单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 956 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-06-08
Single-cell transcriptomics and machine learning unveil liquid-liquid phase separation-related biomarkers in HPV-positive cervical cancer
2026-Jun-06, Infectious agents and cancer IF:3.1Q2
研究论文 结合单细胞转录组学和机器学习揭示HPV阳性宫颈癌中液-液相分离相关的生物标志物 首次发现HPV阳性肿瘤利用独特的液-液相分离机制逃避核仁应激监控,并整合单细胞转录组学与随机森林分类模型识别转化特异性生物标志物 样本类型有限,可能限制结果的普适性 探索液-液相分离失调在HPV阳性宫颈癌中的作用并发现生物标志物 HPV阳性宫颈癌细胞及来自四种组织学条件(正常/癌症、HPV+/-)的单细胞转录组数据 机器学习 宫颈癌 单细胞RNA测序 随机森林 单细胞转录组数据 70,519个单细胞转录组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
702 2026-06-08
Integrated multi-omics and experimental validation reveal CSK and FBLN1 as key targets of stanozolol in accelerating atherosclerosis
2026-Jun-05, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
研究论文 通过整合多组学与实验验证,揭示司坦唑醇加速动脉粥样硬化的关键靶点CSK和FBLN1 首次利用多组学整合与机器学习方法识别出司坦唑醇加速动脉粥样硬化的核心毒性靶点CSK和FBLN1,并通过分子对接与分子动力学模拟验证其结合稳定性 研究仅在ApoE-/-小鼠模型中进行,缺乏人类样本验证;未深入探讨CSK和FBLN1下游的详细信号通路机制 阐明司坦唑醇加速动脉粥样硬化的毒性机制并识别潜在治疗靶点 ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 免疫荧光, 分子对接, 分子动力学模拟 LASSO, SVM-RFE, 随机森林 基因表达数据 12周司坦唑醇干预的ApoE-/-小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
703 2026-06-08
Roles of m6A erasers FTO and ALKBH5 in drug resistance of hepatocellular carcinoma: mechanisms and clinical implications
2026-Jun-04, Gene IF:2.6Q2
综述 本文综述了m6A去甲基化酶FTO和ALKBH5在肝细胞癌药物耐药中的双重功能与机制,并探讨其临床意义 首次系统阐述FTO和ALKBH5在肝癌耐药中通过调控代谢重编程、抗凋亡信号及肿瘤微环境免疫抑制的双重作用,并提出单细胞转录组学解析m6A异质性的新方向 缺乏对FTO和ALKBH5抑制剂临床前验证及人体试验数据的深入讨论 阐明m6A去甲基化酶FTO和ALKBH5在肝癌耐药中的作用机制,探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 FTO和ALKBH5在肝细胞癌药物耐药中的调控机制 数字病理学 肝癌 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
704 2026-06-08
Targeted delivery of IDR-1018 via biomimetic magnetic nanovesicles suppresses neurovascular cell death and promotes angiogenic repair after neonatal hypoxic-ischemic brain injury
2026-Jun-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 开发了一种负载宿主防御肽IDR-1018的仿生磁性纳米囊泡平台(IDR-MNC@RMVs),用于靶向治疗新生小鼠缺氧缺血性脑损伤,通过激活ITGB3/VEGFA信号轴促进血管修复和神经恢复 首次将仿生磁性纳米囊泡与宿主防御肽IDR-1018结合,利用外部磁场引导靶向递送至缺血脑区,并通过单细胞RNA测序等多组学分析揭示了ITGB3/VEGFA信号轴在血管修复中的关键机制 仅在小鼠模型中验证,尚未在大型动物或人类中测试;研究主要聚焦于急性期效果,长期安全性和有效性需进一步评估 评估IDR-MNC@RMVs对新生小鼠缺氧缺血性脑损伤的治疗效果及其分子机制 新生小鼠缺氧缺血性脑损伤模型及人脑微血管内皮细胞 机器学习 新生儿缺氧缺血性脑损伤 单细胞RNA测序, 转录组学分析, 功能实验 NA 单细胞转录组数据, 转录组数据 新生小鼠(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA测序, 批量化转录组测序 NA NA
705 2026-06-08
Endothelial cell-derived plasminogen activator inhibitor-1 potentiates thrombosis in antiphospholipid syndrome
2026-Jun, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1
研究论文 内皮细胞来源的纤溶酶原激活物抑制剂-1在抗磷脂综合征中促进血栓形成 首次通过单细胞RNA测序揭示抗磷脂综合征患者内皮细胞中SERPINE1(PAI-1)表达显著升高,并证实PAI-1抑制可减轻小鼠模型中血栓形成,提出PAI-1作为APS治疗新靶点 研究仅涉及皮肤活检样本和小鼠模型,未在更大规模临床队列中验证PAI-1抑制剂的疗效,且未探讨PAI-1在其他细胞类型中的作用 探讨纤溶酶原激活物抑制剂-1在抗磷脂综合征血栓形成中的作用及其治疗潜力 抗磷脂综合征患者、抗磷脂抗体阳性携带者、非APS血栓形成患者、健康对照者及小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、血液样本数据 167名APS患者、37名抗体阳性携带者、18名非APS血栓形成患者、48名健康对照者及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
706 2026-06-08
Differential traction forces underlie spatial heterogeneity in early differentiation of human embryonic stem cell clones
2026-Jun, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了人类胚胎干细胞克隆早期分化中空间异质性的差异牵引力机制 首次阐明β-整合素-F-肌动蛋白-YAP轴介导的牵引力差异驱动hESC克隆内早期分化空间异质性 仅使用H1细胞系,未评估其他hESC系或iPSC系,且未进行体内验证 阐明机械调节机制如何控制人类胚胎干细胞早期分化中的空间异质性 人类胚胎干细胞(H1 hESCs)克隆的早期定型内胚层分化 机器学习, 数字病理学 NA 牵引力显微镜, 单细胞转录组学 NA 图像, 文本 H1 hESC克隆,样本量未具体说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
707 2026-06-08
Heterogeneity of memory B cells in human blood
2026-Jun-01, International immunology IF:4.8Q2
综述 讨论人类血液中记忆B细胞的异质性,提出用五个标记物区分B细胞亚群的框架 提出一个使用IgD、CD27、CD21、CD11c和CD45RB糖基化亚型五个标记物区分人类血液中大部分B细胞群体的新框架 未具体说明局限性 综述人类循环B细胞中表型和功能的重叠与矛盾,特别是记忆B细胞,并提供一个更好的分化框架 人类血液中的记忆B细胞 NA NA 单细胞技术,单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
708 2026-06-08
SIGLEC6 impairs trophoblast function and orchestrates macrophage M1 polarization via suppression of Akt signaling in early-onset preeclampsia
2026-Jun-01, Placenta IF:3.0Q2
研究论文 本研究揭示了SIGLEC6通过抑制Akt信号通路损害滋养层功能并促进巨噬细胞M1极化,从而驱动早发性子痫前期发病的分子机制 首次阐明SIGLEC6在早发性子痫前期滋养层细胞中的细胞特异性定位及其通过CXCL10介导巨噬细胞招募和M1极化的免疫调控作用,并证实Akt信号通路是关键的分子机制 尚需体内动物模型验证SIGLEC6-Akt通路在子痫前期发展中的因果作用,且临床样本量有限 探究SIGLEC6在早发性子痫前期中损伤滋养层功能并调控胎盘炎症微环境的分子机制 早发性子痫前期胎盘组织及体外培养的滋养层细胞 数字病理学 妊娠期疾病 单细胞RNA测序, RNA-seq, 免疫荧光染色, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 流式细胞术 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 整合多个公共转录组和单细胞RNA测序数据集;体外实验使用多种细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
709 2026-06-07
Single cell and spatial atlas of macrophage and astrocyte interactions in glioblastoma
2026-Jun-06, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞和空间分析技术揭示胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质细胞样细胞的相互作用图谱 首次结合单细胞RNA测序和空间重建技术,系统解析胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质细胞样细胞亚群间的特异性信号网络(如APP-CD74通路),并鉴定与不良预后相关的关键亚群 样本量较小(仅10例患者),且未进行功能验证实验来确认信号通路的因果关系 阐明胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质细胞样细胞间的细胞互作机制及临床意义 10例胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10例胶质母细胞瘤患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
710 2026-06-07
Single-cell immunoprofiling reveals a dysfunctional-like immune microenvironment and malignant phenotype in aging penile squamous cell carcinoma
2026-Jun-06, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞免疫分析揭示衰老阴茎鳞状细胞癌中功能失调的免疫微环境和恶性表型 首次系统揭示衰老对阴茎鳞状细胞癌(PSCC)的影响,鉴定出衰老相关肿瘤细胞亚群及其恶性特征,并发现IL1B可作为PSCC的潜在预后标志物 样本量较小(仅2例非老年和3例老年PSCC样本) 探索衰老对阴茎鳞状细胞癌免疫微环境和肿瘤表型的影响 非老年(2例)和老年(3例)阴茎鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 单细胞组学 阴茎鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞TCR测序(scTCR-seq)、免疫组化、免疫荧光、Masson染色、β-半乳糖苷酶染色、流式细胞术 NA 单细胞基因表达数据、TCR序列数据、组织图像 5份阴茎鳞状细胞癌样本(2例非老年,3例老年) NA 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 NA NA
711 2026-06-07
Machine learning methods identified cellular senescence-related hub molecules in sepsis-induced acute respiratory distress syndrome (ARDS) and their upstream regulatory network
2026-Jun-06, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 运用机器学习方法识别脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征中细胞衰老相关的核心分子及其上游调控网络 首次通过多种机器学习方法系统鉴定脓毒症相关ARDS中细胞衰老相关的核心分子,并验证其在上游调控网络中的角色 部分hub分子在qRT-PCR中未验证出显著差异表达 探索细胞衰老相关基因在脓毒症诱发的ARDS中的作用,并鉴定核心分子及上游调控网络 脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者及小鼠模型 机器学习 脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征 RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR 机器学习(共识聚类、多种算法) 基因表达数据 在线数据库数据及小鼠模型样本 NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
712 2026-06-07
Omics-driven strategies for identifying biomarkers in Alzheimer's disease
2026-Jun-06, Metabolic brain disease IF:3.2Q2
综述 本文综述了组学技术在阿尔茨海默病生物标志物发现中的应用,特别是代谢组学与多组学整合方法如何提高诊断特异性和精准医学潜力 提出了以代谢紊乱为中心的AD生物标志物发现范式,强调脑葡萄糖低代谢、胰岛素抵抗等代谢功能障碍在发病机制中的核心地位,而非次要因素,并展示了多组学整合如何增强生物标志物特异性和预测能力 数据整合、可重复性和临床转化方面仍然存在重要挑战 探索组学驱动策略在阿尔茨海默病生物标志物发现中的应用,特别是整合多组学方法在精准医学中的价值 阿尔茨海默病患者的基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组学数据 机器学习 阿尔茨海默病 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱分析 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
713 2026-06-07
Fusobacterium nucleatum in oral squamous cell carcinoma: molecular mechanisms, tumor microenvironment and translational implications
2026-Jun-06, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 该文章综述了具核梭杆菌在口腔鳞状细胞癌中的分子机制、肿瘤微环境相互作用及转化意义 综合评估F. nucleatum在OSCC肿瘤微环境中的分子和细胞相互作用,重点分析FadA和Fap2相关信号、β-catenin、NF-κB和STAT3介导通路、上皮间质转化、基质重塑和免疫耗竭特征,并探讨空间转录组学、单细胞测序和整合多组学方法的应用 当前研究结果具有异质性和情境依赖性,因肿瘤部位、HPV状态、微生物负荷、宿主免疫组成和研究方法差异而不同;微生物组生物标志物和治疗策略大多处于早期实验阶段,缺乏OSCC特异性的机制和临床验证 总结F. nucleatum在OSCC发展中的作用机制及其临床转化潜力 具核梭杆菌、口腔鳞状细胞癌 自然语言处理 口腔癌 空间转录组学, 单细胞测序, 整合多组学 NA 文本 NA NA 单细胞测序, 空间转录组学 NA NA
714 2026-06-07
Engagement of the TCR against an oncolytic virus generates a population of effector CAR T cells with potent antitumor activity
2026-Jun-05, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 利用溶瘤病毒激活CAR T细胞的内源性T细胞受体,产生具有强效抗肿瘤活性的效应CAR T细胞群体 首次证明通过溶瘤病毒激活CAR T细胞的内源性T细胞受体,能增强CAR T细胞的功能、持久性和治疗效果,并产生具有不同基因和蛋白表达的TCR启动CAR T细胞亚群 未提及具体限制,可能包括临床转化前的验证需求或潜在免疫毒性 探索通过溶瘤病毒激活CAR T细胞TCR来改善实体瘤治疗效果的方法 接受CAR T细胞和水疱性口炎病毒联合治疗的实体瘤模型中的CAR T细胞 机器学习 实体瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
715 2026-06-07
Remodeling lesions locate at sites of strong extravillous trophoblast invasion and are associated with neutrophil presence in the human first-trimester decidua
2026-Jun-05, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 本研究通过空间转录组学、组织形态学分析和定量图像分析,揭示了早期妊娠蜕膜中不同滋养细胞侵入程度对蜕膜组织结构和免疫细胞分布的影响,并定义了‘重塑病变’区域 首次在生理条件下发现强滋养细胞侵入诱导的蜕膜基底层‘重塑病变’区域,并揭示其与中性粒细胞聚集及免疫景观重塑的关联,突破了以往仅在病理条件下观察到的组织重构现象 研究受限于手术切除对组织完整性的破坏和未知妊娠结局;空间转录组学分析的组织切片数量有限,且组织学切片仅为瞬时快照,无法动态追踪变化过程 探究早期妊娠蜕膜中细胞滋养层侵入程度对蜕膜组织结构和免疫细胞分布的影响 人类早期妊娠(孕7-9周)蜕膜组织 空间转录组学 正常妊娠生理机制 空间转录组学, 免疫组化, 定量图像分析, 单细胞RNA测序数据整合 NA 组织切片, 转录组数据 23例早期妊娠蜕膜组织(孕7-9周)及11例存档标本 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium用于空间转录组学分析,整合了来自已发表单细胞RNA-seq数据的10x Chromium平台数据集
716 2026-06-07
Single cell transcriptome profiling of peripheral blood mononuclear cells in Guillain-Barré syndrome patients
2026-Jun-05, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 对格林-巴利综合征患者外周血单个核细胞进行单细胞转录组分析,揭示T细胞分化-趋化因子分泌轴作为炎症性神经病的致病枢纽 首次通过单细胞RNA测序描绘GBS患者外周血免疫细胞的组成动态和激活机制,并利用小鼠模型和转录组数据验证,发现T细胞分化-趋化因子分泌轴的新致病机制 样本量较小(仅3名患者和2名健康对照),且验证依赖动物模型数据,可能限制结论的普适性 探究格林-巴利综合征患者外周血免疫细胞的组成变化和激活机制 格林-巴利综合征患者和健康对照的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 格林-巴利综合征 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 3名GBS患者和2名健康对照,共51358个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
717 2026-06-07
Human immunosuppressive neutrophils: recent answers to old and new questions
2026-Jun-05, The EMBO journal
评论文章 本文综述了人类免疫抑制性中性粒细胞(PMN-MDSCs)的最新研究进展,包括其生成机制、异质性、与肿瘤相关中性粒细胞的转录组相似性,以及区分标准 利用先进技术揭示了人类PMN-MDSCs在紧急粒细胞生成过程中产生,包含未成熟和成熟中性粒细胞的异质性群体,并发现成熟PMN-MDSCs通过转录重编程发挥免疫抑制功能;单细胞RNA测序显示其与肿瘤相关中性粒细胞具有转录组相似性 详细内容未提供,仅从摘要推断可能缺乏大规模实验验证或临床样本的广泛验证 探讨人类PMN-MDSCs的最新认知,包括其生成、区分标准及潜在非免疫抑制功能 人类多形核髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs)及其亚群 免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
718 2026-06-07
FN1+ macrophages fuel aggressive sarcomatoid differentiation and immunotherapy refractory outcome in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jun-05, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过多队列整合分析、单细胞和空间转录组学等技术,揭示了FN1+肿瘤相关巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌肉瘤样分化中富集,驱动免疫治疗耐药,并发现靶向FN1可重塑肿瘤免疫微环境,增强免疫治疗效果 首次系统阐明FN1+巨噬细胞在ccRCC肉瘤样分化中的富集及其与免疫治疗耐药的关系,并证明FN1阻断联合PD-1阻断具有协同抗肿瘤效应 未提及具体局限性 表征FN1+肿瘤相关巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性、功能表型和治疗靶向性 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤样本,特别是具有肉瘤样分化的肿瘤 机器学习 肾细胞癌 NA NA 转录组数据 五个队列的整合分析 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析
719 2026-06-07
Multiscale learning of gene network-driven phenotypic dynamics of single cells
2026-Jun-05, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 提出GRNvelo计算框架,整合基因调控网络与单细胞RNA-seq时序数据,重建多尺度细胞命运动态 构建了耦合GRN驱动的单细胞速度与非局部细胞生长介导的群体动力学的多尺度模型,并设计了基于物理信息神经网络的两阶段协同优化算法 NA 理解基因调控网络如何动态控制细胞命运的出现并预测遗传扰动下的细胞命运变化 单细胞RNA-seq数据中的细胞命运动态 机器学习 NA 单细胞RNA测序 物理信息神经网络(PINN) 基因表达数据 两个合成数据集和四个真实数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
720 2026-06-07
Upregulation of ADAM19 in dendritic cells is associated with immune features and lower C-peptide levels in type 1 diabetes mellitus
2026-Jun-05, Diabetology & metabolic syndrome IF:3.4Q2
研究论文 研究树突状细胞中ADAM19上调与1型糖尿病免疫特征及C肽水平降低的关联 首次在多个数据集和单细胞水平上揭示ADAM19在树突状细胞中的表达与1型糖尿病免疫微环境及β细胞功能障碍的关联,并评估其作为生物标志物的潜力 研究主要基于公开数据集和有限样本量的内部队列,ADAM19的因果机制和临床诊断应用需进一步验证 探究树突状细胞中ADAM19表达与1型糖尿病免疫特征及β细胞功能的关系 1型糖尿病患者的树突状细胞和外周血单个核细胞 数字病理学 1型糖尿病 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 实时定量聚合酶链反应 偏最小二乘判别分析 转录组数据 4个数据集的129份外周血单个核细胞样本、20份内部样本、117份单细胞RNA测序样本及44份验证队列样本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
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