本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-06-18 |
Chromosomal Instability Drives Glioblastoma Heterogeneity and Therapeutic Opportunities
2026-Jun-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501015
PMID:42302064
|
综述 | 本文综述了染色体不稳定性在胶质母细胞瘤异质性和治疗机会中的作用 | 整合了染色体不稳定性驱动胶质母细胞瘤异质性的机制与治疗策略,包括免疫调节和新兴疗法如CAR-T细胞和纳米递药系统 | 未提供具体的实验数据或定量分析,主要基于已有文献的汇总和概念性讨论 | 阐明染色体不稳定性在胶质母细胞瘤进展和治疗中的核心作用,并探索靶向CIN的治疗潜力 | 胶质母细胞瘤及其肿瘤异质性、染色体不稳定性机制和免疫微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 702 | 2026-06-18 |
CTSK+ macrophages drive fibrotic stenosis in benign airway stenosis via the PROS1-AXL pathway
2026-Jun-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117018
PMID:42302376
|
研究论文 | 该研究揭示了CTSK+巨噬细胞通过PROS1-AXL通路驱动良性气道狭窄中纤维化狭窄的机制 | 首次识别出CTSK+巨噬细胞亚群在良性气道狭窄肉芽组织中的特异性富集,并阐明了其通过PROS1-AXL信号轴与CD82+成纤维细胞相互作用促进纤维化的机制 | 未明确提及,但研究中样本量有限,且主要基于体外和动物模型验证,临床转化仍需进一步验证 | 探究良性气道狭窄中纤维化的细胞和分子驱动机制,为治疗提供新靶点 | 良性气道狭窄患者的正常气道、肉芽组织和纤维增殖组织标本,以及小鼠模型 | 数字病理学 | 良性气道狭窄 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、图像数据 | 临床标本包括正常气道、肉芽组织和纤维增殖组织;动物模型使用BAS小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 703 | 2026-06-18 |
ISG15 upregulation characterizes a PD-L1-associated immunosuppressive phenotype with CD8+ T-cell dysfunction in hepatocellular carcinoma
2026-Jun-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116992
PMID:42302375
|
研究论文 | 该研究揭示ISG15上调在肝细胞癌中与PD-L1相关的免疫抑制表型及CD8+ T细胞功能障碍有关 | 首次发现ISG15通过上调PD-L1表达促进肝细胞癌免疫逃逸,并通过单细胞测序鉴定出ISG15富集的CD8+ T细胞亚群呈现干扰素/ISG相关和衰竭特征 | 研究主要基于TCGA数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证及大规模临床样本的多中心验证 | 探究ISG15在肝细胞癌免疫抑制中的作用及其作为免疫治疗潜在靶点的可能性 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及HepG2、MHCC97L肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织图像 | TCGA-LIHC队列(约374例肝癌样本)及临床HCC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 704 | 2026-06-18 |
ENPP1 blockade with a humanized monoclonal antibody enhances renal repair after acute kidney injury
2026-Jun-16, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.05.011
PMID:42302792
|
研究论文 | 人源化单克隆抗体阻断ENPP1促进急性肾损伤后肾脏修复 | 首次发现ENPP1在急性肾损伤中的关键调控作用,并开发了人源化单克隆抗体通过靶向ENPP1外核苷酸酶活性促进肾脏修复 | 未提及,但可能包括临床转化前的附加验证需求 | 探索ENPP1在急性肾损伤后的功能及靶向治疗潜力 | 人类肾脏组织、小鼠模型、人源化小鼠模型、非人灵长类动物 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明,涉及人类肾脏样本、小鼠样本及非人灵长类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 705 | 2026-06-18 |
TGFb signaling promotes astroglial activation and TDP-43 proteinopathy in organoid models of frontotemporal lobar degeneration
2026-Jun-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190035
PMID:42302828
|
研究论文 | 本研究利用诱导多能干细胞来源的皮层类器官模型,揭示了TGFb信号通路促进星形胶质细胞活化及TDP-43蛋白病在额颞叶变性中的机制 | 首次发现TGFb信号通路在GRN突变导致的星形胶质细胞早熟活化中起关键作用,并证实阻断该信号可减轻TDP-43蛋白病 | 研究基于类器官模型,可能无法完全重现体内复杂微环境;且仅关注了GRN缺失突变,未涉及其他FTLD亚型 | 探究GRN突变如何破坏胶质细胞-神经元稳态并导致神经退行性病变 | GRN基因敲除及GRNR493X突变的诱导多能干细胞来源皮层类器官 | 机器学习 | 额颞叶变性 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | GRN-/-和GRNR493X/R493X类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2026-06-18 |
Single cell RNA-sequencing meta-analysis identifies the molecular signature of smoking cessation on the human lung
2026-Jun-16, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.06.012
PMID:42302895
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析,识别吸烟者戒烟后肺部的分子特征 | 首次利用单细胞RNA测序荟萃分析揭示戒烟对肺部不同细胞类型的转录组影响,特别是发现戒烟后毛细血管气细胞仍然存在血管生成和细胞连接基因的失调 | 荟萃分析整合来自三项研究的数据,可能存在研究间批次效应和样本量较小的问题;未包含从不吸烟者以外的对照组 | 理解戒烟对肺部的分子影响,特别是戒烟后肺部无法完全恢复的转录组基础 | 来自9名从不吸烟者、5名主动吸烟者和7名前吸烟者的肺单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 21个样本(9名从不吸烟者、5名主动吸烟者、7名前吸烟者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用公开的肺单细胞RNA测序数据,来源自三项研究 |
| 707 | 2026-06-18 |
Inferring accumulation times of mitochondrial DNA deletion mutants from cross-sectional single-cell data: methodological framework and validation
2026-Jun-16, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-026-00431-4
PMID:42303633
|
研究论文 | 提出一种从横截面单细胞数据推断线粒体DNA缺失突变体积累时间的方法框架并进行验证 | 首次利用横截面单细胞RNA测序数据推断传统上无法直接测量的mtDNA缺失突变体积累时间,结合Moran随机过程模型量化突变概率、选择优势和有利突变比例 | 目前仅基于合成数据集验证,尚未在大型实验数据集上应用,实际生物系统的复杂性可能影响推断准确性 | 建立一种从单细胞转录组数据量化mtDNA突变动态的方法学框架,为衰老研究提供基础 | 线粒体DNA缺失突变体在骨骼肌和神经元等有丝分裂后细胞中的积累过程 | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | Moran过程(随机出生-死亡模型) | 合成数据集(基于两种线粒体生命周期随机模型生成) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 708 | 2026-06-18 |
Patient-derived three-dimensional lung tumor models to evaluate response to therapy
2026-Jun-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01559-y
PMID:42303760
|
研究论文 | 开发一种新的患者来源的三维肺肿瘤模型(3D-LTM),用于评估对免疫检查点抑制剂治疗的响应 | 首次开发出保留细胞间相互作用和组织结构的离体患者来源三维肺肿瘤模型,能够模拟体内肿瘤微环境,并用于评估免疫治疗响应 | NA | 开发新型临床前模型以评估肺癌对免疫检查点抑制剂的治疗响应 | 非小细胞肺癌患者来源的三维肺肿瘤模型组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 3D细胞培养模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 709 | 2026-06-18 |
High-resolution single-cell sequencing of trans-spliced mRNA
2026-Jun-16, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-026-01373-7
PMID:42303775
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 710 | 2026-06-18 |
Microglial dysregulation and spatiotemporal dynamics of inflammation in multiple sclerosis white matter: an integrative transcriptomic analysis
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08360-2
PMID:42304359
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析多发性硬化症白质中小胶质细胞失调和炎症的时空动态变化 | 首次整合单细胞核RNA测序和空间转录组学,揭示多发性硬化症白质中小胶质细胞异质性和IKZF1转录调节因子的作用,并识别病变边缘为炎症热点区域 | 未提供明确的局限性信息 | 通过整合单细胞和空间转录组学,研究多发性硬化症白质中细胞特异性变化和空间异质性,指导潜在临床干预 | 多发性硬化症白质组织样本 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2026-06-18 |
Single-cell and spatial transcriptomes reveal oligodendrocyte remodeling fatty acid metabolism microenvironment of lung cancer brain metastases
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08447-w
PMID:42304367
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学分析肺腺癌脑转移中少突胶质细胞的脂质代谢重编程及其对肿瘤增殖和免疫抑制的促进作用 | 首次揭示少突胶质细胞在肺腺癌脑转移中经历脂肪酸代谢重编程,其分泌的脂肪酸促进肿瘤细胞增殖并诱导巨噬细胞向免疫抑制表型极化,并鉴定出Mac_FABP4巨噬细胞亚群作为脂质驱动免疫抑制的候选介质 | 研究主要基于公开数据集和体外共培养模型,缺乏体内功能性验证;未探讨其他胶质细胞类型的潜在协同作用 | 探究肺腺癌脑转移中少突胶质细胞的脂质代谢重编程及其对肿瘤增殖和免疫调节的功能性影响 | 肺腺癌脑转移中的少突胶质细胞、肿瘤细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 脂质组学, 脂质示踪技术, Western blot, qPCR, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 脂质组数据, 图像 | 独立单细胞RNA测序数据集(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 712 | 2026-06-18 |
Single-cell multi-omics dissection of RevitalAge Markers uncovers age-dependent immunotherapy resistance and druggable targets in melanoma
2026-Jun-16, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00860-x
PMID:42304383
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析构建RevitalAge标记物图谱,揭示年龄依赖性免疫治疗耐药性及黑色素瘤中的可成药靶点 | 首次利用MOFA算法整合多组学数据识别年龄驱动因子,发现Factor6(RevitalAge Marker)与年龄负相关且具有保护作用,并基于机器学习鉴定了五个核心免疫治疗响应预测特征 | 未提及具体局限性 | 探索年龄相关分子重编程对黑色素瘤进展和治疗敏感性的影响机制 | 黑色素瘤细胞、内皮细胞、成纤维细胞等肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | MOFA、机器学习模型 | 基因组、转录组、甲基化、拷贝数变异数据 | 整合了三个单细胞RNA测序数据集,包含4796个RAM+细胞和7229个RAM-细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2026-06-18 |
Identifying NOTCH signaling-specialized hematopoietic supportive subpopulation from mesenchymal stem cells
2026-Jun-16, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05095-1
PMID:42304412
|
研究论文 | 鉴定间充质干细胞中具有NOTCH信号特化的造血支持功能亚群 | 首次发现MLPH和LPXN作为标志物可分离具有高NOTCH信号活性、增强造血支持和免疫抑制能力的人脐带间充质干细胞亚群 | 未明确提及,但样本仅来自两个供体,需进一步验证 | 探究体外扩增过程中人脐带间充质干细胞的细胞异质性,并鉴定具有最佳临床功能的特定亚群 | 人脐带间充质干细胞及其在体外扩增过程中的不同亚群 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 两个胎儿脐带,共78,178个细胞和14个亚群 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 714 | 2026-06-18 |
DISCERN: inferring drug sensitivity from single-cell transcriptomes using cell-type-specific genetic interaction networks
2026-Jun-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01688-w
PMID:42304445
|
研究论文 | 基于单细胞转录组数据构建细胞类型特异性遗传相互作用网络,开发推断药物敏感性的新计算框架DISCERN | 首次构建覆盖14种人类癌症的细胞类型特异性合成致死和合成存活网络图谱,并开发了基于恶性细胞特异性遗传相互作用推断单细胞药物敏感性的计算方法 | 未在摘要中明确说明局限性 | 利用细胞类型特异性遗传相互作用网络推断单细胞药物敏感性,助力癌症治疗研究 | 14种人类癌症的细胞类型(包括恶性细胞和T细胞) | 计算生物学 | 肺癌,乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14种人类癌症的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 715 | 2026-06-18 |
Integrative spatiotemporal transcriptomics identifies a liver metastasis-related initial cell population associated with the SEMA3A-NRP1 axis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08451-0
PMID:42304476
|
研究论文 | 整合时空转录组学分析,鉴定了与胰腺导管腺癌肝转移相关的初始细胞群及其SEMA3A-NRP1信号轴 | 首次利用单细胞和空间转录组学数据识别出与肝转移相关的初始细胞群(LMIC),并揭示了CAF-SEMA3A-NRP1轴在空间微环境中的调控作用 | 需要进一步体外和体内实验验证LMIC的转移机制以及SEMA3A-NRP1轴的治疗靶点潜力 | 阐明胰腺导管腺癌肝转移相关的初始细胞群的转录特征及其与微环境的空间交互作用 | 胰腺导管腺癌肿瘤样本、癌症相关成纤维细胞、恶性上皮细胞亚群 | 机器学习, 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 10x空间转录组学, 免疫组化 | VECTOR, scTour, Monocle2, CellChat, CellPhoneDB, RCTD, MISTy | 转录组数据 | 多个临床队列的转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 716 | 2026-06-18 |
H4K12 lactylation drives TREM2high macrophages differentiation in liver fibrosis
2026-Jun-16, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001808
PMID:42307631
|
研究论文 | 本文通过多组学分析发现H4K12乳酰化驱动TREM2高表达巨噬细胞分化,促进肝纤维化 | 首次揭示H4K12乳酰化在TREM2高表达巨噬细胞分化中的关键作用,并阐明TREM2/LDHA/H4K12la正反馈环路 | 未提及具体局限性 | 探究TREM2高表达巨噬细胞在肝纤维化中的分化机制及其促纤维化功能 | 人和小鼠的纤维化肝脏组织以及单核细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 转录组学、4D蛋白质组学、CUT&Tag、WGCNA、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组蛋白修饰数据 | 人和小鼠纤维化肝脏样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2026-06-18 |
Divergent macrophage-regulated T cell states determine response to Bacillus Calmette-Guérin vaccine in high-risk bladder cancer
2026-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200442
PMID:42081487
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BCG治疗高风险膀胱癌的免疫应答差异,发现巨噬细胞调控的T细胞状态决定治疗反应 | 首次揭示BCG应答者与非应答者中Th17样Th1细胞与CD8+ T细胞耗竭的差异机制,并利用机器学习识别预测性细胞因子 | 未描述具体限制 | 探究BCG疗法对高风险膀胱癌的免疫激活机制,比较应答者与非应答者的局部及全身免疫反应 | BCG治疗的高风险膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 细胞表达数据 | BCG应答者与非应答者的膀胱免疫细胞及循环免疫细胞样本 | 10x Genomics(假设,基于单细胞RNA测序技术) | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium(假设) | NA |
| 718 | 2026-06-18 |
Stepwise single-cell-resolved deep immunophenotyping pipeline to characterise immune heterogeneity and functionality in health and disease
2026-Jun-13, Journal of immunological methods
IF:1.6Q4
DOI:10.1016/j.jim.2026.114076
PMID:42288331
|
研究论文 | 提出一种逐步单细胞分辨率的深度免疫表型分析流程,用于表征健康和疾病中的免疫异质性与功能 | 整合了严格的预分析措施和第一步细胞术分析,以合理引导后续高效、无偏的单细胞RNA测序表征,避免了试错法并降低了成本 | 主要基于临床研究中的CD8 T细胞亚群示例,可能在其他疾病背景下的通用性需进一步验证 | 开发一种能够实现高维度免疫组成和功能表征以及无偏基因组水平分子谱分析的逐步单细胞分辨率深度免疫表型分析流程 | 健康和疾病状态下的免疫细胞,特别是CD8 T细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞术数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2026-06-18 |
RRBP1 promotes osimertinib resistance by activating fatty acid oxidation-dependent metabolic and immune reprogramming in EGFR-Mutant lung adenocarcinoma
2026-Jun-12, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118158
PMID:42285369
|
研究论文 | 该研究揭示了RRBP1通过激活脂肪酸氧化依赖的代谢和免疫重编程促进EGFR突变肺腺癌奥希替尼耐药性的机制 | 首次发现RRBP1通过SREBP1-CPT1A-FAO通路驱动脂质代谢重编程并调控M2巨噬细胞极化,建立代谢-免疫串扰与奥希替尼耐药的新关联 | 未明确RRBP1调控脂肪酸氧化的具体分子机制细节,且主要基于体外和生物信息学分析,缺乏体内模型验证 | 探究奥希替尼耐药肺腺癌中脂质代谢重编程的分子机制及免疫调控角色 | EGFR突变肺腺癌肿瘤细胞及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序, 孟德尔随机化分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | 未明确说明具体样本量,涉及单细胞测序和全基因组测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 720 | 2026-06-18 |
Cellular Heterogeneity in Erectile Dysfunction: An In-silico Analysis Revealing PER1, BHLHE40, NFIL3, and KLF10 as Circadian Rhythm Genes
2026-Jun-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示器质性勃起功能障碍患者海绵体中细胞异质性和昼夜节律基因PER1、BHLHE40、NFIL3和KLF10的作用 | 首次在单细胞水平表征器质性ED患者海绵体中昼夜节律基因的细胞类型特异性表达和动态变化,并鉴定NFIL3为可药物靶点 | 基于公共数据集GSE206528,样本量有限;分子对接为计算机模拟,需实验验证 | 阐明器质性勃起功能障碍中细胞异质性和昼夜节律基因的调控机制 | 人类海绵体组织及其细胞类型(成纤维细胞、内皮细胞、周细胞等) | 计算机视觉 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Monocle 2, CellChat, AUCell, Enrichr, AutoDock 4 | 单细胞基因表达数据 | 来自健康对照和器质性ED患者的海绵体组织样本(数据集GSE206528) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |