始驱动因素 | 干燥综合征患者和非干燥综合征患者的唇腺活检组织 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、透射电子显微镜 | NA | 转录组数据、空间转录数据、超微结构图像、组织学图像 | 848例唇腺活检样本（668例干燥综合征，180例非干燥综合征） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 透射电子显微镜用于超微结构分析 |
| 752 | 2026-06-06 |
Insights gained from single-cell transcriptomics on the cellular identity and plasticity of prostate epithelial cells
2026-Jun-04, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-026-01127-2
PMID:42243465
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 753 | 2026-06-06 |
Microglia and neuroinflammation: function, heterogeneity, and crosstalk
2026-Jun-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-026-01438-3
PMID:42243476
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综述 | 综述了小胶质细胞在中枢神经系统中介导神经炎症的功能、异质性及其与其他细胞间的相互作用 | 整合了单细胞测序揭示的小胶质细胞激活状态谱（如DAMs、IRMs、LDAMs），超越了传统的促炎/抗炎二分法，并突出了小胶质细胞在神经炎症网络中的核心通信枢纽作用 | 未说明 | 综述小胶质细胞的起源、发育、分类及其在神经炎症中的动态细胞状态，以及其与其他中枢神经系统细胞的相互作用机制 | 小胶质细胞及其与神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞和外周免疫细胞的相互作用 | 机器学习 | 神经炎症疾病 | 单细胞测序 | 未说明 | 未说明 | 未说明 | 未说明 | 单细胞RNA测序 | 未说明 | 未说明 |
| 754 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing reveals regulated necrosis-associated heterogeneity in pancreatic cancer
2026-Jun-04, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04437-y
PMID:42243587
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，揭示了胰腺癌中调控性坏死相关的异质性 | 首次在单细胞分辨率下发现非恶性细胞的调控性坏死状态对胰腺癌异质性有显著贡献，并识别出免疫抑制功能的免疫细胞表现出更高的调控性坏死活性 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在批次效应和样本选择偏差；候选基因A2ML1的功能验证尚未在实验中进行 | 确定调控性坏死相关基因在胰腺癌中的异质性及其预后价值 | 胰腺癌患者样本的单细胞RNA测序数据、转录组数据、体细胞突变和拷贝数变异数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和ICGC数据库的胰腺癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 从GEO数据库下载的单细胞RNA测序数据，TCGA和ICGC数据库的批量RNA测序数据 |
| 755 | 2026-06-06 |
scKSFD: federated distillation model with knowledge sharing for cell type classification of clinical transcriptome data
2026-Jun-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06508-x
PMID:42243648
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研究论文 | 提出一个联邦蒸馏框架scKSFD，通过知识共享进行隐私保护的细胞类型分类，适用于临床转录组数据 | 在预测空间通过共享参考数据集的概率级软标签输出实现知识聚合，降低隐私风险；集成分层代理采样以保留稀有细胞群体，并使用概率级聚合缓解批次特异表达偏移 | 依赖参考数据集的质量和代表性；概率级知识共享可能在某些极端异质性场景下性能有限 | 开发一种保护隐私的细胞类型分类方法，解决跨机构单细胞转录组数据协作中的隐私和分布异质性挑战 | 42个临床单细胞转录组数据集 | 机器学习 | 新型冠状病毒病 | scRNA-seq | CNN | 基因表达数据 | 42个临床单细胞转录组数据集 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 756 | 2026-06-06 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Jun-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序系统描绘肿瘤浸润NK细胞的表型和功能景观，发现两种对立的NK细胞群体与免疫抑制相关 | 首次揭示NK细胞中存在由IFNG和TGFB1信号驱动的二分类表型和功能景观，并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断疗法响应相关 | 未提及具体局限性 | 研究肿瘤浸润NK细胞的异质性及其对免疫反应和临床预后的影响 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞（NK细胞） | 自然语言处理 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种肿瘤类型的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 757 | 2026-06-06 |
Thyroid hormone signaling causally influences pancreatic disease risk: Evidence from Mendelian randomization and multi-omics integration
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学整合分析揭示甲状腺激素信号因果影响胰腺疾病风险 | 首次利用双向孟德尔随机化建立甲状腺功能与胰腺疾病因果关联，并整合单细胞RNA测序和空间转录组学阐明细胞类型特异性机制 | 未提及具体局限性 | 确定甲状腺功能与胰腺疾病（急性胰腺炎、慢性胰腺炎、胰腺癌）的因果关系及其分子机制 | 超过50万例GWAS个体、172例胰腺腺癌、急性胰腺炎（32,830个细胞）、慢性胰腺炎（30,426个细胞）、胰腺癌（95,751个细胞）、253个空间转录组区域 | 机器学习 | 胰腺疾病 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因型数据、转录组数据、单细胞表达数据、空间转录组数据 | 超过50万例个体、172例肿瘤、158,407个细胞、253个空间区域 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx Digital Spatial Profiler | 10x Chromium单细胞3'测序, NanoString GeoMx空间转录组学 |
| 758 | 2026-06-06 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出了一种基于坐标卷积神经网络的自动细胞类型识别方法BP-Coord，用于单细胞RNA测序数据分析 | 通过引入坐标信息作为额外通道增强CNN的空间感知能力，并在CoordConv层前添加双三次插值上采样层以捕捉更精确的位置信息 | 未提及具体局限性 | 解决传统CNN在scRNA-seq数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 5个公开scRNA-seq基准数据集，包括大规模PBMC数据集和小样本不平衡数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 759 | 2026-06-06 |
LMCD1 aggravates cardiac fibrosis after myocardial infarction via activating STAT5A
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2026.120153
PMID:42066818
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研究论文 | 本研究探索LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用，发现其通过激活STAT5A促进纤维化过程 | 首次揭示LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的促纤维化作用，并阐明其通过直接结合并激活STAT5A的分子机制 | 仅在小鼠模型和体外细胞实验中验证，缺乏人类样本验证；未探讨STAT5A下游具体靶基因 | 阐明LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的功能及分子机制，为抗纤维化治疗提供新靶点 | 小鼠心肌梗死模型、TGF-β1诱导的原代心脏成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、Western blot | NA | 单细胞测序数据、蛋白表达数据 | 小鼠心肌梗死模型（LAD结扎术）；原代心脏成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 利用公开的单细胞RNA测序数据集进行分析 |
| 760 | 2026-06-06 |
Pathogenic and Clinical Implications of the 2-Way Interplay Between Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential and Multiple Myeloma
2026-Jun, Clinical lymphoma, myeloma & leukemia
DOI:10.1016/j.clml.2026.04.003
PMID:42067472
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综述 | 探讨不确定潜能克隆造血与多发性骨髓瘤之间双向相互作用的致病和临床意义 | 首次系统阐述CHIP作为肿瘤微环境修饰因子，通过双向相互作用影响MM进展和治疗反应的新机制 | NA | 总结CHIP在MM中的转化和临床影响证据 | 不确定潜能克隆造血和多发性骨髓瘤 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |